MATERI OLIMPIADE BIOLOGI SMA (PART 1)

CELLS AND MOLECULAR

putrasantoso26@gmail.com

PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

buffer

Cathode(negative)

Anode(positive)

PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNANDputrasantoso26@gmail.com

• DNA is negatively charged.

• When placed in an electrical field, DNA will migrate toward the positive pole (anode).

• An agarose gel is used to slow the movement of DNA and separate by size.

Scanning Electron Micrograph of

Agarose Gel (1×1 µm)

• Polymerized agarose is porous,

allowing for the movement of DNA

How fast will the DNA migrate?strength of the electrical field, buffer, density of agarose gel…

Size of the DNA!*Small DNA move faster than large DNA…gel electrophoresis separates DNA according to size

smalllarge

Within an agarose gel, linear DNA migrate inversely proportional to the log10 of their molecular weight.PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA

UNANDputrasantoso26@gmail.com

wells Bromophenol Blue

Cathode(-)

Anode(+)

DNA(-)

Ethidium Bromide requires an ultraviolet light source to visualize

PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND putrasantoso26@gmail.com

Visualizing the DNA (ethidium bromide)

100 200 300

1,650 1,000

850 650

5,000 bp 2,000

DNA ladder

PCR Product

1 2 3 4 5 6 7 8wells

+ - - + - + + -

Samples # 1, 4, 6 & 7 were positive for Wolbachia DNA

Primer dimers

PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND putrasantoso26@gmail.com

100 200 300

850 650

12,000 bp

DNA Ladder Standard

Inclusion of a DNA ladder (DNAs of know sizes) on the gel makes it easy to determine the sizes of unknown DNAs.

DNAmigration

bromophenol blue

Note: bromophenol blue migrates at approximately the same rate as a 300 bp DNA molecule

INTERPRETASI HASIL ELEKTROFORESIS

POLA PITA (BAND) MPK CERMINAN BERAT MOLEKUL (JARAK MIGRASI)

BM SAMA : JARAK MIGRASI SAMA (V. versa)BM RINGAN : MIGRASI JAUH (V.versa)

JUMLAH PITA MENCERMINKAN JUMLAH SUBUNIT MOLEKUL YANG DIANALISIS (EX.JML FRAGMEN

1. Material DNA dari masing-masing individu dipotong dengan enzimrestriksi. Hasil pemotongannya dipisahkan menggunakan agar elektroforesis sbb :

Maka pernyataan yang benar berkenaan dengan interpretasi hasil Elektroforesis disamping adalah :

A. Kesemua individu adalah satu orangB. Individu 3 mungkin adalah anak dari indv. 2 dan 4C. Indv. 2 mungkin adalah anak dari 1 dan 3D. Indv. 1 mungkin adalah anak dari 2 dan 3E. Indv. 1 mungkin adalah anak dari 3 dan 4

RX1 (BAM HI+HIindIII) : 800 bp dan 600 bp

RX2 (BAM HI+EcoRI) : 1200 bp dan 400 bp

RX3 (HIindIII+EcoRI) : 1400 bp dan1000bp, 400 bp PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNANDputrasantoso26@gmail.com

Teknik Blotting

Mendeteksi keberadaan fragmen-fragmen tertentu dari suatu material (DNA, RNA, protein, modified protein) dengan menggunakan detektor berupa probe yang komplementer dengan fragmen yang diinginkan

• Dasar teknik : elektroforesis dan fluorosensi

BLOTTING TECHNIQUE

Southern blot : DNA

Northern blot : RNA

Western blot : Protein

Eastern blot : PTMP

DNA/RNA

atbPUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

ENZIM RESTRIKSI

sisi pengenalan probe 28s sisi pengenalanprobe 18s

Hap. A 1-2 : 1.5 kb

2-3 : 2.0 kb

3-4 : 1.0 kb

4-5 : 4 .0 kb

BM Hap.A Hap.B Hap.C hap.D

SEBAGIAN DNA TELAH HILANG PADA SEL TUMOR DIBANDINGKAN SEL NORMAL

HIPOTESIS : PERUBAHAN PERKEMBANGAN PADA DUA JARINGAN DIATUR PD TKT TRANSKRIPSI

SEL-SEL DITRANSFEKSI DENGAN PLASMID UTK SUATU PROTEIN REKOMBINAN (mRNA GEN RK---PROTEIN TOTAL--PROTEIN KHSUS)

TERJADI PERUBAHAN PASCA TRANSLASI DARI PROTEIN (ANALISIS APA??)

