Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

38
on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research. cancerres.aacrjournals.org Downloaded from Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Transcript of Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

Page 1: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

������������ ��������������������� ��� ������������ ����������������������������������������

��

����������������� !��"��#$�"$���������!��%�&���'����(�%$�(!��)�����*+����!��)&��*������!��)�+$��,���������!��-��+����-�.����!��)&������+���+�$��!��-������"�/$��"����� !��)�+����,��0��1!�23���4�-��"+�+!�5����(��6�7� �!��!2,$�����8��-���+�����9���&����� �:�������-��������6�����������1�;�2-����$��������:��1�������+������1�!�<���������� �-��+�1��!�)���)�=��!�-:;�5"�&&�������<��������!�2���9���&���� ����������!��$����!�.$�1�����

������=$����/$������*����>�,$�����8��-���+����?����������+����8�)���)�=��!�-:�@��?��22??�A5@��5B�B5BC�&���+��#D$&��+���$�������������>��������:��$������ ��*������6���������������0���E����>�����������;���&���;���������;�)�*;�*+:����+���$+����+���������� ����� ������������� ��� �������>�,-��%?��90CCA52�3"��%?��*)�@��2��� *$�����)��������>�������������!��+�9������������������������������������������-������"�/$���"�����!��+�9�������"���<�������������������������������������������������<���������� �-��������9���� ������1��F)���&��G��+������1�H��������9��� �)��&���"�������2???�E�<���������)��������������������������������������@�C0�)"I)-;�����J��+�)���-$����!�:K�@A5?B��������������������������������������������"����$�!�-K��CC�?��B?�@��=�������D=�$���$�����������������������������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 2: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

���� ���F2@�I2C?H��:�������������������F*%*H!�)�*�&����������$������ �$���1$����������1���+�

������������������������&��+����&��+��������������&�����1��������� �

��������1�������������F*�KK��H������������$�����������������+��

�$���$���.������!��=�$��?�������� �����������$&�����������+�=������������

*�KK���&%K)��.��������+������*%*�+����������������������� ��KJ�@�!�

+��1���������1� �������������� �����������!�������������+����$���������

�$������������$����������+�����+�����������������������������������+��

��������1���� �*%*��*������������������� �� �@�������&�$���&������ �)��

&�����������������������&��������+���������������/$����� �������

��&������$�������$������ �*��=��1���������������*+:�������-")������ ����

���������=�����1��������+������&�����&����� �*�KK����%����������!���%K)�

&����������$������ �*�KK������������������������������������������*+:��

����� �����*J�9K)�=�����1���������+���KJ�@����&����+��$1+��+��+�E��

��1�����1���1$������KJ�@��1���������������"$��������� ���+����KJ�@�����

*�KK������$����������� ��&��������EK���������!�=$����EK��

�����������������������+��� ���!�+����������������������$�����L�������������

��������=��)�*�&$����������$�������=���������&������� ��� �������

���$������ �*�KK���&%K)��

� �

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 3: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

�������������������������

-$���������+�������&��$���������������1����FAPCH����$������=�$�

�?M�� �������������������F*%*�H�F�!�2H���-���� �+��&$������������

������������+�+�����������$��� �+��CTNNB1����$��Fβ−������H!��+��+�

���$&$��������+��������&!�����+����������������+���$���$�����������

��+�9K)�=�����1�����������+��������� ����� �&����F8�JI�*JH��������1�

���� ���������1��1�����F2!�5H��)�+�$1+���&��*%*����+�=��&$���������

��������&�E����1��1����!���1�!�AXIN2!�CCND1!�MYC!�E����������

���� �������+���=�������=$�����&���������������������������������+��

���������β−���������������=�������)�������$�!�+�����������$�+����������

+��� ��$���������1���1��+�����+������������$������β−�������������F@H���

E+����������$�����+�����+��������������&%K)�����������=�������$�

+�=����(����!��������������������� ����$�����������FC!�BH!� ����������+�������

��$�������1$������� �β−�������1���������������%������!���+���=�����+����

+��+������+��&�����$�������β−������������������FAH���:��*%*�������

&�������!�β−����������������������������������+��$1+��*J�@�F�H!�

�$11����1�+�����������1�CTNNB1 &%K)������=$�����*%*���1���������

9��+���������������4���������+�� ��������&����+����������� ���������

��1$���������&������+���+���������+$&���CTNNB1���&����!�����

���� ������������ �������������9K)�=�����1�������+���+�� ����2???�=�� �+�����

��&����F�H�����������!�+��+$&���CTNNB1���&�������&����6*����+!�

�����������)�)�=�������5�$�����6*����+�"���������+���+�� �����C?�=�� �

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 4: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

+�����������������������F�?H��.������!�+�� $������� �+��������&���6*����+�

���&����������� $������������������

�����J��1���������1�����������49��F���������������������=��+��

+$&���ZNF148����&�$���Zfp148 locusH������$=�/$��$�������������Krüppel����

(���� ��1�������������� �����+��=�����6*����+�9K)����&���� ��/$��������

���������+�"��F����5H��������������/$����� ���&$�����������������+��������

�+����+�����1�����+����+�1�������&�������&$����������$����&��+����&��

+�����4�������������+�+��E���������+����F�@!��CH��J$�+��&���!����

�$���+��&�����������1����������������������� �Zfp148���������������+������

������FZfp148�IECH�����&�����$����=�����&$��������&�1�� ��&��� ����$��

�1�����������$�������$�������$���������� ������������������&����=����

������F�C!��BH��������������1�(�����+�β−������������$���&$�������� �����

1������������1����+���+�������������������&����=�����������������

�� �������F�CH��.����1����=���+���+�������������β−������� $����������

�����������+�����&��������!����������������+�+������������1$�����

CTNNB1 1�������������������������������+�&��������=$�����������&���1�

������������� ��&������

:�����$���� �A@2�*%*�!�ZNF148�1���������������������������+��

��������� ��&����&�������1����*%*�=$�+����������������������1���� �

���������1��������F"�1���:::�����:NH�F�AH���+����$������������������+���

������������������1�+��ZNF148�����������1$��������������������������+��

��1���������1��:::�F��H��E�������$�����+�����+��������� ��&����������

��������&������+�+��$&����$�������C5�F��H�������������������������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 5: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

+�����$�������C5� $������������1��������������� �����Zfp148��������

����������C5��������F2?!�2�H��-�������!��+���������+�����+����+���������

������������������&�������+�1���!����������������+�������$�����������&��

F22�2@H��"����������������������&%K)������������������������$��������������

������������$���1���&��+�F2CH�����*%*F�AH!����+��+���(���+��+��

����������� �������4�����������������������������$&���1��������������&�����

�+�+���������������1�(�����+�E����1�����1�+��$1+�����=���������1$����

CTNNB1 1�����������������

� �

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 6: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

