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SIVOL Système d’Information Volailles

MC Batut - T Heirman

Comité de pilotage : MC Batut, B. BassoArtiguères : F Dubos*, MD Bernadet, M RuinautPEAT : Y Baumard, J Besnard, J Delaveau, D Gourichon, N SellierURA : C. Beaumont*, M Chabault, N SellierGABI : T Heirman, M Tixier Boichard*, A VieaudSAGA : B Basso, R Duzert, C Marie-Etancelin, MM Richard*

Depuis 2003 : 20 réunions (1 tous les 3 mois au début)

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Quelles données gérer ?

Modélisation des données : MCD fait avec PowerAMC

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Tours

GFA URA

Génétique Factorielle Avicole

N. Sellier*/D.Gourichon*

PEAT

Pour qui ? : les UE et UR

Les UE dépendent des 2 départements GA et PHASE

M. Ruinaut*MD Bernadet*C. Peillod

Landes

UEPFG

Unité Expérimentale des Palmipèdes à Foie GrasG.Guy

PalmiPôle

*=CP

Garen O. Demeure

F. PitelLGC

C. Marie*B. Basso*SAGA

Station d’Amélioration Génétique des Animaux

PSGen

Jouy-en-Josas GABI PSGen (ancien GDA)

E. VerrierAgathe Vieaud*

E. DuvalM. Chabault*

Unité de Recherche Avicole

URA

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JOUY EN JOSAS CTIG

Unité Expérimentale

Unité de Recherche

Saisies portables sur le terrain

Enregistrement des donnéesSuivi d’élevage

Sauvegardes

Extraction des donnéesValorisation des donnéesSaS

Comment ? : interface + outils terrain

Oracle 10g

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Particularités des volailles

Beaucoup de données : PEAT : 20 000 animaux identifiés par anFemelles en reproduction :

GFA : 712 femelles contrôlées en individuel sur 4 mois 65796 œufs

Pas d’identification normaliséeIdentification Sivol :

Espèce de l’animal (2) : canard(6), poule(8), caille(9), dinde(10) (Sidex)Domaine de naissance (3): ART, GAV, GFA, URAAnnée de naissance (4) : 2008, 2009Numéro de naissance (4) : boucle sur l’aileLot de naissance (2) : 01,02,03, .etc. (ajouté pour passer 9999)

Identification utilisée aussi par les autres UR volailles (Tours, Rhennes, LGC)

Identification électronique en cours d’élaboration (E Ricard, B Basso)

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Conduite par bande (cellule)

Bâtiment 340 Bâtiment 360

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11

Cellule divisée en cages

Individuelle

Collective

10

11

13

14

15

16

17

18

19

20

10

11

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

Cellules

Cellule collective

Elevés au sol (cellule collective) ou en cage

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• Interface convivial créé avec les utilisateurs• Connexion via un login/mot de passe• Connexion sur une espèce et un domaine de production (autorisation)• Multi-fenêtrage• Droits différents suivant les utilisateurs

– rôles Oracle select/insert/update/delete sur les tables• Développé sous VisualStudio 2005 (Framework 2.0, langage C#)

– utilisation des classes de Thierry pour BD, fonctions échangées avec Hervé et M-Hélène

IHM : Interface Homme Machine

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Menu – Opérations regroupées par thèmes

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Sélection : critères assez larges

Opérateur : égale, différent, in, not in, entre, vide, non videOpérateur : égale, différent, in, not in, entre, vide, non videPour les numériques : >, >=, <, <=Pour les numériques : >, >=, <, <=

Opérateur : égale, différent, in, not in, entre, vide, non videOpérateur : égale, différent, in, not in, entre, vide, non videPour les numériques : >, >=, <, <=Pour les numériques : >, >=, <, <=

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Affichage des données avec clés visuelles

