Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk · (GABA-szintetizáló enzim- GAD65)...

124
Erdélyi Ferenc MTA KOKI Orvosi Géntechnológiai Részleg Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk

Transcript of Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk · (GABA-szintetizáló enzim- GAD65)...

  • Erdélyi Ferenc

    MTA KOKI

    Orvosi Géntechnológiai Részleg

    Transzgenikus egerek

    előállítása és felhasználásuk

  • Transzgenikus állatok

    Géntranszfer eredményeként a genomba (random) beépülve

    egy idegen DNS darabot tartalmaznak.

    Mesterségesen megváltozatott genetikai állománnyal

    rendelkeznek.

    Génaddíció

    Célzott génmódosítás

    Endogén gén célzott mesterséges megváltoztatása.

    Genom módosítás

    Öröklődő: a gén/genom módosítás érinti az ivarsejtet is. (ivarsejt- embrionális őssejt módosítás)

    Szomatikus: gén/genom módosítás csak a testi sejteket érinti.

    (módosítás testi sejtekbe történik, a DNS integrálódhat a

    genomba, vagy lehet episzómális is )

    A genom módosítás lehet térben és időben szabályozott és reverzibilis is.

  • Genetikai állatmodellek

    random

    • spontán mutánsok

    • kémiai mutagenezis tervezett (transzgenikus)

    szomatikus csíravonal

    öröklődő

    funkciónyeréses mutáns

    (gain-of-function)

    funkióvesztéses mutáns

    (loss-of-function)

    túltermelés domináns negatív null-mutáns

    knockout

    részleges

    (hipomorf)

    mutáns

    knockdown

    mutáció

    knockin sejt-abláció

    kondicionális/indukálható térben és/vagy időben szabályozott

  • Transzgenikus állatok felhasználása

    • szövet- és fejlődés- specifikus

    génszabályozás (promoter vizsgálat)

    • génfunkciós és fejlődéstani vizsgálatok

    • sejtazonosítás

    • sejtfunkciós vizsgálatok

    • emberi betegségek állatmodelljeinek

    létrehozása

    • gyógyszercélpontok validálása-fejlesztés

    • gyógyászatban fontos fehérjék előállítása

    (bioreaktorok)

    • haszonállatok előnyös tulajdonságainak

    javítása

    kutatás

    gyakorlat

  • Miért pont egér?

    • Régóta tenyésztik

    • Sok jól definiált törzse ismert

    • Kis helyigény

    • Felhasználó barát

    • Könnyen manipulálható

  • Egerek embrionális fejlődése

  • Donor nőstények előkészítése 5-8 hetes nőstény: 5U Pregnant Mare Serum Gonadotropin

    (FSH)

    5U Human Chorionic Gonadotropin

    Időzítés: PMSG 14 h

    47 órával később

    HCG 13 h

    Pároztatás donor hímmel

    Másnap reggel plugolás

  • Embrió

    Donor nőstény X Donor hím

    Álvemhes anya

    Recipiens nőstény X Vazektomizált hím

  • Embrió preparálás

    ampulla

    Hyaluronidáz

  • Mikroinjektált embrió beültetése

  • Az eukarióta génexpresszió

    szabályozásának lépései

    DNS primér mRNS mRNS

    transzkriptum

    transzkripció

    RNS

    processzing

    RNS

    transzport

    sejtmag citoplazma

    transzlációs

    szabályozás

    inaktív mRNS

    fehérje

    aktív inaktív

    poszttranszlációs

    modifikáció

    mRNS

    degradáció

  • Gének általános szerkezete 5’-upstream

    régió

    3’-downstream

    régió exon inron

    ATG

    Kozák konszenzus

    GCCACCATGGCTG

    PoliA addiciós szignál

    Határoló szekvenciák

    MAR, SAR, LCR

  • Genetikai módosítás fajtái 1.

    transzgén

    A

    „transzgenikus”

    A’ A’’ transzgén transzgén

  • A mikroinjektált transzgén sorsa

    •Fej-farok irányú konkatamér képződés

    •Beépülés a genomba általában egy helyre

    •Koinjektált DNS együttes beépülésének esélye magas

    •Integráció helye random (preferenciális helyek?)

