安捷伦化学工作站

新的化学工作站工作流程入门

Agilent Technologies

数据组织

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手册部件号G2170-97041

版本

2007 年 2 月

德国印刷

Agilent TechnologiesHewlett-Packard-Strasse 8 76337 Waldbronn, Germany

软件版本

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安全警告

小心

小心提示表示危险。提醒您在操作过程中注意，如果执行不当，将影响产品或丢失重要数据。不要忽视小心提示。

警告

警告提示表示危险。提醒您在操作过程中注意，如果执行不当，将导致人身伤害或死亡。不要忽视警告提示。

内容提要

分析实验室中需要高效地采集色谱图数据。澄清含糊的结果会很费时，而且会增加管理成本。自化学工作站 B.02.01 版以来，数据存储和数据浏览功能已得到改进，能更快地检查和再处理结果数据。

在本手册中，将说明如何高效地使用化学工作站 B.02.01/B.03.01 版中的新数据存储和检索功能来提高您的实验室的效率。

1 化学工作站数据结构

本章概述了 B.02.01 之前版本的化学工作站中使用的数据结构与 B.02.01 版本及其后续版本中的新数据结构之间的差别。

2 数据采集

本章将说明对序列和单次运行，新的数据结构如何影响数据采集的工作流程。

3 数据分析

本章将概述可用的数据分析和检查选项，并说明数据结构如何影响选项的选择。

4 专有文件夹创建关闭时的工作流程

本章将介绍 “专有文件夹创建关闭”时的工作流程，此时您可以如同在化学工作站 B.01.03 或更早版本中那样保存数据。该模式不能充分利用化学工作站中最新的数据检查和再处理功能的优点。

数据组织

4 数据组织

目录

1 化学工作站数据结构 7

B.02.01 之前的化学工作站 8

化学工作站 B.02.01/B.03.01 9

2 数据采集 11

数据采集 12

序列中的数据采集 13单次运行的数据采集 15

3 数据分析 17

数据分析 18

数据分析：数据检查 21

数据检查期间的化学工作站用户界面 28

数据分析：数据再处理 30

4 专有文件夹创建关闭时的工作流程 33

专有文件夹创建打开还是关闭？ 34

专有文件夹创建关闭时的工作流程 35

数据组织 5

目录

6 数据组织

安捷伦化学工作站新的化学工作站工作流程入门

1化学工作站数据结构

B.02.01 之前的化学工作站 8化学工作站 B.02.01/B.03.01 9

本章概述了 B.02.01 之前版本的化学工作站中使用的数据结构与 B.02.01 版本及其后续版本中的新数据结构之间的差别。

7Agilent Technologies

1 化学工作站数据结构

B.02.01 之前的化学工作站

B.02.01 之前的化学工作站

在 B.02.01 版本之前的化学工作站中，序列、方法和生成的数据文件及结果都保存在固定的、彼此分开的指定位置。例如，方法在序列中通过名称引用，用户需负责维护方法、序列和数据文件的完整性。因此，数据的长期归档和结果的复制就成了艰巨的任务。用户必须记录色谱图、结果和相关方法；不仅常规实验室是这种情况，有些领域的非常规实验室 （例如环境实验室）也是如此。在 B.02.01之前的化学工作站中，只能通过把所有内容打印在报告中来实现。

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化学工作站数据结构 1化学工作站 B.02.01/B.03.01

