SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos...

26
E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius 2017-09-11

Transcript of SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos...

Page 1: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

E-sveikatos terminologijos

Arvydas Laurinavičius

Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija

SAM, Vilnius 2017-09-11

Page 2: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

INFORMACIJOS VALDYMAS

Institucijos, nacionaliniu ir tarptautiniu mastu

Semantinis interoperabilumas

Techninis interoperabilumas

Sveikatos IS standartai

Page 3: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Grupės

Klasifikacijos

Apsikeitimo formatai

EHR

Structured

Document

Data Group

Element

Folder

Element

Element Element

Element Element

Value Domain

Terminologies

& Codesets

Data Group Duomenų specifikacijos

Terminologijos

Informacijos standartai

TLK-10 Semantiniai: SNOMED CT

LOINC

AU DRG

Techniniai: HL7, CDA, LRA

Page 4: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Terminologijos

Klasifikacijos Grupės

Labai detalios

klinikinei medicinai

Vidutiniškai

detalios kliniškai prasmingaim

grupavimui ir skaičiavimui

Apytikslės

administravimui ir

finansavimui

.....trys skirtingi tikslai

Page 5: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius
Page 6: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

SNOMED CT IR LOINC

TEISINĖ APLINKA LIETUVOJE

• SNOMED CT ir LOINC yra numatyti Sveikatos priežiūros įstaigų informacinių sistemų susiejimo su e. sveikatos paslaugų ir bendradarbiavimo infrastruktūra reikalavimuose ir techninėse sąlygose kaip duomenų mainų standartai (2012 m. birželio 7 d. Nr. V-509)

• SNOMED CT ir LOINC yra numatyti tarp rekomenduojamų IS standartų reikalavimuose sveikatos priežiūros įstaigose diegiamoms informacinėms sistemoms (2011 m. sausio 28 d. Nr. V-89).

Page 7: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius
Page 8: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

SNOMED CT

Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms

• išsamiausia pasaulyje klinikinės terminologijos sistema

• apima visas šiuolaikinės medicinos sritis

• susieta su kitais tarptautiniais standartais

• leidžia elektroninėje ligos istorijoje saugiai aprašyti (sukoduoti)

klinikinius duomenis, reikalingus sveikatos priežiūrai užtikrinti

• Pirminis taikymas – klinikinė medicina (sprendimų palaikymas)

• Antrinis (secondary use) – analitika

• Tarptautinis duomenų interoperabilumas

• Palaikymo kaštus dalinasi daugelis šalių

Page 9: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

http://www.ihtsdo.org/

IHTSDO established, March 2007

Page 10: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

SNOMED International:

30 šalių 2017 metais

http://www.snomed.org/members

Page 11: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

350 tūkst sąvokų

19 hierarcijų

Page 12: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

SNOMED CT LT

Page 13: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

IHTSDO

Unsatisfactory Sample

Page 14: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

PAP Test – Unsatisfactory Sample Rpt

LT

EN

Automatinis ir saugus (autorizuotas) vertimas į kitas ~12 kalbų

Page 15: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

15

Valstybinė gimdos kaklelio vėžio prevencijos programa Sveidroje 13 skirtingų kainos kodų kiekvienai Bethesda kategorijai nuo 2014 m.

CT Ištyrimo rezultatas I CIKLAS II CIKLAS III CIKLAS IV CIKLAS

Netinkamas ištyrimui tepinėlis (1846) 16.618 12.056 11.576 10.126

Nėra intraepitelinių pakitimų ar piktybinio naviko (1847) 294.880 311.675 315.037 342.658

Atipinės nenustatytos reikšmės plokščiojo epitelio ląstelės (ASC-US 1848)

7.556 7.945 10.213 11.395

Atipinės plokščiojo epitelio ląstelės, gali būti žymūs plokščialąsteliniai intraepiteliniai pakitimai (ASC-H 1849)

1.448 1.499 1.680 1.838

Nežymūs plokščialąsteliniai intraepiteliniai pakitimai (LSIL 1850)

2.460 4.112 6.829 5.649

Žymūs plokščialąsteliniai intraepiteliniai pakitimai (HSIL 1851)

3.708 4.043 3.569 3.396

Plokščialąstelinė karcinoma (SCC 1852) 195 96 62 45

Atipinės nenustatytos reikšmės liaukinio epitelio ląstelės (AGUS 1853)

357 171 222 128

Atipinės liaukinės ląstelės, gali būti piktybinės (AGC 1854) 56 58 83 67

Adenokarcinoma in situ (AIS 1855) 5 5 6 9

Adenokarcinoma (AC 1856) 7 9 7 4

Nėra intraepitelinių pakitimų ar piktybinio naviko (endometriumo ląstelės, 40 metų ir vyresnių moterų) (EMP 1857)

128 150 128 123

Kita (1858) 1 4 4 2

Iš viso: 327.419 341.823 349.416 375.440

Tiksli citologijos tyrimų analitika

Bet...

