ChemDraw 起始界面

第一部分 ChemDraw 简介

1

ChemDraw 起始界面


2

点位：移动鼠标直到鼠标的光标放到所要进行操作的位置，

如果选择的位置在图形结构中的键、原子、线等的上面，

一般出现黑方块，称之为光标块，选择块或操作块。

光标块

常用术语


3

单击：快速按下鼠标键 ( 左或右键 ) ，然后快速抬起；

双击：快速操作两次单击；

拖动：由三部分动作组成——按下鼠标左键选择对象，

移动鼠标，将被选的对象移动到指定位置后抬起鼠标；

选择：用鼠标的光标选中某种选择，使对象产生光标。选择对

象并不意味着动作，只是标记要操作的对象和点位；


4

“键＋单击”：按下特殊的键和单击鼠标键同时进行。

如，“ Shift ＋单击”意思是按下” Shift” 键和单击鼠标键；

“键＋拖动”：按下特殊的键和鼠标键，移动鼠标。

如，“ Shift ＋拖动”意思是按下” Shift” 键和拖动鼠标光标。


5

图形工具板

状态 / 信息栏

编辑区滚动栏

菜单栏

工具栏


6

套索实键双键虚键

切割键切割楔键

黑体键黑体楔键空心楔键

波浪键表格长链

环丙烷环环戊烷环环庚烷环

环己烷椅式环戊二烯环

蓬罩橡皮文本笔箭头轨道绘图元素基元化学符号弧形原子反应模板环丁烷环环己烷环环辛烷环环己烷椅式苯环


7

键工具

模板工具

箭头工具轨道工具

画图工具基元工具

符号工具弧形工具

原子反应工具


8

模板工具氨基酸模板工具17 类


9

模板工具芳香化合物模板工具


10

模板工具双环模板工具


11

模板工具生物模板工具


12

模板工具

玻璃仪器模板工具 (I)


13

模板工具

玻璃仪器模板工具 (II)


