LAIKA-FĀZES VARIĒJOŠA MAGNĒTISKĀ LAUKA IETEKME UZ ... · 3 ANNOTATION Of the Thesis...
Transcript of LAIKA-FĀZES VARIĒJOŠA MAGNĒTISKĀ LAUKA IETEKME UZ ... · 3 ANNOTATION Of the Thesis...
Dace Avotiņa
LAIKA-FĀZES VARIĒJOŠA
MAGNĒTISKĀ LAUKA IETEKME
UZ NUKLEĪNSKĀBJU PIEGĀDES
EFEKTIVITĀTI VĒŽA ŠŪNĀS
Promocijas darbs
medicīnas doktora zinātniskā grāda iegūšanai
Specialitāte teorētiskā medicīna
Darba zinātniskie vadītāji:
Dr. biol. Mihails Bariševs
Dr. biol. Svetlana Kozireva
Promocijas darbs izstrādāts ar ESF projekta “Atbalsts doktorantiem studiju programmas
apguvei un zinātniskā grāda ieguvei Rīgas Stradiņa universitātē” atbalstu
Rīga, 2016
2
ANOTĀCIJA
Gēnu piegāde ir viens no problemātiskākajiem posmiem gēnu terapijā, jo ietver ne tikai
terapeitiskā gēna aizvadīšanu līdz šūnām, bet arī efektīvu piesaisti šūnas membrānai ar sekojošu
ieslēgšanu šūnā un migrāciju šūnas iekšējā vidē līdz kodolam. Magnetofekcija ir viena no
efektīvākajām fizikālajām gēnu piegādes metodēm, kuras pamatā ir ar superparamagnētiskajām
nanodaļiņām (SPION) saistītu nukleīnskābju paātrināta koncentrēšana uz šūnu virsmas un
piegāde šūnās, izmantojot spēcīgu ārējo magnētisko lauku.
Permanentu magnētu radītā statiskajā magnētiskajā laukā SPION kustība šķīdumā
virzienā pret magnētu ir aksiāla. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka, kas tiek ģenerēts ar
magnetofekcijas iekārtas DynaFECTOR palīdzību, pamatā ir permanentu magnētu plates
orbitāla rotācija šūnu kultūras platei paralēlā plaknē.
Datormodelēšanas rezultātā tika noskaidrots, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka
ietekmē notiek SPION aksiāli laterāla kustība magnētam paralēlā un perpendikulārā plaknē.
Tas veicina SPION vienmērīgāku sedimentāciju uz virsmas un varētu būt par iemeslu
paaugstinātai SPION-nukleīnskābju kompleksu ieslēgšanai šūnās.
Šajā pētījumā eksperimentāli tika pārbaudīta laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka
ietekme uz SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu piegādes efektivitāti
vēža šūnās.
Iegūtie rezultāti parādīja, ka laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, salīdzinot ar
statisko magnētisko lauku notiek vienmērīgāka SPION sedimentācija uz virsmas un
paaugstinās šūnās ieslēgto SPION daudzums. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē
paaugstinās arī SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu piegāde šūnās, par
ko liecina būtiski paaugstināts gan transficēto šūnu skaits, gan arī kopējais ekspresētā proteīna
līmenis transficētajās šūnās, salīdzinot ar citām gēnu piegādes metodēm. Savukārt
vienmērīgāka sedimentācija uz virsmas laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē
nodrošina SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu piegādi šūnās ar
samazinātu citotoksisko efektu.
Šajā pētījumā aprakstīta uzlabota efektīva gēnu piegādes metode – liposomālā
magnetofekcija laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, kuru varētu izmantot mutēto gēnu
aizstāšanai un jaunu terapeitisku siRNS inhibējošā efekta pētījumiem in vitro šūnu līnijās.
Metode perspektīvā varētu tikt pielietota arī terapeitisko gēnu pārnesē vēža šūnās in vivo.
3
ANNOTATION
Of the Thesis “Influence of the time-phase varied magnetic field on the nucleic acids
delivery into the cancer cells”
Gene delivery is one of the critical steps in gene therapy, including both efficient
delivery of the therapeutic gene to the target cells and attachment to the cell membrane with
following internalization and transfer to the nucleus.
Magnetofection is one of the most effective physical gene delivery methods based on
the increased delivery and concentration of nucleic acids coupling superparamagnetic iron
oxide particles (SPION) onto the cell surface by the influence of an external magnetic field.
In the static magnetic field generated by permanent magnets the movement of SPION
in solution is axial towards the magnet. The time-phase varied magnetic field which is generated
with the magnetofection device DynaFECTOR is based on the orbital rotation of the permanent
magnets plate in the parallel plane of the cell culture plate.
In the result of computer modelling it was shown that the orbital rotation of magnets
causes the axial-lateral movement of SPION in parallel and perpendicular plane against the
magnet. This led to the more uniform distribution of SPION onto the surface and could be
a cause of the enhanced SPION-nucleic acids complexes internalization.
In this study the influence of the time-phase varied magnetic field on the delivery
efficiency of SPION-nucleic acids-liposomal component complexes into the cancer cells was
experimentally investigated.
Obtained results showed that in the time-phase varied magnetic field the SPION
sedimentation onto the surface is more uniform and the amount of internalized SPION increases
when compared to static magnetic field. Under the influence of the time-phase varied magnetic
field, the delivery of SPION-nucleic acids-liposomal component complexes also increases, as
evidenced by the significant increase in both the number of transfected cells and the total
amount of an expressed protein in transfected cells in comparison with other gene delivery
methods. While SPION-nucleic acids-liposomal component complexes delivery into the cells
with less cytotoxic effect in provided by more uniform sedimentation onto the surface.
In this study enhanced effective gene delivery method – the liposomal magnetofection
in the time-phase varied magnetic field is reported. The method could be used for the
replacement of mutated genes and for the investigation of the inhibition effect of novel
therapeutic siRNAs in vitro cell lines. The method could potentially used also for the
therapeutic gene delivery into the cancer cells in vivo.
4
SATURS
ANOTĀCIJA .............................................................................................................................. 2
ANNOTATION .......................................................................................................................... 3
DARBĀ LIETOTIE SAĪSINĀJUMI ......................................................................................... 5
IEVADS .................................................................................................................................... 8
1. LITERATŪRAS APSKATS ............................................................................................... 12
1.1. Gēnu terapijas attīstība un pielietojums vēža terapijā .................................................. 12
1.2. Gēnu terapijas stratēģijas, terapeitisko gēnu veidi ....................................................... 13
1.3. Terapeitisko gēnu piegādes metodes ............................................................................ 13
1.3.1. Vīrusu gēnu piegādes metodes.......................................................................... 14 1.3.2. Bezvīrusu gēnu piegādes metodes .................................................................... 15
1.3.2.1. Ķīmiskās gēnu piegādes metodes. .......................................................16
1.3.2.2. Fizikālās gēnu piegādes metodes ........................................................ 17
2. MATERIĀLS UN METODES ............................................................................................ 36
2.1. Materiāls ....................................................................................................................... 36
2.1.1. Šūnu līnijas........................................................................................................ 36
2.2. Metodes ......................................................................................................................... 36
2.2.1. SPION sedimentācijas profila noteikšana ......................................................... 38
2.2.2. Plazmīdu DNS iegūšana ................................................................................... 38
2.2.3. Transfekcija ar plazmīdu DNS un siRNS ......................................................... 39
2.2.4. Transgēna ekspresijas detekcija un analīze....................................................... 43
2.2.5. Citotoksicitātes noteikšana ................................................................................ 45
2.2.6. Dzelzs satura noteikšana šūnās ......................................................................... 46
2.2.7. Datu statistiskā analīze ...................................................................................... 47
3. REZULTĀTI ....................................................................................................................... 48
3.1. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz SPION sedimentāciju ................. 48
3.2. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz gēnu piegādi vēža šūnās ............. 48
3.2.1. LM LFV – reakcijas optimālie apstākļi ............................................................ 48 3.2.2. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz nukleīnskābju piegādes
efektivitāti šūnās ............................................................................................... 55
3.2.3. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka pielietojuma citotoksiskais efekts ..... 62 3.3. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz SPION piegādes efektivitāti
vēža šūnās ..................................................................................................................... 63
DISKUSIJA .............................................................................................................................. 66
SECINĀJUMI .......................................................................................................................... 72
IZMANTOTĀ LITERATŪRA ................................................................................................ 73
PUBLIKĀCIJAS UN ZIŅOJUMI PAR PĒTĪJUMA TĒMU ................................................. 81
PATEICĪBAS ........................................................................................................................... 83
PIELIKUMI .............................................................................................................................. 84
5
DARBĀ LIETOTIE SAĪSINĀJUMI
SAĪSINĀJUMS SKAIDROJUMS ANGĻU
VALODĀ
SKAIDROJUMS
LATVIEŠU VALODĀ
9L Rattus norvegicus brain glioma
cell line
Rattus norvegicus smadzeņu
gliomas šūnu līnija
A549 human lung adenocarcinoma
cell line
cilvēka plaušu
adenokarcinomas šūnu līnija
AAV adeno asociated virus adenoasociētais vīruss
ADA-SCID adenosine deaminase severe
combined immunodeficiency
iedzimts adenozīna deamināzes
trūkums, kas izraisa
imūndeficītu
Ag silver sudrabs
AO/EB Acridine Orange/Ethidium
Bromide staining
atkrāsošana ar etīdija
bromīda/akridīna oranža
maisījumu
ASV United States of America Amerikas Savienotās Valstis
Au gold zelts
BCL2 apoptosis regulator BCL-2 apoptozes regulators BCL-2
BIRC5 baculoviral inhibitor of
apoptosis repeat-containing 5
bakulovīrusa apoptozo
atkārtojumu motīva inhibitors
5
BT-20 human breast adenocarcinoma
cell line
cilvēka krūts adenokarcinomas
šūnu līnija
C6 Rattus norvegicus brain glioma
cell line
Rattus norvegicus smadzeņu
gliomas šūnu līnija
Caco-2 human colorectal
adenocarcinoma
cilvēka kolorektālās
adenokarcinomas šūnu līnija
CAPAN-2 human pancreas
adenocarcinoma cell line
cilvēka aizkuņģa dziedzera
adenokarcinomas šūnu līnija
CM CombiMAG magnetic
nanoparticles
CombiMAG magnētiskās
nanodaļiņas
CoO cobalt oxide kobalta oksīds
Cos7 African green monkey kidney
fibroblast-like cell line
Āfrikas zaļā pērtiķa nieru
fibroblastu šūnu līnija
DEAE-DEXTRAN diethylaminoethyl dextrane dietilaminoetildekstrāns
DNS deoxyribonucleic acid dezoksiribonukleīnskābe
DPBS Dulbecco’s phosphate buffered
saline
Dulbeko fosfātbuferis
E. Coli Escherichia coli Escherichia coli (zarnu nūjiņa)
ECFP-ERp29pDNS plasmid DNA containing
ECFP-ERp29 gene
ECFP-ERp29 gēnu saturošas
plazmīdas DNS
EDTA ethylenediaminetetraacetic
acid
etilēndiamīntetraetiķskābe
EPR enhanced permeability and
retention effect
pastiprinātas caurlaidības un
aiztures efekts
ES European Union Eiropas Savienība
FBS fetal bovine serum teļa embrionālais serums
FDA Food and Drug administration Pārtikas uz zāļu pārvalde
Fe2+ ferrum (II) ion dzelzs (II) jons
Fe3+ ferrum (III) ion dzelzs (III) jons
6
Fe3O4 magnetite magnetīts
FIX fixative fiksatīvs
GM-CSF granulocyte-macrophage
colony-stimulating factor
granulocītu-makrofāgu
koloniju stimulējošais faktors
HeLa human cervix adenocarcinoma
cell line
cilvēka dzemdes kakla
adenokarcinomas šūnu līnija
HEPG2 human hepatocellular
adenocarcinoma cell line
cilvēka hepatocelulārās
adenokarcinomas šūnu līnija
HER-2/neu human epidermal growth factor
receptor 2
cilvēka epidermālā augšanas
faktora receptors 2
HPRT hypoxanthine-guanine
phosphoribosyltransferase
hipoksantīna-guanīna-
fosforiboziltransferāze
Il-12 interleukin-12 interleikīns-12
Jurkat human acute T cell lymphoma
cell line
cilvēka akūtas T šūnu
limfomas šūnu līnija
L lipofection lipofekcija
L siRNS co-lipofection with siRNA ko-lipofekcija ar siRNS
LacZpDNS plasmid DNA containing LacZ
gene
LacZ gēnu saturošas plazmīdas
DNS
LB Luria Bertrani medium Luria Bertrani barotne
LIP Lipofectamine2000 transfection
reagent
Lipofectamine2000
transfekcijas reaģents
LM liposomal magnetofection liposomālā magnetofekcija
LM LFV liposomal magnetofection in
time-varied magnetic field
liposomālā magnetofekcija
laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā
LM LFV siRNS co-liposomal magnetofection in
time-varied magnetic field with
siRNA
ko-liposomālā magnetofekcija
laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā ar siRNS
LM siRNS co-liposomal magnetofection
with siRNA
ko-liposomālā magnetofekcija
ar siRNS
LS-174T human colorectal
adenocarcinoma cell line
cilvēka kolorektālās
adenokarcinomas šūnu līnija
miRNS micro ribonucleic acid mikro ribonukleīnskābe
mRNS messenger ribonucleic acid matricas ribonukleīnskābe
NCI-H441 human lung adenocarcinoma
cell line
cilvēka plaušu
adenokarcinomas šūnu līnija
NCTC 1469 mouse hepatoma cell line peļu hepatomas šūnu līnija
NdFeB neodymium-iron-boron neodīms-dzelzs-bors
NM23-H1 tumor metastasis suppresor
NM23-H1
audzēja metastāžu supresors
NM23-H1
OTD ornithine transcarbamylase
deficiency
ornitīna transkarbamilāzes
trūkums
p53 tumor suppressor prorein p53 audzēja supresorproteīns p53
PAMAM
DENDRIMERS
polyamidoamine dendrimers poliamidoamīna dendrimēri
PB Prussian blue staining prūšu zilā atkrāsošanas metode
PBS phosphate buffered saline fosfātbuferis
PC3 human prostate
adenocarcinoma cell line
cilvēka prostatas karcinomas
šūnu līnija
7
pcDNA3.1™/His/LacZ mammalian expression vector
containing LacZ gene coding
for enzyme β-galactosidase
Β-galaktozidāzes ekspresiju
kodējošs LacZ gēnu saturošs
vektors ekspresijai zīdītāju
šūnās
pDNS plasmid DNA plazmīdas DNS
pECFP-ERp29 mammalian expression vector
containing ECFP-ERp29 gene
coding for fusion enhanced
cyan fluorescent protein-
endoplasmatic reticulum
protein 29
sapludinātā zaļi fluorescējošā
proteīna-endoplazmatiskā tīkla
proteīna 29 ekspresiju kodējošs
ECFP-ERp29 gēnu saturošs
vektors ekspresijai zīdītāju
šūnās
PEG polyethylene glycol polietilēnglikols
PEI polyethylenimine polietilēnimīns
PLL poly-L-lysine polilizīns
PSMA prostate specific membrane
antigen
prostatas specifiskais
membrānas antigēns
PVA polyvinyl alcohol polivinilspirts
RNS ribonucleic acid ribonukleīnskābe
SDS-PAGE sodium dodecyl sulphate-
polyacrylamide gel
electrophoresis
nātrija dodecilsulfāta
poliakrilamīda gela
elektroforēze
SiO2 silicon dioxide silīcija dioksīds
siRNS small interference ribonucleic
acid
mazā interferences
ribonukleīnskābe
SKOV-3 human ovary adenocarcinoma
cell line
cilvēka olnīcas
adenokarcinomas šūnu līnija
SN standard deviation standartnovirze
SPION superparamagnetic iron oxide
nanoparticle
superparamagnētiskā dzelzs
oksīda nanodaļiņa
TNF tumor necrosis factor tumora nekrozes faktors
X-SCID X-linked severe combined
immunodeficiency
ar X hromosomu saistīts smags
kombinēts imūndeficīts
α-Fe3O4 hematite hematīts
γ-Fe2O3 maghemite maghemīts
8
IEVADS
Tēmas aktualitāte un problēmas nostādne
Vēzis ir nekontrolēta šūnu augšana, kas rodas vairāku gēnu somatisku mutāciju un
epiģenētisku izmaiņu rezultātā.
Gēnu terapija ir terapijas veids, kas balstīts uz viena vai vairāku gēnu, kas kodē
normālus, funkcionālus proteīnus ievadīšanu pacienta šūnu ģenētiskajā materiālā ar mērķi
aizstāt mutēto gēnu (-us) (Mehier-Humbert and Guy, 2005; Dick et al., 2015).
Mūsdienās zināmi vairāki simti dažādu gēnu (> 1% no cilvēka genoma), kuru mutācijas
ir saistītas ar vēža veidošanos (Futreal et al., 2004; Wishhart, 2015), taču gēnu terapija lielā
mērā ir eksperimentāla ārstēšanas metode un tikai nedaudzi gēnu terapijas līdzekļi tiek pielietoti
klīnikā.
Gēnu piegāde ir viens no problemātiskākajiem posmiem gēnu terapijā, jo ietver ne tikai
terapeitiskā gēna aizvadīšanu līdz šūnām, bet arī efektīvu piesaisti šūnas membrānai ar sekojošu
internalizāciju un migrāciju šūnas iekšējā vidē līdz kodolam.Turklāt šo procesu apgrūtina pašu
terapeitisko līdzekļu – nukleīnskābju īpašības – sliktā difundētspēja caur šūnas membrānu to
izmēru, negatīvā lādiņa un hidrofilitātes dēļ (Jafari et al., 2012). Gēnu piegādes iznākums ir
tieši atkarīgs no izvēlētās vektorsistēmas – tai ir jābūt efektīvai, specifiskai un drošai, bet ideālu
gēnu piegādes vektoru raksturo virkne īpašību (Somia and Verma, 2000; Ibraheem et al., 2014):
efektīvā veidā piesaistās terapeitiskajam gēnam neatkarīgi no tā lieluma un formas;
aizsargā terapeitisko gēnu no seruma, ekstracelulāro un intracelulāro endonukleāžu
degradējošās iedarbības;
nodrošina terapeitisko gēnu piegādi noteiktās dalošās un nedalošās mērķšūnās
neatkarīgi no to lokalizācijas vietas un integrētības apkārtējos audos;
ir neimunogēna;
ir netoksiska.
Gēnu piegāde šūnās, izmantojot vīrusu vektorsistēmas, ir visbiežāk pielietotais gēnu
piegādes veids. Vīrusiem piemītošās dabiskās īpašības – spēja viegli pārvarēt šūnas membrānas
barjeru, stimulējot endocitozes procesus, un ekspresēt vīrusa gēnus, izmantojot saimniekšūnas
biosintēzes mehānismu, padara tos par efektīviem gēnu piegādes līdzekļiem (Mulligan, 1993).
Neskatoties uz to, tiem piemīt vairāki būtiski trūkumi – vīrusa proteīnu imunogenitāte, kas var
izraisīt spēcīgu organisma imūno atbildi un augsta citotoksicitāte pie lielām vīrusa devām
(Teramato et al., 2000; Anson, 2004). Pastāv arī zināms inserciju mutaģenēzes risks, kas var
9
novest pie onkogēnu aktivācijas, kā arī nejauša infekciozu vīrusa daļiņu veidošanās (Lachmann
and Davies, 1997; Thrasher et al., 2006; Bushman, 2007). Bezvīrusu – ķīmiskajiem un
fizikālajiem vektoriem ir vairākas priekšrocības, salīdzinot ar vīrusu vektoriem. Tie ir viegli
sintezējami un ekspluatējami, spēj pārnest neierobežota garuma un daudzuma kodējošās
sekvences un tiem ir zema imunogenitāte (Ruβ and Wagner, 2007). Liela daļa ķīmisko vektoru
ir katjoniski savienojumi. Tādējādi tie spēj efektīvi piesaistīties gan negatīvi lādētajiem
fosfātiem, kas ir nukleīnskābju ķēdes skeleta pamatā, veidojot stabilu kompleksu, gan arī
negatīvi lādētajai šūnas membrānai. Piemēram, katjoniski lipīdi veido sfēriskas, hidrofobas
struktūras – liposomas, kur terapeitiskais gēns ir iekapsulēts lipīdu dubultslānī (Fraley et al.,
1980). Liposomu formēšanās procesā lipīda pozitīvi lādētā hidrofilā daļa piesaistās
nukleīnskābes ķēdes skeleta garumā, bet hidrofobās daļas, savstarpēji mijiedarbojoties, aizkavē
hidrofilās daļas atdalīšanos un vienlaicīgi kalpo kā pārklājums, nodrošinot nukleīnskābes
aizsardzību (Kennedy et al., 2000; Oberle et al., 2000). Šis mehānisms padara liposomu mediētu
gēnu piegādi jeb lipofekciju par vienu no efektīvākajām un visplašāk pielietotajām metodēm
visu veidu nukleīnskābju transficēšanai dažādās šūnu līnijās. Ķīmisko gēnu piegādes vektoru
galvenais trūkums ir augstā citotoksicitāte
(Moghimi et al., 2005; Hunter; Lv et al., 2006), tie ir ļoti jutīgi pat pret nelielām izmaiņām vides
pH, temperatūrā un sāļu koncentrācijā, tāpēc ir problemātisks to pielietojums in vivo pētījumos.
Fizikālas gēnu piegādes galvenā priekšrocība ir spēja pārvarēt vairākas ekstracelulārās un
intracelulārās barjeras, apejot vienu vai vairākus pasīvās gēnu piegādes posmus (Brunner et al.,
2002). Tādējādi tiek nodrošināta tieša piekļuve šūnas citoplazmai vai pat kodolam, kas nozīmē,
ka teorētiski šūnās iespējams piegādāt jebkuru membrānu necaurlaidīgu molekulu, un šāda
pieeja vienlaicīgi paaugstina gan gēnu piegādes kinētiku, gan arī efektivitāti. Magnetofekcija ir
viena no efektīvākajām fizikālajām gēnu piegādes metodēm. Tās pamatā ir ar
superparamagnētiskajām nanodaļiņām (SPION) saistītu nukleīnskābju paātrināta
koncentrēšana uz šūnu virsmas un piegāde šūnās, izmantojot spēcīgu ārējo magnētisko lauku.
Salīdzinot ar citām fizikālajām gēnu piegādes metodēm, magnetofekcijai ir vairākas
priekšrocības. Tās gadījumā tiek izmantoti dabiski piesaistes un internalizācijas mehānismi,
tādējādi netiek bojāta šūnas membrāna un rezultātā būtiski samazinās metodes citotoksicitāte
(Laurent et al., 2011; Sapet et al., 2011). Magnētiskā lauka iedarbība audos sniedzas 10–15 cm
dziļumā, līdz ar to magnētiskās nanodaļiņas vienmērīgi akumulējas ne tikai virsējos, bet arī
dziļākajos audu slāņos (Goudy et al., 2008). Magnetofekcijas efektivitāte ir atkarīga gan no
SPION fizikāli ķīmiskajām īpašībām, gan arī magnētiskā lauka parametriem – magnētiskās
intensitātes un magnētiskā lauka gradienta.
10
Permanenti magnēti rada savu patstāvīgu statisku magnētisko lauku, kur magnētiskā
lauka gradienta virziens ir vertikāls pa Z asi (Hofmann-Amtenbrink et al., 2009). Tādējādi
statiskā magnētiskā laukā SPION kustība šķīdumā virzienā pret magnētu ir aksiāla. Vairākās
publikācijās aprakstīts alternatīvu magnētisko lauku pielietojums, kas ietver kompleksu
magnētiskā spēka iedarbību uz SPION pa X-Y-Z asi. Šādu magnētisko lauku ietekmes rezultātā
tiek izmainīta SPION kustība šķīdumā – tā ir ne tikai aksiāla, bet var būt arī laterāla, oscilējoša
un rotējoša. Pastāv uzskats, ka izmainītas SPION kustības rezultātā tiek stimulēta to pārnese
caur šūnas membrānu, taču precīzs šīs parādības mehānisms līdz galam nav noskaidrots. Laika-
fāzes variējoša magnētiskā lauka, kas tiek ģenerēts ar magnetofekcijas iekārtas DynaFECTOR
palīdzību, pamatā ir permanentu magnētu plates orbitāla rotācija šūnu kultūrai paralēlā plaknē.
Datormodelēšanas rezultātā tika noskaidrots, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē
notiek SPION aksiāli laterāla kustība. Tā rezultātā sedimentācijas procesā SPION izvietojas
gan magnēta centrālajā daļā, gan pie ārējās robežas, kas veicina to vienmērīgāku sedimentāciju
arī uz virsmas. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz SPION-nukleīnskābju
kompleksu piegādes efektivitāti šūnās nav noskaidrota.
Darba mērķis
Izpētīt laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmi uz nukleīnskābju piegādes
efektivitāti vēža šūnās.
Darba uzdevumi
1. Salīdzināt superparamagnētisku dzelzs oksīda nanodaļiņu sedimentāciju šķīdumā
statiskajā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, izmantojot iekārtu DynaFECTOR.
2. Veikt eksperimentālu reakcijas apstākļu optimizāciju statiskajā un laika-fāzes
variējošā magnētiskajā laukā, izmantojot iekārtu DynaFECTOR, lai sasniegtu maksimālu
nukleīnskābju piegādes efektivitāti vēža šūnās.
3. Salīdzināt nukleīnskābju piegādes efektivitāti vēža šūnās starp dažādām gēnu
piegādes metodēm.
4. Salīdzināt dažādu gēnu piegādes metožu pielietošanas citotoksisko efektu vēža
šūnās.
5. Salīdzināt superparamagnētisku dzelzs oksīda nanodaļiņu internalizācijas efektivitāti
statiskajā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, izmantojot iekārtu DynaFECTOR.
11
Darba hipotēze
Laika-fāzes magnētiskā lauka ietekmē notiek superparamagnētisku dzelzs oksīda
nanodaļiņu pārvietošanās aksiāli laterālā virzienā, kas stimulē to iekļūšanu šūnās, tā paaugstinot
arī ar to saistīto nukleīnskābju piegādes efektivitāti.
Promocijas darba zinātniskā novitāte
Šajā pētījumā eksperimentāli tiks novērtēta laika-fāzes magnētiskā lauka ietekme uz
nukleīnskābju piegādes efektivitāti vēža šūnās in vitro un līdz ar to raksturota uzlabota gēnu
piegādes metode – liposomālā magnetofekcija laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā.
Metode varētu tikt pielietota efektīvākai gēnu piegādei dažādu veidu monoslāņa šūnu līnijās un
perspektīvā arī terapeitisko gēnu pārnesē vēža šūnās in vivo.
Promocijas darba struktūra un autora personīgais ieguldījums
Promocijas darbs uzrakstīts latviešu valodā uz 86 lpp. un sastāv no šādām sadaļām:
ievads, literatūras apskats, metodes, rezultāti, diskusija, secinājumi, publikāciju saraksts,
pateicības, izmantotā literatūra un pielikums. Promocijas darbs satur 29 attēlus un 14 tabulas.
Autore patstāvīgi veikusi visu eksperimentālo darbu, kā arī patstāvīgi apkopojusi un
analizējusi rezultātus un veikusi datu statistisko analīzi.
Pētījums izstrādāts Rīgas Stradiņa universitātes Augusta Kirhenšteina Mikrobioloģijas
un virusoloģijas institūtā laikā no 2010.–2013. gadam.
Pētījuma finansējuma avoti
1. ESF projekts “Jaunas starpnozaru zinātniskās grupas izveide uz nanotehnoloģijām
bāzētu pieeju izstrādei šūnu bioloģijā ar pielietojumu medicīnā”, vienošanās
Nr. 2009/0221/1DP/1.1.1.2.0/09/APIA/VIAA/074.
2. ESF projekts “Atbalsts doktorantiem studiju programmas apguvei un zinātniskā grāda
ieguvei Rīgas Stradiņa universitātē”, vienošanās
Nr. 2009/0147/1DP/1.1.2.1.2/09/IPIA/VIAA/009.
12
1. LITERATŪRAS APSKATS
1.1. Gēnu terapijas attīstība un pielietojums vēža terapijā
Vēzis ir nekontrolēta šūnu augšana, kas rodas vairāku gēnu somatisku mutāciju un
epiģenētisku izmaiņu rezultātā.
Gēnu terapija ir terapijas veids, kas balstīts uz viena vai vairāku gēnu vai gēnu
fragmentu, kas kodē normālus, funkcionālus proteīnus ievadīšanu pacienta šūnu ģenētiskajā
materiālā ar mērķi modificēt mutēto gēnu (-us) (Mehier-Humbert and Guy, 2005; Dick et al.,
2015).
