Perbaikan Dna
-
Upload
tri-handayani -
Category
Documents
-
view
245 -
download
0
Transcript of Perbaikan Dna
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 1/22
PERBAIKAN DNA
Dian Hutami
Tri Handayani
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 2/22
Sejarah Penemuan Mekanisme Perbaikan DNA
• Carell dan Bürckstümmer membuat rantai-rantaiDNA endek yan! men!andun! lesi "cacat#luka$%&esi-lesi yan! terdaat ada DNA ini anal'!den!an lesi yan! timbul aabila sinar ()
men!enai DNA yan! tersiman dalam s'raseerti s'ra bakteri Bacillus% *ereka membuatrantai-rantai DNA mereka den!an mensintesisdua is'mer dari sebua+ anal'! lesi dinukle'tida
dan memasukkannya ke dalam DNA% Carellmenyebutkan ba+,a anal'!-anal'! lesi yan!serua adala+ substrat untuk enim rearasi DNA%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 3/22
Pen!ertian DNA Reair
• DNA reair meruakan suatumekanisme erbaikan DNA yan!men!alami kerusakan # kesala+an
yan! diakibatkan 'le+ r'sesmetab'lisme yan! tidak n'rmal.radiasi den!an sinar (). radiasi i'n.
radiasi den!an ba+an kimia. ataukarena adanya kesala+an dalamrelikasi DNA%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 4/22
• *ekanisme erbaikan yan! terdaat
ditin!kat selular secara !aris besardisesuaikan den!an /enis kerusakanyan! tentu sa/a terkait erat den!an
/enis 0act'r enyebabnya%
• Kesala+an daat ter/adi saat akti1itas
selular n'rmal. atauun dinduksi%DNA meruakan sasaran untukberba!ai kerusakan%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 5/22
• Kerusakan DNA akibat ba+an kimia.2sik. dan lin!kun!an diklasi2kasikanmen/adi emat tie – Peruba+an satu basa
– Peruba+an dua basa
– Pemutusan rantai – Ikatan silan!
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 6/22
• Aabila ada kesala+an # kerusakan
DNA. sel memunyai dua ili+an 3 –Kesala+an tersebut dierbaiki
den!an cara men!akti0kan DNAreair%%
–Aabila DNA tidak mamudierbaiki la!i. akibat dari adanyakesala+an yan! 0atal maka akan
dimatikan dariada +idu memba,aen!aru+ yan! buruk ba!ilin!kun!an sekelilin!nya
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 7/22
Mekanisme DNA repair
• Dema!e re1ersal 3 Pen!!antian secara lan!sun!meruakan cara erbaikan DNA den!anmelibatkan embuan!an atau embalikan DNAyan! rusak 'le+ sebua+ enim tun!!al yan!
ter!antun! 'le+ ca+aya%• Dema!e t'lerance 3*ent'leransi kesala+an%Hal ini
dilakukan bila kesala+an tidak daat dierbaikise+in!!a kesala+an teraksa dit'leransi dan yan!ter't'n! adala+ kedua strand%
• Dema!e rem'1al 3 Pr'ses ini lebi+ k'mlekskarena melibatkan relacin! atau en!!antianden!an di't'n!-'t'n!%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 8/22
• Ada 4 tie dama!e rem'1al3
1. Mismatch repair "Perbaikan yan! tidak
berasan!an#ketidakc'c'kan$Mismatch repair memerbaiki kesala+an yan! dibuatketika DNA disalin% C'nt'+nya. C daat terseliber+adaan den!an A. atau 'lymerase daat5ter!elincir6 atau 5tersendat6 dan menyisikan dua
samai lima basa tamba+an yan! tidak berasan!an%
2. Base excision repair "Perbaikan den!an mem't'n!Basa$
*ekanisme erbaikan den!an men!eluarkan basayan! abn'rmal% Basa yan! sesuai kemudian diasan!'le+ DNA 'lymerase. dan li!ase memerbalikkanDNA ke keadaannya semula%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 9/22
3. Nucleotide excision repair "erbaikan
den!an mem't'n! nukle'tida$*ekanisme ini di!unakan untukmen!!antikan suatu re!i' DNA yan!men!alami kerusakan%
4. Double strand break repair "erbaikankerusakan untai !anda$
Perbaikan ini meruakan mekanismeentin! untuk memerbaiki DNA yan!rusak seerti akibat radiasi%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 10/22
*ismatc+ Reair
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 11/22