Kolposkopija ?

Biopsijos ?

Gydymo efektas ?

Kvietimų valdymas ?

Stebėsena ?

Page 16: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

~100 darbuotojų

Page 17: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius
Page 18: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

TERMINOLOGY RESOURCES

SNOMED CT®

U.S. Extension to SNOMED CT

U.S. SNOMED CT Content Request System

NLM SNOMED CT Browser

IHTSDO SNOMED CT Concept Identifier Lookup Service

MAPS (SNOMED CT and ICD-9 or ICD-10 and their Clinical Modifications)

Medications - RxNorm

SNOMED CT® Subsets

CORE Problem List Subset of SNOMED CT

Route of Administration Subset of SNOMED CT

Kaiser Convergent Medical Terminology (CMT) Subsets

Nursing Problem List Subset of SNOMED CT

LOINC®

LOINC Common Laboratory Orders Value Set

LOINC Top 2000+ Lab Observations and Mappers' Guide

Newborn Screening Coding and Terminology Guide

Table of Example UCUM Codes for Electronic Messaging

Subsets for Test Panels & Assessment Forms

RxNorm Subsets

RxNorm Current Prescribable Content

Page 19: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Logical Observation Identifiers Names and Codes

loinc.org

regenstrief.org

LOINC - SNOMED CT

Cooperation Project Technology

Preview is available

http://www.snomed.org/news-

articles/loinc--snomed-ct-

cooperation-project-technology-

preview-is-available

Page 20: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Tyrimų „kodavimas“ Lietuvos E-sveikatoje?

Tyrimo ID Tyrimo pavadinimas

Ėminio

ID

Ėminio

kodas Ėminio pavadinimas

933 Gliukozės koncentracijos kraujyje nustatymas 3735 1 Bioptatas

934

Gliukozės koncentracijos serume/plazmoje, likvore

nustatymas 3737 3 Ejakuliatas

934

Gliukozės koncentracijos serume/plazmoje, likvore

nustatymas 3740 6

Kateterio, dreno

galiukas

934

Gliukozės koncentracijos serume/plazmoje, likvore

nustatymas 3742 8 Kraujas

„Nacionaliniai“, iš esmės, lokalūs kodai

Page 21: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

LOINC klasifikatorius: Gliukozės koncentracija

LOINC

kodas Ilgas pavadinimas Lietuviškas pavadinimas

Vienet

ai

39480-9 Glucose [Moles/volume] in Venous blood Gliukozės koncentracija veniniame kraujyje mmol/L

39481-7 Glucose [Moles/volume] in Arterial blood Gliukozės koncentracija arteriniame kraujyje mmol/L

51596-5 Glucose [Moles/volume] in Capillary blood Gliukozės koncentracija kapiliariniame kraujyje mmol/L

14743-9

Glucose [Moles/volume] in Capillary blood by

Glucometer

Gliukozės koncentracija kapiliariniame kraujyje

matuojant gliukometru mmol/L

15076-3 Glucose [Moles/volume] in Urine Glucose Gliukozės koncentracija šlapime mmol/L

14748-8 Glucose [Moles/volume] in Peritoneal fluid Gliukozės koncentracija pilvaplėvės skystyje mmol/L

14749-6 Glucose [Moles/volume] in Serum or Plasma Gliukozės koncentracija serume ar plazmoje mmol/L

14996-3

Glucose [Moles/volume] in Serum or Plasma --pre

75 g glucose PO

Gliukozės koncentracija serume ar plazmoje - prieš

75 g gliukozės testą mmol/L

14995-5

Glucose [Moles/volume] in Serum or Plasma --2

hours post 75 g glucose PO

Gliukozės koncentracija serume ar plazmoje - 2 val.

po 75 g gliukozės testo mmol/L

Page 22: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Tyrimo aprašas pagal LOINC:

Gliukozės koncentracija veniniame kraujyje 39480-9

Component Glucose Related Names

v2.05

Bld ven; Bld venous; Blood - venous; Blood ven; Blood

venus; Chemistry; Glu; Gluc; Glucoseur; Level; Point in

time; QNT; Quan; Quant; Quantitative; Random;

Substance concentration; Venous

Property SCnc Short Name Glucose BldV-sCnc

Time Aspect Pt Order OBS Both

System BldV Example Units mmol/L

Scale Type Qn Long Common

Name Glucose [Moles/volume] in Venous blood

Class CHEM Example UCUM

Units mmol/L

VersionLastCh

anged 2,34

Common Test

Rank 0

Change Type MIN Common Order

Rank 0

Status ACTIVE Common SI Test

Rank 0

Class Type 1

Units Required N

Submitted

Units mmol/L

Page 23: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius
Page 24: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Priemonė: Paciento sveikatos duomenų semantinis

struktūrizavimas tarptautinių medicininių terminologijų pagrindu,

sukuriant duomenų apsikeitimo informacinius modelius.

Įvertinami įdiegti SPĮ IS ir ESPBI IS

duomenų apsikeitimo standartai,

nustatomos prioritetinės duomenų

semantinio struktūrizavimo sritys

(demografiniai, klinikiniai, laboratoriniai ir kiti

duomenys, skubiai medicinai būtini

duomenys, alergijos, vakcinacijos bei vėžio

prevencijos programos, lėtinių ligų

stebėsenos sistemos, ir kt.).

Parenkamos tarptautiniu mastu taikomos ir

palaikomos terminologijos (LOINC,

SNOMED CT ir kt), sukuriami ir pateikiami

diegimui atitinkami informaciniai modeliai

ESPBI ir SPĮ IS mainams, stebėsenos ir

sprendimų palaikymo sistemoms.

Išverčiamos trūkstamos LOINC, SNOMED

CT bei kitų terminijų sąvokos sukurtiems

informaciniams modeliams įgyvendinti.

Bus sukurtos prielaidos saugiam paciento

duomenų turinio perdavimui ir panaudojimui

nacionaliniu ir tarptautiniu mastu.

ESPBI kaupiami struktūruoti duomenys

užtikrins vienareikšmišką jų interpretaciją ir

efektyvų panaudojimą paciento sveikatinimo

reikmėms bei analitikai.

Tarptautinių terminologijų naudojimas

sumažins informacinių sistemų palaikymo

kaštus ir leis išvengti duomenų

interoperabilumo ir migravimo problemų

ateityje.

Aprašymas: Rezultatas:

Page 25: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Susiję uždaviniai:

6.1.1. patvirtinti tvarią nacionalinę e. sveikatos sistemos architektūrą,

visas e. sveikatos sistemos funkcijas vykdyti ir plėtoti nacionalinėje sveikatos

sistemoje;

6.2.2. patvirtinti minimalius naudojamų e. sveikatos sprendimų bei duomenų

mainų reikalavimus, kuriuos turi atitikti visos ASPĮ informacinės sistemos;

6.4.1. plėtoti sukurtus ir kurti naujus specializuotoms sveikatinimo veiklos

sritims skirtus funkcionalumus ESPBI IS bei EMI

6.4.9. plėtoti duomenų apsikeitimą su kitomis ES valstybėmis narėmis.

6.5.1. užtikrinti elektroninės analitikos įrankiams tinkamus e. sveikatos

duomenų standartus bei formatą.

Page 26: SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos Arvydas Laurinavičius Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija SAM, Vilnius

Prioritetinės duomenų semantinio

struktūrizavimo sritys

• Demografiniai - paciento identifikacija

• Klinikiniai – problem list (slauga, pirminė sveikatos priežiūra)

• Laboratoriniai testai

• Nulemia 80% sprendimų medicinoje

• Galimas bendradarbiavimas su Estijos ir „Nordic“ e-sveikata

• Skubi medicina (EPSOS)

• Alergenai, pašalinis vaistų poveikis

• Vakcinacijos valdymas (pvz., Centro poliklinika, Šveicarijos sistema)

• Vėžio prevencijos programos

• Gimdos kaklelio

• Krūties

• Storosios žarnos

• Prostatos

• Lėtinių ligų stebėsenos sistemos

• Kitos - pagal naudos ir kainos santykį