APRIL 2011 DIAGNOSTIK ....................................... 1 IMMUNOLOGIE ................................... 4 ZELLKULTUR ...................................... 7 GERÄTE ............................................ 10
Szabo-Scandic _______________________________________________________________________________________________________________________
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DIAGNOSTIK
Unsere Partnerfirma NANOGEN ADVANCED
DIAGNOSTICS, die zur Gruppe ELITech gehört, hat
die Produktpalette erweitert und viele der Real-Time
PCR Kits verbessert und erneuert.
Hintergrund:
Die Sonden sind nun nicht mehr TaqMan-Sonden
sondern Hybridisierungs-Sonden namens ELITe
MGB.
ELITe MGB™ Sonden sind für folgende Technologien
entwickelt: MGBTM, SuperbasesTM und Eclipse®Dark
Quencher. Diese Kombination ermöglicht erhöhte
Sensitivität, Spezifität und einen niedrigen Fluores-
zenz-Hintergrund.
MGB™ ist ein Molekül, das an den „Minor Groo-
ve“ der Doppel Strang DNA bindet. Diese Verbin-
dung erhöht die Stabilität der Hybridisierung, die
zwischen der Sonde und der amplifizierten DNA ge-
schieht. Die erhöhte DNA-DNA-Hybrid-Stabilität er-
möglicht eine Entwicklung von kurzen Sonden mit
hoher Spezifität (Kumar et al, 1998 NAR 26: 831-
838).
ELITe MGB™ Sonden sind kurze, übereinander
greifende Sonden, die molekulare Sequenzen rasch
detektieren sowie genaue und spezifische Ergebnisse
liefern. Weiters erhöht die Spezifität von ELITe
MGBTM Sonden die Möglichkeit, zwischen einem
perfekten „Match“ und „Mismatch“ in den Targets,
verglichen mit einer analogen MGB-freien längeren
Sonde, zu unterscheiden.
SuperbasesTM sind chemisch ausgeführte Nitro-
genbasen, deren Verwendung die Sonden mit vielen
vorteilhaften Eigenschaften ausstattet, z.B. stabile
Hybridisierungsreaktion, die Hybridisierung findet
auch im Falle von Mutationen statt, keine Unter-
schiede in Tm beim Auftreten von „Mismatch“, glei-
che Affinität für alle Basen uvm.
Die Eclipse® Dark Quencher der ELITe MGBTM Son-
den können die emittierte Fluoreszenz von vielen
Fluorophoren blockieren und ermöglichen somit eine
rauschfreie Amplifikation.
Funktion der Sonden:
Bei der Amplifikation mit ELITe MGB™ Sonden wer-
den die Sonden nicht hydrolysiert, was anschließend
eine Schmelzkurvenanalyse ermöglicht.
ELITe MGB™ Sonden verwenden einen 3-Phasen
Amplifikationszyklus (siehe Abbildung):
Denaturation: Die Sonde ist frei in der Lösung
und es wird keine Fluoreszenz emittiert
Hybridisierung: Die Sonde bindet das DNA-
Template, der Reporter ist somit weit weg von
dem Dark Quencher und Fluoreszenz wird emit-
tiert.
Research Product NEWS ___________________________________________________________________________________________DIAGNOSTIK
2 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic
Extension: Während der DNA-Polymerisation
wird die Sonde von dem Target gespaltet ohne
hydrolysiert zu werden.
Eigenschaften und Vorteile der ELITe
MGBTM-Kits:
Fortgeschrittene Technologie: MGB™, Eclipse®
Dark Quencher und SuperbasesTM
Monoreagenz Format
Verkürzte Handhabung:
Gebrauchsfertiger Amplifikationsmix
Erhöhte Sensitivität: 20 µl Amplifikations-
mix + 20 µl extrahierte Probe.
Lagerung bei -20°C
(3 x Einfrieren-Auftauen möglich)
Gleichmäßige Amplifikationskonditionen
Genaue Ergebnisse: Interne Kontrolle, UNG En-
zym, Standard-Kurve
ELITe-Produkte beinhalten eine interne Kon-
trolle und den UNG anti-Verschleppungs-
Bauteil um verlässliche Ergebnisse zu
erhalten
Eine externe Standard-Kurve ermöglicht
genaue Quantifizierung des Targets
ELITe MGB Schmelzkurven Analyse:
Die Schmelzkurven Analyse besteht aus einem gra-
duellen Heizprozess wobei Fluoreszenz fortlaufend
detektiert wird. Während der ersten Stufe werden
bei niedriger Temperatur die ELITe MGB Sonden zu
single strand DNA hybridisiert. Hier werden die
Rohdaten der Fluoreszenz registriert. Bei Erhöhung
der Temperatur werden die ELITe MGB Sonden von
der DNA gelöst, sind frei in der Lösung und emittie-
ren keine Fluoreszenz, was zur Fluoreszenz-
Abnahme führt.
Die Software des Real Time PCR Geräts generiert
eine sigmoide Kurve Fluoreszenz vs. Temperatur.
Der Wendepunkt in der Graphik entspricht der
Schmelztemperatur (Tm). Die Tm wird mittels einer
weiteren Graphik (erste Ableitung) leicht erkennbar
und automatisch von der Software erkannt.
Vorteile der Schmelzkurven Analyse:
Ermöglicht die spezifische Determination der
Sonden-Amplikon-Hybrid Schmelztemperatur,
(Tm)
Ermöglicht die Identifikation von eventuellen
Mutanten Targets
Ermöglicht die Evaluierung der Zuverlässigkeit der
quantitativen Ergebnisse.
Sample 1,
Tm ~ 67°C, wild type
Sample 2,
Tm ~ 62°C, mutant
Erhältliche Produkte in ELITe MGB-
Format:
CMV, EBV, HSV1, HSV2, HHV6, HHV8, Parvovirus
B19, VZV, BKV, Adenovirus
Demnächst: Aspergillus, Chlamydia trachomatis und
MTB.
