Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk · (GABA-szintetizáló enzim- GAD65)...
Transcript of Transzgenikus egerek előállítása és felhasználásuk · (GABA-szintetizáló enzim- GAD65)...
-
Erdélyi Ferenc
MTA KOKI
Orvosi Géntechnológiai Részleg
Transzgenikus egerek
előállítása és felhasználásuk
-
Transzgenikus állatok
Géntranszfer eredményeként a genomba (random) beépülve
egy idegen DNS darabot tartalmaznak.
Mesterségesen megváltozatott genetikai állománnyal
rendelkeznek.
Génaddíció
Célzott génmódosítás
Endogén gén célzott mesterséges megváltoztatása.
Genom módosítás
Öröklődő: a gén/genom módosítás érinti az ivarsejtet is. (ivarsejt- embrionális őssejt módosítás)
Szomatikus: gén/genom módosítás csak a testi sejteket érinti.
(módosítás testi sejtekbe történik, a DNS integrálódhat a
genomba, vagy lehet episzómális is )
A genom módosítás lehet térben és időben szabályozott és reverzibilis is.
-
Genetikai állatmodellek
random
• spontán mutánsok
• kémiai mutagenezis tervezett (transzgenikus)
szomatikus csíravonal
öröklődő
funkciónyeréses mutáns
(gain-of-function)
funkióvesztéses mutáns
(loss-of-function)
túltermelés domináns negatív null-mutáns
knockout
részleges
(hipomorf)
mutáns
knockdown
mutáció
knockin sejt-abláció
kondicionális/indukálható térben és/vagy időben szabályozott
-
Transzgenikus állatok felhasználása
• szövet- és fejlődés- specifikus
génszabályozás (promoter vizsgálat)
• génfunkciós és fejlődéstani vizsgálatok
• sejtazonosítás
• sejtfunkciós vizsgálatok
• emberi betegségek állatmodelljeinek
létrehozása
• gyógyszercélpontok validálása-fejlesztés
• gyógyászatban fontos fehérjék előállítása
(bioreaktorok)
• haszonállatok előnyös tulajdonságainak
javítása
kutatás
gyakorlat
-
Miért pont egér?
• Régóta tenyésztik
• Sok jól definiált törzse ismert
• Kis helyigény
• Felhasználó barát
• Könnyen manipulálható
-
Egerek embrionális fejlődése
-
Donor nőstények előkészítése 5-8 hetes nőstény: 5U Pregnant Mare Serum Gonadotropin
(FSH)
5U Human Chorionic Gonadotropin
Időzítés: PMSG 14 h
47 órával később
HCG 13 h
Pároztatás donor hímmel
Másnap reggel plugolás
-
Embrió
Donor nőstény X Donor hím
Álvemhes anya
Recipiens nőstény X Vazektomizált hím
-
Embrió preparálás
ampulla
Hyaluronidáz
-
Mikroinjektált embrió beültetése
-
Az eukarióta génexpresszió
szabályozásának lépései
DNS primér mRNS mRNS
transzkriptum
transzkripció
RNS
processzing
RNS
transzport
sejtmag citoplazma
transzlációs
szabályozás
inaktív mRNS
fehérje
aktív inaktív
poszttranszlációs
modifikáció
mRNS
degradáció
-
Gének általános szerkezete 5’-upstream
régió
3’-downstream
régió exon inron
ATG
Kozák konszenzus
GCCACCATGGCTG
PoliA addiciós szignál
Határoló szekvenciák
MAR, SAR, LCR
-
Genetikai módosítás fajtái 1.
transzgén
A
„transzgenikus”
A’ A’’ transzgén transzgén
-
A mikroinjektált transzgén sorsa
•Fej-farok irányú konkatamér képződés
•Beépülés a genomba általában egy helyre
•Koinjektált DNS együttes beépülésének esélye magas
•Integráció helye random (preferenciális helyek?)
•Bépülés helye hatással van az expresszióra
(heterokromatikus régió- néma)
-
Hagyományos pronukleáris
mikroinjektálás
Előnyök
• Felszerelés igénye kicsi
• Olcsó
• Gyors
• Hatékony (1-25%)
• Nagy kópiaszám
• Expresszió szintje magas
Hátrányok
• Véletlenszerű beépülés
• Transzgén beépülése
konkatamer formában
• Inaktiváció esélye magas
• Csak génaddíció
lehetséges.
