Revisão Sistemática · Laboratório de Epidemiologia Veterinária (EPILAB, UFRGS) Objetivos Curso...
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Revisão Sistemática
Luís Gustavo Corbellini ([email protected])
Laboratório de Epidemiologia Veterinária (EPILAB, UFRGS)
Objetivos
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
2
Os alunos devem compreender a importância dos dados
e das informações científicas disponíveis para a realização
de uma AvR;
Compreender o papel da Revisão Sistemática numa AvR;
Identificar as diversas fontes de informação para realizar
uma AvR.
Vamos pensar em uma avaliação de
risco microbiológica de alimentos
Curso de Introdução a Avaliação de risco Qualitativa3
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Trata-se de um processo que pode ir da fazenda à mesa;
Existem inúmeros pontos críticos com risco de contaminação
ao longo do processo;
> 200 agentes biológicos podem causar doenças transmitidas
por alimentos (Sargeant et al., 2006);
Para uma avaliação de risco, é necessário conhecer os perigos
específicos, o processo de produção, os dados de ocorrência
(prevalência e concentração de patógenos), dados de consumo,
preparação, transporte, etc...
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Fontes de informações
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
5
Documentação e coleta de dados é a parte mais
demorada de qualquer avaliação de riscos (AvR);
As fontes de dados podem ser (depende de cada caso):
OIE web site;
FAO EMPRES;
(http://www.fao.org/ag/againfo/programmes/en/empres/home.asp)
GLEWS (http://www.glews.net/);
Órgãos Oficiais (Serviço Veterinário Oficial, etc.);
Bases de dados científicas (indexadas ou não);
Informações de Especialistas (Experts).
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Muitas vezes a obtenção de dados ocorre por:
1. Revisão narrativa;
2. Revisão sistemática;
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Por exemplo
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Qual a prevalência de rebanho do vírus BVDV no RS?
90% (Canal et al., 1988);
48% (Almeida et al., 2013);
24,3% (Machado et al., 2014).
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Qual a razão de tanta variação?
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
1. Validade interna (qualidade do estudo)
Delineamento;
Análise;
População envolvida;
Teste de diagnóstico empregado.
2. Validade externa
O quanto os resultados podem ser extrapolados para outros
indivíduos de uma população.
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Revisão Narrativa (RN)
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Descrever e discutir o desenvolvimento de um
determinado assunto sob o ponto de vista teórico;
Não tem critérios de busca e especificação de métodos
de seleção dos estudos.
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Revisão Sistemática (RS)
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Estratégia de busca objetiva e coordenada – responde a
uma pergunta específica;
Seleção de trabalhos através de uma análise crítica;
Auxiliar na obtenção de dados numéricos e ou descrição
qualitativa com menor viés.
Pode ser seguida de uma análise quantitativa (meta-
análise).
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Etapas para conduzir uma revisão sistemática
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
1• Formular a questão/problema a ser revisado.
2
• Desenvolver protocolo de busca.
• Principais bases de dados eletrônicas: Medline/PubMed, ScienceDirect, Agricola, etc.
3• Definir critérios para identificar estudos relevantes (resumo).
4
• Avaliação crítica dos estudos selecionados na etapa anterior:
• Objetivos do estudo, população envolvida, amostragem, diagnóstico, etc.
5• Definição dos dados a serem extraídos;
6• Prosseguir (ou não) para meta-análise;
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Exemplo: Costa et al. (dados não publicados)
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
1
• Estimativa de prevalência de suínos eliminando Salmonella sp. nas fezes.
• População de interesse composta de suínos industriais.
• Isolamento da bactéria das fezes ou intestino.
2
• Medline/PubMed, Agricola e CAB.
• Termos usados para busca: “Salmonella”; “isolation”; “swine”; “prevalence”; “feces”
3
• Suínos industriais;
• Excluiu revisões ou outras revisões sistemáticas;
• Inglês ou português;
• ≥ 1996
4• Tinha que estar descrito no artigo (check-list): população de estudo, amostra randomizada,
métodos laboratoriais, qualidade da descrição dos resultados.
5• Dados extraídos: autor, ano, país, número de positivos, total amostrado, prevalência, fase de
produção e quantidade de fezes na amostra.
6• Meta-análise para estimar a prevalência.