    •Bépülés helye hatással van az expresszióra

    (heterokromatikus régió- néma)

  • Hagyományos pronukleáris

    mikroinjektálás

    Előnyök

    • Felszerelés igénye kicsi

    • Olcsó

    • Gyors

    • Hatékony (1-25%)

    • Nagy kópiaszám

    • Expresszió szintje magas

    Hátrányok

    • Véletlenszerű beépülés

    • Transzgén beépülése

    konkatamer formában

    • Inaktiváció esélye magas

    • Csak génaddíció

    lehetséges.

  • Riportergéneket expresszáló

    transzgenikus egerek A riportergén egy olyan fehérjét kódol, amelynek az expressziója egy

    meghatározott génhez kötött és nem befolyásolja a sejtfunkciót.

    Alkalmazása ✦ gének szabályozó elemeinek azonosítása, jellemzése ✦ sejtek jelölése ✦ fehérjék jelölése fehérje expresszió, aktivitás

    lokalizáció sejtben, szövetben, szervezetben

    fehérje-fehérje kapcsolat

    fehérje mozgás

    jelátviteli funkciók

  • Biolumineszcencia és fluoreszcencia alapján

    élőben, egész állatban is kimutathatók, nyomon

    követhetők (hűtött CCD kamera).

    Riporterfehérjék

    bakteriális -galaktozidáz enzim: LacZ gén kódolja

    kimutatása enzimhisztokémiával/enzimaktivitás alapján

    Luciferáz enzim (szentjánosbogár)

    kimutatása: biolumineszcenciával/enzimaktivitás alapján

    fluoreszkáló fehérjék (GFP, DsRED)

    kimutatása autofluoreszcencia alapján

  • A génexpresszió helye in vivo detektálható a

    biolumineszcens markergént hordozó

    transzgenikus modellben

    • könnyű valós in vivo detektálás

    • ugyanazon kísérleti állaton több időpontban

    is elvégezhető a vizsgálat

  • 5000

    10000

    15000

    20000

    25000 kontrol

    IFNg+sLPS

    IFNg+sLPS

    + Dex

    IFN+sLPS

    transzkripció

    a májban

    gyulladásos állapotokban

    aktiválódik:

    • zimozán-indukálta arthritis

    • bőrsérülés gyógyulása

    Gyulladáscsökkentő

    szerek tesztelésére

    Az iNOS gén transzkripciós aktivitásának in vivo

    egész állatban történő valós detektálása

    iNOS

    luciferáz

    30000

  • Genetikailag kódolt fluorogének

    fluoreszcens riporter fehérjék

    fluoreszcens szenzorok (PF-k)

  • Genetikailag kódolt fluoreszkáló fehérjék

    használatának előnyei, hátrányai

    ! detektálásához nem kell szubsztrát ! expresszáló sejtek élőben és fixálatlan szeletben is azonosíthatók ! fixálás után is működik ! ellenanyaggal is kimutatható ! mivel nincs amplifikálás a kimutatásnál nem túl érzékeny ! nagyon stabil, ezért az expresszió gyors változásainak kimutatására

    kevésbé alkalmas

    ! sokféleképpen módosítható aminósavcsere fúzió

    inszerció

    cirkuláris permutáció

  • Prototípus: zöld fluoreszkáló fehérje (GFP)

    GFP fehérje GFP fehérje

  • GFP mesterséges színvariánsok

  • Spectra are normalized to the excitation and emission peak for each protein.