-
Riportergéneket expresszáló
transzgenikus egerek A riportergén egy olyan fehérjét kódol, amelynek az expressziója egy
meghatározott génhez kötött és nem befolyásolja a sejtfunkciót.
Alkalmazása ✦ gének szabályozó elemeinek azonosítása, jellemzése ✦ sejtek jelölése ✦ fehérjék jelölése fehérje expresszió, aktivitás
lokalizáció sejtben, szövetben, szervezetben
fehérje-fehérje kapcsolat
fehérje mozgás
jelátviteli funkciók
-
Biolumineszcencia és fluoreszcencia alapján
élőben, egész állatban is kimutathatók, nyomon
követhetők (hűtött CCD kamera).
Riporterfehérjék
bakteriális -galaktozidáz enzim: LacZ gén kódolja
kimutatása enzimhisztokémiával/enzimaktivitás alapján
Luciferáz enzim (szentjánosbogár)
kimutatása: biolumineszcenciával/enzimaktivitás alapján
fluoreszkáló fehérjék (GFP, DsRED)
kimutatása autofluoreszcencia alapján
-
A génexpresszió helye in vivo detektálható a
biolumineszcens markergént hordozó
transzgenikus modellben
• könnyű valós in vivo detektálás
• ugyanazon kísérleti állaton több időpontban
is elvégezhető a vizsgálat
-
5000
10000
15000
20000
25000 kontrol
IFNg+sLPS
IFNg+sLPS
+ Dex
IFN+sLPS
transzkripció
a májban
gyulladásos állapotokban
aktiválódik:
• zimozán-indukálta arthritis
• bőrsérülés gyógyulása
Gyulladáscsökkentő
szerek tesztelésére
Az iNOS gén transzkripciós aktivitásának in vivo
egész állatban történő valós detektálása
iNOS
luciferáz
30000
-
Genetikailag kódolt fluorogének
fluoreszcens riporter fehérjék
fluoreszcens szenzorok (PF-k)
-
Genetikailag kódolt fluoreszkáló fehérjék
használatának előnyei, hátrányai
! detektálásához nem kell szubsztrát ! expresszáló sejtek élőben és fixálatlan szeletben is azonosíthatók ! fixálás után is működik ! ellenanyaggal is kimutatható ! mivel nincs amplifikálás a kimutatásnál nem túl érzékeny ! nagyon stabil, ezért az expresszió gyors változásainak kimutatására
kevésbé alkalmas
! sokféleképpen módosítható aminósavcsere fúzió
inszerció
cirkuláris permutáció
-
Prototípus: zöld fluoreszkáló fehérje (GFP)
GFP fehérje GFP fehérje
-
GFP mesterséges színvariánsok
-
Spectra are normalized to the excitation and emission peak for each protein.
(a,b) Excitation (a) and emission (b) curves are shown as solid or dashed lines
for monomeric variants and as a dotted line for dTomato and tdTomato, with
colors corresponding to the color of each variant. (c,d) Purified proteins (from left
to right, mHoneydew, mBanana, mOrange, tdTomato, mTangerine, mStrawberry,
and mCherry) are shown in visible light (c) and fluorescence (d). The
fluorescence image is a composite of several images with excitation ranging
from 480 nm to 560 nm.