��� �� ��� �!������ "�# ������������ $�����+����+$&������$���������F*'*�C?�!�

*'*�C?2!�*'*�C?5H���������1���������������&��������$����������&&�

��������� �+$&���������F@����&������������$�!���������&�����������������

����������5H������$��+����� ��&�����&����F%��+&���!�*);�

�������&������&H���������$���+���1�!�1�����!��+���1�!�$&���1���������

��1�����

� % � �& �������'�' �(��'����"$��������$����������1�������� ��&�

) �&�����&�������������������������+��6��������������'&��=$��F6�'!�

+>II������=����&���+�1��I1��IH���+�������+���&�������O�����P!�O������P!�

O6�8�BP!�O6�8CA?P!�O6�8CA�P!�O�$������P������������������&=��������'����+��

6�'� �������+��$����������������$��������������� ������>�%J"�����Q��5A5>�

�6"��2�@C��QC��;�6"��@555��Q22B�;�6"��AC5���Q252�;�6"�5�C�C��Q5A�;�

6"�55��@��Q�?�;�6"�5A��2��Q�5?�;�6"�5�C�2��QC���;�6"�@�2C���Q��C���

������������� �+���@??���&�������+�����������������������+���$�������

�������������+��� ��������$���� ��&�+�������������+��� ��������� �������+�

�$����������������$�����6������������������+��O������� �����$������P�����

��������1�������&$�����$���������������=�������������(��+����1������

���$��� �+��ZNF148���=���BERF-1 ���BFCOL!�+��������������������

��&��������������������1��$����������1���+�1+�����$�������������� �1����

��������������+��������$������1�������0�����-���������� �O������� ����

�$������P������� �������$�� ����$�!������&$�����*�����1����������������� ���

���+����������=������+������������$���/$�������� �1������������������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 7: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

+��=���+���+��������$�����+���������1�+��0�����-��������F2BH���+��

+�(������������+��CM���� ����������������������1����4�P ���$�����������$�����

���������=��������$����F2AH���������������������������������������������������������������������������������������������

� ���# �#�������6���������� �Zfp148FL/FL�&���������*CA�8IB�1������

=��41��$������������$����������=���F�CH��ApcFL/+,�Zfp148FL/+�����Zfp148FL/FL�

&���������=������+��VillinCre�FN*H��������1�������&����+�������

+����(�1�$�� ���+��Apc ������ �������������������������+�+��Zfp148FL/+�����

Zfp148FL/FL�1��������)���&�+�������������$����������������=��+��

<���������� �-��+�1���)��&���*��������<���*�&&���!��+��+�&�����������

)&�������)����������� �)�����&�������)������������ �8�=�������)��&���

*���� ��������

) �#���� ���(��*����.�<��������!� ��(������4�������1�������!�

�+��4��� ���&������&����+���5�&��+��� ������&��������$����=������5�

����2?�����1���� ����������.�02�5�����"E@�?�����������������������

$��+����� ��&�)�**����2?�C!�����+��989�����������2?�B���+��0-�2������������

�����$��+����� ��&�+��K*:�%�����������2?�5���+��989�������%0'������������

�����4��������������=�������J������F<���������� �-��+�1��H��)��������������

989�������%0'�������$�$�������9-�-�F6:�*'!�8� �����+����1���H�

�$��&�������+��?M� ����=���������$&�FJ�"H��������=������F�??�<I&8�

�����������$���??�μ1I&8�����&����H��%0'�����989���������������$�$�������

%�-:��B@?���+��?M�J�"!�1�$�&�����������=��������

�� �������� ��+��������E������&$���F-$H�CTNNB1�8$����������

FAC��1��������H���+�2��1�I������ �%����������������������� �������+�

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 8: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

8�� ���&����2???�F8� �����+����1���H�����"E@�?��������$�$��������2������

�����2@+��J��� ����$�� �������������&���(�����%�����������+������&�������

�� ��&�������$������+�����&������%K)����� ���������������������$�$���1�

8�� ���&����%K)��-)R�������=����� ����&���$&����%K)����1��� ���ZNF148�

�������������&��$���� �@�1���&�����/$������F��6�K'-��"-)%����!�

9+��&����� -�?�2BC��?�H���������CTNNB1���%K)������� ��&�J��+���"����� ���

F )-�BA?�H��

(!��# ����##���������� �����(!�)�,�"E@�?��������������������+�

�M� ��&����+��������+���/$���+�����+�1������� ���C�&��������&��&���$����

*�����������FC??S�H������������������+����9K)�������&������2??����???�=�

��1&����F@��������� �5?�������������H�$���1����5?E�"������N�=�������

FN*R�5?��!�K����!�*�H��)�����/$��FCMH�������&����� ��&�+���������� ���

������$�9K)�����+����&�������F@ACS�H�����$�������&&$����������

��������4�����������+���+�������������=�������:16�F���=����������H��

:&&$�����&�������������$����$���1��������)I6��1������=�������) ���

����������+���+��=�$�����������������$��� ��&�+��=������������$����>�C�

���������(��������F���-�1���*+:��)I6�0�!� �A��??�B!�-�������!�-)H��) ���

���������0�����%K)����)���1������!�����������+��&���� ��1&���������

�����(���=���*%�$���1�K���Taq�9K)�����&�����!�F-�������H�����5������ �

��&���� ���4��1�+��CTNNB1, ZNF148 or ChrA���&������1�����F"$��&�����

���H��

����� ��&�*+:������������ ��������=�����1���+��ZNF148���&���!�

+�������������������������������� ����in silico�$���1������������1�&�������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 9: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

+������� ��'82)�=�����1 ��+���+��<*"*�6���&��=�������

F+>II1���&��$������$H��*+:��/�*%����$������������������������ ���$�

9K)�� �����/$�������� ��&���������&���� ���+$&����+��&�1������)�F*+1)H�

�����$�������+���������������&�������������*%����$��������������������

���M��1������1��!���/$����������+���/$��� ����=��/�*%� �����������

�����&�����

-� �� �'���� &��#��)(���*$�$���������������+��������������(���

F:�����1��H� ���%K)��������������9K�������&����T$���������*%����������

�������������$�������������9K)���&����$���1�+���:'�%)9�*�???�+��&���

������!������(�����+�*JR�-���1��N2��� ������������&���(�����Hprt��

�����&����������� ��&����������+�����&���������������-�$����*%���&���

����� ���Zfp148�����>��

������>�CU�66*�)�6��*���*)���*�)�)�6)6�6;���������>�CU�*�*�)�)�**)�*)���*)��*)�*)6�*���

Hprt���&������������>��

������>�CU�)6��***�)6*�6�*�6�6�)���)6*;��� �������>��CU�)�)�6**�***�*���6)6�*)*�)*)�6���

(���$����# ������� $,�989�������%0'�����������������������B�

�������������1���+�&���$&�F�?M�J�"H����???������I������J���0-�2�8@�����

"E@�?������!��??������I���������������������B��������������1���+�&�����

��������1��?M�J�"��"������+�$���� �������1!�+����������������� �������+�

2C��-���6���&��"-)%�������%K)�� ���ZNF148�F-�?�2BC��?�!�9+��&����!�

*+���1�!�:8H!�CTNNB1�F-�??5@�2�??!�9+��&����H����������1�������������

F*��H�F9�??�2?B��5!�9+��&����H��-����������������+���������+�����������+�

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 10: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

