Agilent MassHunter Workstation Software. Un software … · • Analytical Studio Reviewer B.02.01...

34
Agilent MassHunter Workstation Software. Un software común para toda una plataforma de sistemas MS Juan Aybar Especialista de Producto GCMS LCMS AGILENT TECHNOLOGIES 901.11.68.90

Transcript of Agilent MassHunter Workstation Software. Un software … · • Analytical Studio Reviewer B.02.01...

Agilent MassHunterWorkstation Software.

Un software comúnpara toda unaplataforma de

sistemas MS

Juan AybarEspecialista de Producto

GCMS LCMSAGILENT TECHNOLOGIES

901.11.68.90

Agenda

1. Agilent MassHunterWorkstation Software

Un software único para toda una plataforma de espectrometría de masas

2. Algunas peculiaridades

GCMS/GCQQQ

MassHunter Quant

MassHunter Qual

Page 2

MassHunter Workstation SoftwareUn único software para todos los MS de Agilent

Objetivos iniciales – Año 2006

1. Minimiza los tiempos destinados al aprendizajeentre las diferentes plataformas de Agilent

a. Control de Agilent 6000 Series QQQ, TOF y Q-TOF

b. Control de las Series 1100 y 1200 HPLC incluyendo el Chip-LCMS

c. Data Processing para LC/MS QQQ, TOF, Q-TOF y Single Quad

d. Control & data processing para ICP/MS

e. Control & data processing para GC/MS y GC/MS/MS

LC/MS GC/MS ICP-MS

AGILENT MassHunter Workstation

Instrument Control

Monitorización en tiempo real

Puesta a punto de métodos

Autotune

Qualitative Analysis

Resultados cromatográficos

Resultados espectrales

Búsqueda de compuestos

Quantitative Analysis

Vistas al gusto del usuario

Cuantificación/Confirmación

Curve fit assistant

MassHunter Data Acquisition Software• MassHunter Data Acquisition for TOF and Q-TOF B.02.01/B.03.01

• Support of all 6500 series Q-TOF (B.02.01) incl. 6540/6538 Max Res (B.03.01)

• Fast pos/neg switching on the TOF

• MassHunter Data Acquisition for QQQ B.03.01 SP1

• Supports connectivity to Watson LIMS for Bioanalysis

• Supports Workflows using Dynamic MRM and Optimizer including automatic updating of RT

• Software now customer installable (!)

• MassHunter Optimizer B.03.01

• Database includes retention times and many other searchable fields

• Supports multiple databases

• MassHunter Study Manager for QQQ B.03.01

• Allows users to submit studies as separate worklists

• Schedules tasks like Acquisition, Optimizer, Quant

• Study Creation Wizard for Bioanalysis, Drug Discovery Screening

• Dynamic MRM Database Kit w/ method for QQQ

• B.03.01 DMRM Pesticide Database with > 600 compounds

• B.03.01 DMRM Forensics and Toxicology Database with >200 compounds

• MassHunter Easy-Access B.02.01

• Supports SQ, TOF and Q-TOF

• Supports 1290 LC

• Supports CTC type autosamplers on SQ, TOF, and QTOF

• Compound confirmation and sample purity

• BioConfirm

• API for MassHunter Acquisition Worklist

• Allows to create, edit and run worklists programmatically

• Used internally (Easy Acess) and given to 3rd parties (Biocius, GERSTEL)

MassHunter Data Processing Software• Qualitative Analysis B.03.01 • Unknown analysis, impurity analysis, molecular formula confirmation

• Quantitative Analysis B.04.00 • New integrator, Compounds-at-a-Glance, Trend Reporting

• BioConfirm B.03.01 (Add-on to Qual) • Characterization of intact proteins (antibodies), synthetic peptides and oligonucleotides

• Metabolite ID B.02.01 • Identification of known AND unknown exogenous drug metabolites, AMRT database search

• Spectrum Mill A.03.03 • Protein database search, quantitation with labels or label-free

• Personal METLIN Database B.02.00 • ID of endogenous metabolites via accurate mass + RT (AMRT)

• Personal Compound Database Kit w/ method for TOF/Q-TOF • B.03.01 Personal Pesticide Database (PPD) with 1600 pesticides via AM(RT)

• B.03.01 Personal Forensics and Toxicology Database (PFTD) with 7500 cmpds (5000 struct.)

