Marcadores moleculares usados en el mapeo genómico

Dos clases de mapeo genómico: Mapeo genético

– Técnicas genéticas, cruces o pedigrees – Calculo de la distancia basada en la frecuencia de

recombinación.

Mapeo Físico • Evaluación directa de la posición relativa de una

secuencia característica • El mapa físico es la secuencia de DNA del genoma

completo

• Marcadores para el mapeo genético • Fenotípico (morfológico) basados en el

polimorfismo físico: color , forma de la hoja en plantas

• Marcadores citológicos basados en la estructura cromosómica: depleción duplicación inversión translocación

• Marcadores bioquímicos – Macromoléculas – Isoenzimas

• Marcadores Moleculares: • Basados en la hibridación DNA-DNA

– RFLP VNTR

• Basados en PCR – Random primers RAPD – Usando primers específicos STR

• Basados en PCR y cortes por enzimas de restricción – AFLP

• Basados en puntos de mutación en el DNA – SNP detectados por SSCP, DASH, DNA chip,

secuenciamiento

• Marcadores moleculares

• Uni locus (buenos porque son estáticos se mapea un gen en una posición sobre el cromosoma) versus Multilocus (buenos para el análisis completo del genoma y análisis filogenético)

• Principales métodos de detección: Hibridación, PCR

Cinco condiciones que caracterizan a un adecuado marcador molecular. •Debe ser polimórfico •De herencia codominante •Distribuidos al azar y frecuentemente por todo el genoma •De fácil y económico análisis •Reproducible

STR and VNTR Typing: PCR Amplification of Repeat Loci

Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, pg511

STR and VNTR Typing: Mendelian Inheritance of Repeat Loci

Progeny

Parents

Repeats

Typing a Forensic Sample

Molecular Biology of the Cell, 4th Edition, pg511

Forensic STR Profile Comparison: How Many Loci are Needed?

Nine Repeat Loci and Sex

What is a probability match and what does it mean?