化学工作站 B.02.01/B.03.01

为了加强数据文件和方法之间的相关性，在化学工作站 B.02.01/B.03.01 上实现了以下新的数据组织模式。和化学工作站一起使用时，安捷伦企业内容管理器

(ECM) 也会利用新的数据概念，因为现在可以把整个数据集 （序列 / 方法 / 数据文件）作为一个实体传送 （归档）到 ECM。

文件夹 Chem32\1\methods 中的方法用作主方法，也就是说在采集和数据分析期间，它们保持不变。

图 1. B.02.01 / B.03.01 序列采集

数据组织 9

1 化学工作站数据结构化学工作站 B.02.01/B.03.01

类似地，文件夹 Chem32\1\sequence 中的序列用作序列模板，可用于多次重新运行 （但不重新处理）序列。

数据的存储方式取决于采集的是单次运行数据还是序列数据：

1 执行序列时，将在指定子目录中用唯一名称自动创建新文件夹（“序列容器”）。运行单个样品时，数据文件 (*.d) 将写入指定子目录。

2 对于序列数据，执行的序列模板 (*.s) 和所有涉及的方法 (*.m) 都会复制到序列容器中。方法的副本叫做 “序列方法”，以区别于原始主方法。

所有和序列相关的任务 （例如采集和数据分析）都在序列和方法的副本上执行。因此，将来执行序列时，序列模板和主方法保持不变。

执行序列时，生成的所有数据文件 (*.d) 和对应的批处理文件 (*.b) 及序列日志文件 (*.log) 都会保存到序列数据文件夹中。

3 每个数据文件都包含两个用于创建运行的方法副本。

• 第一个副本叫做 ACQ.M，完成方法的采集部分之后直接保存

• 第二个副本叫做 DA.M，在完成数据分析部分之后保存

这样就保证了特定数据文件的采集方法的状态会保留下来。采集参数可以在“数据分析”视图中查看和打印。数据分析期间可以修改 DA.M。在这种情况下，这两种方法有时可能不同，例如在校准表已更新的情况下。

以下章节将详细说明这一结构对典型工作流程的影响。同时还将展示化学工作站对话框中的相应设置。

10 数据组织

安捷伦化学工作站新的化学工作站工作流程入门

2数据采集

数据采集 12序列中的数据采集 13单次运行的数据采集 15

本章将说明对序列和单次运行，新的数据结构如何影响数据采集的工作流程。

11Agilent Technologies

2 数据采集数据采集

数据采集

从化学工作站 B.02.01 开始，您可以利用单次运行和序列的灵活数据存储来指定不同的保存位置，而无需重新配置。使用“视图”菜单的“首选项”对话框中的“路径”选项卡，可以添加除缺省路径 （C:\chem32\x\DATA，其中 x 是仪器编号）之外的多个路径。用 “添加和删除”按钮可以方便地删除现有路径，也可以浏览到选定位置，将新位置的路径添加到 “首选项”中。不能从列表中删除缺省路径，但可以在配置编辑器中更改它。

所有新指定的数据路径在随后执行运行时都可在 “样品信息 / 序列参数”对话框中选择。

图 2. 首选项对话框 / 路径选项卡

12 数据组织

数据采集 2数据采集

序列中的数据采集

为了运行序列，必须有适当的预定义方法。这些方法就是以上所述的主方法。在化学工作站的 “方法和运行控制”视图中，通常使用主方法和序列模板。因此，在 “方法和运行控制”视图中，可通过化学工作站资源管理器访问主方法和序列模板。

图 3. 数据路径选择

数据组织 13

2 数据采集数据采集

序列模板会在序列表中引用这些方法。

就像前面解释过的，用序列模板 < 序列名 >.S 运行序列，并且使用主方法 < 方法名 >.M 时，将创建一个新文件夹（“序列容器”），其中包含所运行序列生成的所有文件。

该文件夹的位置由“序列参数”对话框中的设置决定；该文件夹的命名由“首选项”对话框的“序列”选项卡决定。缺省情况下，名称为 < 序列名 > < 采集日期 >< 采集时间 >，但可以用令牌操作者、仪器、计数器和 PC 名称配置，也可以手动输入任何名称。如果 “名称模式”产生的名称在序列容器中不唯一，则化学工作站将加上一个计数，以确保唯一性。

采集序列开始时，将从主方法文件夹把序列表中指定的方法复制到序列容器中。此外将创建该序列的一个副本，和序列日志、批处理 (*.b) 文件一起放在序列容器中。所有方法更新（例如，校准表的更新）都将写入容器中的该序列方法。现在，所有必需文件都保留下来，可供将来数据复查和再处理之用，而不受其他序列运行时对主方法或序列模板所作更改的影响。

图 4. 首选项对话框 / 序列选项卡

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数据采集 2数据采集

采集期间，数据文件将保存到序列容器中。在每个数据文件 (*.D) 内，有另两个方法 （ACQ.M 和 DA.M）为这次特定运行而保存。这两个方法是序列方法的副本，保存了采集特定数据文件时方法的状态。在某些情况下 （例如校准表更新），每次运行的 DA.M 方法均不同。