mRFP variánsok
-
Transzgenikus egérben: DsRedT3
-
kódoló régió
poli(A)
• mRNS másolat (cDNS)
•minigén hibrid gén
„valódi” gén
intakt/mutáns
ATG
start
TGA
stop
riportergén: sejtek jelölése/fehérjék
-galaktozidáz
zöld fluoreszkáló fehérje (GFP)
luciferáz
„valódi” gén megváltozott sejtfunkció
mutáns, hibrid,csonkolt
Transzgén kódoló régiója
jelző
funkció
promoter
sejt
fehérje
-
mindes sejtjében
„transzgenikus” egér
transzgenikus agy
transzgenikus
idegsejt
promoter
Általános (CAG)
Agyspecifikus (NSE)
Purkinje sejt specifikus (L7)
Transzgén kifejeződés specificitását a
DNS szabályozó elem határozza meg
GFP
-gal
-gal
-
kisagy
Transzgenikus kisagyi Purkinje sejtek
L7 Purkinje sejt specifikus gén
E1 E2 E3
-galaktozidáz
zöld fluoreszkáló fehérje
Purkinje sejt
-
GABAerg idegsejt-specifikus gén
(GABA-szintetizáló enzim- GAD65)
transzgén
fluoreszáló GABAerg idegsejtek
az agyban
szaglógumó kisagyi Purkinje
sejt
medúza zöld
fluoreszkáló
fehérje gén
Gátló (GABAerg) idegsejtek genetikai módosítása
eGFP
embrió agy
hippocampus
cortex
-
GFP+ Purkinje sejtek izolálása FAX-szal
tiszta Purkinje sejt tenyészet
L7/gfp transzgenikus egér
FAX
Purkinje sejt
-
általános, minden sejtben működő promoter CAG (csirke aktin promoter CMV enhancer)
ROSA26
ubiqutin,
RNS pol. II
szövetspecifikus
sejttípus-specifikus
indukálható
promoter típusok
természetes
hibrid/mesterséges szövetspecfikus enhancer-
hsp68 (tk) minimál promoter
szövetspecifikus enhancerek
azonosítására
Transzgén expresszió térbeni szabályozása
transzgén regulációs
régiója kódoló régió enhancer-promoter
Meghatározza a transzgén expressziójának:
helyét
idejét
szabályozását
intron
poli(A)
-
Tipikus emlős génregulációs régió
Az emlős géneket a promotereken kívül több enhancer
és silencer szabályozza. Egy tipikus enhancer ≈ 500 bp hosszú ≈10
Kötőhelyet tartalmaz, amelyhez legalább háromféle transzkripciós
faktor, valamint 2 különböző aktivátor és egy represszor kötődik.
-
A transzkripció szabályozásában
résztvevő transz elemek
-
Nagyméretű inszertet tartalmazó
klónozó vektorok
Plazmid: ~10 kb
l-fág: ~20 kb
cosmid: 34-40 kb
• P1 fág: 100 kb
• PAC/BAC: 350 kb
• YAC: 2 Mb
-
P1 fág – BAC vector
-
YAC vector
-
cortex hippocampus
cerebellum Purkinje sejtek izom
PV-GFP transzgenikus egerek plazmid: csak izom expresszió
BAC: izom és agy expresszió
agy
-
Hagyományos pronukleáris
mikroinjektálás
Előnyök
• Felszerelés igénye kicsi
• Olcsó
• Gyors
• Hatékony (5-30%)
• Nagy kópiaszám
• Expresszió szintje magas
Hátrányok
• Véletlenszerű beépülés
• Transzgén beépülése
konkatamer formában
• Inaktiváció esélye magas
• Csak génaddíció
lehetséges.
-
Genetikai módosítás fajtái 2.
„knock-out”
NeoR gén
Homológ rekombináció
Transzláció nem megy végbe
X X
A exon1 exon2
P
NeoR gén
P
-
Genetikai módosítás fajtái 3.
„knock-in”
Homológ rekombináció
kifejezendő gén
A exon1
exon2 Transzlációs start
P X X
Transzlációs start P
-
Genetikai módosítás fajtái 4.
Speciális fajtája a „speedy mouse”, ahol egy olyan konstitutív génbe
inzertálják homológ rekombinációval a kifejezendő gént, aminek
hiánya nem okoz fiziológiai változást, viszont a gén környezete
lehetővé teszi, hogy minden sejtben egyenletes expresszió alakuljon
ki. (hprt lókusz X kromoszóma, ROSA26)
Transzlációs start P P
-
Kiméra előállítás
-
Szőrszín kimérák
-
C57BL/6NTac-Atm1.1ArteTyrtm1Arte
• Blasztociszta donor
cc,AA
• ES sejt CC,aa
• C57Bl6 CC,aa
• Hibridek Cc, Aa aguti
-
ES-sejt gén manipuláció
Előnyök
• A génbevitel nagy
hatásfokú
• Szelekciós lehetőségek
állnak rendelkezésre
• Könnyen archiválható
• Szinte bármilyen gén és
genom manipulációra
lehetőség van.