Mūsdienās zināmi vairāki simti dažādu gēnu (> 1% no cilvēka genoma), kuru mutācijas
ir saistītas ar vēža veidošanos (Futreal et al., 2004; Wishhart, 2015).
Praktiskās gēnu terapijas pirmsākumi datējami ar 20.gs. 40.gadiem, kad Avery, McLeod
un McCarty eksperimentāli demonstrēja baktēriju Pneumococcus transformāciju ar DNS.
Pirmo reizi DNS ievadīšana eikariotu šūnās tika aprakstīta 1962. gadā, kad Szybalska un
Szybalski publicēja rezultātus par HPRT kodējoša gēna pārnesi cilvēka kaulu smadzeņu šūnu
mutantos, kas zaudējuši HPRT aktivitāti. Līdz ar šiem pētījumiem sākās strauja gēnu terapijas
virziena attīstība un 60.gados oficiāli tika formulēta “gēnu terapijas”, tolaik “gēnu ķirurģijas”
koncepcija tādu slimību ārstēšanai, kuras izraisa bojājumi gēnos (Tatum, 1966). 1990. gadā
ASV FDA apstiprināja pirmo gēnu terapijas izmēģinājumu pacientei ar
ADA-SCID – iedzimtu adenozīna deamināzes trūkumu, kas izraisa imūndeficītu
(Blaese et al., 1995). Drīz pēc tam 1992. gadā Rosenberg ar līdzautoriem ziņoja par pirmo gēnu
terapijas izmēģinājumu vēža slimniekiem. Terapijas ietvaros metastātiskas melanomas
slimniekiem tika injicēti ex vivo modificēti TNF ekspresējoši, tumoru infiltrējoši limfocīti.
Veicot ādas paraugu analīzi injekciju vietās pēc trim nedēļām, tajās netika atrastas audzēja
šūnas. Pēc 10 gadiem tika apstiprināts pirmais gēnu terapijas līdzeklis Gendicine™
(Ķīna, 2003. gads), kas bāzēts uz adenovīrusu saturošu, p53 ekspresējošu gēnu un aprobēts
galvas un kakla plakanšūnu vēža slimnieku terapijai (Pearson et al., 2004). Pēc gada tika
apstiprināts arī pirmais gēnu terapijas līdzeklis ES – Cerepro™, kas bāzēts uz adenovīrusu
saturošu, timīna kināzi ekspresējošu gēnu un aprobēts gliomas slimnieku terapijai
(Osborne, 2008).
Pēdējos gados gēnu terapijas pielietojums vēža ārstēšanā arvien pieaug un turpinās
jaunu pretvēža preparātu izstrāde. Pēc jaunākajiem datiem, vairāk kā 60% no visiem
uzsāktajiem klīniskajiem gēnu terapijas izmēģinājumiem ir saistīti tieši ar vēža terapiju
(Wirth and Ylä-Herttuala, 2014).
13
Gēnu terapija pieder pie t.s. mērķterapijas. Mērķterapijas pamatā ir iedarbība uz
specifiskiem, ar vēža šūnām asociētiem molekulāriem mehānismiem (pamatā receptori),
tādējādi samazinot iedarbību uz veselajām šūnām un attiecīgi arī terapijas blakusefektus
(Cassidy and Schätzlein, 2004). Turklāt, pateicoties spēcīgai amplifikācijas kaskādei
(no dažām nukleīnskābju molekulām gēnu ekspresijas rezultātā iespējams iegūt ievērojamu
daudzumu terapeitisko proteīnu), iespējams panākt augstu terapeitisko efektu.
1.2. Gēnu terapijas stratēģijas, terapeitisko gēnu veidi
Izšķir vairākas gēnu terapijas stratēģijas. Tā var būt tieša terapeitisko gēnu ietekme,
inhibējot vēža šūnu augšanu, apgrūtinot vēža vaskularizāciju un veicinot vēža šūnu bojāeju, vai
arī netieša ietekme, kas izpaužas kā imūnsistēmas stimulācija, iedarboties uz konkrētām mērķa
šūnām (Palmer et al., 2003; Tangney et al., 2006). Mutēto gēnu var atjaunot, pievienojot tam
funkcionāla gēna kopiju, aizstāt ar normālu gēnu vai inhibēt tā ekspresiju. Vēža terapijai
vispiemērotākie ir gēnu ekspresijas inhibitori. Tā ir plaša terapeitisko gēnu grupa, kuras
funkcija ir mutētā gēna transkripcijas inhibēšana, iedarbojoties uz mRNS
(Zhang et al., 2012). Pie tiem pieder antisena oligonukleotīdi, kas inaktivē mutēto gēnu,
hibridizējoties ar mutētā gēna mRNS; siRNS un miRNS, kas nomāc mutēto gēnu ekspresiju
(klusināšana), izraisot mRNS sadalīšanos, un ribozīmi – katalītiskas RNS, kas šķeļ mērķa
mRNS sekvences specifiskā veidā. Terapeitisko gēnu piegāde mērķa šūnās notiek ar nesēju jeb
vektoru palīdzību. Pamatā gēnu piegādes vektori ir rekombinantas plazmīdas DNS (pDNS)
formā. Rekombinantu pDNS sastāv no divām komponentēm: prokariotiskas, kas satur
antibiotiku rezistenci un plazmīdas replikāciju regulējošus gēnus un eikariotiskas, kas satur
transgēnu/-s un tā ekspresiju regulējošas sekvences. Jaunākajos pētījumos aprakstīta gēnu
piegāde izmantojot DNS minisfēras un lineārus, kovalenti slēgtus DNS minivektorus –
struktūras, kas nesatur prokariotiskās sekvences. Šāda vektora struktūra paaugstina gan
ekstracelulāro, gan intracelulāro biopieejamību un tas savukārt rezultējas paaugstinātā gēnu
pārneses efektivitātē (Mayrhofer et al., 2009; Sum et al., 2014).
1.3. Terapeitisko gēnu piegādes metodes
Gēnu piegāde ir viens no problemātiskākajiem posmiem gēnu terapijā, jo ietver ne tikai
terapeitiskā gēna aizvadīšanu līdz šūnām, bet arī efektīvu piesaisti šūnas membrānai ar sekojošu
endocitozi un migrāciju šūnas iekšējā vidē līdz kodolam. Turklāt šo procesu apgrūtina pašu
14
terapeitisko līdzekļu – nukleīnskābju īpašības – sliktā difundētspēja caur šūnas membrānu to
izmēru, negatīvā lādiņa un hidrofilitātes dēļ (Jafari et al., 2012).
Gēnu piegādes iznākums ir tieši atkarīgs no izvēlētās vektorsistēmas – tai ir jābūt
efektīvai, specifiskai un drošai, bet ideālu gēnu piegādes vektoru raksturo virkne īpašību (Somia
and Verma, 2000; Ibraheem et al., 2014):
efektīvā veidā piesaistās terapeitiskajam gēnam neatkarīgi no tā lieluma un formas;
aizsargā terapeitisko gēnu no seruma, ekstracelulāro un intracelulāro endonukleāžu
degradējošās iedarbības;
nodrošina terapeitisko gēnu piegādi noteiktās dalošās un nedalošās mērķšūnās
neatkarīgi no to lokalizācijas vietas un integrētības apkārtējos audos;
ir neimunogēna;
ir netoksiska.
Pateicoties specifiskai un lokalizētai pieejai, ko iespējams panākt pielietojot atbilstošas
vektorsistēmas – gēnu piegādes metodes, var samazināt gan nepieciešamo terapeitiskā gēna
daudzumu, gan arī tā sistēmisku izplatību, tā samazinot terapijas blakusefektus. Gēnu piegādes
metodes klasiski iedala vīrusu (bioloģiskās) un bezvīrusu metodēs
(Cevher et al., 2012).
1.3.1. Vīrusu gēnu piegādes metodes
Gēnu piegāde šūnās, izmantojot vīrusu vektorsistēmas, ir visbiežāk pielietotais un
attīstītākais gēnu piegādes veids. Pēc Temin atklājuma 1961. gadā, ka vīrusu infekcijas var
ierosināt ģenētiskas mutācijas saimniekšūnās, Rogers un Pfuderer 1968. gadā pirmo reizi veica
gēnu pārnesi šūnās, izmantojot Tabakas mozaīkas vīrusa vektoru. 1984. gadā tika izstrādāta
pirmā retrovīrusu vektorsistēma gēnu piegādei zīdītāju šūnās (Cepko et al., 1984) un pēc
vairākiem gadiem veikti arī pirmie gēnu terapijas klīniskie izmēģinājumi, izmantojot
retrovīrusu vektorus. Vīrusiem piemītošās dabiskās īpašības – spēja viegli pārvarēt šūnas
membrānas barjeru, stimulējot endocitozes procesus, un ekspresēt vīrusa gēnus, izmantojot
saimniekšūnas biosintēzes mehānismu, padara tos par efektīviem gēnu piegādes instrumentiem
(Mulligan, 1993). Literatūrā plaši aprakstīts adenovīrusu (Palmer et al., 2002), AAV
(Hareendran et al., 2013), retrovīrusu (Tai and Kasahara, 2008), lentivīrusu
(Durand and Cimarelli, 2011), Herpes simplex vīrusa (Glorioso, 2014), Vaccinia ģints vīrusu
(Puhlmann et al., 2000), bakulovīrusu (Makkonen et al., 2015) un Epšteina Barra vīrusa
(Hellebrand et al., 2006) kā gēnu piegādes vektoru pielietojums. Uz adenovīrusu bāzes
konstruētie ir vieni no efektīvākajiem un visbiežāk pielietotajiem vīrusu vektoriem gēnu
15
piegādē, galvenokārt pateicoties to tropismam pret dažādu veidu šūnām un spējai pārnest
relatīvi lielus ģenētiskā materiāla fragmentus. Neskatoties uz to, tiem tāpat kā citiem vīrusu
vektoriem piemīt vairāki būtiski trūkumi – vīrusa proteīnu imunogenitāte, kas var izraisīt
spēcīgu organisma imūno atbildi un augsta citotoksicitāte pie lielām vīrusa devām
(Teramato et al., 2000; Anson, 2004). Pastāv arī zināms inserciju mutaģenēzes risks, kas var
novest pie onkogēnu aktivācijas, kā arī nejauša infekciozu vīrusa daļiņu veidošanās (Lachmann
and Davies, 1997; Thrasher et al., 2006; Bushman, 2007). Ir aprakstīti gadījumi, kad pēc
retrovīrusu gēnu terapijas, kas tika pielietota X-SCID slimniekiem attīstījās leikēmija
(Kohn et al., 2003; Marshall 2003). 1999. gadā pēc adenovīrusu saturoša vektora gēnu terapijas
uzsākšanas OTD sindroma ārstēšanai iestājās pacienta nāve, ko izraisīja masīva imūnās atbildes
reakcija uz adenovīrusu (Hollon, 2000). Pēc šī gadījuma tika apstādināta vairāku desmitu uz
vīrusiem bāzētu gēnu terapijas līdzekļu klīnisko pētījumu darbība un būtiski pieauga jaunu gēnu
piegādes metožu attīstība.
1.3.2. Bezvīrusu gēnu piegādes metodes
Vienkāršākais bezvīrusu gēnu piegādes veids ir nukleīnskābju piegāde šūnās bez
vektora. Taču šāda nukleīnskābe ir neaizsargāta un pakļauta mononukleāro fagocītu ietekmei
pirms nonākšanas mērķa šūnās un endonukleāžu ietekmei mērķa šūnu iekšējā vidē
(Zhang et al., 2012). Atkarībā no tā, kādā veidā tiek nodrošināta nukleīnskābju aizsardzība un
veicināta efektīvāka gēnu pārnese mērķa šūnās, bezvīrusu gēnu piegādes metodes klasiski
iedala ķīmiskās un fizikālās metodēs (Nayerossadat et al., 2012). Ķīmisku pieeju pamatā ir
vektori, kas nodrošina nukleīnskābju aizsardzību un piegādi enzimātisku procesu rezultātā, bet
fizikāli vektori ir balstīti uz mehānisku pieeju un to pielietošanā parasti nepieciešams specifisks
aprīkojums (Villemejane and Mir, 2009). Jāpiezīmē, ka, lai sasniegtu augstāku gēnu piegādes
efektivitāti un novērstu monometožu trūkumus, arvien biežāk gēnu piegādei izmanto
kombinētu pieeju, kas ietver gan ķīmiskus, gan fizikālus un dažos gadījumos arī vīrusu
vektorus.
Bezvīrusu vektoriem ir vairākas priekšrocības, salīdzinot ar vīrusu vektoriem. Tie ir
viegli sintezējami un ekspluatējami, spēj pārnest neierobežota garuma un daudzuma kodējošās
sekvences un tiem ir zema imunogenitāte (Ruβ and Wagner, 2007). Taču gēnu pārneses
efektivitāte, vērtējot pēc dažādiem ekspresijas rādītājiem, visām šobrīd zināmajām bezvīrusu
metodēm ir būtiski zemāka salīdzinot ar vīrusiem (He et al., 2010). Kamēr vīrusi šūnā iekļūst
izmantojot dabiskus mehānismus, ķīmiskajiem un fizikālajiem vektoriem ir specifiski
jāiedarbojas uz plazmatisko membrānu un/vai iekšējām vezikulārajām membrānām
16
(Luo and Saltzman, 2000). Šis trūkums kavē bezvīrusu metožu aktīvu pielietošanu klīniskajos
pētījumos.
1.3.2.1. Ķīmiskās gēnu piegādes metodes
Ķīmiskie gēnu piegādes vektori veido visplašāko bezvīrusu gēnu piegādes grupu un
pirmais literatūrā aprakstītais gadījums datējams jau ar 1965. gadu, kad Vaheri un Pagano
demonstrēja mūsdienās šīm mērķim plaši pielietotā polimēra atvasinājuma DEAE-dekstrāna
asistētu nukleīnskābju piegādi peļu un žurku fibroblastos. Pie ķīmiskiem gēnu piegādes
vektoriem pieder gan atsevišķi savienojumi kā DEAE-dekstrāns (Onishi et al., 2007), kalcija
fosfāts (Renzing and Lane, 1995), gan arī dažādu savienojumu grupas, kā katjoniski polimēri
(Magin-Lachmann et al., 2004, Luten et al., 2008), kas ietver PEI, PEG, PLL, čitosānu,
dendrimērus u.c. Plaši pielieto arī katjoniskus lipīdus (Wasungu and Hoekstra 2006), kā arī
proteīnus un peptīdus (Bolhassani, 2011; Ahmed et al., 2012).
Liela daļa ķīmisko vektoru ir katjoniski savienojumi. Tādējādi tie spēj efektīvi
piesaistīties gan negatīvi lādētajiem fosfātiem, kas ir nukleīnskābju ķēdes skeleta pamatā,
veidojot stabilu kompleksu, gan arī negatīvi lādētajai šūnas membrānai.
Svarīgs ir veids, kā terapeitiskā nukleīnskābe tiek sasaistīta ar vektoru, lai nodrošinātu
tās aizsardzību pret endonukleāžu degradatīvo ietekmi. Piemēram, katjoniski lipīdi veido
sfēriskas, hidrofobas struktūras – liposomas, kur terapeitiskais gēns ir iekapsulēts lipīdu
dubultslānī (Fraley et al., 1980). Liposomu formēšanās procesā lipīda pozitīvi lādētā hidrofilā
daļa piesaistās nukleīnskābes ķēdes skeleta garumā, bet hidrofobās daļas, savstarpēji
mijiedarbojoties, aizkavē hidrofilās daļas atdalīšanos un vienlaicīgi kalpo kā pārklājums,
nodrošinot nukleīnskābes aizsardzību (Kennedy et al., 2000; Oberle et al., 2000).
Šis mehānisms padara liposomu mediētu gēnu piegādi jeb lipofekciju par vienu no
efektīvākajām un visplašāk pielietotajām metodēm visu veidu nukleīnskābju transficēšanai
dažādās šūnu līnijās.
Vairāku ķīmisko vektoru (katjoniski polimēri) struktūra pieļauj to modifikācijas,
piemēram, dažādu funkcionālu biomolekulu piesaisti, kas paaugstina to difundētspēju caur
šūnas membrānu. Savukārt transdukcijas peptīdi ir dažādu proteīnu saimju īssekvenču
(< 30 aminoskābes) peptīdi, kas spēj pastāvīgi iekļūt šūnās, iespiežoties šūnu membrānās
(Lehner et al., 2013).
Būtisks vektora efektivitāti raksturojošs rādītājs ir tā intracelulārā aktivitāte. PEI satur
lielu skaitu protonējamo aminogrupu, kas nodrošina augstu buferizācijas kapacitāti pie jebkura
vides pH un izraisa t.s. “protonu sūkņa efektu” (Bousiff et al., 1995). Nonākot endosomās, PEI
17
ierosina pastiprinātu hlorīda jonu ieplūšanu tajās, kas savukārt ierosina ūdens ieplūšanu, lai
normalizētu jonu koncentrāciju endosomu iekšējā vidē. Osmotiskā spiediena rezultātā
endosomas membrāna plīst un terapeitiskais materiāls nonāk citoplazmā.
Ķīmisko gēnu piegādes vektoru, īpaši DEAE-dekstrāna, PEI un PAMAM dendrimēru
galvenais trūkums ir augstā citotoksicitāte (Moghimi et al., 2005; Hunter; Lv et al., 2006).
Savukārt citi vektori, kā kalcija fosfāts, ir ļoti jutīgi pat pret nelielām izmaiņām vides pH,
temperatūrā un sāļu koncentrācijā, tāpēc ir problemātisks to pielietojums in vivo pētījumos.
1.3.2.2. Fizikālās gēnu piegādes metodes
Fizikālas gēnu piegādes galvenā priekšrocība ir spēja pārvarēt vairākas ekstracelulārās
un intracelulārās barjeras, apejot vienu vai vairākus pasīvās gēnu piegādes posmus
(Brunner et al., 2002). Mehānisma pamatā lielākoties ir mākslīga pagaidu poru izveidošana
šūnas membrānā, kas kalpo kā dominējošais gēnu pārneses ceļš šūnas iekšējā vidē
(Alsaggar and Liu, 2015). Tādējādi tiek nodrošināta tieša piekļuve šūnas citoplazmai vai pat
kodolam, kas nozīmē, ka teorētiski šūnās iespējams piegādāt jebkuru membrānu necaurlaidīgu
molekulu, un šāda pieeja vienlaicīgi paaugstina gan gēnu piegādes ātrumu, gan arī efektivitāti.
Mikroinjekcija
Metodes pamatā ir nukleīnskābju tieša ievadīšana mērķa šūnu kodolā ar smalkas
> 0,2 µm diametra adatas palīdzību (Dean, 2014). Mikroinjekcija ir visefektīvākā fizikālās gēnu
piegādes metode, un transfekcijas efektivitāte ir pielīdzināma vīrusu gēnu piegādes iznākumam,
sasniedzot 100%. Metode ir laikietilpīga un tās kapacitāte aprobežojas ar nelielu šūnu
populāciju (> 500 šūnu) transficēšanu vienā pielietojuma reizē, tādēļ tā vairāk piemērota
laboratoriskiem eksperimentiem vai nelielu, lokālu šūnu populāciju (piemēram, limfmezglu
robežās) transficēšanai in vivo (Klinghoffer et al., 2015).
Ballistiskā gēnu piegāde jeb “gēnu pistole”
Metodes pamatā ir 1 µm lielu metāla (zelta, volframa, sudraba) mikrodaļiņu, uz kuru
virsmas adsorbētas nukleīnskābes ievadīšana mērķa šūnās ar elektrostatiska spēka vai gāzes
spiediena palīdzību. Ballistiskā gēnu piegāde ir piemērota dažādu, tai skaitā grūti transficējamu
šūnu transficēšanai. Metodei ir potenciāls pielietojumam pretvēža vakcīnu terapijā, ko apliecina
vairāku pētījumu rezultāti. Pelēm ar Her2/neu gēnu pārekspresējošu metastātisku melanomu
18
pēc Her2/neu saturošas DNS vakcīnas ievadīšanas novēroja strauju audzēja masas
samazināšanos un palielinātu dzīvildzi (Sun et al., 2006). Ballistiskās gēnu piegādes
vektorsistēma nodrošina neierobežota izmēra un daudzuma nukleīnskābju pārnesi šūnās, taču
jārēķinās, ka tādējādi tiek izraisīti lieli mehāniska rakstura šūnu bojājumi un līdz ar to pieaug
metodes citotoksiskais efekts (Uchida et al., 2009).
Sonoporācija
Sonoporācijas pamatā ir ultraskaņas radītas ar gāzi pildītu daļiņu jeb mikropūslīšu
oscilācijas, kas izraisa pagaidu poru veidošanos šūnas membrānā. Šādi, paaugstinot šūnas
membrānas caurlaidību, tiek veicināta nukleīnskābju pārnese šūnā (Miller et al., 2002;
Delalande et al., 2013). Metodes efektivitāte pamatā ir atkarīga no uzstādītajiem ultraskaņas
parametriem, taču ne mazāk svarīgs ir mikropūslīšu sastāvs, īpaši apvalks, no kura atkarīga
mikropūslīšu stabilitāte un izturība pret ultraskaņas radīto spiedienu. Mikropūslīši sastāv no
gāzu, piemēram, oglekļa dioksīda, sēra heksafluroīda u.c. kodola un lipīdu, polimēru vai
proteīnu apvalka, kas var tikt papildināts ar virsmaktīvo vielu papildslāni (Fan et al., 2014).
Jaunākajos pētījumos ir aprakstīta modificēta sonoporācijas metode, mikropūslīšu vietā
izmantojot nanopūslīšus, kas vairāk piemēroti terapeitiskiem mērķiem. Atšķirībā no
mikropūslīšiem, kuriem raksturīgs īss cirkulēšanas laiks un to izmēri nepieļauj ekstravazāciju
no asinsrites, nanopūslīšus iespējams akumulēt vēža šūnās, jo to nelielais izmērs ļauj migrēt
caur audzēja asinsvadu porām (Yin et al., 2012).
Šī metode ir neinvazīva un līdz ar to ar zemu citotoksicitāti, taču ir grūti reproducējama
– jāņem vērā vairāki būtiski parametri, kas katrā individuālajā pētījumā ir atšķirīgi.
Elektroporācija
Elektroporācija ir nukleīnskābju piegāde šūnās ar elektrisku impulsu palīdzību.
Elektriskie impulsi destabilizē šūnas membrānu un tajā veidojas īslaicīgas nanoizmēra poras,
kā rezultātā nukleīnskābes brīvi iekļūst citoplazmā, apejot endocitozes ceļu (Wells, 2004).
Elektroporācijas tehniku biomedicīnas pētījumos sāka izmantot pirms vairāk kā 30 gadiem,
(Neumann et al., 1982) un mūsdienās ir iespējams transficēt visu veidu šūnas. Pielietojot
elektroporācijas metodi, iespējams panākt pat 1000-kārtīgu gēnu piegādes efektivitātes
uzlabojumu (Sardesai and Weiner, 2011). Šīs īpašības ir priekšnosacījums elektroporācijas
veiksmīgam pielietojumam vēža terapijas klīniskajos pētījumos. Ir dati par efektīvu DNS
vakcīnu pielietojumu un gēnu terapijas stimulētu imunoterapiju metastātiskas melanomas
19
slimniekiem un prostatas vēža slimniekiem. Pastāvīga antivielu atbildes reakcija tika novērota
rekurenta prostatas vēža pacientiem 18 mēnešus pēc vakcinācijas ar DNS vakcīnu, kas kodē ar
PSMA epitopu saistītu tetanus toksīna C fragmenta domēnu (Low et al., 2009). Terapijas gaitā
netika novērotas ne bioķīmiskas, ne hematoloģiskas izmaiņas asins rādītājos. Metastātiskas
melanomas un rekurentas metastātiskās melanomas slimniekiem tika ievadīta citokīna IL-12
ekspresiju kodējoša pDNS. Biopsiju materiālā, kas tika ņemts no injekciju vietām tika
konstatēts paaugstināts IL-12 proteīna līmenis, audzēja šūnu nekroze un limfocītu infiltrācija
(Cha and Daud, 2012).
Elektroporācijas efektivitāti būtiski ietekmē elektriskā lauka parametri – elektriskā
sprieguma svārstības un impulsu garums, kuriem jābūt sabalansētiem, lai neizraisītu
neatgriezeniskus šūnas membrānas bojājumus (de Baere and Deschamps, 2014).
Magnetofekcija
Magnetofekcijas pamatā ir ar magnētiskajām nanodaļiņām saistītu nukleīnskābju
koncentrēšana uz šūnu virsmas un piegāde šūnās, izmantojot spēcīgu ārējo magnētisko lauku
(1.1. att.).
1.1. attēls. Magnetofekcijas mehānisms: (1) SPION struktūra, (2) SPION-nukleīnskābju
kompleksu veidošanās, (3) SPION kompleksu piegāde uz šūnu virsmas, (4) SPION kompleksu ieslēgšana šūnās un terapeitiskā gēna ekspresija
(Adaptēts no Fouriki et al., 2010)
20
Magnetofekcijai parasti izmanto superparamagnētiskās dzelzs oksīda nanodaļiņas
(SPION). Tās ir pozitīvi lādētas struktūras, kas sastāv no metālu oksīdu – magnetītu Fe3O4,
mehemītu γ-Fe2O3 vai hematītu α-Fe3O4 saturoša kodola un magnētiski inerta pārklājuma
(Mahmoudi et al., 2011). SPION kodola izmērs variē no dažiem līdz vairākiem desmitiem
nanometru (dažādos literatūras avotos no ≤ 20 līdz ≤ 50). Kamēr kodola uzbūve nosaka daļiņu
magnētiskās īpašības un ļauj manipulēt ar tām, izmantojot ārējo magnētisko lauku, no
pārklājuma ir atkarīgi tādi SPION parametri kā izmērs, šķīdība, dispersijas un magnetizācijas
pakāpe, koloidālā stabilitāte (Wilhelm et al., 2003; Yin and Feng, 2005, Easo and Mohanan,
2013). Atbilstošs pārklājums palīdz aizkavēt daļiņu agregāciju, nodrošināt vienmērīgu izkliedi
un saderību ar negatīvi lādēto šūnas virsmu, tā sekmējot internalizācijas efektivitāti mērķa šūnās
un samazinot citotoksicitāti (Santhosh and Ulrih; Singh and Sahoo, 2013). Konstatēts, ka
visefektīvākais pārklājuma veids ir hidrofili katjoniski elementi. Literatūrā ir dati par
organiskas izcelsmes savienojumu (dekstrāns, PEI, PEG, PVA, čitosāns u.c.), tā arī
neorganiskas izcelsmes (ogleklis, dārgmetāli (Au, Ag) un to sakausējumu, oksīdi
(γ-Fe2O3, SiO2, CoO)) elementu pielietojumu SPION pārklāšanai, kā rezultātā iespējams
uzlabot magnetofekcijas efektivitāti (Lam et al., 2013).
Superparamagnētiskas nanodaļiņas magnetizējas tikai magnētiskā lauka iedarbībā un
zaudē magnetizācijas spēju, kad magnētiskā lauka iedarbība beidzas (Silva et al., 2007).
Superparamagnētisms ir būtisks SPION pielietošanai pētījumos in vivo. Šādām SPION ir daudz
mazāka tendence agregēties magnētisko dipolu savstarpējās mijiedarbības dēļ un tas savukārt
samazina embolizācijas risku organisma iekšējā vidē, kā arī palīdz izvairīties no strauja renālā
klīrensa un deponēšanas imūnās sistēmas orgānos (Gupta and Gupta 2005; Shubayev et al.,
2009).
Visbiežāk pielietotā SPION sintēzes tehnika ir ko-precipitācija, bet izmanto arī citas
metodes, kā, piemēram, termiskā sadalīšana, mikroemulsijas, hidrotermālā sintēze u.c.
Ko-precipitācijas metodes pamatā ir SPION sintēze no Fe3+/Fe2+ sāļu ūdens šķīdumiem
sārmainā vidē pH 8–14 (Massart, 1981). Sintēze notiek istabas, retāk paaugstinātā temperatūrā
bezskābekļa apstākļos, lai kavētu Fe3O4 oksidēšanos par γFe2O3. Lai gan sintezētās daļiņas ir
ar plašu izmēru amplitūdu un augstu tendenci agregēties
(Teja and Koh, 2009) metode ir ātra, ekonomiska un ar augstu produktīvo iznākumu (Laurent
et al., 2008, Stephen et al., 2011).
