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Revista sobre microbiología clínica del blog Reciencia.

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ç¿Qué artículos puedes encontrar?

1.Microbiota normal y principios del microbioma ………… pag. 2

2.Homeopatía y dolor testicular. ………………………………….. pag. 4

3.Silenciamiento génico postranscripcional. Defensa antiviral y

contradefensa................................................................................ Pag. 5

4.Historia, evolución y efectos beneficiosos de la rifampicina

…………………………………………………………………………………………pag. 7

5.Experimentación animal ………………………………………………pag. 9

6.Transferencia génica bacteria-eucariota ……………………. pag. 10

Apuntes:

7.Sistemas de Secreción bacteriana tipo I (SST1) …...…….. pag. 11

8.Sistemas de Secrecion Tipo 3 (SST3) …………………………... psg. 12

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1.Microbiota normal y principios del Microbioma La microbiota normal son todos aquellos microorganismos que viven en estrecha asociación y de forma "permanente" sobre nuestras superficies, alcanza su madurez a las dos semanas de nuestro nacimiento y permanece constante en individuos sanos.

Forma parte de nosotros y nunca se le ha dado la importancia que merece, no se puede afirmar que sea como una huella digital de cada uno de nosotros porque puede presentar fluctuaciones con tratamiento con antibióticos o cuando sufrimos alguna infección. Pasteur patinó al afirmar que la microbiota es esencial para la vida, no lo es, pero cabe destacar que organismos Axénicos (sin microorganismos) como cuando aislamos a un ave al salir del huevo en el momento de exposición con patógenos son más sensibles a la infección. De la misma manera que erró Pasteur también lo hizo Metchnikof al afirmar que eran perjudiciales para la salud. La microbiota está en una relación simbiótica de forma que consigue nutrientes y habitats adecuados para vivir a la vez que nos proporciona ayuda en la digestión, producción de vitaminas como la vitamina k y nos protegen de la

colonización de otros microorganismos potencialmente patógenos mediante un fenómeno denominado Antagonismo microbiano y que trataremos más adelante. La microbiota es Beneficiosa para la salud... Sí pero hay que tener cuidado con esta afirmación: Mayor desarrollo del sistema inmune

Mayor número de anticuerpos

Producción de vitaminas K y D en mamíferos....

De esta forma y habiendo contestado casi todos de manera muy acertada, en ausencia de microbiota y en exposición a agentes patógenos debido a la debilidad sel sistema inmune corre mayores riesgos de enfermar y de que los síntomas sean más severos. La localización de la microbiota no es al azar, existen lugares definidos para su establecimiento que serían: Piel compuesto por la flora residente y transeunte, esta última se elimina por la higiene por carecer de mecanismos tan especializados de adhesión y normalmente son organismos oportunistas o patógenos. Los residentes mas abundantes son Gram posisivos como Sthaphylococcus, Streptococcus y Corinebacterium.

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Cavidad Oral siendo abundante los streptococos (Ej: S. mutans = productor de caries), disminuyen con el cepillado o uso de colutorios pero persisten en nuestra boca.

Tracto gastrointestinal, formada en un 99% por microorganismos anaerobios como Bacteroides y fusobacterium. Ausente en el estómago debido al pH ácido. El lugar por excelencia es el intestino grueso (Cálido, húmedo y sin mecanismos mecánicos de defensa), presenta enterobacterias como Escherichia coli y tambien Lactobacillus y Bifidubacterium en mayor proporción durante etapas lactantes.

Vías respiratorias, son abundantes los mismos tipos de microbiota que en las superficies externas y por eso en el test la respuesta correcta seria o bien Neisseria o Pseudomonas,ya que las menos abundantes son las bacterias gram negativas. Si somos estrictos y nos fiamos de wikipedia seríaPseudomonas aeruginosa la que está presente en menor cantidad.

Tracto genito-urinario, por ejemplo Lactobacillus durante las etapas estrogénicas (En la mujer), la levadura Candida albicans y Staphylococcus en la superficie.

No solo hay que respetar estas localizaciones sino que también un microorganismo común e inocuo en cierta zona puede ser patógeno en otra. Este es el caso de Pseudomonas aeruginosa en los alveolos donde es causante de

neumonías y agravan la fibrosis quística. Existen mecanismos que dificultan la supervivencia, colonización y adhesión de microorganismos que debo mentar y de ahí viene la pregunta de abajo.