Im nächsten Newsletter erläutern wir weitere Neuig-
keiten bei NANOGEN ADVANCED DIAGNOSTICS.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Anna Ahlbom
Tel.: 01/4893961-58
DIAGNOSTIK___________________________________________________________________________________________Research Product NEWS
Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________
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Neuigkeiten zum Thema Clostridium difficile Dia-
gnostik von unserer Partner-Firma MERIDIAN
Bioscience Europe.
In den Guidelines der European Society of Clinical
Microbiology and Infectious Diseases (ESMID),
American Society for Microbiology (ASM) und Infec-
tious Diseases Society of America (IDSA) gemein-
sam mit der Society for Healthcare and Epidemiol-
ogy of America (SHEA) wird die Clostridium difficile
Diagnostik als Ein- oder Zwei-Stufen-Algorithmus
empfohlen.
Als alleinige Methode kann ein molekularer Test ein-
gesetzt werden.
Dazu können wir den molekularen illumigene
Clostridium difficile Test anbieten.
Über diesen Test haben wir schon ausführlich im
Newsletter April 2010 bzw. Oktober 2010 berich-
tet.
Als Zwei-Stufen-Algorithmus wird z.B. die Kombina-
tion einer Clostridium difficile GDH (Glutamat de-
hydrogenase) Bestimmung und der daraus resultie-
renden positiven Probe mittels eines molekularen
Clostridium difficile Tests empfohlen.
Für diese Variante können wir nun beide Tests an-
bieten, den GDH-Test und den obengenannten mo-
lekularen Test.
MERIDIAN Bioscience Europe hat, um die Produkt-
palette zu vervollständigen, das folgende Produkt auf
den Markt gebracht:
Premier C. difficile GDH ELISA für den
Nachweis von C. difficile Common Antigen
direkt aus Stuhlproben
Dieser ELISA liefert schnell, effizient und kosten-
günstig äußerst genaue Ergebnisse. Negative Ergeb-
nisse können in einer frühen Phase ausgeschlossen
werden. Der Negativ Predictive Value (NPV) liegt
bei 97%, die Sensitivität bei 94% und die Spezifität
bei 95%.
Die einfache Handhabung und Flexibilität erleich-
tert die Arbeit im Labor. Das schnelle (< 1 Stunde)
Protokoll spricht für sich. Die Auswertung erfolgt vi-
suell oder mittels Photometer.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Anna Ahlbom
Tel.: 01/4893961-58
NGAL-Test von DAKO - Methode zur schnellen Diagnose von akutem Nierenversagen
Der NGAL-Test, ein turbidimetrischer Assay, dient
zur schnellen quantitativen Bestimmung von NGAL
aus nur wenigen Tropfen humaner Urin- oder EDTA-
Plasma-Proben und kann auf vielen Plattformen,
z.B. Hitachi, Roche, Beckmann, Siemens und
Abbott programmiert werden.
Standardmethoden für die Diagnose von akuten
Nierenschäden beziehen sich meistens auf die Er-
mittlung der glomerulären Filtrationsrate (GFR) von
Cystatin C bzw. Kreatinin. Ein aussagekräftiger Wert
ist mit diesen Methoden erst nach 24-72 Stunden
ermittelbar, wodurch für die Einleitung therapeuti-
scher Maßnahmen kostbare Zeit verloren geht. Die
NGAL-Bestimmung ermöglicht bereits in einer frü-
hen Phase einer Nierenschädigung signifikante Mar-
ker-Werte zu messen.
Research Product NEWS _________________________________________________________________________________________IMMUNOLOGIE
4 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic
NGAL (neutrophil gelatinase-associated lipocalin,
Lipocalin-2, Siderocalin) ist ein neuer Biomarker für
akute Nierenschäden und wird in neutrophilen Gra-
nulozyten und in bestimmten Epithelien - z.B. den
Nierenkanälchen - expremiert. Bei Nierenschäden
steigt die Expression von NGAL in der Niere inner-
halb von 2 Stunden signifikant an und kann in Urin-
oder in Plasmaproben nachgewiesen werden. Stu-
dien haben gezeigt, dass bei 90% der Patienten
Werte über 350ng/mL einen Hinweis auf ein bevor-
stehendes Nierenversagen geben.
DAKK980111-2 The NGAL Test™ Reagent Kit
DAKK980211-2 The NGAL Test™ Calibrator Kit
DAKK980311-2 The NGAL Test™ Control Kit *A
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Mag. Norbert Wahler
Tel.: 01/4893961-55
IMMUNOLOGIE
Formaldehyd freier RNA Gel Kit von CEDARLANE Laboratories
Die Verwendung von formaldehydfreier denaturie-
render Agarosegelelektrophorese für RNA bietet
grundlegende neue Vorteile.
Kein langes Inkubieren und kein Rezirkulieren des
Puffers mehr notwendig – Glyoxalfreie Formel
Keine Probenvorbereitung durch Denaturierung
und Probenfärbung in einem Schritt
Instant band visualization – geringer Hintergrund
und brilliantgrüne Banden OHNE der Verwendung
von Ethidium Bromid
Gefahrloses hantieren durch völlig formaldehyd-
freies Gel und Puffer
Kompatibel mit down-stream Applikationen inklu-
sive Northern Blots
Bestandteile des Kits:
Formaldehydfreie RNA Gellösung, 10X
Formaldehydfreier RNA Laufpuffer, 10X
Formaldehydfreier RNA Ladepuffer, 2X – inklusive
Bromphenolblau und Xylencyanol als Tracking
Dyes
Northern Blot Analyse von PGK1 mRNA
auf formaldehydfreiem RNA Gel
Abb. 1:
Gel A: 20 µg Hefe RNA
pro Spur aufgetragen auf
agarose/formaldehydfreiem
RNA Gel;
aufgetrennt bei 8V/cm.
