Bioinf lecture1

29
Биология за 1 пару Николай Вяххи [email protected] Computer Science Club Санкт-Петербург, 2013 воскресенье, 24 февраля 13 г.

Transcript of Bioinf lecture1

Page 1: Bioinf lecture1

Биология за 1 пару

Николай Вяххи[email protected]

Computer Science ClubСанкт-Петербург, 2013

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 2: Bioinf lecture1

Формат обучения

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 3: Bioinf lecture1

12 лекций по воскресеньям

Квизы для самопроверки

Домашние задания и вопросы онлайн

http://rosalind.info/classes/enroll/ff45302de4/

Формат обучения

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 4: Bioinf lecture1

Сегодня

ДНК

РНК

Белки

Геномика

Протеомика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 5: Bioinf lecture1

ДНК

Двойная спираль

Нуклеотиды:

A = T

C ≡ G

Мера длины: bp (base pair)

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 6: Bioinf lecture1

ДНК

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 7: Bioinf lecture1

Направление ДНК

➡ CCCAGAACTGAGATCAAT ➡

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 8: Bioinf lecture1

Направление ДНК

⬅ GGGTCTTGACTCTAGTTA ⬅➡ CCCAGAACTGAGATCAAT ➡

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 9: Bioinf lecture1

Репликация

ДНК → 2 x ДНКвоскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 10: Bioinf lecture1

РНК

Одна цепь

Рибонуклеотиды:

A = U

C ≡ G

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 11: Bioinf lecture1

Транскрипция

ДНК → РНК

T → U

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 12: Bioinf lecture1

Белки / Протеины

Аминокислоты (20):

ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY

Функции: структурная, ферментативная, рецепторная, гормональная, транспортная, сократительная, защитная.

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 13: Bioinf lecture1

Структура белка

1. Последовательность

2. α-спираль / β-лист

3. Трёхмерная структура

4. Комплекс

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 14: Bioinf lecture1

Трансляция

РНК → Белок

3 нуклеотида (кодон) → 1 аминокислота (aa)воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 15: Bioinf lecture1

Центральная Догма

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 16: Bioinf lecture1

ОмикиГеном — все ДНК организма.

Транскриптом — все РНК организма.

Протеом — все белки организма.

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 17: Bioinf lecture1

Геном человека

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 18: Bioinf lecture1

Геномы

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 19: Bioinf lecture1

Чтение геномов

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 20: Bioinf lecture1

ГеномикаAGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGCTTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAATATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAGCCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAAGTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGTGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCCAGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCACCTGGTGGCGATGATTGAAAAAACCATTAGCGGCCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTTTGACGGGACTCGCCGCCGCCCAGCCGGGGTTCCCGCTGGCGCAATTGAAAACTTTCGTCGATCAGGAATTTGCCCAAATAAAACATGTCCTGCATGGCATTAGTTTGTTGGGGCAGTGCCCGGATAGCATCAACGCTGCGCTGATTTGCCGTGGCGAGAAAATGTCGATCGCCATTATGGCCGGCGTATTAGAAGCGCGCGGTCACAACGTTACTGTTATCGATCCGGTCGAAAAACTGCTGGCAGTGGGGCATTACCTCGAATCTACCGTCGATATTGCTGAGTCCACCCGCCGTATTGCGGCAAGCCGCATTCCGGCTGATCACATGGTGCTGATGGCAGGTTTCACCGCCGGTAATGAAAAAGGCGAACTGGTGGTGCTTGGACGCAACGGTTCCGACTACTCTGCTGCGGTGCTGGCTGCCTGTTTACGCGCCGATTGTTGCGAGATTTGGACGGACGTTGACGGGGTCTATACCTGCGACCCGCGTCAGGTGCCCGATGCGAGGTTGTTGAAGTCGATGTCCTACCAGGAAGCGATGGAGCTTTCCTACTTCGGCGCTAAAGTTCTTCACCCCCGCACCATTACCCCCATCGCCCAGTTCCAGATCCCTTGCCTGATTAAAAATACCGGAAATCCTCAAGCACCAGGTACGCTCATTGGTGCCAGCCGTGATGAAGACGAATTACCGGTCAAGGGCCGGGACTCGCCCG

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 21: Bioinf lecture1

Аннотации

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 22: Bioinf lecture1

Геном человека

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 23: Bioinf lecture1

Сравнительная геномика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 24: Bioinf lecture1

Филогения

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 25: Bioinf lecture1

Протеомика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 26: Bioinf lecture1

Масс-спектрометрия

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 27: Bioinf lecture1

Pathways

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 28: Bioinf lecture1

Сегодня

ДНК

РНК

Белки

Геномика

Протеомика

воскресенье, 24 февраля 13 г.

Page 29: Bioinf lecture1

12 лекций по воскресеньям

Квизы для самопроверки

Домашние задания и вопросы онлайн

http://rosalind.info/classes/enroll/ff45302de4/

Формат обучения

воскресенье, 24 февраля 13 г.