Tanto en el tracto urinario, concretamente en la uretra y en la conjuntiva del ojo existe una corriente de fluidos que no permiten la adhesión de microorganismos pero además en esta última existen junto con la saliva en la boca Lisozimas que destruyen a las bacterias. Las vías respiratorias presentan el sistema mucociliar, que atrapa a las bacterias en el moco (que también presenta lisozimas) y son llevadas mediante el movimiento de los cilios hasta la laringe para impedir la colonización de los pulmones. Por último y para mi el sistema más curioso se presenta en el intestino delgado y son los Movimientos peristálticos que no solo van a permitir el tránsito de la digestión sino y no menos importante la adhesión de microorganismos a las paredes del tubo. Como lo prometido es deuda, ahora me toca hablar del antagonismo microbiano y para entenderlo mejor teneis un post con un experimento de laboratorio. En las preguntas de las encuesta os formulé la siguiente: ¿cómo se denomina el fenómeno por el que las bacterias de nuestra microbiota inhiben el crecimiento de

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otras? Pues bien, la respuesta correcta debería haber sido A. microbiano pero debo decir que todos los que habéis respondido competencia, exclusión competitiva o similares os lo doy por bueno ya

que es básicamente lo que sucede. Los microorganismos residentes van a cambiar las propiedades fisico-quimícas de los lugares donde se encuentra para impedir la colonización por otros microorganismos. A su vez no tengo del todo claro que hacer con la respuesta "Antibióticos" ya que actúan en muchos procesos de defensa más que en el antagonismo microbiano propiamente dicho. De esta manera si sería correcto haber puesto Bacteriocinas, suelen ser producidas por especies no patogénicas que colonizan el cuerpo humano con el fin de inhibir el

crecimiento de bacterias similares o de cepas cercanas. Con la siguiente pregunta llegamos al final de la explicación de la microbiota y para ello me gustaría introduciros el térmico "microbioma".

De acuerdo con lo que se sabe hasta hoy día, en nuestro cuerpo presentamos 10 veces más bacterias que células eucariotas o propias de forma que tenemos mas de 10.000 especies que suponen 100 veces mas genes bacterianos que genes humanos. Al total de bacterias y genes de nuestra microbiota es a lo que se denomina MICROBIOMA. Teniendo en cuenta estos datos somos bacterias en un 90-99% de forma que podemos señalar la importancia de estos genes en la vida y salud humana.

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2.Homeopatía y dolor testicular.

La homeopatía es la "ciencia" (me duele hasta entre comillas) o como llaman otros "medicina tradicional" basada en preparados altamente diluidos de la sustancia causante de la dolencia con la finalidad de mejorar el estado vital del cuerpo, cuya premisa viene a ser algo así como "lo similar se cura con lo similar", ¿Qué tiene que ver esto con el dolor testicular? no os preocupéis que la espera tiene su recompensa... Diluciones progresivas de una sustancia acompañadas como no de sus respectivas sacudidas al frasco (Lo que para cualquier persona de laboratorio sería resuspender, pipetear o usar el vortex) consiguen un líquido milagroso llamado "agua" para cualquier entendido, pero que para estos homeópatas y creyentes es "mano de santo". Se han realizado diversos estudios que afirman que no se han encontrado resultados mejores que los obtenidos con tratamientos con placebos. Agua con agua y aún así cada vez mas personas se abrazan a estas creencias no mas lejanas que la alquimia o el Sana sana culito de rana. Es preocupante que cierto tipo de persona reniegue de la medicina, del conocimiento, siempre y cuando sólo les repercuta a ellos pero no es así. El paso del tiempo, generación tras generación, una nueva corriente o nueva religión como se han atrevido algunos a llamarlo ensombrecen a la ciencia. Se atreven a comparar estos métodos con las Vacunas porque

claro, llevan pequeñas dosis o fragmentos del virus o la bacteria aunque después los ves haciendo otras barbaridades como beber de agua mezclada con agua marina diciendo que es bueno porque venimos del mar... "Cuando un tonto coge un camino, se acaba el camino y el tonto sigue" como diría mi madre. ¿Habeis empezado a sentir dolor testicular? bueno, os dejo una imagencita con vacunas REALES que principalmente se diferencian