Abb. 2:
Gel B: Banden wurden auf
eine Hybond N Membrane
übertragen und mit einem
radiomarkierten Oligo-
nukleotid über Nacht ge-
gen PGK1 mRNA inku-
biert.
Abb. 3:
Gel C: Membranen wurden
gestrippt und über Nacht
als Ladekontrolle mit ei-
nem Oligonukleotid gegen
SCR1 RNA geprüft.
1: untransformed control
2: High Copy PGK1 vector
3: Low Copy PGK1 vector
4: High Copy PGK1 vector
5: Low Copy PGK1 vector
IMMUNOLOGIE_________________________________________________________________________________________Research Product NEWS
Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________
5
Abb. 4: Ethidiumbromid Färbung (linker Blot) im Ver-
gleich zu formaldehydfreiem RNA Dye (rechter Blot). Ge-
samt-RNA wurde von K562 Zellen extrahiert, die Proben
in formaldehydfreiem RNA Ladepuffer denaturiert, wobei
einer Ethidiumbromid enthielt, der andere den Formal-
dehydfreien RNA Dye und für 10 Minuten bei 65°C inku-
biert. Die Proben wurden auf einem 2%igen formalde-
hyfreiem RNA Agarosegel aufgetragen und für 1,5 Stun-
den bei 5,1 V/cm aufgetrennt.
Bestellinformation:
Kat.Nr. CEDN726-KIT
Preis: EUR 322,- (exkl. MWSt).
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
DI (FH) Manuel Rauner
Tel.: 01/4893961-30
Komplement Antikörper und Proteine von CEDARLANE Laboratories
CEDARLANE bietet sowohl zahlreiche Formate von
Reagenzien als auch eine umfangreiche Palette an
rekombinant hergestellten Proteinen und Antikörpern
an.
Angeboten werden Antikörper zu komplementären
Komponenten, Regulatoren und Rezeptoren, die
ebenfalls in verschiedensten Formaten (Fluorochro-
me, Biotin, HRP) und gereinigt erhältlich sind.
Abb. 1: Färbung eines Paraffinschnitts (formalinfixiert)
von humanem Plazentagewebe unter Verwendung von
purified anti-Human Complement Component C4b
(KatNr. CEDCL2154AP) bei einer Verdünnung von
20 µg/mL.
Abb. 2: Färbung eines Paraffinschnitts (formalinfixiert)
von humanem Prostatagewebe unter Verwendung von
purified anti-Human Factor H (Kat.Nr. CEDCL7672AP).
Abb. 3: Färbung eines Kryoschnitts von Rattenmilz unter
Verwendung von purified anti-rat Crry (Clone 512)
(Kat.Nr. CL064AP) bei einer Konzentration von 0,1
µg/mL. Vergrößerung ca. 150x.
Research Product NEWS _________________________________________________________________________________________IMMUNOLOGIE
6 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic
Abb. 4: humane RBCs mit komplement Antikörper CD59
FITC (Protectin) (KatNr. CL7673F) gefärbt. Schwarze Li-
nie: Mouse IgG1; Grüne Kurve: Kat.Nr. CL7673F
Abb. 5: Färbung eines Paraffinschnittes (formalinfixiert)
einer Hautbiopsie (4 µm) bei Läsion des frühen Pemphi-
gus vulgaris (ohne Blasenformation). Färbung mit anti-
C3d complement Antikörper (Kat.Nr. CL2904AP) weist
starkes, positives intraepidermales interzelluläres immu-
nostaining auf.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
DI (FH) Manuel Rauner
Tel.: 01/4893961-30
Neuer 2011 Produktkatalog von SANTA CRUZ jetzt bei Szabo-Scandic erhältlich
Wie jedes Jahr liegt auch heuer wieder bei SZABO-
SCANDIC der aktuelle SANTA CRUZ Biotechnology
Katalog 2011 auf.
Unter anderem sind darin zu finden:
Über 51.580 charakterisierte Primärantikörper
(16.720 monoklonale und 34.860 polyklonale
Antikörper)
siRNA, shRNA Plasmide und Lentivirale Partikel
zur Regulation bzw. Inaktivierung aller (100%)
bekannten humanen und murinen Gene
Über 3.360 humane und 3.175 Maus trans-
fizierte Zelllysate zur Western Blot Antikörper-
evaluierung
Über 141.000 ChemCruz Produkte (Biochemika-
lien für die Anwendung im Bereich Biomedizin,
Life Science, Molekularbiologie und Proteomics)
Die Kataloge werden derzeit ausgeschickt. Sollten
Sie in den nächsten 2 Wochen keinen bekommen
haben, kontaktieren Sie uns bitte!
Wir schicken Ihnen gerne ein Exemplar zu.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
DI (FH) Manuel Rauner
Tel.: 01/4893961-30
ZELLKULTUR___________________________________________________________________________________________Research Product NEWS
Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________
7
ZELLKULTUR
Mikrotiterplatten für die Fluoreszenz
Fluoreszenzanwendungen haben in den letzten Jah-
ren immer mehr an Bedeutung gewonnen. Entschei-
dend für den Erfolg Ihrer Arbeit und Experimente auf
diesem Gebiet ist einerseits die Wahl des richtigen
Readers. Unsere Partnerfirma BIOTEK ist einer der
führenden Hersteller von Geräten rund um die
Mikrotiterplatte. Andererseits ist es unbedingt not-
wendig auf qualitativ hochwertige Platten zurückzu-
greifen. Hier bietet unser Lieferant CORNING in der
Zwischenzeit ein breites Spektrum an Platten an, die
für den Bereich Fluoreszenz bestens geeignet sind.