• Knockout Mouse Project
Hátrányok
• Korlátozott a sejtvonalak
száma
• Folyamatos kromoszóma
és fertilitás ellenőrzés
• Drága
• Csak olyan laborokban
működik, ahol
folyamatosan nagyszámú
mutánst állítanak elő
• Neo kazetta problémás
-
Taconic rendszer
exon
exon
Neo loxP loxP
flp flp
-
Hagyományos pronukleáris
mikroinjektálás
Előnyök
• Felszerelés igénye kicsi
• Olcsó
• Gyors
• Hatékony (1-25%)
• Nagy kópiaszám
• Expresszió szintje magas
Hátrányok
• Véletlenszerű beépülés
• Transzgén beépülése
konkatamer formában
• Inaktiváció esélye magas
• Nagy kópiaszám
• Csak génaddíció
lehetséges.
-
Transzpozícióra képes
segédfehérjék használata
• Lentivírus
– Vírus mediált beépülés
– Módosított, defektív HIV vírus
– Helper vírussal burok generálás
– Korlátozott cargo kapacitás
– BLS2 szintű labor és állatház
• Transzpozonok
-
Genetikai módosítás fajtái 1b.
A
„transzgenikus”
A’ A’’
transzgén
LTR LTR
transzgén
LTR LTR
Transzpozáz
-
Transzpozon mediált genom módosítás A 2. típusú transzpozonok olyan mobil genetikai elemek, amelyek
önkivágó/beépítő aktivitással rendelkező transzpozázt kódolnak és annak
felismerő helyét is tartalmazzák.
„cut and paste” transzpozició
önkivágás
beépülés új helyre
1. a transzpozáz felismerő helyekkel (IR) körülvett beültetendő gént tartalmazó vektor
2. A transzpozázt hordozó vektor RNS-sel helyettesíthető
Amennyiben mindkettő jelen van a sejtben a kivágás és a genomiális DNS-be való
Integráció megtörténik.
transzpozon alapú géntranszfer rendszer
1
2
-
Transzpozon mediált genom módosítás Gerincesekben aktív 2-es típusú transzpozon rendszerek
Név/forrás Transzpozon
család
Cargo méret Integrációs preferencia
Sleeping beauty (SB)*
Tc1/mariner 5-7 kb?
Méret növelésével
csökken a hatásfok
nincs gén preferencia
inkább intron
piggyBac piggyBac Hatásfok csökken 9 kb
felett -pronukl. injektálás
gén kódoló régió
preferencia
Frog prince Tc1/mariner ua. min egyéb
Tc1/mainer
intron preferencia
Tol1/2 hAT nagyobb mint a többi
10-20 kb (BAC transzgén
70 kb)
gének 5’-régiója?
Izsvák Zs, Ivics Z, Matés L
SB100 X- 100X aktívabb: 35-50% hatékonyság stem sejtekben, 45% stabil transzgenikus egér
-
Transzpozon mediálta genom módosítás
• Alapja random inszerciós mutagenezis (funkció vesztés funkció nyerés)
• két-komponensű rendszer: (1) transzpozon vektor tartalmazza a bevinni kívánt cDNS-t, vagy a gén inaktiváláshoz (aktiváláshoz) szükséges elemeket
(2) transzpozáz RNS/vektor formában. Mindkét komponenst be kell juttatni a
sejtbe
• Néhány kópiába épül be (függ a transzpozon/transzpozáz mennyiségétől) • Szomatikus és ivarsejt módosításra is alkalmas • Nem vírus-eredetű géntranszfert tesz lehetővé • Nagy hatásfokú, gyors módszer
Használható
• Transzgenikus modellállatok előállítása (egér, patkány, nyúl stb) génaddíció
RNAi knock down- kiválthatja a lentivírust
• Inszerciós mutagenezis- nem homológ rekombináción alapuló KO technológia- ES sejt független - nagyléptékű patkány KO projekt
• génterápia • Humán (és egyéb) KO sejtvonalak előállítása • iPSC vonalak előállítása vírus nélkül
-
sb-cag/eyfp transzgén kópiaszáma
az alapító egyedekben
-
line # founder offspring F1 offspring F2
ID copy number pups/Tg copy number ID/copy number pups/Tg copy number
22 105798 mosaic 8/3 1
5/2 1
23 105799 mosaic 4/4 1
7/3 24 105800 2 11/0 25 105801 2 0
26 105802 3-4 4/4 2
108977 male/2 5/4 1-2
10/8 1-2
27 105803 6 6/6 1-6 110175 female/6 6/5 3-4
110176 female/4 8/8 1-4
28 105804 4-5 6/6 1-4
8/8
43 105815 1 7/5 1 7/6
7/6 6/5
44 105816 ~1 7/2 1
6/2
45 105817 ~2 6/1 ~2
11/0 4/1
46 105818 1 9/5 1-2
7/3
47
105819 5 9/9 3-5 108961 male/4
108964 female/5 4/4 2-4
108967 female/5 7/7
-
A
C
B
D
SB-CAG/eYFP mouse brain sagittal sections. A: Cerebral Cortex, B: Cerebellum, C: Hippocampus
D: Detailed part of prefrontal cortex. As figures show, however the brain itself seems to be green, CAG
promoter is not active in neurons oposite of endothel layer of vessels.