    (a,b) Excitation (a) and emission (b) curves are shown as solid or dashed lines

    for monomeric variants and as a dotted line for dTomato and tdTomato, with

    colors corresponding to the color of each variant. (c,d) Purified proteins (from left

    to right, mHoneydew, mBanana, mOrange, tdTomato, mTangerine, mStrawberry,

    and mCherry) are shown in visible light (c) and fluorescence (d). The

    fluorescence image is a composite of several images with excitation ranging

    from 480 nm to 560 nm.

    mRFP variánsok

  • Transzgenikus egérben: DsRedT3

  • kódoló régió

    poli(A)

    • mRNS másolat (cDNS)

    •minigén hibrid gén

    „valódi” gén

    intakt/mutáns

    ATG

    start

    TGA

    stop

    riportergén: sejtek jelölése/fehérjék

    -galaktozidáz

    zöld fluoreszkáló fehérje (GFP)

    luciferáz

    „valódi” gén megváltozott sejtfunkció

    mutáns, hibrid,csonkolt

    Transzgén kódoló régiója

    jelző

    funkció

    promoter

    sejt

    fehérje

  • mindes sejtjében

    „transzgenikus” egér

    transzgenikus agy

    transzgenikus

    idegsejt

    promoter

    Általános (CAG)

    Agyspecifikus (NSE)

    Purkinje sejt specifikus (L7)

    Transzgén kifejeződés specificitását a

    DNS szabályozó elem határozza meg

    GFP

    -gal

    -gal

  • kisagy

    Transzgenikus kisagyi Purkinje sejtek

    L7 Purkinje sejt specifikus gén

    E1 E2 E3

    -galaktozidáz

    zöld fluoreszkáló fehérje

    Purkinje sejt

  • GABAerg idegsejt-specifikus gén

    (GABA-szintetizáló enzim- GAD65)

    transzgén

    fluoreszáló GABAerg idegsejtek

    az agyban

    szaglógumó kisagyi Purkinje

    sejt

    medúza zöld

    fluoreszkáló

    fehérje gén

    Gátló (GABAerg) idegsejtek genetikai módosítása

    eGFP

    embrió agy

    hippocampus

    cortex

  • GFP+ Purkinje sejtek izolálása FAX-szal

    tiszta Purkinje sejt tenyészet

    L7/gfp transzgenikus egér

    FAX

    Purkinje sejt

  • általános, minden sejtben működő promoter CAG (csirke aktin promoter CMV enhancer)

    ROSA26

    ubiqutin,

    RNS pol. II

    szövetspecifikus

    sejttípus-specifikus

    indukálható

    promoter típusok

    természetes

    hibrid/mesterséges szövetspecfikus enhancer-

    hsp68 (tk) minimál promoter

    szövetspecifikus enhancerek

    azonosítására

    Transzgén expresszió térbeni szabályozása

    transzgén regulációs

    régiója kódoló régió enhancer-promoter

    Meghatározza a transzgén expressziójának:

    helyét

    idejét

    szabályozását

    intron

    poli(A)

  • Tipikus emlős génregulációs régió

    Az emlős géneket a promotereken kívül több enhancer

    és silencer szabályozza. Egy tipikus enhancer ≈ 500 bp hosszú ≈10

    Kötőhelyet tartalmaz, amelyhez legalább háromféle transzkripciós

    faktor, valamint 2 különböző aktivátor és egy represszor kötődik.

  • A transzkripció szabályozásában

    résztvevő transz elemek

  • Nagyméretű inszertet tartalmazó

    klónozó vektorok

    Plazmid: ~10 kb

    l-fág: ~20 kb

    cosmid: 34-40 kb

    • P1 fág: 100 kb

    • PAC/BAC: 350 kb

    • YAC: 2 Mb

  • P1 fág – BAC vector

  • YAC vector

  • cortex hippocampus

    cerebellum Purkinje sejtek izom

    PV-GFP transzgenikus egerek plazmid: csak izom expresszió

    BAC: izom és agy expresszió

    agy

  • Hagyományos pronukleáris

    mikroinjektálás

    Előnyök

    • Felszerelés igénye kicsi

    • Olcsó

    • Gyors

    • Hatékony (5-30%)

    • Nagy kópiaszám

    • Expresszió szintje magas

    Hátrányok

    • Véletlenszerű beépülés

    • Transzgén beépülése

    konkatamer formában

    • Inaktiváció esélye magas

    • Csak génaddíció

    lehetséges.

