[Seleccione la fecha] - biomakers.net · 2015 ESTUDIOS MOLECULARES-1- ... RET Recomendado...
Transcript of [Seleccione la fecha] - biomakers.net · 2015 ESTUDIOS MOLECULARES-1- ... RET Recomendado...
-1-
BIOMAKERS es una Institución especializada en estudios genéticos y moleculares para el cáncer y otras enfermedades complejas de la
Argentina y Latinoamérica. Nuestro equipo de profesionales posee una amplia trayectoria en el ámbito científico, médico y de investigación
clínica, características que nos permiten brindar tanto al médico como al paciente un servicio integral de diagnóstico y asesoría molecular.
Desde los inicios, BIOMAKERS mantiene y promueve un compromiso con la Investigación & Desarrollo que se plasma en la búsqueda
sistemática de metodologías de nueva generación para la determinación de nuevos biomarcadores.
BIOMAKERS sienta sus bases como Institución sobre los valores de:
Calidad
Credibilidad
Rigor Científico
Profesionalidad
-2-
ÍNDICE
I. BIOMARCADORES ASOCIADOS A DISTINTAS PATOLOGÍAS 3
a. Biomarcadores en Cáncer de Pulmón 4
b. Biomarcadores en Cáncer Colorrectal 5
c. Biomarcadores en Cáncer de Mama 6
d. Biomarcadores en Cáncer de Tiroides 6
e. Biomarcadores en Melanoma 7
f. Biomarcadores en Tumores del Sistema Nervioso Central (SNC) 7
g. Biomarcadores en Leucemia Mieloide Aguda (LMA) 8
h. Biomarcadores en Leucemia Mieloide Crónica (LMC) 8
i. Biomarcadores en Tumores del Estroma Gastrointestinal (GIST) 9
II. BIOMARCADORES ASOCIADOS A ENFERMEDADES HEREDITARIAS 10
a. Biomarcadores de Cáncer de Mama y Ovario Hereditario (CMOH) 11
b. Biomarcadores en Poliposis Adenomatosa Familiar (PAF) 12
c. Biomarcadores en Síndrome de Lynch (HNPCC) 12
d. Biomarcadores en Neoplasia Endócrina Múltiple (MEN) 12
e. Biomarcadores en Cáncer Gástrico Difuso 13
f. Biomarcadores en Síndrome de Cowden 13
g. Biomarcadores en Alzhéimer 13
h. Paneles en Síndrome de Li-Fraumeni 13
III. PANELES DE BIOMARCADORES 14
IV. BIOMARCADORES ASOCIADOS A TOXICIDAD A DROGAS 16
-4-
Biomarcadores en Cáncer de Pulmón
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
EGFR De rutina Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores de Tirosina
quinasa (TKI; Afatinib, Gefitinib, Erlotinib) S. Sanger PlEGsa
EML4-ALK De rutina Predictivo Rearreglos Sensibilidad a inhibidores de ALK
(Crizotinib, Ceritinib)
FISH PlEMALfh
IHQ PlEMALih
BRAF Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores de BRAF
(Vemurafenib, Dabrafenib)
S. Sanger PlBRsa
qPCR PlBRqp
Fusiones de RET Recomendado Predictivo Rearreglos
Sensibilidad a inhibidores multidiana
tirosina quinasa
(Vandetanib, Sunitinib, Sorafenib)
FISH PlFRETfh
HER2 Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a TKI de segunda generación
(Afatinib) S. Sanger PlHR2sa
ROS-1 Recomendado Predictivo Rearreglos Sensibilidad a inhibidores de ALK
(Crizotinib)
IHQ PlRSih
FISH PlRSfh
cKit Recomendado Predictivo Mutaciones
Sensibilidad a inhibidores multidiana
tirosina quinasa
(Imatinib, Sunitinib, Sorafenib y Nilotinib)
S. Sanger PlCKsa
KRAS Recomendado Pronostico
Predictivo Mutaciones
Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab) y
Pronóstico de enfermedad
S. Sanger PlKRsa
PI3KCA En Investigación Predictivo Mutaciones Resistencia a TKI y anticuerpos anti EGFR S. Sanger PlPIsa
MET En Investigación Predictivo Amplificación Sensibilidad a inhibidores de MET y
resistencia a TKI FISH PlMTfh
DDR2 En Investigación Predictivo Mutaciones Sensibilidad a tirosina quinasas BCR/ABL,
