Капустин Дмитрий Вячеславович КЛИНИКО...

Капустин Дмитрий Вячеславович

КЛИНИКО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ОСТРЫХ КИШЕЧНЫХ

ВИРУСНЫХ ИНФЕКЦИЙ У ВЗРОСЛЫХ ЖИТЕЛЕЙНОВОСИБИРСКА

Актуальность темы:1. Второе место по распространенности среди всей инфекционной патологии после ОРВИ2. В НСО показатели заболеваемости ОКИ выше РФ (695,7/555,71 - 2019 г.)3. Тенденция к росту заболеваемости ОКИ за 10 лет

716,4

655,1

706,9

717,2715,4

704,3

2012 2013 2014 2015 2016 2017

фактич.забол. тенденция

Динамика заболеваемости ОКИ среди населения Новосибирской области в 2012-2018 гг.

Вирусы как возбудители острых кишечных инфекций (ОКИ)

Высокую долю в этиологической структуре ОКИ в разных странах мира занимают вирусы- от 25 до 60 % 1,2

Норовирусы 3

Ротавирусы 4

Астровирусы 1

Аденовирусы, энтеровирусы,

Бокавирусы, торовирусы, пикорновирусы и др.

1 Oude Munnink BB., van der Hoek L. Viruses Causing Gastroenteritis: The Known, The New and Those Beyond. Viruses. 2016; 8(2).

2 Kotloff KL. The Burden and Etiology of Diarrheal Illness in Developing Countries. Pediatr Clin North Am. 2017; 64(4):799–814.

3 Ahmed SM et al. Global prevalence of norovirus in cases of gastroenteritis: a systematic review and meta-analysis. Lancet Infect Dis. 2014; 14 (8): 725–30.

4 Crawford SE et al. Rotavirus infection. Nat Rev Dis Primers. 2017;3:17083.

Дегидратация

Интоксикационный синдром

Гиповолемическийшок

Тяжелое и осложненное течение ОКИ1,2

1.Ahmed SM, Hall AJ, Robinson AE, et al. Global prevalence of norovirus in cases of gastroenteritis: a systematic review and meta-analysis. Lancet Infect Dis. 2014; 14(8):725-7302.Blanco A, Guix S, Fuster N, et al. Norovirus in Bottled Water Associated with Gastroenteritis Outbreak, Spain, 2016. Emerg Infect Dis. 2017; 23(9):1531-1534

Частота тяжелых форм и осложнений от 2 до 17%*

Тяжелые формы ОКИ

Лабораторная верификация этиологии ОКИ у взрослых в Российской находится на низком уровне, нерасшифрованными остаются до 88,5% случаев 1

Республике Ингушетия , Карачаево-Черкесия, Чеченская республика, Хабаровский край, Ставропольском край,Рязанской, Владимирской, Калужской, Смоленской, Псковской, Кировской, Самарской областях, Ненецком автономном округе

1. Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2018году

В Новосибирской области в структуре ОКИ преобладают ОКИ неустановленной этиологии, составившие в 2019 году 69,2%

Цель исследования:

Установить частоту острых кишечных вирусных инфекций у взрослых жителей Новосибирска, их клинико – эпидемиологические и лабораторные особенности и молекулярно-генетическое разнообразие для обоснования рациональных подходов к диагностике и лечению.

Дизайн исследованияПациенты с диагнозом острая кишечная инфекция при поступлении в стационар

n=1500

Клиническое и общелабораторное обследование больных

ПЦР для выявления РНК вирусов (ротавирусов, норовирусов, астровирусов) в

фекалиях Метод обратной транскрипции-полимеразной цепной реакции (ОТ-

ПЦР) с использованием набора оригинальных специфических праймеров

НоровируснаяОКИ n = 199

РотавируснаяОКИ n = 106

АстровируснаяОКИ n = 27

Микст-инфекция( Вир + бак) n = 33

Бактериальная ОКИ n = 238

ОКИ неуточнен-ная n = 897

Методы исследования:ПЦР исследование: Проводилось в лаборатории молекулярной микробиологии ИХБФМ СО РАН (зав. лаб. - д.б.н. Тикунова Н.В.)

Скрининг и генотипированиеротавирусов A и C и норовирусовпроводили методом ОТ-ПЦР с использованием панели праймеров, разработанной и верифицированной в лаборатории молекулярной микробиологии ИХБФМ СО РАН.

Для генотипирования астровирусовопределяли нуклеотидную последовательность фрагмента второй открытой рамки считывания (ORF2), кодирующей капсидный белок.

