NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE...

31
NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMA

Transcript of NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE...

Page 1: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

NIVOI ORGANIZACIJE I

EKSPRESIJE GENOMA

Page 2: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

PROKARIOTI EUKARIOTI

Page 3: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

REGULACIJA GENSKE AKTIVNOSTI KOD EUKARIOTA

Page 4: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Eksperimenti koji potvrđuju totipotentnost jedra (potencijal da se razviju svi tipovi ćelija adultnog organizma)

Page 5: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao
Page 6: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

TRANSPLANTACIJA JEDRA

Page 7: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

KLONIRANJE KRAVE

Page 8: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Postupak transplantacije jedra

ANIMACIJA

https://www.youtube.com/watch?v=bbZiOiPVG6c

Page 9: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

U jajnu ćeliju sisara naslonjenu na tupu pipetu (levo)

unosi se genetički materijal (jedro) diploidne ćelije

tankom pipetom (desno)

jedro

Page 10: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Dolly, prva klonirana ovca

Page 11: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Cookies and Cream, su dve klonirane krave Holstein rase

uzrasta dve godine. Dobile su zdrave potomke – muškog i

ženskog pola na privatnoj farmi Infigen u SAD. To je farma sa

najvećim brojem (165) kloniranih krava i ovaca.

Page 12: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Osnovni nivoi kontrole

ekspresije gena

kod eukariota

Page 13: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao
Page 14: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

METILACIJA CITOZINA UMANJUJE EKSPRESIJU GENA

Page 15: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Metilacija citozina u

CG sekvencama molekula DNK

Page 16: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Inaktivacija gena

metilacijom citozina

Page 17: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Lokalne promene

strukture hromatina

Page 18: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Shematski prikaz pozitivne (a) i negativne (b)

regulacije genske aktivnosti na nivou transkripcije

KONTROLA TRANSKRIPCIJE

Page 19: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Kontrolni regioni tipičnog eukariotskog gena

Page 20: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Vezivanje dva proteina za različita mesta na molekulu DNK može

u velikoj meri da poveća verovatnoću njihove interakcije

Page 21: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Aktivacija transkripcije

kod eukariota

enhenser

Page 22: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Stimulatorski nizovi nukleotida u DNK (enhenseri,

engl. to enhance – pojačati) predstavljaju DNK sekvence

koje nakon vezivanja regulatornih proteina dovode do naglog

porasta aktivnosti gena. Ovi nizovi nukleotida mogu se nalaziti

na hiljade baznih parova (do 50 000) uzvodno ili nizvodno od

gena čiju aktivnost povećavaju.

Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su

kao sajlenseri (engl. scilence – tišina).

Page 23: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Alternativna obrada

primarnog transkripta

humanog gena za kalcitonin rezultuje

stvaranjem tkivno-specifičnih produkata.

U tkivu paratireoidnih žlezda stvara se

polipeptidini hormon kalcitonin,

a u nervnim ćelijama CGRP protein

(od engl. calcitonin gene-related peptide)

Page 24: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Kontrola transporta iRNK predstavlja regulaciju prelaženja

transkripata iz jedra u citoplazmu. Od veomaheterogene grupe

primarnih transkripata gena za kodiranje proteina

(tzv. hnRNK, heterogena nuklearna RNK) najmanje 50% nikada

ne napusti jedro već se u njemu razgrađuje.

Page 25: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Kontrola translacije ostvaruje tako što ribozomi odabiraju iRNK

koja će se prevesti u protein. Mehanizmi čuvanja iRNK nisu sasvim

jasni, ali ima indicija da su iRNK najčešće u asocijaciji sa

proteinima koji ih štite od razlaganja i istovremeno sprečavaju da

translacija otpočne. Pored toga, zna se da poli-A rep promoviše

translaciju.

Page 26: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Kontrola razlaganja iRNK odnosi se na stepen degradacije iRNK

u citoplazmi. Poznato je da su tRNK i rRNK veoma stabilne,

što je sasvim logično kada se ima u vidu da mogu da učestvuju

u translaciji bilo kog proteina. Nasuprot tome, molekuli iRNK imaju

različit opseg stabilnosti – neke ostaju u citoplazmi mesecima,

a druge se razlože posle svega nekoliko minuta.

Page 27: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Posttranslacioni mehanizmi kontrole genske aktivnosti obuhvataju

modifikacije i kontrolu razlaganja proteina. Degradacija proteina

kod eukariota kontrolisana je široko rasprostranjenim proteinskim

faktorom (ubikvitin). Vezivanje za ubikvitin predstavlja signal za

enzimsko razlaganje proteina.

Page 28: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Embrion miša

u kome je

pokazana

ekspresija

gena za nogin

u mozgu i skeletu

Page 29: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

HIBRIDIZACIJA NUKLEINSKIH KISELINA

Page 30: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Fluorescentna in situ hibridizacija (FISH)

Page 31: NIVOI ORGANIZACIJE I EKSPRESIJE GENOMAbiologija.vet.bg.ac.rs/Katedra/...aktivnosti_gena_Eukaryota_ANIMACIJA.pdf · Nizovi nukleotida koji umanjuju aktivnost gena označeni su kao

Ćelija HeLa u deobi: mikrotubule su obojene ljubičasto, DNK belo,

a zelenom bojom prestavljen je proteinski produkt GFP gena