SRC, c-Kit, varias quinasas Eph (Dasatinib) S. Sanger PlDDsa
PD-L1 En Investigación Predictivo Sobreexpresión Sensibilidad a anti-PDL1 y anti-PD1 IHQ PlPDih
PTEN En Investigación Predictivo Sobreexpresión Resistencia a anticuerpos anti-EGFR IHQ PlPTih
-5-
Biomarcadores en Cáncer Colorrectal
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
KRAS De rutina Predictivo Mutaciones Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab)
S. Sanger CcKRsa
qPCR CcKRqp
NRAS De rutina Predictivo Mutaciones Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab)
S. Sanger CcNRsa
qPCR CcNRqp
EGFR De rutina Expresión Expresión Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab) IHQ CcEGih
BRAF Recomendado Predictivo
Pronóstico Mutaciones
Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab). Pronóstico de
enfermedad
S. Sanger CcBRsa
qPCR CcBRqp
MSI Recomendado Diagnóstico Inestabilidad
Microsatelital Diagnóstico de enfermedad Genotipificación CcMSIgn
PI3KCA En Investigación Predictivo Mutaciones
Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab) y
Pronóstico de enfermedad
S. Sanger CcPKsa
qPCR CcPKqp
PTEN En Investigación Predictivo Amplificación Sensibilidad a anticuerpos anti-EGFR
(Cetuximab, Panitumumab) IHQ CcPTih
-6-
Biomarcadores en Cáncer de Mama
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
BRCA1 y BRCA2 De rutina Predictivo Mutaciones somáticas
Sensibilidad a inhibidor de PARP (Olaparib)
NGS MoBA12ng
HER2 De rutina Predictivo Pronóstico
Amplificación Sensibilidad a anticuerpo anti-HER2 IHQ MoHR2fh
FISH MoHR2fh
Receptor de Estrógeno
De rutina Predictivo Pronóstico
Expresión Sensibilidad a terapia hormonal IHQ MoREih
Receptor de Progesterona
De rutina Predictivo Pronóstico
Expresión Sensibilidad a terapia hormonal IHQ MoRPih
Ki-67 De rutina Pronóstico Expresión Marcador de proliferación celular IHQ MoK67ih
p16 De rutina Pronóstico Expresión Diagnóstico de lesiones pre-cancerosas en el TGI
IHQ MoP16ih
Biomarcadores en Cáncer de Tiroides
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
BRAF Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar S. Sanger TrBRsa
qPCR TrBRqp
KRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrKRsa
HRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrHRsa
NRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrNRsa
RET Recomendado Diagnóstico Rearreglos Carcinoma papilar FISH TrRTfh
PAX8 Recomendado Diagnóstico Rearreglos Carcinoma folicular FISH TrPX8fh
RET Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma medular de tiroides S. Sanger TrMRETsa
-7-
Biomarcadores en Melanoma
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
BRAF De rutina Predictivo Mutaciones Inhibidores de BRAF e Inhibiddores de MEK
S. Sanger MlBRsa
qPCR MlBRqp
cKIT Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores Inhibidor multidiana tirosina quinasa (Imatinib, Sunitinib, Sorafenib y Nilotinib)
S. Sanger MlCKsa
NRAS En investigación Predictivo Mutaciones Sensibilidad a la combinación Sorafenib-Tivantinib
S. Sanger MlNRsa
Biomarcadores en Tumores del Sistema Nervioso Central (SNC)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
1p19q De rutina Diagnóstico Rearreglos Diagnóstico de oligodendrogliomas FISH Sn1p19qfh
IDH1/2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones Diagnóstico de gliomas grado II y III y en GBMs secundarios
S. Sanger SnIDsa
MGMT Recomendado Predictivo Metilación promotor Respuesta a los agentes alquilantes Metilación / S. Sanger SnMGmtsa