MG932590 HAstV-1/RUS/Novosibirsk/NS17-A1346/2017

MG932578 AstV-1/RUS/Novosibirsk/NS16-A808/2016







KY744141 AstV-1/ITA/PA387/2011

MH446380 HAstV-1/RUS/Novosibirsk/NS18-A1448/2018



MK108183 HAstV-1/RUS/Novosibirsk/NS18-A1586/2018


MK430063 AstV-1/KOR/D-1415/2017

KT749772 AstV-1/RUS/Nizhny Novgorod/909/2015


KY294671 AstV-1/RUS/Novosibirsk/NS16-A460/2016

HQ398856 AstV-1a/HUN/HUN4520/2010

MK059949 AstV-1c/Oxford

FJ375759 AstV-1b/CHN/SH1/2008

JN887820 AstV-1d/KOR/Ihar/2011

HAstV-1

GQ901902 AstV-6/RUS/Novosibirsk/Nsc09-B4/2009

MK059954 AstV-6/Oxford





KY294664 HAstV-8/RUS/Novosibirsk/NS16-A87/2016

KM923916 AstV-8/RUS/Nizhny Novgorog/1361/2012

KP862744 AstV-8/KOR/kor85/2014


HAstV-8

DQ070852 AstV-4b/BRA/GO/12/1995

MK059952 AstV-4a/Oxford

DQ344027 AstV-4c/CHN/Guangzhou














HAstV-4

99

84

99

99

90

94

84

83

99

90

99

88 86

98

93

82

89

0.02

Этиологическая структура ОКИ у госпитализированных лиц

1,8%

13,3%

7,0% 0,02%

1,7%

8,1%

6,0%59,8%

2,2%

Этиологическая структура ОКИ (n=1500)

Астровирусы Норовирусы Ротавирусы А

Ротавирусы С Шигеллы Сальмонеллы

Другие бактериальные агенты Неуточненные Микст-инфекции

22 % вирусная этиология

Этиологическая структура ОКИ вирусной этиологии

59,9%31,9%

8,2%

n= 332

Норовирусы Ротавирусы Астровирусы

НВИРВИ

АВИ

51,10%

46,30%

88,90%

29,70%30,60%

11,10%

19,20% 23,10%

0%

18-30 лет 30-50 лет старше 50 лет

Характеристика больных вирусными ОКИ по возрасту

Установлено, что АВИ значительно

чаще встречалась у лиц подросткового и молодого возраста !

Мясные изделия

Салаты

"Фаст-Фуд"

Морепродукты

Молочные

0,0%

5,0%

10,0%

15,0%

20,0%

25,0%

30,0%

35,0%

40,0%

45,0%

50,0%

НВИ

РВИ

АВИ

Наз

ван

ие

оси

НВИ РВИ АВИ

Мясные изделия 16,4% 25,7% 12,3%

Салаты 24,2% 21,1% 10,3%

"Фаст-Фуд" 20,0% 19,7% 17,2%

Морепродукты 14,7% 13,4% 48,2%

Молочные 24,7% 20,1% 12,0%

Пищевые факторы передачи

Распределение больных ОКИ вирусной этиологии с учетом особенностей лихорадки

Клинический признак Больные АВИ

n= 27

Больные РВИ

n=106

Больные НВИ

n= 199

Нормальная температура

тела11,3% 16,8% 0%

Абс 3 Абс 18 Абс 0

Субфебрильная 81,3% 70,2% 67,3%


Умеренная 7,4% 13% 32,7%*


Примечание: * - достоверность отличий между группами больных с умеренной лихорадкой; р <0,05.

Сравнительные клинические показатели больных с ОКИ вирусной этиологии

Показатель НВИ РВИ АВИ

Диарея n=199 n=106 n= 27

Обильная водянистая 92,5% 184 90,5% 96 88,9% 24

Кашицеобразный стул (7,5%) 15 9,5% 10 11,1% 3

Рвота 72,4%* 144 63,2% 67 49,4% 13

Боли в животе 71,3%* 142 77,3% 82 59,3% 16

в эпигастрии 32,3%) 46 35,4% 29 37,5% 6

в мезогастрии 50,7% 72 60,9% 50 56,3% 9

внизу живота 17,0% 24 3,7% 3 6,2% 1

Лабораторные показатели у больных вирусными ОКИ и частота симптомов (%):

Показатель Больные НВИ Больные РВИ Больные АВИ

Гемограмма (количественные показатели)

Лейкоцитоз 19 (9,6%) 15 (14,2%) 4 (13,8%)

Лейкопения 8 (4,1%) 4 (3,4%) 0 (0%)

Гемограмма (формула крови)

Лимфоцитоз 69 (34,7%)* 6 (5,5%) 3 (9,2%)

Нейтрофилез 5 (2,5%) 30 (28,6%) 2 (7,2%)

Средние показатели (M+m) у больных ОКИ

Лейкоциты

(109 /л)6,2±1,63 5,7±1,78 5,2±1,28

Вариабельность

лейкоцитоза (109 /л)9,2-20,5 9,8-18,6 9,1-13,6

25,1%

65,1%

9,2%

0,6%

n= 332

I степень II степень III степень IV степень

Распределение больных ОКИ вирусной этиологии по степени дегидратации

Более высокая частота тяжелых

форм 13,6% среди НВИ !