• Personal Compound Database and Library Software (PCDL) • B.03.01 Create and edit AM(RT) databases and MS/MS spectral libraries

• Mass Profiler B.02.00 • Differential analysis to compare two samples or sample sets, T-test, simple to use, no PCA

• Mass Profiler Professional B.02.00 • Differential analysis of two or more sample sets (integrated with Qualitative Analysis), ID Browser, Pathway Analysis

• Analytical Studio Reviewer B.02.01 • Browser for compound confirmation and purity analysis results

• MassHunter Data Access Component (MHDAC) v2.1• Application interface to directly access MassHunter raw files, given to > 30 groups (academic, 3rd party)

• MassHunter Custom Reporting via Excel 2007 • Based on templates using XML mapping, a custom reporting macro addin based on VB; 300 Quant + 30 Qual templates

MassHunter Software GCMS/GCQQQAlgunas cuestiones interesantes

1. Instrument Control

• Autotune

2. Batch-at-a-Glance

• Navigación sencilla

3. Parameter-less Integrator

• Sin parámetros

4. Outlier Detection

• Más de 20 criterios

5. Excel-based Reporting

• Reporting sencillo y fácilmente adaptable basado en Excel 2003

MSD Chemstation vs MassHunter WorkstationUna comparación rápida

MSD Chemstation

GC/MSD 597x acquisition

Diferente entorno en función de la aplicación

EnviroQuant, DrugQuant, etc.

Un mismo entorno para la cuantificación y la búsqeuda en librería

Flujo de un único fichero

Adaptable usando lenguaje de macros

MassHunter

GCQQQ 7000B acquisition

Procesado de datos GC/MSD y GC/MS/MS

Módulos Quant/Qual (Library searching) independientes

Flujo de trabajao orientado a secuencias -Batches

Herramienta de reporting poderosa y flexible

Común a LC/MS e ICP-MS

Instrument Control UI/Navigation

MassHunterEditor de métodos MRM

Con utilidades cut & paste para importar desde bases de datos o softwares de optimización

AGILENT LC/MSD Triple Cuadrupolo

Enero 2006Página 11

Creación de Método de Cuantificación a partir de uno de Adquisición

AGILENT LC/MSD Triple Cuadrupolo

Enero 2006Página 12

Creación Automática de los Níveles de Calibración a partir del Esquema de Diluciones

1.- Conc. sol. Madre

2.-Esq. diluciones

3.- nº níveles concentración

4.- níveles concentración

Batch-at-a-GlanceNavegación + Informacion

Batch-at-a-GlanceBatch Table: Uno o Múltiples Compuestos

Single Compound, Qualifier, ISTD, ISTD Qualifier

Multiple Compounds

Batch-at-a-GlanceInformación de compuestos

Tolerancias en Ratio

de Abundancias

Relativas entre

transiciones

Batch-at-a-GlanceCalibracion

Integrador libre de parámetrosAmplio rango de trabajo

• Nuevo integrador libre de parámetros

• SIN parámetros

• Discrimina entre picos y “spikes” de ruido

• Integra correctamente desdeconcentraciones bajas a concentraciones elevadas

• Elimina virtualmente la necesidadde integración manual

• Rendimiento > 4 órdenes de magnitud

RSD 14.0%Resp. Factor 1512

RSD 2.0%Resp. Factor 1546

RSD 0.9%Resp. Factor 1542

RSD 0.8%Resp. Factor 1526

RSD 1.1%Resp. Factor 1009

100 fg

1 pg

10 pg

100 pg

1 ng

Integrador libre de parámetrosValidación de picos

• Valida la calidad de pico basándose en:

– Altura de pico

– Area de pico

– Anchura de pico

– Simetría de pico

– Picos unidos a la derecha/izquierda

– Nivel de “spikes” en un pico

• Clasifica la calidad de los picos como:

– Aceptados

– Revisar

– Rechazar

• ¡Permite centrarse en los picos de interés!