Ar negatīvi lādētajām nukleīnskābēm SPION saistās elektrostatiskas mijiedarbības
rezultātā, veidojot stabilus kompleksus (1.2. att.).
21
1.2. attēls. SPION-nukleīnskābes kompleksa veidošanās princips
(Adaptēts no Dennig and Duncan, 2002)
Pielietojot magnētisko lauku, iespējams vieglāk pārvarēt šķīduma difūzijas barjeru un
paātrināti koncentrēt jaunizveidotos kompleksus uz šūnu virsmas (Mykhaylyk et al., 2009b;
2010), kur tie šūnās tiek ieslēgti endocitozes vai makropinocitozes ceļā. Tā pie identiskas
koncentrācijas šķīdumā noteiktā laika intervālā uz šūnu virsmas un pēc tam arī šūnā nonāk
vairāk kompleksu, kas rezultējas paaugstinātā transfekcijas efektivitātē (Gersting et al., 2004;
Plank et al., 2011). Šī īpatnība ir būtiska pielietojumam šūnās, kas ir jutīgas pret transficēšanu,
jo ļauj sasniegt augstu transgēnu ekspresijas līmeni, pielietojot samazinātu terapeitiskā līdzekļa
devu un saīsinot ekspozīcijas periodu (Krötz et al., 2003).
Magnetofekcija ir salīdzinoši jauna metode, kas pirmo reizi aprakstīta 2002. gadā
(Scherer et al., 2002), lai gan pētījumi par terapeitisko līdzekļu piegādi šūnās, izmantojot
magnētisko lauku, aizsākās jau vairāk kā 40 gadus atpakaļ, kad Widder publicēja rezultātus par
magnētisku mikrosfēru sintēzi pretvēža terapeitisko līdzekļu piegādei.
Magnetofekcija ir viena no šobrīd perspektīvākajām gēnu piegādes metodēm un tās
efektivitāte pēc atsevišķu transgēnu ekspresijas rādītājiem var sasniegt vairākus tūkstošus reižu
(Scherer et al., 2002). Tā ir efektīvāka gēnu piegādes metode dažādās vēža šūnu līnijās,
salīdzinot ar ķīmiskajām gēnu piegādes metodēm (Li et al., 2008; Liu et al., 2012), īpaši
lipofekciju (Xiang et al. 2003; Xenariou et al., 2006; Yang et al., 2007; Kievit et al., 2010) un
fizikālajām gēnu piegādes metodēm, piemēram, elektroporāciju (Prosen et al., 2014).
Salīdzinot ar citām fizikālajām gēnu piegādes metodēm, magnetofekcijai ir vairākas
priekšrocības. Tās gadījumā tiek izmantoti dabiski piesaistes un internalizācijas mehānismi,
tādējādi netiek bojāta šūnas membrāna un rezultātā būtiski samazinās metodes citotoksicitāte
(Laurent et al., 2011; Sapet et al., 2011). Magnētiskā lauka iedarbība audos sniedzas
10–15 cm dziļumā, līdz ar to magnētiskās nanodaļiņas vienmērīgi akumulējas ne tikai virsējos,
22
bet arī dziļākajos audu slāņos atšķirībā no ballistiskās gēnu piegādes, kas skar tikai virsējos
šūnu slāņus (Goudy et al., 2008).
Magnetofekcijas efektivitāte ir atkarīga gan no SPION fizikāli ķīmiskajām īpašībām,
gan arī magnētiskā lauka parametriem – magnētiskās intensitātes un magnētiskā lauka
gradienta. Optimizējot šos parametrus, iespējams paaugstināt magnetofekcijas efektivitāti.
Ņemot vērā SPION uzbūves īpatnības, kuru pamatā ir liela virsmas laukuma attiecība
pret tilpumu, kā arī pozitīvi lādēto kompleksu potenciālo mijiedarbību ne tikai ar negatīvi lādēto
šūnas membrānu, bet arī ar negatīvi lādētajiem ekstracelulārā matriksa proteīniem, viena no
stratēģijām ir SPION funkcionalizācija (1.3. att.).
1.3. attēls. Multifunkcionāla SPION
(Adaptēts no Fang and Zhang, 2009)
Lai uzlabotu SPION-terapeitisko gēnu piegādi vēža šūnās, tām var piesaistīt mērķēšanas
ligandus. Antivielas, aptamēri u.c. biomolekulas nodrošina SPION atpazīstamību mērķa šūnās
un līdz ar to efektīvāku mijiedarbību ar tām (Mahmoudi et al., 2014).
Lai nodrošinātu SPION-terapeitisko gēnu optisku detektējamību, bieži vien tiek
pielietota kombinēta pieeja, kompleksiem pievienojot fluorohromus (Bumb et al., 2010).
Literatūrā plaši aprakstīta SPION-ķīmijterapijas līdzekļu piegāde audzēju šūnās (Wilson
et al., 2004, Gautier et al., 2012).
SPION kā nanoizmēra vektorus ūdens vai organiskos ne-magnetizētos nesējos
(ferrošķīdumos) būtiski ietekmē dažādi vides fizikāli procesi – difūzija, šķidruma plūsma un
permeācija (Luo and Saltzman 2000; Plank et al., 2003). Pierādīts, ka vides pretestības spēks
korelē ar SPION nosēdināšanas ātrumu (Babincova and Babinec, 2009). Turklāt šajā pētījumā
tika konstatēts, ka 50 nm lielu SPION pārvietošanās ātrumu var palielināt, paaugstinot
23
magnētiskā lauka intensitāti, kā arī izmainot magnētu konfigurāciju, proti, permanentus
magnētus aizvietojot ar elektromagnētiem, kas ģenerē pulsējošo magnētisko lauku. Līdzīgu
pētījumu izstrādājis Krafcik ar līdzautoriem, modelējot magnētisku aerosolu piegādi plaušās ar
kvadripolāru permanentu magnētu sistēmas Hallbach palīdzību. Rezultātā tika konstatēts, ka
magnētiskais spēks būtiski prevalē pār citiem faktoriem, veicinot ātru SPION sedimentāciju,
pie kam SPION sedimentācijas trajektorijā netika konstatētas nozīmīgas izmaiņas
aerodinamisko un gravitācijas spēku ietekmē, kas radās elpošanas simulācijas rezultātā. Citā
pētījumā, palielinot magnētiskā lauka intensitāti no 150 mT līdz 350 mT, tika samazināta
SPION agregācija un pieauga akumulācija gliomas šūnās (Chertok et al., 2011).
Zināms, ka magnētiskā lauka indukcijas vērtību būtiski ietekmē attālums no magnēta.
Modelējot magnētiskā lauka amplitūdu un gradientu tipiskam cilindriskas formas permanentam
NdFeSm magnētam (d = 2 cm, h = 1 cm), tika konstatēts, ka magnētiskā lauka indukcija un līdz
ar to arī magnētiskā spēka vērtība krītas par 25% no maksimālās vērtības jau 1 cm attālumā no
magnēta virsmas, (Schwerdt et al., 2012).
Permanenti magnēti rada savu patstāvīgu statisku magnētisko lauku, kur magnētiskā
lauka gradienta virziens ir vertikāls pa Z asi (Hofmann-Amtenbrink et al., 2009). Tādējādi
statiskā magnētiskā laukā SPION kustība šķīdumā virzienā pret magnētu ir aksiāla
(1.4. att. (a)). Vairākās publikācijās aprakstīts alternatīvu magnētisko lauku pielietojums, kas
ietver kompleksu magnētiskā spēka iedarbību uz SPION pa X-Y-Z asi. Šādu magnētisko lauku
ietekmes rezultātā tiek izmainīta SPION kustība šķīdumā – tā ir ne tikai aksiāla, bet var būt arī
laterāla, oscilējoša un rotējoša (1.4. attēls (b)).
1.4. attēls. SPION kustība šķīdumā virzienā pret magnētu statiskā magnētiskajā laukā (a) un cita
veida ne statiskos magnētiskajos laukos (b)
24
Pulsējošs magnētiskais lauks, kura pamatā ir pastāvīga sinusveida viļņa iedarbība uz
šūnām perpendikulārā plaknē, kas izraisa SPION svārstības paralēli un perpendikulāri virsmai
ar atšķirīgu svārstību amplitūdu, pirmo reizi aprakstīts Kamau grupas pētījumā. Pielietojot vēža
šūnu līnijās, visaugstākā reportējošā gēna ekspresija tika sasniegta, secīgi kombinējot statisko
un pulsējošo magnētisko lauku. Autori pieļauj, ka SPION pārvietošanos caur šūnas membrānu
sekmē statiskā un pulsējošā magnētiskā lauka radītās aksiālas, laterālas un papildus oscilējošas
daļiņu kustības. Iedarbojoties uz adherentajām šūnu kultūrām ar pulsējošu magnētisko lauku,
kura pamatā ir īsu (milisekundes), atkārtotu impulsu ģenerēšana, iespējams panākt divkārtīgu
transgēna ekspresijas paaugstināšanos; novērotas transfekcijas efektivitātes izmaiņas atkarībā
no magnētiskā lauka stiprums un pulsu skaita
(Chen et al., 2009). McBain ar līdzautoriem izstrādājuši oscilējošās magnetofekcijas metodi,
kuras pamatā ir SPION kustība ne tikai aksiālā, bet arī laterālā virzienā, ko nodrošina zemas
frekvences svārstību ģenerēšana x-y plaknē (McBain et al., 2008). Ar metodes palīdzību
iespējams ievērojami paaugstināt reportējošo gēnu ekspresijas rādītājus dažādās grūti
transficējamās šūnu līnijās, piemēram, elpceļu epiteliālajās šūnās, primārajos astrocītos
(Pickard and Chari, 2010; Tickle et al., 2015), žurku oligodendrocītu prekursoru šūnās (Jenkins
et al., 2011), neirālajās cilmes šūnās (Adams et al., 2013), salīdzinot ar konvencionālajām
metodēm. Būtiski, ka oscilējošā magnētiskā lauka pielietojums neietekmē šūnu dzīvotspēju un
proliferāciju (Jenkins et al., 2011). Autoru novērojums, ka neirosfēru kultūrās, kuras tika
pakļautas oscilējošajām svārstībām, šūnu plazmatiskās membrānas ir ar izteiktāku
“krokojumu”, salīdzinot ar neapstrādātām kultūrām noveda pie hipotēzes, ka oscilējošā
magnētiskā lauka iedarbība izraisa lielāku šūnas membrānas kairinājumu tā, iespējams,
stimulējot endocitozi.
Dahmani grupa aprakstījusi magnētu sistēmu, kas sastāv no diviem permanentiem
magnētiem, starp kuriem ievietota šūnu kultūra. Šo magnētu rotācijas kustības ietekmē pie
noteiktas magnētiskās indukcijas tika ģenerēti impulsi līdz pat 400 apgr./min. Rezultātā
reportējošā gēna ekspresija suspensiju šūnu līnijā šī magnētiskā lauka ietekmē, salīdzinot ar
konvenciālajām metodēm, paaugstinājās 1,7–1,9 reizes, kas ir būtisks rādītājs, jo vairums
suspensiju šūnu līniju ir praktiski netransficējamas. Autori pieļauj, ka rotējošo magnētu radītie
spēki, kas uz SPION iedarbojas x-y plaknē izraisa to laterālu kustību, tā palielinot saskari ar
šūnām. Hajiani un Larachi pētījumā aprakstītas SPION molekulārā transporta īpatnības
statiskā, oscilējošā un rotējošā magnētiskā lauka ietekmē. Pētot daļiņu izkliedi šķīdumā vidēja
stipruma zemu frekvenču magnētisko lauku iedarbībā, autori konstatējuši, ka permanentais un
rotējošais magnētiskais lauks ietekmē to laterālo difūziju, atšķirībā no oscilējošā magnētiskā
lauka, kam netika konstatēta ietekme uz SPION laterālo difūziju. Interesanti rezultāti iegūti
25
analizējot SPION strukturālo izvietojumu šķīdumā dažādu magnētisko lauku ietekmē.
Konstatēts, ka rotējošā magnētiskā lauka iedarbībā SPION veido apaļas formas virpuļveida
struktūras, kamēr oscilējošā un statiskā magnētiskā lauka iedarbībā – lineāras, kvazistatiskas
struktūras (Gravel et al., 2015).
SPION kompleksu internalizācijas efektivitāti šūnās galvenokārt ietekmē to izmērs,
ņemot vērā to, ka tipisks endosomu izmērs klatrīnmediētas endocitozes gadījumā ir 100 nm un
attiecīgi kaveolu mediētas endocitozes gadījumā 50–80 nm (Bareford and Swaan, 2007).
Ir pierādīts, ka SPION, kuru izmēri nepārsniedz 200 nm ieslēgšana šūnās notiek klatrīna vai
kaveolu mediētas endocitozes ceļā, savukārt makropinocitoze ir dominējošais ceļs > 500 nm
lielām SPION (Rejman et al., 2004; Prijic et al., 2010). Jāpiezīmē, ka bieži SPION kompleksu
ieslēgšanas procesā vienlaicīgi iesaistīti vairāki endocitotiskie mehānismi (Hillaireau and
Couvreur, 2009) un endocitozes ceļš ir tieši atkarīgs no mērķa šūnu veida (Huth et al., 2004).
Endocitozes iznākumu magnetofekcijas rezultātā ietekmē arī tādi faktori kā SPION forma un
zeta potenciāls – lādiņš. Piemēram, šūnās tiek efektīvāk ieslēgtas sfēriskas formas SPION,
salīdzinot ar stienīšveida vai diskveida SPION (Chithrani et al., 2006; Muro et al., 2008).
Pozitīvi lādētas SPION parasti tiek labāk ieslēgtas, salīdzinot ar neitrāli lādētām SPION, tāpat
kā katjoniskas SPION salīdzinot ar anjoniskām
(Huang et al., 2010).
Audzēju šūnu membrānu īpatnības ir būtisks faktors SPION transporta nodrošināšanā,
ņemot vērā to, ka malignizācijas procesa rezultātā tiek izmainīta membrānu veidojošā lipīdu
slāņa struktūra, lai pielāgotos hipoksijas un pastiprināta metabolisma apstākļiem
(Sincai et al., 2005; Yameen et al., 2014). Tāpēc ļaundabīgām šūnām piemīt augstāks
endocitozes potenciāls salīdzinājumā ar normālām šūnām.
Magnetofekcija ir aprobēta pielietojumam in vitro dažādās, tai skaitā ļoti grūti
transficējamās šūnu līnijās, ex vivo (Svingen et al., 2009) un in vivo pētījumos.
Nozīmīgi ir RNS interferences pētījumi, ņemot vērā siRNS potenciālu audzēju ģenēzes
procesos iesaistīto gēnu ekspresijas inhibēšanai pat viena oligonukleotīda mutācijas robežās.
Plank grupa ir publicējuši visaptverošus pārskatus un protokolus siRNS
magnetofekcijai tai skaitā cilvēka vēža šūnu līnijās HeLa, NCI-H441 un Jurkat, Caco-2
(Mykhaylyk et al., 2007–2010, 2015). Namiki grupa demonstrējuši efektīvu SPION-siRNS
piegādi pēc reportējošā gēna ekspresijas 10 dažādās kuņģa vēža šūnu līnijās un HeLa šūnu
līnijā.
Vairākos pētījumos pārbaudīts arī potenciāli terapeitisku siRNS efekts. Birc5 gēna, kas
saistīts ar ķīmijterapijas rezistenci, paaugstinātu audzēja rekurenci un mazāku dzīvildzi
pārekspresiju konstatē lielai daļai audzēju. Būtisks siRNS inhibējošais efekts uz birc5 gēna
26
ekspresiju, izmantojot magnetofekciju, tika panākts BT-20, CAPAN-2 un LS-174T šūnu līnijās
(Kumar et al., 2010). BCL2 gēna pārekspresija inhibē apoptozes procesus. Pielietojot
kompleksus SPION-siRNS savienojumus, tika būtiski inhibēta BCL2 gēna ekspresija A549 un
SKOV-3 šūnās (Taratula et al., 2008).
Magnetītu saturošas SPION pagaidām ir vienīgais magnētisko nanodaļiņu veids, kas
aprobēts pielietošanai klīniskos pētījumos (pēc ASV FDA datiem) (Rudolf et al., 2014). Tās ir
fizioloģiski inertas ar zemu toksicitāti (Breimer, 1998; Torchilin, 2000) un noārdīšanās līdz
dzelzij un skābeklim organismā notiek dabiskos metabolisma ceļos (Weissleder et al., 1995).
Magnētiskiem šķīdumiem piemīt laba kardiovaskulārā panesamība (Lübbe et al., 2001).
SPION ir piemērotas pielietošanai vēža ārstēšanā. Savu izmēru un struktūras dēļ tās spēj
izvairīties no mononukleāro fagocītu iedarbības asinsritē un migrēt audzēja mikrovidē
(ekstravazācija no asinsrites) un uzkrājas tur pastiprinātas caurlaidības un aiztures (enhanced
permeability and retention effect – EPR) efekta ietekmē. EPR efekts izskaidro audzēju
angioģenēzes īpatnības – audzēju asinsvadi ir deformēti un tajos veidojas poras, jo endoteliālās
šūnas neveido normālu monoslāni (McDonald and Foss, 2000), savukārt vājā limfas attece no
audzēja audiem dēļ paaugstināta intersticiālā spiediena audzēja centrā kavē nanodaļiņu
aizplūšanu (1.5. att.). Pētījumos apstiprināts, ka SPION labāk akumulējas audzēja, nekā
normālos audos (Byrne et al., 2008).
1.5. attēls. Nanonesēju akumulācija audzēja audos EPR efekta ietekmē
(Adaptēts no Jhaveri and Torchilin, 2014)
Ārējā magnētiskā lauka pielietojums nodrošina SPION kompleksu piegādi un
koncentrēšanos mērķa vietā bez specifiskas SPION funkcionalizācijas, kas savukārt paaugstina
27
SPION internalizācijas iznākumu audzēja audos. Šis efekts plaši demonstrēts pētījumos ar
dzīvniekiem, pielietojot gan sistēmisku, gan lokālu terapeitisko gēnu ievadīšanas pieeju.
Schillinger grupas pētījumā SPION-reportējošā gēna kompleksi tika ievadīti kāmja
krūts audzēja šūnās un virs ievades vietas uz 1 stundu fiksēts permanents magnēts. Pēc 40
stundām audzēja audos tika konstatēta reportējošā gēna ekspresija, kamēr dažādos orgānos –
sirdī, plaušās, aknās, liesā un ādā virs audzēja gēnu ekspresiju nekonstatēja. Scherer ar
līdzautoriem veica SPION-reportējošā gēna kompleksu injekcijas cūku labās un kreisās auss
vēnās, bet permanents magnēts tika fokusēts virs labās auss injekciju vietā. Rezultātā gēnu
ekspresija visos paraugos tika konstatēta vietās, kas pakļautas tiešai magnētiskā lauka ietekmei,
bet kontroles paraugos (kreisās auss vēnas), kā arī attālās vietās labās auss vēnās reportējošo
gēnu ekspresija netika novērota. Būtiski, ka reportējošā gēna signāli netika novēroti citos
orgānos.
Viens no svarīgākajiem aspektiem ir novērtēt SPION kompleksu sistēmiskas
ievadīšanas efektivitāti, jo tas parāda gēnu piegādes vektorsistēmas spēju pārvarēt vairākas
organisma iekšējās vides barjeras un atspoguļo terapijai pietuvinātus apstākļus. Reportējošo
gēnu saturoši SPION kompleksi tika injicēti pelēm caur astes vēnu un ar permanentu magnētu
radīta ārējā magnētiskā lauka palīdzību virzīti uz sirdi un nierēm 6 stundu periodā. Pēc
inkubācijas SPION kompleksu klātbūtne pēc reportējošā gēna ekspresijas tika konstatēta mērķa
vietās – plaušās, sirdī un nierēs, taču SPION zudumi sasniedza 30%
(Kumar et al., 2010). Sistēmiska piegāde uzrādīja lielāku SPION akumulāciju aknās nekā
audzējā, lai gan, veicot SPION virsmas modifikāciju, iespējams paaugstināt to akumulāciju
audzējā (Prabha et al., 2012).
Magnetofekcijas pielietojums neizraisa būtiskus blakusefektus (Schillinger et al., 2005;
Hüttinger et al., 2008; Sharma et al., 2011).
Vairākos pētījumos pierādīts, ka magnetofekcijas pielietojumam ir ietekme arī uz
terapeitisko efektu – izraisa audzēja samazināšanos, samazina recidīvus/vēli recidīvi, kā arī
paaugstina dzīvildzi. Piemēram, pēc kaķu fibrosarkomas audu magnetofekcijas ar cilvēka GM-
CSF gēnu tika novērots būtisks stabilas remisijas gadījumu pieaugums 1 gada periodā.
Identiskus novērojumus attiecībā uz remisijas gadījumiem publicējuši arī citi autori
(Jahnke et al., 2007; Hüttinger et al., 2008) imunostimulējošas gēnu terapijas pētījumos.
Sharma grupas pētījumā tika konstatēts, ka intratumorālas SPION-p53 gēna kompleksu
injekcijas inhibē audzēja augšanu pelēm, kurās pārnestas PC3 p53 neekspresējošas šūnas.
Veicot audzēja audu analīzi, lielāks skaits p53 pozitīvu šūnu tika konstatēts gadījumos, kad tika
pielietota SPION-p53 terapija, salīdzinot ar p53DNS terapiju bez SPION. Pielietojot SPION-
p53 terapiju, tika novērota audzēja samazināšanās par 41%, kamēr p53DNS pielietojums
28
izraisīja audzēja samazināšanos par 20%, salīdzinot ar kontroles grupu. Interesanti rezultāti tika
iegūti veicot reālā laika novērošanu pēc SPION-fluorohroma intravenozas ievadīšanas.
Sākotnēji augsts signāls tika novērots aknās, bet pēc vairākām stundām signāla intensitāte
paaugstinājās audzējā un signālu bija iespējams detektēt vēl
4 dienas. SPION-p53 terapijas gadījumā būtiski palielinājās dzīvildze – vidēji 39 dienas,
salīdzinot ar vidēji 27 dienām pēc p53DNS terapijas. Pēc SPION-p53 terapijas autori konstatēja
būtisku asinsvadu blīvuma samazināšanos audzēja audos, tāpat tika novērots augstāks
apoptozes indekss, salīdzinot ar kontroles grupu. Lielākajai daļai dzīvnieku (6 no 8) pēc
p53DNS terapijas attiecīgā laika posmā tika konstatētas metastāzes limfmezglos un
peritoneālajā dobumā, kamēr SPION-p53 gadījumā metastātisks process tika konstatēts 1 no 7
dzīvniekiem, kas liek domāt, ka SPION-p53 ietekmē ne tikai audzēja augšanu, bet arī
metastātiska procesa attīstību.
Audzēja angioģenēzes samazināšanos un attiecīgi būtisku audzēja masas samazinājumu
par 48% kā rezultātā palielinājās dzīvildze sistēmiskas SPION-p53 terapijas ietekmē pelēm
novēroja arī Prabha ar līdzautoriem.
Magnetofekcija veiksmīgi pielietota melanomas metastāžu inhibēšanai – pētījuma
ietvaros pelēm tika injicēti metastāžu supresorgēnu NM23-H1 saturoši SPION kompleksi un
tika novērtēta gan magnetofekcijas, gan kombinētas (magnetofekcija/ķīmijterapija) pieejas
efektivitāte salīdzinājumā ar ķīmijterapiju. Tika konstatēts, ka gēnu terapija ar SPION dod
līdzvērtīgu rezultātu kā ķīmijterapija, bet visaugstāko efektivitāti iespējams sasniegt, pielietojot
kombinētu pieeju. Tika novērota ne tikai metastāžu samazināšanās līdz pilnīgai izzušanai, bet
arī būtiski palielinājās dzīvildze (Li et al., 2009).
Ir vairāki sekundāri aspekti, kas parāda magnetofekcijas kā vektorsistēmas potenciālu
ne tikai gēnu pārnesei un perspektīvā varētu tikt pielietoti kombinētas terapijas izstrādei.
Magnetofekcija nodrošina efektīvāku ķīmijterapijas līdzekļu piegādi šūnās. Alexiou
grupas pētījumā pelēm ar plakanšūnu karcinomu cirkšņa artērijā vai auss vēnā tika ievadīti
SPION-mitoksantrona kompleksi, kamēr ārējais magnētiskais lauks tika fokusēts uz ādas virs
audzēja. Visaugstākā SPION-mitoksantrona akumulācija tika konstatēta audzēja audos un
nelielos daudzumos arī aknās, plaušās un liesā. Taču, salīdzinot ar kontroli bez magnētiskā
lauka iedarbības, audzējā un apkārtējos audos dzelzs rādītāji bija vairākus simtus reižu augstāki.
Intraarteriāla ievadīšana rezultējās pilnīgā un stabilā remisijā, salīdzinot ar bez terapijas un
intravenozo terapiju. Būtiski, ka šis efekts tika sasniegts pielietojot samazinātu devu – 20 līdz
50% no sistēmiskās devas, pie kuras mitoksantrona koncentrācija audzēja šūnās un apkārtējos
audos pieauga 44 reizes. Piemērotā terapija neizraisīja blakusefektus un novērošanas periodā
netika novērota metastāžu attīstība. Vēlāk šī pati grupa konstatēja, ka magnētiskā lauka
29
iedarbība izraisa ne tikai terapeitisko kompleksu pastiprinātu koncentrēšanos uz audzēja šūnu
virsmas, bet arī stimulē SPION iekļūšanu tā šūnās. Citā pētījumā ar pelēm, kurās pārnestas krūts
audzēja šūnas pēc intravenozas ievadīšanas parādīta efektīva SPION-liposomu-paklitaksela
akumulācija audzēja šūnās ārēja magnētiskā lauka ietekmē (Zhang et al., 2005).
Liela daļa magnetofekcijas pētījumu ir veltīti smadzeņu audzēju terapijai, jo smadzeņu
audzēji bieži vien ir neoperējami izmēru un sarežģītas lokalizācijas vietas dēļ un slikti reaģē uz
ķīmijterapiju hematoencefalītiskās barjeras dēļ (Juratli et al., 2013). Ir pierādīts, ka SPION spēj
šķērsot hematoencefalītisko barjeru un to būtiski ietekmē SPION izmērs
(Pulfer and Gallo, 1998). Kievit grupa pētījumā ar pelēm ar C6 žurku gliomas audzējiem tika
pierādīta SPION kompleksu akumulācija gliomas šūnās pēc sistēmiskas ievadīšanas astes vēnā.
Citā pētījumā SPION akumulācija 9L-gliomas šūnās žurkām pēc intravaskulāras ievadīšanas
palielinājās pieckārt fokusēta ārējā magnētiskā lauka ietekmē, salīdzinot ar kontroles grupu bez
ārējā magnētiskā lauka pievadīšanas ar SPION pasīvu akumulāciju gliomas šūnās (Chertok et
al., 2008).
Vēl viens interesants magnetofekcijas pielietojuma virziens ir šūnu pielāde ar SPION ar
mērķi tās padarīt magnetovadāmas, jo magnētiskā lauka iedarbība izraisa ne tikai SPION
kustību, bet arī ar SPION pielādētu šūnu kustību. Muthana grupas pētījumā reportējošo gēnu
ekspresējoši monocīti tika pielādēti ar SPION. Veicot intravenozas injekcijas nude pelēm, tika
novērots, ka būtiski vairāk SPION saturošu monocītu tiek koncentrēti uz audzēja audiem pēc
magnētiskā lauka pievadīšanas, respektīvi, magnētiskā lauka iedarbība izraisīja monocītu
virzību uz audzēja audiem. Būtiski, ka liels daudzums SPION saturošu monocītu tika konstatēti
slikti apasiņotās audzēja zonās.
Neskatoties uz daudzsološajiem rezultātiem pētījumos in vivo izmantojot dzīvniekus,
šobrīd nav neviena uz magnētiskiem vektoriem bāzēta sistēma, kas būtu izgājusi visas klīnisko
pētījumu fāzes un aktīvi pielietota terapeitiskiem mērķiem. Pirmie ziņojumi par magnētisku
nesēju pielietojumu klīniskajos pētījumos tika publicēti 90. gados
(Lübbe et al., 1996). Pētījumā tika iekļauti 14 slimnieki pēc neefektīvas ķīmijterapijas, kuriem
1–3 kursu veidā tika veiktas intravenozas SPION-epirubicīna infūzijas ar sekojošu ārējā
magnētiskā lauka iedarbību audzēju lokalizācijas vietās 60–120 min garumā. Tika konstatēts,
ka ārējā magnētiskā lauka iedarbība nodrošina SPION kompleksu piegādi audzēja šūnās 50%
no pētījumā iesaistītajiem pacientiem un SPION izraisīta paaugstināta orgānu toksicitāte netika
novērota. Wilson ar līdzautoriem ziņojuši par I/II fāzes hepatocelulārās karcinomas slimnieku
terapijas efektivitāti. Pētījumā tika iekļauti 4 pacienti, kuriem netālu no audzēja esošajā artērijā
injicēja SPION-doksorubicīna hidrohlorīda savienojumus ar sekojošu spēcīga magnētiskā lauka
iedarbību audzēja lokalizācijas vietā. Rezultātā magnētiskā lauka iedarbība izraisīja SPION
30
kompleksu nokļūšanu audzējā un, tā kā kopējais administrēto terapeitisko līdzekļu apjoms bija
ļoti zems, netika novēroti praktiski nekādi blakusefekti.
