Universidade da Beira Interior Licenciatura em Ciências Biomédicas Bioinformática.
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Universidade da Beira InteriorLicenciatura em Ciências Biomédicas
Bioinformática
“Prosite” – base de dados
Proteínas
» Segundo a análise da estrutura primária sabemos que uma proteína é constituída por uma sequência de aminoácidos.
» Para análise da função da proteína e visualização dos respetivos domínios usa-se a forma tridimensional.
O que é o “Prosite”?
» A base de dados PROSITE contém sequências modelo de aminoácidos associadas aos membros de famílias de proteínas, funções específicas de proteínas e modificações pós-traducionais.
» O prosite possui várias ferramentas tais como:ScanProsite, PRATT, MyDomains-Image Creator
Criada em 1988 por Amos Bairoch e Philipp Bucher (investigadores no Instituto Suíço da Bioinformática);
SWISS-PROT & PROSITE;
Base de dados mais antiga e conhecida.
História
Evolução …1988 1994 2006 2012
0500
10001500200025003000350040004500
Variação no número de registos ao longo dos anos
Para que serve?
» Esta base dados é usada para descobrir informações acerca da “nova proteína” como por exemplo: função, estrutura 3D da proteína;
» Também é usada para descobrir modificações numa proteína;
Obrigado pela atenção!!!!
Alexandra Soares a24016Cátia Rocha a23054 Vanessa Conde a23586
FIM