4,7% среди РВИ3,1% среди АВИ

p= 0,029 2

У 26 из 27 больных НВИ определены новые генотипы !

(GII.P17/GII.17, GII.Pe/GII.4 Sydney, GII.P16/GII.2, GII.P17/GII.17).

Дизайн исследованияБеременные с диагнозом острая кишечная инфекция при поступлении в стационар

n=103

Клиническое и общелабораторное обследование больных

ПЦР для выявления РНК вирусов (ротавирусов, норовирусов, астровирусов) в

фекалиях Метод обратной транскрипции-полимеразной цепной реакции (ОТ-

ПЦР) с использованием набора оригинальных специфических праймеров

НоровируснаяОКИ n = 53

РотавируснаяОКИ n = 2

АстровируснаяОКИ n = 0

Бактериальная ОКИ n = 8

ОКИ неуточнен-ная n = 50

Профилактика преэклампсии

51,4%

1,9%

7,5%

Неуточненные39,2%

Норовирусы Ротавирусы А Другие бактериальные агенты Неуточненные

Этиологическая структура острых кишечных инфекций у беременных N103

На основе частичного секвенированиягенома определено, что вирусные ОКИ у беременных вызваны норовирусами

новых генотипов GII.P17/GII.17 и GII.P16/GII.2, и ротавирусом генотипа

G9P [8].

Распределение случаев вирусных ОКИ у беременных по месяцам 2017 г. (в %), n=55.

Февраль Март Апрель Май Июнь

40,60%

31,30%

14,20%

7,90%6%

Распределение беременных женщин, больных норовирусной инфекцией, в зависимости от пищевых факторов передачи (в %), n=53.

16,4%

24,2%

20,0%

14,7%

24,7%

Мясные изделия Салаты "Фаст-Фуд" Морепродукты Молочные

Симптомы Частота (%) Продолжительность, дни (M+m)

Лихорадка 100% (53 абс.) 1,8±0,3

Субфебрильная 81,8% (43 абс.)

Умеренная 18,2% (10 абс.)

Диарея 100% (53 абс.) 2,1±0,42

Рвота 72,7% ( 38 абс) 1,9±0,38

Боли в животе 71,3% ( 37 абс.) 1,7±0,27

в эпигастрии 9,1% ( 4 абс.)

в мезогастрии 86,4%( 32 абс.)

внизу живота 4,1% (1 абс.)

Частота и продолжительность клинических симптомов у беременных с норовирусной ОКИ (в %), n=53

Модификация лечебного питания с включением синбиотика в терапии ОКИ у беременных женщин

Норовирусная инфекция (n= 53) ОКИ неуточненная

НВИ + МЛПN = 17

НВИ + стандартная

терапия (n = 14)

ОКИ неуточненная +

МЛП (n = 25)

Модификация лечебного питания с включением синбиотика в терапии ОКИ у беременных женщин

Компоненты Содержание

Общее содержание молочнокислых бактерий,

КОЕ/г

Мин. 1,5 х 109

Активное вещество

Lactobacillus acidophilus (La-5), % 50

Bifidobacterium lactis (Bb-12), % 50

Общая масса колоний, % 1,4

Рафтилоза, % от сухого вещества 50

Вспомогательные вещества

Декстроза безводная ( наполнитель), % от сухого

вещества

46,9

Двуокись кремния ( разрухлитель), % от сухого

вещества

1,9

Распределение больных по срокам купирования ведущих синдромов с учетом видов терапии

Группы

больных

Диарея (дни болезни) Лихорадка (дни

болезни)

Рвота (дни

болезни)

Болевой синдром

(дни болезни)

1 2 3 4 1 2 3 1 2 1 2 3

Группа

№1

(n=17)

25,0%

(n4)

66,7% *

(n12)

8,3%

(n1)

0,0%(n0)

58,3%

(n10)

33,4%

(n6)

8,3%(n1)

66,6%

(n6)

33,4%

(n3)

58,3%*(n7)

33,4%(n4)

8,3%(n1)

Группа

№2

(n=14)

14,3%

(n2)

14,3%%(n2)

50,0%

(n7)

21,4%

(n3)

50,0%

(n5)

40,0%

(n4)

10,0%

(n1)

71,4%

(n5)

28,6%

(n2)

10,0%

(n1)

60,0%(n6)

30,0%(n3)

Группа

№3

(n=25)