  • Genetikai módosítás fajtái 2.

    „knock-out”

    NeoR gén

    Homológ rekombináció

    Transzláció nem megy végbe

    X X

    A exon1 exon2

    P

    NeoR gén

    P

  • Genetikai módosítás fajtái 3.

    „knock-in”

    Homológ rekombináció

    kifejezendő gén

    A exon1

    exon2 Transzlációs start

    P X X

    Transzlációs start P

  • Genetikai módosítás fajtái 4.

    Speciális fajtája a „speedy mouse”, ahol egy olyan konstitutív génbe

    inzertálják homológ rekombinációval a kifejezendő gént, aminek

    hiánya nem okoz fiziológiai változást, viszont a gén környezete

    lehetővé teszi, hogy minden sejtben egyenletes expresszió alakuljon

    ki. (hprt lókusz X kromoszóma, ROSA26)

    Transzlációs start P P

  • Kiméra előállítás

  • Szőrszín kimérák

  • C57BL/6NTac-Atm1.1ArteTyrtm1Arte

    • Blasztociszta donor

    cc,AA

    • ES sejt CC,aa

    • C57Bl6 CC,aa

    • Hibridek Cc, Aa aguti

  • ES-sejt gén manipuláció

    Előnyök

    • A génbevitel nagy

    hatásfokú

    • Szelekciós lehetőségek

    állnak rendelkezésre

    • Könnyen archiválható

    • Szinte bármilyen gén és

    genom manipulációra

    lehetőség van.

    • Knockout Mouse Project

    Hátrányok

    • Korlátozott a sejtvonalak

    száma

    • Folyamatos kromoszóma

    és fertilitás ellenőrzés

    • Drága

    • Csak olyan laborokban

    működik, ahol

    folyamatosan nagyszámú

    mutánst állítanak elő

    • Neo kazetta problémás

  • Taconic rendszer

    exon

    exon

    Neo loxP loxP

    flp flp

  • Hagyományos pronukleáris

    mikroinjektálás

    Előnyök

    • Felszerelés igénye kicsi

    • Olcsó

    • Gyors

    • Hatékony (1-25%)

    • Nagy kópiaszám

    • Expresszió szintje magas

    Hátrányok

    • Véletlenszerű beépülés

    • Transzgén beépülése

    konkatamer formában

    • Inaktiváció esélye magas

    • Nagy kópiaszám

    • Csak génaddíció

    lehetséges.

  • Transzpozícióra képes

    segédfehérjék használata

    • Lentivírus

    – Vírus mediált beépülés

    – Módosított, defektív HIV vírus

    – Helper vírussal burok generálás

    – Korlátozott cargo kapacitás

    – BLS2 szintű labor és állatház

    • Transzpozonok

  • Genetikai módosítás fajtái 1b.

    A

    „transzgenikus”

    A’ A’’

    transzgén

    LTR LTR

    transzgén

    LTR LTR

    Transzpozáz

  • Transzpozon mediált genom módosítás A 2. típusú transzpozonok olyan mobil genetikai elemek, amelyek

    önkivágó/beépítő aktivitással rendelkező transzpozázt kódolnak és annak

    felismerő helyét is tartalmazzák.

    „cut and paste” transzpozició

    önkivágás

    beépülés új helyre

    1. a transzpozáz felismerő helyekkel (IR) körülvett beültetendő gént tartalmazó vektor

    2. A transzpozázt hordozó vektor RNS-sel helyettesíthető

    Amennyiben mindkettő jelen van a sejtben a kivágás és a genomiális DNS-be való

    Integráció megtörténik.

    transzpozon alapú géntranszfer rendszer

    1

    2

  • Transzpozon mediált genom módosítás Gerincesekben aktív 2-es típusú transzpozon rendszerek

    Név/forrás Transzpozon

    család

    Cargo méret Integrációs preferencia

    Sleeping beauty (SB)*

    Tc1/mariner 5-7 kb?

