1
Medline via l’interface Pubmed
Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO
BU Santé
SMa4 – septembre 2014
Objectifs de la séance
Connaître les principes de constitution de la base Medline
Se repérer dans Pubmed
Savoir effectuer une requête pertinente dans la base
Savoir mettre en place des alertes sur un thème
Medline, quelques principes
Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA
Ne pas confondre
Medline ≠ Pubmed
Le contenu(la base de données)
L'interface d'interrogation
Bases de données Un éditeur privé ou un
organisme institutionnel
Un référencement humain
Un thésaurus organisé
Une interface d'interrogation
Medline
Qui?
Quoi?
Thésaurus MESH
Interface PUBMED (il en existe d'autres)
National Library of Medicine Etats-Unis)
20 M de références d'articles biomédicaux,
issues de 5200 périodiques depuis 1948
Pubmed, quelques repères (interface web)
Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY
Vos premiers pas dans Pubmed
Recherche libre sur la grippe H1N1 chez les femmes enceintes
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed
Présentation de la liste des résultats
Quelques filtres
Triez vos résultats pour n'afficher que les articles écrits en anglais ou en français
Précisez votre recherche en ne sélectionnant que les revues de la littérature
Types d'articles : rappel Case report / étude de cas Clinical Trial / essai clinique Randomized Controlled Trial / essai clinique
en aveugle avec groupe contrôle Practice guideline / recommandation de
bonne pratique Review / revue de la littérature Systematic Review / revue systématique Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)
Pour des recherches fines : le Mesh
Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC
S'il te plaît, dessine-moi...
...un thésaurus
Vocabulaire normalisé
Descripteurs
Hiérarchie
Plusieurs synonymes, un seul descripteur officiel
Syndrome, Down
Down's Syndrome
Downs Syndrome
Syndrome, Down's
Mongolism
Trisomy 21
Trisomy 21, Meiotic Nondisjunction
Trisomy 21, Mitotic Nondisjunction
Down Syndrome, Partial Trisomy 21
Partial Trisomy 21 Down Syndrome
Down Syndrome
Le thésaurus de Medline : le MeSH
Medical Subject Headings (uniquement en anglais)
Heading/Subheading
= Descripteur/Qualificatif
= Mot-clef/Sous-mot-clef
Les mots-clefs Medline peuvent être enrichis par des « sous-mot-clefs »
Les opérateurs booléens
.
A/BA du
point de vue de B
Sur Pubmed
seulement
Le MESH
Descripteurs (>25 000)
Qualificatifs (83)
« L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de l'interrogation de Medline »*
*(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)
Recherche libre vs. Équation de recherche
Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques
multiple sclerosis
environmental factors
1320 résultats – pas tous pertinents
Multiple Sclerosis/etiology"[Mesh]
AND environment[Mesh]
387 résultats pertinents
Exemple de résultat non-pertinent : la
requête a porté indifféremment
sur toutes les parties de la
notice
Source : Georges Beuzet, BU Santé Brest
Un exemple de recherche
Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné
publiés les 10 dernières années
Un exemple de recherche
Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années
"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh]
+ Filters : English, French, published in the
last 10 years
Exemple de résultat
pertinent: la requête a porté exclusivement
sur la partie « mots MESH » de la notice
Correspondances Mesh français – Mesh anglais
=> « Portail terminologique de santé » (CISMEF)
http://pts.chu-rouen.fr/
Ou
=> « Mesh bilingue de l’INSERM » :http://mesh.inserm.fr/mesh/
Bref
« Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de
l’hôpital ou entre 2 stations de métro avec son
smartphone ou sa tablette. »
Philippe Eveillard
Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr
Exercices
1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
le diagnostic de la prééclampsie les effets indésirables de la césarienne
Réponses1- Rechercher les affiliations
descripteurs/qualificatifs correspondant :
au diagnostic de la prééclampsie
"pre-eclampsia/diagnosis"[Mesh]
aux effets indésirables de la césarienne"Cesarean section/adverse effects"[Mesh]
1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte d'équation de recherche et rebond)
3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
2) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)
3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
3 façons d'entrer une requête dans Pubmed
3) Directement dans la barre de recherche simple
La veille dans Pubmed : services personnalisés
Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr
My NCBI : votre Pubmed personnalisé
Ouvrir un compte sur My NCBI « Sign in » « Register for an account »
Paramétrer dans votre compte les filtres suivants
Anglais Français Texte intégral gratuit BU Santé Brest
Filtre « BU Santé Brest »
Icône UBO pour l'accès direct au texte intégral
Exercice
2 - Les troubles des comportements alimentaires chez la femme enceinte
Limiter aux 5 dernières années de parution
Exercice
3. Les effets indésirables du déclenchement du travail obstétrical
Limiter aux essais cliniques
Exercice
4 - Le traitement du diabète gestationnel. Exclure les traitements médicamenteux .
Limiter aux recommandations de bonne pratique publiées ces deux dernières années
Du problème de la veil le
équation de recherche ≠ équation de veille
Des mots MESH ?
.
Ne contient pas de mots MESH
Contient des mots MESH
Exercice
4 - Trouvez les articles les plus récents sur le diagnostic de la mucoviscidose(sans utiliser les mots Mesh)
Solution : le champ Title/abstract ou [tiab]
« cystic fibrosis/diagnosis »[Mesh]
Équation de recherche (pour des résultats les plus
pertinents possibles)
(« cystic fibrosis »[tiab] OR « mucoviscidosis »[tiab]OR « fibrocystic disease »[tiab])
AND diagnos*[tiab]
Équation de veille (pour des articles récents / pas
forcément aussi pertinents)
Créer une alerte dans MyNCBI
Top Related