Gabriel - Bioinfo Grad - Aula 6 06-12-2014
description
Transcript of Gabriel - Bioinfo Grad - Aula 6 06-12-2014
-
+BioinformticaAnlise Funcional
Gabriel da Rocha FernandesUniversidade Catlica de Braslia
-
+Objetivos
2
nIdentificar as funes dos genes.
nCaracterizar os processos celulares.
nMapear em vias metablicas.
nElucidar o funcionamento do organismo.
-
+Ferramentas
nFerramenta de alinhamento:n BLASTnHMMER
nBase de dados:nCOGn KEGG Orthologyn PFamnGene Ontology
3
-
+Dicas
nProcurar por Hits que tenham descrio clara.n Evitar: hypothetical protein, putative..
nBuscar em vrias bases de dados.nAumentar a quantidade de entradas anotadas.nHits no identificados em uma base podem ser anotados por outra.
nObservar a cobertura do alinhamento.n BLAST faz alinhamento local.nNo classificar uma protena como um todo baseado apenas em
alinhamento a um unico domnio.
4
-
+Processo
5
270!!Predio dos genes!
270!!BLAST! Base de dados!
-
+Blast2GO
6
-
+KEGG Mapper
7
-
+iPath
npathways.embl.de
8
-
+Pfam
9