Protein biomarker capabilities for Nanosphere
-
Upload
winton-gibbons -
Category
Health & Medicine
-
view
373 -
download
0
description
Transcript of Protein biomarker capabilities for Nanosphere
Protein Biomarker
Capabilities
CONFIDENTIAL
+�
������������������������ ������������ ��
•� ����������� ��#�•� %$�����%!$$$�� ��������������������������������������������
•� �������"���� ��������#'�*�������*))�������������� ������#����!�&��������������������
•� �����������#'���,(+)/�
•� �����#���������������#������•� �� ������� ���������������������������•� �����"��"�����!��������!������������������� �#�������
•� ��������$��� ����������•� ��������������������������������� ���������� ������� �����������•� �������������������� ����������������������������!����������������!����������
������������ �
•� ������������������������������������� ����������������������
CONFIDENTIAL
��
�������������� ������� �����������
10-3 – Millimolar Colorimetric/Enzymatic Chemistry
Blood Sugar (Glucose)
Molecules/Drop
Quadrillions
Nanosphere Technology
Cancer (ovarian, breast and others), Alzheimer’s, Pulmonary and Cardiovascular Disease
10-21 – Zeptomolar
10-18 – Attomolar
10-15 – Femtomolar
ELISA & Chemiluminesence
Troponin, CK-MB, BNP, �HCG
10-12 – Picomolar
10-9 – Nanomolar
10-6 – Micromolar
Concentration
Trillions
Millions
Billions
Thousands
Tens
<1
CONFIDENTIAL
��
Illustrative Opportunities�
Autoimmune�
Immune / Antibodies
Pharmacogenomics�(e.g., 2C19)�
Direct Genomic Detection
Respiratory�(e.g., Flu,
RSV)�
Cardiac (e.g., cTnI)�
High-sensitivity Proteins
* Bloodstream infections
CONFIDENTIAL
��
��������������� ����������� ����������������� ��
CONFIDENTIAL
,�
•� � �������!�� ��������������" ��������������� �$�*+����� � ��������� � �%���
•� ��� ����� ��������� � ������������������������ ��������� �$�������������������� ��� ��'���$����($������ �������� ���&��� �� ���
•� ��� �������������� ��!����� � ��� ���� ��!�
������������� �� �������!�
Protein probes use
. Direct antibody attachment
. Biotinilated with free streptavidin (published patent app)
. Covalently bound streptavidin (proprietary invention to be filed)
CONFIDENTIAL
��
Gold Nanoparticle Probe-Based – Nucleic Acid Example�
A
B
C
D
Detection in the Verigene System relies on the high sensitivity offered by gold nanoparticle probe technology�(A) Target specific capture oligonucleotides are immobilized on a substrate. �(B) Nucleic acid target is presented to the oligonucleotide array substrate under test conditions. �(C) The target is �sandwiched� by target-specific capture oligonucleotides and DNA-modified gold nanoparticle probes.�(D) Elemental silver is deposited at test site. Light scatter is measured from test sites for detection.
CONFIDENTIAL
��
�� ��������������� �������������� �
�� ���������������������������������������� �������!���������������� ���������������������������������
������������ ������������������� "�!�#���������������������� ����������� �����!��������������������������
������
CONFIDENTIAL
��
������� ������� ���
CONFIDENTIAL
"!�
�����������������������
����������
������������ �
��� ���������������
�������� ���
CONFIDENTIAL
���
������� ��������
CONFIDENTIAL
���
������������� �����
Sample to result Simple and easy to use Random Access High Clinical Multiplex – 50+
�������������������������� ���
CONFIDENTIAL
���
������������������� ������������������
Sample Extraction Amplification Detection
Extraction Tray
Amplification Tray Tip Holder
Test Cartridge
Verigene® SP Consumables
CONFIDENTIAL
���
�� ��������������������� � ���
CONFIDENTIAL
� �
������������
Fluidics valve plate
Fluidics manifold •� Base and cover
Reagent container •� Cover and housing
Cartridge cover
Glass Substrate
Substrate holder
RESTRICTED
CONFIDENTIAL
���
Analysis of results (array scanning) occurs via a photon emission technique where the slide is illuminated internally with light parallel to the slide surface. Spots where silver-enhanced gold nanoparticle probes are present emit light. The photons are detected optically and translated into “signal”.
