Vendredi 10 janvier 2014 pathologie 1 Infections respiratoires.

mardi 11 avril 2023 pathologie 1

Infections respiratoiresInfections respiratoires


1.L’APPAREIL RESPIRATOIRE


1.1. ANATOMIE et HISTOLOGIE


Nez-Bouche-Pharynx

langue

fosses nasales

luette

épiglotte

oesophage

Trachée artère

larynx

pharynx

amygdales


Trachée - Bronches - Poumons

Trachée artère

bronches

bronchioles

Poumon gauche

Poumon droit


Histologie de la trachée et bronches

Film pour le mucus :

http://lewebpedagogique.com/lacrp/2010/12/30/histologie-des-voies-aeriennes-pulmonaires/


Du poumon aux alvéoles


Liens entre poumons et cage thoracique


Appareil respiratoire haut et bas

Appareil respiratoire HAUT

Appareil respiratoire BAS


1.2. FLORES

Appareil respiratoire HAUT

Appareil respiratoire BAS

Quasi-stérilitéQuasi-stérilité

Flore importante :• d’abord Gram +

• comprenant des microorganismes potentiellement pathogènes

Flore importante :• d’abord Gram +

• comprenant des microorganismes potentiellement pathogènes


1.3. MÉTHODES D’INVESTIGATION

L’exploration des infections respiratoires basses (et d’autres pathologies) repose sur :

• la radiographie (et la scannographie, l’IRM…)

• la bronchoscopie pouvant être associées à des prélèvements (biopsies, liquide de lavage bronchoalvéolaire, brossage bronchique…)

• des prélèvements plus classiques : l’examen du crachat spontané.


radiographie


radiographie

Pneumonie lobaire franche (pneumocoque)


scan

Pneumonie lobaire franche (pneumocoque)


radiographie

Pneumonie à Klebsiella


fibroscopie


2. LES INFECTIONS « HAUTES »


2.1. Présentation

Les infections hautes sont :

• les ANGINES (infections des amygdales et de leurs environs)

• un ensemble d’infections ± étendues liées au même microorganisme :

• rhinite, rhinopharyngite, pharyngite, trachéite, laryngite, bronchite mais aussi RHUME… On utilisera par la suite le terme de rhinopharyngite…

• des infections un peu particulières comme la COQUELUCHE ou la GRIPPE


2.2. Rhinopharyngites

Les rhinopharyngites sont essentiellement VIRALES.On peut parfois craindre une SURINFECTION BACTÉRIENNE.

Que faut-il faire ?ATTENDRE car l’infection passera toute seule grâce à l’immunité naturelle. Les seuls soins sont symptomatiques.Les antibiotiques sont INUTILES : ils ne doivent pas être prescrits (sauf en cas de surinfection bactérienne).

Certaines bactéries peuvent être en cause comme les Mycoplasma pneumoniae ou Chlamydia pneumoniae. On attend aussi l’immunité naturelle…


2.3. Les ANGINES

L ’examen médical permet de distinguer plusieurs types d’angines :

• les angines érythématopultacées (grosses amygdales

rouges avec éventuellement des points blancs)

• les angines à fausses membranes

• les angines ulcéronécrotiques (angine de VINCENT)


a. angines érythématopultacées

La plupart de ces angines sont VIRALES… (rhinovirus, coronavirus, adénovirus, myxovirus influenzae et parainfluenzae, virus respiratoire syncitial, ...)

La seule qui est redoutée est l’angine à Streptococcus pyogenes (A) car elles sont graves et peuvent conduire à des complications de nature immunopathologique :

• le RAA, Rhumatisme articulaire aigu ou maladie de Bouillaud

• la GNA, glomérulonéphrite aigue


a. angines érythématopultacées

Que faut-il faire ?• DIAGNOSTIQUER (test rapide immunoenzymatique)

• traiter aux antibiotiques (Pénicilline G) uniquement Streptococcus pyogenes


b. angines à fausses membranes

Deux agents possibles :• une DIPHTÉRIE• UNE MONONUCLÉOSE INFECTIEUSE (MNI) due au virus d’Epstein Barr (HHV4) Maladie du « baiser »


b. angines à fausses membranes

Que faire ?