Prinzipiell sollten für Arbeiten mit Fluoreszenz nicht
klare, sondern „eingefärbte“ Platten, in den meisten
Fällen schwarze Platten verwendet werden. Schwar-
ze Platten, zumeist aus Polystyrol, wurden entwi-
ckelt, um den Crosstalk von Well zu Well und das
Hintergrundrauschen bei einem Fluoreszenz Assay
zu reduzieren.
Es gibt einige grundlegende Regeln bei der Auswahl
der richtigen Platte:
Im Falle einer homogenen Lösung und einem
nicht zellbasierten Assay sollten schwarze Platten
verwendet werden. Gelesen wird von oben (Top-
Reading)
Bei einem zellbasierten Assay sollten schwarze
Platten mit und ohne Klarboden verglichen wer-
den. Gewöhnlich wird von unten gelesen
(Bottom-Reading) um ein besseres Signal-
Rauschen-Verhältnis zu erreichen
Falls nötig können Glasbodenplatten einen niedri-
geren Background bringen
Für Zellen in Suspension sollten die Ergebnisse
von Top- und Bottom-Reading verglichen werden
Als Entscheidungshilfe für Sie im Folgenden eine
Auswahl an CORNING Platten mit Kommentaren
und Erfahrungswerten unseres Lieferanten BIOTEK:
COS3915
Schwarze Platte mit Flachboden, von oben zu le-
sen
Einsatzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
unter 400nm
Gut für Standard Assays, nicht für Zellkultur oder
Immunoassays geeignet, ausgezeichnet für DNA
Quantifizierung mit Hoechst 33258, Picogreen
oder Ribogreen und GFP Assays mit lysierten Zel-
len
COS3694
Half Area (low volume) Version der oben be-
schriebenen COS3915
Gleiche Verwendung und Eigenschaften wie
COS3915
COS3914
Schwarze 8-well Strip-Variante der COS3915
Gleiche Verwendung und Eigenschaften wie
COS3915
COS3615
Schwarze Platte mit extra dünnem, flachem Klar-
boden (Special Optics), von oben oder unten zu
lesen
Verwendbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
über 400nm
Gut für Standard Assays, nicht für Zellkultur oder
Immunoassays geeignet
Diese Platte ist für den überwiegenden Teil der
Anwendungen geeignet
Höherer Background als Platten mit schwarzem
Boden, bei Exzitationswellenlängen unter 400nm
von unten
Verwendungsmöglichkeit: ORAC Assays, lange
kinetische Assays, die einer Abdeckung bedürfen,
Research Product NEWS __________________________________________________________________________________________ZELLKULTUR
8 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic
einige DNA Quantifizierungen mit Picogreen.
Normalerweise werden für DNA Quantifizierungen
mit Picogreen Platten mit schwarzem Boden ver-
wendet, einige Anwender berichteten aber von
der Notwendigkeit von zu unten lesen
COS3631 ist die vergleichbare Platte mit höhe-
rem Background, da sie einen dickeren Boden hat
COS3925
Schwarze Platte mit Flachboden und „high bin-
ding“ Oberfläche, von oben zu lesen
Einsetzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
unter 400nm
Verwendbar für Immunoassays
COS3924
Schwarze 8-well Strip-Variante der COS3925
Gleiche Verwendung und Eigenschaften wie
COS3925
COS3916
Schwarze Platte mit Flachboden und Zellkultur-
behandlung
Einsetzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
unter 400nm
Von oben nach Entfernung des Deckels zu lesen
COS3614
Schwarze Platte mit extra dünnem, flachem Klar-
boden (Special Optics), zellkulturbehandelt, von
oben oder unten zu lesen
Verwendbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
über 400nm
Sehr gut verwendbar für GFP Assays mit leben-
den Zellen. Die Platte kann mit aufgesetztem De-
ckel von unten gelesen werden
Höherer Background als Platten mit schwarzem
Boden, bei Exzitationswellenlängen unter 400nm
von unten
Sollte unter 400nm angeregt werden müssen ha-
ben nur Platten mit Glasboden einen niedrigen
Background
COS3603 ist die vergleichbare Platte mit höhe-
rem Background, da sie einen dickeren Boden hat
COR3340
Schwarze Platte mit klarem Flachboden,
CORNING CellBIND Zellkultur Behandlung, zu le-
sen von unten und von oben
CellBIND verbessert vielfach die Anheftung von
schwer adhärierenden Zellen und ist eine Be-
handlung, keine Beschichtung
Höherer Background als Platten mit Special
Optics Boden
Einsetzbar für alle Wellenlängen, vor allem über
400nm
Höherer Background als Platten mit schwarzem
Boden, bei Exzitationswellenlängen unter 400nm
von unten
CellBIND Oberfläche ist auch in anderen Platten-
formaten (6-well bis 384-well) verfügbar
COS3601
Schwarze Platte mit klarem Flachboden, „high
binding“ Oberfläche, zu lesen von unten und von
oben
Einsatzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
über 400nm
Verwendbar für Immunoassays wie ELISA
Höherer Background als Platten mit schwarzem
Boden, bei Exzitationswellenlängen unter 400nm
von unten
COS3635
Klare Flachboden-UV Platte, zu lesen von unten
und von oben
Sehr niedriger Background, allerdings etwas mehr
als schwarze Platten
Verwendbar für alle Wellenlängen, vor allem unter
300nm
Hauptzweck der Platte ist die Lesbarkeit im UV
Bereich bis hinunter auf 215nm
Auch verwendbar als gewöhnliche Assay Platte,
nicht für Zellkultur und Immunoassays
ZELLKULTUR___________________________________________________________________________________________Research Product NEWS
Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________
9
COS3356
Schwarze Rundbodenplatten aus Polypropylen,
von oben zu lesen
Einsetzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
unter 400nm
Verwendbar für Assays, nicht für Zellkultur oder
Immunoassays
Etwas höherer Background als COS3915
Polypropylen ist kompatibel mit vielen organi-
schen Lösungsmitteln (z.B. DMSO)
CORNING - diverse Zellkulturplatten
6-48 Well
Zahlreiche Varianten von Platten wie COS3506,
COS3512, COS3524 und COS3548
Das Lesen von 6-, 12- und 24 Well-Platten erfor-
dert häufig einen Scan von unten. Um die opti-
sche Verteilung zu bestimmen sollte an mehreren
Stellen im Well gemessen werden. Der 5mm op-
tische Lichtleiter der BIOTEK Fluoreszenz-Reader
deckt eine Fläche mit 6,5mm Durchmesser ab.