• (ntuk memerbaiki basa yan! tidakberasan!an +arus diketa+ui asan!anbasa mana yan! sala+% Pada E. coli. inidaat diketa+ui 'le+ met+ylase yan!disebut den!an 7Dam met+ylase7. dimana
daat memetilasi adenines yan! terdaatada urutan "89$:ATC %
• Pada E. coli. dierlukan ti!a r'tein "*ut ;.*ut C. dan *ut H$ untuk men!enali mutasi
dan mem't'n! untai% Enim lain di dalamsel. termasuk li!ase. 'limerase. dan ;;Bmen!eluarkan dan men!!anti untai%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 12/22
• Dimulai den!an berikatannya r'tein
*ut; ada mismatc+ed baseairs% Kemudian *ut& men!akti0kan*utH untuk ber!abun! bersamaada urutan :ATC% *utH akanmembela+ strand yan! tidak dimetilasiada temat :ATC % ;elan/utnya.se!ment dari temat embela+an
akan dibuan! 'le+ enime<'nuclease"den!an bantuan enim +elicaseII dan ;;B r'teins$%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 13/22
• Bila embela+annya ada
ba!ian =9 dari kerusakan. akandi't'n! 'le+ enim e<'nucleaseI dan bila ada ba!ian 89 'le+
enim e<'nuclease)II atau Rec> untukmende!radasi sin!letranded DNA% Kek's'n!annya akan
diisi den!an bantuan enim DNA'lymerase III dan DNA li!ase%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 14/22
Base excision repair "Perbaikan den!anmem't'n! Basa
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 15/22
• Basa-basa DNA daat dirusak
melalui deaminati'n ataualkylati'n% Temat kerusakan basatersebut disebut den!an 7abasicsite7 atau 7AP
site7% Pada E.coli. enim DNA!lyc'sylase daat men!enal APsite dan membuan!
basanya% Kemudian APend'nuclease membuan! APsite dan nucle'tida
sekitarnya% Kek's'n!an akan diisi
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 16/22
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 17/22
• Pada E. coli. r'tein (1rA.(1rB. dan (1rC bereran dalammembuan! nukle'tida " dimer akibat
() li!+t$% Kemudian kek's'n!anakan diisi den!an bantuanenim DNA 'lymerase I dan DNA
li!ase%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 18/22
Double strand break repair "erbaikan kerusakan untai !anda$
• *ula-mula terdaat dua r'tein yan!bereran dalam enyatuan kembalin'n +'m'l'! suatu kerusakan untai
!anda% Ku. suatu +eter'dimersubunit ?@ kDa dan kDa.berikatan den!an u/un!-u/un! bebas
DNA akti1itas +elikase deenden-ATPlaten% Heter'dimer Ku yan! berikatanden!an DNA merekrut suatu r'tein
kinase unit. r'tein kinase deenden
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 19/22
• DNA-PK memiliki satu ikatan ba!i
u/un!-u/un! bebas DNA dan satutemat ikatan untuk dsDNA teat diba!ian dalam u/un!-u/un! unit%Karena itu. enim-enim inimemun!kinkan ar'ksimasi keduau/un! yan! terisa+% (/un! bebask'mleks DNA-Ku-DNA-PK
memban!kitkan akti1itas kinnaseada u/un!-u/un! yan! terisa+%
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 20/22
• DNA-PK secara timbale balik
mem+'s'rilasi K( dan m'lekulDNA-PK lain di untai yan!berla,anan. ditrans% DNA-PKkemudian kemudian terleas dari
DNA dan K(. menyebabkan akti1asiKu +elikase% Hal ini menyebabkanen!uraian kedua u/un! DNA% DNA
yan! tela+ di urai dan suda+diar'ksimasi kemudian membentukasan!an basa kelebi+an ek'r
nukle'tida dibuan! 'le+
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 21/22
Penutu
• Ribuan masala+ den!an DNA muncul setia +ari disetia sel tubu+. yan! masin!-masin! +arusber+asil terdeteksi dan. /ika erlu. diuba+% ;istemerbaikan DNA mendeteksi dan men!k''rdinasikan
res'n ter+ada seran!an tersebut. memen!aru+ilan!ka+-lan!ka+ untuk mence!a+ kematian selatau men!+aus sel-sel kanker dari sistem tubu+%Dilakukan 'le+ seran!kaian r'tein sel inti. untuk
memerta+ankan inte!ritas DNA. melindun!i kitadari kanker. enuaan. dan berba!ai macam terkaitenyakit. men/a!a sistem kekebalan tubu+ danlebi+
8/19/2019 Perbaikan Dna
http://slidepdf.com/reader/full/perbaikan-dna 22/22
TERI*AKA;IH