8/19/2019 Biosel FG 5

1/39

Struktur,Penyusun,

dan SifatKimia Protein

Biologi Sel danMolekular A

FG 5

Asma

Istri nurul afah

Olya !essariMaria "omauli

 #unita Sari

8/19/2019 Biosel FG 5

2/39

S$"%K$%" P"O$&I'

8/19/2019 Biosel FG 5

3/39

Struktur Sekunder

%rutan(urutanasam amino

yang tersusunse)ara linear

ter*entukmelalui ikatan

antara gugus +

amino dengangugus +kar*oksil

 

ru urPrimer

kom*inasi antara struktur -rimeryang linear dista*ilkan oleh ikatanhidrogen antara gugus .!O dan .'/

http://2.bp.blogspot.com/-xAQFiHsPesQ/UGbw_Bs81AI/AAAAAAAACsQ/q9zj0fjWWm4/s1600/3.+pembentukan+peptida.jpghttp://3.bp.blogspot.com/-g-G5fVGA3fc/UGbxAvnMCmI/AAAAAAAACsY/3v4y1mZklSg/s1600/4.+struktur+primer.jpghttp://2.bp.blogspot.com/-xAQFiHsPesQ/UGbw_Bs81AI/AAAAAAAACsQ/q9zj0fjWWm4/s1600/3.+pembentukan+peptida.jpg

8/19/2019 Biosel FG 5

4/39

Struktur sekunder +(heliks 0Murray etal, 12234

Struktur sekunder +(heliks

Struktur +(helikster*entuk antara masing(

masing atom oksigenkar*onil -ada suatuikatan -e-tida denganhidrogen yang melekat kegugus amida -ada suatuikatan -e-tida em-atresidu asam amino di

se-an6ang rantai-oli-e-tida 0Murray et al,12234

•Beru-a heliks yg *er-utar kekanan 0right(handed4•Gugus " dari asam aminomen)uat keluar tegak lurus thdsum*u heliks•/eliks(+-aling manta- *ila7struktur -rimer mengand AA dgrantai sam-ing tidak *er(muatans-t Ala,8eu, Phe, $ir,$r-, Sis, Met,/is, Asn, Gln 9 :al•

/eliks(+men6adi tdk manta- lagi*ila7AA yg mem*tk struktur-rimer mem- rantai sam-ing yg*esar;*ermuatan s-t Ser, Ile, $re,As-, Glu, 8is 9 Arg

http://4.bp.blogspot.com/-o0xLs6FXA6c/UGbxB4OEXrI/AAAAAAAACsg/Md_31_tx-6s/s1600/5.+struktur+alfa.jpg

8/19/2019 Biosel FG 5

5/39

Struktur sekunder

8/19/2019 Biosel FG 5

6/39

8/19/2019 Biosel FG 5

7/39

WeakInteractions:•Ikatan /idrogen•Ikatan Ionik•Interaksi hidrofo*ik0non -olar4

•Gaya an der =aals

StrongInteraction:

 >em*atan disulda

8/19/2019 Biosel FG 5

8/39

Pem*entukan $ertiaryStru)ture

8/19/2019 Biosel FG 5

9/39

 $ertiary Stru)ture

8/19/2019 Biosel FG 5

10/39

QuarternaryStructure

Struktur tigadimensional yang

ter*entuk se*agai hasildari kom*inasi dua atau

le*ih su*unit-oli-e-tida, disatukan

oleh interaksi nonkoalen se-erti ikatan

ionik, interaksihidrofo*ik dan ikatan

hidrogen

8/19/2019 Biosel FG 5

11/39

Berdasarkan 6umlah su*unit

?imeri) 01 su*unit4

!ontoh7 GA8$ dan insulin0Gala)tose @(-hos-hat uridylyltransferase4

 $rimeri) 0 su*unit4

!ontoh7 !ollagen dan P!'A

 $etrameri) 0 su*unit4

!ontoh7 /emoglo*in

Oligomeri) 0*anyak su*unit4!ontoh7 O$!s 0Ornithine trans)ar*amylases4

8/19/2019 Biosel FG 5

12/39

• Berdasarkan Bentuk

Glo*ular Fi*rousGlobular Protein Fibrous Protein

Strukturnya -adat Strukturnya menye*ar

Bersifat larut dalam air ; li-id*ilayer

 $idak larut dalam air ; li-id*ilayer

Struktur sekunder7 kom-leksBeru-a kom*inasi alfa heliC,*eta sheet dan struktur loo-

