yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail
description
Transcript of yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail
![Page 1: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/1.jpg)
www.yildiz.edu.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html
E mail
![Page 2: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/2.jpg)
klasik moleküler dinamik simülasyon
![Page 3: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/3.jpg)
Atomlar arası etkileşmeler
![Page 4: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/4.jpg)
klasik moleküler dinamik simülasyon
![Page 5: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/6.jpg)
Amaç: Katı ve sıvı fazlarda maddelerin moleküller arası etkileşmeleri
modellemek, termofiziksel özelliklerini, statik yapısını, transport özelliklerini ve faz geçişlerini klasik moleküler dinamik simülasyon ile incelemek.
Özellikler:1. Örgü Sabiti
2. Isı kapasitesi (Sabit hacim ve sabit basınç)
3. Bulk Modülü
4. Lineer Termal Genleşme
5. Lineer Termal Genleşme Katsayısı
6. Radyal Dağılım Fonksiyonu
7. Koordinasyon Sayısı
8. Ortalama Kare Yerdeğiştirme
9. Difüzyon Sabiti
10. Hız oto korelasyon Fonksiyonu
11. Stress oto korelasyon fonksiyonu
12. Kesme Viskozitesi
![Page 7: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/7.jpg)
Simulasyon Kutusu
![Page 8: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/8.jpg)
Krypton Kristal Yapısı
![Page 9: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/9.jpg)
Sıvı Yapısı
![Page 10: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/10.jpg)
![Page 11: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/11.jpg)
• Krypton kütlesi• Örgü sabiti• Örgü pozisyonları• Erime sıcaklığı• Ve diğer özelliklerini bulun
![Page 12: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/12.jpg)
• http://www.ccp5.ac.uk/moldy/moldy.html• moldy.pdf dosyasını indirin• moldy.tar.gz dosyasını indirin• tar.gz dosyasını açın
![Page 13: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/13.jpg)
• Konsole ekranında
• derleme
• çalıştırmaNot : moldy komutunun başına ./ işaretini koyun‘Bulunduğun klasörde çalıştır’ anlamına gelir.
![Page 14: yildiz.tr/~sgunay/molekuler/molekuler.html E mail sdgunay@gmail](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022081503/568146ea550346895db422e5/html5/thumbnails/14.jpg)
Konsole ve editor nasıl çalıştırılır
• http://www.yildiz.edu.tr/~sgunay/sfizik/sifirdanbasla/sfizik.html