23/01/18

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NON-INVASIVEDIAGNOSISOFCHROMOSOMALANOMALIES:AMETABOLOMICSAPPROACH

JacopoTroisi,LauraSarno,PasqualeMar5nelli,Costan5noDiCarlo,GiovanniScala,MaurizioRinaldi,CarlaCiccone,MaurizioGuida

Obie,vo

Valutarelaperformancediagnos=cadiunmodellobioinforma=cobasatosull’analisidimetaboli=presen=nelsanguematernonell’individuareidife,cromosomicifetali.

Materiali e metodi

•  Studiopilotacaso-controllo(giugno2013-dicembre2016)

Materiali e metodi

CASIn=108GravideconFe=affe,daanomaliacromosomicanotadopoCVSoAmniocherichiedonoTOP

CONTROLLIn=220Gravidefisiologicheincorsodell’esamediscreeningdelIItrimestre

CRITERIDIESCLUSIONE•  Gravidanzegemellari•  MalformazioninoteinpresenzadiuncarioIponormale

•  PresunteinfezionidelcomplessoTORCH

•  Prelievodiuncampionedisanguedopoalmeno12oredidigiuno

•  Centrifugato•  Sieroconservatoa-80°C

Materiali e metodi

•  ESTRAZIONEDELMETABOLOMA(MetaboPrepGCkit(Theoreo,MontecorvinoPugliano,Italy))

•  ANALISIDELMETABOLOMA(GC-MSsystem)

• Divisionedeicampioniinduegruppi(54casie110controlli)

Materiali e metodi

ADDESTRAMENTODI7ALGORITMIMATEMATICIuni=inunoschemaensemblesuvo=ng

TESTARELAPERFORMANCE

Imetaboli=piùinfluen=nelcrearel’algoritmodiclassificazione(VIP)sonosta=u=lizza=percrearemappemetaboliche

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RISULTATI

• CASI: •  80Trisomia21

•  19Trisomia18

•  3Trisomia16

•  3MonosomiaX

•  3TrisomiaXXY

•  Idiversimodellidiclassificazionehannomostratounaaccuratezzacompresatrail43%eil100%

•  Ilmodelloensemblehaclassificatocorreeamentetu,icasieicontrolli,mostrandoun’accuratezzadel100%perlarivelazionedianeuploidiecromosomiche

RISULTATI

RISULTATI

VIPmetabolitesheatmap

RISULTATI

RISULTATI MECCANISMI COINVOLTI

• Metabolismodegliacidigrassi

↓acidostearicoeacidoelaidico

•  Gliacidigrassisonoimportan=perlosviluppodellavisioneedelsistemanervoso

•  NellasindromediDownsièosservataunaridoeaquan=tàdiacidigrassinellestrueuremielinicherispeeoacontrollisani

Jhonsonetal,1977Sampathetal,2005

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•  Stressossida=vo

↓borneolo•  Azionean=ossidantee

neuroprote,va

Yuetal,2011Yuetal,20013

↑2-idrossi-bu=rrato•  Aumentanellecondizionidi

aumentatostressossida=vo•  Studipreceden=nehanno

dimostratounaumentonellasindromediDOwn

Laandas,1975Bahado-Singhetal,2013

• Meccanismiimmunologici

• ↓mannosio

•  Associazionetrapolimorfismodellamannose-bindinglec5ne2eS.diDown

•  Maggiorrischiodiinfezioneinques=bambini

Demirhanetal,2011

Conclusioni •  Ilmodellobioinforma=copropostoèstatoingradodiinterpretarecorreeamentetu,icasidianeuploidie•  Ilprofilometabolomicodelsieromaternoincasodianeuoploidiaèsugges=vodiunaumentatostressossida=voediunalteratosviluppodelsistemanervosofetale• Ulterioristudisononecessariavalidarequest’analisi•  L’analisimetabolomicapotrebbepermeeercidicomprenderemeglioimeccanismifisiopatologiciallabasedialcuneaneuploidie. Grazie…