Esercitazione 1

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EsempioQuante sono le proteine di uomo più lunghe di 10000 aminoacidi?

EsempioQuante sono le proteine di uomo e topodepositate in swissprot dall’inizio di quest’anno ?

EsempioE quelle solo di topo?

EsempioDi queste quante sono quelle la cui esistenza è realmente provata?

EsempioQuante sono le proteine di membrana?

EsempioScaricare una lista di proteine

Lista.txt

Campi ricercabiliData di CreazioneLunghezza della SequenzaEC numberSpecie (14.000 Human; 10.000 Yeast; 8.000 Coli; 5000 Rat; 3000 Drosophila)

Classificazione (99.000 bacteria; 100.000 Eukaryota; 50.000 Vertebrata; 17.000 Primates)

Commenti ->109.000 Subcellular Location (Nulceus,cytoplasm, mitochondrion,

membrane)

20.000 Tissue (Liver, Skeleton, Heart Skin, Blood)

71.000 Catalytic activity28.000 Cofactor (zinc, iron, heme, calcium)

13.000 Post Transcriptional Modification73.000 Subunit (monomer,heterodimer, homodimer, homotetramer)

2.500 DiseaseFeatures ->

30.000 Active sites, 21.000 Metal, 29.000 Transmembrane, 21.000 Signal15.000 Mod_res, 60.000 DNA bind, 16.000 Disulfid, 16.000 Carbohyd

Per rifinire-> Nome proteina, Nome gene, Identificativo

20 Questions

E’ un Europeo? SIE’ un politico? SIE’ un contemporaneo? NOE’ morto di vecchiaia? NO

E’ di un vertebrato? NOE’ un enzima? SIE’ una proteina di membrana? NOE’ più lunga di 100 aminoacidi? SI

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