ЦЕЛЬ: РАЗРАБОТАТЬ ТЕХНОЛОГИЮ СОЗДАНИЯ АНАЛИТИЧЕСКИХ ТЕСТ-СИСТЕМ ДЛЯ КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ
БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОБ НА ГЕНОМНОМ, ТРАНСКРИПТО-ПРОТЕОМНОМ И МЕТАБОЛОМНОМ УРОВНЕ
ООО «ПОСТГЕНТЕХ»
СХЕМА РАЗРАБОТКИ ТЕХНОЛОГИИ
МЕТА-АНАЛИЗ ДАННЫХ
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ
ОТБОР ПАТТЕРНОВ (ПЛЕЯДЫ) БИОМАРКЕРОВ
ВАЛИДАЦИОННЫЕ ИСПЫТАНИЯ
ИНФОРМАЦИОННО-АНАЛИТИЧЕСКАЯ
ЭКСПЕРТНАЯ СИСТЕМА
ПРОБЛЕМА С ПАНЕЛЯМИ БИОМАРКЕРОВ: все, что можно было открыть легким способом -
уже открыто !!!Простатический специфический антигенРаковый эмбриональный антигенАльфа-фетопротеин …
ПАТТЕРНЫ ПРОТИВ БИОМАРКЕРОВ
• Здравый смысл Биомаркеры должны лучше отделять опухоли
от нормы, потому что они СПЕЦИФИЧНЫ для опухоли. Паттерны содержат много шума
• Однако высокий уровень шума и определяет злокачественный потенциал опухоли, ее плеоморфизм
ДВА ПРОГНОСТИЧЕСКИХ НАБОРА БИОМАРКЕРОВ ДЛЯ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
Wang et al. Lancet 2005,List = 76 лучших генов
Van’t Veer. et al. Nature 2002,List = 70 лучших генов
276 70
ОПРЕДЕЛЕНИЕ НОРМЫ
ЧТО ТАКОЕ НОРМАЛЬНАЯ
ПЕЧЕНЬ ?
НОРМАЛЬНЫХ ПЕЧЕНЕЙ НЕ БЫВАЕТ, КАК И СТАНДАРТНЫХ ПЕЧЕНЕЙ
НАСКОЛЬКО ПЛОХА МОЯ ОПУХОЛЬ?
ОТВЕТ: дистанция от идеальной нормы
Ваша опухоль
Пространство ,занимаемое ОПУХОЛЕВЫМИ образцами
DCancer
Центр пространства НОРМАЛЬНЫХ тканей
DNormal
Центр пространства ОПУХОЛЕВОЙ
клетки
Пространство,занимаемое НОРМАЛЬНЫМИ образцами
ИЗМЕРЕНИЕ РАССТОЯНИЙ В ПРОСТРАНСТВЕ МНОГОПАРАМЕТРИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ
ПРИМЕР №1: Панели биомаркеров
Каждая точка это отдельный образец нормы и опухоли на микрочипе
АДЕНОКАРЦИНОМА ЛЕГКИХ
СОСЕДНЯЯ НОРМАЛЬНАЯ ТКАНЬ
Dcspec – расстояние от центра пространства, занимаемого ОПУХОЛЕВЫМИ образцами
Dnspec – расстояние от центра пространства, занимаемого НОРМАЛЬНЫМИ образцами
ПРИМЕР №2: мишени для лекарств
Онкогены – драйверы опухолевых процессов
Гены-мишени, повреждение которых убивает опухоль
ВЗГЛЯД В БУДУЩЕЕ
ЦЕНТРАЛИЗОВАННАЯЛАБОРАТОРИЯ Профили 100 нормальных образцов простаты
Определение НОРМАЛЬНОГО ПРОСТРАНСТВАдля каждого вида оборудования
Для каждого опухолевого образца, будет измерено расстояние до нормальной ткани
ДРУГИЕ ПРИМЕНЕНИЯ (кроме онкологии)
• СТАРЕНИЕ: как далеки мои ткани от идеала?
• Хронические заболевания – сердечнососудистые, резистентность к инсулину
• Пре-злокачественные воспалительные состояния – могут регистрировать скрытую анеуплоидизацию … канцерогенез…
Top Related