��%K)�����������1������������$������������� ��&��������4�5�������1�

� ������������2?M���+����������������������+���"!� ���������?M� ��&����� ���5?�

&��$��!�����+���������� �����$���1���+������$����� �?��M����������������+��

�$&=���� ���������� ��&��� ������+����&���������������������������1��� �

+��������1�������������%K)��

������ $���+��-��������������� ��&�����������1���&��$ ��$���U��

����$����������� ��!�%0'!�989��!�0-��2�����"E@�?�������F�???��������������H!�

��������� �������+�+��1�������� �������������1������%K)����1���F2C��-H��

J�$�������� ������� �����!�?�C�&1I&8�� �-�����=����1����$����������������

���+�������������$=���� ���@�+�$�����5AV*��J��&�(�����������1�������������

����������=�����$=���1���+�+�����$=���(��������1���������1+!�����+��

�=���=���������&���$��������������������)CA?������� ��������������1+�� �

)BB?��*�������=�������������&�����$���1�+���/$�����)CA?�W�)BB?�F������

���� �������+�CTNNB1����ZNF148���%K)HXIY)CA?�W�)BB?�F���������� �������+�

���������%K)H���??�����+������������������������������������B������F�???�������

�������H������������� �$��+�$���� �������1!�+����������������� �������+�

2C�-�� ���������1���!�ZNF148����CTNNB1���%K)�$���1�����,������ ������

���1���F":6K)6��H���������1���+��&��$ ��$���U������$��������+��"553�

�9K)������������������������� �����2@+�� ������� ������� �+����%K)�

�1����$���1�+������,�����1�������������� ���=�+����� ������!�?�C�&1I&��� �

-�����=����1����$�������������!����$=���� ���@+���5AV*�����+���&���$����

���������=����=�����

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 11: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

������ �.�������/���� ������+�����������&$���������&����������C�

&&�������������� ��������=��1��������������������2&-��9�)I��"���@V*� ���

5?&�����) ��� ��������+��$1+����??S&�������&��+!�+���$������������

����� $1�����2??Zg� ���C&��!�+��1���������������$����������C?S��� �-���1���

�$��&�������+�)��������9-�-IJ�2!�F:�����1��H���������1�C?M�E���$��

%�"�����������������&�����1�������� ��&���=�����������1�8�������F2�H���+�

���������� ������$��+����� ��&�:�����1��!�����!�K�11���F�??�1I&�H������6J�

FC?�1I&�H!�����+����$�$������5AV*����CM�*'2������������� ����$�$���1�+��

����-���1��!��$�����������������������=����������+��E�������$�$������+��

��������� �=$����1��������������$���+�������������$&������������������

� ���+�������������1��$��5���������������1�����

� ���� ��� $�����*�&��������&��1�&$�����+�����1���1��$������

�� ��&���$���1�0�$�4���E������������������=�����'�������)K'N)���+�

�$4��U����� ���&$�������&������������$��������&���������$&=���!�

���&���(����$�� ���������$��!�-�������������� ��&��1�����������������)K'N)�

����$�����������(��+���������I�+�������&����$�����

� �

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 12: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

������

����� ����ZNF148��0�������������� ���1�!���������'�' ����(�(�

)�+�$1+��������������������������������������������+������$�������

��������������������+�1����������������&���F�A!���!�22H!��+��*������

6���&��)����F�*6)H����=������+���+��+��ZNF148����$��+����������

����������&$��������������@M�� �*%*��F����� �C?@������� ��&�5����=����H�

F��=���"�H��������&������������������������������+������������ �����

+�����1�������1��!��&&$��+����+�&�������������������� ��&������5������ �

�����������������F*%*H����$���������������������������������������&���

+$&���������������������=������� ���β−�����������������������FJ�1��)!��H��

)�+�$1+�&���� �+���������������1���&������������&������I���&�&=����$��

FJ�1����*!��!�6!�:!�0H�����������&��������1��������2�BM�� �+����&���!�+��

��������� ��������������������������&���������������1�� ������������������

��+������������������������������&����������&���������FJ�1���*!�9H��

-�������!�+��&�&=����$������������&���������1������ ���=�+��������

��������������*%*����������������+������������

F+>II����������������1H��K$������β−���������������������=������������1����

������1��2�*%*������������������+�[B?M�� �+�����$�����������1��������

������FJ�1�����8H���+����������� �+����1���� ���=�+����������&��������������

������� �$�����������1�����&����������&���������FJ�1���-!�KH��:���������!����

���&������+�+�����������ZNF148�&%K)�����������������������+��$���������

-����������������� ������������������������������������ ��&�+��6����

'&��=$������������F6�'H�$=�������=���� ������������$���1������=������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 13: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

FBFCOL and BERF1H�+������1��(����/$��������+��*���&��$������5U<�%�� �

ZNF148 FJ�1��"�H�����������ZNF148�&%K)���������������������*%*�������

������������+�������������� �����$���������&���������������+������������

� �����������FJ�1���'!�H���+��� ������������+��+��+�����+��������������

������������������=$����������&����1������������������ �������$����� �

����Apc�������!��+��+�1��������+�1+����������� ���������$����������

��=���(������

(������� �Zfp148����������������Apc+/�IEC&#��� �����$��+��# ����

� �������&����+�������������������������=$����������&��

��1�������!�������������������������������=�+�Zfp148��������������&�$���

&������ �β−�����������������������+��+�����Apc������������������������������

�������$���1�+��VillinCre�&�$��������FVC:Apc+/FL;Zfp148FL/FL!�+���� ����� ������

�����Apc+/�IEC; Zfp148�IECH��9�������� ��������=�+�Zfp148�����������������������

��������������1���+�F�CH!������������+������1�� ������� ����������0�BA�

������1����+������(����FJ�1��"2H���+��� ����+��Zfp148�IEC�&���������������

���+��&$���Apc�1������=��41��$���FApc+/�IECH!�����=���(��+������$�����������

� �������!������$=��/$��������������+�����������&$�������+���������

�������� ��&������9�������� ��������=�+�Zfp148�����������1�� ����������$����

�����������������&%K)����$���������FJ�1��2)!�H��-����+����(�1�$�� ���+��

Apc �������FApc+/�IECH�1���������$&���$���&��������������������+���C�&��+��

� ���=��+�FJ�1��2*��H!������������+������������F2�H��-�������!�������1�����

���=�+�Zfp148�����������1�� ����������$����+���$&=���� ���������������FJ�1��

JH!�=$����+����(�������������� �+��Apc��������������FJ�1��2.!�:H���

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 14: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

