Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos...

51
Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas Manuel J. Gómez Laboratorio de Bioinformática Centro de Astrobiología INTA-CSIC

Transcript of Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos...

Page 1: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Tipos Celulares Básicosy BioMoléculas

Manuel J. GómezLaboratorio de Bioinformática

Centro de Astrobiología INTA-CSIC

Page 2: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Organismos acelularesVirusViroides

Organismos celulares,super-reinos:

EucaryotaBacteria (eubacterias)Archaea (arquebacterias)

Page 3: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Célula ProcariotaBacteria y ArchaeaEscherichia coli, E. coli, EcoMembrana, Citoplasma

Page 4: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Célula EucariotaMembrana, CitoplasmaNucleo, Orgánulos

Page 5: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Golgi, REMitocondria, CloroplastoTeoría endosimbiótica

Page 6: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

VirusCapside, ProteínasADN, ARNParásitos

Page 7: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Biomoléculas

H2O / Sales minerales

Moléculas Macromoléculas

MONOSACARIDOS POLISACARIDOS

ACIDOS GRASOS GRASAS/LIPIDOS

AMINOACIDOS PROTEINAS

NUCLEOTIDOS ACIDOS NUCLEICOS

Page 8: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

La molecula de AGUA es DIPOLAR.Por eso, diferentes moléculaspueden unirse por PUENTES DEHIDROGENO.Los ángulos de enlace se explicanpor los orbitales atómicos deloxigeno.

Page 9: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Biomoléculas

H2O / Sales minerales

Moléculas Macromoléculas

MONOSACARIDOS POLISACARIDOS

ACIDOS GRASOS GRASAS/LIPIDOS

AMINOACIDOS PROTEINAS

NUCLEOTIDOS ACIDOS NUCLEICOS

Page 10: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

HIDRATOS DE CARBONO(CH2O)n. Moléculaslineales o ciclicas.

MonosacáridosDisacáridosPolisacáridos

Uno puede encontrarglúcidos en:Almidón,Celulosa, Glucógeno,Quitina, ADN, ARN,Proteínas.

D-Glucosa

Glicerol

QuitinaSacarosa

Glucógeno

Celulosa

Page 11: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Biomoléculas

H2O / Sales minerales

Moléculas Macromoléculas

MONOSACARIDOS POLISACARIDOS

ACIDOS GRASOS GRASAS/LIPIDOS

AMINOACIDOS PROTEINAS

NUCLEOTIDOS ACIDOS NUCLEICOS

Page 12: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

LípidosFosfolípidosMembranas

Page 13: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Los FOSFOLIPIDOS son una clase muy común de lípidos.Son los principales constituyentes de las membranas biológicas.Tienen una cabeza polar y una cola hidrofóbica, por lo que se dice que tienen caracter ANFIPATICO.

Page 14: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

FosfolípidosAcidos GrasosHidrofóbico = apolarHidrofílico = polarAnfipáticos

Page 15: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Fosfolípidos en unabicapa lipídica, comolas que forman parte delas membranas celulares.

Page 16: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

LípidosAnfipáticosMonocapa lipídicaMicelasDetergentes

Page 17: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Colesterol

Page 18: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Membrana biológicaBicapa lipídicaLípidos anfipáticos, Proteínas integrales y periféricasSeparación Espacio Extracelular : CitoplasmaBarrera de permeabilidadTransportadores y Poros

Page 19: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Membranas, donde: Citoplásmica Nuclear Mitocondrias Cloroplastos Golgi Retículo endoplásmico Vesiculas

Page 20: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Biomoléculas

H2O / Sales minerales

Moléculas Macromoléculas

MONOSACARIDOS POLISACARIDOS

ACIDOS GRASOS GRASAS/LIPIDOS

AMINOACIDOS PROTEINAS

NUCLEOTIDOS ACIDOS NUCLEICOS

Page 21: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

α

Las PROTEINAS estánhechas de aminoácidos.Todos los aminoácidostienen un grupo AMINO(NH2), un grupo ACIDO(COOH) y una cadenalateral (R) que esdiferente en cada unode los 20 tipos deaminoácidos.

Page 22: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

20 aminoácidosCadenas lateralesApolaresPolaresAcidosBásicos

Page 23: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Enlace peptídicoPéptidosProteínasExtremo aminoExtremo carboxilo

Page 24: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Enlace peptídicoFormas resonantes

Page 25: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Ejemplo de proteínaformada por cuatroaminoácidos.

La secuencia deaminoácidos puederepresentarse comouna cadena de letrasen un codigo de trescaracteres o uncaracter.