• Pour la MONONUCLÉOSE INFECTIEUSE on attend !!! (la séroprévalence est très grande, de l’ordre de 80% en France)

• Pour la DIPHTÉRIE, maladie rarissime aujourd’hui en France, on « s'affole » !!! Les examens sont entrepris très rapidement, et si des Corynebactéries sont rencontrés au Gram, on traite le malade par sérothérapie immédiatement. On s’intéresse à l’entourage…


c. Angine de Vincent (ulcéronécrotique)

Les microorganismes responsables sont deux, en association, sont anaérobies strictes et produisent des molécules malodorantes (H2S). Ce sont :

• Treponema vincentii• Fusobacterium


2.4. La COQUELUCHE

La coqueluche est une grave infection respiratoire touchant avant tout l’appareil respiratoire haut.Elle touche avant tout les enfants et les tue dans le pays pauvres.

• Bactérie responsable : Causes du pouvoir pathogène :

• Traitement • Prévention


2.5. Infections hautes au laboratoirePour les rhinopharyngites classiques : on ne fait rien !!!!

Dans le cas de la coqueluche, la bactérie peut être mise en évidence par PCR.

Cas particuliers :

• Chancres syphilitiques

• Muguet buccal


Pour les angines :

Sinon, l’observation oriente :

• angine rouge : recherche de ………………………,

• angine à fausses membranes : recherche de ………………

• angine ulcéronécrotique : recherche de ………………………

Sinon, l’observation oriente :

• angine rouge : recherche de ………………………,

• angine à fausses membranes : recherche de ………………

• angine ulcéronécrotique : recherche de ………………………

Le médecin peut réaliser un « doctor test » pour mettre en évidence Streptococcus pyogenes.

Le médecin peut réaliser un « doctor test » pour mettre en évidence Streptococcus pyogenes.


angine rouge :

À partir de l’écouvillon :

• Ensemencement de ……………………..,incubée en …………………………………

• Puis repérage des colonies ……………………..

• Et identification ………………………………..


• Ensemencement de ……………………..,incubée en …………………………………

• Puis repérage des colonies ……………………..




• Impérativement ……………………..,

• Puis isolement sur ……………………..




• Puis isolement sur ……………………..


angine à fausses membranes :






angine ulcéronécrotique :



• Ensemencement de ……………………..,incubé :

• Recherche des colonies suspectes et identification :


• Ensemencement de ……………………..,incubé :

• Recherche des colonies suspectes et identification :

Remarque : recherche de portage du méningocoque


3. LES INFECTIONS « BASSES »


3.1. Présentation

Les infections basses sont des PNEUMOPATHIES (Pneumonies):

• localisées : pneumonie lobaire

• diffuses

• des infections un peu particulières comme la GRIPPE, la LÉGIONELLOSE ou la TUBERCULOSE

Les PNEUMOPATHIES sont toujours très graves car il y a un grand risque de SEPTICÉMIES et de MÉTASTASES SEPTIQUES.

Elles tuent beaucoup de personnes âgées en France.


3.2. PhysiopathologieLes infections basses sont liées aux infections hautes : les microorganismes responsables sont souvent les mêmes que ceux des infections hautes :

• des VIRUS (rarement) comme celui de la grippe, de par leur pouvoir pathogène ou surtout par la SURINFECTION BACTÉRIENNE.

• des BACTÉRIES, souvent résidentes (commensales), et notamment :

• Streptococcus pneumoniae (le Pneumocoque)

• Haemophilus influenzae

• Neisseria meningitidis

• etc…

• des CHAMPIGNONS : très rarement et uniquement chez de sévères immunodéprimés ou de rarissimes fermiers.


Dans tous les cas, il y a un déséquilibre entre les capacités de défenses de l’individu et le pouvoir pathogène de l’agent pathogène.

L ’analyse microbiologique est compliquée et passe par le prélèvement (LBA, brossage ou crachat). De plus, il faut évaluer la concentration des microorganismes et de granulocytes neutrophiles dans le liquide pour conclure…

Le traitement passe par :

• une antibiothérapie en général,

• des manœuvres kinésithérapeutiques

• l’amydalectomie…

• etc…


3.3. Cas de la grippe

La grippe est une infection respiratoire classique sui touche avant tout le rhinopharynx.

Toutefois, dans certains cas, elle peut atteindre le poumon.

Chez certains individus sensibles : pneumonie mortelle

Sinon fréquentes surinfections bactériennes.