Laika-fāzes variējošs magnētiskais lauks
Mūsu starpdisciplinārā grupa ir aprakstījusi laika-fāzes variējošu magnētisko lauku,
kuru rada permanentu magnētu orbitāla rotācija šūnu kultūrai paralēlā plaknē. Pastāv uzskats,
ka magnētu orbitāla rotācija ietekmē SPION kustību šķīdumā, tā sekmējot to sedimentāciju uz
(šūnu) virsmas.
Laika-fāzes variējošs magnētiskais lauks tiek ģenerēts ar iekārtas DynaFECTOR
palīdzību, kas ir paredzēta šūnu transficēšanai 24 iedaļu šūnu kultūru platē (1.6. att.).
1.6. attēls. Magnetofekcijas iekārta DynaFECTOR: 1 – 24 iedaļu plates vieta, 2 – strāvas padeves
slēdzis, 3 – vadības panelis, 4 – ekspozīcijas ilgums laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, 5 –
ekspozīcijas ilgums statiskajā magnētiskajā laukā, 6 – magnētu apgriezienu frekvence
DynaFECTOR raksturojošie parametri:
programmējama magnētiskās sistēmas rotācija orbītā ar ātrumu 1–150 apgr./min;
fiksēts rotācijas laiks 1–999 min;
papildus ieprogrammēta rotācijas virziena maiņa ik pēc 30 sekundēm visā SPION
nosēdināšanas procesā;
termostatiskā temperatūra 36 ± 1°C.
Iekārta DynaFECTOR konstruēta maisītāja platformas vietā iemontējot magnētisko
sistēmu, kas sastāv no 12 permanentiem, vienpolāri orientētiem cilindriskas formas retzemju
neodīma-dzelzs-bora (NdFeB) permanentajiem magnētiem (d = 19 mm). Magnēti uz
magnētiskās sistēmas izvietoti šahveida kārtībā (1.7. att.) tā, ka ņemot vērā magnētu sistēmas
31
kustības amplitūdu, katra magnēta rotācijas orbīta ietver divas iedaļas 24 iedaļu platē. Saskaņā
ar magnētiskā vektora spēku datormodeli, magnēti uz virsmas izkārtoti tā, lai atkarībā no to
kustības būtu iespējams sasniegt magnētiskā lauka indukciju 0,35 T un aksiālās un radiālās
komponentes gradienta līmeni 3 ×107 a/m2.
1.7. attēls. Magnētu izvietojums DynaFECTOR magnētiskajā sistēmā
(Adaptēts no Vainauska et al., 2012)
Virs magnētu sistēmas nostiprināta ne-magnetizējoša metāla plāksne, uz kuras
paredzēta vieta 24 iedaļu šūnu kultūru platei; fiksētais attālums no šūnu kultūru plates
apakšmalas līdz magnētu virsmai ir 3,5 mm (1.8. att.).
1.8. attēls. Magnētu sistēmas rotācijas plakne
attiecībā pret 24 iedaļu šūnu kultūru plates plakni
Magnētu sistēmas, kas rotē zem šūnu kultūru plates orbitālās rotācijas rādiuss ir 2 cm
neatkarīgi no rotācijas virziena.
Rotējošā magnētu sistēmā specifisku magnētisko spēku iedarbību uz SPION raksturo
magnētu pozīcijas orbītā, respektīvi, 1., 2., 3. fāze (1.9. att. (a)). Pirmās fāzes gadījumā magnēts
neatrodas zem iedaļas un šajā gadījumā magnētiskā spēka iedarbība ir līdzvērtīga nullei. Otrajā
fāzē notiek SPION laterāla kustība, jo dominanta kļūst radiālā komponente, bet trešajā fāzē
SPION kustība notiek aksiālā virzienā, jo magnēts atrodas tieši zem iedaļas.
32
1.9. attēls. Rotējošas magnētiskās sistēmas princips: (a) shematiska magnētu sistēmas ilustrācija
vienam magnētam un divām šūnu kultūru plates iedaļām; 1., 2., 3. fāze – magnētu pozīcijas zem
iedaļām orbitālās rotācijas procesā, (b) shematisks attēlojums magnētiskā lauka darbībai
dažādos laika posmos; 1., 2., 3. – relatīvais magnētiskā lauka darbības ilgums; sarkanās bultiņas
norāda magnētiskā lauka virzienu un relatīvo lielumu (pēc bultiņu garuma)
(Adaptēts no Karpov et al., 2014)
Novērtējot magnēta atrašanās relatīvo ilgumu katrā no fāzēm (1.9. att. (b)), tika
konstatēts, ka pirmajā fāzē kad magnētiskais spēks uz SPION neiedarbojas, to izkliede ir
vienmērīga visā telpā (skat. krāsojumu 1.9. att. (b)). Savukārt otrajā fāzē, magnētiskā spēka
radiālā komponente, īslaicīgi iedarbojoties uz SPION, izraisa to laterālu kustību dažādos
virzienos, jo orbitālā perioda laikā iedarbojas uz SPION divas reizes. Trešajā fāzē magnētiskā
spēka aksiālā komponente virza SPION lejup pretim plates iedaļas (šūnas) virsmai.
Sākotnējie datormodelēšanas rezultāti (Comsol), novērtējot magnētiskā spēka iedarbību
uz SPION laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā1, parādīja, ka sedimentācijas procesā
SPION izvietosies gan magnēta centrālajā daļā, gan pie ārējās robežas, jo magnētiskā lauka
aksiālā komponente dominē Z ass virzienā un virza SPION uz leju pret magnētu, savukārt
radiālā komponente, kas dominē pie magnēta malas veicina SPION laterālu kustību (1.10. att.).
1 Attālums no NdFeB magnēta (350 mT virsmas centrā, r = 9 mm, h = 7 mm) 3,5 mm
33
1.10. attēls. Aksiālā (zils krāsojums) un radiālā (zaļš krāsojums) magnētiskā spēka
komponentes (a), taisnleņķa un cilindriskā koordinātu sistēma attiecībā pret magnētu (b)
(Adaptēts no Karpov et al., 2014)
To uzskatāmi apstiprina datormodelēšanas rezultāti (Matlab), novērtējot magnētiskā
lauka radiālās komponentes virzienu grafisku momentu izplatību diviem gadījumiem2
1.11. att. ((a) un (b)). Izrietošais spēks tiek vērsts magnēta orbītas centra virzienā
(1.11. att. (c)); trešajā fāzē, magnētiskā spēka aksiālā komponente virza SPION aksiālā virzienā
pretim virsmai. Tā kā magnētiskās sistēmas orbitālās kustības rezultātā magnētiskā lauka
iedarbība ir laika-fāzes variējoša, SPION pārvietošanās mainīsies atkarībā no magnētu
apgriezienu frekvences.
Aprēķināts, ka SPION pārvietojuma amplitūda var sasniegt līdz pat 0,5 µm saskaņā ar
magnēta robežas lineāro ātrumu 𝑣 60 mm/s, un magnētiskā lauka gradientu 50 T/m.
2 𝑅0 = 10 𝑚𝑚, 𝑟0 = 9 𝑚𝑚
34
1.11. attēls. Radiālā spēka virzienu izkliede: (a) un (b) – magnētam otrajā fāzē (attiecīgi kreisā
un labā pozīcija kā attēlots 1.9. attēlā), (c) – izrietošais spēks; magnētiskais spēks (a) un (b)
parāda magnētisko momentu (apvilkti ar apļiem) izkliedi
(Adaptēts no Karpov et al., 2014)
Datormodelēšanas rezultāti (FORTRAN3), novērtējot sedimentēto SPION izkliedes
profilu atkarībā no rotējošas platformas apgriezienu frekvences , vienpolāri orientētu magnētu
gadījumā uzrādīja būtiskas atšķirības (1.12. att.).
1.12. attēls. Uz kivetes pamatnes virsmas daļas (kvadrātveida laukums 2 × 2 cm2
) nosēdināto
SPION izkliede pie dažādām maisītāja platformas apgriezienu frekvencēm ω, apgr./min
(Adaptēts no Kozlov et al., 2015)
3 1,3 mm biezs SPION suspensijas slānis tika sadalīts kubiskas formas 1 × 1 × 1 mm3 izmēra elementos un SPION
trajektoriju sākumpunkti atradās šo elementu centrā.
35
Gadījumā, kad magnēti bija nekustīgi (ω = 0) SPION sedimentācija bija ļoti
nevienmērīga (1.12. att. (a)), un ievērojama daļa kivetes pamatnes virsmas (~ 40%) palika
nenoklāta.
Uzsākot rotāciju, SPION sedimentācija uz pamatnes notika vienmērīgāk
(1.12. att. (b un c)). Sasniedzot rotējošas platformas magnētu apgriezienu frekvenci
= 40 apgr./min, SPION izkliede kļuva vienmērīgāka, nenosedzot tikai ~ 10% virsmas
laukuma (1.12. att. (d)). Tika konstatēts, ka SPION izkliede paliek nemainīga, palielinot
platformas apgriezienu frekvenci. Šāds SPION izvietojums uz pamatnes virsmas liecina, ka
SPION, kas pakļautas kustībā esošu magnētu magnētisko lauku iedarbībai, tiek nosēdinātas
praktiski vertikāli kivetes pamatnei pa asi Z ar relatīvi nelielu pārvietojumu šķērsām.
Projekcija no vienas no aprēķinātajām SPION trajektorijām plaknē XZ attēlota
1.13. attēlā. Uzskatāmi redzams, ka magnētu riņķveida kustība atspoguļojas raksturīgās SPION
trajektorijas svārstībās – gan aksiālā, gan laterālā virzienā.
1.13. attēls. SPION trajektorijas projekcija XZ plaknē: a – magnēti rotē ar apgriezienu frekvenci
40 apgr./min, b – magnēti ir nekustīgi
(Adaptēts no Kozlov et al., 2015)
Magnetofekcija ir viena no šobrīd perspektīvākajām gēnu piegādes metodēm, kuras
pamatā ir ar magnētiskajām nanodaļiņām saistītu nukleīnskābju koncentrēšana uz šūnu virsmas
un piegāde šūnās, izmantojot spēcīgu ārējo magnētisko lauku. Laika-fāzes variējoša magnētiskā
lauka, kas tiek ģenerēts ar magnetofekcijas iekārtas DynaFECTOR palīdzību, pamatā ir
permanentu magnētu plates orbitāla rotācija šūnu kultūrai paralēlā plaknē. Datormodelēšanas
rezultātā tika noskaidrots, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē notiek SPION
aksiāli laterāla kustība. Tā rezultātā sedimentācijas procesā SPION izvietojas gan magnēta
centrālajā daļā, gan pie ārējās robežas, kas veicina to vienmērīgāku sedimentāciju arī uz
virsmas. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz
SPION-nukleīnskābju kompleksu piegādes efektivitāti šūnās nav noskaidrota.
36
2. MATERIĀLS UN METODES
2.1. Materiāls
2.1.1. Šūnu līnijas
Darbā kā modelis tika izmantota cilvēka prostatas karcinomas šūnu līnija (PC3)
(ScienCell, ASV) un cilvēka aknu hepatocelulārās karcinomas šūnu līnija (HEPG2) (ScienCell,
ASV). Izvēlētās šūnu līnijas pieder pie grūti transficējamām šūnu līnijām, tāpēc ir piemērotas
transgēna efektivitātes novērtēšanai. Šūnu kultivēšanai tika izmantoti sertificēti šūnu kultūru
reaģenti (Life Technologies, ASV), un šūnu kultivēšana tika veikta atbilstoši ražotāju
rekomendācijām. PC3 šūnas tika audzētas RPMI-1640/F-12 barotnē, papildinātā ar 10% FBS,
penicilīnu (100 U/ml) un streptomicīnu (100 μg/ml). HEPG2 šūnas tika audzētas DMEM
barotnē, papildinātā ar 10% FBS, penicilīnu (100 U/ml) un streptomicīnu
(100 μg/ml). Šūnas tika kultivētas inkubatorā (Sanyo MCO-175) 37°C ar 5% CO2 padevi.
Subkultivēšana tika veikta 2–3 reizes nedēļā, šūnas tripsinizējot ar 0,025% tripsīna šķīdumu
PBS (Life Technologies, ASV).
2.2. Metodes
Pētījumā tika pielietota kompleksa metodoloģiskā pieeja. Metodes un to izmantošanas
kārtība apkopota zemāk.
CM sedimentācijas profila noteikšana:
• CM sedimentācija šūnu kultūru barotnē statiskajā un laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu.
LacZ un ECFP-ERp29 pDNS iegūšana:
• pDNS transformēšana E. Coli un transformēto baktēriju kultivēšana;
• pDNS izdalīšana no E. Coli kultūras, izmantojot Plasmid Midi Kit;
• izdalītās pDNS koncentrācijas noteikšana.
Optimizācija
Optimālās pDNS:LIP un pDNS:LIP:CM attiecības noteikšana:
• PC3 un HEPG2 šūnu transfekcija statiskajā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā, izmantojot dažādu LacZpDNS:LIP un LacZpDNS:LIP:CM
daudzumu/savstarpējo attiecību;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot β-Gal Staining Kit;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• transfekcijas efektivitātes/citotoksiskā efekta novērtēšana.
37
Optimālā ekspozīcijas ilguma noteikšana:
• PC3 un HEPG2 šūnu transfekcija ar 2,5; 5; 10; 20 min ekspozīciju statiskajā un laika-
fāzes variējošā magnētiskajā laukā, izmantojot optimālu LacZpDNS:LIP:CM;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot β-Gal Staining Kit;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā, transfekcijas efektivitātes aprēķini.
Optimālās magnētu apgriezienu frekvences noteikšana:
• PC3 un HEPG2 šūnu transfekcija laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā ar 5; 25;
50; 100 apgr./min frekvenci, izmantojot optimālu LacZpDNS:LIP:CM;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot β-Gal Staining Kit;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā, transfekcijas efektivitātes aprēķini.
Optimālās magnētiskā lauka intensitātes noteikšana:
• PC3 šūnu transfekcija statiskajā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā ar
optimālu magnetofekcijas ilgumu un magnētu apgriezienu frekvenci, izmantojot
optimālu LacZpDNS:LIP:CM;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot β-Gal Staining Kit;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā, transfekcijas efektivitātes aprēķini.
Dažādu transfekcijas metožu efektivitātes noteikšana
LacZpDNS:LIP:CM piegādes efektivitātes noteikšana:
• PC3 un HEPG2 šūnu transfekcija ar L, LM un LM LFV metodēm;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot β-Gal Staining Kit;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā, transfekcijas efektivitātes aprēķini.
ECFP-ERp29pDNS:LIP:CM piegādes efektivitātes noteikšana:
• PC3 un HEPG2 šūnu transfekcija ar L, LM un LM LFV metodēm;
• transficēto šūnu analīze ar Western blota metodi;
•densitometrijas analīze programmā Image Reader LAS-1000.
LacZpDNS:LIP:CM:siRNS piegādes efektivitātes noteikšana:
• PC3 šūnu transfekcija ar L/L siRNS, LM/LM siRNS un LM LFV/LM LFV siRNS
metodēm;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot β-Gal Staining Kit;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā, transfekcijas efektivitātes aprēķini.
Citotoksiskā efekta noteikšana
LacZpDNS:LIP:CM piegādes izraisītās citotoksicitātes noteikšana:
• PC3 šūnu transfekcija ar L, LM un LM LFV metodēm;
• transficēto šūnu krāsošana, izmantojot AO/EB metodi;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā, nedzīvo šūnu īpatsvara aprēķini.
38
Dzelzs satura noteikšana šūnās
Internalizētās Fe2+ noteikšana pēc šūnu skaita:
• PC3 šūnu magnētiskā iezīmēšana ar CM statiskajā un laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā;
• iezīmēto šūnu krāsošana, izmantojot PB metodi;
• mikroskopēšana ar fotoattēlu iegūšanu;
• šūnu skaitīšana ImageJ programmā.
Internalizētās Fe2+ noteikšana pēc daudzuma/šūnā:
• PC3 šūnu magnētiskā iezīmēšana ar CM statiskajā un laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā;
• iezīmēto šūnu spektrofotometriska analīze;
• dzelzs daudzuma aprēķini.
2.2.1. SPION sedimentācijas profila noteikšana
Lai analizētu magnētisko nanodaļiņu sedimentāciju šķīdumā, dažādu magnētisko lauku
ietekmē, 30 μg CombiMag (CM) magnētisko nanodaļiņu (Chemicell, Vācija) tika samaisīti ar
470 μl Opti-MEM šūnu kultūru barotni. Iegūtais maisījums pa pilienam tika pārnests 24 iedaļu
šūnu kultūru platē un inkubēts uz MagnetoFACTOR (Chemicell, Vācija) magnētu sistēmas
(statiskais magnētiskais lauks, 0,35 T) vai uz DynaFECTOR rotējošās magnētu sistēmas
platformas 5 min. Pēc inkubācijas CM izkliede tika analizēta, izmantojot gaismas
mikroskopijas metodi (Nikon Eclipse 80i) 400X kopējā palielinājumā, un iegūti digitāli
fotoattēli ar Nikon kameru.
2.2.2. Plazmīdu DNS iegūšana
Lai novērtētu nukleīnskābju piegādes efektivitāti vēža šūnās gan pēc transficēto šūnu
skaita, gan kopējā proteīnu līmeņa, tika izmantotas divas dažādas plazmīdas –
pcDNA3.1™/His/LacZ (Life Technologies, ASV) un pECFP-ERp29 (Karolinska institūts,
Zviedrija). LacZ gēns kodē enzīmu β-galaktozidāzi, kas piedalās laktozes hidrolīzē līdz glikozei
un galaktozei. β-galaktozidāzes tests ir viena no efektīvākajām un biežāk pielietotajām
metodēm transficēto šūnu skaita noteikšanai, jo bioķīmiskas reakcijas rezultātā transficētās
šūnas dod raksturīgu zilu krāsojumu. pECFP-ERp29 tika izmantota, lai novērtētu transfekcijas
efektivitāti pēc kopējā proteīnu ekspresijas līmeņa.
Nukleīnskābju transformēšanai baktērijās tika izmantots kompetento E. Coli
bakteriālais celms XL1Blue (Promega, ASV), un baktēriju transformācija tika veikta pēc
aprobēta darba protokola. Kompetentās E. Coli šūnas (50 µl alikvota) tika atkausētas, ievietojot
39
ledū, un pēc atkausēšanas tām pievienoja 10 ng pDNS. Iegūtais maisījums tika inkubēts ledū 5
min, tad nekavējoties pārnests ūdens termostatā (LKB Bromma 2209 Multitemp) 42°C, kur
inkubēts vēl 1,5 min, pēc tam pārnests uz ledus un inkubēts 2 min. Pēc inkubācijas, transformēto
baktēriju maisījumam pievienoja 500 µl šķidrās LB barotnes un inkubēja Enviromental shaker
incubator ES-20/60 termostatā (40 min; 200 apgr./min). Pēc inkubācijas, 50 µl transformēto
baktēriju maisījuma pārnesa uz Petri plates ar agarizētu LB barotni ar 100 µg/ml ampicilīna
(LacZpDNS) vai 25µg/ml kanamicīna (ECFP-ERp29pDNS) un inkubēja termostatā 37°C
naktskultūrā. Nākamajā dienā transformētās šūnas tika izsētas šķidrajā LB barotnē ar
ampicilīnu (100 µg/ml) (LacZpDNS) vai kanamicīnu (25µg/ml) (ECFP-ERp29pDNS) un
kultivētas optimālos apstākļos (37ºC, 200 apgr./min) Enviromental shaker incubator ES-20/60
termostatā naktskultūrā. pDNS tika izdalīta, izmantojot Plasmid Midi Kit (Qiagen, Vācija), pēc
ražotāja izstrādāta protokola. Izdalītās pDNS koncentrācija (pie 260 nm) un kvalitāte (260/280
≤ 1,8) tika noteikta, izmantojot NanoDrop 1000 spektrofotometru, pēc ražotāja
rekomendācijām.
2.2.3. Transfekcija ar plazmīdu DNS un siRNS
Šūnu transficēšana statiskajā magnētiskajā laukā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā tika veikta, izmantojot kompleksu liposomālās magnetofekcijas metodi. Liposomālā
komponente nodrošina papildus pDNS aizsardzību un labāku piesaisti šūnas membrānai
(2.1. att.).
2.1. attēls. SPION-nukleīnskābes-liposomālās komponentes savienojumu veidošanās princips
(Adaptēts no Tiwari et al., 2015)
Salīdzinājumam tika veikti eksperimenti izmantojot arī lipofekcijas metodi (L), lai
pārliecinātos par magnētiskā lauka efektu. Eksperimentālajā darbā tika izmantoti sertificēti
40
transfekcijas reaģenti. Lipofectamine2000 (LIP) transfekcijas reaģents (Life Technologies,
ASV) ir aprobēts pielietošanai dažādās adherentās un atsevišķās suspensiju šūnu līnijās, t.sk.
RNS interferences pētījumos. CM superparamagnētiskās nanodaļiņas ir piemērotas
transficēšanai, izmantojot lipīdus, un ir aprobētas pielietošanai PC3 un HEPG2 šūnu līnijās.
Ko-transfekcijai ar siRNS tika izmantota siRNS pret β-galaktozidāzi Stealth™ RNAi LacZ
Reporter Control (Life Technologies, ASV).
Optimālu reakcijas apstākļu noteikšana ir būtisks faktors augstāku transfekcijas
efektivitātes rādītāju sasniegšanai. Tāpēc vispirms eksperimentāli pēc titrēšanas principa tika
veikta reakcijas apstākļu optimizācija, un noteikta pDNS-LIP un pēc tam attiecīgi pDNS-LIP-
CM savstarpējā optimālā attiecība, ņemot vērā ražotāju rekomendācijas (2.1. tabula).
2.1. tabula
pDNS-LIP un pDNS-LIP-CM savstarpējā attiecība optimizācijas eksperimentos
pDNS (µg) LIP (µl) pDNS (µg): LIP (µl) CM (µl)
0,5 0,5 1:1 0,5
1 1 1:2 0,5
2 2 1:3 0,5
3 3 1: 1 1
4 4 1:2 1
0,5 1 1: 3 1
1 2 1:1 2
2 4 1:2 2
3 6 1:3 2
0,5 1,5
1 3
2 6
pDNS-LIP-CM savstarpējā optimālā attiecība tika noteikta, izmantojot 10 min
ekspozīciju magnētiskajā laukā (ražotāja rekomendācija: 10–20 min).
Testējot 5 nM, 20 nM, 50 nM un 100 nM siRNS, tika noteikta arī siRNS koncentrācija,
pie kuras tiek panākts visaugstākais inhibējošais efekts.
Dienu pirms transfekcijas ar pDNS šūnas tika izsētas 24 iedaļu platēs: 1,8 × 105
šūnas/iedaļā PC3 šūnas un 1,5 × 105 šūnas/iedaļā HEPG2 šūnas, lai transfekcijas dienā
sasniegtu ~ 80% konfluenci.
Ko-transfekcijas eksperimentiem ar siRNS PC3 šūnas tika izsētas tāpat kā aprakstā
transfekcijai ar pDNS.
Visiem eksperimentiem paraugi tika sagatavoti triplikātā atbilstoši vadlīnijām.
41
Lipofekcija ar pDNS
Pirms transfekcijas šūnu kultūru barotne tika nomainīta ar 400 µl Opti-MEM barotnes
bez piedevām. Tika sagatavots pDNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Tika
sagatavots LIP reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma un, pirms
sajaukšanas ar citām komponentēm, inkubēts istabas t° 5 min. Sagatavotais pDNS šķīdums tika
pievienots LIP reaģenta šķīdumam un viegli samaisīts 2–3 reizes, lēni pipetējot. Maisījumu
inkubēja istabas t° 25 min un pēc tam pa pilienam pārnesa uz šūnām platē. Kontrolei tika
izmantots LIP reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma. Šūnas kultivēja
CO2 inkubatorā 24 stundas.
Ko-lipofekcija ar siRNS
Pirms transfekcijas šūnu kultūru barotne tika nomainīta ar 400 µl Opti-MEM barotnes
bez piedevām. Tika sagatavots pDNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Tika
sagatavots siRNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Tika sagatavots LIP reaģenta
šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma un, pirms sajaukšanas ar citām
komponentēm, inkubēts istabas t° 5 min. Sagatavotais siRNS šķīdums tika pievienots pDNS
šķīdumam, pēc tam LIP reaģenta šķīdumam un viegli samaisīts 2–3 reizes, lēni pipetējot.
Maisījumu inkubēja istabas t° 25 min un pēc tam pa pilienam pārnesa uz šūnām platē. Kontrolei
tika izmantots LIP reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma un siRNS
šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Šūnas kultivēja CO2 inkubatorā 48 stundas.
Liposomālā magnetofekcija ar pDNS
Pirms transfekcijas šūnu kultūru barotne tika nomainīta ar 350 Opti-MEM barotnes bez
piedevām. Tika sagatavots pDNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Tika
sagatavots LIP reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma un, pirms
sajaukšanas ar citām komponentēm, inkubēts istabas t° 5 min. CM pirms lietošanas tika
vorteksētas 2–3 sekundes, un sagatavots magnētisko nanodaļiņu šķīdums Opti-MEM ar kopējo
daudzumu 50 µl šķīduma. Sagatavotais pDNS šķīdums tika pievienots LIP reaģenta šķīdumam
un viegli samaisīts 2–3 reizes, lēni pipetējot. pDNS-LIP šķīdumam pievienoja CM šķīdumu, 2–
3 reizes lēni pipetējot, un inkubēja istabas t° 25 min. Maisījums pa pilienam tika pārnests uz
šūnām platē. Šūnas tika inkubētas uz MagnetoFACTOR (Chemicell, Vācija) magnētu sistēmas
(statiskais magnētiskais lauks) un uz DynaFECTOR rotējošu magnētu sistēmas platformas.
42
Kontrolei tika izmantots CM reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma.
Pēc inkubācijas šūnas kultivēja CO2 inkubatorā 24 stundas.
Liposomālās magnetofekcijas optimizācija
Lai noteiktu optimālo ekspozīcijas laiku magnētiskajā laukā, tika veikta liposomālā
magnetofekcija statiskajā magnētiskajā laukā (LM) un liposomālā magnetofekcija laika-fāzes
variējošā magnētiskajā laukā (LM LFV) ar ekspozīciju 2,5, 5, 10 un 20 min. Izvēloties
ekspozīcijas ilgumu, pirmkārt tika ņemtas vērā ražotāja rekomendācijas attiecībā uz ieteicamo
magnetofekcijas laiku, izmantojot CM reaģentu: 5–20 min. Ekspozīcijas ilgums 2,5 min tika
izvēlēts, lai pārliecinātos vai nepastāv atšķirības reakcijas kinētikā starp LM un LM LFV.
Lai noteiktu optimālo magnētu apgriezienu frekvenci, tika veikta LM LFV ar magnētu
apgriezienu frekvenci 5, 25, 50 un 100 apgr./min optimālajā ekspozīcijas laikā.
Lai noteiktu optimālo magnētiskā lauka intensitāti, tika veikta LM un LM LFV
optimālos ekspozīcijas ilguma un attiecīgi magnētu apgriezienu frekvences apstākļos, variējot
magnētiskā lauka intensitāti 0,1 T, 0,2 T un 0,35 T robežās. Tas tika nodrošināts palielinot
attālumu starp magnētiem un šūnu kultūras plati, starp tām novietojot magnētiski inertas
plāksnītes (6 un 9 mm).