Struktur sekunder7 sederhana/anya terdiri dari @ ma)amsa6a

Struktur kuartener7 interaksiantar ikatan non koalen yang

mem*entuk suatu 6em*atan

Struktur kuartener7 interaksiikatan koalen

Biasanya untuk meta*olisme0trans-or, enDim, hormon, danimun4!ontoh7 al*umin telur, glo*ulin

0serum4

Biasanya untuk mem*entukstruktur tu*uh 0tulang, otot,kulit, ram*ut4!ontoh7 keratin, )ollagen,

elastin

8/19/2019 Biosel FG 5

13/39

Penyusun -rotein

Kom-onen -enyusun -rotein terdiri darikar*on 5@55E, /idrogen 2,5,E, Oksigen

1@,51,5E, Sulfur 2,51E, Phosfor 2@,5E0inarno, @33@4

8/19/2019 Biosel FG 5

14/39

Ikatan -e-tida

Ikatan -e-tida gugus kar*oksil dari satumolekul asam amino *eraksi dengan gugusamino dari molekul asam amino lainnya

8/19/2019 Biosel FG 5

15/39

Asam amino esensial

@ 8eusin 08eu, 84

Paling umum di6um-ai -ada -roteinFungsi 7

(Men6aga -erom*akan

(Pem*entukan -rotein otot

1 Isoleusin 0Ile, I4"umus kimia sama dengan leusin teta-iletak atom(atomnya *er*eda?i alam hanya terdiri dari @ *entuk sa6aFungsi 7

(Mem*antu men)egah -enyusutan otot(Mm*antu dalam -em*entukan sel darahmerah

8/19/2019 Biosel FG 5

16/39

:alin 0:al,:4Sifat alin dalam air adalah hidrofo*ik:alin di-roduksi denganmenggunakan treonin se*agai *ahan *akuFungsi 7

($idak di-roses di organ hati, dan langsungdisera- oleh otot

(Mem*antu dalam mengirimkan asam amino

lain ke otak 8isin 08ys,K4?alam -elarut air *ersifat *asa, se-erti 6ugahistidin8isin men6adi kerangka *agi niasin

0itamin B@4Fungsi 7

(Bersama dengan :itamin ! mem*entuk 8(!arnitine

(Mem*antu dalam -em*entukan kolagenmau-un 6aringan -enghu*ung tu*uh lainnya

8/19/2019 Biosel FG 5

17/39

5 $ry-to-han 0$ry,4

Bentuk umum 8(tri-tofan

Fungsi 7

(Pemi)u serotonin 0hormon yang memiliki efekrelaksasi4

(Merangsang -ele-asan hormon -ertum*uhan

Methionin 0Met,M4

Asam amino yang memiliki atom SSum*er utama metionina adalah daging0ikan4

Fungsi 7

(Menurunkan kadar kolestrol darah(Mem*antu mem*uang Dat ra)un -ada organhati dan mem*antuk regenerasi 6aringan *aru-ada hati dan gin6al

8/19/2019 Biosel FG 5

18/39

 $hreonin 0$hr,$4

Fungsi 7

(Mem*antu -en)egahan -enum-ukan

lemak -ada organ hati

(Kom-onen -enting dari kolagen

J Fenilalanin 0Phe,P4

Asam amino aromatik yang memiliki)in)in *enDena

Fungsi 7

(Penghantar atau -enyam-ai -esan0neurotransmitter 4 -ada sistem saraf otak

(Mem*antuk menekan nafsu makan

8/19/2019 Biosel FG 5

19/39

3 Arginin 0Arg,"4

!enderung *ersifat *asaSum*er utama 7 daging, susu 0dan olahannya4, dantelur

@2 /istidin 0/is,/4

&sensial *agi anak anak

Fungsi 7/istidina men6adi -rekursor histamin, suatu aminayang *er-eran dalam sistem saraf, dan karnosin,suatu asam amino

8/19/2019 Biosel FG 5

20/39

Asam amino non esensial

8/19/2019 Biosel FG 5

21/39

Asam amino non esensial

ProlinProlina meru-akan satu(

satunya asam amino

dasar yang memilikidua gugus sam-ingyang terikat satu(samalain 0gugus aminomele-askan satu atom/ untuk *erikatandengan gugus sisa4Aki*at strukturnya ini,-rolina hanya memilikigugus amina sekunder0('/(4

