2016 - LU · 2017. 6. 14. · medicīnas grupa Medicīniskās ģenētikas un mitohondriju...

VALSTS ZINĀTNISKAIS INSTITŪTS

ATVASINĀTA PUBLISKA PERSONA

LATVIJAS BIOMEDICĪNAS PĒTĪJUMU UN STUDIJU

CENTRS

2016.GADA

PUBLISKAIS GADA PĀRSKATS

APSTIPRINU

Direktors

_____________ J.Kloviņš

2017. gada 31. maijā

Rīga 2017

2

SATURS

1. PAMATINFORMĀCIJA ................................................................................... 4

1.1. Juridiskais statuss un struktūra..................................................................... 4

1.2. Galvenās funkcijas un uzdevumi ................................................................. 6

1.3. Galvenie zinātnes virzieni ........................................................................... 6

1.4. Stratēģiskie ilgtermiņa un vidējā termiņa mērķi ........................................... 7

2. ZINĀTNISKĀS DARBĪBAS REZULTĀTI ....................................................... 9

2.1. Īstenotie pētījumu projekti un to rezultāti .................................................... 9

2.1.1. LZP fundamentālie un lietišķie pētījumu projekti .................................. 9

2.1.2. Valsts pētījumu programmas projekti ................................................. 13

2.1.3. Starptautiskie pētniecības un attīstības projekti, tai skaitā nacionālais

līdzfinansējums ................................................................................................. 17

2.1.4. Valsts vai pašvaldības budžeta iestāžu un komersantu pētniecības

projektu līgumdarbi .......................................................................................... 22

2.1.5. Starptautiskie un vietējie pētniecības projektu līgumdarbi .................. 23

2.2. Zinātniskās publikācijas ............................................................................ 23

2.2.1. Zinātniskās publikācijas, kas iekļautas Web of Science vai SCOPUS .. 23

2.2.2. Citas zinātniskās publikācijas ............................................................. 29

2.3. Intelektuālā īpašuma aizsardzība ............................................................... 30

2.3.1. Reģistrētie un uzturētie starptautiskie patenti ..................................... 30

2.3.2. Reģistrētie un uzturētie Latvijas patenti .............................................. 30

2.3.3. Pieteiktie starptautiskie patenti .......................................................... 31

2.3.4. Pieteiktie Latvijas patenti ................................................................... 31

2.4. Dalība konferencēs .................................................................................... 32

2.5. Akadēmisko un kvalifikācijas darbu izstrāde ............................................. 39

2.5.1. Izstrādātie un aizstāvētie promocijas darbi......................................... 39

2.5.2. Izstrādātie un aizstāvētie maģistra darbi ............................................ 39

2.5.3. Izstrādātie un aizstāvētie bakalaura darbi .......................................... 39

2.6. Organizētās konferences, kursi, semināri un vieslektoru uzstāšanās BMC . 40

2.7. Cita institūtam būtiska informācija ............................................................ 40

3. FINANŠU RESURSI UN TO IZLIETOJUMS ................................................. 42

4. PERSONĀLS ................................................................................................... 44

5. ATTĪSTĪBAS PERSPEKTĪVAS 2017.GADĀ ................................................. 45

3

IZMANTOTIE SAĪSINĀJUMI

BBMRI-ERIC – Biobanku un biomolekulāro resursu Eiropas pētniecības

infrastruktūru konsorcijs

BMC – Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs

ERAF – Eiropas Reģionālās attīstības fonds

ES – Eiropas Savienība

ESF – Eiropas Sociālais fonds

ESFRI – Eiropas Pētniecības infrastruktūras attīstības forums

DI – Dārzkopības institūts

DU – Daugavpils Universitāte

LR – Latvijas Republika

LR IZM – Latvijas Republikas Izglītības un zinātnes ministrija

LU – Latvijas Universitāte

LZP – Latvijas Zinātnes padome

MK – Ministru kabinets

OSI – Latvijas Organiskās sintēzes institūts

RSU – Rīgas Stradiņa universitāte

VIGDB – Valsts iedzīvotāju genoma datu bāze

VNPC – Valsts nozīmes pētniecības centrs

VPP – Valsts pētījumu programma

7.IP – 7. ietvara programma

4

1. PAMATINFORMĀCIJA

1.1. Juridiskais statuss un struktūra

Valsts zinātniskais institūts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs

saskaņā ar 2006.gada 28.decembra MK noteikumiem Nr.1076 „Grozījumi Zinātniskās

darbības likumā” un LR IZM 2007.gada 10.janvāra lēmumu Nr.15.1-04/04 Valsts

aģentūra „Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs” kļuva par atvasinātu

publisku personu. BMC ir reģistrēts LR IZM Zinātnisko institūciju reģistrā ar

reģistrācijas Nr.181002 un atrodas LR IZM ministra pārraudzībā. BMC darbība

pamatojas uz Zinātniskās darbības likumu un BMC nolikumu, ar kuru saskaņā BMC

pārvalda zinātnieku koleģiāla institūcija – zinātniskā padome un direktors. Zinātnisko

padomi uz pieciem gadiem ievēlē BMC zinātnieku pilnsapulce, direktoru uz pieciem

gadiem ievēlē zinātniskā padome. Zinātniskās padomes priekšsēdētājs ir Dr.biol.

Andris Zeltiņš un BMC direktors ir Dr.biol. Jānis Kloviņš.

2016.gadā notikušas arī nelielas BMC struktūras izmaiņas, jo saskaņā ar BMC

Zinātniskās padomes 2016.gada 9.marta lēmumu tika izveidots jauns amats - direktora

vietnieka finanšu un administratīvajos jautājumos.

5

1.attēls BMC struktūra no 2016.gada 10.marta

Zinātniskā padome

Direktors

Zinātniskais direktors

Cilvēka ģenētikas un molekulārās medicīnas grupa

Medicīniskās ģenētikas un mitohondriju pētījumu grupa

Molekulārās mikrobioloģijas grupa

Vēža šūnas bioloģijas grupa

Melanomas pētniecības grupa

Vēža biomarķieru un imunoterapijas grupa

Vēža gēnu terapijas grupa

Antibakteriālu un pretvēža līdzekļu atlases grupa

Ar G-proteīnu saistīto receptoru funkcionālās izpētes grupa

Vīrusu hepatīta grupa

Molekulārās virusoloģijas grupa

Strukturālās bioloģijas grupa

Augu virusoloģijas grupa

Rekombinantu proteīnu biotehnoloģijas grupa

Studiju direktors

Servisa centri

Genoma centrs

Rekombinanto biotehnoloģiju servisa centrs

Šūnu kultūru un mikroskopijas servisa centrs

Laboratorijas dzīvnieku servisa centrs

IT un bioinformātikas servisa centrs

Direktora vietnieks finanšu un adminsitratīvajos

jautājumos

Projektu un attīstības daļa

Finanšu un grāmatvedības daļa

Saimnieciskā un tehniskā nodrošinājuma daļa

Iepirkumu un sagādes daļa

Lietvedība

Personāla un darba aizsardzības speciālists

Datorsistēmu un datortīklu administrators

Starptautiskā konsultatīvā padome

6

1.2. Galvenās funkcijas un uzdevumi

BMC savu darbību veic saskaņā ar BMC nolikumu, kurā ir definētas šādas BMC

funkcijas:

zinātniskās darbības īstenošanu molekulārajā bioloģijā, ģenētikā, bioķīmijā,

biomedicīnā, biotehnoloģijā un citās zinātņu nozarēs;

zinātnes un augstākās izglītības integrētas attīstības veicināšanu bioloģijas,

ķīmijas, medicīnas un citās zinātņu nozarēs;

pakalpojumu un līgumpētījumu nodrošināšanu Latvijas un ārvalstu

pasūtītājiem;

valsts un starptautisku pētījumu projektu un pētniecības programmu

sagatavošanu, pieteikšanu un īstenošanu;

priekšlikumu sagatavošanu un sniegšanu valsts prioritāšu veidošanā zinātnē,

augstākajā izglītībā un inovācijās;

zinātniskās ekspertīzes veikšanu un Latvijas interešu pārstāvēšanu

starptautiskajās institūcijās atbilstoši BMC kompetencei;

laboratoriskās diagnostikas pakalpojumu sniegšanu un jaunu diagnostikas

līdzekļu un individualizētas terapijas izstrādi.

Lai īstenotu noteiktās funkcijas, BMC veic šādus uzdevumus:

īsteno fundamentālos un lietišķos pētījumus, kas saistīti ar molekulāro

bioloģiju, ģenētiku, bioķīmiju, biomedicīnu, biotehnoloģiju un citām zinātņu

nozarēm;

iesaistās studiju procesā un nodrošina visu līmeņu studentu apmācību

sadarbībā ar Latvijas un ārvalstu augstskolām;

veicina zinātnisko pētījumu rezultātu praktisku izmantošanu, izstrādājot

jaunas tehnoloģijas un produktus, t.sk. bioloģiski aktīvas vielas,

biotehnoloģijas produktus un medicīniskos diagnostikas līdzekļus.

attīsta sadarbību ar citām zinātniskajām institūcijām, iesaistās organizācijās,

biedrībās un asociācijās;

izstrādā un īsteno programmas un pasākumus zinātniskās kvalifikācijas

celšanai;

organizē zinātniskas konferences, seminārus un lekcijas;

izdod informatīvus materiālus;

veido bioloģisko materiālu kolekcijas (biobankas), kā arī klīniskās un

ģenētiskās informācijas datu bāzes;

uztur un attīsta laboratorisko izmeklējumu metodoloģisko, materiāli tehnisko

bāzi un kvalitātes vadības sistēmas medicīnā un citās nozarēs, veic

laboratoriskās diagnostikas pakalpojumus;

veic citos zinātnisko darbību regulējošajos normatīvajos aktos noteiktos

uzdevumus.

1.3. Galvenie zinātnes virzieni

BMC Attīstības stratēģijā 2015.-2020.gadam ir definēti pieci galvenie

zinātniskie virzieni:

7

cilvēka ģenētika un slimību patoģenēzes mehānismi;

vēža izpēte;

biotehnoloģija un struktūrbioloģija;

molekulārā mikrobioloģija un virusoloģija;

molekulārā farmakoloģija.

Cilvēka ģenētikas un slimību patoģenēzes mehānismu virziens BMC ir relatīvi

jauns izpētes virziens, kurā darbojas trīs zinātniskās grupas, kuru darbības mērķis ir

veikt cilvēku ģenētikas pētījumus, ar slimību patoģenēzi asociēto mehānismu izpēti,

biomarķieru identifikāciju un molekulāri diagnostisko testu izstrādi. Būtiski panākumi

pēdējo gadu laikā ir sasniegti, izveidojot unikālu biobanku, Valsts Iedzīvotāju genoma

datubāzi (VIGDB), kas apkopo vairāk nekā 28 000 dalībniekus no Latvijas populācijas

un pacientus no dažādām slimību kohortām. Šī biobanka ir bijusi galvenais resurss

ģenētisko pētījumu ekspansijai BMC, kā arī bāze inovatīviem un integrētiem

pētījumiem.

Vēža izpēte ir viens no lielākajiem BMC pētījumu virzieniem, kurā pašlaik

darbojas piecas zinātniskās grupas. Šajā jomā BMC cenšas nodrošināt līdzsvaru starp

fundamentālajiem pētījumiem vēža bioloģijā un imunoloģijā, un praktiskas ievirzes

pētījumiem, kuru mērķis ir validēt identificētos potenciālos biomarķierus un zāļu

mērķus klīniskajos paraugos, izstrādāt biomarķieru testus un jaunas terapeitiskās

stratēģijas.

Biotehnoloģijas un struktūrbioloģijas virzienā darbojas četras BMC

zinātniskās grupas, kuras ir iesaistītas vīrusu un vīrusveidīgo daļiņu funkcionālos,

strukturālos un pielietojumpētījumus, kā arī uz struktūras balstīto zāļu dizainā.

Molekulārās biokrobioloģijas un virusoloģijas virzienā darbojas trīs

zinātnieku grupas, kuru darbības mērķis ir medicīniski svarīgu mikroorganismu dažādu

bioloģisko funkciju molekulāro mehānismu izpēte un pētījumu veikšana par RNS

saturošiem bakteriofāgiem, B un C hepatīta vīrusiem, poliomavīrusiem, alfavīrusiem,

augu vīrusiem u.c.

Molekulārās farmakoloģijas virzienā darbojas divas zinātnieku grupas, kuru

darbības mērķis ir veikt pētījumus šūnu receptoru balstītā zāļu mērķu identificēšanā,

veicot to detalizētu raksturojumu, izstrādāt un pielietot jaunu savienojumu bioloģiskās

testēšanas sistēmas, lai atklātu jaunus medikamentus.

1.4. Stratēģiskie ilgtermiņa un vidējā termiņa mērķi

BMC Attīstības stratēģijā 2015.-2020.gadam ir noteikti ilgtermiņa un vidējā

termiņa mērķi BMC pētniecības programmas, institucionālā attīstības plāna,

cilvēkresursu attīstības plāna, infrastruktūras un starpinstitucionālās sadarbības

attīstības plāna, izglītības un publicitātes plāna ietvaros.

Pētniecības programmas ietvaros tiks veikti zinātniski pētnieciskais darbs piecu

zinātnisko virzienu ietvaros, veicinot katra virziena attīstību un rezultativitāti.

Institucionālā attīstības plāna ietvaros plānots strādāt pie BMC:

starptautiskās konkurētspējas paaugstināšanas, veicinot starptautisku

sadarbības projektu skaita pieaugumu;

pasākumiem akadēmiskās integritātes un ētikas normu ievērošanai;

8

zināšanu pārneses un inovāciju procesa pilnveides, veicinot legālo

aspektu konsolidāciju sadarbības projektos un inovāciju kapacitātes

palielināšanu, t.sk. zinātnisko pētījumu rezultātu komerciālizāciju;

institucionālās pārvaldības efektivitātes uzlabošanu.

Cilvēkresursu attīstības plāna ietvaros plānots strādāt pie pasākumiem

cilvēkresursu piesaistei un mobilitātes veicināšanai, atbalstot jaunas zinātniskā

personāla paaudzes veidošanos no piesaistītajiem studentiem un ārvalstu zinātnieku

piesaisti.

Infrastruktūras un starpinstitucionālas sadarbības attīstības plāna ietvaros

plānots strādāt pie:

jau esošo infrastruktūras objektu attīstības, turpinot pētniecības servisu

centru pilnveidi gan attīstot to pārvaldības modeļus, gan cilvēkresursu

profesionālo pilnveidi, kā arī izveidojot atvērtās tipa laboratorijas;

jauno infrastruktūras objektu attīstības atbilstoši Latvijas Viedās

specializācijas prioritātēm, kas sevī ietver gan BMC laboratoriju

telpiskā plānojuma un pārvaldes koncepta izstrādi, gan radioloģijas

laboratoriju kompleksa izveidi, gan personalizētās medicīnas, inovatīvo

terapiju un diagnostikas kompleksa izstrādi;

starpinstitucionālās sadarbības stiprināšanā izveidojot un attīstot

Struktūrbioloģijas centru, personalizētās medicīnas konsorciju un

nacionālo biobankas tīklu, kā arī vienota un koordinēta zinātniskās

infrastruktūras attīstības stratēģijas izveides Latvijā.

Izglītības un publicitātes plāna ietvaros plānots strādāt pie:

BMC integrācijas apmācības procesa organizēšanā augstākās izglītības

iestādēs, veicinot sadarbību ar augstākās izglītības iestādēm gan

bakalaura, gan maģistra, gan doktora studiju programmu izstrādē,

īstenošanā un studējošo praktiskā apmācībā;

Starptautisku kursu un konferenču organizēšanas, kā arī publicitātes gan

vietējā, gan starptautiskā mērogā paplašināšanas.

9

2. ZINĀTNISKĀS DARBĪBAS REZULTĀTI

2.1. Īstenotie pētījumu projekti un to rezultāti

BMC zinātniskās pētniecības darbība ir balstīta gan uz Latvijas, gan

starptautiska mēroga zinātniskās pētniecības projektu īstenošanu. 2016.gadā tika

turpināts īstenot gan 7.ietvara programmas projektus (t.sk. ERA-NET), gan Norvēģijas

finanšu instrumenta projektus, kā arī Latvijas-Lietuvas-Taivānas zinātniskās sadarbības

atbalsta fonda projektus. No vietējā mēroga projektiem turpinājās Valsts pētījuma

programmas īstenošana, Latvijas Zinātnes padomes sadarbības projektu un grantu

īstenošana u.c.

2016.gadā tika sagatavoti un iesniegti arī jauni projekti. Lielākas projektu

iesniegumu skaits tika sagatavots darbības programmas "Izaugsme un nodarbinātība"

1.1.1. specifiskā atbalsta mērķa "Palielināt Latvijas zinātnisko institūciju pētniecisko

un inovatīvo kapacitāti un spēju piesaistīt ārējo finansējumu, ieguldot cilvēkresursos un

infrastruktūrā" 1.1.1.1. pasākuma "Praktiskas ievirzes pētījumi" 1. atlases kārtas

izsludinātajā konkursā – kopumā tika iesniegti 20 projekti kā vadošajam partnerim un

7 projekti kā sadarbības partnerim, no kuriem tika apstiprināti īstenošanai 9 projekti kā

vadošajam partnerim un 1 projekts kā sadarbības partnerim. Kā arī 2016.gada nogalē

tika sagatavoti un iesniegti pieteikumi darbības programmas "Izaugsme un

nodarbinātība" 1.1.1. specifiskā atbalsta mērķa "Palielināt Latvijas zinātnisko

institūciju pētniecisko un inovatīvo kapacitāti un spēju piesaistīt ārējo finansējumu,

ieguldot cilvēkresursos un infrastruktūrā" 1.1.1.2. pasākuma "Pēcdoktorantūras

pētniecības atbalsts" 1.atlases kārtas ietvaros – kopumā tika iesniegti 8 projektu

iesniegumi. Starptautiskos projektu konkursos tika sagatavoti pieteikumi Horizon 2020

izsludinātajos konkursos – gan pamatprogrammā, gan apakšprogrammās.