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con el budú homeopático en que hay investigadores detrás, que los han realizado después de estudiar concienzudamente al organismo causante de la enfermedad, la interacción con el huesped y los efectos que causan como consecuencia de la infección mientras que el agüilla milagrosa es vendida por charlatanes. Sin apenas buscar mucho en internet una de las primeras sugerencias al poner tratamientos homeopáticos ha sido "laboratorios Boiron" con una presentación muy distinta a un curandero loco como podeis ver en la siguiente imagen

. Aseguran que los efectos adversos de este tipo de fármacos es inexistente (Aunque no lo dudo, no me imagino a nadie alérgico al agua ni tampoco a sustancias tan diluidas en las que Avogadro aun estaría buscando un mol cual aguja en un pajar).

Cada vez mas gente cree en estos cuentos pero el verdadero problema son las subvenciones y publicidad que estan recibiendo de instituciones tales como universidades y otros organismos pro-ciencia además de la permisividad social por dejarlos llamarse "centros médicos de homeopatía y acupuntura", por ejemplo. Yo no se como os sentará a vosotros pero si en algo me puedo parecer a vosotros entendereis el titulo de post que no deja de ser una mera opinión personal. Si buscais información mas profesional entrad en el blog de JM Mulet : "Los productos naturales ¡Valla Timo!

3.SILENCIAMIENTO GÉNICO POSTRANSCRIPCIONAL. DEFENSA ANTIVIRAL Y CONTRADEFENSA. La mayoría de virus son capaces de inducir mecanismos de PTGS debido a la producción de intermediarios de RNAdc durante la replicación viral. Esto los hace susceptibles de activar la maquinaria silenciadora y por tanto acaba degradándose el RNA. A este proceso se le conoce comoSilenciamiento inducido por virus.

Los ViGS pueden afectar tanto a transgenes virales, no virales e incluso genes endógenos siempre y cuando exista una alta homología de secuencia. El ViGs es capaz de reducir notablemente la acumulación del

propio virus, proceso que se conoce como Recuperación, de manera que en plantas trangénicas con transgenes homólogos a algún gen viral se observa como la planta es inicialmente susceptible al virus pero el aumento de RNA viral en el citoplasma procedente de la

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replicación del virus desencadena los procesos de silenciamiento, funcionando como un amplificador del silenciamiento el transgen viral que también se va acumulando en el citoplasma. En algunos casos se ven procesos de recuperación sin existir transgenes homólogos en la planta debido a que los PTGS son mecanismo de defensa natural ante virus.

SUPRESION DE PTGS POR PROTEINAS VIRALES (CONTRADEFENSA)

Existen virus con capacidad supresora de PTGS. Muchos de los genes virales implicados en la contradefensa habían sido indentificados cono factores de patogenecidad necesarios para una correcta acumulación y expansión del virus en la planta. La supresión de los PTGS por tanto es fundamental para que se desarrolle la infección viral. Se han descubierto virus con actividad supresora tanto en plantas como animales, presentan proteínas que difieren en estructura, localización celular e incluso mecanismos de actuación por lo que conforman un claro caso de convergencia evolutiva corroborando la necesidad de los virus de interferir con el PTGS para producir la enfermedad. Los

principales procesos que se ven afectados son: - Silenciamiento local: supresión del silenciamiento en la célula infectada. - Silenciamiento Sistémico: Interfieren con el movimiento de la señal silenciadora por la planta. - Interferencia con miRNA: implicados en el desarrollo y diferenciación que generan síntomas similares a plantas con la proteína Dicer mutada. HC-Pro de potyvirus Se demostró su capacidad supresora de silenciamiento mediante el cruce de un virus HC-Pro:GUS con plantas portadoras del transgen gus de forma que se revirtieron los efectos del silenciamiento. Esta proteína es capaz de suprimir silenciamiento inducido por virus cuando se expresa en la celula infectada de igual forma que suprime el PTGS en plantas portadoras de un transgen vírico incluso si ya esta establecido. Presenta actividad sinérgica de forma que la presencia de la proteína favorece la expresión de otros virus. Interfiere con metilaciones en el DNA impidiendo silenciamiento transcripcional pero además inhibe los efectos de miRNA y siRNA que aunque se están sintetizando de manera normal no se pueden procesar de forma normal el RNAdc dando a pensar que afecta a la funcionalidad de la proteína Dicer. No se sabe muy bien si afecta al silenciamiento sistémico o no ya que se observan casos en los que en infecciones normales no ocurre mientras que en infiltraciones de HC-Pro mediante A. tumefaciens se inhibe dicho silenciamiento

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sistémico. Lo que deja que pensar en que se puede producir debido a la cantidad relativa de HC-Pro que

es mucho mayor en el caso de la clonación o a la propia interacción con A. tumefaciens.