14

模板工具构象异构体模板工具


15

模板工具环戊二烯模板工具


16

模板工具脂环模板工具


17

模板工具DNA 模板工具


18

模板工具官能团模板工具


19

模板工具

己糖模板工具


20

模板工具苯环模板工具


21

模板工具多面体模板工具


22

模板工具 RNA 模板工具


23

模板工具

特殊符号模板工具

立体中心模板工具


24

快捷键命令

灰色表示命令未激活小三角

表示子菜单

省略号表示新对话框


25

文档设置

页面规划


26

页眉页脚


27

绘图


28

标题

ChemDraw V7.0 Times New Roma×ÖÌå

ChemDraw V7.0 Arial×ÖÌå


29

原子标记

N

OH


30

颜色

设置背景颜色


31

优选项


32

优选项显示设置

错误警告


33

优选项打开 / 存盘

默认路径

默认打开文件格式

默认存盘文件格式


34

国外化学刊物默认文档格式


35

打开文件

不同文件格式


36

文件格式介绍

1 CD Template(*.ctp, *.ctr)—— 用于保存模板文档

2 ChemDraw (*.cdx)——ChemDraw 原本格式，是一个公共标记

的文件格式，易被其它程序建立和解释

3 ChemDraw Steyl Sheet(*.cds)—— 用于存储文件设置和其它物体

4 Connection Table(*.ct)—— 一种实例格式，存储关于原子与元素、

系列编号、 X 和 Y轴、键序、键类型等的连接和联系的列表。是

用于多类应用程序间互换信息的通用格式


37

5 DARC-F1 (*.fld)——Questel DARC系统中存储结构的原本文件

格式

7 ISIS Reaction(*.rxn)——MDL 开发的格式，用于存储元素反应信息

8 ISIS Sketch(*.skc)—— 在 Windows 或 Macintosh 环境下，存储并传输

到另外的 ISIS 应用程序中

6 DARC-F1 Query(*.flq)——Questel DARC系统中存储查询的原本

文件格式


38

9 MDL MolFile (*.mol)——MDL( 分子设计有限公司 ) MolFile 文件

格式用于其它一些在 Windows 、 Macintosh 和 Unix 环境下的化学

数据库和绘画应用软件

11 Jcamp Spectra(*.jdx ， *.dx)—— 图谱文件格式，可读入紫外、

质谱、红外、核磁等数据文件

12 MSI ChemNote(*.msm)—— 一种 ASCII 文本文件，可以用于像

ChemNote 一类的应用程序

10 Galactic Spectra(*.spc)——银河图谱文件格式


39

13 SMD 4.2 (*.smd)——ASCII 文本文件，一般用于检索化学文摘

数据库

14 Windows Metafile(*.wmf)—— 图片文件格式，可以将 ChemDraw

图片传输到其它应用程序中，如 Word 。 WMF 文件格式含有中

ChemDraw 的结构信息，可被 ChemDraw早期版本编辑


40

一、反应方程式

O

OH

OOH

2-propanone2mol

4-Hydroxy-4-methyl-pentan-2-one1mol


41

选择点位拖动定位单击

单击

定位

单击生成双键

拖动生成双键



42

双击生成文本框输入字母

按 Ctrl 键拖动复制



43


定位单击生成一单键再定位连续单击生成三单键

定位双击后输入 OH


44


用套索或蓬罩进行部分选择


45



生成独立的两个分子


46


选择反应箭头在两个分子中单击生成一反应箭头


47


箭头上方建立文本框输入反应条件


48


选择电荷

定位添加负电荷


49


选择居中

分子下方建立文本框


50


依次输入文本信息


51


选择阴影框

将反应方程式全部罩上


52

二、绘制中间体结构

O

OH


53


选择环己烷以建立六员环模型

选择橡皮，擦去六员环一部


54


选择单键定位连续单击生成新的单键

单击单键中央，生成双键


55


在原子上定位建立标记


56


选择笔工具在曲线菜单中选择箭头位于末端


57


定位拖动鼠标左键定位单击生成曲线箭按 Esc 键退出绘制模式


58

单击箭头


用小手形光标移动造另一虚线


59

小手形光标选中虚线柄


拖动改变虚线箭形状

按 Esc 键


60

三、复杂环结构

CH

O


61


选择环己烷；并添加第一个环

添加第二个环


62


橡皮擦去多余部分


63


选择键工具；单击生成新的单双键


64




65

四、 Fischer葡萄糖结构图

CHO

CH2OH

OHH

HHO

H OH

H OH


66


选择键工具；连续单击生成五连键


67


建立与五连键垂直的水平键


68




69

O

OHOH

OH

OH

CH2OH

五、透视图形


70

五、透视图形

选择环己烷旋转环己烷


旋转指示箭头


71

五、透视图形

添加垂直键

按 Alt 键，任意键长


72

五、透视图形

选择套索工具，阴影右下脚按 Shift键

向上按动，垂直压缩 50％


73

五、透视图形



74

五、透视图形

选择黑体楔键单击下部两侧键的中央


75

五、透视图形

选择黑体键单击底键的中央


76

六、 Newman 结构


77


选择键工具；连续单击生成三键对称结构



78


选择键工具；按住 Alt 键，连接两个结构


79


选择轨道工具定位中心原子；按住 Alt 键，按下鼠标键，向外按动建立轨道


80


部分选择上面分结构

右上脚双击旋转柄，对话框中输入 180

单击旋转


81


从 Object 菜单选择 Bring to Front 命令


82


后面结构移至前面按 Esc 键

添加阴影框


83

七、立体化学


84

七、立体化学


85

七、立体化学


86

七、立体化学


87

七、立体化学


88

七、立体化学


89

七、立体化学


90

七、立体化学


91

H3C

C C

CH3

Br

H

HBr

虚键实键楔键虚楔键

3.1 键工具


92

实键 (Solid Bond)

双键 (Double Bond)

虚键 (Dashed Bond)

切割键 (Hashed Bond)

切割楔键 (Hashed WedgedBond)

黑体键 (Bold Bond)

黑体楔键 (Bold WedgedBond)

空心楔键 (Hollow WedgedBond)

波浪键 (Wavy Bond)


93

双键 (Double Bond)

异构键 (Tautometic Bond)

双抉键 (Double Either Bond)

三键 (Triple Bond)

双黑体键 (Double Bold Bond)

芳香族键 (Aromatic Bond)

配键 (Dative Bond)