-
Transzpozáz mediált genom
módosítás
Előnyök
• Nagy hatásfokú (15-85%)
• Az integrálódás egyedi,
így a transzgén
inaktiválódás esélye
alacsonyabb
• A transzgén
továbbörökítés aránya
magas
Hátrányok
• RNS munkát igényel, ami
drágább és nagyobb
odafigyelést igényel.
• Az alacsony kópiaszámból
adódóan a transzgén
expressziója alacsony
lehet
• A „cargo” méretre korlátoz
• A random integrálódásból
adódó gén inaktiválódás
előfordulhat
-
PhiC31 integráz mediált géntranszfer
attB helyek elhelyezése a ROSA26 locusba
Streptomyces ΦC31fág integráz
-
Genetikai módosítás fajtái 4. Speciális fajtája a „speedy mouse”, ahol egy olyan konstitutív génbe
inzertálják homológ rekombinációval a kifejezendő gént, aminek
hiánya nem okoz fiziológiai változást, viszont a gén környezete
lehetővé teszi, hogy minden sejtben egyenletes expresszió alakuljon
ki. (hprt lókusz X kromoszóma, ROSA26)
Transzlációs start P P
-
Meganukleázok
• Endonukleáz aktivitással bíró enzimek
• DNS duplaszál törést követően megnő
a repair aktivitás, ami rekombinációs hot
spotot alakít ki
• Target specifitással bíró hibrid
meganukleázok kialakítása
-
Genetikai módosítás fajtái 2b.
„knock-out”
Transzláció nem megy végbe
X X
A
MN MN
TALEN, ZFN, CRISPR
P
P
XX
P
-
„ZN-finger” nukleáz mediált genom módosítások
-
„ZN-finger” nukleáz mediálta genom
módosítások ZNF kettőszálú törést okoz a genom
meghatározott helyén.
Specificitást a ZF biztosítja.
1. A törést a sejt NHEJ
mechanizmussal javítja
mikrodeléció/inszerció
potenciális KO
2. A törést a sejt HR
mechanizmussal javítja
+ módosított homológ régió
knock in
deléció
mutáció
-
ZN-finger” nukleáz mediálta genom módosítással
KO sejtek és modellállatok is létrehozhatók
Előnye
• Homológ rekombináció nélkül
létrehozható KO sejtvonal, vagy modellállat
• Azokba az állatfajokban is alkalmazható,
amelyeknél nem áll rendelkezésre
pluripotens ES sejt
• Nagy a hatásfoka és gyors
A kívánt specificitású ZNF-et elő kell állítani
Ez nem egyszerű és drága
Hátránya
Transzgenikus patkány előállítása
ZNF technológiával
mutáció a kódoló
exonban
KO
-
SIGMA-SAGE labs
• ZNF
• KO sejtvonalak előállítása
• GMO állatmodellek előállítása: egér, patkány és nyúl bármely törzs
constitutive KO
humanization
reporter tagging
point mutations Kész patkány KO modellek
-
TALEN
-
Xanthomonas sp.