Liposomālā ko-magnetofekcija ar siRNS
Lai sasniegtu visaugstāko inhibējošo efektu tika testēts 5 nM, 20 nM, 50 nM un
100 nM siRNS. Pirms transfekcijas šūnu kultūru barotne tika nomainīta ar 300 µl Opti-MEM
barotnes bez piedevām. Tika sagatavots pDNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu
50 µl. Tika sagatavots siRNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Tika sagatavots
LIP reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma un, pirms sajaukšanas ar
citām komponentēm, inkubēts istabas t° 5 min. CM pirms lietošanas tika vorteksētas
2–3 sekundes un sagatavots magnētisko nanodaļiņu šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu
50 µl šķīduma. Sagatavotais siRNS šķīdums tika pievienots pDNS šķīdumam, pēc tam LIP
reaģenta šķīdumam un viegli samaisīts 2–3 reizes lēni pipetējot. pDNS-siRNS-LIP šķīdumam
pievienoja CM šķīdumu, lēni pipetējot 2–3 reizes, un inkubēja istabas t° 25 min. Maisījums pa
pilienam tika pārnests uz šūnām platē. Šūnas tika inkubētas uz MagnetoFACTOR (Chemicell,
Vācija) magnētu sistēmas (statiskais magnētiskais lauks) un uz DynaFECTOR rotējošās
magnētu sistēmas. Kontrolei tika izmantots CM reaģenta šķīdums Opti-MEM ar kopējo
43
daudzumu 50 µl šķīduma un siRNS šķīdums Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl. Pēc
inkubācijas šūnas kultivēja CO2 inkubatorā 48 stundas.
2.2.4. Transgēna ekspresijas detekcija un analīze
LacZ gēna ekspresija tika noteikta, izmantojot β-Gal Staining Kit (Life Technologies,
ASV) reaktīvu komplektu, pēc ražotāja protokola. Atkrāsotās šūnas tika analizētas gaismas
mikroskopā (Leitz Labovert FS) 200X kopējā palielinājumā un iegūti to digitāli fotoattēli no 5–
10 nejauši izvēlētiem laukumiem, izmantojot fotokameru Sony DSC W-115. Šūnu skaitīšana,
izmantojot fotoattēlus, tika veikta datorprogrammā Image J (NIH, ASV). Transfekcijas
efektivitāte tika aprēķināta pēc sekojošas formulas:
Transfekcijas efektivitāte % = (kopējais zili iekrāsoto šūnu skaits/visu šūnu skaits)
× 100
ECFP-ERp29 detekcijai tika izmantota Western (imuno) blota metode, pēc aprobēta
darba protokola. Transficētās šūnas tika mazgātas ar 1 ml PBS 3 reizes un lizētas ar 200 µl 1%
Triton X-100 šķīdumu PBS, inkubējot ledū uz kratītāja (Elmi Shaker DOS-20L) 15 min. Pēc
inkubācijas lizētās šūnas tika savāktas, centrifugētas (+4°C, 15 min, ≥ 15 000 g) un supernatants
tika izmantots proteīnu koncentrācijas noteikšanai.
Proteīnu koncentrācijas noteikšana
Proteīnu koncentrācija tika noteikta pēc Lowry metodes ar spektrofotometru (Eppendorf
BioPhotometer). Tika sagatavots Lowry A [20 g Na2CO3, 4 g NaOH, destilēts H2O līdz 1 litram]
un Lowry B šķīdums [1,63 g CuSO4 x 5H2O, 7,68 g K-Na tartrāts, destilēts H2O līdz 250 ml,
250 ml 0.2 M NaOH] attiecībā 50:1. Viena parauga apstrādei tika izmantots 1,9 ml gatavā
šķīduma, kas sajaukts ar 100 µl supernatanta, un iegūtais maisījums tika inkubēts istabas t° 20
min. Pēc inkubācijas maisījumam pievienoja 100 µl Folin reaģenta [Folin Ciocalteaus Reagent
un destilēts H2O attiecībā 1:1] un inkubēja istabas t° vēl 10 min. Maisījumu centrifugēja (5 min,
5000 g) un 1 ml supernatanta izmantoja proteīnu koncentrācijas noteikšanai spektrofotometrā,
aktivizējot mērījumu programmu “Lowry”.
44
Paraugu sagatavošana proteīnu elektroforēzei
Vienai reakcijai tika izmantots 20µg proteīna un katrs paraugs tika sagatavots 30 µl
daudzumā: proteīnu šķīdums tika atšķaidīts ar destilētu ūdeni līdz kopējam daudzumam 15 µl,
tad sajaukts ar 15 µl 2X Loading buffer [100 mM Tris-HCI (pH 6,8), 200 mM DTT, 4% SDS,
0,2% BPB, 20% glicerīnsC3H8O3]. Iegūto maisījumu denaturēja termostatā (Biokom Termo 24–
15) 90ºC 10 min.
Proteīnu sadalīšana gelā
Proteīnu sadalīšanai tika izmantota SDS PAGE elektroforēzes metode 10%
poliakrilamīda gelā, kura sastāvs norādīts 2.2. tabulā.
2.2. tabula
Poliakrilamīda gela sastāvs
Sadalošais gels Koncentrējošais gels
H2O destilēts 3,15 ml H2O destilēts 4,2 ml
30% C3H5NO šķīdums 2,5 ml 30% C3H5NO šķīdums 650 µl
4X Tris – SDS šķīdums, pH 8.8 1,87 ml 4X Tris – SDS šķīdums, pH 6,8 1,6 ml
10% (NH4)2S2O8 75 µl 10% (NH4)2S2O8 67 µl
TEMED 7,5 µl TEMED 6,7 µl
Elektroforēzes kamera tika pildīta ar 1X Run Buffer [0,192 mM C2H5NO2, 0,25 mM
Tris-HCI (pH 8,3) un 0,1% SDS] un aktivizēts režīms 200 V, 1 stunda.
Proteīnu pārnese
Pēc elektroforēzes proteīni no gela tika pārnesti uz PVDF membrānu, izmantojot iekārtu
proteīnu pārnesei no gela. Kamera tika piepildīta ar 1X Transfer Buffer [0,192 mM C2H5NO2,
0,25 mM Tris-HCI un 10% metanola] un aktivizēts režīms 100 V, 1 stunda.
Bloķēšana un imunodetekcija
Pēc pārneses membrāna tika inkubēta 5% piena šķīdumā TBS-TWEEN Buffer
[50 mM Tris-HCI pH 7,5, 150 mM NaCI un 0,1% Tween 20] uz kratītāja (65 apgr./min,
1 stunda), pēc inkubācijas izžāvēta uz filtrpapīra. Imunodetekcijai tika izmantotas antiERP
Rabbit primārās un anti Rabbit sekundārās antivielas. β aktīna ekspresija tika izmantota kā
ielādes kontrole un attiecīgi β aktīna imunodetekcijai tika izmantotas antiβactin Mouse
45
primārās un anti Mouse sekundārās antivielas. Membrāna tika inkubēta 3 ml primāro antivielu
5% piena šķīdumā (1 : 1000) rotējošā maisītājā (Elmi Intelli-Mixer RM-2M) 1 stundu. Pēc
inkubācijas membrānu atmazgāja 3 reizes ar 5 ml 1X TBS-TWEEN Buffer, inkubējot uz rotējošā
maisītāja 5 min. Pēc tam atmazgāto membrānu inkubēja 3 ml sekundāro antivielu
5% piena šķīdumā (1 : 1000) rotējošā maisītājā 1 stundu. Pēc inkubācijas membrānu atmazgāja
3 reizes ar 5 ml 1X TBS-TWEEN Buffer, inkubējot uz rotējošā maisītāja 5 min.
Vizualizācija un analīze
Membrāna tika pilnībā izžāvēta uz filtrpapīra un attīstīta uz Kodak Bio Max filmas
(Carestream Health, ASV), izmantojot ECL Prime Western Blotting Detection Reagent
detekcijas reaģentu (GE Healthcare, Lielbritānija), atbilstoši ražotāja rekomendācijām. Iegūtie
attēli tika skanēti (Canon PIXMA MG2550) un proteīnu ekspresijas līmenis tika noteikts ar
densitometrijas metodi, izmantojot Fujifilm Luminescent Image Analyzer LAS 1000 attēlu
apstrādes programmatūru Image Reader LAS-1000.
2.2.5. Citotoksicitātes noteikšana
Citotoksicitāte tika noteikta, izmantojot akridīna oranža/etīdija bromīda (AO/EB)
atkrāsošanas metodi, pēc Ribble un līdzautoru apraksta. Šī metode tika izvēlēta, jo ir minimāli
invazīva – nav nepieciešams atdalīt šūnas no virsmas, centrifugēt vai fiksēt, kas būtiski
samazina bojājumu risku un līdz ar to iespējams iegūt precīzāku rezultātu. Pielietojot AO/EB
metodi, iespējams vienlaicīgi diferencēt dzīvas un nekrotiskas šūnas pēc raksturīga un labi
izšķirama krāsojuma.
Citotoksicitātes noteikšanai dienu pirms transfekcijas šūnas tika izsētas uz segstikliņiem
24 iedaļu platē 1,8 x 105 šūnas/iedaļā, lai nākamajā dienā sasniegtu ~ 80% konfluenci. Tika
veikta LM LFV, LM un LIP optimālos reakcijas apstākļos, izmantojot LacZpDNS un šūnas
kultivētas CO2 inkubatorā 24 stundas. Pēc tam šūnas tika atmazgātas ar 1 ml ledusauksta PBS
un tām pievienoja 30 µl PBS ar EB/AO maisījumu (10 µg/ml katra krāsa). Atkrāsotās šūnas
(zaļš krāsojums – dzīvas; dzeltens/oranžs/sarkans – apoptotiskas vai mirušas) tika analizētas ar
fluorescences mikroskopu Nikon Eclipse 80i 200X kopējā palielinājumā, izmantojot Nikon B2-
A emisijas filtru. Ar Nikon kameru tika iegūti digitāli fotoattēli no 5–10 nejauši izvēlētiem
laukumiem. Šūnu skaitīšana, izmantojot iegūtos fotoattēlus, tika veikta datorprogrammā Image
J (NIH, ASV), katrā paraugā uzskaitot vismaz 100 šūnas.
46
2.2.6. Dzelzs satura noteikšana šūnās
Lai pārliecinātos, ka gēnu ekspresijas izmaiņas izraisa šūnās ieslēgto magnētisko
kompleksu daudzums, tika veikta šūnu magnētiskā iezīmēšana ar CM un noteikts dzelzs saturs
šūnās. Dienu pirms magnētiskās iezīmēšanas PC3 šūnas tika izsētas 24 iedaļu platēs
1,8 × 105 šūnas/iedaļā, lai nākamajā dienā sasniegtu ~ 80% konfluenci.
Šūnu magnētiskā iezīmēšana
Šūnu kultūru barotne tika nomainīta ar 400 µl Opti-MEM barotnes bez piedevām. CM
tika vorteksētas 30 s un 10 µg izšķīdināja Opti-MEM barotnē līdz kopējam daudzumam
100 µl. Maisījums pa pilienam tika pārnests uz šūnām platē un šūnas inkubētas optimālos
apstākļos uz MagnetoFACTOR magnētu sistēmas vai uz DynaFECTOR platformas. Pēc
inkubācijas šūnas tika kultivētas CO2 inkubatorā 24 stundas. Dzelzi saturošu šūnu skaits tika
noteikts, izmantojot Prussian blue (PB) krāsošanas metodi, bet dzelzs daudzums šūnās tika
noteikts spektrofotometriski.
Krāsošana pēc Prussian blue metodes
Šūnas tika mazgātas ar 1 ml PBS 3 reizes un fiksētas ar 1 ml FIX reaktīvu [0,05%
glutaraldehīda šķīdums PBS] istabas t° 15 min. Fiksētās šūnas tika mazgātas ar 1 ml PBS
3 reizes. Tika sagatavots 500 µl 2,3% HCl un 2% K3Fe(CN)6 šķīdums attiecībā 1:1, kuru
pievienoja šūnām un inkubēja istabas t° 30 min. Pēc inkubācijas šūnas tika mazgātas ar 1 ml
destilētu ūdeni 3 reizes. Dzelzi saturošas atkrāsotās šūnas (gaiši zils krāsojums) tika analizētas
gaismas mikroskopā (Leitz Labovert FS) ar kopējo palielinājumu 200X un, izmantojot
fotokameru Sony DSC W-115, tika iegūti to digitāli fotoattēli no 5–10 nejauši izvēlētiem
laukumiem. Šūnu skaitīšana, izmantojot fotoattēlus, tika veikta datorprogrammā Image J (NIH,
ASV).
Spektrofotometriskā analīze
Magnētiski iezīmēto šūnu spektrofotometriskai analīzei tika izmantota uz
1,10–fenontralīna (1,10–C12H8N2) bāzēta metode. 1,10–C12H8N2 saistās ar Fe2+, veidojot
kompleksu jonu oranžsarkanā krāsā ar raksturīgu UV absorbciju pie 510 nm.
47
Šūnas tika mazgātas ar 1 ml PBS 1 reizi un atdalītas no virsmas ar 200 µl DPBS ar
1 mM EDTA. Atdalītās šūnas tika savāktas stobriņos, centrifugētas (5 min; 1000 apgr./min) un
mazgātas ar 1 ml PBS, procedūru atkārtojot 2 reizes. No katra parauga tika paņemta 20 µl
alikvota šūnu skaita noteikšanai ar hemocitometru. Iegūtā šūnu nogulsne tika šķīdināta 200 µl
skābju šķīduma [3M HCl un 0,6M C2HCl3O2] un inkubēta uz nakti 65°C, lai no CM izdalītu
Fe2+ un Fe3+ jonus. Nākamajā dienā 100 µl no sagatavotā šķīduma tika pievienots 40 μl
10% ONH3·HCl šķīduma (reducē Fe3+ uz Fe2+), 200 μl C2H7NO2 buferšķīduma
[25g C2H7NO2 un 70 ml ledus etiķskābes maisījums uzpildīts ar dejonizētu ūdeni līdz 100 ml
tilpumam] un 100 μl 0.2% 1,10–C12H8N2 šķīduma. Maisījums tika inkubēts istabas t° 10 min.
Absorbcija tika mērīta pie 510 nm, izmantojot Evolution 60S spektrofotometru. Iekššūnu dzelzs
saturs tika kvantificēts attiecībā pret standartlīkni (standartlīknei izmantoti dzelzs hlorīda
paraugi ar dzelzs saturu 1,25–10 μg/ml). Dzelzs daudzums šūnās tika izteikts kā vidējais
daudzums pg /šūnā, aprēķinot pret kopējo šūnu skaitu plates iedaļā.
1.2.7. Datu statistiskā analīze
Katram eksperimentam tika veikti vismaz trīs secīgi atkārtojumi atbilstoši vadlīnijām.
Dati tika izteikti kā vidējās vērtības ± SN (standartnovirze). Datu statistiskā analīze tika veikta
programmā SPSS 15.0 for Windows (SPSS Inc., ASV). Vispirms tika noteikta paraugkopu
atbilstība normālsadalījumam, izmantojot Shapiro-Wilk testu, pēc kura rezultātiem tika
izvēlētas datu analīzes metodes. Kvantitatīvo datu atšķirība starp divām grupām tika noteikta,
izmantojot Stjūdenta t-testu, bet starp trim un vairāk grupām – vienfaktora dispersiju analīzi
(One-way ANOVA) ar sekojošu Tukey testu, kas paredzēts vienāda lieluma paraugkopu
salīdzināšanai. P vērtība < 0,05 tika uzskatīta par statistiski nozīmīgu.
48
3. REZULTĀTI
3.1. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz SPION sedimentāciju
Datormodelēšanas rezultāti parādīja, ka rotējošas magnētu sistēmas ģenerēta
magnētiskā lauka ietekmē notiek SPION kustība kā aksiālā tā laterālā virzienā, tā veicinot
SPION vienmērīgāku izkliedi un veidojot raksturīgu sedimentēto SPION ainu uz virsmas. Lai
eksperimentāli pārliecinātos vai pastāv atšķirības SPION sedimentācijā statiskajā magnētiskajā
laukā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, tika veikta CM sedimentācija uz šūnu
kultūras plates iedaļas virsmas reālajiem transfekcijas apstākļiem raksturīgā vidē, respektīvi,
Opti-MEM šūnu kultūru barotnē. Iegūtie rezultāti parāda krasas atšķirības SPION
sedimentācijas profilā statiskajā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā (3.1. att.).
3.1. attēls. SPION sedimentācijas profila salīdzinošā analīze; SPION dispersijas raksturīgā aina
statiskajā magnētiskajā laukā (a) un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā (b), × 400
Gadījumā, kad sedimentācija tika veikta statiskajā magnētiskajā laukā, SPION veidoja
izteiktu svītrveida rakstu (3.1. att. (a)). Laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā SPION
izvietojās vienmērīgāk (3.1. att. (b)), izteiktas formas struktūru veidošanās netika novērota.
Iegūtie rezultāti apstiprina pieņēmumu, ka aksiāli laterāla SPION kustība šķīdumā, ko izraisa
laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka iedarbība, noved pie vienmērīgāka SPION izvietojuma
uz šūnu kultūras plates iedaļas virsmas.
3.2. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz gēnu piegādi vēža šūnās
3.2.1. LM LFV – reakcijas optimālie apstākļi
Optimizācijas rezultātā tika konstatēts, ka visaugstākos transfekcijas efektivitātes
rādītājus ar minimālu citotoksisku efektu iespējams iegūt pie LacZpDNS:LIP:CM savstarpējās
49
attiecības 1:2:1 (3.2. att.). Liposomālā magnetofekcija ar LacZpDNS:LIP:CM savstarpējo
attiecību 1:1:0,5; 1:2:0,5; 1:1:1; 1:1:2 noved pie zemākas efektivitātes. Savukārt pie
LacZpDNS:LIP:CM attiecības 1:3:0,5; 1:3:1; 1:2:2; 1:3:2 tika konstatēts spēcīgs citotoksiskais
efekts (liels daudzums bojātu šūnu).
3.2. attēls. Transfekcijas efektivitātes izmaiņas un citotoksiskais efekts atkarībā no
LacZpDNS:LIP:CM savstarpējās attiecības (pēc β-galaktozidāzes ekspresijas PC3 šūnās laika-
fāzes variējošā magnētiskajā laukā), × 200
Visvairāk β-galaktozidāzi ekspresējošu šūnu, vienlaicīgi nenovērojot citotoksisku
efektu, statiskajā magnētiskajā laukā gan PC3, gan HEPG2 šūnās, iespējams iegūt pie
LacZpDNS:LIP:CM savstarpējās attiecības 1:2:1. Tāda pati LacZpDNS:LIP:CM savstarpējā
attiecība, attiecīgi 1:2:1 ļauj sasniegt maksimālo β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaitu,
vienlaicīgi nenovērojot citotoksisku efektu, arī laika-fāzes variējošā laukā gan PC3, gan HEPG2
šūnās.
Visvairāk β-galaktozidāzi ekspresējošu šūnu, vienlaicīgi nenovērojot citotoksisku
efektu gan PC3, gan HEPG2 šūnās, iespējams iegūt pie LacZpDNS:LIP savstarpējās attiecības
1:2.
Maksimālais siRNS inhibējošais efekts pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita
tika sasniegts izmantojot 50 nM siRNS pret β-galaktozidāzi.
Iegūtie dati tālāk tika izmantoti, lai noteiktu optimālos magnētiskā lauka parametrus –
ekspozīcijas ilgumu, magnētu apgriezienu frekvenci un magnētiskā lauka intensitāti.
Transfekcijas efektivitātes aprēķinu rezultātā iegūtie rādītāji ar LacZpDNS transficētās
PC3 un HEPG2 šūnās ar variablu ekspozīcijas ilgumu statiskajā un laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā apkopoti 3.1. un 3.2. tabulā.
50
3.1. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) PC3 šūnu paraugos pēc 2,5; 5; 10 un 20 min ekspozīcijas
magnētiskajā laukā
Eksp.
Nr.
Statiskais magn. lauks Laika-fāzes magn. lauks
2,5 min 5 min 10 min 20 min 2,5 min 5 min 10 min 20 min
1. 28,4 53,2 43,8 35,3 41,8 74,6 53,7 40,0
2. 33,5 59,0 51,2 42,9 43,6 77,3 57,9 45,8
3. 28,5 56,0 44,1 43,6 44,3 78,6 54,4 41,2
3.2. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) HEPG2 šūnu paraugos pēc 2,5; 5; 10 un 20 min ekspozīcijas
magnētiskajā laukā
Eksp.
Nr.
Statiskais magn. lauks Laika-fāzes magn. lauks
2,5 min 5 min 10 min 20 min 2,5 min 5 min 10 min 20 min
1. 17,3 36,1 29,5 19,8 65,0 79,0 72,1 54,8
2. 17,3 35,2 31,0 18,2 59,9 84,7 68,2 51,1
3. 14,8 31,2 26,4 16,4 57,0 74,6 63,7 48,1
Visvairāk β-galaktozidāzi ekspresējošo PC3 un HEPG2 šūnu tika konstatēts pie 5 min
ekspozīcijas statiskajā magnētiskajā laukā (3.3. att.). Palielinot ekspozīcijas ilgumu
magnētiskajā laukā, β-galaktozidāzi ekspresējošo PC3 un HEPG2 šūnu skaits samazinājās, lai
gan 5 min un 10 min ekspozīcijas rezultāti ir līdzvērtīgi, īpaši HEPG2 šūnās (3.3. att. (b)).
Optimālais ekspozīcijas ilgums statiskajā magnētiskajā laukā – 5 min tika izmantots
turpmākajos eksperimentos.
51
3.3. attēls. Transfekcijas efektivitāte PC3 šūnās (a) un HEPG2 šūnās (b) pēc β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita ar variablu ekspozīcijas ilgumu statiskajā magnētiskajā laukā (n = 3)
3.4. attēls. Transfekcijas efektivitāte PC3 šūnās (a) un HEPG2 šūnās (b) pēc β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita ar variablu ekspozīcijas ilgumu laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā (n = 3)
Analogs rezultāts tika iegūts nosakot optimālo ekspozīcijas ilgumu laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā. Visvairāk β-galaktozidāzi ekspresējošo PC3 un HEPG2 šūnu tika
konstatēts pie 5 min ekspozīcijas magnētiskajā laukā (3.4. att.). Līdzīgi kā statiskā magnētiskā
lauka gadījumā, palielinot ekspozīcijas ilgumu > 5 min, tika novērota stabila transfekcijas
efektivitātes samazināšanās gan PC3, gan HEPG2 šūnās.
Turpmākajos eksperimentos tika pārbaudīta laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka
30,1 ±
2,9
56,1 ±
2,946,4 ±
4,2 40,6 ±
4,6
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
2.5 5 10 20
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Laiks (min)
16,5 ±
1,4
34,2 ±
2,6 29,0 ±
2,318,1 ±
1,7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
2.5 5 10 20
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Laiks (min)
43,2 ±
1,3
76,8 ±
2,0
55,3 ±
2,342,3 ±
3,1
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
2.5 5 10 20
Tr
an
sfe
kc
ija
se
fek
tiv
itā
te(%
)
Laiks (min)
60,6 ±
4,1
79,4 ±
5,168,0 ±
4,2
51,3 ±
3,4
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
2.5 5 10 20
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Laiks (min)
b a
b a
52
raksturojošo parametru – magnētu apgriezienu frekvences un magnētiskā lauka gradienta
ietekme uz LacZ gēna ekspresiju.
Transfekcijas efektivitātes aprēķinu rezultātā iegūtie rādītāji ar LacZpDNS transficētās
PC3 šūnās pie variablas magnētu apgriezienu frekvences laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā apkopoti 3.3. tabulā.
3.3. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) PC3 šūnu paraugos pie 5; 25; 50 un 100 apgr./min magnētu
apgriezienu frekvences
Eksp. Nr. 5 apgr./min 25 apgr./min 50 apgr./min 100 apgr./min
1. 70,9 42,8 36,9 47,6
2. 72,4 44,0 39,9 50,8
3. 78,6 46,0 37,6 53,2
Analizējot transfekcijas efektivitāti pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita PC3
šūnās, pie dažādām rotējošas magnētu sistēmas magnētu apgriezienu frekvencēm, tika
konstatēts, ka visefektīvākā iedarbība ir 5 min ekspozīcijai laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā ar 5 apgr./min frekvenci (3.5. att.). Palielinot magnētu apgriezienu frekvenci
(25 un 50 apgr./min), vērojams straujš transfekcijas efektivitātes kritums, bet pie
100 apgr./min transfekcijas efektivitāte atkal paaugstinās.
3.5. attēls. Transfekcijas efektivitāte PC3 šūnās pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita ar
variablu magnētu apgriezienu frekvenci pie 5 min ekspozīcijas laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā (n = 3)
Transfekcijas efektivitātes aprēķinu rezultātā iegūtie rādītāji ar LacZpDNS transficētās
74,0 ± 4,1
44,3 ±1,638,1 ± 1,6
50,5 ± 2,8
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
5 25 50 100
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Frekvence (apgr./min)
53
HEPG2 šūnās ar variablu magnētu apgriezienu frekvenci laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā parādīti 3.4. tabulā.
3.4. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) HEPG2 šūnu paraugos pie 5; 25; 50 un 100 apgr./min magnētu
apgriezienu frekvences
Eksp. Nr. 5 apgr./min 25 apgr./min 50 apgr./min 100 apgr./min
1. 41,1 52,0 77,4 74,4
2. 36,8 50,6 77,5 67,9
3. 35,3 45,5 69,4 66,0
HEPG2 šūnās augstākie LacZ piegādes efektivitātes rādītāji pēc β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita tika novēroti pie 50 apgr./min magnētu apgriezienu frekvences ar
5 min ekspozīciju magnētiskajā laukā (3.6. att.). Taču augsta transfekcijas efektivitāte
saglabājas arī pie magnētu apgriezienu frekvences 100 apgr./min.
3.6. attēls. Transfekcijas efektivitāte HEPG2 šūnās pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita
ar variablu magnētu apgriezienu frekvenci pie 5 min ekspozīcijas laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā (n = 3)
Transfekcijas efektivitātes aprēķinu rezultātā iegūtie rādītāji ar LacZpDNS
transficētajās PC3 šūnās ar variablu magnētu magnētiskā lauka intensitāti statiskajā un
laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā apkopoti 3.5. tabulā.
37,6 ± 3,0
49,4 ± 3,4
74,8 ± 4,669,4 ± 4,4
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
5 25 50 100
Tra
nsf
ekci
jas
efek
tivit
āte
(%
)
Frekvence (apgr./min)
54
3.5. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) PC3 šūnu paraugos pie 0,35; 0,2 un 0,1 T magnētiskā lauka
intensitātes
Eksp. Nr. Statiskais magn. lauks Laika-fāzes magn. lauks
0,35 T 0,2 T 0,1 T 0,35 T 0,2 T 0,1 T
1. 49,3 25,8 8,8 72,9 54,0 42,6
2. 52,6 27,6 9,3 76,1 56,9 44,6
3. 50,5 31,7 12,4 78,2 58,4 39,2
Analizējot transfekcijas efektivitātes izmaiņas atkarībā magnētiskā lauka intensitātes,
visaugstākā LacZ ekspresija PC3 šūnās gan statiskajā, gan laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā tika novērota pie maksimālās pielietotās magnētiskā lauka intensitātes 0,35 T (3.7. att.).
3.7. attēls. Transfekcijas efektivitāte PC3 šūnās pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita ar
optimālu magnētiskā lauka ekspozīcijas ilgumu/frekvenci un variablu magnētiskā lauka
intensitāti statiskajā magnētiskajā laukā (a) un laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā (b)
(n = 3)
Samazinot magnētiskā lauka intensitāti, abos gadījumos tika novērots stabils
transfekcijas efektivitātes kritums, taču redzams, ka statiskajā magnētiskajā laukā transfekcijas
efektivitātes samazinājums ir straujāks (3.7. att. (a)) nekā laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā (3.7. att. (b)).
Iegūtie optimālos reakcijas apstākļus atspoguļojošie rādītāji pēc β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita tika izmantoti, lai novērtētu laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka
ietekmi uz LacZ un ECFP-ERp29 ekspresiju PC3 un HEPG2 šūnās salīdzinājumā ar divām
50,8 ±
1,7
28,4 ±
3,0
10,2 ±
2,0
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
0.35 0.2 0.1
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Intensitāte (T)
75,7 ±
2,7
56,4 ±
2,2
42,1 ±
2,7
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
0.35 0.2 0.1
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Intensitāte (T)
b a
55
plaši pielietotām konvencionālajām gēnu piegādes metodēm – liposomālo magnetofekciju un
lipofekciju.