94

O

OH

OHCH3

HO

OH

H2COH OH

OH

OHOH

O

OH

OH

HO

HO

OH

OH

OH

OH

OHOH

OHOH

HO

OH

O

O

H3C

H3COH

HO

OH

OH

OH

OHHOOHCH3OHCH3

OH

O

NH

O

HO

CH3

O

O

OH2N

OH

OH

HO

Polytoxin(海葵毒素 )


95

更改页面设置


96

改为“横向”


97

更改文档设置


98

点击” Drawing”


99

选择固定长度


100

改为” 0.6”


101

3.2 环工具

环丁烷 (Cyclobutane Ring)

环己烷 (Cyclohexane Ring)

环辛烷 (Cyclooctane Ring)

环己烷椅式 1(Cyclohexane Chair Ring)

苯环 (Benzene Ring)


102

环丙烷 (Cyclopropane Ring)

环戊烷 (Cyclopentane Ring)

环庚烷 (Cycloheptane Ring)

环己烷椅式 2(Cyclohexane Chair Ring)

环戊二烯 (Cyclopentadiene Ring)


103

选择六员环

六员环光标

按住 Ctrl 键，不定域共轭环光标


104

3.3 无环链工具

无环链工具

无环链光标

按住拖动


105

定位按住拖动


106

定位，单击输入键的个数


107

CH3

CH3

CH3

CH3 CH3

CH3

H3C

CH3

CH3CH3


108

先画一半结构；按 Ctrl 键复制


109

点击水平翻转


110

点击垂直翻转


111

橡皮擦去多余部分

靠近原结构


112

全部选择


113

结合


114

CH3

CH3CH3

CH3

CH3CH3

前后顺序错误

前后顺序正确


115

CH3

CH3CH3双击

选择后键


116

置后

选择单键


117

N

OC

NHCHCO

CH2O

NHCHCO

CH3

N

CH3

CH CO N

CH3

CHCO

CH

(CH3)2

OCH2

SCH3

S

CHCON

CH3

COCH

HC

(CH3)2

N

CH3

COCHNH

CH3

COCHNH

CO

NEchonomycin(海胆霉菌素 )

D-Ser

L-MeVal

L-Ala

L-Ala

L-MeVal

D-Ser


118

文本

原子标记4.1 文本


119

使用快捷键输入文本和原子标记

更改快捷键设置


120

字号柄

文本框

按动字号柄，文本框宽度发生变化


121

改变说明文本的字体、字号和字形

说明文本菜单


122

文本字体


123

文本字形

下标下标公式


124

文本字号


125

文本行间距


126


127

4.2 原子符号的标记

使用文本工具建立原子标记框

使用键工具建立原子标记框

定位单击

定位双击


128

使用快捷键输入文本和原子标记

更改快捷键设置


129

标记同位素

选择上标


130

标记电荷

选择上标


131

重复原子标记

选中自动原子标记


132

重复原子标记 ( 快捷方式 )