Im Vergleich dazu verfügen andere Reader oft nur
über eine Lesefläche von 1 bis 1,5mm im
Durchmesser
Aufgrund des verwendeten Materials (klares Poly-
styrol) sind diese Platten nicht optimal für Fluo-
reszenzmessungen. Auch ist der Boden dicker als
der der entsprechenden 96 Well-Platten, folglich
kann auch der Background hoch sein, besonders
wenn von unten gelesen wird. Trotzdem werden
diese Platten von vielen Anwendern erfolgreich für
Fluoreszenzmessungen im Zellkulturbereich ver-
wendet
COS3912
Weiße Flachbodenplatte, von oben zu lesen
Einsatzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch
unter 400nm
Höherer Background als schwarze Platten, aber
niedrigerer Background als klare Platten
Nicht geeignet für Immunoassays und Zellkultur
Hauptanwendung ist die Lumineszenz, im Fluo-
reszenzbereich können weiße Platten für Time
Resolved Fluoreszenz, HTRF und Assays, die un-
ter 400nm anregen müssen verwendet werden
MAT4951
Schwarze Platte mit Glasboden, von unten und
oben zu lesen
Besonders niedriger Background
Besonders gute Performance bei Anwendungen
wie Laser Induced Fluorescence (LIF), Fluores-
cence Correlation Spectroscopy (FCS) oder Fluo-
rescent Polarization (FP)
Auch erhältlich als sterile Variante mit Deckel
(MAT4952)
Hersteller dieser Platte ist unser Lieferant Matrix
Wir stehen Ihnen gerne für alle weiteren Fragen zu
Verfügung. Darüber hinaus können wir Muster der
einzelnen Platte besorgen sowie Demogeräte bereit-
stellen.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Dr. Andreas Bergmann
Tel.: 01/4893961-40
Research Product NEWS ______________________________________________________________________________________________GERÄTE
10 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic
GERÄTE
BioShake – Ultraschnelle Mixer bzw. Thermomixer für kleine und kleinste Volumi-na in Mikrotiterplatten und Probengefäßen
Die BioShake-Serie ermöglicht erstmals hochpräzi-
ses und effizientes Mischen im Mikrotitermaßstab
für einen großen Applikationsbereich. Assays in
Mikrotiterplatten oder Probengefäßen können schnell
und sicher mit einstellbaren Geschwindigkeiten von
200 bis 3.000 U/min realisiert werden. Dabei ist
die BioShake-Mischtechnologie deutlich robuster,
vibrationsfreier und wartungsärmer als klassische
Schüttler.
Mischfrequenz bis 3.000 U/min
Für Mikrotiterplatten, PCR-Platten, Deep-Well-
Platten, Tubes und Glasfläschchen geeignet
Kundenspezifische Adapter auf Anfrage
Integrierte Vortex- und Short-Mix-Funktionen
3D-Shake-Control: schnelles orbitales und pro-
benschonendes Mischen
Anti-Spill-Technologie: kontrollierte planare
Mischbewegungen
Anti-Vibrationstechnologie: sehr hohe Laufruhe
ohne vibrieren und klappern
Einsparung zeitraubender Zentrifugationsschritte
nach dem Mischen
Kompakte Leichtbauweise in edler Aluminium-
ausführung
Die Bedienung des BioShake XP und BioShake iQ
erfolgt über Direktwähltasten. Zusätzlich können
durch 2 wählbare Programmtasten Zeitabläufe und
Mischbewegungen aktiviert, gespeichert und somit
komplexe Applikationen durchgeführt werden. Dies
eröffnet eine ganz neue Sichtweise auf die tägliche
Laborarbeit und optimiert bisherige Standardrouti-
nen erheblich.
Der BioShake iQ ist der High-End-Thermoshaker
der BioShake-Serie. Zusätzlich zu den Spezifikatio-
nen des BioShake XP überzeugt der BioShake iQ
durch den Einsatz einer sehr genauen Temperier-
technologie. Die Temperaturen sind ausgehend von
der Raumtemperatur bis 99°C in 0,1°C Schritten
wählbar. Die Temperaturregelgenauigkeit beträgt +/-
0,1°C, wobei die homogene Temperaturverteilung
über alle Probengefäße immer besser als +/- 1,0°C
ist.
Für die BioShake-Serie sind zusätzlich eine Viel-
zahl an standardisierten und spezifischen Adapter-
platten und Wechselblöcken erhältlich. Die Adapter
gewährleisten eine optimale Anpassung an Stan-
dard-Tubes, Lysis-Tubes, Mikrotiterplatten, Deep-
Well-Platten, Glasfläschchen und andere Probenge-
fäße.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Mag. Norbert Wahler
Tel.: 01/4893961-55
Elektrophorese Eco-Line
Glasplatten mit fixierten Spacern
Modulares Tanksystem für PAGE-Elektrophorese
und Blotting
Integrierte Kühloption
Gelgießsystem für 1 oder 2 Gele
Beide Größen des modularen Tanksystems der Eco-
Linie sind für eine Vielzahl von Auftrennungstechni-
ken einsetzbar. Hierzu gehören, z.B., SDS-PAGE,
sowie native, präparative Gradienten-Elektrophorese
und Blotting-Applikationen. Eco-Mini und Eco-Maxi
sind ausgelegt für die simultane Auftrennung in 1
oder 2 Gelen.
