Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie
description
Transcript of Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie
![Page 1: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/1.jpg)
Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie
Historische ontwikkeling van de systematiek
5. Ontwikkelingen in de twintigste eeuw
karyosystematiek
chemotaxonomie
serologische systematiek
moleculaire systematiek
experimentele systematiek
numerieke taxonomie
cladisme
![Page 2: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/2.jpg)
Begin twintigste eeuw
Ontwikkeling van experimentele richtingen in de biologie
Systematiek ‘dormant’
![Page 3: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/3.jpg)
1665 Robert Hooke ontdekking van de cel
1838 M.J. Scheiden celtheorie
1882 W. Flemming ontdekking van structuren die overlangs splitsen tijdens mitose (helften gaan naar dochtercellen)
1888 Waldeyer benaming 'chromosoom‘
>>>>> beschrijvende cytologie
![Page 4: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/4.jpg)
Nature (2003) 423 : 810-812.
![Page 5: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/5.jpg)
1900 De Vries herontdekking mendelisme
>>>> experimentele cytologie & cytogenetica
![Page 6: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/6.jpg)
Julian Huxley (1940)
The New Systematics
![Page 7: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/7.jpg)
![Page 8: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/8.jpg)
Cytologische waarnemingen
Aantal
Vorm
Relatieve lengte
Techniek:Squash-preparaat(mitose of meiose)
![Page 9: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/10.jpg)
Enkele voorbeelden van chromosoomgetallen (2n) bij planten
Arabidopsis thaliana Brassicac. 2Haplopappus gracilis Asterac. 2 of 4 (rassen!)Crepis neglecta Asterac. 8Crepis kotschyana Asterac. 8Crepis fuliginosa Asterac. 22Sagittaria, alle spp. Alismatac. 22Pinus, alle spp. Gymnospermae 24Caltha palustris Ranunculac. 32 of 56Crepis leontodontoides Asterac. 38Crepis kashmirica Asterac. 100Poa litorosa Poac. 265Voanicola Arecac. 450Ophioglossum reticulatum varens c. 1400
![Page 11: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/11.jpg)
Brachycome dichromosomatica2n = 4
Ophioglossum reticulatum2n = c. 1400
![Page 12: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/12.jpg)
Enkele voorbeelden van chromosoomgetallen (2n) bij planten
Arabidopsis thaliana Brassicac. 2Haplopappus gracilis Asterac. 2 of 4 (rassen!)Crepis neglecta Asterac. 8Crepis kotschyana Asterac. 8Crepis fuliginosa Asterac. 22Sagittaria, alle spp. Alismatac. 22Pinus, alle spp. Gymnospermae 24Caltha palustris Ranunculac. 32 of 56Crepis leontodontoides Asterac. 38Crepis kashmirica Asterac. 100Poa litorosa Poac. 265Voanicola Arecac. 450Ophioglossum reticulatum varens 1260
![Page 13: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/13.jpg)
Enkele voorbeelden van chromosoomgetallen (2n) bij planten
Arabidopsis thaliana Brassicac. 2Haplopappus gracilis Asterac. 2 of 4 (rassen!)Crepis neglecta Asterac. 8Crepis kotschyana Asterac. 8Crepis fuliginosa Asterac. 22Sagittaria, alle spp. Alismatac. 22Pinus, alle spp. Gymnospermae 24Caltha palustris Ranunculac. 32 of 56Crepis leontodontoides Asterac. 38Crepis kashmirica Asterac. 100Poa litorosa Poac. 265Voanicola Arecac. 450Ophioglossum reticulatum varens 1260
![Page 14: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/14.jpg)
Vergelijkende interpretatievan deze cytologische variatie:
cytotaxonomiekaryosystematiek
![Page 15: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/15.jpg)
chromosoomgetal
2n = 22n = haploïd getalx = 11 (basisgetal)
2n = 44n = haploïd getalx = 11 (basisgetal)(auto)polyploïdie
![Page 16: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/16.jpg)
Sinds 1958:Index of Plant Chromosome Numbers
![Page 17: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/17.jpg)
Nl28-118(1966)
Be16-118(1984)
![Page 18: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/18.jpg)
ploïdie 2ndi- 16tetra- 28, 30, 31, 32hybridogeen 34, 36, 38, 39hexa- 42, 44, 45, 46, 48hybridogeen 52, 53, 54octo- 56, 58, 59, 60, 61, 62, 64hybridogeen 65, 66, 67, 68deca- 70, 72, 73, 74, 75, 76, 78, 80, 84? ca. 118
Cardamine pratensis
?