    Méret növelésével

    csökken a hatásfok

    nincs gén preferencia

    inkább intron

    piggyBac piggyBac Hatásfok csökken 9 kb

    felett -pronukl. injektálás

    gén kódoló régió

    preferencia

    Frog prince Tc1/mariner ua. min egyéb

    Tc1/mainer

    intron preferencia

    Tol1/2 hAT nagyobb mint a többi

    10-20 kb (BAC transzgén

    70 kb)

    gének 5’-régiója?

    Izsvák Zs, Ivics Z, Matés L

    SB100 X- 100X aktívabb: 35-50% hatékonyság stem sejtekben, 45% stabil transzgenikus egér

  • Transzpozon mediálta genom módosítás

    • Alapja random inszerciós mutagenezis (funkció vesztés funkció nyerés)

    • két-komponensű rendszer: (1) transzpozon vektor tartalmazza a bevinni kívánt cDNS-t, vagy a gén inaktiváláshoz (aktiváláshoz) szükséges elemeket

    (2) transzpozáz RNS/vektor formában. Mindkét komponenst be kell juttatni a

    sejtbe

    • Néhány kópiába épül be (függ a transzpozon/transzpozáz mennyiségétől) • Szomatikus és ivarsejt módosításra is alkalmas • Nem vírus-eredetű géntranszfert tesz lehetővé • Nagy hatásfokú, gyors módszer

    Használható

    • Transzgenikus modellállatok előállítása (egér, patkány, nyúl stb) génaddíció

    RNAi knock down- kiválthatja a lentivírust

    • Inszerciós mutagenezis- nem homológ rekombináción alapuló KO technológia- ES sejt független - nagyléptékű patkány KO projekt

    • génterápia • Humán (és egyéb) KO sejtvonalak előállítása • iPSC vonalak előállítása vírus nélkül

  • sb-cag/eyfp transzgén kópiaszáma

    az alapító egyedekben

  • line # founder offspring F1 offspring F2

    ID copy number pups/Tg copy number ID/copy number pups/Tg copy number

    22 105798 mosaic 8/3 1

    5/2 1

    23 105799 mosaic 4/4 1

    7/3 24 105800 2 11/0 25 105801 2 0

    26 105802 3-4 4/4 2

    108977 male/2 5/4 1-2

    10/8 1-2

    27 105803 6 6/6 1-6 110175 female/6 6/5 3-4

    110176 female/4 8/8 1-4

    28 105804 4-5 6/6 1-4

    8/8

    43 105815 1 7/5 1 7/6

    7/6 6/5

    44 105816 ~1 7/2 1

    6/2

    45 105817 ~2 6/1 ~2

    11/0 4/1

    46 105818 1 9/5 1-2

    7/3

    47

    105819 5 9/9 3-5 108961 male/4

    108964 female/5 4/4 2-4

    108967 female/5 7/7

  • A

    C

    B

    D

    SB-CAG/eYFP mouse brain sagittal sections. A: Cerebral Cortex, B: Cerebellum, C: Hippocampus

    D: Detailed part of prefrontal cortex. As figures show, however the brain itself seems to be green, CAG

    promoter is not active in neurons oposite of endothel layer of vessels.

  • Transzpozáz mediált genom

    módosítás

    Előnyök

    • Nagy hatásfokú (15-85%)

    • Az integrálódás egyedi,

    így a transzgén

    inaktiválódás esélye

    alacsonyabb

    • A transzgén

    továbbörökítés aránya

    magas

    Hátrányok

    • RNS munkát igényel, ami

    drágább és nagyobb

    odafigyelést igényel.