3.2.2. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz nukleīnskābju piegādes
efektivitāti šūnās
Rezultāti, kas iegūti pēc PC3 šūnu transfekcijas ar LacZ saturoša gēna pDNS,
izmantojot dažādas gēnu piegādes metodes – lipofekciju, kad šūnas nav pakļautas magnētiskā
lauka iedarbībai, liposomālo magnetofekciju statiskajā magnētiskajā laukā un laika-fāzes
variējošā magnētiskajā laukā optimālos reakcijas apstākļos, apkopoti 3.6. tabulā.
3.6. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) ar dažādām metodēm transficētu PC3 šūnu paraugos
Eksp. Nr. L LM LM LFV
1. 33,9 50,9 74,9
2. 35,0 59,5 73,9
3. 35,4 58, 2 69,8
4. 40,0 58,0 78,3
5. 41,7 60,1 79,6
6. 41,2 60,8 79,0
7. 43,2 62,2 77,7
8. 44,4 61,0 78,6
9. 39,0 61,0 79,2
Tika konstatēts, ka LM LFV ietekmē būtiski paaugstinās LacZ gēna ekspresija
PC3 šūnās (p < 0,001) salīdzinājumā ar abām pārējām metodēm – L un LM. Pielietojot
LM LFV, iespējams sasniegt visaugstāko transfekcijas efektivitāti pēc β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita – 79,6% transficēto šūnu, kas ir par 21% vairāk, salīdzinot ar LM un
par 42% vairāk, salīdzinot ar L.
Turklāt tika novērots, ka ar LM LFV metodi transficētajās, atkrāsotajās PC3 šūnās
raksturīgā krāsojuma intensitāte ir augstāka, salīdzinot gan ar LM, gan L (3.8. att. (a)).
Tas netieši norāda, ka, pielietojot LM LFV, ne tikai paaugstinās β-galaktozidāzi ekspresējošo
šūnu skaits, bet arī pieaug β-galaktozidāzes ekspresijas līmenis transficētajās šūnās.
56
3.8. attēls. LacZ gēna piegāde PC3 šūnās, izmantojot trīs dažādas gēnu piegādes metodes:
(a) β-galaktozidāzes ekspresija PC3 šūnās (× 200), (b) transfekcijas efektivitāte pēc
β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita (n = 9; * p 0,05, salīdzinot ar L un LM,
Tukey tests)
Līdzīgi rezultāti tika iegūti nosakot laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmi uz
ECFP-ERp29pDNS piegādi PC3 šūnās. Relatīvā proteīnu daudzuma (densitometriskajās
vienībās), kas atspoguļo ECFP-ERp29 proteīnu ekspresijas līmeni novērtējuma rezultāti
apkopoti 3.7. tabulā.
3.7. tabula
Relatīvais proteīnu daudzums ar dažādām metodēm transficētu PC3 šūnu paraugos
Eksp. Nr. L LM LM LFV
1. 19864,8 30656,5 33907,7
2. 19616,5 30582,1 33873,7
3. 19328,5 29764,4 33930,4
4. 20443,0 29707,9 34264,0
5. 20056,3 30530,5 33496,0
6. 19971,7 30116,2 34066,8
7. 20251,3 30217,6 33823,9
39,3 ± 3,8
59,1 ± 3,4
76,8 ± 3,3*
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
L LM LM LFV
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Transficēšanas metode
b
a
57
3.7. tabulas turpinājums
Eksp.Nr. L LM LM LFV
8. 19809,9 30011,2 33609,2
9. 19649,5 30324,6 34395,0
Tika konstatēts, ka LM LFV pielietojums būtiski paaugstina arī ECFP-ERp29 piegādes
efektivitāti PC3 šūnās (p < 0,001) salīdzinājumā ar abām pārējām gēnu piegādes metodēm – L
un LM (3.9. att. (a)). LM LFV gadījumā kopējais ECFP-ERp29 ekspresijas līmenis ir par 6%
augstāks, salīdzinot ar LM un par 22% augstāks, salīdzinot ar L
(3.9. att. (b)).
3.9. attēls. ECFP-ERp29 gēna piegāde PC3 šūnās, izmantojot trīs dažādas gēnu piegādes
metodes: (a) ECFP-ERp29 ekspresija PC3 šūnās (Western blota analīze), (b) transfekcijas
efektivitāte pēc ECFP-ERp29 ekspresijas līmeņa (n = 9; * p 0,05, salīdzinot ar L un LM,
Tukey tests)
Rezultāti, kas iegūti transficējot HEPG2 šūnas ar LacZ saturoša gēna pDNS, izmantojot
dažādas gēnu piegādes metodes – lipofekciju, kad šūnas nav pakļautas magnētiskā lauka
19887,9 ±
340,1
28055,1 ±
345,1
31425,3 ±
285,6*
0
10000
20000
30000
40000
L LM LM LFV
De
nsit
om
etr
isk
ās v
ien
ība
s
Transficēšanas metode
b
a
58
iedarbībai, liposomālo magnetofekciju statiskajā magnētiskajā laukā un laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā optimālos apstākļos, apkopoti 3.8. tabulā.
3.8. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) ar dažādām metodēm transficētu HEPG2 šūnu paraugos
Eksp. Nr. L LM LM LFV
1. 32,3 37,0 87,2
2. 30,0 37,2 86,1
3. 30,2 35,2 87,7
4. 28,7 33,9 79,6
5. 26,1 35,6 79,1
6. 24,5 34,1 75,4
7. 26,9 31,0 83,3
8. 26,1 30,3 80,0
9. 24,0 33,6 76,4
3.10. attēls. LacZ gēna piegāde HEPG2 šūnās, izmantojot trīs dažādas gēnu piegādes metodes:
(a) β-galaktozidāzes ekspresija HEPG2 šūnās (× 200), (b) transfekcijas efektivitāte pēc
β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita (n = 9; * p 0,05, salīdzinot ar L un LM, Tukey tests)
27,6 ± 2,7
34,2 ± 2,3
81,6 ± 4,6*
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
L LM LM LFV
Tr
an
sfe
kc
ija
s e
fek
tiv
itā
te (
%)
Transficēšanas metode
b
a
59
Tika konstatēts, ka LM LFV ietekmē būtiski paaugstinās transfekcijas efektivitāte arī
HEPG2 šūnās (p < 0,001) salīdzinājumā ar abām pārējām metodēm – L un LM. Pielietojot LM
LFV, iespējams sasniegt visaugstāko transfekcijas efektivitāti pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo
šūnu skaita – 87,7% transficētu šūnu, kas ir par 51% vairāk, salīdzinot ar LM un par 56% vairāk,
salīdzinot ar L. Kā redzams 3.10. attēlā (a), arī HEPG2 šūnās tika novērots, ka ar LM LFV
metodi transficētajās atkrāsotajās šūnās raksturīgā krāsojuma intensitāte ir ievērojami augstāka,
salīdzinot ar LM un L.
Relatīvā proteīnu daudzuma (densitometriskajās vienībās), kas norāda uz
ECFP-ERp29 proteīnu ekspresijas līmeni novērtējuma rezultāti apkopoti 3.9. tabulā.
3.9. tabula
Relatīvais proteīna daudzums ar dažādām metodēm transficētu HEPG2 šūnu paraugos
Eksp. Nr. L LM LM LFV
1. 22721,1 24645,4 30427,4
2. 22641,3 25117,6 31459,2
3. 22548,7 24926,8 30545,6
4. 23085,6 25310,5 30979,6
5. 22639,7 25024,2 30647,2
6. 22465,3 25204,5 30514,2
7. 22756,9 25204,6 30223,4
8. 22725,1 24918,0 30871,8
9. 22207,9 24629,6 30865,8
ECFP-ERp29 ekspresijas rādītāji HEPG2 šūnās atspoguļoti 3.11. attēlā.
Tika konstatēts, ka LM LFV pielietojums būtiski paaugstina ECFP-ERp29 gēna piegādi
HEPG2 šūnās (p < 0,001) salīdzinājumā ar abām pārējām gēnu piegādes metodēm. Kopējais
ECFP-ERp29 ekspresijas līmenis LM LFV ietekmē pieaug par 9%, salīdzinot ar LM un par
15%, salīdzinot ar L.
Iegūtie rezultāti parāda, ka, salīdzinot trīs dažādas gēnu piegādes metodes, LM LFV
pielietojums noved pie gan pie visaugstākā reportējošo gēnu ekspresējošo šūnu skaita, gan pie
visaugstākā kopējā proteīnu līmeņa transficētajās šūnās.
60
3.11. attēls. ECFP-Erp29 gēna piegāde HEPG2 šūnās, izmantojot trīs dažādas gēnu piegādes
metodes: (a) ECFP-ERp29 ekspresija HEPG2 šūnās (Western blota analīze), (b) transfekcijas
efektivitāte pēc ECFP-ERp29 ekspresijas līmeņa (n = 9; * p 0,05, salīdzinot ar L un LM,
Tukey tests)
Ko-transfekcijas eksperimentos tika pārbaudīts siRNS inhibējošais efekts uz
β-galaktozidāzes ekspresiju PC3 šūnās, izmantojot dažādas gēnu piegādes metodes.
Iegūtie rezultāti atspoguļoti 3.10. tabulā.
3.10. tabula
Transfekcijas efektivitāte (%) ar dažādām metodēm transficētu un ko-transficētu PC3 šūnu
paraugos
Eksp. Nr. L L siRNS LM LM siRNS LM LVF LM LFV siRNS
1. 43,1 9,8 59,8 9,1 78,0 6,2
2. 44,8 10,0 60,0 9,0 75,3 6,0
3. 43,8 9,9 60,0 8,9 79,0 6,0
4. 39,5 9,6 54,2 9,2 70,1 6,0
5. 38,2 9,6 55,1 8,8 71,2 5,9
22286,0 ±
237,6
24997,9 ±
242,2
30141,7 ±
365,4*
0
10000
20000
30000
40000
L LM LM LFV
De
nsit
om
etr
isk
ās v
ien
ība
s
Transficēšanas metode
b
a
61
3.10. tabulas turpinājums
Eksp. Nr. L siRNS LM LM siRNS LM LFV LM LFV si RNS
6. 34,7 10,1 51,1 9,0 69,9 6,1
7. 42,2 9,9 56,8 9,2 77,5 6,2
8. 43,1 9,7 56,0 8,9 73,4 6,1
9. 44,1 10,0 58,1 9,2 76,4 6,0
Tika panākta būtiska siRNS inhibējoša ietekme uz β-galaktozidāzes ekspresiju PC3
šūnās (p < 0,001), pielietojot visas trīs gēnu piegādes metodes (3.12. att. (a)).
3.12. attēls. LacZ gēna un siRNS pret β-galaktozidāzi piegāde PC3 šūnās, izmantojot trīs dažādas
gēnu piegādes metodes: (a) LacZ gēna ekspresija PC3 šūnās (× 200), (b) transfekcija ar LacZ
(balts) un ko-transfekcija ar LacZ un siRNS pret β-galaktozidāzi (pelēks) (n = 9; * p 0,05,
salīdzinot ar L/L siRNS un LM/LM siRNS, Tukey tests)
*
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
90%
100%
L/ L siRNS LM/ LM siRNS LM LFV/ LM
LFV siRNS
siR
NS
in
hib
ējo
ša
is e
fek
ts
Transf icēšanas metode
a
b
62
Tomēr, novērtējot siRNS inhibējošo efektu attiecībā pret transfekciju bez siRNS,
respektīvi, L, LM un LM LFV, tika konstatēts, ka LM LFV ietekmē tiek panākts visaugstākais
β-galaktozidāzes ekspresiju inhibējošais efekts – 92,4% β-galaktozidāzi neekspresējošu šūnu,
kas ir būtiski vairāk, salīdzinot ar LM (86,3%) un L (80,9%) (p < 0,001) (3.12. att. (b)).
3.2.3. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka pielietojuma citotoksiskais efekts
Ar LacZpDNS transficētu PC3 šūnu dzīvo/nedzīvo šūnu attiecības aprēķinu rezultātā
iegūtie rādītāji apkopoti 3.11. tabulā.
3.11. tabula
Nedzīvo šūnu īpatsvars (%) ar dažādām metodēm transficētu PC3 šūnu paraugos
Eksp. Nr. L LM LM LFV
1. 13 16 6
2. 9 17 7
3. 10 17 6
4. 10 20 7
5. 9 21 6
6. 11 18 5
7. 11 16 7
8. 10 17 7
9. 9 19 8
Vizuāli visaugstākais citotoksiskais efekts tika novērots ar LM transficētu PC3 šūnu
paraugos (3.13. att. (a)). Aprēķinu rezultātā tika konstatēts, ka LM LFV ietekmē būtiski
samazinās apoptotisko un mirušo šūnu īpatsvars paraugos, salīdzinot abām pārējām gēnu
piegādes metodēm – LM un L (3.13. att. (b)). Dzīvo PC3 šūnu īpatsvars LM LFV ietekmē
sasniedza 94%, kamēr LM gadījumā 82% un L gadījumā 90% (p < 0,001).
63
3.13. attēls. Dažādu gēnu piegādes metožu pielietojuma citotoksiskais efekts: (a) ar trim
dažādām gēnu piegādes metodēm transficētas un pēc AO/EB metodes atkrāsotās PC3 šūnas
(× 200), (b) citotoksicitāte (n = 9; * p 0,05, salīdzinot ar L un LM, Tukey tests)
3.3. Laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekme uz SPION piegādes efektivitāti vēža
šūnās
Lai netieši apstiprinātu iepriekšējās eksperimentu sērijās konstatēto, ka β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita pieaugumu un ECFP-ERp29 kopējā ekspresijas līmeņa
paaugstināšanos laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē izraisa lielāks sedimentēto un
attiecīgi PC3 šūnās iekļauto SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu
daudzums, tika veikta SPION internalizācijas kvalitatīva analīze. Veicot šūnu magnētisko
iezīmēšanu ar 10 µg SPION/šūnu kultūras plates iedaļu, un pielietojot PB krāsošanas metodi,
tika skaidri parādīta SPION klātbūtne magnētiski iezīmētu šūnu citoplazmā.
10 ± 1,3
18 ± 1,8
7 ± 0,9*
0
5
10
15
20
25
L LM LM LFV
Ne
dz
īvo
šū
nu
īp
ats
va
rs (
%)
Transf icēšanas metode
b
a
64
3.14. attēls. Pēc PB metodes atkrāsotās magnētiski iezīmētās PC3 šūnas (× 200): (a) – magnētiskā
iezīmēšana veikta statiskajā magnētiskajā laukā, (b) – magnētiskā iezīmēšana veikta laika-fāzes
variējošā magnētiskajā laukā; zilais krāsojums norāda uz šūnās internalizēto SPION klātbūtni
Kā redzams 3.14. attēlā, PC3 šūnu magnētiskās iezīmēšanas efektivitāte pēc
ekspozīcijas kā statiskajā magnētiskajā laukā (3.14. att. (a)), tā laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā (3.14. att. (b)) bija tuvu 100%. Vizuāli starp abām pielietotajām metodēm
tika novērota atšķirība krāsojuma intensitātē, kas netieši norāda par atšķirībām internalizētās
dzelzs daudzumā.
Lai apstiprinātu iegūtos rezultātus pēc PB krāsojuma, tika kvantitatīvi novērtēts šūnās
ieslēgto SPION daudzums, veicot dzelzs satura spektrofotometrisku analīzi ar SPION
magnētiski iezīmētās šūnās. Aprēķinu rezultāti apkopoti 3.12. tabulā.
3.12. tabula
PC3 šūnās internalizētās dzelzs daudzums (pg) dažādu magnētisko lauku ietekmē
Eksp.Nr. Statiskais magn. lauks Laika-fāzes magn. lauks
1. 30,0 59,0
2. 30,5 58,8
3. 29,5 59,1
4. 27,7 57,4
5. 28,4 57,9
6. 28,5 56,0
7. 22,9 55,1
8. 25,2 52,4
9. 23,4 50,2
65
3.15. attēls. Dzelzs daudzums magnētiski iezīmētās PC3 šūnās: (a) – magnētiskā iezīmēšana
veikta statiskajā magnētiskajā laukā, (b) – magnētiskā iezīmēšana veikta laika-fāzes variējošā
magnētiskajā laukā (n = 9; * p 0,05, salīdzinot ar a, t-tests)
Tika konstatēts, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē būtiski – 2 reizes
paaugstinās internalizētās dzelzs daudzums PC3 šūnās, salīdzinot ar statiskā magnētiskā lauka
ietekmē šūnās internalizētās dzelzs daudzumu (3.15. att.). Iegūtie rezultāti apstiprina šūnās
internalizēto SPION un attiecīgi SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu
saistību ar paaugstinātu gēnu ekspresiju laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē.
Pētījumā eksperimentāli tika parādīts, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē
tiek panākta vienmērīgāka SPION izkliede uz šūnu kultūras plates iedaļas virsmas, salīdzinot
ar SPION izkliedi uz virsmas statiskajā magnētiskajā laukā. Laika-fāzes magnētiskā lauka
ietekmē paaugstinās šūnās internalizēto SPION daudzums, kā arī palielinās gan transficēto šūnu
skaits, gan kopējais ekspresētā proteīna līmenis transficētajās šūnās.
Laika-fāzes variējošā magnētiskā lauka ietekmē samazinās gēnu piegādes izraisītais
citotoksiskais efekts.
27,3 ± 2,8
56,2 ± 3,1*
0
10
20
30
40
50
60
70
a b
Fe2
+/u
z šū
nu
(p
g)
66
DISKUSIJA
Gēnu terapijas efektivitāti raksturo atbilstošas devas terapeitiskā gēna piegāde mērķa
šūnās, neizraisot būtisku citotoksisko efektu. Magnetofekcija ir viena no efektīvākajām gēnu
piegādes metodēm, kuras pamatā ir ar SPION saistītu nukleīnskābju piegāde šūnās ar ārēja
statiska magnētiskā lauka palīdzību. Magnētiskais lauks ļauj īsā laikā koncentrēt nukleīnskābes
uz šūnu virsmas, tā paaugstinot arī šūnās piegādāto nukleīnskābju daudzumu.
Literatūras datu analīzē tika noskaidrots, ka dažādu alternatīvu (ne statisku) magnētisko
lauku pielietojums uzlabo magnetofekcijas efektivitāti. Pastāv uzskats, ka kompleksa
magnētiskā lauka iedarbība izraisa SPION-nukleīnskābju svārstības dažādos virzienos, tā
stimulējot to pārnesi caur šūnas membrānu, taču šīs parādības mehānisms līdz galam nav
noskaidrots. Mūsu starpdisciplinārā grupa aprakstījusi jaunu – laika-fāzes variējošu magnētisko
lauku, kura pamatā ir permanentu magnētu orbitāla rotācija šūnu kultūrai paralēlā plaknē.
Datormodelēšanas rezultāti parādīja, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē, SPION
sedimentācija notiek tās pārmaiņus pārvietojot aksiālā un laterālā virzienā, kā rezultātā tiek
panākta vienmērīga SPION izkliede uz virsmas.
Promocijas darbā ir praktiski pierādīts, ka pielietojot laika-fāzes variējošu magnētisko
lauku, iespējams būtiski paaugstināt nukleīnskābju piegādes efektivitāti vēža šūnās.
Lai apstiprinātu datormodelēšanas rezultātus, pirmkārt tika savstarpēji salīdzināta
sedimentēto SPION izkliede statiska un laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē. Iegūtie
rezultāti uzrādīja krasu atšķirību SPION izvietojumā uz šūnu kultūras plates iedaļas virsmas –
statiskajā magnētiskajā laukā SPION veidoja izteiktu svītrveida rakstu ar salīdzinoši lieliem bez
SPION laukumiem starp svītrveida struktūrām, kamēr LM LFV gadījumā SPION izvietojās
vienmērīgāk un bez SPION laukumi praktiski novēroti netika. Šāds SPION sedimentācijas
profils varētu būt izskaidrojams ar specifisko magnetofekcijas iekārtas DynaFECTOR magnētu
rotācijas programmu, kas nodrošina magnētiskā lauka spēku nepārtrauktu mainību, kas saistīta
ar trim dažādām fāzēm (magnētu pozīcija zem iedaļas) magnētu rotācijas procesā. Iegūtie
rezultāti varētu norādīt uz to, ka magnētu orbitālās kustības laikā notiek nepārtraukta SPION
pārvietošana aksiāli laterālā virzienā, nodrošinot to pakāpenisku sedimentāciju “soli pa solim”
tā, iespējams, kavējot lineāru ķēžveida struktūru veidošanos. Dažādu magnētisko lauku
atšķirīgā ietekme uz magnētisko nanodaļiņu kustību šķīdumā novērota arī citos pētījumos.
Gravel grupas pētījumā tika novērotas būtiskas atšķirības magnētisko nanodaļiņu izvietojumā
tubulāra divpolu trīsfāžu elektromagnēta ģenerētu magnētisko lauku iedarbības rezultātā.
Rotējošā magnētiskajā laukā magnētiskās nanodaļiņas veidoja apaļas formas virpuļveida
67
struktūras, bet oscilējoša un statiska magnētiskā lauka gadījumā – lineāras struktūras, kas sakrīt
ar šajā pētījumā novēroto attiecībā uz statisko magnētisko lauku.
Ja SPION sedimentācijas procesa laikā laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā daļiņu
pārvietošanās notiek gan aksiālā, gan laterālā virzienā, tad sagaidāms, ka arī SPION-
nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu kustība notiks ne tikai aksiālā, bet arī
laterālā virzienā. Tas, iespējams, varētu sekmēt šo kompleksu iekļūšanu šūnās, kas attiecīgi
rezultēsies paaugstinātā transfekcijas efektivitātē.
Optimālā pDNS-LIP-SPION savstarpējā attiecība gan magnetofekcijai statiskajā un
laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā abām šūnu līnijām bija identiska: 1:2:1. Pie
x pDNS-LIP-SPION savstarpējās attiecības tika novērota nukleīnskābju piegādes
efektivitātes samazināšanās, savukārt pie x pDNS-LIP-SPION savstarpējās attiecības
paaugstinājās citotoksiskais efekts. Neskatoties uz identisku pDNS-LIP-SPION savstarpējo
attiecību, kas tika pielietota magnetofekcijai statiskajā un laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā, transfekcijas efektivitāte laika-fāzes variējošā magnētiskā lauka gadījumā bija augstāka,
nekā statiskajā magnētiskajā laukā. Tas varētu norādīt uz to, ka laika-fāzes variējoša lauka
ietekmē paaugstinās internalizēto nukleīnskābju daudzums un tam ir saistība ar
SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu laterālu kustību rotācijas ietekmē,
jo visi citi parametri (magnētiskā lauka intensitāte, darbības ilgums), salīdzinot ar statisko
magnētisko lauku, ir identiski.
Magnetofekcijas efektivitāte variē atkarībā no ekspozīcijas ilguma magnētiskajā laukā.
Tika novērots, ka visefektīvākā LacZ gēna piegāde PC3 un HEPG2 šūnās
(pēc β-galaktozidāzi ekspresējošo šūnu skaita) notiek pie 5 min ekspozīcijas gan statiskajā, gan
laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā. Īsāka ekspozīcija noved pie samazinātas gēnu
piegādes efektivitātes, kas liecina par to, ka ekspozīcijas ilgums < 5 min ir nepietiekams
SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu koncentrēšanai uz šūnas virsmas.
Iegūtie rezultāti sakrīt ar Huth grupas konstatēto – pētījumos ar HeLa šūnu līniju tika novērota
SPION koncentrēšanās apkārt šūnas membrānai jau pēc 5 min ekspozīcijas magnētiskajā laukā.
Arī mūsu iepriekšējos pētījumos transgēna ekspresija vēža šūnās, transficējot ar
magnetofekcijas metodi, tika konstatēta jau pēc 4 stundām salīdzinājumā ar lipofekcijas metodi
– 8 stundām, kas apstiprina citu autoru pētījumos konstatēto attiecībā uz magnetofekcijas
kinētiku salīdzinājumā ar citām metodēm, piemēram, lipofekciju
(Mykhaylyk et al., 2009b, 2010).
Magnetofekcijas efektivitātes izmaiņas, atkarībā no ekspozīcijas ilguma magnētiskajā
laukā, iepriekš novērojusi Kamau ar līdzautoriem. Savstarpēji salīdzinot reportējošā gēna
ekspresiju vairākās sūnu līnijās, pēc 5 un 20 min ekspozīcijas kombinētā statiskā/oscilējošā
68
magnētiskajā laukā, izmantojot divu veidu SPION, tika konstatēts, ka efektīvāka ir 20 min
ekspozīcija magnētiskajā laukā. Pretēji mūsu grupas iegūtie rezultāti liecina, ka, izmantojot
tikai 5 min ekspozīciju gan statiskajā, gan laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā, ir iespējams
sasniegt augstu transfekcijas efektivitāti, bet jāatzīmē atšķirības pētījuma dizainā. Kamau
grupas pētījumā gēnu piegāde HeLa un Cos7 šūnās tika nodrošināta ar magnetofekcijas metodi,
izmantojot komerciālās polyMAG un autoru sintezētās ar PEI pārklātās SPION. Jebkurš no šiem
faktoriem – gan SPION, gan reportējošo gēnu kodējoša plazmīdas DNS, gan izvēlētā šūnu līnija
un visbeidzot transfekcijas metode var ietekmēt gēnu piegādes efektivitāti.
Maksimāli īss ekspozīcijas ilgums varētu būt kritisks faktors klīniskajos pētījumos, kur,
lai panāktu vēlamo efektu, nepieciešams pielietot augstas intensitātes magnētisko lauku.
Pierādīts, ka mērenas intensitātes (0,5–2 T) magnētiskā lauka iedarbība neizraisa blakusefektus
(Leszczynski, 2005), bet ekspozīcija augstas intensitātes (200 T) magnētiskajā laukā var izraisīt
DNS degradāciju (Li and Chow, 2001). Šajā pētījumā magnētu specifiskā izvietojuma rezultātā
tiek radīts mērens (0,35 T) magnētiskais lauks, taču tas ir pietiekams efektīvam pielietojumam
arī in vivo (Chertok et al., 2011).
Interesanti rezultāti tika iegūti novērtējot magnetofekcijas efektivitātes izmaiņas
atkarībā no magnētu apgriezienu frekvences – nozīmīgākā laika-fāzes variējoša magnētiskā
lauka raksturojošā rādītāja. Datorsimulācijās tika parādīts, ka SPION sedimentācija uz virsmas
ir atkarīga no magnētu apgriezienu frekvences – palielinot magnētu apgriezienu frekvenci
līdz noteiktai robežai ( = 40), SPION sedimentācija uz virsmas kļūst vienmērīgāka un būtiski
nemainās pie tālāka frekvences pieauguma. Eksperimentāli tika konstatēts, ka magnetofekcijas
efektivitāte variē atkarībā no magnētu apgriezienu frekvences, bet atšķirīgi dažādās šūnu līnijās.
Vislielākais β-galaktozidāzi ekspresējošo PC3 šūnu skaits tika iegūts pie 5 apgr./min ar 5 min
ekspozīciju magnētiskajā laukā, savukārt vislielākais
β-galaktozidāzi ekspresējošo HEPG2 šūnu skaits – ar 5 min ekspozīciju magnētiskajā laukā pie
magnētu apgriezienu frekvences 50 apgr./min. Atšķirības starp datorsimulācijās un
eksperimentāli iegūtajiem rezultātiem varētu norādīt uz šūnu membrānas lomu internalizācijas
iznākumā, bet lai to precīzi noteiktu ir nepieciešami papildu pētījumi. Eksperimentāli iegūtie
rezultāti varētu būt skaidrojami pirmkārt ar PC3 un HEPG2 šūnu atšķirīgajām membrānas
īpašībām, jo, zināms, ka SPION internalizācijas sekmes ir tieši atkarīgas no šūnu veida (Kamau
et al., 2006; Cromer Berman et al.; Schwarz et al., 2012). PC3 šūnas (d = 23 µm) ir vairāk kā
divas reizes lielākas par HEPG2 šūnām (d = 10 µm). Palielinot magnētu rotācijas ātrumu,
paātrinās arī SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu kustība laterālā
virzienā pa šūnas virsmu tā, iespējams, papildus stimulējot endocitozes procesus, kas varētu būt
izšķirošs faktors neliela izmēra šūnām. Iegūtie rezultāti arī norāda uz to, ka rotējošā magnētu
69
sistēmā iespējams pielāgot magnetofekcijas protokolu dažādu šūnu veidu transfekcijai, attiecīgi
pielāgojot magnētu apgriezienu frekvenci.
