Fenotipo Regolazione post-trascrizionale Regolazione post-traduzionale Citoplasma Proteina DNARNA...
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Fenotipo
Regolazionepost-trascrizionale
Regolazionepost-traduzionale
Citoplasma
ProteinaDNA RNA
Nucleo
Regolazionetrascrizionale
Stabilità TrasportoMaturazione
Traduzione
Modificazione
Modulazionefunzionale
Double Dimension Protein Gel
Quantizzazionedell’espressionegenica
REGOLAZIONE GENICA
Durante lo sviluppoIn risposta a stimoli ambientali
DIAGNOSTICA
Tessuti malati/tessuti sani
Profili di espressione dei tumori
Organizzazionedel genoma
Ibridazione genomica comparativa
Immunoprecipitazione della cromatina
Screening di mutazioni
Total RNA
Affinitypurification
mRNA
Reverse transcription
dNTP (33P, Cy3, Cy5, Biotin)
Affinitypurification
mRNA
T7 promoter - poliTpoliA
Reverse transcription
Transcription
T7 promoter Random primerLabeling
SIGNAL
AMPLIFICATION
DENDRIMERS
cDNA
Software: “sovrapposizione”
e “normalizzazione”
Marcaturaradioattivabiotina
IMMAGINE FINALE COMPUTERIZZATA ANALISI DEI DATI
Microarrays
NT
IRR
Controllo Condizione
<<<<<<<<<<<<<<<<<<
+1.99
-3 and less +3 and greater-1.99
RNR4
HSP26
CUP1
ADH1
ERG5
28S
HHF1
RNR2
RNR3
TTR1K
699
wt
DM
P1497
/2b rad53
YLL15
0 rad6
400 808080 NTNTNT
-4 -2 0 2 4 6 8
-4
-2
0
2
4
6
8
mR
NA
irra
diat
o/no
n ir
radi
ato
(Gen
e Fi
lter
mic
roar
rays
)mRNA irradiato/non irradiato (Northern Blot)
CUP1
NT 0 15'30'1h 2h 4h
0 50 100 150 200 250
0.5
1.0
1.5
2.0
2.5
3.0
3.5
CUP1
CYC7
RNR4
HSP26
mR
NA
irra
diat
o / n
on ir
radi
ato
tempo (min)
K-mean clustering
DNA-proteinCrosslink
Lisi Frammentazione
ImmunopurificazioneIdentificazione DNA purificato
Transcriptional regulatory networks in Saccharomyces cerevisiae.
Lee TI, Rinaldi NJ, Robert F, Odom DT, Bar-Joseph Z, Gerber GK, Hannett NM, Harbison CT, Thompson CM, Simon I, Zeitlinger J, Jennings EG, Murray HL, Gordon DB, Ren B, Wyrick JJ, Tagne JB, Volkert TL, Fraenkel E, Gifford DK, Young RA.
Science 2002 Oct 25;298(5594):763-4
enomica
unzionale e
roteomica
Facoltà di Scienze MMFFNN Centro di Ricerche di