标记原子

新键定位三击


133

原子标记的调整

原子标记调整菜单


134

原子标记的调整

Alt + Enter

左对齐右对齐


135

原子标记自动调整


136

H3CN

H3CN

CH3N

NCH3

NCH3

NCH3

左对齐右对齐


137

C

C

C C

C

C

H

H H

H

HH


138

5.1 轨道工具s- 轨道

单瓣型轨道

d- 轨道

dz2- 轨道


139

- 轨道

杂化轨道

p- 轨道


140

s- 轨道的绘制

定位原子选择轨道点击或向外按动


141

单瓣型轨道的绘制

定位原子点击或向外按动

选择轨道


142

p- 轨道及杂化轨道的绘制

定位原子点击或向外按动选择轨道


143

5.2 化学符号环正、负电荷

一般正、负电荷阴、阳离子自由基

H- 划

孤对电子 H- 点


144

H- 划：表示沿 Z轴向平面里进入的氢

H- 点：表示沿 Z轴向平面外伸出的氢

定位单击


145

孤对电子

定位单击


146

电荷符号

定位

单击


147

化学符号的旋转

选择旋转

旋转角度


148

6.1 箭头

箭头工具


149

普通箭头

粗体箭头

虚箭头

上半箭头

下半箭头

双头箭头


150

空心箭头

全头曲箭头

半头曲箭头

平衡箭头

后开口空心箭头


151

箭头的绘制

定位按动


152

箭头的选择

两个编辑块


153

箭头的选择

旋转按钮


154

O

CH

CH2

CH2

CH2

H

R

O

CH

CH2

CH2

CH2

H

R

O

CH

CH2

CH2

CH2

H

R

用箭头指示电荷的转移


155

Ph3P

Pt

Ph3P

C

C

Ph

Ph

103°

39°

140°

1.32Å

用箭头指示键角及键长


156

CH3 CH3

NO2

CH3

NH2

CH3

NHCOCH3

CH3

NHCOCH3

Br

CH3

NH2

Br

CH3

N2Cl+

Br

CH3

Br

CH3

NO2

CH3

NH2

CH3

N2Br+

CH3

Br

HNO3

H2SO4

Fe

H+

(CH3CO)2O

Br2

H2O

H+

NaNO2

HCl

H3PO2

HNO3

H2SO4

Fe

H+

NaNO2

HBr CuBr

¼×±½

m-äå¼×±½

o-äå¼×±½

甲苯的溴化


157

6.2 绘图元素及基元

圆基元工具

椭圆基元工具基本方框图形工具

基本线形图形工具


158

括号工具短键工具


159

灰圆工具 ( 上 ) 和空心圆工具 ( 下 ) 建立的分子结构


160

线工具绘制的交叉线是相交的

实键工具绘制的交叉线是不相交的


161

6.3 弧形工具

90° 、 120° 、 180° 、 270°弧


162

B

B

B

B

H

H

H

H

H

H

H H

HH

90°弧


163

旋转指示

旋转角度


164

缩放指示

缩放比例


165

6.4 笔工具

笔工具按钮


166

1 定位、单击并按动

2 二次定位、单击并按动

3 三次定位、单击并按动


167

4 鼠标右键，选择是否箭头位于末端

5 选择箭头位于末端

6 取消箭头位于末端


168

笔工具处于编辑状态

笔工具选中编辑部位


169

按动控制柄末端，改变曲线角度

按动控制柄中央，改变曲线长短


170

用笔工具绘制的反应曲线


171

7.1 使用快捷键标记原子7.1.1 标记最后被绘制的原子 ( 方法 1)

绘制键按快捷键 C


172

7.1.2 定位快捷标记原子 ( 方法 2)


173

7.1.3 选择工具快捷变换原子 ( 方法 3)


174

7.1.4 标记被选结构中的原子 ( 方法 4)


175

7.1.5 运用默认快捷键 ( 方法 5)

1) Enter 键：打开原子标记文本框

2) Space 键：删除原子标记

3) / 键：当指向定位原子时，显示原子属性对话框

4) = 键：显示列举俗名对话框

5) . 键：增加一个连接点


176

7.1.6 快捷键效果 ( 方法 6)


177

俗名式

7.2 俗名的使用

Et

Me

NHOH

CH2CH3

CH3

NHOH

普通式


178

俗名列表对话框


179

定义俗名

1) 建立一个结构，其中含有将定义为俗名的官能团；

2) 选择该官能团，其中必须有一个原子，它的一些键被选择，而其余的键没被选择，用于表示官能团的连接键；

可定义俗名不可定义俗名连接键无连接键


180

3) 从 Structure 菜单中，选择 Define Nickname, 出现 Define Nickname 对话框；

4) 给俗名输入一个简短的名称；

5) 单击 OK 按钮，俗名被定义，即可用此俗名标记原子。


181定义俗名输入俗名


182

注意

1) 如果定义的俗名符号与元素符号相同，将被警告元素符号被俗名符号取代；

2) 要恢复元素的定义，从 File 菜单中选择 List俗名，可删除俗名定义。


183

查看俗名

1) 从 File 菜单中，选择 List Nicknames ，出现俗名列表对话框；


184

2) 使用快捷键 = ，前提是编辑区必须有一个未被选择的键。

光标移至单键末端

选择俗名

确定


185

7.3 多中心结构

Fe多中心键

多中心键中心原子

多中心节点

多中心节点

二茂铁


186


187警示标志的去除与添加

警示标志

显示 (去除 ) 警示


188分别添加多中心节点


189

选择实键工具，在上下两个中心节点画出上下两根单键在其中一根单键上标记 Fe


190

另一根键与Fe没有连接

选择键的末端，拉动与 Fe连接

调整对齐


191

键的前后次序错误键的前后次序正确


192

结构展开

7.4 结构展开与调整


193展开标记结构调整


194

结构的符号形式结构展开结构调整


195

结构调整


196

7.5 检查化学结构信息

结构分析


197分析结果窗口

分子式

精确质量

分子量

质谱分析

元素分析

结果粘贴

两位小数

质谱图


198

结果粘贴


199化合物命名将结构转化成名称


200将名称转化成结构


2011HNMR预测

1HNMR 位移


2021HNMR预测结果


203预测结果

Protocol of the H-1 NMR Prediction:

Node Shift Base + Inc. Comment (ppm rel. to TMS)

CH2 3.12 1.37 methylene 0.63 1 alpha -C=C 1.12 1 alpha -C(=O)-C CH2 3.71 1.37 methylene 1.22 1 alpha -1:C*C*C*C*C*C*1 1.12 1 alpha -C(=O)-C CH 7.06 7.26 1-benzene -0.20 1 -C CH 7.14 7.26 1-benzene -0.12 1 -C CH 7.07 7.26 1-benzene -0.19 1 -C CH 7.14 7.26 1-benzene -0.12 1 -C CH 7.06 7.26 1-benzene -0.20 1 -C CH3 3.76 0.86 methyl 2.90 1 alpha -OC(=O)-C=C H 5.97 5.25 1-ethylene 0.80 1 -C(=O)O-R gem -0.08 1 -CC=O cis H 7.12 5.25 1-ethylene 1.18 1 -C(=O)O-R cis 0.69 1 -CC=O gem


20413CNMR预测

13CNMR 位移


20513CNMR预测结果


206部分预测结果


207

绘制完结构后，在ChemFinder.com网站查找相关信息


208

该化合物的相关数据


209

该化合物的其它相关数据


210

该化合物的供应商查询


211

两个查询结果


212

化合物名称

化合物其它名称


213

索取详细资料


214

详细资料展示


215


216

由结构查询 ACX数据库编号


217

编号显示


218

浏览 ChemStore.com


219


220

浏览 CambridgeSoft.com


221


222

浏览 ChemOffice SDK数据库


223


224

ChemOffice SDK 主页菜单


225

ChemDraw 控件窗口


226


227

有机合成电子刊物

http://www.orgsyn.org


228

开始检索


229接受协议


230

检索界面


231

检索条件

1 画出检索条件

2 反应结果列表

3 检索


232

检索结果

检索到 76 个结果，显示 1-5

反应摘要


233

文献全文本文所在期刊的卷号及页码

操作过程

注意事项


234

本文被其它论文引用

参考文献

本文所用化合物及其 CA登记号


235

9.1 利用键工具建立模型9.2 利用 Replacement Text 建立模型9.3 检查结构能量9.4 ChemDraw 和 Chem3D 信息转换9.5 分子轨道 (HOMO 及 LUMO)


