Elizabeth Chen, PhD - Towards Structuring Unstructured GenBank
Deber Blast Genbank Gen Brca2
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UNIVERSIDAD POLITÉCNICA SALESIANA Escuela de la Ingeniería en Biotecnología de los RRNN Nombre: Karina Quishpe Fecha: 24-noviembre del 2014 GENÉTICA MOLECULAR Análisis de la secuencia y diseño de primers para el gen BRCA2 (Gen ID 675) Secuencia BLAST
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Trabajo en clase sobre el uso del blast para el análisis del gen BRCA2 responsable del cáncer de seno en mujeres que han heredado este desorden.
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UNIVERSIDAD POLITCNICA SALESIANAEscuela de la Ingeniera en Biotecnologa de los RRNNNombre: Karina QuishpeFecha: 24-noviembre del 2014GENTICA MOLECULARAnlisis de la secuencia y diseo de primers para el gen BRCA2 (Gen ID 675)
Secuencia BLAST
Resultados BLAST
Secuencias con las que tiene alineamientos (15 primeras)De los resultados obtenidos se observa que esta secuencia tiene homlogas con las que alinea en gran porcentaje, que concuerda con lo encontrado en la literatura con respecto a la presencia de este gen en otras especies de mamferos. Gracias a esto muchos estudios se han desarrollado en modelos murinos.Diseo de primers
Los 5 primeros resultados de opciones de primer:
CONCLUSIONESEstos primers fueron diseados para el gen de identidad GenID 675 por tanto son especficos para esta secuencia, a pesar de esto no se descarta que puedan ser utilizados en el anlisis de otras secuencias homlogas, que como se encontr en el anlisis BLAST son varias y tienen un gran porcentaje de alineamiento.