2.1.1. LZP fundamentālie un lietišķie pētījumu projekti

1. LZP Sadarbības projekts Nr. 593/2014 „Jaunu aģentu izstrāde pretvēža un

antimikrobiālai terapijai”

Vadošais partneris – OSI

Apakšprojekta vadītājs BMC - vadošais pētnieks Dr.biol. A.Leončiks

Īstenošanas laiks – 2014.-2017.gads

Projekta ietvaros ir izanalizēts liels skaits jaunsintezētu savienojumu ar potenciālu

pretvēža aktivitāti, lai noskaidrotu to metaloproteināžu inhibīcijas spējas un

selektivitāti. Pārbaudītās vielas un no tām atlasītie kandidāti ir sintezēti no ļoti dažādām

savienojumu grupām (kumarīni, aziridīnu-azolu un azetidīnu-azolu konjugāti,

pirolidīn-2-ona atvasinājumi u.c.), kuras ir tikušas specifiski selektētas izmantojot

struktūras-aktivitātes pētījumus. Jaunsintezētie savienojumi ar potenciālo pretvēža

aktivitāti tiek tālāk testēti OSI un LU, lai noskaidrotu to antimikrobiālo un citotoksisko

efektu, kā arī lai strukturāli uzlabotu specifiskās pretvēža īpašības.

2. LZP Sadarbības projekts Nr.625/2014 „Vēža eksosomas – jauns avots

gastrointestinālo audzēju biomarķieru un terapeitisko mērķu identificēšanai”

Projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol.A.Linē


10

Šajā gadā galvenā uzmanība tika vērsta uz hipoksijas ietekmes izpēti. Iegūtie

rezultāti parādīja, ka daļā, bet ne visās, vēža šūnu līnijās hipoksija stimulē EV

produkciju HIF1 atkarīgā veidā. Hipoksiskās EVs tiek uzņemtas citās vēža šūnās un

tās stimulē vēža šūnu migrāciju. Meklējot EV virsmas marķierus, ar kuru palīdzību

varētu izolēt hipoksiskās EVs no pacientu plazmas, tika parādīts, ka uz vēža šūnu līniju

producēto EV virsmas ir prezentēta CAIX. Turklāt, tās daudzums pieaug hipoksijas

apstākļos. COST akcijas ME-HAD ietvaros Dr. Ābols viesojās Prof. Pia Siljander

laboratorijā Helsinku Universitātē, kur veica CAIX-pozitīvo EV analīzi CRC un krūts

vēža pacientu plazmā. Pašlaik notiek iegūto rezultātu analīze.

3. LZP Sadarbības projekts Nr.651/2014 „Cilvēka hemokīnu receptoru CCR1

un CCR2, kā potenciālu B-šūnu malignitātes progresijas diagnostisko

marķieru, izpēte”

Vadošais partneris – RSU

Apakšprojekta vadītājs BMC - vadošais pētnieks Dr.biol. A.Leončiks


Projekta ietvaros ir analizēti selektīvi izvēlētu RNS aptamēru vēža šūnu

dzīvotspējas un proliferācijas specifiskie bloķējošie efekti dažādās B un T šūnu līnijās

izmantojot MTT šūnu proliferācijas testu. Tāpat ir pārbaudīti “no piestiprināšanās

neatkarīgās augšanas” aptamēru bloķējošie efekti izmantojot soft agar augšanas testu.

Visa projekta ietvaros tiek pētīta hemokīnu receptoru ekspresijas intensitāte dažādām

augsti malignu B-šūnu limfomām un neagresīvām HLL leikēmiskām šūnām, lai

noskaidrotu šo receptoru ekspresijas bioloģiju kā potenciālo ļaundabīgo audzēju

progresijas prognostisko marķieru nozīmību pacientiem ar B-šūnu neoplāzijām.

4. LZP Sadarbības projekts Nr.672/2014 „Pētnieciskie un tehnoloģiskie

risinājumi ilgtspējīgai smiltsērkšķu audzēšanai un pilnvērtīgai izmantošanai”

Vadošais partneris – DI

Apakšprojekta vadītājs BMC - vadošais pētnieks Dr.biol. Z.Zeltiņš


2016. gadā tika veiktas divu potenciāli inficētu smiltsērkšķu paraugu jaunās

paaudzes sekvenču transkriptomas analīzes. Izmantojot Ion Torrent iekārtu, kopsummā

tika iegūti 706754 un 470872 sekvenču nolasījumi (“read”, vidējais garums – ap 180

nt). Sekvenču datoranalīze uzrādīja vairākas potenciālās vīrusu sekvences, tajā skaitā

augu vīrusu izcelsmes. Papildus tika veiktas manuālas analīzes, izmantojot “blastn”

programmu. Automātiski identificētās vīrusu sekvences izrādījās pārsvarā dažādas

smiltsērkšķu RNS sekvences, ar izteiktu ribosomālo RNS dominanci atlasītajos

sekvenču nolasījumos. Tālākajos eksperimentos tiks optimizēta smiltsērkšķu

transkriptomas iegūšana, īpašu uzmanību pievēršot rRNS aizvākšanai no

analizējamajiem paraugiem.

5. LZP grants Nr.233/2012 „Plazmas membrānas Ca 2+ ATPāzes 4 loma vīriešu

neauglības funkcionālā diagnostikā”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.med. J.Ērenpreiss


2016.gadā sasniegtie rezultāti:

11

Tika iegūti 200 paraugi no Genoma datus bāzes no auglīgiem Latvijas vīriešiem

(kam ir 4 un vairāk bērni). Minētā mutācija tika konstatēta 5% auglīgu Latvijas

vīriešu, kas ir līdzīgs izplatības biežums, salīdzinot ar 5.8% neauglīgu Igaunijas

vīriešu. Līdz ar to tika konstatēts, ka atrastai PMCA4 gēna mutācijai nav

saistības ar vīriešu auglības funkciju. Iespējams, mutācijas zemā izplatība

jauniem Latvijas vīriešiem ar labu spermatozoīdu kustīgumu (1.1%), salīdzinot

ar 4.2% izplatību vispārējā latviešu populācijā, un 5.8% izplatību starp

neauglīgiem Igaunijas vīriešiem ar pazeminātu spermatozoīdu kustīgumu, ir gan

nejauša atrade (analizēto grupu apjoms – ap 200 katrā grupā), gan parāda ne-

lineāru saistību starp spermatozoīdu kustīgumu, auglības funkciju, kur vēl kā

papildus faktors ņemams vērā etniskais faktors, jo populāciju analīze parāda, ka

šī mutācija visbiežāk ir sastopama (ir radusies) Igaunijā, no kurienes tika iegūta

neauglīgo pacientu izpētes grupa.

Tika analizēta minētā mutācija 52 slovēņu paraugiem no vīriešiem no

neauglīgiem pāriem, un konstatēta 3.8%.

Tika noteikts ATF līmenis 15 neauglīgu pacientu ar samazinātu spermatozoīdu

kustīgumu, un 13 spermas donoru spermas paraugos. Šobrīd iegūtie grupām.

Iegūtie dati par PMCA4 mutāciju šķiet interesanti vairāk no populāciju

ģenētikas viedokļa (nevis saistības ar vīriešu neauglību viedokļa, jo tāda

pārliecinoši konstatēta netika), jo tie norāda uz nesen parādījušos jaunu mutāciju

Baltijas reģionā, kas ir izplatījusies uz apkārtējiem pieguļošiem reģioniem

(Krievija, Baltkrievija, Somija, Slovēnija), bet pēc 1000 Genomu datu bāzes

datiem nav konstatēta nekur citur pasaulē.

6. LZP grants Nr.341/2012 „Pašatjaunošanās un novecošanās regulācija pēc

DNS bojājumu audzēju šūnās”

Projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.habil.med. J.Ērenpreisa


Tika analizēts 2015.-2016.gada klīniskais materiāls, lai noskaidrotu

pašatjaunošanos un novecošanos attiecības rezistentā pret neoadjuvantu terapiju krūts

vēzī. In vito petījumos izmantojot vēža cilmes šūnu modeļi ar mērķi atrast mehānismu

neatgriezeniskai novecošanai, kas pārvar rezistenci pret genotoksisku terapiju, lielākā

uzmanība tika veltīta kodoliņa agresomām, pozitīvi saistītām ar autofāgiju, un to

saistībai ar hromatīna izeju no šūnu kodoliem, to sastāvu un izdalīšanas mehānismiem.

Tika veikti arī eksperimenti hromatīna topoloģijas pētījumiem, skaidrojot kodoliņa un

heterohromatīna pericentrisko domēnu strukturālas un funkcionālās attiecības normālā

un vēža šūnu bojāejā pēc genotoksiskas terapijas. Ar domu atrast c-myc atkarīgus

transckriptoma mērķus normala poliploidijā, tika pētīti publicēti transkriptomu dati, ka

arī paveikti eksperimenti c-myc proteinu noteikšanai poliploīdās peles hepatocītos,

cilvēka kardiomiocitos un decidua šūnās.

7. LZP grants Nr.343/2012 „2.tipa cukura diabēta attīstības dažādu patogēno

mehānismu identifikācija ar pacientam specifisku šūnu modeļu palīdzību”

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.med.V.Pīrāgs


12

2016.gadā tika turpināta adipozo audu paraugu ievākšana no 2.tipa diabēta un

insulīna rezistentiem pacientiem kā arī veseliem cilvēkiem. Kopsummā iegūti 21

paraugi un lielākai daļai ir izveidotas pacientu specifiskās adipozo audu cilmes šūnu

(ADSC) kultūras, kuras izmantotas insulīna rezistences modeļu pētījumiem un

diferenciācijai par insulīnu producējošām šūnām. Preliminārie dati no viena pacienta

adipocītu transkriptoma sekvencēšanas analīzes uzrādīja šūnas virsmas proteoglikāna-

glipikāna 4, WNT5a un ar tiem saistīto molekulu ekspresijas izmaiņas insulīna

rezistentajos apstākļos kā arī pretdiabēta ligandu klātbūtnē. Gēni, kas uzrādīja statistiski

ticamu atšķirību ekspresijas līmenī tika validēti izmantojot reālā laika PCR diabēta

pacientu (n=5), insulīna rezistento pacientu (n=3) un kontroles (n=2) ADSC šūnās.

Validēšanas dati apstiprina pazeminātu glipikāna 4 ekspresiju un paaugstinātu WNT5a

un tā signāla pārnesē iesaistīto molekulu (RYK, MAPK) gēnu ekspresiju insulīna

rezistences apstākļos. Turklāt glipikāna 4 ekspresija tiek paaugstināta, bet WNT5a

ekspresija tiek normalizēta pretdiabēta ligandu - tiazolidīndeonu klātbūtnē. Iespējams,

ka glipikāns 4 var modulēt insulīna jūtību samazinot iekaisuma reakciju caur WNT5a

signālu pārnesi un ir saistīts ar diabēta terapijas medikamentu terapeitiskajiem

efektiem. Paralēli turpinājās darbs pie iegūto ADSC šūnu diferenciācijas par insulīnu

producējošām šūnām. Diferenciācijas protokoli ar dažādām barotnes un

ķīmisko/hormonālo savienojumu, kas piedalās beta-šūnu attīstībā un nobriešanā,

kombinācijām tika izmēģināti uz 6 ADSC šūnu līnijām. Divām šūnu līnijām vizuāli tika

novēroti ditizona pozitīvie sakopojumi. Tomēr gēnu ekspresijas analīze neuzrādīja

būtisku beta- šūnu transkripciju.

8. LZP grants Nr.364/2012 „Melanokortīnu receptoru un to palīgproteīnu

molekulārā struktūra”

Projekta vadītājs – pētnieks Dr.biol.D.Fridmanis


Projekta iepriekšējos posmos tika radītas vairākas rekombinantu ACTHR

ekspresējošas P.pastoris GS115 celma līnijas, neviena no kurām neekspresēja

rekombinanto proteīnu pietiekamā daudzumā. Tādēļ iepriekšējā posma noslēgumā tika

radīts ACTHR ekspresijas konstrukts, kura aminoskābju secību kodējošie kodoni tika

optimizēti, lai atbilstu P. pastoris ekspresijas sistēmā pieejamajiem t-RNS. Šī

ekspresijas sistēmas modifikācijas stratēģija tiek sekmīgi un samērā plaši pielietots

dažāda tipa proteīnu ekspresijā. Saskaņā ar iepriekš minēto šī gada laikā veiktās

aktivitātes pārsvarā bija saistītas ar jaunizveidotā ekspresijas konstrukta darbības

efektivitātes novērtēšanu. Tā kā iepriekšējos projekta posmos tika secināts, ka P.

pastoris SMD1168 celms ir ievērojami efektīvāka rekombinanto proteīnu ekspresijas

sistēma, tad tā tika pielietota arī šajos eksperimentos. Līdzīgi, kā visos iepriekšējos

eksperimentos arī šajā gadījumā pēc ekspresijas klonu atlases tika veikti ACTHR

lielapjoma ekspresijas un proteīna attīrīšanas eksperimenti, kuriem sekoja SDS -

poliakrilamīda gela elektroforēzes un Western blot analīzes. Šajos eksperimentos

iegūtie rezultāti neuzrādīja būtisku ekspresijas efektivitātes pieaugumu salīdzinājumā

ar ekspresijas konstruktu, kas tika balstīts uz savvaļas tipa ACTHR kodējošo sekvenci,

tādejādi arī šajā gadījumā pēc attīrīšanas iegūtā proteīna daudzums vēl ar vien nebija

pietiekams, lai veiktu tā kristalizāciju. Tādēļ projekta posma noslēgumā tika veikta

padziļināta pieejamās literatūras analīze, kuras rezultātā tapa apskata raksts “ACTH

receptor (MC2R) specificity: what do we know about underlying molecular

13

mechanisms?”, kā arī tika gūtas atziņas par rekombinantā ACTHR kodējošās sekvences

modifikācijām kuras nākotnē varētu uzlabot proteīna ekspresijas efektivitāti (piemēram

T4Lyz novietojums un modifikācija).

9. LZP grants Nr.387/2012 „Hepatīta B core daļiņu funkcionālā uzbūve: stabila

ekspresija eikariotu šūnu līnijās, attīrīšana, strukturālās īpatnības un

imunoloģiska izvērtēšana”

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.habil.biol. T.Kozlovska


Ir iegūti izšķiroši rezultāti eikariotiskā HBc kultivēšanā un izdalīšanā un

sagatavots materiāls eikariotiskā HBc izsmeļošai strukturālai raksturošanai. Pirmo reizi

pasaules praksē eikariotiskais HBc ir izdalīts tādā kvalitātē un daudzumā, lai ar to

varētu veikt strukturālus pētījumus. Pirmo reizi ir izdalīti divi eikariotiskā HBc veidi:

no HBc-producējošam cilvēka un kāmja šūnām, kuru salīdzināšanai ir būtiska nozīme

eikariotiskā HBc oriģinālās struktūras noskaidrošanai, pirmām kārtām, vēl joprojām

nezināmās N-gala struktūras noteikšanai. Ir atstrādāti optimāli un reproducējami

cilvēka un kāmja šūnu kultivēšanas apstākļi, ar tādu HBc saturu, lai tas būtu pietiekams

efektīvai eikariotiskā HBc attīrīšanai vīrusiem līdzīgo daļiņu (VLD) veidā. Izstrādāts

optimāls, efektīvs un reproducējams eikariotiskā HBc attīrīšanas protokols - abiem

eikariotisko šūnu-producentu veidiem. Uzsākts darbs pie eikariotiskā HBc

enzimātiskās šķelšanas. Šim nolūkam atstrādāti tādas enzimātiskās šķelšanas modeļi ar

diviem rekombinantā HBc paraugiem, kas iegūti no baktērijām Escherichia coli un no

rauga Pichia pastoris. Iegūti pirmie rezultāti, kas apstiprina sagaidāmās molekulārās

masas N-gala peptīda izveidošanos.

10. LZP grants Nr.532/2012 „ARF ietekme uz HCV core pamata izveidoto

ģenētisko vakcīnu imunoloģiskām īpašībām”

Projekta vadītāja – vadošā pētniece Dr.biol. I.Sominska


Tika uzkonstruētas uzlabotas HCV core un ARFP ekspresijas plazmīdas

imunizācijas eksperimentiem. Tika iegūti attīrīto eikariotu ekspresijas plazmīdu DNS

preparāti imunizācijas eksperimentiem nepieciešamā kvalitātē un daudzumā.

Laboratorijas dzīvnieki tika imunizēti ar HCV core un ARFP ekspresējošām

plazmīdām, pielietojot elektroporācijas protokolu. Paralēli tika veikta laboratorijas

dzīvnieku imunizācija ar HCV core un ARFP rekombinantiem baktērijās ekspresētiem

un attīrītiem proteīniem, lai salīdzinātu rekombinanto proteīnu un attiecīgo proteīnu

ekspresējošo DNS konstrukciju imunogenitāti. Imunizētiem laboratorijas dzīvniekiem

tika novērtēta imūnatbilde pret HCV core un ARFP antigēniem – peptīdiem un

proteīniem. Izanalizējot datus tika izvelētas konstrukcijas kas var tikt izmatotas kā

vakcīnu prototipi. Iegūtie dati tika izmantoti zinātniskās publikācijas sagatavošanai.

2.1.2. Valsts pētījumu programmas projekti

VPP 2014.-2017.gada 3.posma programmas „Biomedicīna sabiedrības

veselībai (BIOMEDICINE)” (programmas vadītājs - Dr.med. V.Pīrāgs) projekti.

14

1. Projekts Nr.2 „Diabēta un kardiovaskulāro komplikāciju molekulārie

mehānismi, farmakoģenētika un jauni ārstniecības līdzekļi”

Projekta vadītājs - Dr.chem. I.Kalviņš (OSI)

Apakšprojekts Nr.2.1., apakšprojekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. K.Tārs


2016. gadā ir uzproducēti tipisku mikrobiotas pārstāvju Klebsiella pneumoniae,

Providencia rettgeri un Eschericia coli CntA un CntB proteīni. Izveidota vienkāršota

CntA aktivitātes testēšanas sistēma bez aktivējošā enzīma CntB klātbūtnes, izmantojot

reducējošo aģentu nātrija ditionītu. Noskaidrots, ka, pretēji dažos literatūras avotos

aprakstītajam, CntA enzīmi nemetabolizē holīnu. Visiem 3 CntA enzīmiem izmēģināti

vairāk kā 10000 kristalizēšanas apstākļi. Kristāli iegūti P. rettegri CntA enzīmam, no

kuriem savākti 3.2 Å izšķirtspējas dati.

Apakšprojekts Nr.2.8., apakšprojekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol.

J.Kloviņš


Valsts pētījumu programmas ietvaros tika turpināta 2.tipa cukura diabēta

ārstēšanā plaši lietotā medikamenta metformīna efektivitāti nosakošo faktoru izpēte.

