SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos...
Transcript of SNOMED CT LOINC - Lietuvos Respublikos sveikatos … 1 prie LP... · E-sveikatos terminologijos...
E-sveikatos terminologijos
Arvydas Laurinavičius
Sveikatos informatikos ir bioinformatikos asociacija
SAM, Vilnius 2017-09-11
INFORMACIJOS VALDYMAS
Institucijos, nacionaliniu ir tarptautiniu mastu
Semantinis interoperabilumas
Techninis interoperabilumas
Sveikatos IS standartai
Grupės
Klasifikacijos
Apsikeitimo formatai
EHR
Structured
Document
Data Group
Element
Folder
Element
Element Element
Element Element
Value Domain
Terminologies
& Codesets
Data Group Duomenų specifikacijos
Terminologijos
Informacijos standartai
TLK-10 Semantiniai: SNOMED CT
LOINC
AU DRG
Techniniai: HL7, CDA, LRA
Terminologijos
Klasifikacijos Grupės
Labai detalios
klinikinei medicinai
Vidutiniškai
detalios kliniškai prasmingaim
grupavimui ir skaičiavimui
Apytikslės
administravimui ir
finansavimui
.....trys skirtingi tikslai
SNOMED CT IR LOINC
TEISINĖ APLINKA LIETUVOJE
• SNOMED CT ir LOINC yra numatyti Sveikatos priežiūros įstaigų informacinių sistemų susiejimo su e. sveikatos paslaugų ir bendradarbiavimo infrastruktūra reikalavimuose ir techninėse sąlygose kaip duomenų mainų standartai (2012 m. birželio 7 d. Nr. V-509)
• SNOMED CT ir LOINC yra numatyti tarp rekomenduojamų IS standartų reikalavimuose sveikatos priežiūros įstaigose diegiamoms informacinėms sistemoms (2011 m. sausio 28 d. Nr. V-89).
SNOMED CT
Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms
• išsamiausia pasaulyje klinikinės terminologijos sistema
• apima visas šiuolaikinės medicinos sritis
• susieta su kitais tarptautiniais standartais
• leidžia elektroninėje ligos istorijoje saugiai aprašyti (sukoduoti)
klinikinius duomenis, reikalingus sveikatos priežiūrai užtikrinti
• Pirminis taikymas – klinikinė medicina (sprendimų palaikymas)
• Antrinis (secondary use) – analitika
• Tarptautinis duomenų interoperabilumas
• Palaikymo kaštus dalinasi daugelis šalių
SNOMED International:
30 šalių 2017 metais
http://www.snomed.org/members
350 tūkst sąvokų
19 hierarcijų
SNOMED CT LT
IHTSDO
Unsatisfactory Sample
PAP Test – Unsatisfactory Sample Rpt
LT
EN
Automatinis ir saugus (autorizuotas) vertimas į kitas ~12 kalbų
15
Valstybinė gimdos kaklelio vėžio prevencijos programa Sveidroje 13 skirtingų kainos kodų kiekvienai Bethesda kategorijai nuo 2014 m.
CT Ištyrimo rezultatas I CIKLAS II CIKLAS III CIKLAS IV CIKLAS
Netinkamas ištyrimui tepinėlis (1846) 16.618 12.056 11.576 10.126
Nėra intraepitelinių pakitimų ar piktybinio naviko (1847) 294.880 311.675 315.037 342.658
Atipinės nenustatytos reikšmės plokščiojo epitelio ląstelės (ASC-US 1848)
7.556 7.945 10.213 11.395
Atipinės plokščiojo epitelio ląstelės, gali būti žymūs plokščialąsteliniai intraepiteliniai pakitimai (ASC-H 1849)
1.448 1.499 1.680 1.838
Nežymūs plokščialąsteliniai intraepiteliniai pakitimai (LSIL 1850)
2.460 4.112 6.829 5.649
Žymūs plokščialąsteliniai intraepiteliniai pakitimai (HSIL 1851)
3.708 4.043 3.569 3.396
Plokščialąstelinė karcinoma (SCC 1852) 195 96 62 45
Atipinės nenustatytos reikšmės liaukinio epitelio ląstelės (AGUS 1853)
357 171 222 128
Atipinės liaukinės ląstelės, gali būti piktybinės (AGC 1854) 56 58 83 67
Adenokarcinoma in situ (AIS 1855) 5 5 6 9
Adenokarcinoma (AC 1856) 7 9 7 4
Nėra intraepitelinių pakitimų ar piktybinio naviko (endometriumo ląstelės, 40 metų ir vyresnių moterų) (EMP 1857)
128 150 128 123
Kita (1858) 1 4 4 2
Iš viso: 327.419 341.823 349.416 375.440
Tiksli citologijos tyrimų analitika
Bet...