Dati, kas tika iegūti novērtējot magnētiskā lauka intensitātes izmaiņu ietekmi uz
β-galaktozidāzes ekspresiju, ir likumsakarīgi, jo, zināms, ka, palielinoties attālumam no
magnēta, samazinās magnētiskā lauka intensitāte, un tas savukārt ietekmē efektivitāti. Fouriki
pētījumā netika novērotas statistiski ticamas atšķirības transgēna ekspresijas rādītājos atkarībā
no attāluma no magnēta – 3 mm (0,1 T), 4 (0,08 T) un 5 mm (0,06 T). Mūsu pētījumā attāluma
izmaiņas ir daudz lielākas – 9 un 6 mm attiecībā pret kontroles attālumu 0 mm, kas attiecīgi
nozīmē lielāku atšķirību magnētiskās intensitātes rādītājos – 0,1 T un 0,2 T attiecībā pret 0,35
T.
Magnetofekcijas efektivitāte pie 5 min ekspozīcijas magnētiskajā laukā ar magnētu
apgriezienu frekvenci 5 apgr./min PC3 un 50 apgr./min HEPG2 šūnās pēc β-galaktozidāzi
ekspresējošo šūnu skaita sasniedz 79,6% un 87,7%. Šie ir ļoti augsti magnetofekcijas
efektivitātes rādītāji, ņemot vērā to, ka gan PC3, gan HEPG2 šūnu līnijas pieder pie grūti
transficējamām šūnu līnijām ar raksturīgu transfekcijas efektivitāti 30–40% robežās.
Analizējot gēnu piegādes efektivitāti, ir būtiski noskaidrot, gan cik šūnās, gan cik daudz
vienā/visās šūnās ir notikusi rezultatīva gēna piegāde. Pēc literatūras datiem šāda veida
pētījumos, lai atspoguļotu gēnu piegādes efektivitāti pamatā izmanto luciferāzes aktivitātes
kvantitatīvu detekciju, taču pēc šīs analīzes nevar spriest par transficēto šūnu skaitu. Šajā
pētījumā ir analizēti abi indicējošie parametri.
Salīdzinošie dati, kas iegūti transficējot vēža šūnas ar trim dažādām metodēm, parādīja,
ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē statistiski būtiski paaugstinās nukleīnskābju
piegādes efektivitāte:
a) gan pēc reportējošo gēnu ekspresējošo šūnu skaita – par 21%, salīdzinot ar LM un
par 42%, salīdzinot ar L PC3 šūnās, un par 51%, salīdzinot ar LM un 56%, salīdzinot ar
L HEPG2 šūnās;
b) gan pēc kopējā proteīnu daudzuma – par 6%, salīdzinot ar LM un par 22%,
salīdzinot ar L PC3 šūnās, un par 9%, salīdzinot ar LM un 15%, salīdzinot ar L HEPG2 šūnās.
Būtiski, ka uzlabota gēnu piegādes efektivitāte LM LFV gadījumā salīdzinājumā ar LM
un L tika novērota arī gadījumos kad reportējošā gēna ekspresija nepārsniedza 50%, kas
apstiprina laika-fāzes magnētiskā lauka prevalējošo iedarbību pār citiem transfekcijas
efektivitāti ietekmējošiem faktoriem.
Pārliecinoši rezultāti tika iegūti pārbaudot siRNS inhibējošo efektu uz
β-galaktozidāzes ekspresiju ar ko-transfekcijas metodi. Nosakot siRNS inhibējošo efektu
attiecībā pret magnetofekcijas efektivitāti (bez siRNS), tika konstatēts statistiski nozīmīgs LM
70
LFV (92,4%) pārākums, salīdzinot gan ar LM (86,3%), gan L (80,9%), kas norāda uz metodes
potenciālu pielietošanai terapeitisko siRNS piegādei vēža šūnās.
Salīdzinot ar abām plaši pielietotajām konvencionālajām gēnu piegādes metodēm
(L un LM), uzlabotā gēnu piegādes metode (LM LFV) ir mazāk citotoksiska, kas tika uzskatāmi
parādīts, izmantojot PC3 šūnu līniju. Novērotais attiecībā uz SPION kustību sedimentācijas
laikā laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā liecina, ka magnētu rotācijas rezultātā SPION
izkliedējas vienmērīgi un tiek kavēta liela izmēra struktūru veidošanās šķīdumā un attiecīgi arī
uz šūnu membrānām. Tas samazina šūnu bojājumus un tādā veidā ir saistīts ar mazāku
citotoksisko efektu, salīdzinot ar LM. Savukārt novērojumi attiecībā uz specifisko SPION
izkliedi statiskā magnētiskā lauka ietekmē izskaidro augstos LM citotoksicitātes rādītājus.
SPION citotoksiskais efekts statiskā magnētiskā lauka ietekmē plaši analizēts Bae un līdzautoru
pētījumā. Autori pierādījuši, ka mērena statiskā magnētiskā lauka ietekmē (vidēji 0,4 T) SPION
veido agregātus, kas tiek koncentrēti uz NCTC 1469
(normālas peļu hepatocītu šūnas) šūnu virsmas. Tieši šādu agregātu koncentrēšanās uz šūnu
virsmas, ne internalizācija šūnās būtiski ietekmē šūnu dzīvotspēju atkarībā gan no SPION
sākotnējās koncentrācijas, gan ekspozīcijas ilguma magnētiskajā laukā.
SPION izkliede, iespējams, ir prevalējošais faktors attiecībā uz citotoksicitātes
rādītājiem šajā pētījumā, ņemot vērā arī to, ka SPION ir salīdzinoši netoksiskas un to
pielietojums dažādos savienojumos pēc literatūras datiem var pat samazināt kopējo
citotoksicitāti (Leung et al., 2013).
Magnētiskā iezīmēšana ar SPION un sekojoša Fe2+ daudzuma noteikšana magnētiski
iezīmētās šūnās apstiprināja, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē šūnās iekļūst
vairāk SPION. Tādējādi ir pamats uzskatīt, ka laika-fāzes variējoša magnētiskā lauka ietekmē
šūnās vairāk iekļūst arī ar SPION saistītu nukleīnskābju.
Līdz šim šāda veida pētījumos, kur tikusi analizēta dažādu ne statisku magnētisko lauku
ietekme, paaugstināta nukleīnskābju piegāde šūnās tiek saistīta tikai ar laterālas SPION kustības
kā endocitozi stimulējoša faktora ietekmi. Dobson grupa (Fouriki et al., 2010) izstrādājusi
oscilējošu magnētu sistēmu magnefect-nano™. Tās pamatā ir NdFeB magnētu sistēmas
izraisītas 2 Hz laterālas oscilācijas 200µm amplitūdā. Ar šīs sistēmas palīdzību tiek nodrošināta
SPION-kompleksu sedimentācija uz šūnu virsmas, kam seko kustība sānu virzienā pa šūnas
virsmu, tā stimulējot SPION-kompleksu internalizāciju. Kamau ar līdzautoriem aprakstījusi
dinamiskā lauka ģeneratora Dynamic Marker pielietojumu gēnu piegādei šūnās. Šīs sistēmas
pamatā ir elektromagnētu radīts 50 Hz magnētiskais lauks, kas darbojas Z ass virzienā un
papildus 0,75 Hz magnētiskais lauks, kas darbojas X ass virzienā ar 1,5 cm amplitūdu, tādējādi
izraisot SPION-kompleksu svārstības šūnu kultūras plaknei perpendikulārā un paralēlā
71
virzienā, ar attiecīgu svārstību amplitūdu 50 un 0,75 Hz. Šīs laterālās svārstības kopā ar
iespējamu rotējošu kustību uz šūnas virsmas stimulē SPION-kompleksu pārvietošanos caur
šūnas membrānu.
Šajā pētījumā iegūtie rezultāti parāda, ka ticamāk paaugstināta SPION-nukleīnskābju-
liposomālās komponentes kompleksu internalizācija šūnās varētu notikt multiplu faktoru
iedarbības rezultātā. Viens no būtiskākajiem faktoriem, kas tika pierādīts arī praktiski ir SPION
vienmērīgā izkliede uz šūnu kultūras plates iedaļas virsmas laika-fāzes variējošā magnētiskajā
laukā laterālas SPION kustības ietekmē. Statiskajā magnētiskajā laukā īsā laikā uz šūnu virsmas
koncentrējas ļoti daudz SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu, kas
vienlaicīgi nevar tikt iekļauti šūnās. Tas var novest ķēžveida struktūru veidošanās.
Sedimentācija “soli pa solim” aksiāli laterālā virzienā laika-fāzes variējošā laukā kavē
vienlaicīgu SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu sedimentāciju uz šūnu
virsmas un attiecīgi ķēžveida struktūru veidošanos kā rezultātā netiek traucēta to internalizācija.
Nevar izslēgt, ka arī laterāla SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes
kompleksu kustība pa šūnas virsmu veicina to ieslēgšanu šūnās – kustības rezultātā ar šūnas
virsmu saskaras vairāk kompleksu – vairāk mehāniski tiek stimulēta šūnas membrāna. Jenkins
ar līdzautoriem novērojuši, ka neirosfēru kultūrās, kuras tika pakļautas oscilējošām laterālām
svārstībām, šūnu plazmatiskās membrānas ir ar izteiktāku reljefu. Citos pētījumos ir pierādīts,
ka ārēja mehāniska spēka inducēta membrānas stimulācija sekmē gan endocitozes, gan
eksocitozes procesus (Apodaca, 2002) un SPION-nukleīnskābju kompleksu pastiprinātu
iekļūšanu šūnā primāri izraisa mehāniski stimulēti endocitozes procesi (Fouriki et al., 2010).
Savukārt šo mehānisko stimulāciju var izraisīt gan svārstīga SPION-nukleīnskābju kompleksu
kustība pa šūnas membrānas virsmu mainīga magnētiskā lauka ietekmē (Lim et al., 2012) gan
arī pagaidu poru veidošanās šūnas membrānā mainīga magnētiskā lauka izraisītu vibrāciju
ietekmē (Dahmani et al., 2013).
72
SECINĀJUMI
1. Atšķirības uz virsmas sedimentēto SPION izvietojumā statiskajā un laika-fāzes
magnētiskajā laukā liecina par atšķirīgu SPION kustību šķīdumā šo magnētisko lauku ietekmē.
Iespējams, tā ir aksiāli laterāla SPION kustība, kas rodas laika-fāzes magnētiskā lauka ietekmē.
2. Magnētu apgriezienu frekvence (apgr./min) ir viens no būtiskākajiem laika-fāzes
variējoša magnētiskā lauka raksturlielumiem. Atšķirīga optimālā magnētu apgriezienu
frekvence pie identiska ekspozīcijas ilguma magnētiskajā laukā PC3 šūnās (5 apgr./min) un
HEPG2 šūnās (50 apgr./min) norāda uz to, ka magnētu apgriezienu frekvencei ir būtiska loma
gēnu piegādes efektivitātes paaugstināšanā.
3. Būtisks transficēto PC3 un HEPG2 šūnu skaita pieaugums līdz ar kopējā ekspresēto
proteīnu līmeņa pieaugumu transficētajās PC3 un HEPG2 šūnās, kā arī būtisks gēnu piegādi
inhibējoša efekta pieaugums un citotoksiskā efekta samazināšanās PC3 šūnās liecina par laika-
fāzes variējoša magnētiskā lauka pozitīvu ietekmi uz SPION-nukleīnskābju-liposomālās
komponentes kompleksu piegādes efektivitāti vēža šūnās. Liposomālā magnetofekcija
laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā ir efektīvāka nukleīnskābju piegādes metode vēža
šūnās, salīdzinot ar lipofekciju un liposomālo magnetofekciju.
4. Kopumā, analizējot iegūtos rezultātus, var secināt, ka laika-fāzes magnētiskā lauka
ietekmē notiek SPION-nukleīnskābju–liposomālās komponentes kompleksu aksiāli laterāla
kustība šķīdumā. Tā rezultātā notiek vienmērīgāka SPION sedimentācija uz šūnu virsmas
paaugstinās šūnās ieslēgto SPION daudzums paaugstinās arī šūnās ieslēgto
SPION-nukleīnskābju-liposomālās komponentes kompleksu daudzums palielinās ne tikai
magnetificēto šūnu skaits, bet arī paaugstinās piegādāto gēnu ekspresijas līmenis magnetificētās
šūnās samazinās citotoksicitāte.
73
IZMANTOTĀ LITERATŪRA
1. Adams C.F., Pickard M.R., Chari D.M. Magnetic nanoparticle mediated transfection of neural stem
cell suspension cultures is enhanced by applied oscillating magnetic fields // Nanomed, 2013; 9 (6):
737–741.
2. Ahmed N., Fessi H., Elaissari A. Theranostic applications of nanoparticles in cancer // Drug Discov
Today, 2012; 17 (17-18): 928–934.
3. Alexiou C., Jurgons R., Schmid R.J., et al. Magnetic drug targeting-biodistribution of the magnetic
carrier and the chemotherapeutic agent mitoxantrone after locoregional cancer treatment // J Drug
Target, 2003; 11 (3): 139–149.
4. Alsaggar M., Liu D. Physical methods for gene transfer // Adv Genet, 2015; 89: 1–24.
5. Anson D.S. The use of retroviral vectors for gene therapy-what are the risks? A review of retroviral
pathogenesis and its relevance to retroviral vector-mediated gene delivery // Genet Vaccines Ther,
2004; 2 (1): 9.
6. Apodaca G. Modulation of membrane traffic by mechanical stimuli // Am J Physiol Ren Physiol,
2002; 282 (2): F179–F190.
7. Avery O.T., MacLeod C.M., McCarty M. Studies on the chemical nature of the substance inducing
transformation of pneumococcal types: induction of transformation by a deoxyribonucleic acid
fraction isolated from pneumococcus type III // J Exp Med, 1944; 79 (2): 137–158.
8. Babincova M., Babinec P. Magnetic drug delivery and targeting: principles and applications //
Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Czech Repub, 2009; 153 (4): 243–250.
9. Bae J.E., Huh M.I., Ryu B.K., et al. The effect of static magnetic fields on the aggregation and
cytotoxicity of magnetic nanoparticles // Wiley Interdiscip Rev Nanomed Nanobiotechnol, 2011; 3
(4): 343–355.
10. Bareford L.M., Swaan P.W. Endocytic mechanisms for targeted drug delivery // Adv Drug Deliv
Rev, 2007; 59 (8): 748–758.
11. Blaese R.M., Culver K.W., Miller A.D., et al. T lymphocyte-directed gene therapy for ADA- SCID:
initial trial results after 4 years // Science, 1995; 270 (5235): 475–480.
12. Bolhassani A. Potential efficacy of cell-penetrating peptides for nucleic acid and drug delivery in
cancer // Biochim Biophys Acta, 2011; 1816 (2): 232–246.
13. Boussif O., Lezoualc'h F., Zanta M.A., et al. A versatile vector for gene and oligonucleotide transfer
into cells in culture and in vivo: polyethylenimine // Proc Natl Acad Sci USA, 1995; 92 (16): 7297–
7301.
14. Breimer D.D. Future challenges for drug delivery research // Adv Drug Deliv Rev, 1998; 33 (3):
265–268.
15. Bumb A., Regino C.A.S, Perkins M.R., et al. Preparation and characterization of a magnetic and
optical dual-modality molecular probe // Nanotechnol, 2010; 21 (17): 175704.
16. Bushman F.D. Retroviral integration and human gene therapy // J Clin Invest, 2007; 117 (8): 2083–
2086.
17. Byrne J.D., Betancourt T., Brannon-Peppas L. Active targeting schemes for nanoparticle systems
in cancer therapeutics // Adv Drug Deliv Rev, 2008; 60 (15): 1615–1626.
18. Cassidy J., Schätzlein A.G. Tumour-targeted drug and gene delivery: principles and concepts //
Expert Rev Mol Med, 2004; 6 (19): 1–17.
19. Cepko C.L., Roberts B.E., Mulligan R.C. Construction and applications of a highly transmissible
murine retrovirus shuttle vector // Cell, 1984; 37 (3): 1053–1062.
20. Cevher E., Sezer A.D., E.S. Gene Delivery Systems: Recent Progress in Viral and Non-Viral
Therapy // Recent Advances in Novel Drug Carrier Systems / Ed. by Sezer A.D., 2012. – ISBN:
978-51-0810-8.
21. Cha E., Daud A. Plasmid IL-12 electroporation in melanoma // Hum Vaccin Immunother, 2012; 8
(11): 1734–1738.
22. Chen C.B., Chen J.Y., Lee W.C. Fast transfection of mammalian cells using superparamagnetic
nanoparticles under strong magnetic field // J Nanosci Nanotechnol, 2009; 9 (4): 2651–2659.
23. Chertok B., David A.E., Yang V.C. Brain tumor targeting of magnetic nanoparticles for potential
drug delivery: effect of administration route and magnetic field topography // J Control Release,
2011; 155 (3): 393–399.
74
24. Chertok B., Moffat B., David A., et al. Iron oxide nanoparticles as a drug delivery vehicle for MRI
monitored magnetic targeting of brain tumors // Biomaterials, 2008; 29 (4): 487–496.
25. Chithrani B.D., Ghazani A., Chan W. Determining the size and shape dependence of gold
nanoparticle uptake into mammalian cells // Nano Lett, 2006; 6 (4): 662–668.
26. Cromer Berman S.M., Walczak P., Bulte J.W. Tracking stem cells using magnetic nanoparticles //
Biomaterials, 2011; 32 (35): 9401–9414.
27. Dahmani C., Mykhaylyk O., Helling F., et al. Rotational magnetic pulses enhance the
magnetofection efficiency in vitro in adherent and suspension cells // J Mag Mag Mater, 2013; 332:
163–171.
28. de Baere T., Deschamps F. New tumor ablation techniques for cancer treatment (microwave,
electroporation) // Diagn Interv Imaging, 2014; 95 (7-8): 677–682.
29. Dean D.A. Microinjection // Reference Module in Biomedical Sciences, 2013; 409–410.
30. Delalande A., Kotopoulis S., Postema M., et al. Sonoporation: Mechanistic insights and ongoing
challenges for gene transfer // Gene, 2013; 525 (2): 191–199.
31. Dennig J., Duncan E. Gene transfer into eukaryotic cells using activated polyamidoamine
dendrimers // J Biotechnol, 2002; 90 (3-4): 339–347.
32. Dick T., Hengst J., Yun J. Gene Therapy // Reference Module in Biomedical Sciences, 2015.
33. Durand S., Cimarelli A. The inside out of lentiviral vectors // Viruses, 2011; 3 (2): 132–159.
34. Easo S.L., Mohanan P.V. Dextran stabilized iron oxide nanoparticles: Synthesis, characterization
and in vitro studies // Carb Polym, 2013; 92 (1): 726–732.
35. Fan Z., Kumon R.E., Deng C.X. Mechanisms of microbubble-facilitated sonoporation for drug and
gene delivery // Ther Deliv, 2014; 5 (4): 467–486.
36. Fang C., Zhang M. Multifunctional magnetic nanoparticles for medical imaging applications // J
Mater Chem, 2009; 19: 6258–6266.
37. Fouriki A., Farrow N., Clements M.A., Dobson J. Evaluation of the magnetic field requirements
for nanomagnetic gene transfection // Nano Rev, 2010; 1: 5167.
38. Fraley R., Subramani S,, Berg P., Papahadjopoulos D. Introduction of liposome-encapsulated SV40
DNA into cells // J Biol Chem, 1980; 255 (21): 10431–10435.
39. Futreal P.A., Coin L., Marshall M., et al. A census of human cancer genes // Nat Rev Cancer, 2004;
4 (3): 177–183.
40. Gautier J., Munnier E., Paillard A., et al. A pharmaceutical study of doxorubicin-loaded PEGylated
nanoparticles for magnetic drug targeting // Int J Pharm, 2012; 423 (1): 16–25.
41. Gersting S.W., Schillinger U., Lausier J., et al. Gene delivery to respiratory epithelial cells by
magnetofection // J Gene Med, 2004; 6 (8): 913–922.
42. Glorioso J.C. Herpes simplex viral vectors: late bloomers with big potential // Hum Gene Ther,
2014; 25 (2): 83–91.
43. Goudy K.S., Wang B., Tisch R. Gene gun-mediated DNA vaccination enhances antigen-specific
immunotherapy at a late preclinical stage of type 1 diabetes in nonobese diabetic mice // Clin
Immunol, 2008; 129 (1): 49–57.
44. Gravel O., Lauzon-Gauthier J., Duchesne C., Larachi F. Inception of vortical coherent structures
from spinning magnetic nanoparticles in rotating magnetic fields–New nanofluid microscale
mixing tool // Chem Eng J, 2015; 260: 338–346.
45. Gupta A.K., Gupta M. Synthesis and surface engineering of iron oxide nanoparticles for biomedical
applications // Biomaterials, 2005; 26 (18): 3995–4021.
46. Hajiani P., Larachi F. Controlling lateral nanomixing and velocity profile of dilute ferrofluid
capillary flows in uniform stationary, oscillating and rotating magnetic fields // Chem Eng J, 2013;
223: 454–466.
47. Hareendran S., Balakrishnan B., Sen D., et al. Adeno-associated virus (AAV) vectors in gene
therapy: immune challenges and strategies to circumvent them // Rev Med Virol, 2013; 23 (6):
399–413.
48. He C.H., Tabata Y., Gao J.Q. Non-viral gene delivery carrier and its three-dimensional transfection
system // Int J Pharm, 2010; 386 (1-2): 232–242.
49. Hellebrand E., Mautner J., Reisbach G., et al. Epstein-Barr virus vector-mediated gene transfer into
human B cells: potential for antitumor vaccination // Gene Ther, 2006; 13 (2): 150–162.
50. Hillaireau H., Couvreur P. Nanocarriers' entry into the cell: relevance to drug delivery // Cell Mol
Life Sci, 2009; 66 (17): 2873–2896.
75
51. Hofmann-Amtenbrink M., von Rechenberg B., Hofmann H. Superparamagnetic nanoparticles for
biomedical applications // Nanostructured Materials for Biomedical Applications / Ed. by Tan
M.C., 2009. – ISBN: 978-81-7895-397-7.
52. Hollon T. Researchers and regulators reflect on first gene therapy death // Nat Med, 2000; 6 (1): 6.
53. Huang R.B., Mocherla S., Heslinga M.J., et al. Dynamic and cellular interactions of nanoparticles
in vascular-targeted drug delivery // Mol Membr Biol, 2010; 27 (4-6): 190–205.
54. Hunter A.C. Molecular hurdles in polyfectin design and mechanistic background to polycation
induced cytotoxicity // Adv Drug Deliv Rev, 2006; 58 (14): 1523–1531.
55. Huth S., Lausier J., Gersting S.W., et al. Insights into the mechanism of magnetofection using PEI-
based magnetofectins for gene transfer // J Gene Med, 2004; 6 (8): 923–936.
56. Huttinger C., Hirschberger J., Jahnke A., et al. Neoadjuvant gene delivery of feline granulocyte-
macrophage colony-stimulating factor using magnetofection for the treatment of feline
fibrosarcomas: A phase I trial // J Gene Med, 2008; 10 (6): 655–667.
57. Ibraheem D., Elaissari A., Fessi H. Gene therapy and DNA delivery systems // Int J Pharm, 2014;
459 (1-2): 70–83.
58. Jafari M., Soltani M., Naahidi S., et al. Nonviral approach for targeted nucleic acid delivery // Curr
Med Chem, 2012; 19 (2): 197–208.
59. Jahnke A., Hirschberger J., Fischer C., et al. Intra-tumoral gene delivery of feIL-2, feIFN-c and
feGM-CSF using magnetofection as a neoadjuvant treatment option for feline fibrosarcomas: A
phase-I study // J Vet Med, 2007; A54: 599–606.
60. Jenkins S.I., Pickard M.R., Granger N., Chari D.M. Magnetic nanoparticle-mediated gene transfer
to oligodendrocyte precursor cell transplant populations is enhanced by magnetofection strategies
// ACS Nano, 2011; 5 (8): 6527–6538.
61. Jhaveri A.M., Torchilin V.P. Multifunctional polymeric micelles for delivery of drugs and siRNA
// Front Pharmacol, 2014; 5: 77.
62. Juratli T.A., Schackert G., Krex D. Current status of local therapy in malignant gliomas — A
clinical review of three selected approaches // Pharm Ther, 2013; 139 (3): 341–358.
63. Kamau S.W., Hassa P.O., Steitz B., et al. Enhancement of the efficiency of non-viral gene delivery
by application of pulsed magnetic field // Nucleic Acids Res, 2006; 34 (5): e40.
64. Karpov A., Kozireva S., Avotiņa D., et al. Investigation of nanoparticle distribution formed by the
rotation of the magnetic system // J Magn Magn Mater, 2014; 369: 86–91.
65. Kennedy M.T., Pozharski E.V., Rakhmanova V.A., MacDonald R.C. Factors governing the
assembly of cationic phospholipid–DNA complexes // Biophys J, 2000; 78 (3): 1620–1633.
66. Kievit F.M., Veiseh O., Fang C., et al. Chlorotoxin labeled magnetic nanovectors for targeted gene
delivery to glioma // ACS Nano, 2010; 4 (8): 4587–4594.
67. Klinghoffer R.A., Bahrami S.B., Hatton B.A., et al. A technology platform to assess multiple cancer
agents simultaneously within a patient's tumor // Sci Transl Med, 2015; 7 (284): 284–258.
68. Kohn D.B., Sadelain M., Glorioso J.C. Occurrence of leukaemia following gene therapy of X-
linked SCID // Nat Rev Cancer, 2003; 3 (7): 477–488.
69. Kozlov V., Avotina D., Kasyanov V., Baryshev M. The Effect of Cyclic Movement of Magnets on
the Sedimentation of Magnetic Nanoparticles in Magnetofection Devices: Computer Simulation //
Separat Sci Technol, 2015; 50 (5): 767–771.
70. Krafcik A., Babinec P., Frollo I. Computational analysis of magnetic field induced deposition of
magnetic particles in lung alveolus in comparison to deposition produced with viscous drag and
gravitational force // J Mag Mag Mater, 2015; 380: 46–53.
71. Krötz F., Sohn H.Y., Gloe T., et al. Magnetofection potentiates gene delivery to cultured endothelial
cells // J Vasc Res, 2003; 40 (5): 425–434.
72. Kumar A., Jena P.K., Behera S., et al. Multifunctional magnetic nanoparticles for targeted delivery
// Nanomed, 2010; 6 (1): 64–69.
73. Kumar M., Yigit M., Dai G., et al. Image-guided breast tumor therapy using a small interfering
RNA nanodrug // Cancer Res, 2010; 70 (19): 7553–7561.
74. Lachmann P.J., Davies A. Complement and immunity to viruses // Immunol Rev, 1997; 159 (1):
69–77.
75. Lam T., Pouliot P., Avti P.K., et al. Superparamagnetic iron oxide based nanoprobes for imaging
and theranostics // Adv Coll Int Sci, 2013; 199-200: 95–113.
76. Laurent N., Sapet C., le Gourrierec L., et al. Nucleic acid delivery using magnetic nanoparticles:
The magnetofection technology // Ther Deliv, 2011; 2 (4): 471–482.
76
77. Laurent S., Forge D., Port M., et al. Magnetic iron oxide nanoparticles: synthesis, stabilization,
vectorization, physicochemical characterizations, and biological applications // Chem Rev, 2008;
108 (6): 2064–2110.
78. Lehner R., Wang X., Marsch S., Hunziker P. Intelligent nanomaterials for medicine: carrier
platforms and targeting strategies in the context of clinical application // Nanomed, 2013; 9 (6):
742–757.
79. Leszczynski, D. Rapporteur report: cellular, animal and epidemiological studies of the effects of
static magnetic fields relevant to human health // Prog Biophys Mol Biol, 2005; 87: 247–253.
80. Leung K.C., Wong C.H., Zhu X.M., et al. Ternary hybrid nanocomposites for gene delivery and
magnetic resonance imaging of hepatocellular carcinoma cells // Quant Imaging Med Surg, 2013;
3 (6): 302–307.
81. Li S.H., Chow K.C. Magnetic field exposure induces DNA degradation // Biochem Biophys Res
Commun, 2001; 280 (5): 1385–1388.
82. Li W., Ma N., Ong L.L., et al. Enhanced thoracic gene delivery by magnetic nanobead-mediated
vector // J Gene Med, 2008; 10 (8): 897–909.
83. Li Z., Xiang J., Zhang W., et al. Nanoparticle delivery of anti-metastatic NM23-H1 gene improves
chemotherapy in a mouse tumor model // Cancer Gene Ther, 2009; 16: 423–429.
84. Lim J., Clements M.A., Dobson J. Delivery of Short Interfering Ribonucleic Acid-Complexed
Magnetic Nanoparticles in an Oscillating Field Occurs via Caveolae-Mediated Endocytosis // Plos
One, 2012; 7 (12): e51350.