Transcriptional
activator like effectors
TALE
34 aminosav modulok
(repeat variable
diresidues RVD)
12., 13. aminosav a
nukleotid kötésért
felelős aminosavak
NI = A,
HD = C,
NG = T,
NN = G or A)
-
TRESK mutáns egerek szekvenciája
Wt CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCTGTCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm48 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT-TCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm57 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT--CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm7 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATGCT--CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm57 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGATG--GTCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm60 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAAGC----TCCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm51 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm49 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm44 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm38 CTGAGGAGCCA---------------------CCTGAGGCCCTGGGGAAGGCCAGGGGATGCTGCCCCG
Tm43 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGG---------------------------------GGATGCTGCCCCG
Tm61 CTGAGGAGCCACCTGAGGCCAGGAGA---------------------------------TGAGGCCCCG
TALEN felismerő hely
Nucleotid mutáció
--- deléció
9bp hosszú repeat
-
CRISPR/Cas
-
Lehetséges történések
-
Target specifikus nukleázok
Cink finger TALEN CRISPR/Cas
Tervezés közepes könnyű könnyű
Konstruálás közepes könnyű nagyon könnyű
Hatékonyság alacsony 80-90% magas
Aktivitás alacsony/
változó
magas magas
Off-targeting
vágás
változó alacsony magas
Toxikusság változó alacsony alacsony
Költség magas közepes alacsony
-
ES sejt vs target specifikus
nukleázok
ES
• Csak dedikált laborokban
• Folyamatos ES sejt ellenőrzés
• Egy konstrukció 1 vonal
• Egy sejtvonal még nem
garantálja az egész egeret és
a továbbörökítés sem 100%
• ~40.000 €
• 40 hét
TSN
• Nem igényel nagy befektetést
• RNS munka
• Egy konstrukció több féle vonal
(knock-out, potenciális knock-
down és knockin)
• Vonal kialakítás közel 100%
• ~4-6.000 €
• 16-20 hét
-
Konstitutív - indukálható
• Korai megnyilvánulás, vagy korai
génhiány sok esetben káros
• A szervezet gyakorta kompenzál, így egy
gén hiányát más, hasonló funkcióval bíró
gének veszik át
• Egy gén sok szövet - és sejtféleségben
nyilvánulhat meg, az általános génkiütés
elfedheti a specifikus működést.
-
Indukálható promóterek I. indukálható endogén promoterek használata:
transzgén expresszió szabályozása endogén kontrol szekvenciákkal
heat shock promoter;
metallothionein MAF kötődik a MRE-hez Cd/Zn jelenlétében;
interferon aktiválható promoter;
steroid regulált promoterek;
GRE (glukokortikoid- MMTV)
indukálhatóság nem túl magas, “mellékhatások”
-
Indukálható promóterek II.
Mesterségesen indukálható génexpresszió: indukálható transzgenezis
Szövetspecifikus promóter TRANSZKRIPCIÓS faktor
Reszponzív promóter Target transzgén
RNS
pol
-
Szövetspecifikus promóter rtTA-VP16
tetO – CMV IE Target transzgén
RNS
pol
-
Térbeli szabályozás Cre
rekombinázzal
-
Cre mediált génkifejezés
-
Brainbow egér
-
1. Konstrukció elkészítése
2. Génbevitel
3. „founder” kiválasztása – genotipizálás
4. Transzgenikus vonal kialakítása
5. Kísérletezés
6. Egyéb állattechnológiai eljárások
-
Genomiális DNS izolálás farok mintákból
2-3 mm darab - Proteináz K feltárás
• fenol-kloroform extrakció
- etanol/izopropanol kicsapás
Előny: nagy mennyiségő tiszta DNS, olcsó
Hátrány: munkaigényes, veszélyes szerves oldószer
• magas ionerő mellett szilikátos megkötés
- mosás guanidin izo tiocianát hidroklorid oldattal
- elúció alacsony ionerő mellett
Előny: automatizálható
Hátrány: rossz kitermelés, drága
Transzgenikus egyedek azonosítása
és jellemzése
-
Transzgenikus egyedek azonosítása
és jellemzése II. Génexpresszió alapján
RNS - Northern hibridizáció
- RT-PCR
Fehérje - Western blot
- enzim aktivitás
- fenotípus
Homozigóta egyedekben a transzgén expresszió szintje
magasabb lehet.
-
1. Konstrukció elkészítése
2. Génbevitel
3. „founder” kiválasztása – genotipizálás
4. Transzgenikus vonal kialakítása
5. Kísérletezés
6. Egyéb állattechnológiai eljárások
-
Transzgenikus egyedeket nem transzgenikus egyedekkel
keresztezik, felszaporított heterozigóta egyedek
keresztezésével homozigóta vonalakat alakítanak ki.
-
1. Konstrukció elkészítése
2. Génbevitel
3. „founder” kiválasztása – genotipizálás
4. Transzgenikus vonal kialakítása
5. Kísérletezés
6. Egyéb állattechnológiai eljárások
-
Kísérletezés
Mit használjunk, és hogyan?