:��$ �������$&=����� ������������������+�����������������+��� ���� �

������1�Zfp148�FJ�1��26H��:��+��������� �+��Apc��������������!��������

������������������+�1+���+�����+������Apc�����!�����+�������������1�� �����

� ������&%K)��������FJ�1��2)!������$��29!�H������������������� ��������

���������������������+�+�������� ��������=�+�Zfp148���������FJ�1��29H��$����

��=���(������ ����������������+���������� �����Apc��������F5?!�5�H���

K����+������������1�=�+�Zfp148�����������1�� �����������������=�+��������

����������&%K)�FJ�1��29!�H��*����������!�+�������$�������������������+�

����������������������$������ �+��ctnnb1���&����=����������������������

+��$1+�&%K)���=����������=$��1���+������$��������� �β−��������������

ZNF148 ������ ��������2�&���������������1!�

��� $�+������+�� $������������������� �β−��������������������

������!�������� ��&��1��������������� ��&���� ���4���4��1������ZNF148�

����������=����%K)����β−���������������*%*������������F989��!�"E@�?H!�

�+��+����$�����$������)�*�������F52H����β−������������������*%*������

������F%0'!�0-�2H!��+��+����$�����������)�*�F55H�FJ�1��5)!�H��%��$����

���������������������������������� ��&�����FJ�1��5)!�H�������������=�����FJ�1��

5*H����+��β−��������������������������=��C?M�=$�+������� ������+��

β−������������������������������%��$���1����������������������������

β−����������������������;��+������%K)�&�������4���4������ �CTNNB1������

���$���������������������FJ�1��59H���

%��$���1�CTNNB1 �������������������������� ��&�����=��[�?M����

+������������������!�=$����+��������������������������������FJ�1��5)�9H���

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 15: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

J$�+��&���!����$������������=��������+��"E@�?�������������������=�������

��������1������$������������"553�&$�����������������!�=$�+������� ���

���+�����=������ �+���������������������0-�2�����������FJ�1��"5H���+$�����

�����$����+���������&��$������� ������1���+������E��������������������

��/$�������������:���������!����������1���������������������������������

�����������������������������������������1���+����+��989�������������FJ�1��

5�!JH���+��� �������+��������� �E����1�����1!��������������������������

�$ ������ ���E�−�������������1���+���

Zfp148 ����������#��������������������

E����1�����1����+�1+�����+��=����� �+����������������+����+����&�

�������������F5@H��J��&����������$����������1������ �������������������

��/$����������� ��&�+����&���������+��F5CH��9�������� �Apc�����&������=��

��������E����1�����1���&�����+�������+���������������&��4�=��� ���+��

�=������� �����=$���F5CH��)�������$�����������F5BH!���� �$���+�����������

��&���������&���� ��&�=$����1������1�������������� ������� ��&�+��

���������������&������� ���&��$���� ���&������������&�� ���1�������FJ�1��

@)H�����������!�1�������������� ��&�Apc �IEC /+&������&�����+���������������

��+�+�1+�E�������������&����������� �+����&������+������FJ�1��@�H�����

�������������/$��� ����FJ�1��@*H������������������ ��&�+��Zfp148 �IEC /�IEC�

&�������������+�=����1�� ������� �����������+�����=������� ��&�=$����1�

�����������&�������+��*�����1���������������������FJ�1��@9!��H�����

������!�1������ ��&�Apc�IEC /+;Zfp148�IEC/+�&����������&����+�=������&��

=$����1���&�������+��Apc�IEC /+ ��������, �+��+�1���������&�������������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 16: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

=��������FJ�1��@9!��H����+��� ����+���+������+������������������+������1��

=������Zfp148�������������E����1�����1����+����&���������+��� ��������� �

����Apc�������;��+����=$����1����$�������+���������� �����Zfp148����������

������������������������ ������������ �=�+�Zfp148 ����������������+��

�=������� �����Apc��������FApc�IEC /+H!���������1�����/$���&��� ���Zfp148�

������������ ��&�����������)���������������E����1�����1����+���=������

� ����������Zfp148�������������$ �����������$���=$����1��

34)&56������$����� ���!� CTNNB1����#����

� .��+���(��1�+�����������������=�������+��CTNNB1���&���!����

����� �������������$�����������������2?�=�in silico�$����&� ��&�+��

���������������������� �+��+$&���CTNNB1 1����FJ�1��C)H��*+:�����������

���������+��+��&�������&���ZNF148����&�������2?�=�F��+���+���2?�������

��1&��H����������+��+�1+���� �����9K)�=�����1�������&�������

��������1�9K)���1&�������@22����2B�������C5�����5���FJ�1��C)H���+��

$�����6*����+��������=�����1���������2?��������&����� $�+���=���-")�����

�������������������&�������)�������� �+��$�����&�������������"��������

+����������� �"�����=�����$����+� ���+����&������+������������������

��=��=�����1��+�������������=�������������!���������1�+������&������ �

+����&����&��������������������FJ�1��C�H��E��$����9K)�� �����

����������F9)�)H�$���1���=������������=���� $�+�����&�������+������

���=��������� ���������+��9K)����&�������2?�=�FJ�1��C*H��)����1�E�����1��

��&�����������&������������=�����1���+��=������������=��FJ�1��C�!������5H�

�+����������=�����1���������������+�+����������� �+��2�=�&$������1��FJ�1��

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 17: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

C�!������@H��K��!�����+�����+�� $������1+���������������������$������

CTNNB1��$�� ���������������������1�C���=�� �+����&����=$�����������$���

+������������=�+�"E@�?�����.�02�5�������� �+��2�=�����&$���������

�����$��������+���������9K)�=�����1���������2?�FJ�1��C9!�!6H���*��

���� ����1����������������&$������+�+������������&������������+��

���$�������/$�����+����������� �(���� ��1�������������+���+���&������&�����

��&����FJ�1��C9!J!.H����+��� �����������������=���������������+��CTNNB1�

��&���������$�����������������+���&��+����&���������������������+�+��

�=���������+����&������ �+��Zfp148����������������������������&%K)�����

�������������������+�����������1�����!��+��+��$=��/$�������������������

��&��������Apc�&$���&����F����J�1��2H��

"�����+��4���4������ �CTNNB1����������������������������

����������FJ�1��5*H!���������+������=�����+��E��β−���������1�����1�

���$����+��ZNF148����$���$=��/$��������������1�+������$������������ ��������

�������In silico����������� �+������&���ZNF148���&�������������$�����

�*JI8�J������=���������A������C�5�F6���&���H!��+��+�������� ��&���=��

*+:�����������$���1����=���������������FJ�1��B)�*H������������������� �

E����������$�����������������������"E@�?����������$����ZNF148�&%K)�

&������&�����������+����������� �E�5)������������&�����FJ�1��B9H���

J$�+��&���!������������������ �����������1+������$����ZNF148�&%K)�

���������!��$11����1���&����1����� ���� ���1$������FJ�1��B9H����+$�!�������

=�+����������������������������������$����1��������������� ����+��+��!�

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 18: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