    • Az alacsony kópiaszámból

    adódóan a transzgén

    expressziója alacsony

    lehet

    • A „cargo” méretre korlátoz

    • A random integrálódásból

    adódó gén inaktiválódás

    előfordulhat

  • PhiC31 integráz mediált géntranszfer

    attB helyek elhelyezése a ROSA26 locusba

    Streptomyces ΦC31fág integráz

  • Genetikai módosítás fajtái 4. Speciális fajtája a „speedy mouse”, ahol egy olyan konstitutív génbe

    inzertálják homológ rekombinációval a kifejezendő gént, aminek

    hiánya nem okoz fiziológiai változást, viszont a gén környezete

    lehetővé teszi, hogy minden sejtben egyenletes expresszió alakuljon

    ki. (hprt lókusz X kromoszóma, ROSA26)

    Transzlációs start P P

  • Meganukleázok

    • Endonukleáz aktivitással bíró enzimek

    • DNS duplaszál törést követően megnő

    a repair aktivitás, ami rekombinációs hot

    spotot alakít ki

    • Target specifitással bíró hibrid

    meganukleázok kialakítása

  • Genetikai módosítás fajtái 2b.

    „knock-out”

    Transzláció nem megy végbe

    X X

    A

    MN MN

    TALEN, ZFN, CRISPR

    P

    P

    XX

    P

  • „ZN-finger” nukleáz mediált genom módosítások

  • „ZN-finger” nukleáz mediálta genom

    módosítások ZNF kettőszálú törést okoz a genom

    meghatározott helyén.

    Specificitást a ZF biztosítja.

    1. A törést a sejt NHEJ

    mechanizmussal javítja

    mikrodeléció/inszerció

    potenciális KO

    2. A törést a sejt HR

    mechanizmussal javítja

    + módosított homológ régió

    knock in

    deléció

    mutáció

  • ZN-finger” nukleáz mediálta genom módosítással

    KO sejtek és modellállatok is létrehozhatók

    Előnye

    • Homológ rekombináció nélkül

    létrehozható KO sejtvonal, vagy modellállat

    • Azokba az állatfajokban is alkalmazható,

    amelyeknél nem áll rendelkezésre

    pluripotens ES sejt

    • Nagy a hatásfoka és gyors

    A kívánt specificitású ZNF-et elő kell állítani

    Ez nem egyszerű és drága

    Hátránya

    Transzgenikus patkány előállítása

    ZNF technológiával

    mutáció a kódoló

    exonban

    KO

  • SIGMA-SAGE labs

    • ZNF

    • KO sejtvonalak előállítása

    • GMO állatmodellek előállítása: egér, patkány és nyúl bármely törzs

    constitutive KO

    humanization

    reporter tagging

    point mutations Kész patkány KO modellek

  • TALEN

  • Xanthomonas sp.

    Transcriptional

    activator like effectors

    TALE

    34 aminosav modulok

    (repeat variable

    diresidues RVD)

    12., 13. aminosav a

    nukleotid kötésért

    felelős aminosavak

    NI = A,

    HD = C,

    NG = T,

    NN = G or A)

  • TRESK mutáns egerek szekvenciája

    Wt CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCTGTCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm48 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT-TCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm57 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT--CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm7 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT--CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm57 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATG--GTCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm60 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAAGC----TCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm51 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm49 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm44 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm38 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG

    Tm43 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGG---------------------------------GGATGCTGCCCCG

    Tm61 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGA---------------------------------TGAGGCCCCG

    TALEN felismerő hely

    Nucleotid mutáció

    --- deléció

    9bp hosszú repeat

  • CRISPR/Cas

  • Lehetséges történések

  • Target specifikus nukleázok

    Cink finger TALEN CRISPR/Cas

    Tervezés közepes könnyű könnyű

    Konstruálás közepes könnyű nagyon könnyű

    Hatékonyság alacsony 80-90% magas

    Aktivitás alacsony/

    változó

    magas magas

    Off-targeting

    vágás

    változó alacsony magas

    Toxikusság változó alacsony alacsony

    Költség magas közepes alacsony

  • ES sejt vs target specifikus

    nukleázok

    ES

    • Csak dedikált laborokban

    • Folyamatos ES sejt ellenőrzés

    • Egy konstrukció 1 vonal

    • Egy sejtvonal még nem

    garantálja az egész egeret és

    a továbbörökítés sem 100%

    • ~40.000 €

    • 40 hét

    TSN

    • Nem igényel nagy befektetést

    • RNS munka

    • Egy konstrukció több féle vonal

    (knock-out, potenciális knock-

    down és knockin)

    • Vonal kialakítás közel 100%

    • ~4-6.000 €

    • 16-20 hét

  • Konstitutív - indukálható

    • Korai megnyilvánulás, vagy korai

    génhiány sok esetben káros

    • A szervezet gyakorta kompenzál, így egy

    gén hiányát más, hasonló funkcióval bíró

    gének veszik át

    • Egy gén sok szövet - és sejtféleségben

    nyilvánulhat meg, az általános génkiütés

    elfedheti a specifikus működést.