GERÄTE_______________________________________________________________________________________________Research Product NEWS
Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________
11
Das Elektrophorese Modul ist dank integrierter, spe-
zieller Seitenklammern einfach in der Handhabung
und garantiert in Verbindung mit dem Gelgießstand
ein auslaufsicheres System für das Gießen von Ge-
len. Nach dem Polymerisieren der Gele wird das
Elektrophorese-Modul zusammen mit den Glasplat-
ten-Sandwiches in den Puffertank eingesetzt und
bildet hier die „obere“ Pufferkammer. Austauschbare
Module ermöglichen den Wechsel zwischen
Elektrophorese und Tank-Blotting.
Eco-Mini, PAGE-Elektrophoresesystem
Modulares Tanksystem für PAGE-Elektrophorese
und Blotting
Gelgröße 9,4 cm x 8 cm (B x L)
Doppel-Gel-System
Geeignet für gegossene Gele und für die meisten
handelsüblichen Pre-Cast Fertiggele
Gelgießstand für 1 oder 2 Gele
Kühloption (integriertes Wasserzirkulationssys-
tem)
Eco-Mini ist sowohl mit selbst gegossenen Gelen, als
auch mit den meisten Fertiggelen kompatibel. In das
Elektrophorese-Modul können Glasplatten mit
10,5 cm bis 11 cm Breite und einer Länge bis zu
11 cm eingesetzt werden. Eco-Mini ist kompatibel
mit den Glasplatten von Minigel und Minigel-Twin
(beide BIOMETRA).
Die Puffertanks EB (ohne Kühloption) und EBC
(mit Kühloption) sind kompatibel mit dem Blot-
Modul für Tankblot Eco-Mini. Für Tank-Blotting An-
wendungen unter kontrollierten Temperaturbedin-
gungen sollte möglichst der Puffertank mit integrier-
ter Kühloption (EBC) verwendet werden.
Der Bigfoot-Sicherheitsdeckel ermöglicht durch
seinen speziellen Fuß eine platzsparende und siche-
re Aufbewahrung des Deckels wenn dieser nicht auf
dem Puffertank sitzt.
Gelgießstand für Eco-Mini
Der Gelgießstand ermöglicht den einfachen, schnel-
len und auslaufsicheren Aufbau von 1 oder 2 Glas-
platten-Sandwiches. Als Vorbereitung zum Gießen
der Gele werden 1 oder 2 Glasplatten-Sandwiches
in das Elektrophorese-Modul eingesetzt und mittels
seitlicher Klammern fixiert. Da die Spacer perma-
nent auf einer Glasplatte fixiert sind, entfällt der
Schritt des mühsamen Positionierens und Ausrich-
ten der Spacer.
Research Product NEWS ______________________________________________________________________________________________GERÄTE
12 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic
Anschließend werden das Elektrophorese-Modul und
die fixierten Glasplatten in den Gelgießstand einge-
setzt und mittels zweier Exzenterschrauben einfach
fixiert. Durch die Verwendung eines einzigartigen
high-tech Materials für die Dichtungen im Gel-
gießstand und spezieller Rutschhemmung in den
Seitenklammern des Elektrophorese-Moduls ist die
Auslaufsicherheit garantiert. Nach der Polymerisati-
on der Gele wird der komplette Aufbau aus
Elektrophorese-Modul und Glasplatten-Sandwiches
aus dem Gelgießstand entnommen und in den Puf-
fertank eingesetzt.
Eco-Maxi, PAGE-Elektrophoresesystem
Gelgröße 19,4 cm x 18,5 cm (B x L)
Doppel-Gel-System
Bigfoot-Sicherheitsabdeckung
Gelgießstand für 1 oder 2 Gele
Kühloption (integriertes Wasserzirkulationssys-
tem)
Eco-Maxi ist für die Verwendung von Glasplatten mit
einer Breite von 21 cm und einer Länge bis zu 20
cm ausgelegt. Weiterhin ist die Eco-Maxi mit den
Glasplatten des Maxigels (BIOMETRA) kompatibel.
Für die elektrophoretische Auftrennung unter kon-
trollierten Temperaturbedingungen wird er Einsatz
des Puffertanks EBC mit integrierter Kühloption
(Wasserzirkulationssystem) empfohlen. Hierdurch
wird das generelle Problem von Smiling-Effekten
und ineffizientere Bandentrennung bei größeren Ge-
len, verursacht durch starke Wärmeentwicklung, zu-
verlässig vermieden.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Mag. Norbert Wahler
Tel.: 01/4893961-55
TOptical – real time PCR System mit maximaler Flexibilität
Modulares Blockkonzept
Der TOptical setzt sich aus der Basiseinheit des
TProfessional Thermocyclers und dem TOptical Mo-
dul zusammen. Dieses modulare System ermöglicht
die Aufrüstung von bestehenden TProfessional
Thermocyclern durch das TOptical Modul zum
hochwertigen Real-Time-PCR-Gerät. Für herkömmli-
che PCR-Anwendungen stehen fünf verschiedene
Blockmodule, angefangen von 0,5mL Reaktionsge-
fäßen bis hin zur 384well Platte zur Verfügung.