Merge

Valley

Height

15 %

Peak

Accepted

Merge

Valley

Height

39 %

Inspect

Peak

Merge

Valley

Height

54%

Peak

Rejected

Detección automatizada de valoresanómalos

• Más de 20 criterios

• Limitesestablecidos en el método

• Avisos y filtros

• Report específicode valoresanómalos

Reporting basado en ExcelExcel 2003 + XML

Selección de la plantilla correctaCola con reports múltiplesSelección Impresora/Pdf

ExcelCarga la plantillaImporta los resultadosFormatea el reportReport es:

a) Guardado como XLSb) OPT: Printerc) OPT: PDF

Report Resultados (XML) &Gráficos generados

MassHunter y la línea GCMSGCMS - GCQQQ

• 7000A Triple Cuadrupolo GC/MS – Sólo MassHunter

• MassHunter Acquisition

• MassHunter Data Analysis

• MassHunter Reporting

• GC/MSD – Disponible MassHunter SOLO para Data Analysis

• MSD ChemStation Acquisition

• MassHunter Data Analysis via Translator

– Traduccion sencilla y rápida desde MSD ChemStation

– CUALQUIER fichero producido por MSD ChemStation

La propuesta de Agilent para proporcionarestas ventajas al usuario de GC/MS/MS

• Proporcionar una serie de herramientas que asisten al usuarioen la CREACION y OPTIMIZACION del método de adquisición MS/MS

• Dynamic MRM para GC/MS es una parte del flujo de trabajoque incluye la generacion del método (basado en RTs/transiciones conocidas y LA OPTIMIZACION DE LOS PARÁMETROS DE ADQUISICIÓN MRM

1. Design Experiments Assistant

2. Analyze Experiments Assistant

3. DynamicMRM Assistant

Flujo de

Trabajo

Asistente de Diseñode ExperimentosCreación automatica de un set de experimentos MRMs basados en diferentes CEs

Asistente para análisis de experimentos

Proceso de datos generadosdesde el set de experimentosanterior.

Creación automatizada de un método MRM basado en las Cesque proporcionan señales másintensas para cada transiciónprogramada.

Herramientas de optimización. ¿Generación manual de segmentos?

Zonas de bajadensidad de picos

permiten una division manual sencilla

En zonas de gran densidad de compuestos es casi imposible.

Problema clásico del campo de residuos

¿Como funciona Dynamic MRM para GC/MS a la hora de optimizar métodos MS/MS?

• Dynamic MRM optimiza scan cycle time, dwell times, y el orden de adquisición (generación automatizada de segmentos) para conseguir:

1. Maxima señal

2. Mínimo ruido

3. %RSD bajas

4. La mayor velocidad de análisis

5. La mayor robustez en el método

• La aproximación tiene en cuenta la integración de picos y el ruido de línea de base en el proceso de optimización del valor de dwell time.

Ventajas del uso de dynamic MRM para GC/MS1. Dynamic MRM automatiza y simplifica la creación de métodos

complejos que requieren muchos segmentos

2. Facilita el mantenimiento de lo métodos. Pueden ser regenerados en segundos desde datos adquiridos si se cambia de columna/tune

3. Dynamic MRM proporciona mejoras en %RSD vs. métodosoptimizados por expertos

4. Para métodos de 40-min con hasta 300 transiciones puedenesperarse reducciones en torno a 10-20% para los valores de %RSD

5. Dado que la mayor contribución a RSD proviene de erroressistemáticos (p.e. variación en el volumen de inyección), la disminucion de ruido en comparación con los métodostradicionales, es bastante mayor

MassHunter CualitativoAlgunas mejoras para la representación de ficheros de datos MS

Page 27

Extracción automtizaday superposicion de EICs

provenientes de una adquisición en

SCAN/SIM

Presentación conjunta de ficheros SCAN –

Cromatogramas y Espectros

Medidas en Scan MassHunter Editor de Librerías

Parámetros de búsqueda de librería

Page 29

Perceive CompoundsUtilidad de deconvolución

Page 30

Page 31

Deconvolucion usada para evaluar purezaespectral – pureza de pico

Metrics Plot – Facilitando el QC en el Laboratorio

• Representa una columna de datos, e.g. comportamiento de los ISTDs a lo largo de un batch

• Selecciona la columna a representar, elige Plot this Column y examina la representación

• Pueden representarse múltiples columnas a la vez

Resumen1. MassHunter Workstation es un gran paso adelante

en las plataformas de software de cromatografía yespectrometría de masas

2. Permite un mismo entorno de control para losdiferentes sistemas de espectrometría de masas

3. Facilita tareas hasta ahora tediosas tanto en laparte de cuantificación como en la decuantificación

4. Mejora notablemente las capacidades en cuanto arepresentación y reporting de resultados

5. Facilita la exportación de datos hacia otrossoftwares de control y tratamiento de datos

Gracias por suAtención

Juan Aybar

AGILENT TECHNOLOGIES

[email protected]

901.11.68.90