Otras proteínas supresoras de PTGS

4.Historia, Evolución y Efectos beneficiosos de la Rifampicina

Si tuviera que centrarme en un solo siglo de la historia de la microbiología no lo dudaría jamás. El nacimiento de lo invisible, esa pequeña gota que hace que hoy en día las ciencias biomédicas burbujeen y que miles de investigadores se levanten por la mañana deseando cambiar el mundo, el siglo XIX.

En 1653 van Leeuwenhoek introdujo mejoras en la fabricación del microscopio y constato la existencia bacteriana en 1683 dando lugar al nacimiento de la microbiología. No fue hasta 1796 cuando Eduard Jenner descubriera la primera vacuna (Para la Viruela), dejó como relevo a su discípulo Louis Pasteur que tras idear el método de la pasteurización hizo posible mantener los alimentos y asegurar

el material para intervenciones quirúrgicas. No es hasta 1882 cuando Robert Koch vislumbra al mundo con el nacimiento de las enfermedades. infecciosas,

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los Postulados de Koch y el descubrimiento del bacilo de Koch (Mycobacterium tuberculosis) y posteriormente el bacilo del Cólera concluyendo así la primera edad de oro de la microbiología. Actualmente el llamado bacilo de Koch sigue infectando a 1/3 de la población mundial y sumado al aumento de las resistencias a antibioticos como en el Gram positivo Staphylococcus aureus o el Gram Negativo Acinetobacter baumannii, en especial este último, siguen preocupando y manteniendo ocupados a la comunidad científica. La tendencia es adoptar nuevas medidas terapeúticas como reutilizar la colistina, ya casi olvidada o combinaciones antibióticas como en el caso que quiero comentar: Rifampicina + imipenem o sulbactan.

Rifampicina + colistina.

La Rifampicina es un macrólido efectivo en el tratamiento contra la tuberculosis, su mecanismo de acción se basa en bloquear la subunidad beta de la RNA-polimerasa inhibiéndola, impidiendo la síntesis de RNA y por ende de las proteinas. Últimas investigaciones han demostrado que la actividad de la rifampicina regula la respuesta inmune a nivel de:

Migración de linfocitos

Producción de citoquinas y óxido nítrico

Presentación de antígenos

Fagocitosis

Además de los beneficios inmunológicos se ha demostrado un Efecto protector ante enfermedades neurodegenerativas como es el caso de Alzheimer y Parkinson.

En humanos consigue activar receptores de glucocorticoides e inhibe a Prostaglandinas (PGE2), ácido araquidónico (AA) y al factor de necrosis tumoral (TNF-α) consiguiendo Inhibir la muerte celular. Los efectos citoprotectores han sido demostrados en infecciones de tuberculosis y meningitis de forma que Mycobacterium tuberculosis induce la apoptosis mientras que la rifampicina reduce los niveles de FNT inhibiéndola. Como conclusión podemos decir que Los efectos beneficiosos en el uso de la Rifampicina son: Protección ante la muerte celular inducida por enfermedades infecciosas y neurodegenerativas y protección ante metabolitos toxicos derivados de una infección. Aunque hilar el tema es algo complicado, quiero que entendais que gracias a los avances conseguidos en el siglo XIX hoy día sabemos a que nos enfrentamos y cómo combatirlos pero la constante coevolución de las enfermedades infecciosas consiguen mantenernos aún ocupados e investigando nuevos tratamientos antimicrobianos como los anteriores nombrados, que además derivan en hallazgos como los efectos beneficiosos que estaban ocultos en metodos antes utilizados.

