滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理
-
Upload
sr-ws -
Category
Health & Medicine
-
view
383 -
download
0
Transcript of 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理
![Page 1: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/1.jpg)
系統的レビュー研究計画書作成ワークショップ第三回 Ovid Medline 検索 文献管理
兵庫県立尼崎総合医療センター Hospital Care Research Unit
辻本 啓 / 片岡 裕貴
![Page 2: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/2.jpg)
復習:系統的検索とは?
~~を高めた検索のこと
逆は~~的検索
2
![Page 3: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/3.jpg)
前回の復習
検索式の構造は?
→P + IO は入れない!
3
![Page 4: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/4.jpg)
各要素の構造は?
統制語+ free word でした
4
![Page 5: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/5.jpg)
今回の目標
• 系統的レビューのための Ovid Medline のデータベース選択ができる
• Ovid を用いて統制語を探すことができる• 先行文献を参考に Ovid を用いて統制語、キーワードで
検索できる• 自分の RQ について Ovid MEDLINE で大まかな検索式
をつくることができる• 簡単な Background section を作ることができる• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつけることが
できる
5
![Page 6: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/6.jpg)
Ovid は検索できるデータベースがいっぱい!
6
下にスクロールするとMEDLINE が出てきます
![Page 7: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/7.jpg)
MEDLINE がいっぱい!
7
![Page 8: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/8.jpg)
MEDLINE がいっぱい!
お経:以下 2 つを選択すれば OK !
Ovid MEDLINE(R)<1946 to Present with Daily Update>
Ovid MEDLINE(R)In-Process & Other Non-Indexed Citations
8
![Page 9: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/9.jpg)
MEDLINE でも advanced search
ゼロから作るのは大変なのでまた似た P 、似た I のレビューの組み合わせで検索式を作りましょう!
9
![Page 10: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/10.jpg)
先人に学ぶ
10
![Page 11: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/11.jpg)
Advanced search を選択
11
![Page 12: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/12.jpg)
12
1. こちらに入れると
2. こちらに出てきます
![Page 13: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/13.jpg)
13
0. ここは気にしなくて OK !
![Page 14: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/14.jpg)
知らない記号がたくさん $?
14
![Page 15: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/15.jpg)
MEDLINE via Ovid のゆらぎの演算子
前方一致 $, $n (=n 文字目までの制限でゆらぎを許容 )
ワイルドカード #, ? ( # は何か word が必ず入るが、 ? はなくても OK )
例: disease$=disease, diseases など dog$2= dog, dogs (≠doghouse) wom#n= woman, women colo?r= color, colour
15
![Page 16: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/16.jpg)
MEDLINE via Ovid の位置演算子
近接演算子: ADJ もしくは スペース=その語順で近接している語を hit
近接演算子: ADJn= 語順不同で n 語以内に近接しているものを hit
例: blood pressure = blood adj pressure
例: continuous adj2 dialysis =continuous peritoneal dialysis, continuous venoveous dialysis etc.
16
![Page 17: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/17.jpg)
ストップワード
出現頻度の高い一般的な語 ( 例 :the, or, of など ) は、ノイスを低減するため、検索対象から除外されることがあります。
それらの語をストップワードと呼ひます。
※ 仕様が結構変わるらしいので、ストップワードであることが分からなかったら試しに検索してみましょう
17
MEDLINE® 2016 Database Guide
![Page 18: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/18.jpg)
(参考)応用編:変な結果だったら、簡単に動作確認
何故かマニュアルと違う動作をすることがあります
18
MEDLINE® 2016 Database Guide
![Page 19: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/19.jpg)
“.mp.” って?
Multi-purpose の略いろいろなフィールドをいっぺんにフリーワード検索してくれる便利機能→ 迷ったらこれで!対象は title, original title, abstract, name of substance word, subject heading word など詳しくはhttp://demo.ovid.com/demo/documents/docs/English/MP%20fields.pdf
19
![Page 20: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/20.jpg)
“.tw.” って?
フリーワードでタイトルを検索してくれる先行研究がこれなら今回はこれで OK !
20
![Page 21: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/21.jpg)
“/” スラッシュ
スラッシュで統制語を示します
21
![Page 22: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/22.jpg)
用語の説明 1 :フィルターとは?
検索で研究デザインを指定する式のこと
→Cochrane review などの系統的レビューで使われるものには、 RCT 用があります他は系統的レビューでは普通は使いません!