单个采集方法 ACQ.M 用于保留采集参数，因此建议您在以后的数据检查操作中不要更改此方法。可在 “数据分析”视图中查看和打印此方法的采集参数。

如果序列文件夹中保存了这些文件，则可以执行数据复查和再处理而不改变主方法或序列模板。如果需要，也可以将方法更改再次保存到主方法中。

单次运行的数据采集

对单次运行也引入了新的数据概念。在这种情况下，数据文件直接保存到各自的子目录中。因为单次运行只使用一个方法，该方法无需复制到子目录中；因此所有操作都将直接用主方法执行。完成方法的采集部分之后，主方法的副本

(ACQ.M) 将保存到数据文件目录中。执行主方法的数据分析部分之后，将保存另一个副本 (DA.M)。

数据组织 15

2 数据采集数据采集

16 数据组织

安捷伦化学工作站新的化学工作站工作流程入门

3数据分析

数据分析 18数据分析：数据检查 21数据检查期间的化学工作站用户界面 28数据分析：数据再处理 30

本章将概述可用的数据分析和检查选项，并说明数据结构如何影响选项的选择。

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3 数据分析数据分析

数据分析

采集数据后，可在化学工作站 “数据分析”视图中对其进行分析。选择化学工作站资源管理器的 “数据”选项卡时，可双击对应符号调用某序列的所有运行或特定文件夹中的所有单次运行。相应的数据集随即出现在浏览表中。

浏览表的主要部分由数据集所有运行的列表组成。除了通过 “文件 / 调用信号”菜单调用运行之外，现在还可以通过双击浏览表中的相关行来将运行调入化学工作站内存。此外，右键单击某次运行也会出现几个选项，例如从文件调用或叠加特定信号、导出数据或者查看采集方法参数。

调用运行后，即可检查它，即调整数据分析参数、积分信号并最终打印报告。在这种情况下，将运行分析为单次运行时不考虑序列环境。

这种数据分析叫做“数据检查”。浏览表提供了图 6 中所示的工具组，使数据检查更为方便。

图 5. 从化学工作站资源管理器将序列调入浏览表

图 6. 浏览表的数据检查工具组

18 数据组织

数据分析 3数据分析

用这套工具组，您可以跳到浏览表的开头或末尾、步进到下次或上次运行、在运行之间自动步进，也可以停止自动步进。

分析数据的另一种方式是 “再处理”整个序列。在再处理期间，所有运行都会在序列环境中重新分析，即序列方法的校准表会在校准运行情况下更新，倍增器、含量等可在序列表中更改，新方法可添加到序列容器，等等。对再处理，浏览表提供了以下工具组：

请注意，浏览表中的数据再处理图标仅可用于化学工作站 B.02.01 和更高版本生成的序列数据。对单次运行数据、B.02.01 之前版本生成的数据、“生成专有文件夹”关闭 （请参阅第 4 章，专有文件夹创建关闭时的工作流程）时采集的数据，“数据分析”中的数据再处理不可用。B.02.01 之前版本采集的序列必须在“方法和运行控制”中再处理，将序列参数“要运行的方法部分”定义为“仅再处理”。对于化学工作站 B.02.01 和更高版本生成的序列，“方法和运行控制”中的再处理选项已删除（请参阅第 20 页的图 8），浏览表将再处理作为“数据分析任务”提供。

图 7. 浏览表的序列再处理工具组

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3 数据分析数据分析

图 8. 化学工作站 B.02.01 和更高版本的 “方法和运行控制”视图中的序列参数

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数据分析 3数据分析：数据检查

数据分析：数据检查

数据检查就是对每次运行都执行一次分析。使用化学工作站，您可以指定从浏览表调用数据文件时自动执行的缺省操作。这些操作包括调用后对色谱进行积分之类的数据分析任务，以及指定要调用的方法。

检查（不用于再处理）的相应选项可在“首选项”对话框的“检查 / 信号选项”选项卡上设置。

第一部分 “调用信号选项”指定调用运行中的哪些信号，以及是否在调用后直接对色谱进行积分并报告结果。

在第二部分“数据检查选项”中，您可以配置在“浏览表”中的运行之间自动步进的间隔。

图 9. “首选项”对话框 / “信号 / 检查选项”选项卡

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3 数据分析数据分析：数据检查

本部分的其余部分指定从浏览表调用运行时，数据检查期间调用哪个方法。它们仅适用于数据检查，不适用于数据再处理。对序列运行和单次运行，有以下单独的选项设置可用：

保留 “现有方法”