Septembrī Eiropas endokrinoloģijas žurnālā (L.Zaharenko et al., European Journal of

Endocrinology, 2016 Sep 8.) tika publicēts raksts, kas apkopo metformīna

farmakoģenētikas pētījumos iegūtos rezultātus. Īsumā, metformīna transportieru gēnu

rajonus reprezentējošo 102 viena nukleotīda polimorfismu (SNP) marķieru asociācijas

analīzē tika parādīts, ka organisko katjonu transportiera 2 gēna lokusā esošie rs3119309

un rs7757336, kā arī organisko katjonu transportiera 3 gēna rajonā lokalizētais

rs2481030 varētu būt marķieri metformīna terapijas neefektivitātei. Pētījuma farmako-

kinētikajā daļā tika apstiprināts, ka rs2481030 marķieris asociējas ar pazeminātu

metformīna uzņemšanu.

2. Projekts Nr.3. „Jaunu pretvēža zāļu un imunoterapijas līdzekļu izstrāde”

Projekta vadītāja - vadošā pētniece Dr.biol. A.Linē

Apakšprojekts Nr.3.6., apakšprojekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. A.Linē


Valsts pētījumu programmas ietvaros tika turpināts darbs pie ogļskābes

anhidrāzes IX (CAIX) funkciju izpētes krūts vēža šūnās. Lai noskaidrotu mehānismu,

ar kura palīdzību CAIX inhibīcija ietekmē krūts vēža šūnu adaptāciju hipoksijas

apstākļiem, tika veikta gēnu ekspresijas profilēšana 3 krūts vēža šūnu līnijās, kurās ar

shRNS nomākta CAIX ekspresija. Iegūtie rezultāti parādīja, ka CAIX ietekme uz

hipoksijas atbildi transkripcijas līmenī ir salīdzinoši neliela. Tomēr katrā šūnu līnijā tika

atrasti vairāki gēni, kuru ekspresija ir atkarīga no CAIX. MDA-MB-231 šūnās CAIX

nomākšana pilnībā bloķēja Stanniokalcīna-1 (STC1) indukciju hipoksijas apstākļos.

Turklāt, šāds pat efekts tika novērts farmakoloģiski inhibējot CA ar acetazolamīdu, kas

parada, ka šis regulācijas mehānisms ir saistīts ar CA enzimātisko aktivitāti. STC1 ir

sekretēts glikoproteīns, kas veicina krūts vēža šūnu invazivitāti un audzēja progresiju.

Šie rezultāti vismaz daļēji izskaidro to, kādēļ CAIX inhibīcija samazina invazivitāti un

15

sfēru veidošanas potenciālu MDA-MB-231 šūnās, ko mēs parādījām iepriekšējos

pētījumos. Par šo tēmu ir sagatavota publikācija.

Apakšprojekts Nr.3.7., apakšprojekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol.

D.Pjanova


2016. gadā tika vērtēta atsevišķu dsRNS inducēto citokīnu iespējamā

mijiedarbība. Ar ELISA metodes palīdzību tika noteikta divu antagonistu, IL-10 un

IFN- indukcija. Diemžēl cerēto IFN- produkcijas samazināšanos, pieaugot IL-10

koncentrācijai, nenovērojām. Tāpat ELISA metode tika izmantota, lai apstiprinātu

augsto MIP-1 produkciju un IL-16 supresiju. MIP-1 augstā indukcija apstiprinajās,

kas ir kontekstā ar dsRNS antivirālo darbību, savukārt, IL-16 supresija neapstiprinājās

un varēja novērot ļoti lielas atškirības starp indivīdiem. Darbs pie individuālo reakciju

analīzes vēl turpinās. Dubultspiralizētās dsRNS ietekmes analīzei uz audzēja šūnām

tika izmantotas 13 dažādas audzēju šūnu līnijas (melanomas - FM3, FM9, FM55,

FM94, SkMel28, LVC5, krūts audzēji - SkBr3, MCF7, olnīcu audzējs – SKOV-3,

dzemdes kakla audzējs – HeLa, aizkuņģa dziedzera audzējs – HPAF-II, kuņģa audzējs

– AGS, rabdomiosarkoma – RD), un analizēta audzēju šūnu mitotiskā aktivitāte pēc to

tiešas apstrādes ar dsRNS. Statistiski ticamas atšķirības tika novērotas divu šūnu līniju

gadījumos (SKOV-3 un HPAF-II), tāpēc dsRNS netiešās ietekmes analīzei tika izvēlēta

HPAF-II šūnu līnija, kur audzēja šūnu mitotiskā aktivitāte tika noteikta pēc to apstrādes

ar limfocītiem, kas iepriekš bija kontaktā ar dsRNS. Aktivēto limfocītu ietekme uz

audzēja šunām bija atšķirīga un variēja starp donoriem, kas vēlreiz parāda, ka dsRNS

ietekme ir stipri personalizēta.

Apakšprojekts Nr.3.8., apakšprojekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol.

A.Leončiks


Projekta ietvaros ir veiktas inhibitorās aktivitātes pārbaudes 36 jaunsintezētiem

selenofēna-kumarīna savienojumiem, izmantojot vielu fluorimetrisku FRET skrīningu,

kā arī papildus vielu kolorimetrisku skrīningu. Skrīninga rezultātā atlasīti tālākiem

pētījumiem savienojumi ar selektīvu MMP2 un MMP14 matriksa metaloproteināžu

inhibitoro aktivitāti. Labākajiem atlasītajiem MMP inhibitoru kandidātiem veikta

citotoksiskuma analīze uz 8 šūnu līnijām, pavisam analizēti 10 perspektīvākie

savienojumi.

Apakšprojekts Nr.3.9., apakšprojekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.habil.biol.

T.Kozlovska


Šajā posma tika pētīta jaunu OSI sintezētu HBV kapsīda veidošanās inhibitora

BAY 41-4109 analogu efektivitāte zīdītāju šūnās. Šajā darbā HBV kapsīdas proteīna

(HBc) sintēze BHK-21 šūnās tika nodrošināta, izmantojot rekombinantu alfavīrusa

replikonu. Ir pārbaudīta Bay-41-4109 un tā analogu citotoksicitāte šūnās, izvērtējot

šūnu morfoloģiju un aktivitāti ar MTT testu. Tika pieradīts, ka trīs Bay-41-4109

analogi -V4-84-s, V4-92, V4-93- salīdzinot ar Bay-41-4109 ir mazāk toksiski BHK-21

šūnās. Salīdzinot ar kontroles šūnām, vismazākā citotoksicitāte ir novērota V4-92 un

16

V4-93, kas satur lipofilākus aizvietotājus 5.pozīcijā. Noteikts, ka šūnu dzīvotspēja pie

25μM inhibitoru koncentrācijas sastādīja attiecīgi 80% un 83%. Optimizētas kapsīdu

un HBc noteikšanas metodes BHK-21 šūnās, pēc to infekcijas ar rekombinanto

SFV1/HBc alfavīrusu: neskatoties uz ELISA metodes jūtīgumu, ar komerciālo HBeAg

ELISA nevar novērtēt kapsīdu veidošanās inhibitoru devas ietekmi uz veidoto kapsīdu

daudzumu šūnās; Natīvas agarozes gēla elektroforēzes un imunoblota metode ir ļoti

jūtīga, tā ļauj noteikt līdz pat 10 ng HBV kapsīdu paraugā. Ar natīvas agarozes un

Western blot metodēm ir parādīta BAY 41-4109 kapsīdu savākšanās inhibīcija no devas

atkarīgā manierē. Salīdzinot ar oriģinālo BAY 41-4109 inhibitoru, neviens no trīs

analizētājiem analogiem nav pietiekami efektīvs, lai uzrādītu būtisku HBc produkcijas

samazināšanos SFV1/HBc inficētās šūnās. Inhibitors V4-93 inducē ar natīvās agarozes

gēla elektroforēzes imunoblota metodi detektējamu HBc agregātu veidošanos, kuru

identificēšanai un ietekmei uz vīrusa replikāciju ir nepieciešami tālāki pētījumi.

Apakšprojekts Nr.3.10., apakšprojekta vadītājs - vadošā pētniece

D.biol.A.Zajakina


Šī darba posma mērķis bija izpētīt dažādas gēnu piegādes stratēģijas peļu

audzēju modeļos, izmantojot rekombinantos alfavīrusu vektorus un nevirālās gēnu

piegādes sistēmas. Īpaša uzmanība tika pievērsta rekombinanto vīrusu daļiņu un vīrusa

RNS/liposomālo savienojumu pielietošanai, kā arī alfavīrusu onkotropisma

raksturošanai dažādos audzēju modeļos.

Luciferāzes gēnu kodējošais Semliki meža vīruss (SFV/Luc vīrusa daļiņas) un

šī vīrusa RNS genoma lipopleksi (SFV/Luc RNS molekula) tika izmantoti

bioizplatīšanas pētījumos peļu vēža modeļos: peļu krūts vēzis (Balb/c 4T1 un TS/A)

un peļu melanoma (C57BL/6 B16). Vīrusa RNS genoma lipopleksi, kas tika izvēlēti

3.5. aktivitātes rezultātā, tika pielietoti in vivo vēža modeļos, paralēli salīdzinot tos ar

vīrusu daļiņām un neiepakotām, brīvām RNS molekulām. Šajā posmā mēs parādījām

SFV/Luc vīrusa daļiņu dominējošu lokalizāciju audzējos pie optimizētas vīrusa devas

un sistēmiskas vīrusa ievadīšanas (i.v. un i.p.) gan krūts vēža, gan melanomas modeļos.

Interesanti, ka vīrusa devas palielināšana noved pie vīrusa plašākas izplatīšanās

organismā ar maksimālo ekspresiju sirdī un plaušās. Tāpat tika izpētīts SFV RNS gēnu

piegādes potenciāls. Tomēr, neskatoties uz labiem RNS transfekcijas rezultātiem ar

SFV/Luc RNS un 1,3-dihidropiridīna atvasinājumu kompleksiem vēža šūnu kultūrās in

vitro, kas nodrošināja 40-60% transfekcijas efektivitātes (FACS rezultāti), ne

intravenozās, ne intratumorālās RNS/lipopleksu injekcijas nenodrošināja augstāku

transgēna ekspresiju audzējos, salīdzinot ar brīvo RNS intratumorālo injekciju un

vīrusa daļiņu intratumorālo un sistēmisko ievadīšanu. Mēs secinājām, ka EPR efekts

(enhanced permeability and retention effect, paaugstinātā caurlaidība un aizturēšanas

efekts) nespēj nodrošināt liposomālo daļiņu intratumorālo lokalizāciju un augstāku

transgēna ekspresiju. Citi faktori, tādi kā liposomālo daļiņu izmērs (vidēji 120 nm –

Zetasizer Nano), daļiņu internalizācija šūnās 3D apstākļos in vivo (entry), RNS

endosomāla atbrīvošanās šūnās (RNA release), pret daļiņu iedzimtā imūnatbilde (innate

immune response), var ietekmēt piegādes efektivitāti.

17

3. Projekts Nr.7. „Inovatīvu infekcijas procesa regulācijas un modulācijas

stratēģiju izveide”

Projekta vadītāja – Dr.med.M.Murovska (RSU)

Apakšprojekts Nr.7.3., apakšprojekta vadītājs - vadošā pētniece Dr.biol. R.Ranka


Tuberkulozes izraisītāja molekulārie pētījumi veikti sadarbībā ar RAKUS un

RSU speciālistiem, kā arī balstoties uz agrāk iegūtām zināšanām par M. tuberculosis

genomu un TB sublīniju izplatību Latvijā. Veikta M. tuberculosis klīnisko paraugu

genotipēšana ar konvencionālām metodēm un iegūto datu analīze. Šie rezultāti sniedza

svarīgu informāciju par M. tuberculosis celmu izplatību Latvijā. Īpaši tika padziļināti

pētīti daži, mūsuprāt, potenciāli bīstami genotipi. M. tuberculosis LAM apakšlīnijas

konvencionālā genotipēšana un filoģeogrāfiski pētījumi sadarbībā ar Prof. I.

Mokrousovu (Krievija) apstiprināja Latvijā izolēto tuberkulozes paraugu ģenētisko

radniecību ar Ziemeļaustrumu Eirāzijas reģiona TB izolātiem. Iegūtie rezultāti liecina

par iespējamo LAM ģimenes izcelšanos Rietumu Vidusjūras reģionā, un norāda, ka

cilvēku masu migrācija varētu būt galvenais faktors kas ietekmēja šīs līnijas

izplatīšanos. Ir sagatavots un nopublicēts zinātnisks raksts starptautiski citējamā

izdevumā (Mokrousov et al., 2016). Turpināta Latvijā atrasto TB mikroepidēmiju

uzraudzība. Veikta 16 mikroepidēmiju analīze, iegūtie rezultāti ir prezentēti

Starptautiskās konferencēs.

Nolūkā atrast iespējamās atšķirības LAM klanu virulencē ir atlasīti vairāki DNS

paraugi, kuriem ir veikta visa genoma sekvenēšanai ar jaunās paaudzes tehnoloģiju.

Rezultāti ir prezentēti starptautiskā konferencē.

Ir turpināta M. tuberculosis monitoringa iespēju analīze un praksē lietojamās

shēmas izveide. Veikta konvencionālo genotipēšanas metožu (IS6110 RFLP,

spoligotipēšana un MIRU-VNTR) izšķirtspējas izvērtēšana un analīze gan katrai

metodei atsevišķi, gan 2 metožu kombinācijām ar nolūku izvērtēt to noderīgumu TB

transmisiju izsekošanai. Veikti teorētiski aprēķini par MIRU-VNTR datu iespējamu

homoplāziju. Homoplāzijas lielā varbūtība, uz ko norāda M. avium simulēto populāciju

matemātiskā modelēšana, liecina ka līdzīgu MIRU-VNRT profilu izolātu radniecība

pat relatīvi nelielu ģeogrāfisku attālumu gadījumos ir jāizvērtē piesardzīgi. Šie rezultāti

ir publicēti starptautiski citējamā žurnālā (Kalvisa et al, 2016).

2.1.3. Starptautiskie pētniecības un attīstības projekti, tai skaitā nacionālais

līdzfinansējums

1. 7.IP Nr.313010 „BBMRI-Large Prospective Cohorts” (BBMRI-LPC),

sadarbības projekts

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. J.Kloviņš

Īstenošanas laiks – 2013.gada 1.februāris – 2017.gada 31.oktobris

Šajā projekta realizācijas periodā turpināts uzsāktais darbs pie biobanku resursu

apzināšanas, veicot anketēšanu, kā rezultātā atjaunināti sākotnējie dati par Latvijas

biobanku tīklā esošajām un iesaistāmajām organizācijām. Veikta arī starptautisku

biobanku kursu organizēšana un vadīšana. Šo kursu laikā astoņi dalībnieki no Ukrainas,

18

Lietuvas, Polijas, Gruzijas, Portugāles apguvuši dažādas praktiskas iemaņas bioloģisko

kolekciju veidošanā un uzturēšanā, kā arī tālākajā izmantošanā pētniecība.

2. 7.IP Nr.602437 „Development of a universal influenza vaccine based on

tandem core technology” (FLUTCORE), sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošais pētnieks Dr.biol. A.Kazāks

Īstenošanas laiks – 2013.gada 1.septembris-2017.gada 31.marts

Projekta mērķis ir uzkonstruēt universālas pretgripas vakcīnas kandidāta

prototipu.

Projektā ir uzkonstruēti un producēti vairāki hepatīta B tandēm-kor-antigēna (t-

HBCAg) varianti ar ģenētiski izveidotiem insertiem no gripas vīrusa hemaglutinīna

stiebra rajona un M2 proteīna konservatīviem fragmentiem. Izveidotajiem

konstruktiem ir konstatēta protekcija peļu modeļos, bet iegūtās vīrusveidīgās daļiņas ir

ļoti nestabilas un grūti attīrāmas.

Ņemot vērā faktu, ka (1) hemaglutinīna stiebra rajons, sapludināts ar t-HBCAg

nespēj izveidot natīvo trimērisko struktūru un (2) uz HBCAg bāzētām vakcīnām ir

paredzamas nopietnas problēmas FDA atļauju iegūšanai lietošnā cilvēkiem, mēs esam

izstrādājuši alternatīvu, nesen apstiprināto ERAF projektu. Jaunajā projektā vakcīnas

konstruēšanai ir paredzēts izmantot RNS fāgu VVD un HA stiebra fragmentu natīvajā,

trimēriskjā konformācijā.

3. Latvijas-Lietuvas-Taivānas zinātniskās sadarbības atbalsta fonda projekts

„Mitohondriālo slimību funkcionālā modeļa izveide un biomarķieru atlase”,


Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. I.Iņaškina

Īstenošanas ilgums – 2016.gada 1.janvāris-2017.gada 30.novembris (2.posms)

Turpinājām apzināt un iesaistīt projektā slimniekus ar aizdomām par

mitohondriālajām saslimšanām. 2016. gadā projektā tika iesaistīti 22 jauni pacienti un

viņiem veikta mtDNS analīze. Trim pacientiem ir atrastas nezināmas nozīmes, iepriekš

neaprakstītas mtDNS mutācijas. Kopiju skaita analīze atklāja ievērojamas mt kopiju

skaita palielināšanas 12 pacientiem. Laboratorijas praksē tika ieviesta metode

OXPHOS proteīnu kompleksu aktivitātes (I, II, III, IV, V, I+III, II+III) noteikšanai

asins perifērajos limfocītos, izmantojot spektrofotometru. Tika izveidota kontroles

grupa no veseliem cilvēkiem dažādās vecuma grupās. Tas tika veikts, jo ir nepieciešams

noteikt references vērtību robežas (kurus katra laboratorija nosaka autonomi), ar kurām

salīdzināt pacientu rādītājus. Iegūtie rezultāti pierāda, ka metode var būt veiksmīgi

izmantojama klīniskajā praksē. Tika turpināti darbi pie iepriekšējā periodā izveidotiem

cibrīdu modeļiem (kā patoloģisko mtDNS mutāciju saturošiem, tā arī kontroles grupas

modeļiem kas satur Eiropai raksturīgas mitohondriālas haplogrupas – A12, H3, H11,

I1, J1, U4, U5, V1, V7, W6), kvalitatīvi analizējot tos. Papildus tam, mēs izveidojām

jaunus cibrīdu modeļus, kas satur mtDNS haplogrupas, kas netika iesaistītas projekta

iepriekšējā periodā.

