Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy...

26
Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy

Transcript of Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy...

Page 1: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Proteiny

Peptidy

Oligopeptidy

Polypeptidy

Page 2: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Úvodní

pojmy: • Struktura proteinů

– primární

– sekundární

– terciární

– kvartérní

• Proteiny podle tvaru

– fibrilární

– globulární

• Konjugované proteiny

• Funkce a význam

• Denaturace

Page 3: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Reakce AMK – tvorba peptidů

Page 4: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Rezonanční struktury peptidové

vazby

• Délka vazby je mezi jednoduchou a dvojnou (peptidová vazba je ze 40% dvojná)

• Uvolňuje se rezonanční energie 85 kJ/mol

Page 5: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Rovinné útvary v řetězci polypeptidu

• útvary jsou planární

• poloha vazby je trans

(výjimečná poloha cis zvyšuje

energii systému)

• každý α-uhlík na sebe váže dva rovinné

útvary, vodík a zbytek R

• vzniká nekonečně konformačních

izomerů stáčením rovinných

útvarů o tzv.torzní úhly (ψ,θ)

Page 6: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární
Page 7: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Řazení AMK v primární struktuře bílkovin

Page 8: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

BIURETOVÁ REAKCE

Page 9: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Hovězí inzulín

Page 10: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Rovinná projekce terciární struktury

molekuly insulinu

Page 11: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

α - Helix

Skládaný list - ß-Hřeben

- paralelní (shodná orientace řetězců)

- antiparalelní (C-N konec a sousední N-C

konec)

Sekundární struktura proteinů

Page 12: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Interakce v řetězci polypeptidu

Interakce mají povahu:

Page 13: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Disperzní síly mezi nepolárními (hydrofóbními) skupinami

fenylalaniny isoleuciny

Page 14: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Některé AMK v předcházejícím obrázku

Najdi a pojmenuj

tyto AMK ???

Page 15: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

„Jednodušší obrázek vazebných interakcí “

Page 16: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Denaturace - vratná

- nevratná

Page 17: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární
Page 18: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

KOLAGEN

Page 19: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

MYOGLOBIN

Page 20: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Membránové proteiny

Page 21: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Oligopeptidy

Page 22: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Další bílkoviny

Page 23: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

Konjugované proteiny obsahují mimo

aminokyselin ještě nebílkovinnou –

prostetickou skupinu

Page 24: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární
Page 25: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární
Page 26: Proteinyvondrackova/CHRANENE/Prezentace/4.Biochemie... · 2013. 11. 4. · Proteiny Peptidy Oligopeptidy Polypeptidy . Úvodní pojmy: • Struktura proteinů –primární –sekundární

ELISA