Kolposkopija ?
Biopsijos ?
Gydymo efektas ?
Kvietimų valdymas ?
Stebėsena ?
~100 darbuotojų
TERMINOLOGY RESOURCES
SNOMED CT®
U.S. Extension to SNOMED CT
U.S. SNOMED CT Content Request System
NLM SNOMED CT Browser
IHTSDO SNOMED CT Concept Identifier Lookup Service
MAPS (SNOMED CT and ICD-9 or ICD-10 and their Clinical Modifications)
Medications - RxNorm
SNOMED CT® Subsets
CORE Problem List Subset of SNOMED CT
Route of Administration Subset of SNOMED CT
Kaiser Convergent Medical Terminology (CMT) Subsets
Nursing Problem List Subset of SNOMED CT
LOINC®
LOINC Common Laboratory Orders Value Set
LOINC Top 2000+ Lab Observations and Mappers' Guide
Newborn Screening Coding and Terminology Guide
Table of Example UCUM Codes for Electronic Messaging
Subsets for Test Panels & Assessment Forms
RxNorm Subsets
RxNorm Current Prescribable Content
Logical Observation Identifiers Names and Codes
loinc.org
regenstrief.org
LOINC - SNOMED CT
Cooperation Project Technology
Preview is available
http://www.snomed.org/news-
articles/loinc--snomed-ct-
cooperation-project-technology-
preview-is-available
Tyrimų „kodavimas“ Lietuvos E-sveikatoje?
Tyrimo ID Tyrimo pavadinimas
Ėminio
ID
Ėminio
kodas Ėminio pavadinimas
933 Gliukozės koncentracijos kraujyje nustatymas 3735 1 Bioptatas
934
Gliukozės koncentracijos serume/plazmoje, likvore
nustatymas 3737 3 Ejakuliatas
934
Gliukozės koncentracijos serume/plazmoje, likvore
nustatymas 3740 6
Kateterio, dreno
galiukas
934
Gliukozės koncentracijos serume/plazmoje, likvore
nustatymas 3742 8 Kraujas
„Nacionaliniai“, iš esmės, lokalūs kodai
LOINC klasifikatorius: Gliukozės koncentracija
LOINC
kodas Ilgas pavadinimas Lietuviškas pavadinimas
Vienet
ai
39480-9 Glucose [Moles/volume] in Venous blood Gliukozės koncentracija veniniame kraujyje mmol/L
39481-7 Glucose [Moles/volume] in Arterial blood Gliukozės koncentracija arteriniame kraujyje mmol/L
51596-5 Glucose [Moles/volume] in Capillary blood Gliukozės koncentracija kapiliariniame kraujyje mmol/L
14743-9
Glucose [Moles/volume] in Capillary blood by
Glucometer
Gliukozės koncentracija kapiliariniame kraujyje
matuojant gliukometru mmol/L
15076-3 Glucose [Moles/volume] in Urine Glucose Gliukozės koncentracija šlapime mmol/L
14748-8 Glucose [Moles/volume] in Peritoneal fluid Gliukozės koncentracija pilvaplėvės skystyje mmol/L
14749-6 Glucose [Moles/volume] in Serum or Plasma Gliukozės koncentracija serume ar plazmoje mmol/L
14996-3
Glucose [Moles/volume] in Serum or Plasma --pre
75 g glucose PO
Gliukozės koncentracija serume ar plazmoje - prieš
75 g gliukozės testą mmol/L
14995-5
Glucose [Moles/volume] in Serum or Plasma --2
hours post 75 g glucose PO
Gliukozės koncentracija serume ar plazmoje - 2 val.