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Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________
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Optionale Gradientenfunktion
Die richtige Annealingtemperatur zu finden ist gera-
de für Real-Time-PCR-Ansätze von wichtiger Bedeu-
tung. Oft werden zeitaufwendige Testläufe nur ein-
geschränkt durchgeführt, wodurch suboptimale Er-
gebnisse unter Routine-Bedingungen zustande
kommen. Um das Austesten von neuen Primerkom-
binationen in einem einzigen Lauf zu ermöglichen,
ist das TOptical-Modul optional mit einer Gradien-
tenfunktion erhältlich. Mit einer Gradientenspanne
von 40°C und dem Linear Gradient Tool zur Pro-
grammierung von gleich großen Temperaturabstän-
den bleiben keine Wünsche hinsichtlich der Opti-
mierungsmöglichkeiten von Real-Time-PCR-
Experimenten offen. Neue Primerpaare mit unbe-
kannten Annealingtemperaturen können schnell ge-
testet und neue Protokolle innerhalb kürzester Zeit
optimiert werden.
Flexible Filterausstattung
Das patentierte optische System des TOptical Ther-
mocyclers ist mit einem Filterrad für 6 Farbfiltermo-
dule ausgestattet. Die Ausstattung mit Farbfiltermo-
dulen lässt sich frei konfigurieren. Weiterhin kann
das System auch nachträglich aufgerüstet und somit
das Einsatzspektrum erweitert werden. Insgesamt
stehen 10 verschiedene Farbfiltermodule zur Aus-
wahl, mit denen sich das gesamte Spektrum ge-
wöhnlich verwendeter Real-Time-PCR-
Anwendungen (vom blauen bis zum roten Absorpti-
onsbereich) abdecken lässt.
Filter Wellenlänge (Abs. / Em.)
Farbstoffe
TOptical Filter Module 1
470/520nm FAM, SYBR Green, Alexa488
TOptical Filter Module 2
470/545nm JOE, VIC, HEX, Yakima Yellow
TOptical Filter Module 3
535/580nm TAMRA, DFO, Alexa 546, NED
TOptical Filter Module 4
565/605nm ROX, TexasRed, Cy3.5
TOptical Filter Module 5
630/670nm Cy5, Alexa 633, Quasar 670
TOptical Filter Module 6
660/705nm LightCycler Red 705, Alexa 680
TOptical FRET Module 1
470/580nm FAM/TAMRA
TOptical Filter Module 2
470/670nm FAM/Cy5
TOptical Filter Module 3
470/705nm FAM/Cy5.5
TOptical Filter Module 4
515/670nm JOE/Cy5
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LED Technologie
Die Anregung der Fluoreszenzfarbstoffe erfolgt über
drei LEDs in den Farben blau, weiß und rot. Die
Kombination dieser Lichtquellen erlaubt eine opti-
male Anregung der Fluoreszenzfarbstoffe über einen
weiten Spektralbereich. Anders als mit „wide blue“
LEDs lassen sich insbesondere der kurzwellige blaue
und der langwellige rote Bereich bestens anregen. In
Verbindung mit Hochleistungs-Optikfasern und ei-
nem hoch-sensitiven Channel Photo Multiplier wer-
den Intensitätsverluste in der Quantenausbeute ver-
mieden und die maximale Sensitivität sichergestellt.
Bedingt durch die Einzelanregung jedes Wells ist
zudem die Verwendung von passiven Referenzfarb-
stoffen überflüssig, was das Multiplexing mit bis zu
6 Farbstoffen erlaubt. Die Langlebigkeit der LEDs
macht einen regelmäßigen Austausch der Lichtquel-
le überflüssig und hilft damit wiederkehrende Folge-
kosten zu vermeiden.
Software
Der TOptical wird über die qPCRsoft-Software ange-
steuert. Bei der Entwicklung der Software wurde
insbesondere auf leichte Bedienbarkeit und über-
sichtliche Anordnung der Funktionselemente geach-
tet. Die Software enthält die gleiche tabellarische
bzw. graphische Programmierfunktion wie der TPro-
fessional Thermocycler. Informationen zu den Pro-
ben lassen sich in einem übersichtlichen Platten-
schema leicht eingeben und auf einen Blick erfas-
sen. Typische Auswertemethoden der Real-Time
PCR wie der absoluten und relativen Quantifizie-
rung, delta-delta Ct-Methode und Effizienzberech-
nung sind in die Software integriert. Darüber hinaus
sind Export-Tools für weitere externe Analysenpro-
gramme wie Excel, REST und qBASE vorhanden.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Mag. Norbert Wahler
Tel.: 01/4893961-55
Take3 – Proben im Mikro-volumen-Maßstab einfach und schnell gemessen
Moderne Life-Science-Labors benötigen Mikroti-
terplatten-Detektionssysteme mit hoher Flexibilität,
um die Anforderungen verschiedener Benutzer und
diverser Assays erfüllen zu können.
Die Miniaturisierung von Assays gerät immer
mehr in den Interessensmittelpunkt, um Kosten von
Reagenzien und Probenvolumina zu reduzieren.
Während Assay-Miniaturisierung in Mikrotiterplatten
teilweise durch Verwendung von High-Through-Put-
Plattenformaten erreicht werden kann, stehen für die
Quantifizierung von Nukleinsäuren und Protein-
Proben nur wenige Hilfsmittel zur Verfügung.
Die Kombination aus Spektralphotometer und der
Take3 Multivolumen-Platte ergibt ein System, das
dem Anwender ermöglicht, Konzentration von DNA-
Proben bereits ab 2 µL zu bestimmen. Eine Vielzahl
an Assays mit unterschiedlichen Probengefäßen und
Probenmengen können in der Take3-Platte durchge-
führt werden.