16% (n4)

68%*(n17)

16% (n4)

0% (n0)

56% (n14)

24,0%

(n6)

20% (n5)

68,8%

(n11)

31.2%

(n5)

12% (n3)

56% (n14)

32% (n8)

*- достоверность различий p<0,05, критерий χ2 Пирсона

1 группа – НВИбазисная +Синбиотик

2 группа – НВИ + базисная

3 группа ОКИ неуточненная +

базисная + синбиотик

Выводы:

1. В Новосибирске в 2016-2018 гг. в структуре уточненных острых кишечных инфекций среди госпитализированных взрослых больных вирусная этиология установлена у 22,1% , бактериальная – у 15,9%. Микст-инфекции, вызванные вирусами и бактериями, верифицированы у 2,2% пациентов.

Выводы:

2. Среди вирусных острых кишечных инфекций у взрослых больных преобладала норовирусная, составив 60%. Установлено генетическое различие циркулирующих изолятов норовирусов, выделенных от взрослых больных: в Новосибирске в 2016-2018 гг. доминировали норовирусы геногруппы GII (91,5 %), представленные генотипами GII.17 и GII.2. Среди 13 геновариантов норовирусов GII(n=191) преобладающими были GII.P17/GII.17 (34,6%), а также новые рекомбинантные штаммы, у которых GII.P16 – полимераза сочеталась с GII.2 (31,9%), GII.4_Sydney (10,5%), GII.3 (3,1%), GII.13(2,1%); а также увеличилась доля рекомбинантных штаммов, регистрируемых ранее GII.Pe/GII.4_Sydney (6,3%), GII.P12/GII.3 (5,2%), GII.P2/GII.2 (2,1%).

Выводы:

3. Ротавирусная инфекция среди вирусных ОКИ у взрослых выявлена в 32% случаев, преимущественно, в зимне-весеннем сезоне, виде гастроэнтерита (63,2%) с кратковременной (1,9± 0,6 дней) субфебрильной лихорадкой (у 70,2%), рвотой от 1 до 4 дней, водянистой диареей от 3 до 20 раз в сутки и длительностью 2,5+0,25 дней. Спектр идентифицированных ротавирусов G[P]-типов включал семь комбинаций: G9P[8] (35,8%), G2P[4] (30,5%), G4P[8] (16,8%), G1P[8] (9,5%), G3P[8] (3,2%), G12P[8] (3,2%) и G3P[6] (1,1%).

Выводы:

4.Доля астровирусной инфекции в этиологической структуре вирусных кишечных инфекций у госпитализированных взрослых составила 8%. В Новосибирске со-циркулировали классические астровирусытрех генотипов: HAstV-4 (48%), HAstV-1 (44,5%) и HAstV-8 (7,5%). В 2016 г. доминировал HAstV-4 (61,5%), и у двух больных впервые определен HAstV-8. В 2017 г. преобладающим стал HAstV-1 (58,3%). Среди заболевших преобладали лица моложе 30 лет, употребляли в пищу морепродукты 48%, частота заболевания не зависела от сезона года.

Выводы:

5. При сравнительном анализе тяжести клинических форм острых кишечных

инфекций в зависимости от этиологической структуры вирусов установлено, что

у 81,8% пациентов с тяжелыми степенями дегидратации (III и IV)

верифицирована норовирусная инфекция ( 27 из 33 абс.). Проведение

генотипирования выявило у 96,3 % больных (26 из 27 абс.) рекомбинантные

штаммы норовирусов, ранее не встречаемые на территории Новосибирской

области.

Выводы:

6. У 103 беременных женщин, госпитализированных с острой кишечной

инфекцией с февраля по июнь 2017 г., установлена более высокая частота

вирусной этиологии заболевания (53,3%), по сравнению с общей группой 1500

взрослых пациентов с ОКИ (33,3%); p<0,05, 2. Выявлено существенное

преобладание норовирусной инфекции (51,4%) над ротавирусной (1,9%), а

астровирусная инфекция не регистрировалась, что отличает данную группу от

общей группы больных, где доля норовирусной инфекции была лишь 20,1%;

p<0,05, 2

Выводы:

7. У беременных с острой кишечной инфекцией норовирусной и неуточненной

этиологии при включении в лечебное питание синбиотика, содержащего

лиофилизированные штаммы Lactobacillus acidophilus (La-5), Bifidobacterium

lactis (Bb12), фруктоолигосахарид рафтилозу, отмечено более раннее

купирование диареи, по сравнению с больными, получавшими только

патогенетическую терапию p<0,05, 2 .

Благодарю за внимание!

Капустин Дмитрий Вячеславович КЛИНИКО...

Documents

Transcript of Капустин Дмитрий Вячеславович КЛИНИКО...