19


„Kuņģa vēža asociēto autoantivielu testa izveide un validēšana agrīnai kuņģa

vēža diagnostikai”, sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. Z.Kalniņa


Projekta ietvaros tika veikts liela apjoma pētījums, kurā tika noskaidrots, kurā

kuņģa vēža attīstības posmā pacientiem sāk veidoties autoantivielas pret vēža

antigēniem un kāda ir to prognostiskā nozīme. Izmantojot iepriekš izstrādāto

rekombinanto proteīnu mikrorindu tehnoloģiju, šī projekta ietvaros tika testēti vairāk

kā 2500 plazmas paraugi. Šī kohorta ietver kuņģa vēža un atrofiska gastrīta pacientus,

praktiski veselus cilvēkus, kam veikta endoskopiska izmeklēšana, kā arī longitudināla

populācijas pētījuma pacientus, kam pētījuma laikā detektēts kuņģa vēzis (un ir

pieejami pirms diagnozes noteikšanas ņemtie plazmas paraugi). Tika sagatavots viens

zinātniskais raksts.


„Dažāda garuma bakteriofāga izcelsmes dsRNS imūnmodulatorās īpašības un

to pielietojums vakcīnās”, sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. D.Pjanova


Projekta pirmā gada ietvaros no heterogēnās dsRNS (Larifāna) ar gēla

hromatogrāfijas metodi iegūtas dažāda garuma dsRNS frakcijas un ar Lumex xMAP

tehnoloģiju izanalīzēts to induceto citokīnu un hemokīnu spekts (kopā 29 dažādi

citokīni un hemokīni). Balstoties uz iegūtajiem rezultātiem atlasītas trīs dažādas

frakcijas tālākai izpētei.

6. Nr. NFI/R/2014/045 „Prostatas vēža ekstracelulārās vezikulas: funkcionālā

loma starpšūnu komunikācijā un klīniskais pielietojums”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. A.Linē

Īstenošanas ilgums – 2015.gada 1.maijs-2017.gada 30.aprīlis

Projekta galvenais mērķis ir noskaidrot prostatas vēža šūnu producēto

ekstracelulāro vezikulu (EV) lomu audzēja progresijā un, pētot EV saturu, identificēt

potenciālus terapijas mērķus un biomarķierus slimības gaitas prognozēšanai. Šajā gadā

tika veikti sekojoši uzdevumi:

Pabeigta prostatas vēža (PC) pacientu iesaistīšana pētījumā un izveidota

longitudināla kohorta, kurā iekļauti 53PC pacienti. Šiem pacientiem ir savākti

asins un urīna paraugi pirms operācijas, 7. dienā, 3 un 9 mēnešus pēc operācijas,

kā arī audzēja un normālo audu paraugi no operācijas materiāla. Otrkārt, tika

pabeigta klīniskās informācijas apkopošana retrospektīvās PC un BPH kohortas

pacientiem, kas ļāva identificēt pacientu grupu, kuriem sākotnēja diagnoze BPH

piecu gadu laikā ir mainījusies uz PC.

Tika veikta mazo RNS sekvenēšana viena pacienta asins un urīna EV paraugos,

kas ņemti pirms un pēc operācijas, kā arī audzēja un normālo audu paraugā.

Negaidīti, RNA-Seq datu analīze parādīja, ka šī pacienta asins un urīna EV

paraugos 35 - 82% RNS lasījumu atbilst dažādu mikroorganismu genomiem.

Analizējot cilvēka miRNS, tika konstatēts, ka pirms-operācijas asins un urīna EV

20

paraugi klāsterējas kopā ar audzēja audiem, savukārt pēc operācijas EV paraugi

kopā ar normālajiem audiem. Nākamajā gadā paredzēts veikt mazo RNS

sekvenēšanu vēl viena pacienta pilnā paraugu komplektā un interesējošās mazās

RNS testēt visos longitudinālās kohortas paraugos.

Veicot sistemātisku literatūras analīzi, izveidots 15 PC-asociēto miRNS panelis.

Šīs miRNS ir augstu ekspresētas PC audos, detektētas pacientu plazmā vai urīnā

un tām ir parādīta prognostiska nozīme. Ir iesākts darbs pie šo miRNS testēšanas

retrospektīvās kohortas pacientu plazmas EV un totālās plazmas paraugos. Šī

eksperimenta galvenais mērķis ir noskaidrot vai EV izolēšana dod priekšrocības

diagnostiski vai prognostiski nozīmīgo miRNS biomarķieru detektēšanai.

Tika turpināts darbs pie EV funkcionālo efektu izpētes un peļu modeļa

izveidošanas. NFI stipendiju projekta ietvaros Lilite Sadovska viesojās Oslo

Universitātes slimnīcā, Prof. Kjersti Flatmark laboratorijā, kur apguva praktiskās

iemaņas darbam ar laboratorijas dzīvniekiem, to skaitā audzēju ksenotransplantu

iegūšanā.

Publicēti divi zinātniskie raksti.

7. Nr. NFI/R/2014/051 „Vizuāli kontrolējama vēža gēnu terapija kombinācijā ar

potenciāliem ķīmijterapijas savienojumiem”

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol. A.Zajakina


Lai pārbaudītu citokīnus ekspresējošu, uz Semliki meža vīrusu (SFV) balstītu

vektoru potenciālu audzēja imunoterapijā, tika sintezētas trīs jaunas, uz SFV vektoru

balstītas alfavīrusu konstrukcijas, kas saturēja mTNFa, mIFNg un hIFNg gēnus. Tika

parādīta SFV vektoru spēja inficēt Lewis plaušu karcinomas (LLC) šūnas un efektīvi

inhibēt to augšanu in vitro. Lai noteiktu, vai SFV-mIFNg iegūts mIFNg spēj paaugstināt

makrofāgu aktivāciju caur TLR in vitro, SFV-mIFNg iegūtais mIFNg tika izmantots,

lai aktivētu no kaulu smadzenēm iegūtus makrofāgus (BMDM) un novērtētu LLC šūnu

augšanas inhibīciju. Tā kā SFV iegūta mIFNg funkcionalitāte in vitro tika parādīta trīs

neatkarīgos eksperimentos, tika secināts, ka no SFV iegūts mIFNg varētu tikt izmantots

makrofāgu aktivācijas paaugstināšanā un audzēja supresīva fenotipa iegūšanā caur

dažādu TLR aktivāciju.

Tālāk, terapija ar SFV vektoriem atsevišķi vai kopā ar TLR ligandiem tika

izpētīta audzēju augšanas inhibēšanas eksperimentos sadarbībā ar Norvēģijas

partneriem. Rezultāti demonstrēja pozitīvu terapeitisku efektu (30% audzēju augšanas

samazinājumu), pielietojot šo ārstēšanas stratēģiju. Papildus tam, OSI sintezētie

fluorescentie savienojumi tika izmantoti, lai iezīmētu vēža šūnas šūnu vizualizācjai in

vivo peļu modeļos. Šie jaunie savienojumi ar fluorescences īpašībām infrasarkanajā

spektrā tiks tālāk izmantoti, lai izveidotu teranostikumus vēža diagnostikai un terapijai.

Nākotnē ir paredzēts novērtēt SFV-mTNFa ietekmi uz audzēja augšanas inhibīciju in

vivo kombinācijā ar SFV-mIFNg, kā arī pārbaudīt SFV-hIFNg konstrukta efektivitāti

cilvēka plaušu audzēja ksenotransplantācijas modelī in vivo.

21

8. ERA-NET projekts „Melanomas metastāžu un sekundāro audzēju attīstības

ģenētiskie marķieri (GENMEL)”, sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol.D.Pjanova


Projekta ietvaros tika atlasīti 11 melanomas pacienti, kuriem pieejama gan

genomiskā DNS no asinīm, gan saldēts audzēju audu materiāls. No saldētajiem audiem

ar fenola-hloroforma metodi tika izdalīta DNS, kam paralēli ar attiecīgās personas asiņu

DNS tika veikta eksomu sekvenēšana. Iegūtās sekvences gan ir iekļauti projekta kopējā

analīzē, gan norisinās darbs pie eksomu datu apstrādes un analīzes. Parēli tika izdalīta

DNA no formalīnā fiksētiem un parafīnā ieslēgtiem audu DNS paraugiem un parbaudīta

DNS kvalitāte lielapjoma dauzdķēžu paralēlejai sekvenēšanai, izmantojot HaloPlex

platformu. Iegūtie rezultāti atspoguļoti LU Bioloģijas fakultātes studentes Alises

Annijas Vaitkus kursa darbā.

9. ERA-NET projekts „Universāls nano-pastiprinātājs miRNS analīzei multiplās

sklerozes pacientu asinīs, izmantojot virsmas plazmonu rezonanses

tehnoloģiju (NanoPlasmiRNA)”, sadarbības projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol.A.Linē

Īstenošanas ilgums – 2016.gada 1.janvāris-2017.gada 31.decembris

Projekta mērķis ir izstrādāt universālu nano-pastiprinātāju, kas uzlabo virsmas

plazmonu rezonanses (SPRi) tehnoloģijas jutību miRNS detektēšanai un parādīt

iespējas šo tehnoloģiju izmantot miRNS biomarķieru detektēšanai multiplās sklerozes

(MS) pacientu asinīs. BMC galvenais uzdevums šajā projektā ir izveidot ~60 miRNS

paneli, kas tiks izmantots SPRi tehnoloģijas testēšanā. miRNS atlase balstās uz mazo

RNS sekvenēšanu MS pacientu un veselu cilvēku plazmā. Projekta pirmajā īstenošanas

gadā tika optimizēta metodika cfRNS (cell-free RNA) izolēšanai no cilvēku plazmas un

nosekvenētas 11 mazo RNS bibliotēkas, izmantojot Ion Torrent tehnoloģiju. Lai gan

visos gadījumos tika iegūts pietiekami liels primāro lasījumu (raw reads) skaits,

rezultātu analīze parādīja, ka identificēto miRNS lasījumu skaits būtiski variē starp

dažādiem paraugiem un ievērojamu daļu lasījumu katrā bibliotēkā sastāda pašliģēti

adapteri bez inserta, kas liecina par to, ka Ion Torrent tehnoloģija nav labi piemērota

mazo RNS bibliotēku konstruēšanai no ļoti maza RNS daudzuma (0.5-1ng). Tādēļ

pašlaik tiek meklētas iespējas izmantot citus reaģentu komplektus mazo RNS bibliotēku

konstruēšanai.

10. ERA-NET projekts „Uz alfavīrusiem basltīta hitināzei līdzīgā proteīna gēna

piegāde makrofāgu pretaudzēja programmēšanai (AlphaChit)”, sadarbības

projekts

Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol.A.Zajakina

Īstenošanas ilgums – 2016.gada 1.janvāris-2018.gada 30.jūnijs

Šajā projekta posmā tika sintezēti vairāki alfavīrusu vektori, kas ekspresē peļu

SI-CLP gēnu: SFV/SI-CLP, SFV/enhSI-CLP, SINrep5/SI-CLP, SIN(NspSer)/SI-CLP.

Savstarpēji salīdzinot šo rekombinanto alfavīrusu vektoru transgēna ekspresiju,

visaugstākā gēna SI-CLP ekspresija tika konstatēta BHK šūnās pēc infekcijas ar

22

SFV/enhSI-CLP vektoru. Izmantojot imunofluorescences mikroskopiju, tika

konstatēts, ka SI-CLP lokalizējas pārsvarā šūnu citoplazmā un daļēji kodolā. Balstoties

uz anti-SI-CLP imunoprecipitāciju ar turpmāku western blota analīzi, tika konstatēts,

ka proteīna sekrēcija nenotiek. Kopā ar Vācijas partneriem tika parādīts, ka SI-CLP

ekspresējošās vēža šūnas stimulē peļu makrofāgu M1 fenotipa marķieru ekspresiju un

makrofāgu pretvēža darbību in vitro.

11. Zviedrijas institūta Baltijas jūras reģiona projekts Nr. 19806/2016 “Baltic

platform for the innovative immunotherapies (INNOVIMMUNE)”,


Projekta vadītājs – vadošā pētniece Dr.biol.I.Sominska

Īstenošanas ilgums – 2016.gada 1.novembris-2018.gada 31.marts

Projekta mērķis ir uzlabot Baltijas jūras reģiona (BJR) globālo konkurētspēju

prioritārās sabiedrības veselības nozarēs, izmantojot (1) pēcdiploma izglītību

biomedicīnas un biotehnoloģijas nozarēs, lai nodrošinātu plašu aktuālo zināšanu

izplatīšanas; (2) aktīvi veicināt jauno pētnieku statusa, darbības rādītājus un

konkurētspējas paaugstināšanas; (3) atsevišķo iesaistīto partneru/valstu kapacitāšu

apvienošana kopīgai postošo cilvēku slimību imūnās terapijas inovatīvo pieeju

izstrādāšanai.

2.1.4. Valsts vai pašvaldības budžeta iestāžu un komersantu pētniecības projektu

līgumdarbi

1. Iedzīvotāju genoma datubāzes projekta īstenošana

Projekta vadītājs - vadošais pētnieks Dr.biol. J.Kloviņš

Īstenošanas ilgums – 2016.gada 1.janvāris-2016.gada 31.decembris

2016.gadā Valsts iedzīvotāju genoma datu bāzē tika iesaistīti 2234 dalībnieki,

veikta paraugu apstrāde. Ievākto audu paraugu un fenotipiskās informācijas sadalījums

pa medicīnas iestādēm:

Lai palielinātu datubāzē iesaistīto gēnu donoru skaitu, tika turpināta sadarbība

ar Latvijas Universitātes un starptautisko partneru atbalstīto gremošanas trakta audzēju

izpētes projektu GISTAR. Šāda pieeja ir ļāvusi iesaistīt VIGDB par 935 gēnu donoriem

vairāk no kopējā paraugu skaita.

2016.gadā tika veiktas 18 visa genoma hibridizācijas (CGH) analīzes

pacientiem ar aizdomām par hromosomu struktūras mikrodelēcijām/duplikācijām.

Iedzimtās hiperholesterinēmijas pacientu testēšana veikta 16 pacientiem. FLT3, NPM1

genotipēšanu bērnu onkohematologu vajadzībām tika nosūtīti divi pacienti. Latentā

autoimūnā diabēta (LADA) izpētes ietvaros datubāzē identificēti 126 cilvēki, kuriem

veikta anti-GAD65 antivielu noteikšana un tiek apkopoti iegūtie rezultāti, lai izveidotu

priekšlikumus LADA precīzai diagnostikai Latvijā. Veikta testēšana 20

vairogdziedzera vēža pacientu DNS paraugiem.

23

2.1.5. Starptautiskie un vietējie pētniecības projektu līgumdarbi

1. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – SAIBA AH GmbH.

2. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – SAIBA GmbH.

3. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – Uppsala Universitet.

4. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – ViroGen Corporation.

5. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – HypoPet GmbH.

6. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – Dundee Universitet.

7. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – RSU.

8. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – LLU.

9. Līgums par pētniecības pakalpojumu, pasūtītājs – SIA GenEra.

2.2. Zinātniskās publikācijas

2.2.1. Zinātniskās publikācijas, kas iekļautas Web of Science vai SCOPUS

1. Rasina, D., Otikovs, M., Leitans, J., Recacha, R., Borysov, O.V., Kanepe-Lapsa, I.,

Domraceva, I., Pantelejevs, T., Tars, K., Blackman, M.J., Jaudzems, K., Jirgensons,

A. Fragment-Based Discovery of 2-Aminoquinazolin-4(3H)-ones As Novel Class

Nonpeptidomimetic Inhibitors of the Plasmepsins I, II, and IV (2016) Journal of

Medicinal Chemistry, 59 (1), pp. 374-387. PMID: 26670264

2. Stepanovs, D., Tetere, Z., Raviņa, I., Kumpiņš, V., Zicane, D., Bizdena, E., Bogans,

J., Novosjolova, I., Grigaloviča, A., Meri, R.M., Fotins, J., Čerkasovs, M., Mishnev,

A., Turks, M. Structural characterization of cevimeline and its trans-impurity by

single crystal XRD (2016) Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 118,

pp. 404-409. PMID: 26609680

3. Capligina, V., Berzina, I., Bormane, A., Salmane, I., Vilks, K., Kazarina, A.,

Bandere, D., Baumanis, V., Ranka, R. Prevalence and phylogenetic analysis of

Babesia spp. in Ixodes ricinus and Ixodes persulcatus ticks in Latvia (2016)

Experimental and Applied Acarology, 68 (3), pp. 325-336. PMID: 26481239

4. Spjuth, O., Krestyaninova, M., Hastings, J., Shen, H.-Y., Heikkinen, J.,

Waldenberger, M., Langhammer, A., Ladenvall, C., Esko, T., Persson, M.-.,

Heggland, J., Dietrich, J., Ose, S., Gieger, C., Ried, J.S., Peters, A., Fortier, I., de

Geus, E.J.C., Klovins, J., Zaharenko, L., Willemsen, G., Hottenga, J.-J., Litton, J.-

E., Karvanen, J., Boomsma, D.I., Groop, L., Rung, J., Palmgren, J., Pedersen, N.L.,

McCarthy, M.I., van Duijn, C.M., Hveem, K., Metspalu, A., Ripatti, S., Prokopenko,

I., Harris, J.R. Harmonising and linking biomedical and clinical data across

disparate data archives to enable integrative cross-biobank research (2016)

European Journal of Human Genetics, DOI: 10.1038/ejhg.2015.165. PMID:

26306643

5. Krupovic, M., Dutilh, B.E., Adriaenssens, E.M., Wittmann, J., Vogensen, F.K.,

Sullivan, M.B., Rumnieks, J., Prangishvili, D., Lavigne, R., Kropinski, A.M.,

Klumpp, J., Gillis, A., Enault, F., Edwards, R.A., Duffy, S., Clokie, M.R.C.,

Barylski, J., Ackermann, H.-W., Kuhn, J.H. Taxonomy of prokaryotic viruses:

update from the ICTV bacterial and archaeal viruses subcommittee (2016) Archives

of Virology, pp. 1-5. DOI: 10.1007/s00705-015-2728-0. PMID: 26733293

24

6. Tiškina, V., Capligina, V., Must, K., Berzina, I., Ranka, R., Jokelainen, P. Fatal

Babesia canis canis infection in a splenectomized Estonian dog (2016) Acta

Veterinaria Scandinavica, DOI: 10.1186/s13028-016-0189-4. PMID: 26810086

7. Backes S, Jäger C, Dembek CJ, Kosinska AD, Bauer T, Stephan AS, Dišlers A,

Mutwiri G, Busch DH, Babiuk LA, Gasteiger G, Protzer U. Protein-prime/modified

vaccinia virus Ankara vector-boost vaccination overcomes tolerance in high-

antigenemic HBV-transgenic mice (2016) Vaccine. 2016 Feb 10;34(7):923-32. doi:

10.1016/j.vaccine.2015.12.060. Epub 2016 Jan 15. PMID: 26776470

8. Gerashchenko, B.I., Salmina, K., Eglitis, J., Huna, A., Grjunberga, V., Erenpreisa,

J. Disentangling the aneuploidy and senescence paradoxes: a study of triploid breast

cancers non-responsive to neoadjuvant therapy (2016) Histochemistry and Cell

Biology, 145 (4), pp. 497-508. PMID: 26860864

9. Klionsky, D.J., … Erenpresa J., ... Deter, R.L. Erratum to: Guidelines for the use

and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition) (Autophagy, 12,

1, 1-222, 10.1080/15548627.2015.1100356 (2016) Autophagy, 12 (2), p. 443.