Touches dans la grille : comme dans Windows (en bleu foncé animaux sélectionnés)Touches dans la grille : comme dans Windows (en bleu foncé animaux sélectionnés)Se positionner sur UN animal : numéro de naissance ou numéro cage (orange)Se positionner sur UN animal : numéro de naissance ou numéro cage (orange)Trier les animaux : cliquer sur le titre de la colonneTrier les animaux : cliquer sur le titre de la colonneErgonomie : quand on agrandit ou diminue la forme, les colonnes sont redimensionnéesErgonomie : quand on agrandit ou diminue la forme, les colonnes sont redimensionnées

Touches dans la grille : comme dans Windows (en bleu foncé animaux sélectionnés)Touches dans la grille : comme dans Windows (en bleu foncé animaux sélectionnés)Se positionner sur UN animal : numéro de naissance ou numéro cage (orange)Se positionner sur UN animal : numéro de naissance ou numéro cage (orange)Trier les animaux : cliquer sur le titre de la colonneTrier les animaux : cliquer sur le titre de la colonneErgonomie : quand on agrandit ou diminue la forme, les colonnes sont redimensionnéesErgonomie : quand on agrandit ou diminue la forme, les colonnes sont redimensionnées

dgrv.ColumnHeadersDefaultCellStyle.BackColor = frmMaquette.coulColEnTete;dgrv.RowHeadersDefaultCellStyle.BackColor = frmMaquette.coulLigneEnTete;for (int i = 0; i < dgrv.ColumnCount; i++) dgrv.Columns[i].DefaultCellStyle.BackColor = frmMaquette.coulColNePasSaisir;

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Actions possibles à partir d’une grille

Action à faire sur un ou plusieurs animauxAction à faire sur un ou plusieurs animauxAction à faire sur un ou plusieurs animauxAction à faire sur un ou plusieurs animaux

Possible sur UN seul animalPossible sur UN seul animalPossible sur UN seul animalPossible sur UN seul animal

Dans toutes les grillesDans toutes les grillesDans toutes les grillesDans toutes les grilles

A partir de n’importe quelle grille, clic droit avec la sourisA partir de n’importe quelle grille, clic droit avec la sourisA partir de n’importe quelle grille, clic droit avec la sourisA partir de n’importe quelle grille, clic droit avec la souris

cmOperation.Enabled = true; menuCompter.Enabled = true;menuEnregistrer.Enabled = true;menuImprimer.Enabled = true;menuModifierReforme.Enabled = myDroit_Update;menuReactiver.Enabled = myDroit_Update;menuReformer.Enabled = myDroit_Update;menuChangerSexe.Enabled = myDroit_Update;

Les droits : Insert, Update, Delete sur UNE table

SELECT privilege FROM dba_tab_privs"WHERE grantee='" + myRole.ToString().ToUpper() + "'"AND table_name='" + nom_table + "'"AND privilege != 'SELECT'"

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2- Automate de pesées Baléa

Identification électronique

Saisie terrain : de nombreuses possibilités

1- Sur boîtier de saisie PDA :

3- Saisie directe par l’IHM sur PC portable : Mirages, Eclosion

Pesées des animaux vivantsRéforme, changement de sexeChantiers divers (abattage, .etc.)

Saisie de la ponteSaisie des phénotypes liés à un locus visible à œil nuSaisie de mesures diverses (abattage, morphologie, comportement, prélèvement des mâles, échantillons)

Jaune = à saisir

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Saisie de mesures diverses : exemple abattage

Se fait par bâtiment/celluleChoix des mesures à faire (10 maxi)Saisie par numéro animal ou par cageSaisie de la mesure : Contrôles de la mesure par rapport à des bornes (orange) et à un seuil (rouge)Listes possibles des animaux mesurés, non mesurés ou les deux avec mesuresGestion des doubles (avertit si animal déjà mesuré)

Avant : Extraire les animaux à mesurer, choisir une première liste de mesuresEnvoyer le fichier au PDACharger la liste sur le boîtier

Après : Extraire les mesures du PDA, envoyer les données au PCImporter les données, regarder le journal (anomalies)

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MAJ à partir d’un fichier : souple

DataGridView à 5 colonnes

dgrv.Rows.Add("Domaine de naissance", "DOM_NAIS", "C", dimDomNais, 0);

sql="select lib_champ,nom_champ,typ_data,dim,dec from sivol.parametre

where dom_prod='" + myDomaine + "' and espece='" + myEspece + "and nom_table='" + nom_table + "';