85. Liu Q., Zhang J., Xia W., Gu H. Magnetic field enhanced cell uptake efficiency of magnetic silica
mesoporous nanoparticles // Nanoscale, 2012; 4 (11): 3415–3421.
86. Liu W.M., Xue Y.N., He W.T., et al. Dendrimer modified magnetic iron oxide
nanoparticle/DNA/PEI ternary complexes: a novel strategy for magnetofection // J Control Release,
2011; 152 (1): e159–160.
87. Low L., Mander A., McCann K., et al. DNA vaccination with electroporation induces increased
antibody responses in patients with prostate cancer // Hum Gene Ther, 2009; 20 (11): 1269–1278.
88. Lübbe A.S., Alexiou C., Bergemann C. Clinical applications of magnetic drug targeting // J Surg
Res, 2001; 95 (2): 200–206.
89. Lübbe A.S., Bergemann C., Riess H., et al. Clinical experiences with magnetic drug targeting: A
phase I study with 4'-epidoxorubicin in 14 patients with advanced solid tumors // Cancer Res, 1996;
56 (20): 4686–4693.
90. Luo D., Saltzman W.M. Enhancement of transfection by physical concentration of DNA at the cell
surface // Nat Biotechnol, 2000; 18 (8): 893–895.
91. Luten J., van Nostrum C.F., De Smedt S.C., Hennink W.E. Biodegradable polymers as non-viral
carriers for plasmid DNA deliver // J Control Release, 2008; 126 (2): 97–110.
92. Lv H., Zhang S., Wang B., et al. Toxicity of cationic lipids and cationic polymers in gene delivery
// J Control Release, 2006; 114 (1): 100–109.
93. Magin-Lachmann C., Kotzamanis G., D´Aiuto L., et al. In vitro and in vivo delivery of intact BAC
DNA-comparison of different methods // J Gene Med, 2004; 6 (2): 195–209.
94. Mahmoudi M., Meng J., Xue X., et al. Interaction of stable colloidal nanoparticles with cellular
membranes // Biotechnol Adv, 2014; 32: 679–692.
95. Mahmoudi M., Sant S., Wang B., et al. Superparamagnetic iron oxide nanoparticles (SPIONs):
development, surface modification and applications in chemotherapy // Adv Drug Deliv Rev, 2011;
63 (1-2): 24–46.
96. Makkonen K.E., Airenne K., Ylä-Herttulala S. Baculovirus-mediated gene delivery and RNAi
applications // Viruses, 2015; 7 (4): 2099–2125.
97. Marshall E. Gene therapy. Second child in French trial is found to have leukemia // Science, 2003;
299 (5605): 320.
98. Massart R., Preparation of aqueous magnetic liquids in alkaline and acidic media // EEE
Transactions on Magnetics, 1981; 17 (2): 1247–1248.
99. Mayrhofer P., Schleef M., Jechlinger W. Use of minicircle plasmids for gene therapy // Methods
Mol. Biol, 2009; 542: 87–104.
100. McBain S.C., Griesenbach U., Xenariou S., et al. Magnetic nanoparticles as gene delivery agents:
enhanced transfection in the presence of oscillating magnet arrays // Nanotechnology, 2008; 19
(40): 405102.
77
101. McDonald D.M., Foss A.J. Endothelial cells of tumor vessels: abnormal but not absent // Cancer
Metastasis Rev, 2000; 19 (1-2): 109–120.
102. Mehier-Humbert S., Guy R.H. Physical methods for gene transfer: improving the kinetics of gene
delivery into cells // Adv Drug Deliv Rev, 2005; 57 (5): 733–753.
103. Miller D.L., Pislaru S.V., Greenleaf J.E. Sonoporation: mechanical DNA delivery by ultrasonic
cavitation // Somat Cell Mol Genet, 2002; 27 (1-6): 115-134.
104. Moghimi S.M., Symonds P., Murray J.C., et al. A two-stage poly(ethylenimine)-mediated
cytotoxicity: implications for gene transfer/therapy // Mol Ther, 2005; 11 (6); 990–995.
105. Mulligan R.C. The basic science of gene therapy // Science, 1993; 260 (5110): 926–932.
106. Muro S., Garnacho C., Champion J.A., et al. Control of endothelial targeting and intracellular
delivery of therapeutic enzymes by modulating the size and shape of ICAM-1-targeted carriers //
Mol Ther, 2008; 16 (8): 1450–1458.
107. Muthana M., Scott S.D., Farrow N., et al. A novel magnetic approach to enhance the efficacy of
cell-based gene therapies // Gene Ther, 2008; 15: 902–910.
108. Mykhaylyk O., Antequera Y.S., Vlaskou D., Plank C. Generation of magnetic nonviral gene
transfer agents and magnetofection in vitro // Nat Protoc, 2007; 2 (10): 2391–2411.
109. Mykhaylyk O., Sanchez-Antequera Y., Vlaskou D., et al. Liposomal magnetofection // Meth Mol
Biol, 2010; 605: 487–525.
110. Mykhaylyk O., Steingotter A., Perea H., et al. Nucleic acid delivery to magnetically-labeled cells
in a 2D array and at the luminal surface of cell culture tube and their detection by MRI // J Biomed
Nanotechnol, 2009 (a); 5 (6): 692–706.
111. Mykhaylyk O., Zelphati O., Hammerschmid E., et al. Recent advances in magnetofection and its
potential to deliver siRNAs in vitro // Methods Mol Biol, 2009 (b); 487: 111–146.
112. Mykhaylyk O., Zelphati O., Rosenecker J., Plank C. siRNA delivery by magnetofection // Curr
Opin Mol Ther, 2008; 10 (5): 493–505.
113. Namiki Y., Namiki T., Yoshida H., et al. A novel magnetic crystal–lipid nanostructure for
magnetically guided in vivo gene delivery // Nat Nanotech, 2009; 4: 598–606.
114. Nayerossadat N., Maedeh T., Ali P.A. Viral and nonviral delivery systems for gene delivery // Adv
Biomed Res, 2012; 1: 27.
115. Neumann E., Schaefer-Ridder M., Wang Y., Hofschneider P.H. Gene transfer into mouse lyoma
cells by electroporation in high electric fields // EMBO J, 1982; 1 (7): 841–845.
116. Oberle V., Bakowsky U., Zuhorn I.S., Hoekstra D. Lipoplex formation under equilibrium
conditions reveals a three-step mechanism // Biophys J, 2000; 79 (3): 1447–1454.
117. Onishi Y., Eshita Y., Murashita A., et al. Characteristics of DEAE-dextran-MMA graft copolymer
as a nonviral gene carrier // Nanomed Nanotechnol Biol Med, 2007; 3 (3): 184–191.
118. Osborne R. Ark floats gene therapy's boat, for now // Nat Biotechnol, 2008; 26: 1057–1059.
119. Palmer D.H., Chen M.J., Kerr D.J. Taking gene therapy into the clinic // J Biomed Biotechnol,
2003; 2003 (1): 71–77.
120. Palmer D.H., Mautner V., Kerr D.J. Clinical experience with adenovirus in cancer therapy // Curr
Opin Mol Ther, 2002; 4 (5): 423–434.
121. Pearson S., Hepeng Jia H., Kandachi K. China approves first gene therapy // Nat Biotechnol, 2004;
22 (1): 3–4.
122. Pickard M., Chari D. Enhancement of magnetic nanoparticle-mediated gene transfer to astrocytes
by ‘magnetofection’: effects of static and oscillating fields // Nanomed (Lond), 2010; 5 (2): 217–
232.
123. Plank C., Schillinger U., Scherer F., et al. The magnetofection method: using magnetic force to
enhance gene delivery // Biol Chem, 2003; 384 (5): 737–747.
124. Plank C., Zelphati O., Mykhaylyk O. Magnetically enhanced nucleic acid delivery. Ten years of
magnetofection-progress and prospects // Adv Drug Deliv Rev, 2011; 63 (14-15): 1300–1331.
125. Prabha S., Sharma B., Labhasetwar V. Inhibition of tumor angiogenesis and growth by
nanoparticle-mediated p53 gene therapy in mice // Cancer Gene Ther, 2012; 19 (8): 530–537.
126. Prijic S., Scancar J., Romih R., et al. Increased cellular uptake of biocompatible superparamagnetic
iron oxide nanoparticles into malignant cells by an external magnetic field // J Membr Biol, 2010;
236 (1): 167–179.
127. Prosen L., Markelc B., Dolinsek T., et al. Mcam silencing with RNA interference using
magnetofection has antitumor effect in murine melanoma // Mol Ther Nucleic Acids, 2014; 3 (10):
e205.
78
128. Puhlmann M., Brown C.K., Gnant M., et al. Vaccinia as a vector for tumor-directed gene therapy:
biodistribution of a thymidine kinase-deleted mutant // Cancer Gene Ther, 2000; 7 (1): 66–73.
129. Pulfer S.K., Gallo J.M. Enhanced brain tumor selectivity of cationic magnetic polysaccharide
microspheres // J Drug Target, 1998; 6 (3): 215–227.
130. Rejman J., Oberle V., Zuhorn I.S., Hoekstra D. Size-dependent internalization of particles via the
pathways of clathrinand caveolae-mediated endocytosis // Biochem J, 2004; 377 (Pt1): 159–169.
131. Renzing J., Lane D.P. p53-dependent growth arrest following calcium phosphate-mediated
transfection of murine fibroblasts // Oncogene, 1995; 10 (9): 1865–1868.
132. Ribble D., Goldstein N.B., Norris D.A., Shellman Y.G. A simple technique for quantifying
apoptosis in 96-well plates // BMC Biotechnol, 2005; 5: 12.
133. Rogers S., Pfuderer P. Use of viruses as carriers of added genetic information // Nature, 1968; 219
(5155): 749–751.
134. Rosenberg S.A., Aebersold P., Cornetta K., et al. Gene transfer into humans–immunotherapy of
patientswith advancedmelanoma, using tumor-infiltrating lymphocytes modified by retroviral gene
transduction // N Engl J Med, 1990; 323: 570–578.
135. Rotariu O., Strachan N.J.C. Modelling magnetic carrier particle targeting in the tumor
microvasculature for cancer treatment // J Magn Magn Mater, 2005; 293 (1): 639–646.
136. Rudolf B., Salmainb M., Wilczewskad A.Z., et al. Fabrication of multifunctional magnetic
nanoparticles bearing metallocarbonyl probes and antibodies // Coll Surf, 2014; 457: 142–151.
137. Ruß V., Wagner E. Cell and tissue targeting of nucleic acids for cancer gene therapy // Pharm Res,
2007; 24 (6): 1047–1057.
138. Santhosh P.B., Ulrih N.P. Multifunctional superparamagnetic iron oxide nanoparticles: Promising
tools in cancer theranostics // Cancer Letters, 2013; 336 (1): 8–17.
139. Sapet C., Laurent N., de Chevigny A., et al. High transfection efficiency of neural stem cells with
magnetofection // Biotechniques, 2011; 50 (3): 187–189.
140. Sardesai N.Y., Weiner D.B. Electroporation delivery of DNA vaccines: Prospects for success //
Curr Opin Immunol, 2011; 23 (3): 421–429.
141. Scherer F., Anton M., Schillinger U., et al. Magnetofection: enhancing and targeting gene delivery
by magnetic force in vitro and in vivo // Gene Ther, 2002; 9 (2): 102–109.
142. Schillinger U., Brill T., Rudolph C., et al. Advances in magnetofection–magnetically guided
nucleic acid delivery // J Magn Magn Mater, 2005; 293 (1): 501–508.
143. Schwarz S., Wong J.E., Bornemann J. Polyelectrolyte coating of iron oxide nanoparticles for MRI-
based cell tracking // Nanomed, 2012; 8 (5): 682–691.
144. Schwerdt J.U., Goya G.F., Calatayund M.P., et al. Magnetic field-assisted gene delivery:
achievements and therapeutic potential // Curr Gene Ther, 2012; 12 (2): 116–126.
145. Sharma B., Ma W., Adjei I.M., et al. Nanoparticle-mediated p53 gene therapy for tumor inhibition
// Drug Deliv Trans Res, 2011; 1 (1): 43–52.
146. Shubayev V.I., Pisanic T.R. 2nd, Jin S. Magnetic nanoparticles for theragnostics // Adv Drug Deliv
Rev, 2009; 61 (6): 467–477.
147. Silva A.K.A., Silva É.L., Carriço A.S., Egito E.S.T. Magnetic Carriers: A Promising Device for
Targeting Drugs Into the Human Body // Curr Pharm Des, 2007; 13 (11): 1179–1185.
148. Sincai M., Ganga D., Ganga M., et al. Antitumor effect of magnetite nanoparticles in cat mammary
adenocarcinoma // J Magn Magn Mater, 2005; 293: 438–441.
149. Singh A., Sahoo S.K. Magnetic nanoparticles: a novel platform for cancer theranostics // Drug
Discov Today, 2014; 19 (4): 474–481.
150. Somia N., Verma I.M. Gene therapy: trials and tribulations // Nat Rev Genet, 2000; 1: 91–99.
151. Stephen Z.R., Kievit F.M, Zhang M. Magnetite Nanoparticles for Medical MR Imaging // Mater
Today, 2012; 14 (7-8): 330–338.
152. Sum C.H., Wettig S., Slavcev R.A. Impact of DNA vector topology on non-viral gene therapeutic
safety and efficacy // Curr Gene Ther, 2014; 14 (4): 309–329.
153. Sun W., Qian H., Zhang X., et al. Induction of protective and therapeutic antitumour immunity
using a novel tumour-associated antigen-specific DNA vaccine // Immunol Cell Biol, 2006; 84 (5):
440–447.
154. Svingen T., Wilhelm D., Combes A.N., et al. Ex vivo magnetofection: a novel strategy for the study
of gene function in mouse organogenesis // Dev Dyn, 2009; 238 (4): 956–964.
155. Szybalska E.H., Szybalski W. Genetics of human cess line. IV. DNA-mediated heritable
transformation of a biochemical trait // Proc Natl Acad Sci USA, 1962; 48: 2026–2034.
79
156. Tai C.K., Kasahara N. Replication-competent retrovirus vectors for cancer gene therapy // Front
Biosci, 2008; 13: 3083–3095.
157. Tangney M., Casey G., Larkin J.O., et al. Non-viral in vivo immune gene therapy of cancer:
combined strategies for treatment of systemic disease // Cancer Immunol Immunother, 2006; 55
(11): 1443–1450.
158. Taratula O., Salva R., Pandya I., et al. Multifunctional siRNA delivery system for cancer therapy
// Nanotech, 2008; 2 (1): 49–52.
159. Tatum E.L. Molecular biology, nucleic acids, and the future of medicine // Perspect Biol Med,
1966; 10 (1): 19–32.
160. Teja A.S., Koh P-Y. Synthesis, properties, and applications of magnetic iron oxide nanoparticles //
Prog Crystal Growth Charact Mater, 2009; 55 (1-2): 22–45.
161. Temin H.M. Mixed infection with two types of Rous sarcoma virus // Virology, 1961; 13: 158–
163.
162. Teramato S., Ishii T., Matsuse T. Crisis of adenoviruses in human gene therapy // Lancet, 2000;
355 (9218): 1911–1912.
163. Thrasher A.J., Gaspar H.B., Baum C., et al. Gene therapy: X-SCID transgene leukaemogenicity //
Nature, 2006; 443 (7109): E5–7.
164. Tickle J.A., Jenkins S.I., Pickard M.R., Chari D.M. Influence of amplitude of oscillating magnetic
fields on magnetic nanoparticle-mediated gene transfer to astrocytes // Nano LIFE, 2015; 5 (1):
1450006.
165. Tiwari A.P., Ghosh S.J., Pawar S.H. Biomedical applications based on magnetic nanoparticles:
DNA interactions // Anal Methods, 2015; 7: 10109–10120.
166. Torchilin V.P. Drug targeting // Eur J Pharm Sci, 2000; 11 (Suppl 2): S81–S91.
167. Uchida M., Li X.W., Mertens P., Alpar H.O. Transfection by particle bombardment: Delivery of
plasmid DNA into mammalian cells using gene gun // Biochim Biophys Acta, 2009; 1790 (8): 754–
764.
168. Vaheri A., Pagano J.S. Infectious poliovirus RNA: a sensitive method of assay // Virology, 1965;
27 (3): 434–436.
169. Vainauska D., Kozireva S., Karpovs A., et al. A Novel Approach for Nucleic Acid Delivery Into
Cancer Cells // MEDICINA (Kaunas), 2012; 48 (6): 324–329.
170. Villemejane J., Mir L.M. Physical methods of nucleic acid transfer: general concepts and
applications // Br J Pharmacol, 2009; 157: 207–219.
171. Wasungu L., Hoekstra D. Cationic lipids, lipoplexes and intracellular delivery of genes // J Control
Release, 2006; 116 (2): 255–264.
172. Weissleder R., Bogdanov A., Neuwelt E.A., Papisov M. Longcirculating iron-oxides for Mr-
imaging // Adv Drug Deliv Rev, 1995; 16 (2-3): 321–334.
173. Wells D.J. Gene therapy progress and prospects: electroporation and other physical methods //
Gene Ther, 2004; 11 (18): 1363–1369.
174. Widder K.J., Senyei A.E., Scarpelli D.G. Magnetic microspheres: a model system for site specific
drug delivery in vivo // Proc Soc Exp Biol Med, 1978; 58 (2): 141–146.
175. Wilhelm C., Billotey C., Roger J., et al. Intracellular uptake of anionic superparamagnetic
nanoparticles as a function of their surface coating // Biomaterials, 2003; 24 (6): 1001–1011.
176. Wilson M.W., Kerlan R.K., Jr, Fidelman N.A., et al. Hepatocellular carncinoma: Regional therapy
with a magnetic targeted carrier bound to doxorubicin in a dual MR imaging/conventional
angiography suite-initial experience with 4 patients // Radiology, 2004; 230 (1): 287–293.
177. Wirth T., Ylä-Herttuala S. Gene Therapy Used in Cancer Treatment // Biomedicines, 2014; 2 (2):
149–162.
178. Wishart D.S. Is cancer a genetic disease or a metabolic disease? // EbioMedicine, 2015; 2 (6): 478–
479.
179. Xenariou S., Griesenbach U., Ferrari S., et al. Using magnetic forces to enhance non-viral gene
transfer to airway epithelium in vivo // Gene Ther, 2006; 13 (21): 1545–1552.
180. Xiang J.J., Tang J.Q., Zhu S.G., et al. IONP-PLL: a novel non-viral vector for efficient gene
delivery // J Gene Med, 2003; 5 (9): 803–817.
181. Yameen B., Choi W.I., Vilos C., et al. Insight into nanoparticle cellular uptake and intracellular
targeting // J Control Release, 2014; 190: 485–499.
182. Yang S.Y., Sun J.S., Liu C.H., et al. Ex vivo magnetofection with magnetic nanoparticles: a novel
platform for nonviral tissue engineering // Artif Organs, 2007; 32 (3): 195–204.
80
183. Yin T., Wang P., Zheng R., et al. Nanobubbles for enhanced ultrasound imaging of tumors // Int J
Nanomed, 2012; 7: 895–904.
184. Yin W.K., Feng S.S. Effects of particle size and surface coating on cellular uptake of Polymeric
nanoparticles for oral delivery of anticancer drugs // Biomaterials, 2005; 26 (15): 2713–2722.
185. Zhang J.Q., Zhang Z.R., Yang H., et al. Lyophilized paclitaxel magnetoliposomes as a potential
drug delivery system for breast carcinoma via parenteral administration: In vitro and in vivo studies
// Pharm Res, 2005; 22 (4): 573–583.
186. Zhang Y., Satterlee A., Huang L. In vivo gene delivery by nonviral vectors: overcoming hurdles?
// Mol Ther, 2012; 20 (7): 1298–1304.
81
PUBLIKĀCIJAS UN ZIŅOJUMI PAR PĒTĪJUMA TĒMU
ZINĀTNISKIE RAKSTI PAR PĒTĪJUMA TĒMU
1. Kozlov V., Avotina D., Kasyanov V., Baryshev M. The Effect of Cyclic Movement of
Magnets on the Sedimentation of Magnetic Nanoparticles in Magnetofection Devices:
Computer Simulation // Separat Sci Technol, 2015; 50 (5): 767–771.
2. Karpov A., Kozireva S., Avotiņa D., Chernobayeva L., Baryshev M. Investigation of
nanoparticle distribution formed by the rotation of the magnetic system // J Magn Magn
Mater, 2014; 369: 86–91.
3. Avotina D., Kozireva S., Karpovs A., Chistyakovs M., Baryshev M. Dynamic magnetic
field increases intracellular magnetic labelling of prostate carcinoma and Burkitt’s
lymphoma cells // Collection of Scientific Papers 2012 RSU, 2013; (2): 65–70.
4. Vainauska D., Kozireva S., Karpovs A., Čistjakovs M., Bariševs M. A Novel Approach for
Nucleic Acid Delivery Into Cancer Cells // MEDICINA (Kaunas), 2012; 48 (6): 324–329.
PMID: 22885367.
KONFERENČU TĒZES
1. Kozireva S., Avotiņa D., Karpovs A., Cistjakovs M., Baryshev M. “Dynamic magnetic field
increases transduction efficacy of GFP-modTAT into prostate carcinoma PC3 cells” RSU
2013. gada Zinātniskā konference, Rīga, 21.–22. marts, 2013.
2. Baryshev M., Avotina D., Kozireva S. Use of Transducible Modified TAT Peptide for
Simultaneous Protein and DNA Delivery into PC3 Cells. 1st International Conference on
BioNano Innovation, Brisbena, Austrālija, 18.–20. jūlijs, 2012.
3. Kozireva S., Avotina D., Baryshev M. Transduction of GFP-Tus-NLS and GFP-modTat
Fusion Proteins into Prostate carcinoma and Burkitt’s Lymphoma Cells. 1st International
Conference on BioNano Innovation, Brisbena, Austrālija, 18.–20. jūlijs, 2012.
4. Avotiņa D., Kozireva S., Karpovs A., Chistyakovs M., Baryshev M. Enhanced Magnetic
Cell Labeling Efficiency Using Dynafector. RSU 2012. gada Zinātniskā konference, Rīga,
29.–30. marts, 2012. (stenda referāts)
5. Vainauska D., Kozireva S., Karpovs A., Chistyakovs M., Baryshev M. Imroved Technique
of Nucleic Acid Delivery into Cancer cells. RSU 2011. gada Zinātniskā konference, Rīga,
14.–15. aprīlis, 2011. (mutisks referāts)
6. Karpovs A., Vainauska D., Kozireva S., Chistyakovs M., Baryshev M. Dynafector Is a New
Device for the Enhancement of Liposomal Magnetofection. Efficiency of Cancer Cells under
82
Dynamic Gradient Magnetic Field. RSU 2011. gada Zinātniskā konference, Rīga, 14.–15.
aprīlis, 2011.
PATENTS
Kozlovs V., Karpovs A., Priedīte V., Avotiņa D., Stradiņš P., Kalējs M., Kasjanovs V.,
Mironovs V. Telpiski sakārtotas šūnu struktūras izveidošanas paņēmiens no dzīvotspējīgām
pieauguša cilvēka šūnām. LV-14595B, 20.02.2013.
83
PATEICĪBAS
Šis pētījums ir komandas darbs, tāpēc vislielākais PALDIES maniem ESF projekta 2.
aktivitātes kolēģiem – Dr. biol. Mihailam Bariševam, Dr. biol. Svetlanai Kozirevai un
Maksimam Čistjakovam, bez kuriem šī promocijas darba izstrāde nebūtu iespējama. Pateicos
ESF projekta fiziķiem Vladimiram Kozlovam un Andrejam Karpovam par ieguldījumu šī darba
fizikas sadaļas tapšanā.
Vēlos pateikties visam RSU A. Kirhenšteina Mikrobioloģijas un virusoloģijas institūta
kolektīvam un institūta vadītājai Dr. med. asociētajai profesorei Modrai Murovskai par iespēju
te strādāt triju gadu garumā, par iegūto neatsveramo zinātnisko pieredzi. Īpašs paldies Alīnai
un Zaigai par vērtīgajiem padomiem un uz personīgo pieredzi balstītu atbalstu promocijas
procesā.
PALDIES visai manai otrā plāna komandai – Gunai, Andrejam, Artūram, Dmitrijam,
Dainai, Inārai, Renātei, Benitai, Aļonai, Lanai, Sergejam, Sintijai, Lāsmai, Ērikai, Nikolai,
Jānim, Ģirtam, Ancei, Gitai, Zanei un meitenei no Valsts policijas par nesavtīgi veltīto laiku,
lai palīdzētu man šī promocijas darba tapšanā. PALDIES!
Pateicos Dr. habil. med. profesoran Jānim Vētram, Dr. habil. phys. profesoram Jurijam
Dehtjaram un Dr. biol. asociētajai profesorei Elenai Kashubai par promocijas darba recenzēšanu.
84
PIELIKUMI
85
1. pielikums
Liposomālā magnetofekcija laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā
PC3 un HEPG2 šūnu līnijām
PROTOKOLS
CM – CombiMAG magnētiskās nanodaļiņas
LIP – Lipofectamine2000 transfekcijas reaģents
Komponentu attiecība vienai reakcijai: 1 µg pDNS:2 µl LIP:1 µl CM uz vienu 24 iedaļu
plates iedaļu.
1. No katras plates iedaļas ar šūnu kultūru atsūc esošo barotni un aizvieto to ar 350 µl Opti-
MEM barotnes.
2. Sagatavo pDNS šķīdumu Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma.
3. Sagatavo LIP reaģenta šķīdumu Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma, inkubē
istabas temperatūrā 5 minūtes.
4. Magnētiskās nanodaļiņas CombiMAG vorteksē 2–3 sekundes. Sagatavo CM šķīdumu Opti-
MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma.
5. Sagatavoto pDNS šķīdumu pievieno LIP reaģenta šķīdumam un viegli samaisa
2–3 reizes pipetējot. pDNS-LIP šķīdumam pievieno CM šķīdumu, viegli samaisa, 2–3
reizes lēni pipetējot, un inkubē istabas temperatūrā 25 minūtes.
6. Maisījumu pa pilienam pārnes uz iedaļām šūnu kultūras platē.
7. Plati pašūpo no labās uz kreiso pusi un no augšas uz apakšu, lai nodrošinātu vienmērīgu
pDNS-LIP-CM kompleksu izkliedi iedaļā.
8. Plati novieto uz DynaFECTOR platformas un inkubē nepieciešamajā režīmā – 5 min/5
apgr./min (PC3 šūnas) vai 5 min/50 apgr./min (HEPG2 šūnas).
9. Pēc inkubācijas plati liek CO2 inkubatorā uz 24 stundām.
86
2. pielikums
Liposomālā ko-magnetofekcija laika-fāzes variējošā magnētiskajā laukā
PC3 šūnu līnijai
PROTOKOLS
CM – CombiMAG magnētiskās nanodaļiņas
LIP – Lipofectamine2000 transfekcijas reaģents
Komponentu attiecība vienai reakcijai: 1 µg pDNS:50 nM siRNS:2 µl LIP:1 µl CM uz vienu
24 iedaļu plates iedaļu.
1. No katras plates iedaļas ar šūnu kultūru atsūc esošo barotni un aizvieto to ar 300 µl Opti-
MEM barotnes.
2. Sagatavo pDNS šķīdumu Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma.
3. Sagatavo siRNS šķīdumu Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma.
4. Sagatavo LIP reaģenta šķīdumu Opti-MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma, inkubē
istabas temperatūrā 5 minūtes.
5. Magnētiskās nanodaļiņas CombiMAG vorteksē 2–3 sekundes. Sagatavo CM šķīdumu Opti-
MEM ar kopējo daudzumu 50 µl šķīduma.
6. Sagatavoto siRNS šķīdumu pievieno pDNS šķīdumam, pēc tam LIP reaģenta šķīdumam
un viegli samaisa, 2–3 reizes pipetējot. pDNS-siRNS-LIP šķīdumam pievieno CM
šķīdumu, viegli samaisa, 2–3 reizes lēni pipetējot, un inkubē istabas temperatūrā 25
minūtes.
7. Maisījumu pa pilienam pārnes uz iedaļām šūnu kultūras platē.
8. Plati pašūpo no labās uz kreiso pusi un no augšas uz apakšu, lai nodrošinātu vienmērīgu
pDNS-siRNS-LIP-CM kompleksu izkliedi iedaļā.
9. Plati novieto uz DynaFECTOR platformas un inkubē nepieciešamajā režīmā – 5 min/5
apgr./min.
10. Pēc inkubācijas plati liek CO2 inkubatorā uz 48 stundām.