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5.Experimentación animal Disfruto de la compañía de cualquier animal, cuando digo cualquiera no me refiero a animales domésticos como perros y gatos sino que disfruto viendo animales en libertad. Son todo lo contrario al ser humano, no destruyen, no matan, se protegen y el altruismo no esta enmascarado por alguna conveniencia oculta. Son toda la honestidad que le falta a nuestra especie. A la hora de investigar a veces nos vemos obligados a experimentar con animales, a lo largo de la carrera he “manipulado” un pollito, una rata y un conejo y por supuesto no me gusta acabar con ninguna vida pero de ahí a llamarlo maltrato animal hay un gran paso. En la web igualdad animal hablan de sustituir los modelos “animales no humanos” en la investigación y de cómo son sometidos a pruebas en contra de su voluntad. "Nunca he visto a una rata firmar un contrato", Hablan de que los animales modelo son tan parecidos a nosotros se merecen la misma consideración "aunque nadie se la quita".

¿Quién cree que nos gusta matar animales? Pero aunque el fin no justifica los medios hay procedimientos en experimentación como pruebas biomédicas, comportamiento animal, investigaciones genéticas donde prescindir de un modelo animal es imposible. Es necesario un control en tales experimentos, una normativa que limite las pruebas científicas en animales. En el periódico El mundo, podeis leer un artículo de cómo el Parlamento

Europeo ha dado luz verde a una directiva que busca reducir la cifra de experimentos con animales en la UE. Si tuvieran que operarte y te dijeran: Mira, el cirujano no a operado aun a nadie pero ha visto cientos de videos sobre la intervención ¿Dejaríamos que nos tocase? Yo creo que no, es necesario un método de prácticas imprescindibles para aprender. Estudiar los principios moleculares de la infección de un patógeno o nuevos métodos de intervención quirúrgicos son utilizados continuamente en animales como el cerdo, a veces se pueden sustituir por cadáveres pero ¿Ha muerto el paciente tras la intervención? ¡A mi me lo han dado fiambre! Ser diagnosticado como diabético era a menudo una sentencia de

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muerte antes de que se desarrollarse el tratamiento de la insulina a partir de los datos en animales. Anestésias, antibióticos o analgésicos, todos probados en animales y que hoy salvan vidas, no

solo humanas sino de otros animales (Todos los activistas olvidan este dato, ¿Cuantos animalillos no morirían si no se hubieran desarrollado tratamiento?

6.Transferencia génica Bacteria-Eucariota ¿Qué es un bacteriófago? Segun wikipedia un bacteriófago son virus que infectan exclusivamente a bacterias, cubiertos por una cápside proteica en cuyo interior presentan en un 95 % de los casos ADN de doble cadena. Para hacernos una idea de su importancia podemos recurrir a un dato bastante curioso " se estima que en un mililitro de agua del mar existen 10^9 partículas víricas, pudiendo estar infectadas un 70% de las bactérias marinas. Reconocen a un receptor de membrana del procariota, que puede ser un lipopolisacárido, ácido teicoido o incluso proteinas del flagelo. Inyectan cual jeringuilla el material genetico en la celula y se producira bien el Ciclo lítico o el Lisogénico.

En este post no os voy a hablar de la transducción bacteriana sino de un mecanismo de transferencia de genes entre bacterias y eucariotas mediado por bacteriófagos descubierto por investigadores del centro de biología molecular Severo Ochoa. Han descubierto señales de localizacion nuclear o NLS (nuclear localizations signals) hallazco ante todo inesperado. Son secuencias de aminoácidos en la superficie de las proteinas que actúan como señales para transportar genes al nucleo pero... ¡Las bacterias NO tienen nucleo!. Los axiomas creados respecto a los bacteriófagos acaban de chocarse contra un muro, resultando que: Los bacteriófagos no infectan sólo a bacterias.

Pueden poseer secuencias señal para el transporte de genes al nucleo.

La transduccion no es un proceso exclusivo de procariotas.

Los procesos de transformacion bacteria- eucariota pueven estar mediados por vectores víricos.

La transferencia génica entre procariotas y celulas con nucleo es mas que posible y se denuestra que existe una coevolucion entre ambos.

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Los bacteriófagos y más concretamente, sus proteínas terminales podrían haber mediado la transferencia horizontal de genes entre organismos procariotas y organismos eucariotas a lo largo de la evolución. ¿Qué supone este hallazgo? Las aplicaciones son infinitas, pero son en las industrias biotecnológicas y biomédicas donde suponen un enorme paso. ¿Qué aplicaciones se te ocurren a ti?