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MAJ des mesures d’abattage par l ’IHM

Choisir les mesures à saisir sur les animauxChoisir les animaux

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Suivi de l’élevage : liste et inventaire

Liste des pesées par animal sur une même ligne (poids en gramme, age en jour)

Extraction de données, listes, inventaires, bilans, statistiques élémentaires …

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Suivi de l’élevage : résultats de ponte

Exemple : série de ponteAprès une éclosion :

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Lien avec autres bases : Sidex

Il créé le fichier au format SidexIl met un drapeau à chaque animal sélectionné pour indiquer que l’animal est parti dans Sidex

Peut se faire par cellule ou à partir d’un fichier

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Lien avec autres bases : Gemma, BarCodePour Gemma : Extraction des généalogies et des tubes pour les échantillons prélevés

Pour BarCode : feuille de route FR6 et FR7

Il met un drapeau à chaque animal sélectionné pour indiquerque l’animal a été exporté dans Gemma

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• Remontées des anciennes généalogies– GFA : de Niakwa -> reconstruire les généalogies

• Lignées de André Bordas : Thierry a commencé• Lignées de Michèle Tixier Boichard : Thierry a commencé• Lignées de Marie-Hélène Pinnard : non demandeuse • Francis Minvielle (cailles) : non demandeur

– GAV : • Lignées BC, Salmonelles (AIL), D+/D- • reste quelques lignées à faire

– ART : Palmi Sivol : à faire• Sivol IHM

– Finir demandes des utilisateurs– Visual Studio 2008 (Framework 3)

• Boîtier de saisie :– Tester en grandeur nature Sivol_Mesure– Demande : charger un boîtier avec les animaux à réformer puis valider ou pas

sur le terrain

• MAJ des docs : http://germinal.toulouse.inra.fr/~mcbatut/ • Formations

Futur

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Lié à Oracle ? Oui et non• Utilisation de la classe clsDataBase (T. Heirman)

– Classe clsOracle pour l’IHM : OracleConnection, OracleCommand, OracleDataAdapter, OracleDataReader, OracleTransaction

– Classe clsSQLServeur pour .Net sur PDA : SqlConnection, SqlCommand, SqlDataAdapter, SqlDataReader, SqlTransaction

– Utilisation de fonction pour les datessql_where = sql_where + " and B.d_nais = "+frmMaquette.to_good_format(dtpD_Nais1.Value.ToString(),frmMaquette.TYP_DATA_DATE);

• Liés à Oracle

– Triggers

– PL/SQL : mise à jour de la ponte, des pesées et des phénotypes

– Dictionnaire de données : les droits, le module d’extraction de données

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Utilisation de la classe clsDataBasenamespace INRA_Databases{

public abstract class clsDataBase{

#region Lecture/Modification des attributs de classepublic abstract string DataSource {get; set; }public abstract string User {get; set; }public abstract string Password {get; set; }#endregion#region Ouverture/Fermeture de la base de donnéespublic abstract bool bdOpen();public abstract bool bdOpen(string ConnexionString);

public abstract bool bdClose();#endregion#region SELECT... FROM... , SELECT... FROM... WHERE...

public abstract bool SQLResult_In_Dataset(string SQL); public abstract bool SQLResult_In_Dataset(DataSet ds_gen, string SQL, string nomTable); public abstract Object[,] SQLResult_in_Array(string SQL); public abstract Int64 SQLCount(string SQL);

#endregion#region INSERT, UPDATE, DELETE

public abstract bool ExecuteNonQuery(string SQL);#endregion

}}

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Initialisations public const string dbDataSource="sivol";static public int iDB_USED = 1; // Oracle// public int iDB_USED = 2; // MySQL// public int iDB_USED = 3; // PostGreSQLstatic public int iDB_USED = 4; // SQLServeur

using INRA_Databases;namespace SIVOL {

public class frmListerAnimaux : System.Windows.Forms.Form {private DataSet ds_gen;private clsDataBase ora_gen;…private void InitialiseDataSet() {

ds_gen = new DataSet();// Connexion à la baseora_gen = frmMaquette.InitDescripteurBD(); }