po 75 g gliukozės testo mmol/L
Tyrimo aprašas pagal LOINC:
Gliukozės koncentracija veniniame kraujyje 39480-9
Component Glucose Related Names
v2.05
Bld ven; Bld venous; Blood - venous; Blood ven; Blood
venus; Chemistry; Glu; Gluc; Glucoseur; Level; Point in
time; QNT; Quan; Quant; Quantitative; Random;
Substance concentration; Venous
Property SCnc Short Name Glucose BldV-sCnc
Time Aspect Pt Order OBS Both
System BldV Example Units mmol/L
Scale Type Qn Long Common
Name Glucose [Moles/volume] in Venous blood
Class CHEM Example UCUM
Units mmol/L
VersionLastCh
anged 2,34
Common Test
Rank 0
Change Type MIN Common Order
Rank 0
Status ACTIVE Common SI Test
Rank 0
Class Type 1
Units Required N
Submitted
Units mmol/L
Priemonė: Paciento sveikatos duomenų semantinis
struktūrizavimas tarptautinių medicininių terminologijų pagrindu,
sukuriant duomenų apsikeitimo informacinius modelius.
Įvertinami įdiegti SPĮ IS ir ESPBI IS
duomenų apsikeitimo standartai,
nustatomos prioritetinės duomenų
semantinio struktūrizavimo sritys
(demografiniai, klinikiniai, laboratoriniai ir kiti
duomenys, skubiai medicinai būtini
duomenys, alergijos, vakcinacijos bei vėžio
prevencijos programos, lėtinių ligų
stebėsenos sistemos, ir kt.).
Parenkamos tarptautiniu mastu taikomos ir
palaikomos terminologijos (LOINC,
SNOMED CT ir kt), sukuriami ir pateikiami
diegimui atitinkami informaciniai modeliai
ESPBI ir SPĮ IS mainams, stebėsenos ir
sprendimų palaikymo sistemoms.
Išverčiamos trūkstamos LOINC, SNOMED
CT bei kitų terminijų sąvokos sukurtiems
informaciniams modeliams įgyvendinti.
Bus sukurtos prielaidos saugiam paciento
duomenų turinio perdavimui ir panaudojimui
nacionaliniu ir tarptautiniu mastu.
ESPBI kaupiami struktūruoti duomenys
užtikrins vienareikšmišką jų interpretaciją ir
efektyvų panaudojimą paciento sveikatinimo
reikmėms bei analitikai.
Tarptautinių terminologijų naudojimas
sumažins informacinių sistemų palaikymo
kaštus ir leis išvengti duomenų
interoperabilumo ir migravimo problemų
ateityje.
Aprašymas: Rezultatas:
Susiję uždaviniai:
6.1.1. patvirtinti tvarią nacionalinę e. sveikatos sistemos architektūrą,
visas e. sveikatos sistemos funkcijas vykdyti ir plėtoti nacionalinėje sveikatos
sistemoje;
6.2.2. patvirtinti minimalius naudojamų e. sveikatos sprendimų bei duomenų
mainų reikalavimus, kuriuos turi atitikti visos ASPĮ informacinės sistemos;
6.4.1. plėtoti sukurtus ir kurti naujus specializuotoms sveikatinimo veiklos
sritims skirtus funkcionalumus ESPBI IS bei EMI
6.4.9. plėtoti duomenų apsikeitimą su kitomis ES valstybėmis narėmis.
6.5.1. užtikrinti elektroninės analitikos įrankiams tinkamus e. sveikatos
duomenų standartus bei formatą.
Prioritetinės duomenų semantinio
struktūrizavimo sritys
• Demografiniai - paciento identifikacija
• Klinikiniai – problem list (slauga, pirminė sveikatos priežiūra)
• Laboratoriniai testai
• Nulemia 80% sprendimų medicinoje
• Galimas bendradarbiavimas su Estijos ir „Nordic“ e-sveikata
• Skubi medicina (EPSOS)
• Alergenai, pašalinis vaistų poveikis
• Vakcinacijos valdymas (pvz., Centro poliklinika, Šveicarijos sistema)
• Vėžio prevencijos programos
• Gimdos kaklelio
• Krūties
• Storosios žarnos
• Prostatos
• Lėtinių ligų stebėsenos sistemos
• Kitos - pagal naudos ir kainos santykį