3.4. Cas de la tuberculose

La tuberculose est une maladie de grande complexité.

• Bactéries responsables : ……. …... ….. ….. ….. ….. ….. …..

• Maladie :


3.5. Cas de la légionellose

Legionella pneumophila (sérovar 1 surtout)

• transmis par :

• non contagieux

• détecté par :

• test urinaire :

• isolement sur :

• immunologie sérique :

• prévention par


3.5. L’analyse a. Genèse du crachat


• crachat spontané : lavage de la bouche, émission d’un « vrai crachat venant des profondeurs »…

b. Le prélèvement

• prélèvement sous endoscopie

• À la brosse télescopique

• Par lavage bronchoalvéolaire

• ponction transtrachéale


L’expectoration contient :

• les microorganismes commensaux

• les microorganismes responsables

• des granulocytes neutrophiles

• du mucus

• de la fibrine

• des cellules de l’arbre respiratoire

S’ajoute éventuellement la salive entourant les particules purulentes vertes…

c. Traitement du prélèvement

On le traite pour une analyse correcte :

• lavage, si nécessaire et possible, en eau physiologique (5 mL d’eau physiologique et réaspiration)

• homogénéisation pour extraire les microorganismes pathogènes grâce à un digesteur à base de ………………………


Les frottis sont colorés avec :

• Gram

• Kinyoun-Ziehl (BAAR)

• éventuellement MGG/BM

• immunofluorescence pour Legionella

d. Examen microscopique


Il ne peut y avoir de pneumopathies sans granulocytes neutrophiles !!!

Pour conclure à l’infection, on évalue la concentration leucocytaire :

• à x 100 : plus de 25 leucocytes par champ

• à x 100 : moins de 25 cellules épithéliales par champ

• flore monomorphe

Noter la présence éventuelle de larves ou d’œuf (P………………)


Nocardia (actinomycétale)

Histoplasme (champignon dimorphique)


Là encore, s’il y a infection, la concentration en microorganismes sera élevée. Une numération est donc utile.

e. Cultures

Les ensemencements sont réalisés à la dilution 105 réalisée de la façon suivante : une anse calibrée de 10 µL de dilution dans 10 mL d’eau physiologique.

Milieux possibles :

• gélose au sang frais

• gélose au sang frais + ANC

• gélose Chocolat enrichie + Bacitracine (sélectif d’Haemophilus)

• éventuellement une gélose lactosée au BCP pour des microorganismes de culture facile

• si des champignons ont été vus au direct, une gélose Sabouaud + chloramphénicol

Donc 1 colonie correspond à ……………………


Pour conclure :

• 105 bactéries par mL : flore commensale

• 106 bactéries par mL : doutes…

• 107 bactéries par mL : flore probablement pathogène

La bactérie (ou le champignon éventuel) sera évidemment :

• identifiée

• antibiogrammée


Il est possible de détecter des « antigènes urinaires ».

La technique est généralement IMMUNOCHROMATOGRAPHIQUE.

C’est le cas pour :

• Legionella pneumophila

• Streptococcus pneumoniae

f. Tests immunologiques


La recherche du BK impose l’utilisation d’un L3.

Le crachat étant contaminé par la flore commensale, des techniques de décontamination dans le cadre de la fluidification du crachat.

g. Cas particulier du bacille de Koch


On utilise, pour éliminer la flore commensale des détergents : laurylsulfate en milieu alcalin ou benzalkonium.

Il faut revenir à pH neutre (tampon ou acide phosphorique)

On ensemence les milieux ……………

Et on réalise les frottis.


4. TRAITEMENT - PRÉVENTION des

infections respiratoires


TRAITEMENTS• symptomatiques le plus souvent• antibiothérapie dans les cas les plus graves (en particulier les pneumopathies).

PRÉVENTION• Isolement des malades• Masque pour les soignants et visiteurs• Hygiène des locaux et des mains• Interdiction des crachats• Lutte contre le tabagisme• Lutte contre les aérosols amibiens

• Vaccinations• Pneumocoque• Méningocoque• Virus grippal• Coqueluche• Tuberculose• Diphtérie• …


Merci de votre attention !!!!

Réalisé par Jean-Noël Joffinaoût 2006

Au laboratoire de SAINT BRICE !Critiques : [email protected]

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