![Page 19: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/19.jpg)
ploïdie 2ndi- 16tetra- 28, 30, 31, 32
34, 36, 38, 39 hexa- 42, 44, 45, 46, 48
52, 53, 54octo- 56, 58, 59, 60, 61, 62, 64
65, 66, 67, 68deca- 70, 72, 73, 74, 75, 76, 78, 80, 84? ca. 118
Cardamine pratensis
POLYPLOÏDIE
![Page 20: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/20.jpg)
ploïdie 2ndi- 16tetra- 28, 30, 31, 32hybridogeen 34, 36, 38, 39 hexa- 42, 44, 45, 46, 48hybridogeen 52, 53, 54octo- 56, 58, 59, 60, 61, 62, 64hybridogeen 65, 66, 67, 68deca- 70, 72, 73, 74, 75, 76, 78, 80, 84? ca. 118
Cardamine pratensis
ANEUPLOÏDIE(polyploïdisatie + hybridisatie)
![Page 21: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/21.jpg)
Verklaring van de onregelmatigheden:
Bastaardering tussen ploïdie-niveausFragmentatie of fusie van chromosomenDysploïde translocatiesB-chromosomen
![Page 22: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/22.jpg)
![Page 23: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/24.jpg)
Spartina maritima2n = 56 (n = 28)Europa
Spartina alterniflora2n = 70 (n=35)N-Amerika
![Page 25: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/25.jpg)
Spartina towsendii2n = 126 (n=63)
![Page 26: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/26.jpg)
S. maritima S. x townsendii S alterniflora AA AABB BB
56 126 70
ALLOPOLYPLOÏDIE
![Page 27: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/27.jpg)
Polyploïde paren
![Page 28: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/28.jpg)
Cardamine hirsutaKleine veldkers2n = 16Akkers & braakland;nitrofiel
Cardamine flexuosaBosveldkers2n = 32Bossen & heggen;Vochtige bodem
![Page 29: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/29.jpg)
Viola reichenbachianaDonkersporig bosviooltje
Viola rivinianaBleeksporig bosviooltje
2n = 20 2n = 40
A – VA Bossen, heggen
, struwelen VA - VZ
![Page 30: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/30.jpg)
Systematische praktijk:
Relatie tussen cytotype en afmeting van pollenkorrels
![Page 31: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/31.jpg)
2n = 22
2n = 22
2n = 22
2n = 44
2n = 44
2n = 44
2n = 44
![Page 32: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/32.jpg)
Vorm & relatieve lengte:
Karyotype en idiogram
![Page 33: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/33.jpg)
Karyosystematiek = microsystematiek ???
![Page 34: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/34.jpg)
Variatie van het basisgetal in de Rosaceae s.l.
Rosoideae x = 7 (zelden 8 of 9)
Prunoideae x = 8
Spiraeoideae x = 9
Pomoideae x = 17
![Page 35: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/35.jpg)
Rosoideae x = 7 (zelden 8 of 9)
Prunoideae x = 8
Spiraeoideae x = 9
Pomoideae x = 17
met monobasische reeksen van chromosoomgetallen
met dibasische reeksen (17 = 8 + 9)
Variatie van het basisgetal in de Rosaceae s.l.
![Page 36: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/36.jpg)
Ranunculaceae
![Page 37: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/37.jpg)
Ranunculaceae
![Page 38: Van artificieel klasseren naar fylogenetische reconstructie](https://reader035.fdocuments.net/reader035/viewer/2022062423/568144bf550346895db1895d/html5/thumbnails/38.jpg)
1970 –“The New Karyosystematics”