プロトコルができた段階で、必要であればコピペで追加してもらいます!
今回は学習不要です。
22
![Page 23: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/23.jpg)
用語の説明 2 : variant spellings とは?
“tumour” と” tumor”“hematoma” と” Haematoma” など
想定されるものがあれば or で加える
23
![Page 24: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/24.jpg)
MeSH はどうやって検索する?
24
![Page 25: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/25.jpg)
MeSH はどうやって検索する?
25
![Page 26: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/26.jpg)
MeSH はどうやって検索する?ほとんど” explode” で OK
26
![Page 27: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/27.jpg)
MeSH はどうやって検索する? ほとんどの場合すべての subheading を選択
27
![Page 28: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/28.jpg)
MeSH はどうやって検索する? 検索式に挿入
28
![Page 29: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/29.jpg)
MeSH はどうやって検索する?
29
![Page 30: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/30.jpg)
文献がたくさん!
30
![Page 31: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/31.jpg)
文献管理ソフト
31
![Page 32: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/32.jpg)
文献管理ソフトの使い方
どれも使ったことない人は、講義スライドの終わりにの Mendeley資料を添付しています。系統的レビューでは必須です。
32
![Page 33: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/33.jpg)
文献管理ソフトが手に入ったら
レビュー計画書の簡単な Background を 3-5 文程度で書いてみましょう!今回は日本語です!
33
![Page 34: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/34.jpg)
背景の構造 ( PICO の例の計画書のテンプレ)
背景1. 対象となる疾患について(リファレンスをつけてください) 2. 対象となる介入方法について 3. 介入方法が有効なメカニスム 4. 本レビューを実施する意義
34
![Page 35: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/35.jpg)
背景( PICO の例)
(病態が人類にとって” relevant”な理由=疫学データ ) (例 : 世界での発生率 ) (引用 1).(例 : 致死率など ) (引用 2).
近年_ (I: 介入内容 ) _は___のようなを効果が言われおり臨床試験で__アウトカムを改善したことが報告されている (引用 1) .
系統的レビューとして (P: 病態 )に対する (I: 介入内容 )_を評価したものは報告されていない .それゆえ、今回 (PI(E)CO)での系統的レビューを行った .
<文献リスト (bibliography)>1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-492. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J Clin Epidemiol 58 (3) 859-862
35
片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @ 尼崎 グループワークシートを一部改変
![Page 36: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/36.jpg)
背景1
対象となる疾患の疫学データ
( 例 : P の世界での実数 etc.) (引用 1).
36
![Page 37: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/37.jpg)
背景2
その介入について
近年 (I: 介入内容 ) の臨床試験で介入の効果が報告されている (引用 1).
37
![Page 38: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/38.jpg)
背景3
その介入が有効となるメカニスム
(I: 介入内容 ) は△△を予防することにより○○のアウトカムを改善すると考えられている (引用 2).
38
![Page 39: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/39.jpg)
背景4
本レビューを実施する意義
系統的レビューとして (P: 病態 ) に対する_ (I: 介入内容 ) を評価したものは報告されていない .
それゆえ、今回 (PICO) に関して系統的レビューを行った .
39
![Page 40: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/40.jpg)
簡単な Background ができたら
文献管理ソフトを使って引用文献をつけます
指定引用形式: Vancouver
※趣旨は引用をつける練習なので、Background は簡単でいいです。
40
![Page 41: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/41.jpg)
Vancouver 式を知らなくても OK
文献管理ソフトで選択できます!
41
![Page 42: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/42.jpg)
引用文献をつけてみる (例)
(病態が人類にとって” relevant”な理由=疫学データ ) (例 : 世界での発生率 ) (引用 1).(例 : 致死率など ) (引用 2).
近年_ (I: 介入内容 ) __ の臨床試験で〜の効果が報告されている (引用 1).
系統的レビューとして (P: 病態 )に対する_ (I: 介入内容 )_を評価したものは報告されていない .それゆえ、今回 (PI(E)CO)での系統的レビューを行った .