}

public static clsDataBase InitDescripteurBD() { clsDataBase myDB = null;

switch (iDB_USED) { case 1: myDB = new clsOracle(); bIdentificationRequise = true; break;case 4: myDB = clsSQLServer(); bIdentificationRequise = false; break;}

sChaineConnexion = myDB.ConnectionStringBuilder(dbDataSource, myIdUser, myPassword); try { bConnexionEtablie = myDB.bdOpen(sChaineConnexion); } catch { myDB = null; }

static public string myIdUser = "";static public string myPassword = "";static public string myEspece = "";static public string myDomaine = "";

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DataGridView : lié à une source de données

for (int iLigne = 0; iLigne < dgrvCage.RowCount; iLigne++) { if (dgrvCage.Rows[iLigne].Selected) {

campagne = dgrvCage[col_campagne, iLigne].Value.ToString();batiment = dgrvCage[col_batiment, iLigne].Value.ToString();cellule = dgrvCage[col_cellule, iLigne].Value.ToString();cage = dgrvCage[col_cage, iLigne].Value.ToString();intra_cage = dgrvCage[col_intra_cage, iLigne].Value.ToString();...

string sql= " select .. from .. where .. order by.. ";string nomTable = "Cage"; if (ora_gen.SQLResult_In_Dataset(ds_gen, sql, nomTable)){ // Afficher les données dgrvCage.DataSource = ds_gen.Tables[nomTable]; Afficher_TitreColonnes(dgrvCage);

- Le dataset ds_gen contient une collection de Tables (1 dataset par forme)

- Travail sur le DataGridView

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DataGridViewPeut être construit en conception :

DataGridViewButtonColumn, DataGridViewCheckBoxColumn, DatGridViewComboBoxColumn, DataGridViewTextBoxColumn

Peut être construit en dynamique

for (int iColonne = 0; iColonne < nb_colonnes; iColonne++){ DataGridViewTextBoxColumn nouvelle_colonne = new DataGridViewTextBoxColumn(); dgrv.Columns.Add(nouvelle_colonne); // Attention j'ajoute 1 pour avoir col1, col2, .. . no_colonne = iColonne + 1; dgrv.Columns[iColonne].Name = "Col" + no_colonne.ToString(); dgrv.Columns[iColonne].HeaderText = "Col" + no_colonne.ToString(); dgrv.Columns[iColonne].Width = 80;}

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private void dgrvMirIJ_CellEnter(object sender, DataGridViewCellEventArgs e) { int col; switch (cbOperation.SelectedIndex) { case 0: //Mirage1 if (dgrvMir1IJ.CurrentCell != null && dgrvMir1IJ.CurrentCell.Value != null) { col=frmMaquette.Chercher_NoColonne_DataGridView_ParSonNom(dgrvMir1IJ,"CD_MIRAGE1"); if (dgrvMir1IJ.CurrentCell.ColumnIndex == col) MIR1IJ_OLD = (string)dgrvMir1IJ.CurrentCell.Value; } break;…private void dgrvMirIJ_CellValidated(object sender, DataGridViewCellEventArgs e){ // valeurs acceptées de 1 à 4 pour le code du 1er mirage int col; switch (cbOperation.SelectedIndex) { case 0: //Mirage1 if (dgrvMir1IJ.CurrentCell != null) { col = frmMaquette.Chercher_NoColonne_DataGridView_ParSonNom(dgrvMir1IJ,"CD_MIRAGE1"); if (dgrvMir1IJ.CurrentCell.ColumnIndex == col) { if (dgrvMir1IJ.CurrentCell.Value != null && int.Parse((string)dgrvMir1IJ.CurrentCell.Value) > 4) dgrvMir1IJ.CurrentCell.Value = MIR1IJ_OLD; } } break;

DataGridView : contrôle sur une colonne

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Merci de votre attention