236

9.1 利用键工具建立模型

Chem3D 起始界面


237

9.1 利用键工具建立模型

Chem3D 起始界面


238

选择轨迹球单键

双键三键

虚键文本橡皮


239

显示设置


240

显示设置属性

线状模型

棒状模型

球棍模型

圆柱键模型

比例模型

带状模型


241选择【单键】工具，在模型窗口向右按动

圆柱键模型


242

线状模型


243

棒状模型


244

球棍模型


245

比例模型


246

带状模型常用于生物分子


247

选择【轨迹球】工具，使分子模型在模型窗口沿 X 、 Y轴旋转

X 、 Y轴旋转指示


248

选择【轨迹球】工具并按“ Alt” 键，使分子模型在模型窗口沿 Z轴旋转

Z轴旋转指示


249模型结构信息

光标位于原子上，自动显示原子信息


250

光标位于键上，自动显示键信息

模型结构信息


251模型的进一步信息


252模型的键长数据


253模型的键长和键角数据


254乙烯模型中的双键信息


255

键级改动


256

显示氢及孤对电子


257

不显示氢及孤对电子的环己烷

原子名称及序数


258

选择工具，双击原子，按顺序改变原子序号


259

利用【键】工具建立的结构，键角及键长可能不正常，应【整理结构】


260

环己烷的椅式构象


261

9.2 利用 Replacement Text 建立模型

使用【文本】工具输入结构式


262按【 Enter】自动转化为模型


263括号表示支链


264


265

整理结构


266

简单优化


267

4-甲基 -2- 戊醇模型


268

建立 1 ， 2- 双甲基环戊烷模型


269


270

整理结构


271

建立 Ibuprofen(布洛芬 ) 模型

H3C CH

CH3

CH2 CH

COOH

CH3


272


273

建立十肽菌素模型


274


275

建立十二丙氨酸醇分子模型


276


277

改变显示方式


278

设为线状模型


279


280

设为带状模型


281

-螺旋模型


282

使用子结构建立模型


283

子结构模型库


284

选择所需的子结构，然后复制


285

粘贴复制结果


286

在子结构上进行编辑


287

9.3 检查结构能量


288

模型旋转

对位交叉


289

总能量计算


290

空间位阻能： 0.977kcal/mol

计算结果


291

模型的二面角数据


292

数据与模型对应


293

显示原子符号及序号


294

按动旋转

数据相应改变


295

对位重叠


296

空间位阻能： 3.906kcal/mol

计算结果


297

9.4 ChemDraw 和 Chem3D 信息转换

ChemDraw 中画出的分子结构

复制粘贴到 Chem3D 中


298

Chem3D 中画出的分子模型复制粘贴到

ChemDraw 中


299

9.5 分子轨道 (HOMO 及 LUMO)


300

显示轨道时必须选择


301

选择分子轨道


302

选择 HOMO轨道

HOMO 轨道显示


303

乙烯分子的 HOMO 轨道


304

选择 LUMO轨道

LUMO 轨道显示


305

乙烯分子的 LUMO 轨道


306

10.1 数据库检索10.2 反应查询10.3 表单的制作10.4 数据库连接10.5 建立自己的数据库10.6 制作子表单


307

10.1 数据库检索

打开数据库文件


308

双击编辑


309

From ChemFinder


310

选择【子结构】


311

选择【类似】


312

选择【查找】


313

查找结果：数据库中 285条记录，含有苯环子结构及类似物结构的记录 132条，此为第一条


314

转为列表形式


315

或在“ View” 菜单中使用“ Data Table” 命令的子命令“ In Separate Window”


316

数

据

库

进

行

排

序


317

使用文本进行检索


318

输入检索条件，分子式 C6N2


319

开始检索


320

检索结果


321

输入检索条件，分子名称 benz


322

检索结果


323


324

使用数字进行检索

输入检索条件，分子量在 90-100


325

检索结果


326

混合检索


327


328

10.2 反应查询


329


330

反应查询窗口


331

输入查询条件


332


333

产物查询


334

标记反应中心


335

标记反应符号


336

回到检索窗口


337


338


339

反应过程查询


340


341


342

限制性反应过程查询

必须大写


343


344


345

10.3 表单制作

( 选择 )Selection

(数据框 )DataBox

(边框 )Frame

(数据边框 )Framed Boxed

( 文本 )Text

( 图片 )Picture

( 按钮 )Button

( 子表 )Subform

(栅格 )Grid


346

起始界面


347


348

同样方法建立多个数据框


349

数据框标记


350

保存为 tut3.cfw


351

10.4 数据库连接


352

结构数据来源


353

打开数据库


354

选择要连接的数据库


355

CS_DEMO数据中的数据类型


356

结构数据连接


357

结构数据连接显示


358

名称数据来源


359

名称数据连接结果


360

分子式数据来源


361

分子式数据连接结果


362

文件保存为 tut4a.cfw


363

10.5 建立自己的数据库先建立表单，命名为 mydb.cfw


364

结构数据来源中选择创立数据库


365

要创立的数据库的名称


366

创立的数据库的数据类型


367

建立沸点字段


368

建立字段


369

字段名称

字段数据类型


370

字段建立完毕


371

字段的分配


372

输入数据

自动产生


373

10.6 制作子表单

建立子表单


374子表单名称


375

子表单数据来源


376子表单数据类型


377

子表单数据性质


378子表单数据未连接


379子表单与主表单的连接


380子表单数据显示


381

美国化学学会 (America Chemical Society)


382

美国化学学会 (America Chemical Society)


383


384


385


386


387


388


389


390

ChemDraw 起始界面

Documents

Transcript of ChemDraw 起始界面