要使用当前调用的方法时，应始终使用 “现有方法”检查设置。在这方面，对于数据检查来说现有方法和调用的单次运行数据文件或序列容器文件无关。该设置应用于方法开发、创建校准表或其他更新等等。例如，以不同浓度多次运行序列以优化积分参数，随后建立校准表。因为这些数据分析参数更改要用于将来的所有采集运行，所以必须将它们应用于主方法。为此，选择 “首选项”对话框中的“现有方法”选项，请参阅图 10。这确保了对调用的每次运行，内存中始终保留同一方法。

表 1. 序列和单次运行数据的数据检查选项

用于浏览序列数据的方法 用于浏览单次运行数据的方法

现有方法 现有方法

序列方法 从数据文件调用单个方法 (DA.M)

从数据文件调用单个方法 (DA.M)

22 数据组织

数据分析 3数据分析：数据检查

调用主方法 （最方便的途径是从化学工作站资源管理器的 “主方法”选项卡调用）。

现在，优化积分参数并用运行建立校准表。将来所有使用此方法进行的采集都将应用优化过的数据分析参数。

调用 “序列方法”

特定于序列的事件还可能需要和该序列一起使用的所有方法中的更改。检查每次运行并改进序列方法后，就可以用更新过的方法再处理整个序列。

在这种情况下，用 “序列方法”选项检查数据 （请参阅图 11）。

图 10. 保留数据检查的现有方法

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3 数据分析数据分析：数据检查

这表示每次从浏览表调用运行时，将调用该运行的序列行所对应的序列方法。

数据检查完成后，可能需要再处理整个序列，以便不仅在每次运行的基础上应用方法更改，而且在整个序列环境中都应用 （包括校准表更新等等）。

调用数据文件的单个方法 (DA.M)

如果您希望将单个 DA.M 随相应的数据文件一起自动调用 （用浏览表调用此文件时），应使用检查设置“数据文件的单个方法 (DA.M)”（请参阅图 12）。更改方法随后调用下次运行时，会要求您保存方法更改，因为您调用了新方法：下次运行的 DA.M。

不同的工作流程可能要求您始终在调用单个数据分析方法 (DA.M) 时检查数据。例如，所有运行都调用 DA.M 时，分析结果和采集期间或上次数据再处理期间的结果相同。此外，也可以执行特定于运行的更改，并将它们保存在该运行的单独数据分析方法中。这对于手动积分事件尤其有用。

图 11. 调用序列方法进行数据检查

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数据分析 3数据分析：数据检查

使用单个数据分析方法 (DA.M)，可以方便地将手动积分事件仅保存至特定数据文件。这样，您使用自动检查和打印报告时，特定手动积分的报告就一目了然了。

使用以下步骤将手动积分事件复制到方法：

1 执行手动积分，直到结果令人满意。

2 选择积分 / 将手动事件复制到方法。

图 12. 从数据文件调用单个方法进行数据检查

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3 数据分析数据分析：数据检查

如果手动事件已保存到单个方法 （而不是相应主方法之类），则对色谱图积分时始终应用这些事件可能很有用：

3 在 “积分事件”对话框中选中 “手动事件”选项 （请参阅图 14）。

4 保存方法。

图 13. 将手动积分事件复制到方法

图 14. 每次对色谱图积分时都应用手动积分事件

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数据分析 3数据分析：数据检查

注意 再处理序列时，会在序列方法上执行所有操作并覆盖每个数据文件的 DA.M，包括手动积分事件。

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3 数据分析数据检查期间的化学工作站用户界面

数据检查期间的化学工作站用户界面

化学工作站用户界面提供了许多功能，以方便您使用不同的数据分析方法（图 15）。

• 方法的修改状态显示在“数据分析”视图中，如果有未保存的方法更改，您会很容易注意到。用户界面始终显示当前调用的方法名称（并指出它是某数据文件的单个数据分析方法还是序列方法）

• 此外，将鼠标指针移到该字段上时，会有一条工具提示显示该方法的完整路径和名称

• 通过下拉框可快捷地访问“首选项”对话框中该方法的选项。您可以直接启用任何可用选项，该选项会在下次从浏览表调用运行时应用。此外，查看当前激活的选项也很方便。请注意，这些选项仅适用于数据检查，不适用于数据再处理

