TALLER 3

GUIA DIDÁCTICA

Bioinformática EstructuralTALLER DE SIMULACIONES BIOMOLECULARES

2012

Bioinformática Estructural 2

MODELADO DE NUEVAS ESTRUCTURAS y/o estudio gráfico de estructuras

problemas

1 - Tomen como secuencia o estructura problema: Sebastian: la secuencia problema que traes de tu

proyecto (enviármela por email) Astrid: tu tarea se va a centrar en ADN pero

puedes diseñar una parte para modelar proteínas (enviarme la secuencia por email)

Vania: deberemos armar la secuencia de 18 aminoácidos que trajiste como problema

Gustavo: secuencia de lipasa seleccionada (enviarmela por email)

Yamandú: secuencia o PDB de receptores nicotínicos de acetil colina humanos

Adrian y Alvaro: cualquiera de los PDBs de cristales de RBP estudiados

Marcela y Diego: Va secuencia por email de (transportadores de ácidos grasos).

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2 - Con sus secuencia problema realizaremos el ejercicio de superposición (SAS), selecciòn de proteína template, modelado y observaciòn de template y modelos con los tutoriales del Taller 1 y 2

3 – Aquellos que trabajen sobre PDBs (y no tengan que modelar) investigarán la informaciòn (respondiendo a la pregunta,p or ejemplo: cuales proteinas son similares a la problema?), analizando la estructura de proteínas alineadas

Otros tutoriales a ser usados como referencia: TALLER.3.protein_course_2006.ppt

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Suerte, paciencia y mucha perserverancia!

Espero preguntas, planteos etc, por esta

vía durante los TalleresLos espero hoy en el

CEBIOINFO!

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Buena semana!