+�����$����������������$11����� ��� ������������1��=������+��CTNNB1�����

ZNF148������FJ�1��AH��

7����������

-$���������+��APC�1�������$���������������$������������ �β−�������

+��$1+����������� ��+�����F2H���.������!�+����&���� ��$��+���1���������

=����������������������&��+����&�����$���1����β−���������������=���(�����

���������������������+���$���$��� ��������������� ��&���������)�*������!�

β−�������+��+��������!�$=�/$���������������+$���1���+��������&���-����

�������!�������+������4������1���+��CTNNB1 1�������������������

�����=$�������������������$������������ �+�����������1�������+��������� �

APC�&$������������������=���������������������+����1����� �*%*�

�������������F�H��3��+������������� ���������$���1����1��������������+����

���=�������&���������������*�&����������������� �+��CTNNB1 ��&����

�&��1�&�&&����������������������+�������6*����+���������������������

$�����"�I�������=�����1��������+���+������&�����&���F�?H���

�+�������������������� ����� �&������������� �2��+���1����\ZNF281�

����ZNF740�F1�����������1H���ZNF281���������������������!��+��+�

����1��(���+����&��6*����+�=�����1���������������������+����9K)�=�����1�

��&���������A�M����������������M���&�����F5AH��E��+��� ���������������+��

������������������&�1+���1$������&��� �+����&����1��1�������

*������������!�+�������� ����������������������&�������+���=�����$��������

��&����������+�����������1$����1������������*%*����������1��������

F5�!�5�H��"��� ������!�+������������� �����"K):8!��+��+���&������+��������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 19: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

&�����+�&������������F�-�H������������$����ZNF281�1���������������

-�������!�/$��������*+:��������������������+������������$����+��

��&����� �+��E����1��1����LGR5!��+��+�$��&����������������������

�����������+����/$�������� ���&�����������F5�H���������=�����+������&���

CTNNB1 ��&�����������$����CTNNB1�&%K)��������1�������&������!�

��&�������1�+����������� �&����&�&=�����������=�����������1$�����

CTNNB1�1��������������F@?H���+$�!�������!���������� �&����&�&=��!�����=���

��������������1$���������������������*%*�����������!�������������=������+��

CTNNB1���&����������� �����������!��$11����1�+���������&�1+������

��1$����CTNNB1�1����������������

8�4��������!�����+���+����+����������������������=�����+��CTNNB1�

��&������������=�����1������=$���������������������������������������1�

�������=�+�Zfp148 �������������$ �����������$������������&%K)�����������

���������!����$���1���� �����������-�������!��������������������������

Apc�&$�����1����������������&������+������F�+�������+��H!��+���

Zfp148�����������!��$11����1�+��������������������������+���&������)�

������������ �Zfp148��� ������������� �$������$�������� ��&�����������

Apcmin�&������ ���������������=$��������������+��1�������������F2�H!�

��+����$�������$����Zfp148����+���&&$�����&��&����+��������������

�����+�1+������������F�2H��

� )�������?�������� �*%*����+�=��APC�&$����������������������

���������������� ��������������������1�+��/$�����������+���ZNF148�1����

��������������������$���������������� ���������β−��������������F5�H���:������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 20: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

��� �$���+��4���4��1������CTNNB1�&%K)������$ �����������&��������

���$�����������������������������+$�!���������$���+��β−�������������

���$&$��������+���=������� ��� $��������APC �����������������������1��&�� �

��������� �������+��$1+������1��1����!�����$���1����$������ �ZNF148 1����

�����������"$=��/$����!��$��������������� �CTNNB1���������������=��

&���������+��$1+�+��=�����1�� ����������������+��CTNNB1���&����

$�+����������1�+������� �β−���������������+���=������� �ZNF148

&$�������������������&%K)�����������APC+/����������$&�����$11���+��

$���1$�����E����1�����1���������+���������������������1����������������:��

+������!�+��������������������1$���������������O ��� ������P�&��+����&���

�$�����$���1$�����β−���������1�����1����+����&���������+��FJ�1��AH���

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 21: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

��+��������

��� "�+���4��!�,�!�������+����!�,���+������������E����1������1��+�����������)�*�����������������������������&����6$�2??A��CB>@�A�@2C��

2�� ����4��!����E����1�����1�������������6�����9���2???���@>��5A���C���

5�� .��=�!�)�!�,$�������!�N�!�0��=�!�"�!��+��&�!�"���!���$&!�.�!�6�4�!���!�����0����1�!�J����*�&��+����������������� �=������������1��1�������������������������&���������������+�����1$�����E�I=������������1�����1���-*�6���&����2?�@���C>A@��

@�� -���!�%���!������&��!���!���$���!�-�!����������&��!�K���+����&��������������� �E����1�����1�+��$1+�=�����������"�������2??2��2�B>�B@@��B@B��

C�� �����+����!�-�)�!���$���&!�%�!�,� ���!�%�!����=�!�:�!�����)�����!�-�%���+������������� ������+���������������������������������������������&���.$&���+���2??���52>�2�B��22@��

B�� -���!���!�6����!�-�!�"�����!�)�!�.���4�!�-�8�!�6���+��!�)�!�:����!�-�!����&��!�E�J�!�-����!�-���!�%���4��!���'�!��$+�!�.�,�!����������1��1������ �=����������������� ����I��&+������+������ �������1�����1����+$&��������������������&���������K���)����"���<�"�)��������B>�B?5��B?���

A�� 6$�1��!�*�,�!�0�&!�9�E�!��+$!�R�!��+��!�8�!�����*+��1!�"�3���$&����$�������������� ���1������+������+��&�����������=���=������������������� �=����������1��������������������������1��2?�?���C�>CC2��CC5B��

��� ���������!�'�%�!�9�+�&���!�"�!�.����!�%�!�-��+���6����1��!�"�!�E��(!�,�!�"�+��&��+��!���!����������!�0�������������������������� �+��=����������1������+����������� ����� �����������������&���������,���+���2??���2��>5A?�5A���

��� 8�!�T�!�9��+����!�E�-�!��+��1!�R�!�)��J�1��+!�-�!�����9��+����!�%�.��*�����1�� �+�����=����������1����F*��=�H���&����������� $�������������������&�������+�+��*��=�����*�KK�����&������6���&����2??@���5>25��2@2��

�?�� K����!�J�!�����!�6�!�-���&���!�J�!���������%��!�J��6���&�����1���(������ �+��+$&���=����������1����F*�KK��H��6���&�������B��52>@�5�@2@��

���� -���+��!�,�8�!�:���!�6�%�!�������!���%�!�0��+��!�,�%�!�-�������!���%�!�E��1!���!�J���� !�%�,�!�-��+��!�,���!������������9$=�!�%��������!���0�$�����4��(���� ��1��������!���+�=��������&���1���+� ��������$������ �+��1��������&�����-���*������������B���B>BB@@�BBC5��

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 22: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

�2�� 8��!�6�8�!�:�+!�.�!�8��!�9�,�!�-�(�!�6�,�!�-���+��!�,�8�!�����-�����!�9�%�������������� ��������������1$�����+���������� �+������+���������=����������&�����,������*+�&�������2A5>���CC����B@��

�5�� ���!�8�!�����-���+��!�,�8�������������� �����������������������+�+��������������� ������5??��$���1�=$��������������� �2��� ����������������+$&����������,������*+�&�2???��2AC>5?A2C�5?A55��

�@�� 8��!�9�,�!�8�=$!���-�!�)��&�!�%�9�!�����-���+��!�,�8��)����� ��&�� ������������������+������������������K$������)�����%���2??B��5@>�5@2��5C?��

�C�� ������!�����!�6���=��1��!�.�!�%�&���!�%�9�!�8��!�9�,�!�N����&�����!�K�)�!�"�/$��"�����!�-�!����������!�-�!��������!�)�!�.����!�-�-�!�3��1!�)�*�!��������������%�1$���������������� �����+���.�����������:�����-$������9� �����)1�����"��&���������+�&$��$&����-�����6�����������1��2?�5���@@>�@BB��@AA��

�B�� 0�&&����!���!�����0�$��(!�,�9��6�����$�������&$�������� ������*$���'���6�����������2?�@��5?>C�5�C����

�A�� 6��!�R�.�!�8�$!�T���!�*+��1!�E�!�R$!�R�9�!�9$!�3�!�.��!�3�!�8�$!�3�!�3$!���T�!��$�!���6�!�R��1!�,�,�!������������������ ��KJ�@������� �������������1���1���� ���������������������������1���������$�>������1��*+�������$���=�����������$��&�����������*������2?�5�����>22�2�2222��

���� �������!���!�-��$&=���!�%�!�*$=���!���!�.������!���!������!�%�!�8�=��1�!�)�!�6�=��$!�<�!�"���!�,�,�!�����6������J��������!�,��)�1������1��$���� ���1�������$�������� ��+�����4�� ����$�������������1�����������9$4��]�����������������������'�����%��2??A���A>�?����?�@��

���� ���!�8�!�����-���+��!�,�8�����������&����1���+�������+��$1+���=���(������ �C5��-���*���������2??���2�>@BA?�@B�5��

2?�� "����!�N�:�!�0+��!�'�-�!���+������1�$!�8���!�"� ��!�)�!�:=��+�&!�-�R�!�)��$��!�)�!�)1���!���!�K����!�)�!����1���&!�6�!����1�!�-�'�!�������8����� ���������� �� �@�����$�������������&����+�1������ ������������+����������������&����=���������1�C5��*����%���2?�@����C>A���A����

2��� K����!�)�!�"����!�N�:�!���$!���N�!�"����!�"�:�!�����#���!�*�!�6$�!�K�!�)1���!���!�J�1�������!���!�K������!�'�!����1�!�-�'�!����������1���1�� �@����������C5��������$����$&���������������+��1$��'�����1��2?�B��

22�� 3��!�"�-�!�E$!�.�K�!�.�!�J�!�.$!�R���!��+��1!���3�!�.$��1!�-�3�!�E$!�R�!�.$��1!�*�3�!�����8�!�3��.�1+������������ �(����=�����1����������������������������$�������������+�1�����/$�&�$���������������)����+�����"$�1�2?�@���A>��BB���A5��

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 23: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

25�� *��!�-�3�!�8$�!�%���!�8�!�3�.�!�9��1!���!��+��1!���8�!��+�$!�J�,�!�*+��!�,�E�!�3$�!�,���!��+��1!�*���!�����*��!�3��.�1+������������ ��������������������+�������&������������������1������� ���������������������������������������&�������+�&����+���%���*�&&$��2?�2��@2B>B5B�B@2��

2@�� �+��1!�*���!�*��!�3�!�3$�!�,���!�*+��!�6�6�!�����8��!������:�������������������� �����������������1��������1�� ����������+�������$�����������&���.����+���1��2?�2��B?>���@���2@��

2C�� ����$�+�!���!�-�������!���%�!�J��1$���!�)�!�6�������!�,�!�����-���+��!�,�8��'�������������� �������!���(���� ��1���9K)�=�����1������!����1������������������+�&����+���%���*�&&$�����A��255>�C@��B?��

2B�� -�+���!���!�0��&��!�-�!�8���(4�!�)�!�9��4!�-�!��$��(���!�,�!�"(��(!�-�)�!�����6��� �!����)�&������������� �1��������������=�����=��&��4�����������1��$��&��� ����&��� ������&������=�������������������*������%��������2?�5���@?>2���252��

2A�� 6��� �!���!�"$�����4!���!��$��(���!�,�!�����8���(4�!�)��'�������$������������������ ��������������+����1���������$��� �=��&��4����$���1���������&���������������&����������$�1����������8�"�'���2?�5���>��22@���

2��� -����+�!�.�!�)#�&�!�%�!�8$�!�*���!�3�&�1$�+�!�����!�����"���=��4!���"��E�C�����������6J�=�����1�����1�����&�����������������1���������� ������$����#$����"�������2?�2��55�>�?����5��

2��� .����!���!�)4���!�)�!��+�����!���0�!�J��1$���!�9�'�!�6�������!�,�0�!�E�����&�!���'�!�*+�!�0�%�!�����J�����!���%��-�$���&������ ��������������&���������&����1��������=����������&����)��������������*������%���2??A��BA>�A2���A5?��

5?�� %����=�$+!�,�!�E��1!�R�!�����.�+�!�E�*��6���&�������1+������EK�I=������������1�����1����������+��&�����"���2?�@��5C>�?5��?���

5��� E+��!���9�!�*+���!�)�,�!�����9�����!�9�E��9����1$������� �E�I=������������1�����1����1����������������������6�����������1��2?�2���@2>2���252��

52�� 3��1!�,�!��+��1!�E�!������!���-�!�*+��!�R�!�.�!�R�!�����8�$!�*��)����&��$���������������F)�*H��� ������������1$�����=����������+��+�������������$=�/$�������������������������������,������*+�&�2??B��2��>�AAC���AACA��

55�� 9��1!�9���!�-�+���!�*�"�!�9��1!�8�.�!�)1=����!�:�)�!�����3��1!�N�E������������� �+��1$������+���0�$�����4�� �����F0�$�����4�� �����@H�

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 24: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

1�������+��+$&��������������������������%0'���������������*9R2��'���1����2??���2?>@��@�@��?��

5@�� �������E�����1!�-�!�"���+�!���!�N�����#!�*�!����8�$!�E�!�'���1!�:�!�.$������!�)�!���������.���!�0�!������!���!�*�$���$��!�9�!�.���&��!�)���!��������+��=���������I�*J�@���&�����&�������������1������+���������������������������������*����2??2�����>2@��2C?��

5C�� 9��!�8���!�']%�$�4�!�0���!�"�&��!�,�!����+�+��1���+!�9�J�!�������!�,�.�!�*������!�.�!�����8���!�"�E��)��%������������&����*���$����9� ��������������%����=���+���*���.�&�����������*���������*�������*����2?�C���B�>�C5���CC2��

5B�� "��!���!�N����!�%�6�!�"����!�.�,�!��������E�����1!�-�!����4��!�K�!�"��1�!�9���!�������!�,�.�!�)=�!�)�!�0$#���!���!������!���,�!�������"��1���81�C���&�������=$������������$����$�$��������������+�$���&�����+�&������+���K�$���2??���@C�>2B2�2BC��

5A�� 8��!�9�,�!�9$!�-�!�8��!�6�8�!�����-���+��!�,�8����������� ����������������� �&����� ������������ ������������1$���������+���������=��������1�������������������+�&����+���%���*�&&$��������2B2>��5��2?��

5��� .�+�!�"�!�,��4���!�%�!�"��&���!�.�!�.$���!�"�!�����.��&�4��1!�.��"K):8�����&�%�5@�� ���� ���������1$������� ��KJ2��I��������&������+������&�����+�&��������������-�'�,�2?�5��52>5?A��5?�C��

5��� .�+�!�"�!�����.��&�4��1!�.���KJ2��I������>������������������+������&�����+�&�����������!���&����!�������������,�-���-���F����H�2?�@���2>CA��C����

@?�� "��!�0�E�!�%�+!�0�.�!��+������!�9�%�!����4!�"���!�8��!�"�0�!�����0��1!�0�"���KJ2���4���4��������$��������1������� ����������� �+$&���&$��������&����������������������������*�������������2?�5��22>2��@?��

�� �

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 25: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

��8��1����#�����+���$+����+��4�+��-����$���������1��*����� �+��<-�99%*��5?�90�?5@�55�����J�������4�8��-�9������:::� ����������1���+���&���������&��� ���+��ZNF148���&����������+�&���� �1$�������1���� �

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 26: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

�������*�������

�������9������� ����34)&56���������0������������(�(������ ���1�!�

�����������'�' ��%������������&�1��� ���������������������

�&&$��+����+�&����������������$���1����������������� ����$��&�����������

��&����&���+$&���������F)!��H;������&��F*!�9H;�)�����������&�!�"�1����F�!�

JH;�"�1��2�F6!�.H;�"�1��5�F:!�,H;�"�1��@�F0!�8H��-�1�� ������>��??Z�����@??Z�

���+����������+�����1+����������� �+���&&&$��+����+�&�����������1� ���

�������F-H����β−�������FKH����������� $������� �+��+�����1���������$��� ���

��&����1�+������1��$�����������&�����=��0�$�4���E�������*$������ �

O�$������� ����������P� ���*%*������������2??�&��+��F�B�B������H� ���

) �&�����ZNF148���=�������1�����BFCOL1�����BERF-1�F'!��H��.�%��Q�

.�(����������

�������:,�(������� ���������+�Zfp148�������������������� ���$��

��#��������VC:Apc+/FL #�����F)H�E������=�������F�H�&%K)�������� ����������

����β�*������������� ��&�+�����������&$������ ��������$���&������+�+��

���������1�������Zfp148+/+ FE�H�F�������!2H; VC:Zfp148FL/+�F������5!@H;

VC:Zfp148FL/FL�F������C!�BH����1��@���C�&��+���6)�9.�$�������+��������1�

��������T$���������*%� ���Zfp148�F������H����ctnnb1 F������H�&%K)�

���&���(�����Hprt�&%K)��"+�������+��&����^"�-� ���KQ�C������&�������

�� ��&������������������_?�?�!�K"Q������1�� ����� �����������������+�����

1�����!���������)K'N)���+��$4��U���)��Apc����������������������+��

�����������+���$&�=��=������1�+��Apc+/FL�&�$����������+��N�����*���FN*H������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 27: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

��+�$�FZfp148+/+H������+���������� ������FZfp148+/FLH����=�+�Zfp148�

FZfp148FL/FLH����������F*H�"�������������� �"����������.G���F��H� ��&�VC:Apc+/FL;�

VC:Apc+/FL:�Zfp148+/FL;�VC:Apc+/FL:Zfp148FL/FL�&�����:�����Q�2?���F9H�E������

=��� ��������������������������� ����������$���&������+�+�����������

1�����������F�H�&%K)�������� ���Zfp148�F������H�����ctnnb1�F������H�

&%K)����&���(�����Hprt��"+�������+��&����^"�-� ���KQ�C������&����

�� ��&�����������������_?�??5!�����_?�???���'�������)K'N)���+��$4��U���

"�����1��+�� �+���$&=���� ���������&�$��� ���+�����������1����������

+����������FJH�����������F6H��"+��������+��&�����^"9����_?�?2����

����_?�??�!�K"�Q������1�� ����!���������)K'N)���+��$4��U���F.H�9����=$����

� �������������F������� ������$&=���� �����H����1�����;�F:H�9����=$����

� �������(��F������� ������$&=���� �����H����1�������K�Q�A�&�������

1�������

�������;,�β−� ����&���������������1!���<������34)&56��F)H�

�+��&����1��+��� ������������������������������ ��&�989��!�%0'!�"E@�?�

����0-�2������������5����4��� ������� ����1�����&=����F��*��H������%K)�

���1��� ���ZNF148�F��ZNF148H�����CTNNB1�F��CTNNB1H��F�H�K$&=���� ����������

��$�����������F������������ �+������&=����������1�������������*��H� ���

���+����������"+�������+��&����^"�9�� ���KQ�5������&������ ��&������

�����������_?�?2!����_?�??2����������_?�???����K����1�� ������� ����������+��

������1��� �%0'�����0-�2�����������&��1�+��5����&���1��$���F*H�-���

������� ���������=����� ������+�� �+��@������������� ���@��������"+�������+��&����

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 28: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� �

^"�9�������������1��� �+������&=����F"*%H�������!����_?�??2!�����_?�??2!�

�����_?�???�!���������)K'N)���+��$4��U������F9H�E������=���� ��������

����β−��������������������������&���(�����6)�9.�� ������� ������� �

��%K)����1����F�H�E������=���� ������������β−�����������������������

���&���(�����6)�9.�� ������� ������� ����������1��&�$���� �ZNF148

��������������������9K)��FJH�K$&=���� �����������������1��+��������

$������� ����������1��&�$���� �ZNF148 �������������������� �����

��&�������+���9K)��&��������F?��1H��"+�������+��&����^"�9�� ���K�Q�5�

�����&���!�����_?�??����&��������&��������$���1���������)K'N)��

%�����������+��&����1��+��� �+����������������������������+����

=����� ������+��&�$��� �ZNF148��������������������� ������

�������=,�7�������+�Zfp148 �����������������+�VC:Apc+/FL ��!��������

�+�����������&����1��+��� ���������&��+���1�� ��&������������� �������1�

�����������1������ ��&�F)H�E��F��������&��+���1�H�����F�H�VC:Apc+/FL��

FApc+/�IECH�&����F�+������&��+���1�H���F*H�6��+��+����+��������1��� �

��������F=���4H�����$���+�������F1���H���+���+���$�$���������������1��� ��&�

5�����1������1�������F9H��+�����������&����1��+��� ����������$�$����

���1������F*�����1�����E�!�Zfp148�IEC!�Apc+/�IEC�����Apc+/�IEC>Zfp148+/�IECH�

���!�5������������� �������1������������1�������F�H�6��+��+����+��&����

������1��� ���������&��+���1�����������$�$����F���������`��+������H���

����5����������� ���5�����1����$�$��������������� ��&�5�&�������1�������

"+��������+��&�����^"�-!����_?�??�!�����_?�???��=���������)K'N)��

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 29: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

��������,�34)&56���������!��CTNNB1����#�����F)H�"�+�&����� �+��+$&���

CTNNB1 ��&������*%���&���������$�������&�� ��5���1������ �+����&����

F����1������!2!5H�=�������C5���������=�$����&� ��&�+���������������

�������� �������1�*+:����+�����������=������*%����$�������������(��������

�M��1������1�������=��/�*%������������� �+����$������_?�??�!���������

)K'N)���+��$4��U���*+��&�1�����)�F*.%)H�����$����������$��������

��&������������������������+��:16���1�������������F�H��-")�$���1�+��2C�

=��������=�����1����� ��&�+��CTNNB1 ��&��������2?�=�$����&� ��&�+��

��������� ������������$�������+��E����=��F������������������������$��

=�����1����� ����������������!���2B�����6*****�1�1�1����H;��$���������

&$������)����������������������$����������F-$H��8�����>����=�;�8����2>�B�

S1��$�����������;�8����5>��??��&������������� �E�����1�;�8����@>��??��&�����

�������� �-$����1�;�8����C>��S��"�����=����F������4����������"���$���+� H;�

8����B>��S������������=���;�8����A>�2S������������=���;�8�����>�5S���������

���=���;�8�����>��S�����+�� �"����������������=�����F*H�9K)�) �����

�����������)�����F9)�)H�$���1�+��E��=������������=����8�����>���$�

�$�����������;������2>�������������+�E����=�;������5>�E����=��Q��??Z�

&������������� �E�����1�;������@>��??Z�&��������������+�-$����1�����������+�

+������������=������K$������������� ��&�"E@�?�������$���� ���=�+��-")�

����9)�)��F9H�"�+�&����� �ZNF148��9K)����������������������9K)��J��� ���

�$�� ����������������&���(�����%�������� ������� ������� ��$�� �������������

68@!��9K)����J$������1+�FJ8H���������������������&�����+��CTNNB1

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 30: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

� ��

����������&���F�C�����`�@AH���+�$������+�+��2�=�&$���������2?�F-$H����

������=����=�������� ���������"E@�?����.�02�5�������F�!�6H���+��

CTNNB1−�$�� �������������������� �������+� $������1+�������������������

�����$���FJ8�������!�a*���!�a�����J��1���H�����"E@�?����.�02�5�������FJ!�

.H���������������+��&������ �KQ�C������&������ ��&��������������^"�9��

��_?�?C;�����_?�??C!���������)K'N)���+��$4��U���

��������,�β&� �������������!� ZNF148����#�����F)H�"+��������+�&����� �

+��+$&���ZNF148���&������+�$������*JI8� �=�����1����������� �����F�H�

�*%���&���������$�������&�� ��5���1������ �+����&����=�������2��A�����

�B?B�=�$����&� ��&�+����������������������� �������1�*+:����+��������

���=������*%����$�������������(���������M��1������1����*+��&�1�����)�

F*.%)H�����$����������$����������&������������������������+��:16�

��1�������������F*H��*%����$��������������+�+�����=��������������(���

=��/�*%������������� �+����$�������_?�???�!���������)K'N)���+��$4��U���

F9H�:��$������ �ZNF148�&%K)����"E@�?�������=��E�5)���������1������������

&��������+����������� ����������������1�����������"553��*������Q�&�����

��&��������� �����8��������K�Q�5������&��������������!���_?�?C!����_?�?��

�����������9K)�������������!���������)K'N)���+��$4��U����

��������,�����+��1 ������� �����+�β−� ������$�34)&56���"�+�&����

�$&&�����$11����1�+����������$���������������������� �����������+��

���&����������+��$�����+�&���������������������� ��������� �)�*� $�������

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 31: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 32: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 33: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. ©

2016 Am

erican Association for C

ancer Research.

cancerres.aacrjournals.org D

ownloaded from

Author m

anuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited.

Author M

anuscript Published O

nlineFirst on O

ctober 10, 2016; DO

I: 10.1158/0008-5472.CA

N-15-3150

Page 34: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 35: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 36: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150

Page 37: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

on March 18, 2018. ©

2016 Am

erican Association for C

ancer Research.

cancerres.aacrjournals.org D

ownloaded from

Author m

anuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited.

Author M

anuscript Published O

nlineFirst on O

ctober 10, 2016; DO

I: 10.1158/0008-5472.CA

N-15-3150

Page 38: Transcription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of β-catenin ...

Published OnlineFirst October 10, 2016.Cancer Res   Bryan E Essien, Sinju Sundaresan, Ramon Ocadiz-Ruiz, et al.   -catenin expression in colorectal cancer

βTranscription factor ZBP-89 drives a feedforward loop of

  Updated version

  10.1158/0008-5472.CAN-15-3150doi:

Access the most recent version of this article at:

  Material

Supplementary

  http://cancerres.aacrjournals.org/content/suppl/2016/10/08/0008-5472.CAN-15-3150.DC1

Access the most recent supplemental material at:

  Manuscript

Authoredited. Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been

   

   

   

  E-mail alerts related to this article or journal.Sign up to receive free email-alerts

  Subscriptions

Reprints and

  [email protected] at

To order reprints of this article or to subscribe to the journal, contact the AACR Publications

  Permissions

  Rightslink site. Click on "Request Permissions" which will take you to the Copyright Clearance Center's (CCC)

.http://cancerres.aacrjournals.org/content/early/2016/10/08/0008-5472.CAN-15-3150To request permission to re-use all or part of this article, use this link

on March 18, 2018. © 2016 American Association for Cancer Research.cancerres.aacrjournals.org Downloaded from

Author manuscripts have been peer reviewed and accepted for publication but have not yet been edited. Author Manuscript Published OnlineFirst on October 10, 2016; DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-15-3150