更新主方法功能

开发单个数据分析方法时，您可决定将为单个方法开发的数据分析参数用于序列或主方法。在浏览表中右键单击相应的运行，即可用数据分析参数更新序列或主方法。

图 15. 数据分析中的用户界面

28 数据组织

数据分析 3数据检查期间的化学工作站用户界面

该功能在以下情况下可用：

该功能只更新目标方法的数据分析参数并将覆盖所有数据分析参数，注意到这点很重要。

图 16. 更新主方法或序列方法

表 2. 更新方法功能的可用性

已调用的方法 可用选项

单个数据分析方法 (DA.M) 更新主方法

更新序列方法

序列方法 更新主方法

主方法 —

注意 由于技术原因，除了数据分析参数外，目标方法的方法更改历史也会被源方法的历史所覆盖。

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3 数据分析数据分析：数据再处理

数据分析：数据再处理

与数据检查相比，序列再处理意味着序列环境中某序列的所有运行都将重新分析，也就是包括校准表更新、序列表中的参数变更以及在序列中添加新方法等等。

根据新的数据组织概念，序列容器包含再处理需要的所有文件：数据文件、序列文件的副本以及所有原来随采集使用的序列方法。因此，为了再处理序列，只需将它调入浏览表即可使用所需工具组。

关于再处理，请注意以下规则：

• 所有操作都在序列方法上执行。如果要应用更改过的分析参数，必须更改序列方法

• “首选项”对话框的方法调用设置对再处理没有影响；它始终应用于序列方法或更新过的序列方法。该功能组仅可用于检查

• 再处理期间，批处理 (*.b) 文件、序列 / 单次运行日志 (*.log)、浏览表和每个已处理数据文件的单个数据分析方法 (DA.M) 都将更新

• 如果要将新的方法从主方法目录之一添加到序列表，则必须用方法列表中的“浏览”项目浏览至任何指定方法目录 （如果不浏览，则只有已在序列容器中的方法可用）。再处理期间，新方法也将复制到序列容器。这意味着您不能选择与容器中已有方法同名的方法

图 17. 序列再处理的工具组

30 数据组织

数据分析 3数据分析：数据再处理

• 在序列表中不能添加或删除行

• 在 “序列参数”对话框中，只能更改操作者名称、序列注释和序列表使用信息。其他所有字段都必须在数据采集期间设置，否则不会应用于再处理

图 18. 浏览至序列表中的主方法目录

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3 数据分析数据分析：数据再处理

图 19. 数据分析中的序列参数

32 数据组织

安捷伦化学工作站新的化学工作站工作流程入门

4专有文件夹创建关闭时的工作流程

本章将介绍 “专有文件夹创建关闭”时的工作流程，此时您可以如同在化学工作站 B.01.03 或更早版本中那样保存数据。该模式不能充分利用化学工作站中最新的数据检查和再处理功能的优点。

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4 专有文件夹创建关闭时的工作流程专有文件夹创建打开还是关闭？

专有文件夹创建打开还是关闭？

以上章节中所述的新数据概念可提供很多优势：

• 序列数据不会被覆盖。每次序列采集都会将结果数据文件以唯一名称保存在自己的序列容器中

• 有了序列容器概念，数据保存时已带有数据分析所需的所有必要信息，即序列文件的副本和随序列使用的所有方法。这些方法可用针对序列的输入更改，而不影响原始主方法。因此，容器概念加强了序列的意义，即共同用于生成结果的数据文件和方法的集合

• 通过浏览表，可在 “数据分析”视图中同时实现数据检查和数据再处理

• 数据容器概念为化学工作站与安捷伦企业内容管理器 (ECM) 的集成提供了最佳的预调节

但是，有时用户可能希望如同在化学工作站 B.01.03 或更早版本中那样保存数据，并根据相应工作流程工作：

• 在方法的开发期间，采集和数据分析只用一种方法较为方便，这样将来的采集和已采集数据的重新分析都可以自动使用更改

• 分几次采集的数据必须放在一个文件夹中，例如部分采集的情况

• 为较早版本设计的化学工作站系统上自定义的宏解决方案可能会要求根据旧的数据组织模式存储数据、方法或序列

• 如果运行化学工作站 B.03.01 的实验室中，还有其他运行化学工作站 B.01.03 或更早版本的系统存在，则在所有系统上使用相同的数据组织模式可能更方便

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专有文件夹创建关闭时的工作流程 4专有文件夹创建关闭时的工作流程