Eigenschaften
16 x 2µL Proben Microspots auf einer Quarzglas-
oberfläche
1 Standard-Küvette und 2 BioCell Messpositionen
Kompatibel mit BIOTEK´s Epoch, PowerWave
XS2 und mit allen Synergy Readern
Möglichkeit der Messung in Absorbanz und Fluo-
reszenz
Vorgefertigte Messprotokolle im Gen5-Take3-
Modul
Einfache Reinigung der Quarzglasoberfläche
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Applikationen
Quantifizierung von Nukleinsäuren im
Mikrovolumen
Quantifizierung von Proteinen im Mikrovolumen
In-situ fluorometrische Proteinquantifizierung
In-situ BCA-Assays
Spectral Scanning von einzelnen oder mehreren
“low volume” Proben
Konzentrationsbestimmung von
Fluoreszenzfarbstoffen
Genexpressionsassays
Zellkulturmessungen
Endpunkt- und Kinetic Assays
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an
Dipl.Ing. Danut Laes
Tel.: 01/4893961-43
oder an
Mag. Norbert Wahler
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Hybrid Reader von BIOTEK
Synergy H4 und Synergy H1 sind flexible Filter- und
Monochromatoren-Multi-Mode-Reader. Die Monoch-
romatoren entstammen der dritten Generation eines
Vierfach-Beugungsgitter-Designs, wodurch Wellen-
längen in 1 nm Schritten eingestellt werden können.
Die moderne optische Architektur unterstützt Top-
und Bottom- Fluoreszenzintensität, UV-VIS-
Absorbanz sowie High-Performance-Lumineszenz
Detektion.
Hybrid Technology™: kombiniert die Sensitivität
eines Filter-basierenden Geräts mit den Vorzügen
der Flexibilität der Monochromatoren-Optik, wo-
durch ein breites Spektrum an aktuellen Applika-
tionen abgedeckt werden kann.
Detection Modes: Fluoreszenz Intensität, Time-
Resolved Fluorescence, Fluoreszenz Polarisation,
AlphaScreen®/AlphaLISA, Lumineszenz, UV-VIS
Absorbanz, FRET, TR-FRET, BRET, Well Area
und Spectral Scanning.
Modulare und aufrüstbare Konstruktion: ver-
schiedene Basis-Modelle erhältlich, die in weite-
rer Folge aufgerüstet werden können.
Quadruple Grating System und variierbare
Bandbreitenauswahl: die Optik beinhaltet zwei
Doppel-Brechungsgitter. Dieses Design ergibt die
bestmögliche Performance für Spektral-
Aufnahmen. 4 verschiedene Bandbreiten lassen
sich beim SynergyH4 zusätzlich einstellen.
Filter und dichroische Spiegel: die Kombination
aus Filtern und dichroischen Spiegeln bietet beste
Anwendungsmöglichkeiten für Fluoreszenz Inten-
sität, Time-Resolved-Fluoreszenz und Fluoreszenz
Polarisation Applikationen.
Kompatibel mit Take3™: für DNA-
Quantifizierungen bei 260nm werden nur 2µL
Probenvolumen benötigt.
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PCRSetup - Pipettierroboter von XIRIL
In der modernen Forschung und in diagnostischen
Labors spielen PCR Assays eine wichtige Rolle. Die
gewünschte Sensitivität erfordert beim Pipettieren
von zumeist kleinen Volumina hohe Präzision und
Reproduzierbarkeit, weshalb eine Automatisierung
dieses Arbeitsprozesses verstärkt gefordert wird.
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Die Vorteile einer Automatisierung sind deutlich er-
kennbar: zeitraubendes und fehleranfälliges Handpi-
pettieren und die Gefahr einer Kreuzkontamination
können vermieden werden.
XIRIL AG, ein Schweizer Unternehmen, konnte
sich in den vergangenen Jahren als Anbieter für La-
borautomatisierung mit mittlerem und kleinem
Durchsatz im Bereich Life Science und Diagnostik
positionieren. Die Firmengründer, die auf mehr als
25 Jahre Erfahrung im Bereich Liquid Handling und
Automatisierung zurückgreifen, entwickeln Produkte,
die den aktuellen Anforderungen eines modernen
High Throughput Labors gerecht werden und stellen
mitunter auch eine günstige Alternative für den Mid-
und Low-End-Anwender dar, bei dem Platzprobleme
und limitierte Budgets im Vordergrund stehen.
XIRIL 75 Serie
XIRIL 75 ist ein ideales, für eine kleinere Probenan-
zahl konzipiertes Einstiegsgerät mit einem ausge-
zeichneten Preis-Leistungsverhältnis. Pipettieren,
Plate Handling, Auslesen von Barcodes, Schütteln
etc. können je nach Ausführung auf der kleinen
Grundfläche durchgeführt werden.
Zwei Pipettierkanäle können sich unabhängig
voneinander in der Y- und Z-Achse bewegen und
sich optimal an den Flüssigkeitsspiegel anpassen.
Spezifikation
Pumpe 250 µL 1000 µL
Volumen Bereich
2-250 µL 10-1000 µL
Präzision und Ge-nauigkeit
Pumpe Dispen-siertes Volumen
Präzision (CV%)
Ungenauig-keit (%)
250 µL 20 µL 1.0 % 2.5 %
200 µL 0.5 % 1.0 %
1000 µL
100 µL 1.0 % 3.0 %
1000 µL 0.5 % 1.0 %
Beispiel Deck-Layout für PCR-Setup
Das Layout auf einem XIRIL-Roboter X75-1-2 (1
Roboterarm und 2 Pipettierkanäle) kann leicht neu
konfiguriert werden, um individuelle Bedürfnisse
besser bedienen zu können. In der folgenden Abbil-
dung ist ein Deck-Layout abgebildet, das für die
meisten PCR-Setup- Applikationen verwendet wird.
Abb. Layout für PCR-Setup: 1: Module Decktray, 2: Tip
Waste und Liquid Waste, 3: Rack für 1,5 mL Reagenz-
gefäße, 4: Standard Decktray, 5: 96-well PCR-Platte, 6:
Standard Decktray, 7: Rack für 1,5 mL Reagenzgefäße,
8: 96-well Mikrotiterplatte, 9: High-Precision Decktray,
10: 250µl Rainin Filterspitzen, 11: Proben-Eingabe-
Fenster
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