PMID: 26799652

10. Vazquez-Martin, A., Anatskaya, O., Giuliani, A., Erenpreisa, J., Huang, S., Salmina,

K., Inashkina, I., Huna, A., Nikolsky, N., & Vinogradov, A. (2016). Somatic

polyploidy is associated with the upregulation of c-MYC interacting genes and EMT-

like signature. Oncotarget, 7(46), 75235-75260. PMID: 27655693

11. Anatskaya, O.V., Erenpreisa, J.A., Nikolsky, N.N., Vinogradov, A.E. Pairwise

comparison of mammalian transcriptomes associated with the effect of polyploidy

on the expression activity of developmental gene modules (2016) Cell and Tissue

Biology, pp. 122-132. PMID: 26995969

12. Maggio B, Raffa D, Raimondi MV, Cascioferro S, Plescia F, Schillaci D, Cusimano

MG, Leonchiks A, Zhulenkovs D, Basile L, Daidone G. Discovery of a New Class

of Sortase A Transpeptidase Inhibitors to Tackle Gram-Positive Pathogens: 2-(2-

Phenylhydrazinylidene)alkanoic Acids and Related Derivatives. Molecules. 2016

Feb 19;21(2):241. PMID: 26907235

13. Cascioferro S, Maggio B, Raffa D, Raimondi MV, Cusimano MG, Schillaci D,

Manachini B, Leonchiks A, Daidone G. A new class of phenylhydrazinylidene

derivatives as inhibitors of Staphylococcus aureus biofilm formation. Medicinal

Chemistry Research. (2016) May 1;25(5):870-878. DOI: 10.1007/s00044-016-

1535-9

14. Mokrousov, I., Vyazovaya, A., Iwamoto, T., Skiba, Y., Pole, I., Zhdanova, S.,

Arikawa, K., Sinkov, V., Umpeleva, T., Valcheva, V., Alvarez Figueroa, M., Ranka,

R., Jansone, I., Ogarkov, O., Zhuravlev, V., Narvskaya, O. Latin-American-

Mediterranean lineage of Mycobacterium tuberculosis: Human traces across

pathogen's phylogeography (2016) Molecular Phylogenetics and Evolution, 99, pp.

133-143. PMID: 27001605

15. Kalvisa, A., Tsirogiannis, C., Silamikelis, I., Skenders, G., Broka, L., Zirnitis, A.,

Jansone, I., Ranka, R. MIRU-VNTR genotype diversity and indications of homoplasy

in M. avium strains isolated from humans and slaughter pigs in Latvia (2016)

Infection, Genetics and Evolution, 43, pp. 15-21. PMID: 27178993

16. Igumnova, V., Capligina, V., Krams, A., Cirule, A., Elferts, D., Pole, I., Jansone, I.,

Bandere, D., Ranka, R. Genotype and allele frequencies of isoniazid-metabolizing

25

enzymes NAT2 and GSTM1 in Latvian tuberculosis patients (2016) Journal of

Infection and Chemotherapy, 22 (7), pp. 472-477. PMID: 27236516

17. Baumane, K., Ranka, R., Laganovska, G. Association of NT-proANP Level in

Plasma and Humor Aqueous with Primary Open-Angle Glaucoma (2016) Current

Eye Research, pp. 1-4. PMID: 27723368

18. Pumpens, P., Renhofa, R., Dishlers, A., Kozlovska, T., Ose, V., Pushko, P., Tars,

K., Grens, E., Bachmann, M.F. The True Story and Advantages of RNA Phage

Capsids as Nanotools (2016) Intervirology, pp. 74-110. PMID: 27829245

19. Shishovs, M., Rumnieks, J., Diebolder, C., Jaudzems, K., Andreas, L.B., Stanek, J.,

Kazaks, A., Kotelovica, S., Akopjana, I., Pintacuda, G., Koning, R.I., Tars, K.

Structure of AP205 Coat Protein Reveals Circular Permutation in ssRNA

Bacteriophages (2016) Journal of Molecular Biology, 428 (21), pp. 4267-4279. doi:

10.1016/j.jmb.2016.08.025. PMID: 27591890

20. Stanek J, Andreas LB, Jaudzems K, Cala D, Lalli D, Bertarello A, Schubeis T,

Akopjana I, Kotelovica S, Tars K, Pica A, Leone S, Picone D, Xu ZQ, Dixon NE,

Martinez D, Berbon M, El Mammeri N, Noubhani A, Saupe S, Habenstein B, Loquet

A, Pintacuda G. NMR Spectroscopic Assignment of Backbone and Side-Chain

Protons in Fully Protonated Proteins: Microcrystals, Sedimented Assemblies, and

Amyloid Fibrils. Angew Chem Int Ed Engl. 2016 Nov 16. doi:

10.1002/anie.201607084. PMID: 27865050

21. Andreas, L.B., Jaudzems, K., Stanek, J., Lalli, D., Bertarelloa, A., Marchand, T.L.,

De Paepe, D.C., Kotelovica, S., Akopjana, I., Knott, B., Wegner, S., Engelke, F.,

Lesage, A., Emsley, L., Tars, K., Herrmann, T., Pintacuda, G. Structure of fully

protonated proteins by proton-detected magic- Angle spinning NMR (2016)

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,

113 (33), pp. 9187-9192. doi: 10.1073/pnas.1602248113. PMID: 27489348

22. Koning, R.I., Gomez-Blanco, J., Akopjana, I., Vargas, J., Kazaks, A., Tars, K.,

Carazo, J.M., Koster, A.J. Asymmetric cryo-EM reconstruction of phage MS2

reveals genome structure in situ (2016) Nature Communications, 7, art. no. 12524.

doi: 10.1038/ncomms12524. PMID: 27561669

23. Liepinsh, E., Makrecka-Kuka, M., Volska, K., Kuka, J., Makarova, E., Antone, U.,

Sevostjanovs, E., Vilskersts, R., Strods, A., Tars, K., Dambrova, M. Long-chain

acylcarnitines determine ischaemia/reperfusion-induced damage in heart

mitochondria (2016) Biochemical Journal, 473 (9), pp. 1191-1202. doi:

10.1042/BCJ20160164. PMID: 26936967

24. Recacha, R., Jaudzems, K., Akopjana, I., Jirgensons, A., Tars, K. Crystal structure

of Plasmodium falciparum proplasmepsin IV: The plasticity of proplasmepsins

(2016) Acta Crystallographica Section:F Structural Biology Communications, 72,

pp. 659-666. doi:10.1107/S2053230X16011663. PMID: 27599854

25. Vasilevska, J., De Souza, G.A., Stensland, M., Skrastina, D., Zhulenvovs, D.,

Paplausks, R., Kurena, B., Kozlovska, T., Zajakina, A. Comparative protein

profiling of B16 mouse melanoma cells susceptible and non-susceptible to

alphavirus infection: Effect of the tumor microenvironment (2016) Cancer Biology

and Therapy, 17 (10), pp. 1035-1050. PMID: 27636533

26. Legzdina, D., Romanauska, A., Nikulshin, S., Kozlovska, T., Berzins, U.

Characterization of senescence of culture-expanded human adipose-derived

26

mesenchymal stem cells (2016) International Journal of Stem Cells, 9 (1), pp. 124-

136. PMID: 27426094

27. Endzeliņš, E., Melne, V., Kalniņa, Z., Lietuvietis, V., Riekstiņa, U., Llorente, A.,

Line, A. Diagnostic, prognostic and predictive value of cell-free miRNAs in prostate

cancer: A systematic review (2016) Molecular Cancer, 15 (1), art. no. 41. PMID:

27189160

28. Viter, R., Jekabsons, K., Kalnina, Z., Poletaev, N., Hsu, S.H., Riekstina, U.

Bioanalytical system for detection of cancer cells with photoluminescent ZnO

nanorods (2016) Nanotechnology, 27 (46), art. no. 465101. PMID: 27731308

29. Romanchikova, N., Strods, A., Strazdina, J., Strumfs, B., Trapencieris, P. A novel

aziridine-based bruton's tyrosine kinase inhibitor induces apoptosis through down-

regulation of p65/RelA phosphorylation on serine 536 and ERK1/2 in mantle cell

lymphoma (2016) Anticancer Research, 36 (11), pp. 6133-6140. PMID: 27793942

30. Hamdi, Y., .... Tihomirova, L., ..... Simard, J. Association of breast cancer risk in

BRCA1 and BRCA2 mutation carriers with genetic variants showing differential

allelic expression: identification of a modifier of breast cancer risk at locus 11q22.3

(2016) Breast Cancer Research and Treatment, pp. 1-18. PMID: 27796716

31. Lawrenson, K., … Tihimirova, L., ... Price, M. Functional mechanisms underlying

pleiotropic risk alleles at the 19p13.1 breast-ovarian cancer susceptibility locus

(2016) Nature Communications, 7, art. no. 12675. PMID: 27601076

32. Dujic, T., Zhou, K., Yee, S.W., van Leeuwen N., de Keyser, C.E., Javorský, M.,

Goswami, S., Zaharenko. L., Marie, M., Christensen, H., Out, M., Tavendale, R.,

Kubo, M., Hedderson, M.M., van der Heijden, A.A., Klimčáková, L., Pirags, V.,

Kooy, A., Brøsen, K., Klovins, J., Semiz, S., Tkáč, I., Stricker, B.H., Palmer, C.N.,

't Hart, L.M., Giacomini, K.M., Pearson, E.R. Variants in Pharmacokinetic

Transporters and Glycaemic Response to Metformin: A MetGen Meta-Analysis.

2016. Clinical Pharmacology & Therapeutics, PMID: 27859023

33. Zaharenko, L., Kalnina, I., Geldnere, K., Konrade, I., Grinberga, S., Židzik ,J.,

Javorský, M., Lejnieks, A., Nikitina-Zake, L., Fridmanis, D., Peculis, R., Radovica-

Spalvina, I., Hartmane, D., Pugovics, O., Tkáč, I., Klimčáková, L., Pirags, V.,

Klovins, J. Single nucleotide polymorphisms in the intergenic region between

metformin transporter OCT2 and OCT3 genes are associated with short-term

response to metformin monotherapy in type 2 diabetes mellitus patients (2016)

European Journal of Endocrinology. PMID: 27609360

34. Zhou, K., Yee, S.W., Seiser, E.L., Van Leeuwen, N., Tavendale, R., Bennett, A.J.,

Groves, C.J., Coleman, R.L., Van Der Heijden, A.A., Beulens, J.W., De Keyser,

C.E., Zaharenko, L., Rotroff, D.M., Out, M., Jablonski, K.A., Chen, L., Javorský,

M., Zidzik, J., Levin, A.M., Keoki Williams, L., Dujic, T., Semiz, S., Kubo, M.,

Chien, H.-C., Maeda, S., Witte, J.S., Wu, L., Tká, I., Kooy, A., Van Schaik, R.H.N.,

Stehouwer, C.D.A., Logie, L., Sutherland, C., Klovins, J., Pirags, V., Hofman, A.,

Stricker, B.H., Motsinger-Reif, A.A., Wagner, M.J., Innocenti, F., Hart, L.M.,

Holman, R.R., McCarthy, M.I., Hedderson, M.M., Palmer, C.N.A., Florez, J.C.,

Giacomini, K.M., Pearson, E.R. Variation in the glucose transporter gene SLC2A2

is associated with glycemic response to metformin (2016) Nature Genetics, 48 (9),

pp. 1055-1059. PMID: 27500523

27

35. Megnis, K., Mandrika, I., Petrovska, R., Stukens, J., Rovite, V., Balcere, I., Jansone,

L.S., Peculis, R., Pirags, V., Klovins, J. Functional Characteristics of Multipotent

Mesenchymal Stromal Cells from Pituitary Adenomas (2016) Stem Cells

International, 2016, art. no. 7103720. PMID: 27340409

36. Peculis, R., Balcere, I., Rovite, V., Megnis, K., Valtere, A., Stukens, J., Arnicane,

L., Nikitina-Zake, L., Lejnieks, A., Pirags, V., Klovins, J. Polymorphisms in MEN1

and DRD2 genes are associated with the occurrence and characteristics of pituitary

adenomas (2016) European Journal of Endocrinology, 175 (2), pp. 145-153. PMID:

27185868

37. Franke, B., Stein, J.L., Ripke, S., Anttila, V., Hibar, D.P., van Hulzen, K.J., Arias-

Vasquez, A., Smoller, J.W., Nichols, T.E., Neale, M.C., McIntosh, A.M., Lee, P.,

McMahon, F.J., Meyer-Lindenberg, A., Mattheisen, M., Andreassen, O.A., Gruber,

O., Sachdev, P.S., Roiz-Santiañez, R., Saykin, A.J., Ehrlich, S., Mather, K.A.,

Turner, J.A., Schwarz, E., Thalamuthu, A., Yao, Y., Ho, Y.Y., Martin, N.G., Wright,

M.J., Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium,

Psychosis Endophenotypes International Consortium, Wellcome Trust Case Control

Consortium 2, Enigma Consortium, O'Donovan, M.C., Thompson, P.M., Neale,

B.M., Medland, S.E., Sullivan, P.F. Genetic influences on schizophrenia and

subcortical brain volumes: large-scale proof of concept (2016) Nature

Neuroscience, 19(3):420-31. PMID: 26854805

38. Sekar, A., Bialas, A.R., de Rivera, H., Davis, A., Hammond, T.R., Kamitaki, N.,

Tooley, K., Presumey, J., Baum, M., Van Doren, V., Genovese, G., Rose, S.A.,

Handsaker, R.E., Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics

Consortium, Daly, M.J., Carroll, M.C., Stevens, B., McCarroll, S.A. Schizophrenia

risk from complex variation of complement component 4 (2016). Nature,

530(7589):177-83. PMID: 26814963

39. Bigdeli, T.B., Ripke, S., Bacanu, S.A., Lee, S.H., Wray, N.R., Gejman, P.V.,

Rietschel, M., Cichon, S., St Clair, D., Corvin, A., Kirov, G., McQuillin, A., Gurling,

H., Rujescu, D., Andreassen, O.A., Werge, T., Blackwood, D.H., Pato, C.N., Pato,

M.T., Malhotra, A.K., O'Donovan, M.C., Kendler, K.S., Fanous, A.H.,

Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium. Genome-

wide association study reveals greater polygenic loading for schizophrenia in cases

with a family history of illness (2016) American Journal of Medical Genetics Part B:

Neuropsychiatric Genetics, 171B(2):276-89. PMID: 26663532

40. Johnson, E. C., D. W. Bjelland, D. P. Howrigan, A. Abdellaoui, G. Breen, A.

Borglum, S. Cichon, F. Degenhardt, A. J. Forstner, J. Frank, G. Genovese, S.

Heilmann-Heimbach, S. Herms, P. Hoffman, W. Maier, M. Mattheisen, D. Morris,

B. Mowry, B. Müller-Mhysok, B. Neale, I. Nenadic, M. M. Nöthen, C. O’Dushlaine,

M. Rietschel, D. M. Ruderfer, D. Rujescu, T. G. Schulze, M. A. Simonson, E. Stahl,

J. Strohmaier, S. H. Witt, Consortium Schizophrenia Working Group of the

Psychiatric Genomics, S. Ripke, B. M. Neale, A. Corvin, J. T. R. Walters, K. H.

Farh, P. A. Holmans, P. Lee, B. Bulik-Sullivan, D. A. Collier, H. Huang, T. H. Pers,

I. Agartz, E. Agerbo, M. Albus, M. Alexander, F. Amin, S. A. Bacanu, M.

Begemann, R. A. Belliveau, Jr., J. Bene, S. E. Bergen, E. Bevilacqua, T. B. Bigdeli,

D. W. Black, R. Bruggeman, N. G. Buccola, R. L. Buckner, W. Byerley, W. Cahn,

G. Cai, D. Campion, R. M. Cantor, V. J. Carr, N. Carrera, S. V. Catts, K. D.

28

Chambert, R. C. K. Chan, R. Y. L. Chen, E. Y. H. Chen, W. Cheng, E. F. C. Cheung,

S. A. Chong, C. Robert Cloninger, D. Cohen, N. Cohen, P. Cormican, N. Craddock,

J. J. Crowley, D. Curtis, M. Davidson, K. L. Davis, J. Del Favero, D. Demontis, D.

Dikeos, T. Dinan, S. Djurovic, G. Donohoe, E. Drapeau, J. Duan, F. Dudbridge, N.

Durmishi, P. Eichhammer, J. Eriksson, V. Escott-Price, L. Essioux, A. H. Fanous,

M. S. Farrell, L. Franke, et al.. No Reliable Association between Runs of

Homozygosity and Schizophrenia in a Well-Powered Replication Study (2016) PLoS

Genetics, 12 (10), art. no. e1006343. PMID: 27792727

41. Damsgaard, J., Joensen, U.N., Carlsen, E., Erenpreiss, J., Blomberg Jensen, M.,

Matulevicius, V., Zilaitiene, B., Olesen, I.A., Perheentupa, A., Punab, M.,

Salzbrunn, A., Toppari, J., Virtanen, H.E., Juul, A., Skakkebæk, N.E., Jørgensen, N.