Page 26: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Estructura: Primaria, SecundariaTerciaria y Cuaternariaα-helices, β-sheet, turns, loopsDominios

Page 27: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

α-hélicePuentes de Hidrógeno3.6 aa por vuelta

Page 28: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

α-hélice, ribbonCadenas lateralesorientadas haciaafuera

Page 29: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

β-sheet β-strand Paralelas Anti-paralelasCadenas lateralesalternando lado

Page 30: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Estructuras

Page 31: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Proteínas, donde y qué: solubles, de membrana, transportadores, enzimas, estructurales, contráctiles

Page 32: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Enzimas,Binding site,Centro activo

Page 33: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Electroforesis, SDS PAGEGel de PoliacrilamidaSDSMigraciónCampo eléctricoSeparación por tamaño(peso molecular, MW, dalton)TinciónMarcaje radioactivo

Page 34: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

2D electrophoresisElectroforesis bidimensional,Separación por:

1-punto Isoelectrico, pI (IEF)2-tamaño (SDS PAGE)

Detergentes neutrosAnfolitos

Page 35: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Determinación EstructuralCristalografía de Rayos XResonancia magnética nuclear

Page 36: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Biomoléculas

H2O / Sales minerales

Moléculas Macromoléculas

MONOSACARIDOS POLISACARIDOS

ACIDOS GRASOS GRASAS/LIPIDOS

AMINOACIDOS PROTEINAS

NUCLEOTIDOS ACIDOS NUCLEICOS

Page 37: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Acidos NucléicosAcidos Nucléicos

El experimentode Griffith (1920),demostró laexistencia deuna “sustanciatransformante”que podíacambiar elfenotipo de unorganismo.

Page 38: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Los Nucleótidos estáncompuestos de:

FosfatoAzucar

Deoxiribosa (ADN)Ribosa (ARN)

Bases NitrogenadasPurinas

Adenina, AGuanina, C

PirimidinasCitosina, GTimina, T (ADN)Uracilo, U (ARN)

¿Habeis visto GATTACA?

ADN Y ARN !!ADN Y ARN !!

Los Acidos Nucleícos estánhechos de NUCLEOTIDOS.

Page 39: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Deoxi-ribosa

FosfatoGuanina

EJEMPLO: Desoxi - Guanidin Mono Fosfato, dGMP, G

Page 40: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Basesnitrogenadas

Fosfato

Azucar

Page 41: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

El Acido Deoxiribonucleico (ADN, DNA) está formado por unadoble cadena de nucleótidos. Se dice que las cadenas sonCOMPLEMENTARIAS, porque las bases nitrogenadas estánenfrentadas (apareadas) según unas reglas fijas: A con T yC con G. Las cadenas tienen dirección (extremos 5' y 3') yson antiparalelas. Longitud en nucleótidos o en bp, Kb

ADNADN

Page 42: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Apareamiento debases nitrogenadasPu - PiG - CA - T (en DNA)A - U (en RNA)

Page 43: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Las dos cadenas están enrolladas una sobre la otra, formandouna doble hélice. La estructura del ADN fué descubierta pr Watsony Crick en 1953, por lo que les dieron el premio Nobel en 1962.Usaron datos de Rosalind Franklin, que injustamente no fuépremiada.

Page 44: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

DNASurco mayorSurco menor

Page 45: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

El genoma, o materialgenético, en bacteriófagos(virus come-bacterias)

Page 46: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Muchos procariotas tienen uncromosoma circular y plásmidos,que son otras moléculascirculares de ADN, mucho máspequeñas (flechas blancas en lafoto de la derecha).

El genoma, o material genético, en células procariotas

Page 47: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Eucariotas:CromosomasDNA mitocondrialDNA cloroplastos

El genoma, o material genético, en células eucariotas

Page 48: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Cromosoma mitótico descompactado de forma artificial

Page 49: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

El Acido Ribonucleíco (ARN,RNA) está formado por unaúnica cadena de nucleótidos.Hay tres tipos de ARN:

mRNA, mensajerorRNA, ribosomaltRNA, de transferencia

Son muy importantes paralos procesos de:

TRANSCRIPCION

TRADUCCION

ARNARN

Page 50: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

Electroforesis en geles deagarosa,poliacrilamida(secuenciación)

Page 51: Tipos Celulares Básicos y BioMoléculas · monosacaridos polisacaridos acidos grasos grasas/lipidos aminoacidos proteinas nucleotidos acidos nucleicos.

El material gráfico proviene de:

● Horton et al, Principles of Biochemistry, Prentice Hall

● Lewin, Genes VII, Oxford University Press● Access Excellence Graphics Gallery,

(www.accessexcellence.org)● www.bact.wisc.edu/Bact303/Bacteriology