<文献リスト (bibliography)>1. Kataoka Y. (2013) History of Tigers. Plos Ama, 8(12) 45-492. Tsujimoto H. (1998) Quality of Amagasaki Chanpon. Ama J Clin Epidemiol 58 (3) 859-862
42
片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @ 尼崎 グループワークシートを一部改変
![Page 43: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/43.jpg)
今回の目標
• 系統的レビューのための Ovid Medline のデータベース選択ができる
• Ovid を用いて統制語を探すことができる• 先行文献を参考に Ovid を用いて統制語、キーワードで
検索できる• 自分の RQ について Ovid MEDLINE で大まかな検索式
をつくることができる• 簡単な Background section を作ることができる• 文献管理ソフトを用いて文章に参考文献をつけることが
できる
43
![Page 44: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/44.jpg)
参考資料
1. Lefebvre C, Manheimer E, Glanville J. Chapter 6: Searching for studies. Box 6.4 d. Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions Version 5.1.0 (updated March 2011). 2010. 1-46 p. available from http://community.cochrane.org/handbook
2. 『看護研究者・医療研究者のための系統的文献検索概説』諏訪敏幸 近畿病院図書室協議会 2013
3. Ovid Online Training http://www.ovid.com/site/support/training.jsp#tabs1
“MEDLINE” https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zGizVDdlez34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineIntro“Special techniques in MEDLINE”https://www.brainshark.com/wkovid/vu?pi=zFvzXHuX2z34XJz0&cmpid=Brainshark:MedlineSpecialTechniques
4. 片岡・辻本 2016/3/19 コクランレビュータイトル登録セミナー @尼崎 グループワークシート
5. MEDLINE® 2016 Database Guideavailable from http://access.ovid.com/training/ja/docs/FieldGuide_MEDLINE_JPN.pdf
6. Ovid 講習会ビデオシリースhttp://access.ovid.com/training/ja/
44
![Page 45: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/45.jpg)
[ 参考スライド ] Mendeley の使い方
たくさんある中で free の Mendeley を紹介宿題はどのソフトを使ってもいいです!
45
![Page 46: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/46.jpg)
参考スライドの目標 ( Mendeley の場合)
• 文献管理ソフトをインストールできる• Wordへのプラグインをインストールで
きる• Word 内で文章への citation を入れるこ
とができる• 参考文献リスト (Bibliography) を入れ
ることができる
46
![Page 47: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/47.jpg)
1. Mendeley のダウンロード
![Page 48: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/48.jpg)
![Page 49: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/49.jpg)
![Page 50: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/50.jpg)
使い方はたくさん動画があります。
50
日本語 https://www.youtube.com/channel/UCyftgRDCOa09RYl63QBFPdg
英語https://www.youtube.com/user/MendeleyResearch
![Page 51: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/51.jpg)
Mendeley と MS word を使った引用文献リスト作り方
51
https://www.youtube.com/watch?v=zkrVbBSrK_w
![Page 52: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/52.jpg)
[ 参考 ] PubMed について
52
同じデータベース( MEDLINE を検索している)→ ほとんど同じと考えてください
欠点:1. 検索に使える演算子が少ない複雑な free word 検索が必要な場合は検索の難易度が上がる or ノイスが増える2. 検索結果のダウンロードが面倒(件数上限があり、前半 /後半など、分けてやらないといけない)
![Page 53: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/53.jpg)
MEDLINE via PubMed での注意
1. 近接演算子はつかえない2. ワイルドカードは使えない3. 前方一致は * のみ (400パターンまで許
容 )4. Automatic Term Mapping が作動5. “and” や” or” などは必ず大文字で使用
53
![Page 54: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/54.jpg)
Automatic Term Mapping とは
free word(= 統制語でない言葉 ) をそのままPubMed で入れると生じる便利な機能(系統的レビューの本番の検索では邪魔)
語尾に[ tiab]などのサーチタグをつけることで off できる※ また、フレース検索は””で囲わないとこの機能でバラバラにされて検索される
54
![Page 55: 滋賀医大Srws第三回Ovid Medline検索と文献管理](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022042508/586f8fee1a28ab54768b77dd/html5/thumbnails/55.jpg)
さらに Pubmed を知りたい方は
PubMed Tutorialhttp://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/cover.html東大図書館 PubMed の使い方http://www.lib.m.u-tokyo.ac.jp/manual/pubmedmanual.pdfユサコ株式会社 MEDLINE 簡易マニュアルhttp://www.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/manual/medline_manual_1010.pdf山梨大学付属図書館PubMed と Ovid MEDLINE の比較一覧http://www.lib.yamanashi.ac.jp/db/ovid_ma/ovid%20medline%20vs%20pubmed%20for%20Yamanashi%20Univ_200712.pdf
55