专有文件夹创建关闭时的工作流程

为了能如同在 B.02.01 版本之前的化学工作站中那样使用数据存储概念，“首选项”对话框的“序列”选项卡有一个“数据存储”部分。在这里您可以选择“专有文件夹创建打开”或“专有文件夹创建关闭”( 图 20)。缺省情况下将选中“专有文件夹创建打开”。选择 “专有文件夹创建打开”可启用以上三章所述的数据存储概念。

图 20. 首选项对话框 / 序列选项卡

注意 在“专有文件夹创建打开”和“专有文件夹创建关闭”之间切换只影响将来的采集，但不会改变已采集数据的数据组织。

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4 专有文件夹创建关闭时的工作流程专有文件夹创建关闭时的工作流程

选择 “专有文件夹创建关闭”对数据存储有以下影响：

• 序列数据不会采集到序列容器中，而是直接进入“序列参数”中指定的子目录

( 第 13 页的图 3)。因此，序列名称模式在“首选项”对话框的“序列”选项卡上呈灰色显示 ( 第 35 页的图 20)

• 这意味着两次或更多次序列采集的数据可能会采集到同一子目录中。这样会有覆盖现有数据的危险，但另一方面也可以用部分序列执行来分割序列，并仍将结果结合在一个文件夹中 （专有文件夹创建打开时是不能实现的）

• 序列方法 (.M) 或序列文件的副本 (.S) 不会随数据保存，只保存序列日志文件和批处理文件 (.B)。这意味着只有“首选项”对话框 ( 第 12 页的图 2) 中指定路径中的方法和序列可用。它们必须同时用于采集、数据检查和数据再处理。针对序列或数据文件的方法更改，只能通过用不同名称保存方法来存储。否则，这些更改也会应用到采集方法。另一方面，方法开发期间可能正希望如此

注意 建议您开始工作时就决定好用哪种模式，不要在两者之间切换。

如果已集成化学工作站 ECM 或已安装 ChemStore / 安全软件包，则不能切换到“专有文件夹创建关闭”。

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专有文件夹创建关闭时的工作流程 4专有文件夹创建关闭时的工作流程

• 没有存储针对数据文件的方法 ACQ.M 和 DA.M。要保存原始采集的信息，只能将这些信息包含在报告中，或者在该方法的运行时选项表中选择“将方法和数据保存在一起” ( 图 21)。使用该选项，采集方法将在每个数据文件中保存为RUN.M

图 21. 运行时选项表：将方法和数据保存在一起

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4 专有文件夹创建关闭时的工作流程专有文件夹创建关闭时的工作流程

和化学工作站 B.02.01 一起引入的增强型化学工作站用户界面，在 “专有文件夹创建”关闭时也可用。但是，在此模式中有些功能无法使用。同样的限制也适用于用 B.02.01 之前的化学工作站采集的运行。

• 序列调入浏览表时，数据再处理工具组将呈灰色显示 (图 22)。在此数据存储模式中采集的序列，只能用 “序列参数”中的 “仅再处理”选项在 “方法和运行控制”视图中进行再处理 ( 图 23)

图 22.“专有文件夹创建”关闭时采集的序列的浏览表

图 23.“专有文件夹创建”关闭时采集的序列数据的再处理

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专有文件夹创建关闭时的工作流程 4专有文件夹创建关闭时的工作流程

• 采用方法使用选项“使用来自数据文件的方法”和“使用序列方法”（请参阅第 21 页的“数据分析：数据检查” ）时，每当双击浏览表中的某个运行时，若单个方法 / 序列方法不存在，则都会显示警告信息。如上所述，这些方法不会随数据存储。在这种情况下，对于数据检查来说唯一有意义的选项就是“使用当前方法”

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4 专有文件夹创建关闭时的工作流程专有文件夹创建关闭时的工作流程

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内容提要

自化学工作站 B.02.01 版以来，数据检查和数据再处理功能已得到显著改进，能更快地检查结果数据。

化学工作站的新数据存储功能有助于高效地组织序列数据和方法。