Određivanje broja životinja u pokusu

prof. dr. sc. Mladen PetrovečkiKatedra za medicinsku informatiku, Medicinski fakultet Sveučilišta u RijeciKlinički zavod za laboratorijsku dijagnostiku, KB Dubrava, Zagreb

Radionica Hrvatskog društva za znanost o laboratorijskim životinjama

PRIMJENA 3R PRISTUPA U RADU S LABORATORIJSKIM ŽIVOTINJAMAZagreb, 22.-23. listopada, 2015.

Statistička metodologija

http://gornbein.bol.ucla.edu/how%20to%20ensure%20rejection.pdf

Statistička metodologija

http://gornbein.bol.ucla.edu/how%20to%20ensure%20rejection.pdf

Veličina uzorka

http://ncifrederick.cancer.gov/rtp/lasp/intra/acuc/beth/Animal%20Study%20Proposal%20Guidance%20for%20Animal%20Numbers%20Justification.pdf

National Cancer Institute, Frederick National Laboratory for Cancer Research

populacija

uzorak

istraživanjezaključak

Uzorak

zavisnost dostupnost mjerljivost pogrješka uzorkovanja veličina reprezentativnost

Osobine uzorka

Nezavisni uzorci

uzorak Buzorak A uzorak Buzorak A

Zavisni uzorci

Uzorak:◦ urea/serum, N = 7 miševa

◦ mjerenje: 10,2 ± 2,2 mmol/Lwww.medcalc.org

Statistika uzorka

Urea/serum (N = 7) miševa◦ uzorak: 10,2 ± 2,2 mmol/L

(aritmetička sredina ± SD)◦ populacija: 10,2 ± 0,8 mmol/L

(aritmetička sredina ± SEM)

Standardna pogrješka

mali i veliki uzorci kako odrediti veličinu uzorka?

◦ prigodno ◦ izračun

jednadžbe statističke tablice nomogrami softver

Veličina uzorka

mali i veliki uzorci kako odrediti veličinu uzorka?

◦ prigodno ◦ izračun

jednadžbe statističke tablice nomogrami softver

Veličina uzorka

Marušić M i sur. Uvod u znanstveni rad u medicini. Zagreb: Medicinska naklada, 2013.

mali i veliki uzorci kako odrediti veličinu uzorka?

◦ prigodno ◦ izračun

jednadžbe statističke tablice nomogrami softver

Veličina uzorka

Johnston LJ, Renteria A, Hannon MR. Improving validity of on-farm research. J Swine Health Prod 2003;11(5): 240-246.

mali i veliki uzorci kako odrediti veličinu uzorka?

◦ prigodno ◦ izračun

jednadžbe statističke tablice nomogrami softver

Veličina uzorka

Altman DG. How large a sample? In: Gore SM, Altman DG, editor. Statistics in Practice. London, UK: British Medical Association; 1982.

Veličina uzorka

mali i veliki uzorci kako odrediti veličinu uzorka?

◦ prigodno ◦ izračun

jednadžbe statističke tablice nomogrami softver

http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/ http://www.dssresearch.com/KnowledgeCenter/ToolkitCalcu

lators.aspx http://homepage.stat.uiowa.edu/~rlenth/Power/

• uzorak B

• N = 7 miševa

• terapija u t0

• urea nakon 24 h12,9 ± 2,3 mmol/L

• uzorak A

• N = 7 miševa

• kontrolna skupina

• urea nakon 24 h10,2 ± 2,2 mmol/L

usporedbaH0: nema razlike

Primjer: testiranje hipoteze

Zadane vrijednosti

pogrješka 0,05 (0,01; 0,001)

pogrješka 0,2P-vrijednost izračunznačajnost ako je P <

Statističko zaključivanje

urea:◦ A: 10,2 ± 2,2 mmol/L, N = 7◦ B: 12,9 ± 2,3 mmol/L, N = 7

testiranje hipoteze:◦ H0: nema razlike, t-test, = 0,05

izračun: http://www.graphpad.com/quickcalcs/ttest1/

Primjer, značajnost razlike

Primjer, značajnost razlike

urea:◦ A: 10,2 ± 2,2 mmol/L, N = 7◦ B: 12,9 ± 2,3 mmol/L, N = 7◦ = 0,05, P = 0,044

određivanje snage studije (1 – ) izračun:

http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/

Primjer, snaga testa

Primjer, snaga testa

urea:◦ A: 10,2 ± 2,2 mmol/L◦ B: 12,9 ± 2,3 mmol/L

određivanje veličine uzorka (N)◦ = 0,05, = 0,2

izračun: http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/

Primjer, veličina uzorka

Primjer, veličina uzorka

urea:◦ A: 10,2 ± 2,2 mmol/L◦ B: 12,9 ± 2,3 mmol/L

određivanje veličine uzorka (N)◦ = 0,05, = 0,2

izračun: http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/http://homepage.stat.uiowa.edu/~rlenth/Power/

Primjer, veličina uzorka

urea:◦ A: 10,2 ± 2,2 mmol/L◦ B: 12,9 ± 2,3 mmol/L

određivanje veličine uzorka (N)◦ = 0,05, = 0,2

izračun: http://www.stat.ubc.ca/~rollin/stats/ssize/http://homepage.stat.uiowa.edu/~rlenth/Power/

Primjer, veličina uzorka Pokus sa životinjama

http://www.research.uci.edu/ora/acup/animalnumbers.htm

najmanji mogući dostatan za traženu snagu istraživanja razlikovanje◦ broja životinja◦ broja uzoraka tkiva

opis i broj mogućeg gubitka životinja prethodno iskustvo može se rabiti mora biti

dokumentirano u protokolu

Broj životinja

intuitivno (prigodno) računski snaga studije sekvencijalno uzorkovanje◦ Arnold S. Chamove (Animal Welfare Information

Center Newsletter, Spring 1996, Vol. 7 No. 1)

Određivanje N (pokus)

http://www.nal.usda.gov/awic/newsletters/v7n1/7n1chamo.htm

Oblikovanje studije

Strasak AM, Zaman Q, Pfeiffer KP, Göbel G, Ulmer H. Statistical errors in medical research – a review of common pitfalls. Swiss Med Wkly 2007;137:44-9.

Radionica Hrvatskog društva za znanost o laboratorijskim životinjama

PRIMJENA 3R PRISTUPA U RADU S LABORATORIJSKIM ŽIVOTINJAMAZagreb, 22.-23. listopad, 2015.

Hvala na pozornosti

mladenp@kbd.hrhttp://mi.medri.hr

http://www.kbd.hr/lab