-
Egér fajok elterjedése
-
Laboratóriumi egerek eredete
-
W.E. Castle C.C. Little
Kedvtelésből tartott egerek -
Ázsia, Európa
(XVIII-XX. Sz.)
Abbie Lathrop összegyűjtötte
és tenyésztette őket
Granby, MA – 1900
Castle, Little és
Mások folytatták Lathrop
munkáját és alakították ki
Az első inbred törzseket
(1908-tól)
-
Swiss
Castle’s egerek
C57- leszármazott
Kína Japán
Egyéb törzsek
vad eredetű
Egér Családfa
-
Felhasznált egértörzsek
C57/BL6
FVB/N
NMRI
129
-
Outbred/F1 Inbred
-
Magatartás
Szív és érrendszer élettana
Fejlődési defektek
Diabetes
Immunitás and gyulladás
Metabolizmus
Tumor képzés és gyakoriság
A genetikai háttér hatása a genetikai módosítás
fenotípusos megjelenésére
-
Adapted from Almind et al., Diabetes 52:1535, 2003
15
10
5
0
n 100
200
300
400
500
Blood glucose (mg/dL)
129
B6
-
2 típusú diabetes
Obese ob/ob (Lepob)
C57BL/6 (B6.V-Lepob/J)
elhízás tranziens diabetes-szel
C57BLKS (BKS.V-Lepob /J)
elhízás megnyilvánuló diabetes-szel
Diabetes db/db (Leprdb) C57BL/6 (B6.Cg-m +/+ Leprdb/J)
elhízás tranziens diabetes-szel
C57BLKS (BKS.Cg- m +/+ Leprdb /J)
elhízás megnyilvánuló diabetes-szel
-
Episztatikus faktorok hatása a
transzgén megnyilvánulásra
25
30
35
40
45
50
5 10 15 20 25 30 35
weeks
Bo
dy
we
igh
t (g
)
WT
HDC -/-
Fülöp et al. Endocrinology 2003
-
FVB/N-FVB/Ant
-
Co-isogenic Congenic
1 2 3 4 5 1 2 3 4 5
-
A. Hagyományos B. “SPEED CONGENIC”
Strain A
a/amt
Strain B
b/b
b/amt
Strain B
b/b
b/amt
N5-N11
b/amt
N12F1
amt/amt
N12F1
a/amt
N12F1
a/amt
N12F1
a/a
N12F1
amt/amt
Beltenyésztett
kongenikus törzs
N12F1
a/a
Strain B-amt Strain B
Generation
F1
F1N2
F1N3
F1N4
F1N1
F1N12
% loci A/B
100%
25%
12.5%
6.25%
50%
-
Alom kontrol
cb1Z cb1 cypD D2R net
+/+ 29% 27% 31% 30% 31%
+/- 50% 50% 47% 48% 56%
-/- 21% 23% 22% 22% 13%
utódszám 288 2145 221 330 327
tenyészpár 16 78 7 12 13
-
1. Konstrukció elkészítése
2. Génbevitel
3. „founder” kiválasztása – genotipizálás
4. Transzgenikus vonal kialakítása
5. Kísérletezés
6. Egyéb állattechnológiai eljárások
• Rederiválás
• Embrió mélyhűtés
-
Befogadó állatház
Rederiválás
Tripszin
kezelés
SPF space
♀
SPF „béranya”
Elválasztás után
higiéniai státusz
ellenőrzése
Szuperovuláció kiváltása
hormoninjekcióval
Kórokozó mentes kolónia
barrier
♂ ♀ X
Fertőzött kolónia
zigóta/hólyagcsíra
állapotú embrió
preparálás
-
1. Konstrukció elkészítése
2. Mikroinjektálás
3. „founder” kiválasztása – genotipizálás
4. Transzgenikus vonal kialakítása
5. Kísérletezés
6. Egyéb állattechnológiai eljárások
• Rederiválás
• Embrió mélyhűtés
-
1. Konstrukció elkészítése
2. Génbeviteli eljárás
3. „founder” kiválasztása – genotipizálás
4. Transzgenikus vonal kialakítása
5. Kísérletezés
6. Egyéb állattechnológiai eljárások
• Rederiválás
• Embrió mélyhűtés
Technológiai sor