SerinSerina meru-akan asam amino

 -enyusun -rotein yangumum ditemukan -ada-rotein he=an Proteinmamalia hanya memiliki 8(serin 'amanya diam*il dari*ahasa8atin, sericum 0*erarti sutera4 karena -ertama kalidiisolasi dari -rotein seratsutera -ada tahun @J5

Fungsi *iologi dan kesehatanyaitu Serina -enting *agimeta*olisme karena terli*atdalam *iosintesis 

http://id.wikipedia.org/wiki/Hidrogenhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Amina&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Asam_aminohttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Suterahttp://id.wikipedia.org/wiki/Metabolismehttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Biosintesis&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Biosintesis&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Metabolismehttp://id.wikipedia.org/wiki/Suterahttp://id.wikipedia.org/wiki/Proteinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_aminohttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Amina&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Hidrogen

8/19/2019 Biosel FG 5

22/39

Asam amino non esensial

AlaninAlanin 0Ala4 atau asam 2-

aminopropanoat 

memiliki *entuk umum 8(alanin 0S(alanin4 di alammeski-un terda-at -ula*entuk ?(alanin 0R(alanin4 -ada dinding sel*akteri dan se6umlahanti*iotika 8(alanin

meru-akan asam amino-roteinogenik yang-aling *anyak di-akaidalam -rotein setelahleusin

Arginin Asam amino ini tergolong

setengah esensial *agimanusia dan mamalia

 lainnya, tergantung -adatingkat -erkem*angan ataukondisi kesehatan

Bagi anak(anak, asam aminoini esensial Pangan yangmen6adi sum*er utamaarginin adalah -roduk(-roduk-eternakan 0dairy products4

se-erti daging, susu 0danolahannya4, dan telur ?ari-roduk tum*uhan da-atdise*utkan *i6i ka)ang tanahdan )okelat

http://id.wikipedia.org/wiki/Antibiotikahttp://id.wikipedia.org/wiki/Leusinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Mamaliahttp://id.wikipedia.org/wiki/Mamaliahttp://id.wikipedia.org/wiki/Leusinhttp://id.wikipedia.org/wiki/Antibiotika

8/19/2019 Biosel FG 5

23/39

Asam amino non esensial

As-araginAs-aragin *ersifat netral

0tidak *ermuatan4 dalam

-elarut air As-araginameru-akan asam amino-ertama yang *erhasildiisolasi 'amanyadiam*il karena -ertamakali di-eroleh dari 6usas-aragus Fungsi *iologi7As-aragina di-erlukan

oleh sistem saraf  untukmen6aga kesetim*angandan dalam transformasiasam amino

Asam as-artatAsam as-artat meru-akan

asam amino analognya

karena ter*entuk melaluiaminasi as-artat -ada satugugus hidroksilnya Asamas-artat *ersifat asam,dan da-at digolongkanse*agan asam kar*oksilatBagi mamalia as-artattidaklah esensial

Fungsinya diketahuise*agai -em*angkitneurotransmisi di otak dan saraf  otot

http://id.wikipedia.org/wiki/Asparagushttp://id.wikipedia.org/wiki/Sarafhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidroksilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asamhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_alkanoathttp://id.wikipedia.org/wiki/Mamaliahttp://id.wikipedia.org/wiki/Otakhttp://id.wikipedia.org/wiki/Sarafhttp://id.wikipedia.org/wiki/Sarafhttp://id.wikipedia.org/wiki/Otakhttp://id.wikipedia.org/wiki/Mamaliahttp://id.wikipedia.org/wiki/Asam_alkanoathttp://id.wikipedia.org/wiki/Asamhttp://id.wikipedia.org/wiki/Hidroksilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Sarafhttp://id.wikipedia.org/wiki/Asparagus

8/19/2019 Biosel FG 5

24/39

Asam amino non esensial

SisteinSistein meru-akan asam

amino *ukan esensial *agi

manusia yang memilikiatom S, *ersama(samadengan metionin Karenamemiliki atom S, sisteinamen6adi sum*er utamadalam sintesis senya=a(senya=a *iologis lain yangmengandung *elerang