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Resultados
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Search:
146 articles found
Relevance Screening:
86 remain
Critical Appraisal:
9 articles utilized (15 trials)
60 excluded
Duplicated 60%
Before 1996 20%
Another POP 13.7%
Review/Note 6.6%
77 excluded
Pool 29.8%
Inoculate/Disease 27.2%
Treatment 20.77%
ELISA 6.4%
Another agent 3.9%
Data used before 3.8%
Not random 2.6%
Isolation not in feces 13%
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Prevalência
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Prevalência: 14 %( CI 95% 7% - 25%)
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Fontes de variação entre estudos
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Alta heterogeneidade foi encontrada em função de:
Quantidade de fezes coletada nos estudos;
Abate em comparação com terminação;
Ano do estudo e localidade não tiveram influencia;
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Por que a revisão sistemática e meta-análise é uma
ferramenta aliada da avaliação de risco?
Curso de Introdução a Avaliação de risco Qualitativa16
Estratégia de busca
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
As bases de dados científicos são inúmeras:
CABI, Agricola, Medline/PubMed, ScienceDirect, Scopus, etc.
Sintaxe: Operadores booleanos
AND, OR, and NOT
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And
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Restringir a pesquisa;
Faz intersecção de trabalhos;
Prevalência de isolamento de Salmonella nas fezes de suínos:
Salmonella and isolation and swine and prevalence and feces
113 resultados no ScienceDirect;
169 resultados no PubMed;
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Or
Curso de Introdução a Avaliação de risco Qualitativa
Agrupar termos
Amplia a pesquisa
a) sinônimos: swine or pork;
b) acrônimos: bovine viral diarrhea vírus or BVDV;
c) variantes: ovino or ovelha;
d) grafias diferentes: raios X or raios-X or raio X or raio-X;
e) relacionados: epidemia or epizootia;
Prevalência de isolamento de Salmonella nas fezes de suínos ou
porcos:
Salmonella and isolation and swine or Pork and prevalence and feces
148 resultados no ScienceDirect;
176 resultados no PubMed;*
*Salmonella and isolation and (swine or Pork) and prevalence and feces
19
Not
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Serve para eliminar termos não pertinentes para o objeto ou
o tema da pesquisa;
Prevalência de isolamento de Salmonella nas fezes de suínos ou
porcos não realizado por ELISA:
Salmonella and isolation and swine or Pork and prevalence and feces
and not ELISA
103 resultados no ScienceDirect;
152 resultados no PubMed;*
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Resumo: operadores booleanos
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Operador Descrição Sintaxe da busca ScDirect PubMed
And Restringir a
pesquisa
Salmonella and isolation
and swine and prevalence
and feces
113 169
Or Agrupar termos
(ampliar)
Salmonella and isolation
and (swine or Pork) and
prevalence and feces
148 176
Not Eliminar termos
(restringe)
Salmonella and isolation
and swine or Pork and
prevalence and feces and
not ELISA
103 152
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Pequeno exercício prático: Efetuar uma pesquisa booleana Science Direct*
com os termos pobreza, crime e género e preencher o quadro seguinte.
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Termos Pesquisados Número de resultados
Poultry
Feces
Waste
Contamination
Poultry and Feces
Poultry and Feces and Waste and
Contamination
“Poultry feces”
* Últimos 10 anos e apenas no Agricultural and biological Science
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Guia para discussão
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Procure observar, de maneira geral, os resultados das
buscas. A ideia é vocês se familiarizarem com a sintaxe e
os retornos das buscas.
Observar o que ocorre nas buscas com operadores
booleanos, por exemplo:
Poultry and Feces – esta busca é eficaz caso você esteja
buscando o assunto relacionado a fezes de frangos? S/N
Porquê? Alguém tem alguma solução para restrição?
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Resultado
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
Termos Pesquisados Número de resultados
Poultry 13.317
Feces 8.513
Waste 41.647
Contamination 45.924
Poultry and Feces 992
Poultry and Feces and Waste and Contamination 91
“Poultry feces” 26
* Últimos 10 anos, apenas no Agricultural and biological Science e em Journals.
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Em síntese
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
A AvR é uma etapa que necessita de coleta de informações
Tanto na quantitativa como na qualitativa;
Muitos dos dados serão utilizados para
Definir parâmetros das distribuições de probabilidades (quantitativa);
Definir a escala de risco aplicada (qualitativa);
Pesquisa bibliográfica (sustentação científica da AvR) é
essencial:
A RS é um método que auxilia na identificação e sumarização de
dados disponíveis de forma objetiva, reduzindo possíveis vieses bem
como identificando áreas onde existe falta de informação.
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É preciso salientar que...
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
26
Nem sempre é necessário a realização de uma RS
Muitas vezes uma RN simples ou,
Apenas uma busca estratégia pode resolver.
Existem diversas fontes de informações para realização de
uma AvR.
Links úteis
Curso de Introdução a Avaliação de risco
Qualitativa
https://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ja97/ja97_pubmed.
html
http://libguides.mit.edu/c.php?g=175963&p=1158594
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