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Exploitation d’ontologies Exploitation d’ontologies pour la gestion des pour la gestion des
connaissances et le travail connaissances et le travail collaboratif dans ucollaboratif dans un n réseau réseau
de soinde soin Rose DIENG-KUNTZRose DIENG-KUNTZ, David MINIER, , David MINIER,
Frederic CORBY, Olivier CORBY, Frederic CORBY, Olivier CORBY, Laurent ALAMARGUY, Phuc-Hiep Laurent ALAMARGUY, Phuc-Hiep
LUONGLUONG ProjetProjet ACACIAACACIA
INRIA, Sophia AntipolisINRIA, Sophia Antipolishttp://www.inria.fr/acaciahttp://www.inria.fr/acacia
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PPllaann Contexte : Le projet Ligne de Vie Contexte : Le projet Ligne de Vie Web Sémantique médicalWeb Sémantique médical Reconstitution et extensions de Reconstitution et extensions de
ll’ontologie Nautilus’ontologie Nautilus Le staff virtuelLe staff virtuel ConclusionsConclusions
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RRéseau de soinéseau de soinObjectifs d’un Réseau de santé : Objectifs d’un Réseau de santé : Favoriser accès aux soins, coordination, continuité Favoriser accès aux soins, coordination, continuité
ou interdisciplinarité des prises en charge ou interdisciplinarité des prises en charge sanitaires, notamment celles spécifiques sanitaires, notamment celles spécifiques àà certaines populations, pathologies ou actes certaines populations, pathologies ou actes sanitairessanitaires
Éducation Éducation àà la santé, prévention, diagnostic, soins. la santé, prévention, diagnostic, soins. Membres poss. Membres poss. : :
professionnels de santé libéraux, professionnels de santé libéraux, médecinmédecinss du travail, du travail, établissementétablissementss de santé, centre de santé, centress de santé, de santé, institutioninstitutionss sociale socialess ou m ou méédidicco-socialeo-socialess, , organisationorganisationss àà vocation sanitaire ou sociale… vocation sanitaire ou sociale…
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Exemple : réseau de Exemple : réseau de mucoviscidosemucoviscidose
Dossier patient electronique
KinePediatre
Medecin traitant
Gastro-enterologue
Infirmier
Psychologue
Pneumologue
Assistant social
Famille du Patient
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Le projet Ligne de VieLe projet Ligne de Vie Partenaires : Nautilus, INRIA, SPIMPartenaires : Nautilus, INRIA, SPIM Objectifs :Objectifs :
– Vision orientée Vision orientée problèmeproblèmess du dossier patient du dossier patient la la ligne de vieligne de vie
– Terminologie communTerminologie communee pour pour communicationcommunication entre entre membres du réseaumembres du réseau OntologieOntologie décrivant le vocabulaire conceptuel décrivant le vocabulaire conceptuel partagpartagéé
– Partage de documentsPartage de documents RRecherche d’infosecherche d’infos guid guidéée par cette ontologiee par cette ontologie
– Diff. Diff. profils des membres du reseau profils des membres du reseau diff. points de vuediff. points de vue dans l’ontologie ou dans la dans l’ontologie ou dans la présentation du dossier patient présentation du dossier patient
– Raisonnement collaboratifRaisonnement collaboratif entre les acteurs médicaux entre les acteurs médicaux le le staff virtuelstaff virtuel..
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Web sémantique médical
<dossierPatient> <date> 19 Mai 2000 </date> <donneesAdministratives> <Patient><nom>Dupont</nom> <prenom> Michel </prenom> </Patient> </donneesAdministratives>…
Documents (Dossier patient,Guide bonnes pratiques…)
OntologieAnnotations Sémantiques
Traducteur
BD Nautilus
Moteur derech. sem. Staff virtuel
Ligne de vie
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Ontologie NautilusOntologie Nautilus
A partir de la BD A partir de la BD médicale Nautilus médicale Nautilus de de l’industriel :l’industriel :– Traducteur pour Traducteur pour rreconstitueconstituerer uneune ontologie ontologie
formalisformaliséée en RDFS et visualisablee en RDFS et visualisable– Vérification de cohérenceVérification de cohérence de cette ontologiede cette ontologie– Validation humaineValidation humaine via via le moteur le moteur CoreseCorese– Extensions de l’ontologieExtensions de l’ontologie (Acteur, Reseau…) (Acteur, Reseau…)– Utilisation de l’ontologie pour Utilisation de l’ontologie pour ::
guider guider la recherche d’infosla recherche d’infos guider le staff virtuelguider le staff virtuel
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Algorithme de traductionAlgorithme de traduction
Savoir
Liste des Chapitres
Lexique
classeNautilus.rdfs
Liste des concepts racines
Déduit de la lecture des codes contenus dans Lexique.