7.Sistemas de Secreción bacteriana tipo I (SST1)

Característico de Gram negativas, se utiliza para secretar muchas toxinas, como las Rtx ( Hemolisinas ) de E. coli uropatogénica. El aparato de secreción está formado por:

1. Proteina Abc : Está en la membrana interna, son homólogas a los sitemas de transporte Abc, pero estas últimos están presentes tanto en Gram negativas como en positivas.

2. Proteina MFP ( proteina de fusión de membrana) : se proyecta desde la membrana interna a la externa y pone en contacto a la proteína Abc con las proteinas que forman el canal ( Proteinas OMP ).

Las proteinas que se secretan por el SST1 no tienen secuencia señal en el extremo N-terminal sino en el C-terminal, esta secuencia ni se procesa ni se corta. El componente Abc es el encargado de generar la energía para la secreción ya que tiene un dominio ATPasa, este aparato no está siempre montado del todo, sino que generalmente no está listo hasta que se necesita.

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8.Sistemas de Secrecion Tipo 3 (SST3)

Aparece el Gram negativas, está especializado en la inyección de proteinas efectoras desde el citosol de la bacteria al citosol Eucariota. Estas proteinas nunca salen al exterior, es decir, no se secretan por lo que podemos decir que más que un sistema de secreción sería un sistema de translocación de proteinas. Esta translocación depende del contacto entre bacterias y eucariota, esto es lo que pasa por ejemplo en Yersinia. Las proteinas que se secretan son factores de virulencia de bacterias patógenas, por ejemplo las proteinas Yop de Yersinia. Los SST3 están muy conservados en todas las bacterias. Se piensa que este hecho se debe a la transferencia horizontal entre bacterias. Sin embargo las proteinas que se secretan son muy distintas. Tanto los genes que codifican el SST3 como las que codifican las proteinas efectoras estan agrupadas en plásmidos o en secuencias de ADn nuclear formando ISLAS DE PATOGENIDAD ( ejemplo Salmonella posee 2 islas ) Lo que tienen en común las proteinas efectoras es que son proteinas homólogas a celulas eucariotas, el origen puede ser por convergencia evolutiva o bien que se han capturado de dichas células.

El SST3 es muy complejo, formado por mas de 30 proteinas, muchas de ellas en la membrana plasmática. Las proteinas Ysc hacen un canal en la membrana plasmatica, Yscn es una ATPasa que proporciona la energía para la translocación. Despues la proteina Yscj forma un cilindro que atraviesa el periplasma. Una secretina por último atraviesa la membrana externa. Por último hay un apendice extracelular de Yscf que forma una especie de aguja. Pese a la similitud de estas estructuras con el flagelo bacteriano, ni la unidad formadora de la aguja ni la del pilus tienen similitud en la secuencia de formacion del Flagelo. La aguja se

ha estudiado a microscopía

electrónica en los generos Salmonella,

Shigella y Yersinia.

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NIVEL FÁCIL. ¿Conoce el término "microbiota" ? *

Si

No Si eliminamos las bacterias que normalmente viven en ud. "microbiota normal" : *

Enfermará menos

Enfermará más

No le afectará ¿Cree que portar microbios le aporta algún beneficio en términos generales? *

Si

No

Si pero muy poco, casi todos los microorganismos son infecciosos. ¿Cuantas bacterias cree que porta en su cuerpo de forma continua? *

10 veces menos que células humanas

Misma cantidad de células humanas que microbios

10 veces más bacterias que células humanas

Mi higiene es impecable, no porto casi bacterias, al menos sobre mi piel NIVEL MEDIO/DIFICIL ¿Donde no espera encontrar o puede ser potencialmente patógena...Pseudomonas aeruginosa? *

Boca

Faringe

Alveolos

Uretra ¿En qué lugar presenta un mayor número de bacterias? *

Tracto urinario

Intestino delgado

Intestino grueso

Esófago Marque la bacteria menos común en la faringe. *

Staphylococcus epidermidis

Neisseria meningitidis

Staphylococcus aureus

Pseudomonas aeruginosa ¿Cómo se denomina el fenómeno por el que las bacterias de nuestra microbiota inhiben el establecimiento de otras?

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