Sisteina dan metionin-ada -rotein 6uga*er-eran dalammenentukan konformasi-rotein

o GlutaminGlutamina di*uat dengan

mengganti rantai

sam-ing hidroksil asamglutamat dengan gugusfungsional aminaGlutamina meru-akan*agian -entingdari asimilasinitrogen yang *erlangsung-ada tum*uhan Glutamina

di6adikan su-lemen atlet*inaraga untuk menggantikerusakan otot dengansegera aki*at latihan*e*an yang *erat

http://id.wikipedia.org/wiki/Beleranghttp://id.wikipedia.org/wiki/Metioninhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Konformasi_protein&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Konformasi_protein&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Konformasi_protein&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Konformasi_protein&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Metioninhttp://id.wikipedia.org/wiki/Belerang

8/19/2019 Biosel FG 5

25/39

Asam amino nonesensial

Asam glutamatAsam glutamat

termasuk asam amino yang*ermuatan 0-olar4 *ersama(sama dengan asamas-artat Ini terlihatdari titik isoelektriknya yangrendah, yang menandakania sangat mudahmenangka- elektron0*ersifat asam menurut8e=is4 Ion glutamat

merangsang *e*era-ati-e sarafyang adadi lidah manusia Sifat inidimanfaatkan dalamindustri -enyeda-

GlisinGlisina meru-akan asam

amino yang mudahmenyesuaikan diri dengan*er*agai situasi karenastrukturnya sederhanaSe)ara umum -rotein tidak*anyak mengandungglisina Penge)ualiannyaialah -ada kolagen yangdua -er tiga darikeseluruhan asam

aminonya adalah glisinaGlisina *er-erandalam sistem saraf se*agaiinhi*itor neurotransmiter-ada sistem saraf -usat

8/19/2019 Biosel FG 5

26/39

Sifat Kimia Protein Sifat Koloid

Protein akan mem*entuk sistem dis-ersi

koloid

Protein mem-unyai gugus(gugus hidrolikse-erti '/1, (!OO/, (O/

8/19/2019 Biosel FG 5

27/39

/idrolisis

/idrolisis oleh asam

/idrolisis oleh *asa/idrolisis oleh enDim

8/19/2019 Biosel FG 5

28/39

"eaksi("eaksi arna

"eaksi Biuret

"eaksi 'inhidrin"eaksi Millon

8/19/2019 Biosel FG 5

29/39

Sifat asam *asa

?itentukan oleh gugus(gugus asam;*asa yangterda-at -ada gugus " nya

Protein 6uga mem-unyai nilai titik isoelektrik

8/19/2019 Biosel FG 5

30/39

?enaturasi dan Koagulasi

?enaturasi meru-akan -eru*ahan struktur

sekunder, tersier, dan kuaterner darimolekul -rotein tan-a ter6adinya-eme)ahan ikatan -e-tida

8/19/2019 Biosel FG 5

31/39

Faktor -enye*a* denaturasi7

@ Panas

1 8arutan %rea

Pelarut Organik

Asam dan *asa kuat

5 ?etergen

Garam(garam dari logam *erat Pengo)okan kuat

J Penam*ahan Dat -ereduksi;-engoksidasi

8/19/2019 Biosel FG 5

32/39

Penam*ahan asam atau *asa kuat

8/19/2019 Biosel FG 5

33/39

Penam*ahan alkohol

8/19/2019 Biosel FG 5

34/39

Penam*ahan Dat -ereduksi;-engoksidasi

8/19/2019 Biosel FG 5

35/39

Interaksi Molekular Ikatan /idrogen

Ikatan Ionik Interaksi an der aals

Interaksi hidrofo*ik

8/19/2019 Biosel FG 5

36/39

Ikatan /idrogen Interaksi lemah

Ikatan yang -aling *anyak dalam sistem

*iologis !ontoh -ada asam nukleat dan -rotein

8/19/2019 Biosel FG 5

37/39

Ikatan Ionik Ikatan -aling kuat

Adanya -er*edaan muatan -ada atom

yg *erinteraksi Interaksi nonkoalen

Ikatan ini da-at dihilangkan saat Phekstrem atau dalam kadar garam yg

tinggi

8/19/2019 Biosel FG 5

38/39

Interaksi an der aals?istri*usi muatan yang tidak simetris

yaitu d=ikutu* sementara

Interaksi lemah, umumnya -ada 8eusindan aline

8/19/2019 Biosel FG 5

39/39

Interaksi /idrofo*ik

'on-olar,umumnya -ada Alanin dan8eusin

Gugus sam-ing alifatik dan aromatiksuatu -rotein dan *asa(*asa asam

nukleatMenye*a*kan ter6adinya -eli-atan

makromolekul