Light�source
����� ���������������� ���
CONFIDENTIAL
���
�� �������������������
��150 µm diameter
��240 µm grid
RESTRICTED
Target
Potential for additional targets
CONFIDENTIAL
���
������� ��������
CONFIDENTIAL
+-�
��� �!�#��������!���#(����������������%�������������!�����������"�� ���*&,����'��������
����������
CONFIDENTIAL
���
��������� ����� ������������������������������������
����������
20
CONFIDENTIAL
)(�
�� �����������������%����!�������������������������'����!��� ��������$�������!�����������������'�����!�%�
���"���������#�����
���"�������!�'�������#����!�'���
���"�����!�'���
21
CONFIDENTIAL
���
� �� ������������������ ������ � ���� ����������
“Serial changes in high-sensitive troponin I predict outcome in patients with decompensated heart failure,” European Journal of Heart Failure (2010) 13, 37–42
CONFIDENTIAL
���
���������������������������������������� ��������������������� ���
CONFIDENTIAL
!�
��������������������������� �� �������� �� ������������ ���
������
�����
����� ������
�����������
������� ������
�
��
��
�
��
��
��
��
��
��
��
���� ���� ��� ����
�������� �����
� ������ �����
CONFIDENTIAL
!"�
��������������� ����������������������� �������������������
25
CONFIDENTIAL
!�
��������������������������
Doxorubicin - Progressive changes observed over time/dose:
1.� Lymphopenia/eosinopenia 2.� Anemia 3.� Nephrotoxicity (glomerular nephropathy) 4.� Hyperlipidemia 5.� Albumin �/globulin �
6.� ALP and AST changes - likely linked to decreased FC/bodyweight and mobility, respectively
26
!����������������� �������������������� �������� ���������
CONFIDENTIAL
')�
•� �����������!��������������
•� ������������������������������������� ��������"������������ #��������������������% ������������� � � ����� ��#�����������
•� ���!���� ��� ���� �#�������� �����!� ������ ������������� ���������������%�!� ��&�
•� ������ ��������� �����!�������� ������ ��������� ���� ����������� � ���$������ ���!������������!��
•� ���� � �� ����������!�('')�%�(�! ���������������&����
(�������"����#���� #�!������"���������� �������� ���������
27
CONFIDENTIAL
� �
� ��� �������������� �������������������������������
Serum cTnI pg/mL
Individual male animals n=67
CONFIDENTIAL
���
���� ����� ����������������������� ����������� �����������������������
Group mean cTnI (pgs/mL) + 1SD
Doxorubicin Dosing Schedule
Number of animals per group =6
CONFIDENTIAL
-+�
������ ������������������!���"����$� ���������������#��%�#����).+���'��*�������#�� �� ���),���'��*��������������� ����� ��������������$�"�������������������(��������� �������$�
19577 19582 19581 19580 19579 19578 Animal Number
Serum cTnI pg/mL
Mild atrial vacuolation
Mild atrial vacuolation
Mild ventricular vacuolation
NAD NAD
Minimal focal necrosis
CONFIDENTIAL
���
��������� ��������� �������
CONFIDENTIAL
&%�
�������������� ������� ������#�������� �������� ���
�����$��� �"�)� �"�)� ���)� ���)�
����� ���� ����� ���� ����
�� �� �� � ���� ���� ����
ROC curve AUC = 0.92
Evaluation of 131 clinical serum samples (59 non-cancer, 72 cancer) Plot of ROC Curve
CONFIDENTIAL
���
������������������������ �� ���
CONFIDENTIAL
���
Test Area 95% CI SE Class = 1
Ave-DNA 0.95 0.93 to 0.98 0.013 have higher values
Ave-protein 0.85 0.81 to 0.89 0.021 have higher values
Com-Ave 0.97 0.95 to 0.99 0.009 have higher values
Results of 310 Patient Samples
����� ��� ������ ������ �������
CONFIDENTIAL
���
������������������� �� ���
CONFIDENTIAL
���
RA assay •� Multiple epitopes for RA test. •� Cirtrulline-, non-cirtrulline compounds, and Ab as captures •� Performed tests on 1535 patient sera •� Performed comparative assay (Inova 3.1 and RF-ELISA) •� Demonstrated analytical and clinical sensitivity
RA Test chip with 98 captures
��������������� �������� � �
����������
CONFIDENTIAL
���
��������� �������������������� ����������������
State-of-the-art Competitive Assay State-of-the-art
Competitive Assay
Rule out
CONFIDENTIAL
���
•� High sensitivity (LOD 0.01 kU/L) •� Ability to use crude allergen extracts •� Multiplexed microarray •� Rapid assay time (1 1/2 hours) •� Correlated with Phadia’s tests
Microarray with Crude Allergen Extracts Example of an Allergen Test
������������ ���������������
)$������%����*$������+$���%)�,$���%*�-$���%+�.$���%,��/$� ��!����0$�����������1$�����������)($�������
))$����� ���)*$���"�����)+$����� ��),$�����)-$�����).$�����)/$�����)0$�����)1$��������*($��������
• LinkedIn'– hjp://www.linkedin.com/in/wintongibbons/'
• Twijer'– @wingibbons'
• Blog'– hjp://www.wingibbons.wordpress.com'
'
©'2013'Winton'Gibbons'