Bioinf lecture1

Post on 22-May-2015

885 views 6 download

Transcript of Bioinf lecture1

Биология за 1 пару

Николай Вяххиvyahhi@bioinformaticsinstitute.ru

Computer Science ClubСанкт-Петербург, 2013

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Формат обучения

воскресенье, 24 февраля 13 г.

12 лекций по воскресеньям

Квизы для самопроверки

Домашние задания и вопросы онлайн

http://rosalind.info/classes/enroll/ff45302de4/

Формат обучения

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Сегодня

ДНК

РНК

Белки

Геномика

Протеомика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

ДНК

Двойная спираль

Нуклеотиды:

A = T

C ≡ G

Мера длины: bp (base pair)

воскресенье, 24 февраля 13 г.

ДНК

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Направление ДНК

➡ CCCAGAACTGAGATCAAT ➡

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Направление ДНК

⬅ GGGTCTTGACTCTAGTTA ⬅➡ CCCAGAACTGAGATCAAT ➡

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Репликация

ДНК → 2 x ДНКвоскресенье, 24 февраля 13 г.

РНК

Одна цепь

Рибонуклеотиды:

A = U

C ≡ G

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Транскрипция

ДНК → РНК

T → U

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Белки / Протеины

Аминокислоты (20):

ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY

Функции: структурная, ферментативная, рецепторная, гормональная, транспортная, сократительная, защитная.

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Структура белка

1. Последовательность

2. α-спираль / β-лист

3. Трёхмерная структура

4. Комплекс

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Трансляция

РНК → Белок

3 нуклеотида (кодон) → 1 аминокислота (aa)воскресенье, 24 февраля 13 г.

Центральная Догма

воскресенье, 24 февраля 13 г.

ОмикиГеном — все ДНК организма.

Транскриптом — все РНК организма.

Протеом — все белки организма.

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Геном человека

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Геномы

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Чтение геномов

воскресенье, 24 февраля 13 г.

ГеномикаAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGTGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCACCTGGTGGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGCCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTTTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGGTTCCCGCTGGCGCAATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATTAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTATGGCCGGCGTATTAGAAGCGCGCGGTCACAACGTTACTGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATTGCTGAGTCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGATCACATGGTGCTGATGGCAGGTTTCACCGCCGGTAATGAAAAAGGCGAACTGGTGGTGCTTGGACGCAACGGTTCCGACTACTCTGCTGCGGTGCTGGCTGCCTGTTTACGCGCCGATTGTTGCGAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATACCTGCGACCCGCGTCAGGTGCCCGATGCGAGGTTGTTGAAGTCGATGTCCTACCAGGAAGCGATGGAGCTTTCCTACTTCGGCGCTAAAGTTCTTCACCCCCGCACCATTACCCCCATCGCCCAGTTCCAGATCCCTTGCCTGATTAAAAATACCGGAAATCCTCAAGCACCAGGTACGCTCATTGGTGCCAGCCGTGATGAAGACGAATTACCGGTCAAGGGCCGGGACTCGCCCG

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Аннотации

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Геном человека

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Сравнительная геномика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Филогения

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Протеомика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Масс-спектрометрия

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Pathways

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Сегодня

ДНК

РНК

Белки

Геномика

Протеомика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

12 лекций по воскресеньям

Квизы для самопроверки

Домашние задания и вопросы онлайн

http://rosalind.info/classes/enroll/ff45302de4/

Формат обучения

воскресенье, 24 февраля 13 г.