10q23 En investigación Diagnóstico Deleción Diagnóstico de glioblastomas FISH Sn10q23fh
-8-
Biomarcadores en Leucemia Mieloide Aguda (LMA)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
AML1/ETO De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qPCR LmaAMqp
BCR-ABL1 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable qPCR LmaABqp
CBFB/MYH11 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qPCR LmaCMqp
CBFB/MYH11 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable FISH LmaCMfh
CEPBA De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaSEPsa
cKIT De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaCKsa
20q De rutina Pronóstico Deleción Factor de pronóstico favorable FISH Lma20qfh
-5, 5q-, -7, 7q- De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable FISH Lma5q7q
11q23 -non t(9;11)
De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable FISH Lma11q23fh
FLT3 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico desfavorable S. Sanger LmaFLsa
NPM1 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaNPMsa
PML/RARA De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qPCR LmaLqp
IDH1/2 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaIDsa
Biomarcadores en Leucemia Mieloide Crónica (LMC)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
BCR-ABL1 De rutina Diagnóstico Predictivo
Rearreglos Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)
qPCR LmcAB922qp
BCR-ABL1 De rutina Diagnóstico Predictivo
Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Dasatinib, Nilotinib y Bosutinib)
qPCR LmcABqp
-9-
Biomarcadores en Tumores del Estroma Gastrointestinal (GIST)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID
cKIT Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)
S. Sanger GiCKsa
PDGFR-α Recomendado Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)
S. Sanger GiPGsa
BRAF Recomendado Pronóstico y Predictivo
Mutaciones
Alto riesgo de malignidad. Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib)
S. Sanger GiBRsa
-11-
Biomarcadores de Cáncer de Mama y Ovario Hereditario (CMOH)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID
BRCA1 y BRCA2 De rutina Diagnóstico Mutaciones NGS MhBA12ng
Paneles de biomarcadores Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID
Panel de mutaciones Judío Ashkenazí
De rutina Diagnóstico Mutaciones Fundadoras: BRCA1 185delAG y 5382insC BRCA 2: 6174delT
S. Sanger
MhPJAsa
Panel de Cáncer de Mama En investigación Diagnóstico
ACVR1B EP300 IRAK4 PBRM1 TP53 AKT1 ERBB2 ITCH PCGF2 TRAF5 ATM ERBB3 KMT2C PIK3CA WEE1 BAP1 ESR1 MAP2K4 PIK3R1 ZBED4 BRCA1 EXOC2 MAP3K1 PPM1L BRCA2 EXT2 MDM2 PTEN CBFB FBXO32 MUC16 PTGFR CDH1 FGFR1 MYC RB1 CDKN2A FGFR2 NCOR1 RET EGFR GATA3 NEK2 SEPT9
NGS
PtPCMng
-12-
Biomarcadores en Poliposis Adenomatosa Familiar (PAF)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID
APC De rutina Diagnóstico Mutaciones S. Sanger PafAPCsa
MYH De rutina Diagnóstico Mutaciones S. Sanger PafMYHsa
Biomarcadores en Síndrome de Lynch (HNPCC)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID
MLH1 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynL1ih
MSH6 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LyS6ih
MSH2 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynS2ih
PMS2 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynPM2ih
Inestabilidad Microsatelital (MSI) Recomendado Diagnóstico Alteración en Microsatélites Genotipificación LynMSIgn
Mutaciones MSH2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynS2sa