Déduit des relations ES contenues dans Savoir.Ex : X ES Y X est le fils de Y
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BD NautilusBD Nautilus
LIBELLELIBELLE CODECODE
BioprotheseBioprothese AABIOP1BIOP1
Heterogreffe valvulaireHeterogreffe valvulaire AABIOP2BIOP2
Bioprothese cardiaqueBioprothese cardiaque AAOPRO1OPRO1
Table Lexique.db (36000 termes médicaux) :
Table Savoir.db (relations) :
QualifieQualifie LienLien QualifiantQualifiant
AOPROAOPRO ESES ABIOPABIOP
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Ontologie obtenue aprOntologie obtenue aprèès s traductiontraduction
Concept d’Anatomie
Bioprothese(ou Heterogreffe valvulaire)
Bioprothese cardiaque
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Extensions de Extensions de l’ontologiel’ontologie
A partir d’un A partir d’un extracteur de extracteur de termestermes (Nomino) sur un corpus (Nomino) sur un corpus
Par Par interprétation manuelle interprétation manuelle d’un texted’un texte
Par Par réutilisation dréutilisation d’un’une e classificationclassification existante sur les existante sur les acteurs de la santacteurs de la santéé
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Verification de Verification de l’ontologiel’ontologie
Tests de cohTests de cohéérence rence par le par le programme de traduction programme de traduction Détection d’erreurs dans la BD Détection d’erreurs dans la BD Nautilus :Nautilus :– Cycles pour la relation ES (Est-un)Cycles pour la relation ES (Est-un)– Relations A ES ARelations A ES A– RedondancesRedondances
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ValidationValidation avec avec CoreseCorese
IHM de Corese : - Permettre de mieux visualiser l’ontologie- Déceler des erreurs potentielles dans la hiérarchie des concepts :
- Pbs de redondance- Erreurs de structuration- Mélange de plusieurs points de vue dans la modélisation
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RequRequêêtete avec Corese avec Corese
Rechercher toutes les pathologies situées sur un organe ?
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Reponse deReponse de Corese Corese
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Le Staff VirtuelLe Staff Virtuel
Outil visant l’aide au raisonnement Outil visant l’aide au raisonnement collaboratif par plusieurs acteurs collaboratif par plusieurs acteurs médicaux.médicaux.
Support de discussion synchrone Support de discussion synchrone ou asynchroneou asynchrone des décisions des décisions diagnostiques ou diagnostiques ou thérapeutiques.thérapeutiques.
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ModModèèle SOAPle SOAP
Préoccupation de santé du patient Préoccupation de santé du patient -> -> Hypothèses diagnostiquesHypothèses diagnostiques-> -> Propositions de traitementPropositions de traitement
Modèle SOAP (Subjective, Objective, Modèle SOAP (Subjective, Objective, Assessment, Plan) :Assessment, Plan) :– S : Symptômes et signes cliniques actuels du S : Symptômes et signes cliniques actuels du
patientpatient– O : analyses ou observations du médecinO : analyses ou observations du médecin– A : maladies, pbs de santé du patientA : maladies, pbs de santé du patient– P : procédure ou plans d’action pour résoudre P : procédure ou plans d’action pour résoudre
ces pbs de santéces pbs de santé
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SOAPSOAP
A
S
P P
O
O S
A AListe des A……….……….……….
100%
50%
50%
100%
50%50%
Médecin 1Médecin 2Médecin 3Médecin 4Médecin 5
Liste des acteurs
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ModModèèle QOCle QOC
Besoin Besoin d’aide d’aide àà la d la déécisioncision pour :pour :– Diagnostic d’une pathologieDiagnostic d’une pathologie– Recherche d’une prescriptionRecherche d’une prescription
ModModèèle QOC (le QOC (Questions, Options, Questions, Options, CritèresCritères))
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QOCQOC
A
Procédure 1
Procédure 2
Procédure 3
Critère 1.1
Critère 1.2
Critère 2.1
Critère 3.1
Critère 3.2
Critère 2.2
+
-
+
-
+
-
50%
25%
25%
Relation de type « se résoud »
Médecin 1Médecin 2Médecin 3Médecin 4Médecin 5
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Prototype du StaffPrototype du Staff
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Prototype du StaffPrototype du Staff
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ConclusionsConclusions
InterInterêêt ontologie : t ontologie : – Annotations de doc. (dossier patient, Annotations de doc. (dossier patient,
guides de bonne pratique…)guides de bonne pratique…)– InfInféérences lors de la rech. d’infosrences lors de la rech. d’infos– Aide Aide àà construire les graphes SOAP et construire les graphes SOAP et
QOC dans le staff virtuelQOC dans le staff virtuel Future validation du staff virtuel avec Future validation du staff virtuel avec
l’industriel et son rl’industriel et son rééseau de soin.seau de soin.
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