Varicocele Is Associated with Impaired Semen Quality and Reproductive Hormone

Levels: A Study of 7035 Healthy Young Men from Six European Countries (2016)

European Urology, 70 (6), pp. 1019-1029. PMID: 27423503

42. Jørgensen, N., Joensen, U.N., Toppari, J., Punab, M., Erenpreiss, J., Zilaitiene, B.,

Paasch, U., Salzbrunn, A., Fernandez, M.F., Virtanen, H.E., Matulevicius, V., Olea,

N., Jensen, T.K., Petersen, J.H., Skakkebæk, N.E., Andersson, A.-M. Compensated

reduction in Leydig cell function is associated with lower semen quality variables:

A study of 8182 European young men (2016) Human Reproduction, 31 (5), pp. 947-

957. PMID: 26936886

43. Inashkina, I., Jankevics, E., Stavusis, J., Vasiljeva, I., Viksne, K., Micule, I.,

Strautmanis, J., Naudina, M.S., Cimbalistiene, L., Kucinskas, V., Krumina, A.,

Utkus, A., Burnyte, B., Matuleviciene, A., Lace, B. Robust genotyping tool for

autosomal recessive type of limb-girdle muscular dystrophies (2016) BMC

Musculoskeletal Disorders, 17 (1), art. no. 1058. PMID: 27142102

44. Mangold, E., Böhmer, A.C., Ishorst, N., Hoebel, A.-K., Gültepe, P., Schuenke, H.,

Klamt, J., Hofmann, A., Gölz, L., Raff, R., Tessmann, P., Nowak, S., Reutter, H.,

Hemprich, A., Kreusch, T., Kramer, F.-J., Braumann, B., Reich, R., Schmidt, G.,

Jäger, A., Reiter, R., Brosch, S., Stavusis, J., Ishida, M., Seselgyte, R., Moore, G.E.,

Nöthen, M.M., Borck, G., Aldhorae, K.A., Lace, B., Stanier, P., Knapp, M., Ludwig,

K.U. Sequencing the GRHL3 Coding Region Reveals Rare Truncating Mutations

and a Common Susceptibility Variant for Nonsyndromic Cleft Palate (2016)

American Journal of Human Genetics, 98 (4), pp. 755-762. PMID: 27018475

45. Kreile, M., Piekuse, L., Rots, D., Dobele, Z., Kovalova, Z., Lace, B. Analysis of

possible genetic risk factors contributing to development of childhood acute

lymphoblastic leukaemia in the Latvian population (2016) Archives of Medical

Science, 12 (3), pp. 479-485. PMID: 27279837

46. Audere, M., Rutka, K., Inaskina, I., Peculis, R., Sepetiene, S., Valeina, S., Lāce, B.

Genetic linkage studies of a North Carolina macular dystrophy family (2016)

Medicina (Lithuania), 52 (3), pp. 180-186. PMID: 27496188

47. Taylor, N.J., Handorf, E.A., Mitra, N., Avril, M.-F., Azizi, E., Bergman, W.,

Bianchi-Scarrà, G., Bishop, D.T., Bressac-de Paillerets, B., Calista, D., Cannon-

Albright, L.A., Cuellar, F., Cust, A.E., Demenais, F., Elder, D.E., Friedman, E.,

Gerdes, A.-M., Ghiorzo, P., Goldstein, A.M., Grazziotin, T.C., Hansson, J.,

Hayward, N.K., Hocevar, M., Höiom, V., Holland, E.A., Ingvar, C., Landi, M.T.,

Landman, G., Larre-Borges, A., Leachman, S.A., Mann, G.J., Nagore, E., Olsson,

29

H., Palmer, J., Perić, B., Pjanova, D., Puig, S., Schmid, H., van der Stoep, N., Tucker,

M.A., Wadt, K.A.W., Whitaker, L., Yang, X.R., Newton Bishop, J.A., Gruis, N.A.,

Kanetsky, P.A. Phenotypic and Histopathological Tumor Characteristics According

to CDKN2A Mutation Status among Affected Members of Melanoma Families

(2016) Journal of Investigative Dermatology, 136 (5), pp. 1066-1069. PMID:

26827760

48. Hollestelle, A.,…. Tihomirova, L., … Goode, E.L., Breast Cancer Family Register,

EMBRACE, GENICA Network, HEBON, SWE-BRCA No clinical utility of KRAS

variant rs61764370 for ovarian or breast cancer (2016) Gynecologic Oncology, 141

(2), pp. 386-401. PMID: 25940428

49. Tamošiunas, M., Kadikis, R., Saknite, I., Baltušnikas, J., Kilikevičius, A., Lihachev,

A., Petrovska, R., Jakovels, D., Šatkauskas, S. Noninvasive optical diagnostics of

enhanced green fluorescent protein expression in skeletal muscle for comparison of

electroporation and sonoporation efficiencies (2016) Journal of Biomedical Optics,

21 (4), art. no. 045003. PMID: 27129126

50. Couch, F.J.,…, Tihomirova, L., …. Antoniou, A.C. Identification of four novel

susceptibility loci for oestrogen receptor negative breast cancer (2016) Nature

Communications, 7, art. no. 11375. PMID: 27117709

51. Dunning, A.M.,… Tihomirova, L., … Edwards, S.L. Breast cancer risk variants at

6q25 display different phenotype associations and regulate ESR1, RMND1 and

CCDC170 (2016) Nature Genetics, 48 (4), pp. 374-386. PMID: 26928228

52. Meeks, H.D., …. Tihomirova, L., … Goldgar, D.E. BRCA2 Polymorphic Stop

Codon K3326X and the Risk of Breast, Prostate, and Ovarian Cancers (2016)

Journal of the National Cancer Institute, 108 (2), art. no. Djv315. PMID: 26586665

53. Leśniak, R.K., Markolovic, S., Tars, K., Schofield, C.J. Human carnitine

biosynthesis proceeds via (2S,3S)-3-hydroxy-Nε-trimethyllysine (e-pub 2016)

Chemical Communications, 53 (2), pp. 440-442 PMID: 27965989

54. Zeng, C., .... Tihomirova, L., ... Zheng, W. Identification of independent association

signals and putative functional variants for breast cancer risk through fine-scale

mapping of the 12p11 locus (2016) Breast Cancer Research, 18 (1), art. no. 64,

PMID: 27459855

55. Pumpens, P., Grens, E. The true story and advantages of the famous Hepatitis B

virus core particles: Outlook 2016 (2016) Molecular Biology, 50 (4), pp. 489-509.

PMID: 27668597

56. Rebbeck, T.R., .... Tihomirova, L., ... Ramus, S.J. Inheritance of deleterious

mutations at both BRCA1 and BRCA2 in an international sample of 32,295 women

(2016) Breast Cancer Research, 18 (1), art. no. 112, PMID: 27836010

57. Tsuchiya, M., Giuliani, A., Hashimoto, M., Erenpreisa, J., Yoshikawa, K. Self-

organizing global gene expression regulated through criticality: Mechanism of the

cell-fate change (2016) PLoS ONE, 11 (12), art. no. 0167912, PMID: 27997556

2.2.2. Citas zinātniskās publikācijas

1. Popēna I, Jēkabsons K, Ābols A, Saulīte L, Čonka U, Kozlovska I, Zandberga E,

Stefanovičs J, Ose-Klinklāva V, Muceniece R, Linē A, Riekstiņa U. Vēža šūnu

līniju producēto eksosomu uzņemšana un funkcionālie efekti mezenhimālajās cilmes

30

šūnās. Uptake and functional effects of cancer cell line-produced exosomes in

mesenchymal stem cells. Latvijas Universitātes raksti, 2016, 812: 85-99

2.3. Intelektuālā īpašuma aizsardzība

2016. gadā ir turpināta jau esošu Latvijas un starptautisko patentu uzturēšana,

kā ari turpinājās iepriekšējos gados iesniegto patentu pieteikumu lietvedības process.

Jauni patentu pieteikumi 2016.gadā netika iesniegti.

2.3.1. Reģistrētie un uzturētie starptautiskie patenti

1. Australian patent AU 2009200115, Packaging of immunostimulatory substances

into virus-like particles: method of preparation and use. Inventors: Tissot A,

Meijerink E, Lipowsky G, Cielens I, Storni T, Bachmann Martin F, Maurer P,

Pumpens P, Renhofa R, Schwarz K. Uzturēts līdz: 16.09.2016.

2.3.2. Reģistrētie un uzturētie Latvijas patenti

1. Latvijas patents Nr.13958, Hepatīta B vīrusa core pilna garuma proteīna kapsīdu

iegūšanas paņēmiens, Renhofa R., Pumpēns P., Ozols J., Ose-Klinklāva V.,

uzturēts līdz 14.01.2016.

2. Latvijas patents Nr.13979, Antibiotikas doksorubicīna iepakošana bakteriofāga GA

apvalka proteīna veidotajās nanodaļiņās-kaspīdās, Renhofa R., Pumpēns P.,

Cielēns I., Strods A., uzturēts līdz 08.05.2016.

3. Latvijas patents Nr.14084, Paņēmiens izvēlētā bioloģiskā materiāla iepakošanai

hepatīta B vīrusa core pilna garuma proteīna kapsīdās, Renhofa R., Ozols J., Ose-

Klinklāva V., uzturēts līdz 08.10.2016.

4. Latvijas patents Nr.14204, Heterologas proteīnu sekvences eksponējošu kartupeļu

vīrusam PVY līdzīgo daļiņu iegūšana un izmantošana, Zeltiņš A., Kalniciema I.,

Skrastiņa D., Ose V., Pumpēns P., uzturēts 2011.-2016.

5. Latvijas patents Nr.14884, 1,4-Dihidropiridīn-4-il-piridīnija atvasinājumi kā jauni

adenozīna A2A receptora agoallostēriskie modulatori, Duburs G., Kloviņš J.,

Brūvere I., Petrovska R., Mandrika I., Ignatoviča V., Bisenieks E., Uldriķis J.,

Poikāns J., Vīgante B, iesniegts 17.01.2013., uzturēts 2014-2016.

6. Latvijas patents Nr.14945, Ekspresijas sistēma HBc-preS1 vīrusveidīgo daļiņu

iegūšanai, Dišlers A., Petrovskis I., Liekniņa I., Bērza I, Bogans J., Akopjana I.,

Sominska I., Pumpēns P., iesniegts 21.06.2013., uzturēts 2015.-2016.

7. Latvijas patents Nr.14982, 3’-Aril- un heterilaizvietotās 2-akrilamidocikloheks-1-

ēn-karbonskābes kā hidroksikarbonskābju receptoru saimes (HCA2) jauna ligandu

grupa, Loža E., Bobiļeva O., Bokaldere R., Gailīte V., Kaula I., Ikaunieks M.,

Mandrika I., Petrauska R, Kloviņš J., Duburs G., Bisenieks E., iesniegts

10.10.2013., uzturēts 2015.-2016.

8. Latvijas patens Nr.15002, Heterociklā aizvietoti[(2-karboksi vai

metoksikarbonil)fenilkarbamoil-metil-(vai trimetilēn)]piridīnija vai izohinolīnija

bromīdi kā hidroksikarbonskābju receptoru saimes(HCA2) jauna ligandu klase,

Vīgante B., Luntēna I., Kalme Z., Bisenieks E., Poikāns J., Petrauska R., Mandrika

31

I., Kloviņš J., Loža E., Brūvere I., Duburs G., Uldriķis J., iesniegts 29.10.2013.,

uzturēts 2015.-2016.

9. Latvijas patents Nr.15004, 5-(4-Hlorobutil)-pirano[2,3-d]pirimidīn-

2,4,7(3H)trions un 5-alkil-2-tiokso-1H-pirano[2,3-d]pirimidīn-4,7-dioni kā

niacīna receptoru saimes (HCA2 un HCA3)jauni ligandi un sintoni jaunu ligandu

iegūšanai, Vīgante B., Brūvere I., Bisenieks E., Mandrika I., Petrauska R., Kloviņš

J., Poikāns J., Uldriķis J., Duburs G., iesniegts 08.11.2013., uzturēts 2015.-2016.

10. Latvijas patents Nr.15007, Kartupeļu vīrusam PVM līdzīgo daļiņu iegūšana, Zeltiņš

A., Kalnciema I., Ose-Klinklāva V, Baļķe I., iesniegts 22.10.2013., uzturēts 2015.-

2016.

11. Latvijas patents Nr.15006, Daudzziedu airenes raibuma vīrusam līdzīgo daļiņu

iegūšana, A.Zeltiņš, I. Baļķe, G. Reseviča, V. Ose-Klinklāva, A.Kazāks,

J.Freivalds, iesniegts 02.08.2013., uzturēts 2015.-2016.

12. Latvijas patents Nr.15018, Upeņu reversijas vīrusa antigēnu iegūšana, A.Zeltiņš,

I.Baļķe, J.Šaripo, I. Moročko-Bičevska, D.Skrastiņa, iesniegts 09.12.2013., uzturēts

2015.-2016.

13. Latvijas patents Nr.15033, Paņēmiens izvēlēta materiāla piešūšanai HBV core

proteīna veidotajām nanodaļiņām, R. Renhofa, A. Kazāks, A.Dišlers, L.Jackeviča,

V. Ose-Klinklāva, P. Pumpēns, iesniegts 01.2014., uzturēts 2015.-2016.

14. Latvijas patents Nr.15034, Modificēti HBV core nanokonteineri kā universāla

platforma bioloģiska materiāla eksponēšanai, R. Renhofa, I. Cielēns, A. Strods, G.

Kalniņš, D.Priede, V. Ose-Klinklāva, P. Pumpēns, iesniegts 01.2014., uzturēts

2015.-2016.

15. Latvijas patents Nr.14987, Anti-HCV individuālas terapeitiskas vakcīnas prototips,

I. Sominska, J.Jansons, P.Pumpēns, I.Petrovskis, D.Skrastiņa, G.Sudmale, iesniegts

25.09.2013., uzturēts 2015-2016.

16. Latvijas patents Nr.15035, Rekombinanta himēriska polipeptīda kDNS, kas satur

melanokortīna otrā tipa receptora (MC2R) un melanokortīnu receptoru

palīgproteīna (MRAP) secības, un tās izmantošana aktīvo vielu testēšanai un

terapeitiskiem mērķiem, D.Fridmanis, J.Kloviņš, I.Mandrika, R.Petrovska, A.Roga,

iesniegts 27.12.2013., uzturēts 2015.-2016.

17. Latvijas patents Nr.15022, Viena nukleotīda polimorfismu komplekts paaugstināta

vai pazemināta augsta blīvuma lipoproteīna holesterola līmeņa asinīs ģenētiskās

predisponētības noteikšanai, I.Radoviča, D.Fridmanis, L.Ņikitina-Zaķe, J.Kloviņš,

iesniegts 12.12.2013., uzturēts 2015.-2016.

2.3.3. Pieteiktie starptautiskie patenti

2016.gadā netika pieteikti jauni starptautiskie patenti.

2.3.4. Pieteiktie Latvijas patenti

2016.gadā netika pieteikti jauni Latvijas patenti.

32

2.4. Dalība konferencēs

Nr.

p.k. Prezentācijas/ stenda referāta autori Prezentācijas/ stenda referāta nosaukums Konferences nosaukums

Konferences

vieta

Konferences

datums

1.

Meistere I., Zajakins P., Rulle

U., Pismennaja A., Kalniņa

Z., Šantare D., Leja M., Linē A.

Kuņģa vēža pacientu seruma autoantivielu profilēšana,

izmantojot His-Halo rekombinanto vēža antigēnu

mikrorindas

LU 74. zinātniskā konference Rīga, Latvija 01.02.2016.

2. Salmiņa K., Hūna A., Ērenpreisa Je. Kodoliņa agresomu struktūra un veidošanās mehānismi

šūnās ar nesareparētu DNS bojājumu LU 74. zinātniskā konference Rīga, Latvija 01.02.2016.

3. Krigerts J., Salmiņa K., Erenpreisa Je. Interfāzes kodola heterohromatīna telpiskā organizācija:

primārā attēlu analīze LU 74. zinātniskā konference Rīga, Latvija 01.02.2016.

4.

Kazarina A., Gerhards G., Pētersone-

Gordina E., Pole I., Zole E., Vilks

K.,.Capligina V, Jansone I., Ranka R.

Seno cilvēku mikrobioma identifikācija, izmantojot jaunās

paaudzes sekvenēšanu LU 74. zinātniskā konference Rīga, Latvija 01.02.2016.

5.

Zaharenko L., Kalnina I., Geldnere K.,

Konrade I., Grinberga S., Židzik J.,

Javorský M., Lejnieks A., Nikitina-

Zake L., Fridmanis D., Vaivade I.,

Peculis R., Radovica-Spalvina I.,

Hartmane D., Pugovics O., Tkáč I.,

Pīrāgs V., Klovins J.

Polymorphisms nearby SLC22A2 and SLC22A3 are

associated with the efficiency of metformin monotherapy LU 74. zinātniskā konference Rīga, Latvija 19.02.2016.

6. Meškovska L., Baumane K.,

Laganovska G., Ranka R.

Analysis of gene polymorphisms in Latvian patients with

primary open angle glaucoma RSU Studentu konference Rīga, Latvija 16.03.2016.

7. Zadinane K., Zole E., Pole I., Ranka R. Links between mitochondrial DNA and aging RSU Studentu konference Rīga, Latvija 16.03.2016.

8.

Pole I., Jansone I., Šķenders Ģ.,

Nodieva A., Ozere I., Igumnova V.,

Ranka R.

Mycobacterium tuberculosis Austrumāzijas līnijas

genotipiskais raksturojums Latvijā

2016. gada RSU zinātniskā

konference Rīga, Latvija 18.03.2016.

9. Kajuna I., Rovīte V., Ņikitina-Zaķe L.,

Kloviņš J., Mikažāne H., Staņēviča V. Riska alēļu analīze pacientiem ar vēnu trombozēm Latvijā



10. Staņēviča V., Zaķe-Ņikitina L., Zepa L.,

Šantere R., Ščegoļevs A.

Modeling fetal DNA fraction requirements for chr21, chr18

and chr13 trisomy detection using semiconductor

sequencing



33

11.

Vaivode K., Petrovska R., Marska I.,

Brūver R., Magone S., Doniņa S.,

Feldmane G., Pjanova P.

Dubultspiralizēto RNS ex vivo inducētie citokīni 2016. gada RSU zinātniskā


12. Stepanovs J., Ozolina A., Rovite V.,

Mamaja B., Vanags I.

Thrombogenic Risk Factor Assessment and Correlation

with Surgical Outcome after Microvascular Free Flap

Transfer



13. Stepanovs J., Ozolina A., Rovite V.,


Role of Hypercoagulation Detected by Rotational

Thromboelastometry in Prediction of Free Flap Thrombosis

in Patients Undergoing Microvascular Surgery



14. Vaivode K. Dubultspiralizēto RNS ex vivo inducētie citokīni 2016. gada RSU zinātniskā


15. Pjanova D. Immunotherapy of melanoma”, Symposium “Targets of

immunotherapy of chronic viral infections and cancers



16.

Linē A, Ābols A, Zandberga E,

Toleikiene R, Bajo CS, Pūpola D,

Sadovska L, Zayakin P, Riekstiņa U.