Mutaciones MLH1 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynL1sa
Mutaciones MSH6 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynS6sa
Mutaciones PMS2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynPM2sa
Biomarcadores en Neoplasia Endócrina Múltiple (MEN)
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID
RET Recomendado Diagnóstico Polimorfismos S. Sanger AzAE2qp
-13-
Biomarcadores en Cáncer Gástrico Difuso
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID
CDH1 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger GdCDH1sa
Biomarcadores en Síndrome de Cowden
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID
PTEN Recomendado Diagnóstico Mutaciones germinales S. Sanger GdCDH1sa
Biomarcadores en Alzhéimer
Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID
APOE e2 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qPCR AzAE2qp
APOE e3 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qPCR AzAE3qp
APOE e4 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qPCR AzAE4qp
Proteína precursora amiloide (APP), presenilina-1 (PS1) y presenilina-2 (PS-2)
Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger AzAPSsa
Paneles en Síndrome de Li-Fraumeni
Panel Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID
Panel Tp53 Recomendado Diagnóstico Tp53 NGS PtPTP53ng
-15-
Paneles de Biomarcadores
Panel Evidencia Tipo Alteración Molecular Enfermedad Asociada Test ID
Panel Pulmón (22 genes)
Recomendado Predictivo
Mutaciones en KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2
Pronóstico de enfermedad en Cáncer de Pulmón
PlPPng
Panel de Cáncer Colorrectal (22 genes)
Recomendado Predictivo
Mutaciones en KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2
Pronóstico de enfermedad en CCR
CcPCng
Panel Tp53 Recomendado Diagnóstico Tp53 Li-Fraumeni PtPTP53ng
Panel Cáncer de Mama En investigación Diagnóstico
ACVR1B EP300 IRAK4 PBRM1 TP53 AKT1 ERBB2 ITCH PCGF2 TRAF5 ATM ERBB3 KMT2C PIK3CA WEE1 BAP1 ESR1 MAP2K4 PIK3R1 ZBED4 BRCA1 EXOC2 MAP3K1 PPM1L BRCA2 EXT2 MDM2 PTEN CBFB FBXO32 MUC16 PTGFR CDH1 FGFR1 MYC RB1 CDKN2A FGFR2 NCOR1 RET EGFR GATA3 NEK2 SEPT9
Clasificación del tumor en cáncer de mama
PtPCMng
Panel de enfermedades hereditarias-328 genes asociados a 700 enfermedades hereditarias
En investigación Diagnóstico Consultar en el siguiente link: https://goo.gl/jADVk9
Diagnóstico de enfermedades hereditarias
PtPEHng
-17-
Biomarcadores asociados a Toxicidad a Drogas
Biomarcador
Evidencia Tipo Alteración Molecular Sensibilidad a Droga Metodología* Test ID
DPYD Recomendado Predictivo Polimorfimos 5FU S. Sanger TxDPYD
TYMS Recomendado Predictivo Polimorfimos 5' UTR 5FU S. Sanger TxTYMS5
TYMS Recomendado Predictivo Polimorfimos 3' UTR Metrotexato qPCR TxTYMS3
UGT1A1 Recomendado Predictivo Polimorfimos *28A Irinotecan S. Sanger TxUGT1A1
MTHFR Recomendado Predictivo Polimorfimos Metrotexato S. Sanger TxMTHFR
ERCC1 En investigación Predictivo Expresión Cisplatinos IHQ TxERCC1
RRM1 En investigación Predictivo Expresión Gemcitabina IHQ TxRRM1
-18-
La clasificación de los estudios moleculares disponibles actualmente ha sido supervisada por el equipo de especialistas de BIOMAKERS. Las
recomendaciones aquí presentes no pretenden sustituir a las directrices de consensos de sociedades médicas o de las guías de tratamiento
oncológico vigentes en la actualidad.
* Metodología de Análisis:
FISH: Hibridación in situ de fluorescencia
IHQ: Inmunohistoquímica
NGS: Next-Generation Sequencing
qPCR: Real Time PCR
S. Sanger: Secuenciación Sanger