  • Indukálható promóterek I. indukálható endogén promoterek használata:

    transzgén expresszió szabályozása endogén kontrol szekvenciákkal

    heat shock promoter;

    metallothionein MAF kötődik a MRE-hez Cd/Zn jelenlétében;

    interferon aktiválható promoter;

    steroid regulált promoterek;

    GRE (glukokortikoid- MMTV)

    indukálhatóság nem túl magas, “mellékhatások”

  • Indukálható promóterek II.

    Mesterségesen indukálható génexpresszió: indukálható transzgenezis

    Szövetspecifikus promóter TRANSZKRIPCIÓS faktor

    Reszponzív promóter Target transzgén

    RNS

    pol

  • Szövetspecifikus promóter rtTA-VP16

    tetO – CMV IE Target transzgén

    RNS

    pol

  • Térbeli szabályozás Cre

    rekombinázzal

  • Cre mediált génkifejezés

  • Brainbow egér

  • 1. Konstrukció elkészítése

    2. Génbevitel

    3. „founder” kiválasztása – genotipizálás

    4. Transzgenikus vonal kialakítása

    5. Kísérletezés

    6. Egyéb állattechnológiai eljárások

  • Genomiális DNS izolálás farok mintákból

    2-3 mm darab - Proteináz K feltárás

    • fenol-kloroform extrakció

    - etanol/izopropanol kicsapás

    Előny: nagy mennyiségő tiszta DNS, olcsó

    Hátrány: munkaigényes, veszélyes szerves oldószer

    • magas ionerő mellett szilikátos megkötés

    - mosás guanidin izo tiocianát hidroklorid oldattal

    - elúció alacsony ionerő mellett

    Előny: automatizálható

    Hátrány: rossz kitermelés, drága

    Transzgenikus egyedek azonosítása

    és jellemzése

  • Transzgenikus egyedek azonosítása

    és jellemzése II. Génexpresszió alapján

    RNS - Northern hibridizáció

    - RT-PCR

    Fehérje - Western blot

    - enzim aktivitás

    - fenotípus

    Homozigóta egyedekben a transzgén expresszió szintje

    magasabb lehet.

  • 1. Konstrukció elkészítése

    2. Génbevitel

    3. „founder” kiválasztása – genotipizálás

    4. Transzgenikus vonal kialakítása

    5. Kísérletezés

    6. Egyéb állattechnológiai eljárások

  • Transzgenikus egyedeket nem transzgenikus egyedekkel

    keresztezik, felszaporított heterozigóta egyedek

    keresztezésével homozigóta vonalakat alakítanak ki.

  • 1. Konstrukció elkészítése

    2. Génbevitel

    3. „founder” kiválasztása – genotipizálás

    4. Transzgenikus vonal kialakítása

    5. Kísérletezés

    6. Egyéb állattechnológiai eljárások

  • Kísérletezés

    Mit használjunk, és hogyan?

  • Egér fajok elterjedése

  • Laboratóriumi egerek eredete

  • W.E. Castle C.C. Little

    Kedvtelésből tartott egerek -

    Ázsia, Európa

    (XVIII-XX. Sz.)