Hypoxic cancer-derived EVs contain specific miRNA cargo

and mediate intercellular communication among hypoxic

cancer cells

ISEV 2016 annual meeting Roterdama,

Nīderlande

04.05.2016.

–

07.05.2016.

17. Bērziņš U. Biosafety aspects for clinical applications of adult human

mesenchymal stem cells

European Biotechnology

Congress 2016 Rīga, Latvija

05.05.2016.

-

07.05.2016.

18. Spunde K, Renhofa R, Fjodorovs A,

Vezane A, Kozlovska T.

Investigation of interaction of preS1-addressed virus like

particles with hepatitis B virus receptor NTCP expressed in

mammalian cells



05.05.2016.

-

07.05.2016.

19. Balke I, Resevica G, Kalnciema I,

Zeltina V, Ose V, Zeltins A.

New plant virus-like particles: Construction and

characterization



05.05.2016.

-

07.05.2016.

20.

Burnyte B., Inashkina I., Lace B.,

Pelnena D., Molyte A., Grigalioniene

K., Kucinskas V., Utkus A.

Implementing the survey of disease natural history as a tool

to collect complex information on mitochondrial patients in

Lithuania and Latvia

The European Human Genetics

Conference 2016

Barselona,

Spānija 21.05.2016.

21.

Capligina V., Berzina I., Bormane A.,

Salmane I., Kazarina A., Bandere D.,

Ranka R.

Prevalence and phylogenetic analysis of Borrelia

miyamotoi relapsing-fever group spirochete in Ixodes

ricinus and Ixodes persulcatus ticks in Latvia

3rd Conference on Neglected

Vectors and Vector-Borne

Diseases (EurNegVec)

Zaragoza,

Spānija

24.05.2016.

-

26.05.2016.

34

22. Sominska I. HBV - viral vaccine as the first vaccine against cancer

Symposium „Targets of

immunotherapy of chronic viral

infections and cancer”

Rīga, Latvija

24.05.2016.

-

26.05.2016.

23.

Isaguliants M., Starodubova E., Petkov

S., Kilpeläinen A., Krotova O., Jansons

J. Latyshev O., Tukhvatullin A.,

Logunov D.

Naked DNA as a vehicle in immune prevention and immune

therapy of viral infections




Rīga, Latvija

24.05.2016.

-

26.05.2016.

24.

Dishlers A., Skrastina D., Petrovskis I.,

Ose V., Lieknina I, Jansons J., Pumpens

P., Sominskaya I.

A novel efficient HBV vaccine candidate based on HBc

and preS1 components presented by VLPs




Rīga, Latvija

24.05.2016.

-

26.05.2016.

25.

Jansons J., Dovbenko A., Skrastina D.,

Petkov S., Akopjana I., Stahovska

I.,Isaguliants M., Sominskaya I.

Immunogenicity in mice of plasmid DNA encoding HCV

core and alternative reading frame proteins




Rīga, Latvija

24.05.2016.

-

26.05.2016.

26.

Petkov S., Jansons J., Skrastina D.,

Abakumov M., Gordeychuk I.,

Latanova A., Dovbenko A., Strods A.,

Kalis M., Moriizumi Y., Bankovsky P.,

Verkhusha V., Isaguliants M.

Optimization of naked DNA delivery in human explant

model using reporter genes




Rīga, Latvija

24.05.2016.

-

26.05.2016.

27. Baumanis E., Zole E., Dale R., Leise A.,

Lietuvietis V.

Quantification of mtDNA copy number and telomere length

in benign prostatic hyperplasia patients 3rd EAU Baltic Meeting

Tallina,

Igaunija

27.05.2016.

-

28.05.2016.

28.


Gordina E., Leonova V., Pole .I,

Capligina V., Jansone I., Ranka R.

Metagenomics analysis of archaeological human remains

samples from Medieval Latvia as a primary screening tool

for the identification of pathogen genomes

2nd Conference “Rapid

Microbial NGS and

Bioinformatics: Translation Into

Practice”

Hamburga,

Vācija

09.06.2016.

-

11.06.2016.

29. Vaivode K. Oncolytic ECHO-7 virus effect on different lymphocyte

subpopulations ex vivo and in vivo

4th European Seminar in

Virology “Oncogenic and

Oncolytic Viruses”

Bertinoro,

Itālija

10.06.2016.

-

12.06.2016.

30. Kotelovica K., Dishlers D., Ose V., Tars

K. VLP based vaccine candidates against Lyme borreliosis

3rd meeting on Virus-like

Particles & Nano-particles

Vaccines

Leidene,

Nīderlande

22.06.2016.

-

24.06.2016.

35

31.

Dovbenko A., Petrovska R., Akopjana

I., Jansons J., Stahovska I., Sominskaya

I.

Expression of hepatitis C virus core and ARF protein

variants in eukaryotic system

Vilnius International summit on

Communicable Diseases

Viļņa,

Lietuva

26.06.2016.

-

01.07.2016.

32.

Latanova A., Dovbenko A., Berzina A.,

Hippe L., Strods A., Kalis M.,

Bankovsky P., Yasuhiro M., Isaguliants

M., Jansons J.

Comparing efficacy of elektroporation and lipofection in

eukaryotic cell lines using gene of fluorescent reporter



Viļņa,

Lietuva

26.06.2016.

-

01.07.2016.

33.

Jansons J., Dovbenko A., Skastina D.,

Petkov S., Akopjana I., Stahovska I.,

Akmenkalns G., Isaguliants M.,

Sominskaya I

Immunogenecity in mice of plasmid DNA encoding HCV

core and alternative reading frame proteins



Viļņa,

Lietuva

26.06.2016.

-

01.07.2016.

34.

Sominskaya I., Petrovskis I., Dovbenko

A., Jansons J., Andersone S., Lieknina

I., Stahovska I.

HCV core and its ARFP variants: comparison of expression

levels in E. coli cells and protein immunogenicity



Viļņa,

Lietuva

26.06.2016.

-

01.07.2016.

35.

Pérez-Lago L., Navarro Y., Herranz M.,

Sierra O., Pole I., Ozere I., Comas I.,

Sicilia J., Jesús Ruiz Serrano M., Gijón

P., Bouza E., Garcia de Viedma D.

Evaluation of the acquisition of variability in

Mycobacterium tuberculosis in complex circumstances

involving active transmission and latency periods

Annual Congress of the

European Society of

Mycobacteriology

Sicīlija,

Itālija

03.07.2016.

-

06.07.2016.

36.

Mokrousov I., Vyazovaya A., Iwamoto

T., Skiba Y., Pole I., Zhdanova S.,

Arikawa K., Sinkov V., Valcheva V.,

lvarez Figueroa M., Ranka R., Jansone

I., Ogarkov O., Zhuravlev V.,

Narvskaya o.

Towards global phylogeography and phylogeny of Latin-

American-Mediterranean lineage: Insights from large

deletions and high-resolution Minisatellites


European Society of

Mycobacteriology

Sicīlija,

Itālija

03.07.2016.

-

06.07.2016.

37.

Silamikelis I., Fridmanis F., Radovica-

Spalvina I., Šķenders Ģ., Pole I.,

Jansone I., Ranka R., Klovins J.

Insight in diversity of Mycobacterium tuberculosis strains

from Latvia based on whole genome sequencing


European Society of

Mycobacteriology

Sicīlija,

Itālija

03.07.2016.

-

06.07.2016.

38.

Pole I., Ozere I., Jansone I., Šķenders

Ģ., Nodieva A., Bobrikova O., Lauska

Z., Kristons M., Embrasa L., Igumnova

V., Norvaisa I., Ranka R.

Analysis of M. tuberculosis genotypes in epidemiologically

linked TB patients


European Society of

Mycobacteriology

Sicīlija,

Itālija

03.07.2016.

-

06.07.2016.

36

39.

Vyazovaya A., Mokrousov I., Pole I.,

Solovieva N., Umpeleva T., Skiba Y.,

Al-Hajoj Al-Nakhli S., Varghese B.,

Ludannyy R., Alvarez Figueroa M.,

Šķenders Ģ., Ranka R., Jansone I.,

Zhuravlev V., Narvskaya O.

Multidrug-resistant clone Myсobacterium tuberculosis

LAM SIT252 emerging in some regions of European Russia

and Eastern Europe


European Society of

Mycobacteriology

Sicīlija,

Itālija

03.07.2016.

-

06.07.2016.

40.

Inashkina I., Stavusis J., Micule I.,

Strautmanis J., Naudina M. S.,

Cimbalistiene L., Utkus A., Burnyte B.,

Matuleviciene A., Lace B..

Genotyping versus sequencing in the diagnostics of Limb

Girdle Muscular dystrophies

14th International Congress of

Neuromuscular diseases

Toronto,

Kanāda

05.07.2016.

-

09.07.2016.

41. Pelnena D., Lace B., Micule I.,

Grinfelde I., Inaskina I.

OXPHOS enzyme activity measurements in mitochondria

isolated from peripheral blood leukocytes in control group

and patients with suspected mitochondrial disease

MitoFit Science Camp 2016 Kuehtai,

Austrija

07.07.2016.

-

13.07.2016.

42.

Linē A, Zandberga E, Ābols A, Bajo

CS, Toleikiene R, Zayakin P, Pūpola D,

Shvirksts K, Grube M, Riekstiņa U.

Hypoxic conditions regulate the molecular content, release

and uptake rates of extracellular vesicles produced by

colorectal cancer cells

EACR24 Mančestera,

Lielbritānija

09.07.2016.

-

12.07.2016.

43. Tiškina V., Capligina V., Must K.,

Berzina I., Ranka R., Jokelainen P.

Splenectomized Estonian dog with a fatal Babesia canis

canis infection EMOP XII

Turku,

Somija

20.07.2016.

-

24.07.2016.

44.

Erenpreisa Je., Salmiņa K., Huna A.,

Inashkina I., Belyayev A., Vazquez-

Martin A.

The Nucleolar Aggresome Initiates Autophagic Cell Death

by ‘Destructive Mitosis’

12th International Congress of

Cell Biology

Prāga,

Čehija

21.07.2016.-

25.07.2016.

45. Baumane K., Laganovska G.,

Meskovska L., Ranka R.

Analysis of genetic polymorphisms in operated primary

open angle glaucoma patients in Latvian population

XV Forum

OPHTHALMOLOGICUM

BALTICUM 2016

Rīga, Latvija

19.08.2016.

-

21.08.2016.

46. Ozolina A., Stepanovs J., Rovite V.,


Does hypercoagulation detected by rational

thromboelastography (rotem) improve prediction of free

flap thrombosis in microvascular surgery patients?

16th World Congress of

Anaesthesiologists

Honkonga,

Ķīna

28.08.2016.

–

02.09.2016.

47.


Gordina E., Pole I., Capligina V.,

Jansone I., Ranka R.,

Ancient tuberculosis DNA analysis: possible impact of the

burial environment The 41st FEBS Congress

Kuşadası,

Turcija

03.09.2016.

-

08.09.2016.

37

48.

Petkov S., Jansons J., Skrastina D.,




Verkhusha V.

Near infra-red fluorescent protein iRFP670 as an in vivo

imaging reporter for delivery and immunogenic

performance of naked DNA vaccines

The second international

conference „Mucosal vaccines,

adjuvants & delivery”

Lozanna,

Šveice

14.09.2016.

-

16.09.2016.

49. Ērenpreiss J. Role of plasma membrane Ca2+ ATPase 4 gene in sperm

motility and infertility

9th European Academy of

Andrology Congress

Roterdama,

Nīderlande

21.09.2016.

–

23.09.2016.

50. Baumane K., Meskovska L.,

Laganovska G., Ranka R.

Analysis of genetic polymorphisms in Latvian patients with

primary open angle glaucoma DOG-Kongress 2016

Berlīne,

Vācija

29.09.2016.

-

02.10.2016.

51. Salmina K., Belyayev A., Scherthan H.,

Inashkina I., Erenpreisa J.

Retrotransposition caused and autophagy-aided

heterochromatin release in etoposide treated senescent

teratocarcinoma PA1 cells

2nd Danube Conference on

Epigenetics

Budapešta,

Ungārija

05.10.2016.-

08.10.2016.

52.

Abols A., Santare D., Toleikiene R.,

Zandberga E., Kalnina Z., Vangravs R.,

Takatalo-Laine M., Palviainen M.,

Siljander P., Leja M., Line A.

Carbonic anhydrase ix as the marker of the hypoxia induced

extracellular vesicle secretion.

United European

Gastroenterology Week 2016

Vīne,

Austrija

15.10.2016.

-

19.10.2016.

53.

Kalnina Z., Meistere I., Kupcinskas J.,

Zayakin P., Pismennaja A., Kupcinskas

L., Jonaitis L.V., Leja M., Wu C.-Y.,

Linē A.

The use of cancer-associated autoantibodies as biomarkers

in gastric malignancies

United European

Gastroenterology Week 2016

Vīne,

Austrija

15.10.2016.

-

19.10.2016.

54. Inaskina I., Pelnena D., Micule I.,

Krumina Z., Lace B.

Improvement of diagnosing of patients with suspected

mitochondrial diseases in Latvia

The 13th conference of Asian

Society for Mitochondrial

Reasearch and Medicine

Tokija,

Japāna

30.10.2016.

–

02.11.2016.

55. Lāce B., Pelnēna D., Stāvusis J.,

Jaudzems K., Inaskina I.

Nuclear magnetic resonance spectroscopy role in the

metabolic profiling of mitochondrial diseases

The 13th conference of Asian

Society for Mitochondrial

Reasearch and Medicine

Tokija,

Japāna

30.10.2016.

–

02.11.2016.

56. Pole I., Jansone I., Ozere I., Nodieva A.,

Skenders G., Norvaisa I., Ranka R.

Molecular genotyping of Mycobacterium tuberculosis for

detection of local TB outbreaks in Latvia

First International Forum on TB

in Central and Eastern Europe

Varšava,

Polija

04.11.2016.

-

06.11.2016.

38

57. Erenpreisa J., Krigerts J., Salmina K. Radial, nucleolus-dependent gradient of the chromatin

distribution in active and aging cells

EMBO Conference: From

Functional Genomics to Systems

Biology

Heidelberga,

Vācija

12.11.2016.-

15.11.2016.

58. Sominska I. Protein against DNA, a review of vaccines against hepatitis

B virus

The international conference

"Toolkits for DNA vaccine

design, an update"

Maskava,

Krievija

17.11.2016.

-

21.11.2016.

59.

Dovbenko A., Jansons J., Skastina D.,

Petkov S., Stahovska I., Isaguliants M.,

Sominskaya I.

Comparison of immunogenicity of HCV core and its

alternative reading frame protein in mice



design, an update"

Maskava,

Krievija

17.11.2016.

-

21.11.2016.

60.

Jansons J., Petkov S., Skrastina D.,




Verkhusha V., Isaguliants M.

Delivery and immunogenic performance of naked DNA

vaccines visualized by in vivo imaging of a novel

nearinfrared fluorescent reporter



design, an update"

Maskava,

Krievija

17.11.2016.

-

21.11.2016.

61.

Zajakina A., Ķūrēna B., Skrastiņa D.,

Vežāne A., Yin S., Riabov V.,

Kzhyshkowska J.

Development of Gene Therapy Vectors for Functional

Programming of Tumor-associated Macrophages

World Congress on Cancer

Research & Therapy Miami, ASV

21.11.2016.

-

23.11.2016.

62. Elbere I. Association of metformin treatment with gut microbiome

dysbiosis in healthy volunteers

2nd Annual European

Microbiome Congress

Londona,

Lielbritānija

30.11.2016.-

01.12.2016.

63. Zandberga E., Orlova V., Siliņa K.,

Isajev S., Sperga M., Linē L.

Carbonic Anhidrase IX Contributes to the Induction of

Immunosupressive Microenvironment in Triple-Negative

Breast Cancer

2nd Symposium on Advances in

Cancer Immunology and

Immunotherapy

Atēnas,

Grieķija

15.12.2016.

–

17.12.2016.

39

2.5. Akadēmisko un kvalifikācijas darbu izstrāde

2.5.1. Izstrādātie un aizstāvētie promocijas darbi

1. A.Bogdanova-Jātniece „No cilvēka taukaudiem iegūtu cilmes šūnu augšanas

īpašību, marķieru ekspresijas un diferenciācijas spēju raksturojums”, darba

vadītājs – Dr.habil.biol. T.Kozlovska.

2. J.Vasiļevska „Alfavīrusu vektori kā gēnu piegādes līdzeklis vēža terapijai”, darba

vadītājs - Dr.biol. A.Zajakina.

2.5.2. Izstrādātie un aizstāvētie maģistra darbi

1. A.Eihentāle „ Y hromosomas filoģenētiskās struktūras izpēte baltu un austrumslāvu

populāciju kontekstā”, darba vadītājs – Dr.biol. L.Pliss.

2. B.Ķūrēna „Vēža imūnterapijas alfavīrusu vektoru izstrādāšana makrofāgu

aktivācijai”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Zajakina, Dr. Alexandre Corthay (Oslo

University Hospital).

3. E.Černooka „Bakteriofāga Enc34 replikācijas moduļa proteīnu ekspresija,

attīrīšana un raksturošana”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Kazāks.

2.5.3. Izstrādātie un aizstāvētie bakalaura darbi

1. J.Pjalkovskis „ Hepatīta B Vīrusa G genotipa serdes antigēna veidoto vīrussveidīgo

daļiņu raksturošana”, darba vadītājs – Mg.biol. I.Liekniņa.

2. I.Petrovska „ Kolistīna rezistentoindikatorbaktēriju rezistences raksturojums,

izmantojot mikrobioloģijas un molekulārās bioloģijas metodes”, darba vadītājs –

Dr.biol. A.Dišlers.

3. U.N.Dubova „HBV kapsīdu savākšanās inhibīcija ar mazmolekulāriem

savienojumiem”, darba vadītājs – Dr.biol. K.Spunde.

4. L.Voškāne „Laboratorijā pieejamo metožu validācija un optimizācija prenatālo

diagnožu skrīningam”, darba vadītājs – Mg.biol. J.Stāvusis.

5. V.Pancakova „ Listeria monocytogenes transpeptidāzes Sortāzes A inhibitoru

atlase izmantojot uz fluorescences rezonanses enerģijas pārnesi (FRET) bāzētu

skrīningu”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Leončiks.

6. D.Pūpola „Ogļskābes anhidrāzes IX ietekme uz signālceļiem krūts vēža šūnu

līnijās”, darba vadītājs – Mr.biol. E.Zandberga.

7. L.Mandrika „Dubultspiralizēto RNS modulējošās īpašības perifēro asiņu

mononukleārās šūnās un audzēju šūnās”, darba vadītājs – Mg.biol. K.Vaivode.