P1 : ACTIVATED BY STEROID

P2 : NO STEROID

mRNA panjang

mRNA pendek

BM .... migrasi??

WESTERN ANALYSIS

CHECK POINT SYSTEMPUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

GEN RICIN DARI RicinuscommunisPUTRA SANTOSO, BIO FMIPA

UNANDputrasantoso26@gmail.com

LIGASE

APOPTOSIS (CDP)

NECROSIS

Smac : Second mitocondrialactivating caspase

IAPs: Inhibitor Apoptosis Proteins

Apaf-1 : Apoptosis protein activating factor-1

OPERON : GEN STRUKTURAL (SISTRON) + SITUS PENGONTROL + TERMINATOR

SEKUENSKONSENSUS

OPERON POLISISTRONIK: OPERON DGN > 1 SISTRON

KUNCI : SEKUENS KONSENSUS (TITIK AWAL TRANSKRIPSI SETELAH SEKUENS TSB)PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

CANCERTUMOR

Tumor suppressor gene atau anti-oncogene : gen yang melindungi selterhadap perubahan ke arah kanker

Onkogen : gen yang jika terpicu akanmenyebabkan sel berkembang menjadikanker

Ekspresi gen supresor tumor bersifatresesif sedangkan onkogen bersifatdominan

Two-hit hypothesis oleh A.G Knudson

GEN REPRESOR

GEN SUPRESOR

ONCOGEN

TUMOR DAN KANKER

KANKER

TWO HITS HYPOTHESIS

(SUPRESOR GENE)VS ONCOGEN

NEW TRAND IN CANCER THERAPHY

Variable Number Tandem Repeat (or VNTR)

Schematic of a Variable Number of Tandem Repeats in 4 alleles.

ALEL VNTR 1 VNTR 21 0.2 0.12 0.4 0.13 0.3 0.24 0.1 0.6

OrganismeOrganisme AA GG CC TT

Escherichia coliEscherichia coli 24,724,7 26,026,0 25,725,7 23,623,6

KhamirKhamir 31,331,3 18,718,7 17,117,1 32,932,9

GandumGandum 27,327,3 22,722,7 22,822,8 27,127,1

SalmonSalmon 29,729,7 20,820,8 20,420,4 29,129,1

AyamAyam 28,828,8 20,520,5 21,521,5 29,329,3PUTRA SANTOSO, BIO FMIPA UNAND

NORTHERN BLOT WESTERN BLOT

TREATMENT : UPR

CONTROL : FPR

POINT MUTATION

MIKROBA TERMOFILIK

MATERI OLIMPIADE BIOLOGI SMA (PART 1)

Education

Transcript of MATERI OLIMPIADE BIOLOGI SMA (PART 1)

20282797 Panduan Olimpiade Matematika Sma

prediksi soal olimpiade biologi

Kisi kisi olimpiade SMA

buku soal olimpiade biologi tingkat nasional edisi-?

Olimpiade Sains Nasional Biologi Smp

Soal Olimpiade Biologi Propinsi 2004. A

BIOLOGI SMA

OLIMPIADE SAINS BIOLOGI

[Www.indowebster.com]-Seleksi Olimpiade Biologi 2012

Pembahasan Soal OSK SMA 2017€¦ · Pembahasan Soal OSK SMA 2017 OLIMPIADE SAINS KABUPATEN SMA 2017 OSK Matematika SMA (Olimpiade Sains Kabupaten Matematika SMA) Disusun oleh: Pak

Olimpiade Biologi Pengamatan Mikroskopis

Pembahasan Soal OSK SMA 2018 - matikzone.files.wordpress.com · Pembahasan Soal OSK SMA 2018 OLIMPIADE SAINS KABUPATEN/KOTA SMA 2018 OSK Matematika SMA (Olimpiade Sains Kabupaten/Kota

soal olimpiade biologi 2009

Rangkuman Biologi SMA

Biologi Sma Biologi Sma 2

SILABUS OLIMPIADE SAINS NASIONAL 2010 - · PDF fileSILABUS OLIMPIADE SAINS NASIONAL 2010 Biologi ... Biologi, Fisika, Matematika, ... Reproduksi*) Mengetahui dan memahami sel,

Sukses olimpiade biologi

Molecular biology olimpiade biologi

KUMPULAN SOAL PREDIKSI OLIMPIADE BIOLOGI UDAYANA

Ptk Biologi Sma