    Abbie Lathrop összegyűjtötte

    és tenyésztette őket

    Granby, MA – 1900

    Castle, Little és

    Mások folytatták Lathrop

    munkáját és alakították ki

    Az első inbred törzseket

    (1908-tól)

  • Swiss

    Castle’s egerek

    C57- leszármazott

    Kína Japán

    Egyéb törzsek

    vad eredetű

    Egér Családfa

  • Felhasznált egértörzsek

    C57/BL6

    FVB/N

    NMRI

    129

  • Outbred/F1 Inbred

  • Magatartás

    Szív és érrendszer élettana

    Fejlődési defektek

    Diabetes

    Immunitás and gyulladás

    Metabolizmus

    Tumor képzés és gyakoriság

    A genetikai háttér hatása a genetikai módosítás

    fenotípusos megjelenésére

  • Adapted from Almind et al., Diabetes 52:1535, 2003

    15

    10

    5

    0

    n 100

    200

    300

    400

    500

    Blood glucose (mg/dL)

    129

    B6

  • 2 típusú diabetes

    Obese ob/ob (Lepob)

    C57BL/6 (B6.V-Lepob/J)

    elhízás tranziens diabetes-szel

    C57BLKS (BKS.V-Lepob /J)

    elhízás megnyilvánuló diabetes-szel

    Diabetes db/db (Leprdb) C57BL/6 (B6.Cg-m +/+ Leprdb/J)

    elhízás tranziens diabetes-szel

    C57BLKS (BKS.Cg- m +/+ Leprdb /J)

    elhízás megnyilvánuló diabetes-szel

  • Episztatikus faktorok hatása a

    transzgén megnyilvánulásra

    25

    30

    35

    40

    45

    50

    5 10 15 20 25 30 35

    weeks

    Bo

    dy

    we

    igh

    t (g

    )

    WT

    HDC -/-

    Fülöp et al. Endocrinology 2003

  • FVB/N-FVB/Ant

  • Co-isogenic Congenic

    1 2 3 4 5 1 2 3 4 5

  • A. Hagyományos B. “SPEED CONGENIC”

    Strain A

    a/amt

    Strain B

    b/b

    b/amt

    Strain B

    b/b

    b/amt

    N5-N11

    b/amt

    N12F1

    amt/amt

    N12F1

    a/amt

    N12F1

    a/amt

    N12F1

    a/a

    N12F1

    amt/amt

    Beltenyésztett

    kongenikus törzs

    N12F1

    a/a

    Strain B-amt Strain B

    Generation

    F1

    F1N2

    F1N3

    F1N4

    F1N1

    F1N12

    % loci A/B

    100%

    25%

    12.5%

    6.25%

    50%

  • Alom kontrol

    cb1Z cb1 cypD D2R net

    +/+ 29% 27% 31% 30% 31%

    +/- 50% 50% 47% 48% 56%

    -/- 21% 23% 22% 22% 13%

    utódszám 288 2145 221 330 327

    tenyészpár 16 78 7 12 13

  • 1. Konstrukció elkészítése

    2. Génbevitel

    3. „founder” kiválasztása – genotipizálás

    4. Transzgenikus vonal kialakítása

    5. Kísérletezés

    6. Egyéb állattechnológiai eljárások

    • Rederiválás

    • Embrió mélyhűtés

  • Befogadó állatház

    Rederiválás

    Tripszin

    kezelés

    SPF space

    SPF „béranya”

    Elválasztás után

    higiéniai státusz

    ellenőrzése

    Szuperovuláció kiváltása

    hormoninjekcióval

    Kórokozó mentes kolónia

    barrier

    ♂ ♀ X

    Fertőzött kolónia

    zigóta/hólyagcsíra

    állapotú embrió

    preparálás

  • 1. Konstrukció elkészítése

    2. Mikroinjektálás

    3. „founder” kiválasztása – genotipizálás

    4. Transzgenikus vonal kialakítása

    5. Kísérletezés

    6. Egyéb állattechnológiai eljárások

    • Rederiválás

    • Embrió mélyhűtés

  • 1. Konstrukció elkészítése

    2. Génbeviteli eljárás

    3. „founder” kiválasztása – genotipizálás

    4. Transzgenikus vonal kialakítása

    5. Kísérletezés

    6. Egyéb állattechnológiai eljárások

    • Rederiválás

    • Embrió mélyhűtés

    Technológiai sor