8. I.Bobrova „ Izmaiņas augsta un vidēja riska gēnos gados jauniem melanomas

pacientiem”, darba vadītājs – Dr.biol. D.Pjanova.

9. A.Ogriņa „Bromoviridae dzimtas augu vīrusa nanodaļiņu konstruēšana un

raksturošana”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Zeltiņš, Dr.biol.I.Baļķe.

10. I.Barkovska „Bromoviridae dzimtas augu vīrusu apvalka proteīnu N-terminālo

daļu īpašību pētījumi”, darba vadītājs – Dr.biol. A.Zeltiņš, Dr.biol.I.Baļķe.

11. U.Krūmiņa „Ģenētiskās izmaiņas pārmantotās melanomas pacientiem Latvijā”,

darba vadītājs – Dr.biol. D.Pjanova.

40

2.6. Organizētās konferences, kursi, semināri un vieslektoru uzstāšanās BMC

1. Seminārs “Novel approaches in cancer treatment”, 31.05.2016.

2. Dr. El Habib Dakir (Bredfordas Universitāte) vieslekcija „Targeting RAN-GTP's in

breast cancer metastasis”, 07.10.2016.

3. Kursi „From blood to sequence” (7.IP projekta Nr.313010 „BBMRI-Large

Prospective Cohorts” (BBMRI-LPC)” ietvaros), 28.11.2016.-02.12.2016.

4. Prof. Luis Antunes (University of Trás-os-Montes and Alto Douro, Porto,

Portugāle) vieslekcija “Design and Conduct of Animal Experiments - The

Economics of Reproducibility in Preclinical Research”, 02.12.2016.

2.7. Cita institūtam būtiska informācija

2016.gada 26.maijā svinīgi

tika atklāts jaunais Biomedicīnas

tehnoloģiju komplekss, kurā ir

izvietots Šūnu bioloģijas bloks un

Dzīvnieku laboratorijas bloks.

Šāds komplekss, kas ir vienīgais

Latvijā, ir aprīkots ar īpašu

ventilācijas un drošības sistēmu,

kas paver iespējas Latvijā veikt

pētījumus pasaules līmenī

sadarbojoties ar ārzemju

labākajiem zinātniekiem, kā arī nodrošināt Latvijas vadošo augstskolu studentu

apmācību.

2016.gada augustā Latvija tika

uzņemta Eiropas pētniecības

infrastruktūras konsorcijā BBMRI-

ERIC (Biobanking and BioMolecular

resources Research Infrastructure -

European Research Infrastructure

Consortium). BMC ir nominēts īstenot

nacionālā mezgla funkciju, savukārt

direktors Jānis Kloviņš ir nominēts kā

nacionālais koordinators.

2016.gada 12.septembrī LZP priekšsēdētāju tika tika ievēlēts BMC direktors

Dr.biol. Jānis Kloviņš.

2016.gada 30.septembrī BMC notika

gadskārtējā Zinātnieku nakts, kura tika

organizeta kvesta veidā ar moto – “Veselā

miesā vesels gars!”. Zinātieku nakts

apmeklētāji BMC varējo noklausīties gan

izglītojošu lekciju, gan paši piedalīties

eksperimentos un datu analīzē.

41

2016.gada 24.novembrī par

Latvijas Zinātņu akadēmijas

korespondētājlocekli tika ievēlēts

BMC Zinātniskās padomes

priekšsēdētājs Dr.biol. Andris

Zeltiņš.

42

3. FINANŠU RESURSI UN TO IZLIETOJUMS

2016. gadā lielākais finanšu ieņēmumu avots, kas sastāda aptuveni 33.02% no

visiem BMC ieņēmumiem, ir piešķirtais zinātniskās darbības bāzes finansējums,

savukārt otrs lielākais ienākumu avots bija ES struktūrfondu iepriekšējā plānošanas

perioda projektu gala maksājuma pieprasījumu atmaksa, kas sastāda 17.48% no

kopējiem BMC ieņēmumiem. Tam seko LZP finansēto grantu un sadarbības projektu

finansējums – 12.91%, pārējais valsts budžeta finansējums (ERA-NET projekti,

Latvijas-Lietuvas-Taivānas sadarbības fonda projekti, 7.IP projektu valsts budžeta

līdzfinansējums, Valsts iedzīvotāju genoma datu bāzes īstenošana, u.c. projekti) –

10.38%, NFI finansējums – 10.27%, VPP īstenošana – 7,53%, starptautiskais

finansējums (piemērām, 7.IP un līgumdarbi starptautiskām juridiskām personām) –

5.95%, ieņēmumi no citām saimieciskām darbībām – 1,78% un ieņēmumi no

līgumdarbiem ar LR juridiskām personām – 0.67% no BMC kopējiem finanšu

līdzekļiem. Sīkāku finansējuma sadalījumu pa finansējuma avotiem var aplūkot

1.tabulā.

1. tabula BMC zinātniskās darbības finansējums, EUR

Ieņēmumu veids

Gads

2013 2014 2015 2016

Finansējums (kopā) 4795.9 4559.0 4909.9 3486.5

Valsts budžeta finansējums (kopā) 4393.2 4126.1 4271.0 3193.7

Eiropas Savienības struktūrfondu finansējums

zinātniskajai darbībai (kopā) 3090.3 2605.2 1890.5 609.6

ESF 1.1.1.2.0. aktivitātes projektu finansējums 99.2 430.8 450.5 0

ERAF 2.1.1.1.0. aktivitātes projektu finansējums 1469.4 952.1 1094.8 0.2

ERAF 2.1.1.2.0. aktivitātes projektu finansējums 16.4 0 45 0

ERAF 2.1.1.3.1. aktivitātes projektu finansējums 1505.3 1222.3 0 501.7

ERAF 2.1.1.3.3. aktivitātes projektu finansējums 0 0 300.2 107.7

NFI projektu finansējums 0 0 357 358.2

LZP granti un cits LZP finansējums 452.9 398.2 450.1 450.1

Zinātniskās darbības bāzes finansējums 458.3 666.2 1030.3 1151.3

Valsts pētījumu programmu finansējums 307.3 259.8 253.6 262.5

Pārējais valsts budžeta finansējums 84.4 196.7 289.5 362.0

Finansējums no starptautiskiem avotiem (kopā) 169.9 316.8 442.9 207.6

7.ietvara programma un cits starptautiskais finansējums 103.3 210.4 125.6 0

Ieņēmumi no līgumdarbiem ar ārvalstu juridiskām

personām 66.6 106.4 317.3 24.4

Ieņēmumi no līgumdarbiem ar Latvijas Republikas

juridiskām personām 136.5 54.3 86.5 23.2

Cits finansējums zinātniskai darbībai (kopā) 96.3 61.8 109.5 62.0

Ieņēmumi no citām saimnieciskām darbībām 96.3 61.8 109.5 62.0

2.tabulā var aplūkot ar saimniecisku darbību nesaistīta finansējuma izlietojumu,

savukārt 3.tabulā var aplūkot ar saimniecisku darbību saistīta finansējuma izlietojumu.

43

2.tabula Ar saimniecisku darbību nesaistīta finansējuma izlietojums, EUR

Izdevumu veids

Izdevumu

finansēšanas

klasifikācijas

kods

Apgūtais finansējums

2013 2014 2015 2016

Izdevumi kopā (1000-4000; 6000-

7000. + 5000;9000.rinda) 1000-9000 4460.0 3220.0 5592.6 2828.5

Uzturēšanas izdevumi 1000-4000;

7000 3921.6 2339.3 3271.7 2516.5

Kārtējie izdevumi (1000. +

2000.rinda) 1000-2000 3905.8 2289.5 3174.8 2441.6

Atlīdzība 1000 2333.5 1665.8 2014.5 1553.3

no tā – zinātniskai darbībai 1100 2283.7 1323.5 1618.6 1237.7

Preces un pakalpojumi 2000 1569.3 623.7 1160.3 888.3


Procentu izdevumi (4000.rinda) 4000 0.0 2.2 1.2 1.4


Uzturēšanas izdevumu transferti,

pašu resursu maksājumi

(7000.rinda)

7000 3.0 47.6 95.7 73.5


Kapitālie izdevumi (5000.rinda) 5000; 9000 554.2 880.7 2320.9 312.0

Pamatkapitāla veidošana 5000 554.2 880.7 2320.9 312.0


3.tabula Ar saimniecsku darbību saistīta finansējuma izlietojums, EUR

Izdevumu veids

Izdevumu

finansēšanas

klasifikācijas

kods

Apgūtais finansējums

2013 2014 2015 2016

Izdevumi kopā (1000-4000; 6000-

7000. + 5000; 9000.rinda) 1000-9000 20.5 422.5 444.4 400.0

Uzturēšanas izdevumi 1000-4000 15.7 377.9 380.1 397.1

Kārtējie izdevumi (1000 +

2000.rinda) 1000-2000 15.7 377.9 380.1 397.1

Atlīdzība 1000 0.0 277.9 238.0 245.9


Preces un pakalpojumi 2000 15.7 100.0 142.1 151.2


Kapitālie izdevumi (5000.rinda) 5000; 9000 4.8 44.6 64.3 2.9

Pamatkapitāla veidošana 5000 4.8 44.6 64.3 2.9


44

4. PERSONĀLS

Vidēji mēnesī 2016.gadā darba tiesiskās attiecības bija nodibinātas ar 140

nodarbinātajiem, no kopējā nodarbināto skaita – 13.6% sastāda administratīvais

personāls.

2016.gadā ar 17 nodarbinātajiem tika uzsāktas darba tiesiskās attiecības. Ar 27

nodarbinātajiem tika beigtas darba tiesiskās attiecības, no kuriem 33% turpināja

zinātnisko darbību ārvalstīs.

2016.gada zinātniskā personāla izmaiņas: 3 zinātniskie asistenti tika ievēlēti

par pētniekiem un 2 dabaszinātņu labotanti – par zinātniskiem asistentiem.

2016.gadā doktora zinātnisko grādu bioloģijā aizstāvēja 2 nodarbinātie un 2

nodarbinātie ieguva maģistra grādu dabaszinātnēs.

1. Zinātniskā personāla raksturojums

Zinātnē nodarbinātais personāls iedalās: Zinātniskajā personālā un Zinātniski

tehniskajā personālā.

Zinātniskajā personālā (direktors, zinātniskais direktors, studiju direktors,

vadošie pētnieki, pētnieki un zinātniskie asistenti) kopā nodarbināti vidēji mēnesī 103

darbinieki. Zinātniskā personāla vidējais vecums – 41,12 gadi. No zinātniskā personāla

darbiniekiem 74 sievietes (vidējais vecums 40,66 gadi, salīdzinot ar 2015.gadu

samazinājies par 3,6 % ) un 29 vīrieši (vidējais vecums 41,58 gadi, salīdzinot ar

2015.gadu palielinājies par 4,11%).

Zinātniskajā personālā nodarbināti 45 darbinieki ar doktora grādu bioloģijā vai

medicīnā (no tiem 16 vīrieši un 29 sievietes), 56 darbinieki ar maģistra grādu vai

augstāko profesionālo izglītību (no tiem 13 vīrieši un 43 sievietes), savukārt 2 darbinieki

ar bakalaura grādu (2 sievietes).

Zinātniskā personāla sadalījuma pa amatiem:

Vadošie pētnieki – 27 (no tiem 11 vīrieši un 16 sievietes);

Pētnieki un pētnieka v.i. – 28 (no tiem 11 vīrieši un 17 sievietes);

Zinātniskie asistenti – 48 (no tiem 10 vīrieši un 38 sievietes).

Zinātnes tehniskajā personālā (datu ievades operators, biotehnoloģisko

procesu operators, laboratorijas dzīvnieku kopējs un dabaszinātņu laboranti) nodarbināti

vidēji mēnesī 22 darbinieki. Zinātnes tehniskā personāla vidējais vecums 31,83 gadi.

No zinātnes tehniskā personāla darbiniekiem 15 sievietes (vidējais vecums 32,87 gadi,

salīdzinot ar 2015.gadu ir pieaudzis par 11,53 %) un 7 vīrieši (vidējais vecums 30,79

gadi, salīdzinot ar 2015.gadu samazinājies par 1,16 %).

No zinātnes tehniskajā personālā nodarbinātajiem darbiniekiem, 15 darbinieki

ir ar bakalaura grādu (11 sievietes un 4 vīrieši).

2. Administratīvā personāla raksturojums:

BMC administrācijā vidēji nodarbināti 18 darbinieki. Administratīvā personāla

vidējais vecums - 47,42 gadi (salīdzinot ar 2015.gadu samazinājies par 8.3 %). No

administratīvā personāla darbiniekiem 8 personām ir maģistra grāds vai augstākā

izglītība.

Personāla rotācijas koeficients BMC 2016.gadā – 0,32.

45

5. ATTĪSTĪBAS PERSPEKTĪVAS 2017.GADĀ

2017.gadā tiks turpināts mērķtiecīgs darbs pie BMC Attīstības stratēģijas 2015.-

2020.gadam īstenošanas.

1. Pētniecības programmas īstenošana

2017. gadā BMC zinātniskajās grupās tiks turpināta darbība visos piecos

zinātniskās pētniecības virzienos un to ietvaros tiks turpināti vairāki iepriekšējos

periodos uzsāktie zinātniskie projekti:

četri LZP sadarbības projekti (Nr.593/2014, Nr.625/2014, Nr.651/2014,

Nr.672/2014);

divi 7.ietvara programmas projekti (Nr.313010, Nr.602437);

Valsts pētījumu programma BIOMEDICINE;

divi Latvijas-Lietuvas-Taivānas zinātniskās sadarbības fonda projekti;

divi Norvēģijas finanšu instrumenta līdzfinansētie projeki;

trīs ERA-NET projekti;

viens Zviedrijas institūta finansētais Baltijas jūras reģiona sadarbības

projekts;

Valsts iedzīvotāja genoma datu bāzes projekta īstenošana.

BMC ir bijis sekmīgs ERAF 1.1.1.1.pasākuma “Praktiskas ievirzes pētījumi”

1.atlases kārtā, kuras ietvaros 2017.gadā tiks uzsākta desmit jaunu projektu īstenošana

– septiņi individuāli īstenoti projekti, divi kā vadošajam partnerim (sadarbības partneris

– LU) un viens projekts kā sadarbības partnerim (vadošais partneris – DU).

Tiek plānots, ka 2017.gadā tiks uzsākta arī vairāku ERAF 1.1.1.2.pasākuma

“Pēcdoktorantūras pētniecības atbalsts” 1.atlases kārtas projekti, jo 2016.gada nogalē

BMC iesniedza kopumā deviņus projekta iesniegumus.

2017. gadā tiks turpināts darbs pie jaunu projektu pieteikumu gatavošanas, tai

skaitā Horizon 2020 un citu projektu grantu shēmās.

2. Institucionālā attīstība

2017.gada nogalē tiek plānota otrā BMC Starptautiskās konsultatīvās padomes

vizīte, kurā padome izvērtēs BMC pētniecības programmas īstenošanu par pēdējiem

divem gadiem.

Starptautiskās konkurētspējas paaugstināšanai BMC plāno turpināt un attīstīt

sadarbību ar vietējiem un ārzemju partneriem, lai nodrošinātu precīzu līgumdarbu

izpildi. Īpaši paredzēts turpināt strādāt pie līgumpētījumu apjoma palielināšanas

biotehnoloģijas nozarē uzsākot jaunus projektus sadarbībā ar ārzemju kompānijām

cilvēku un dzīvnieku vakcīnu izstrādes jomā.

BMC strādājošo studentu turpmākai zinātnieku karjeras un iemaņu attīstībai,

plānots izveidot studentu pašpārvaldi.

3. Cilvēkresursu attīstība

Jauna zinātniskā personāla piesaistei plānots turpināt atbalstīt perspektīvos

studentus, nodarbinot tos BMC īstenotajos pētniecības projektos, spējīgāko atalgošanai

paredzot finansējumu no BMC pieejamajiem finanšu līdzekļiem.

46

Plānots, ka ERAF 1.1.1.2.pasākuma “Pēcdoktorantūras pētniecības atbalsts”

1.kārtas iesniegumu pozitīva rezultāta gadījumā darbam BMC tiks piesaistīts ārvalstu

pētnieks, tādējādi sekmējot starptautiskā zinātniskā personāla mobilitāti.

4. Infrastruktūras un starpinstitucionālās sadarbības attīstība

2017.gadā tiks sagatavots un uzsākts projekts ERAF 1.1.1.4.pasākuma “P&A

infrastruktūras attīstīšana viedās specializācijas jomās un zinātnisko institūciju

institucionālās kapacitātes stiprināšana” ietvaros. Projekts pilnveidos jau ES

struktūrfondu iepriekšējā plānošanas periodā Farmācijas un biomedicīnas valsts

nozīmes pētniecības centra ietvaros izveidotā Biomedicīnas tehnoloģiju kompleksa

infrastruktūras objekta funkcionalitāti, kā arī ievērojami paaugstinās BMC zinātnisko

kapacitāti. Projekta rezultātā tiks pilnveidots Laboratorijas dzīvnieku servisa centrs,

Šūnu kultūru un mikroskopijas servisa centrs, no jauna izbūvēts un aprīkots Genoma

centra biobankas komplekss, kā arī iegādātas iekārtas Eksperimentālās

biotehnoloģiskās ražošanas laboratorijai un Bioinformātikas servisa centram. Papildus

projekta ieguldījumiem, BMC no piešķirtā zinātniskās darbības bāzes finansējuma

turpinās stiprināt 2016.gadā pētniecisko atbalsta vienību (core facilities) darbību.

Tāpat tiks turpināts darbs pie Nacionālā biobanku tīkla izveides, kas BBMRI-

ERIC struktūrā veidos biomedicīnas pētījumu pamatresursu ar būtisku ietekmi Baltijas

reģionā un Eiropā kopumā.

5. Izglītība un publicitāte

2017. gadā paredzēts turpināt bakalauru, maģistratūras un doktorantūras

studentu zinātnisko darbu izstrādes nodrošināšanu BMC speciālistu vadībā. Ar

augstākās izglītības iestādēm plānots apspriest sadarbības iespējas par jaunu studiju

programmu izveidi BMC zinātniskās pētniecības virzienu ietvaros.

2016 - LU · 2017. 6. 14. · medicīnas grupa Medicīniskās ģenētikas un mitohondriju...

Documents

Transcript of 2016 - LU · 2017. 6. 14. · medicīnas grupa Medicīniskās ģenētikas un mitohondriju...