Prokario teukariot
-
Upload
syarif-hamdani -
Category
Education
-
view
96 -
download
1
description
Transcript of Prokario teukariot
Prokariot dan Eukariot
Klasifikasi sel
Prokariot dan eukariot
SelProkariotEukariot
Sel prokariot: bakteri
Tidak memiliki nukleus - DNA bebas dalam
sitoplasma
Tidak memiliki membrane-bound organelles
Berukuran lebih kecil
Sebagian besar memiliki dinding sel
Polisakarida menutupi dinding sel pada banyak
spesies
Genom:
Kandungan genetik total pada set haploid kromosom pada eukariot
Kromosom tunggal pada bakteri atau pada DNA atau RNA virus
Material genetik pada organisme
Genom bakteri terdiri dari kromosom sirkular
Terkondensasi dengan cara supercoiling dan looping membentuk badan nukleoid yang terpak secara rapat
Kromosom bereplikasi di dalam sel dan sel membelah secara biner
Genom bakteriCircular dsDNA
G+C = 50%
G+C content merupakan struktur genom
Gen transfer pada bakteri
(from Redfield, Nat. Rev. Genet. 2001)
Transduction:Melalui bacteriophage
Transformation:Mengintegrasikan free DNA atau plasmid
Conjugation:Kontak langsung
Plasmid adalah DNA sirkular kecil yang terdapat pada sel prokariot
PlasmidsExtra chromosomal circular DNAsDitemukan pada bakteriUkuran bervariasi dari ~ 3,000 bp sampai 100,000 bp.Bereplikasi secara otonomi (origin of replication)Dapat mengandung gen resistenDapat ditransfer dari satu bakteri ke bakteri lainnyaDapat ditransfer kepada kingdom yang berbedaMulticopy plasmids (~ up to 400 plasmids/per cell)Low copy plasmids (1 –2 copies per cell)Digunakan sebagai vektor untuk membawa gen yang
diinginkan
Genom bakteri berukuran kecil dan terpak secara padat dengan gen-gen
Spesies Ukuran genom (Mb)Fungi
Saccharomyces cerevisiae 12.1
Aspergillus nidulans 25.4
Protozoa
Tetrahymena pyriformis 190
Invertebrates
Caenorhabditis elegans 97
Drosophila melanogaster 180
Bombyx mori (silkworm) 490
Strongylocentrotus purpuratus (sea urchin) 845
Locusta migratoria (locust) 5000
Vertebrates
Takifugu rubripes (pufferfish) 400
Homo sapiens 3200
Mus musculus (mouse) 3300
Plants
Arabidopsis thaliana (vetch) 125
Oryza sativa (rice) 430
Zea mays (maize) 2500
Pisum sativum (pea) 4800
Triticum aestivum (wheat) 16 000
Fritillaria assyriaca (fritillary) 120 000
ORGANISASI GENORGANISASI GEN
EUKARIOT dan PROKARIOT
SITOPLASMA
NUKLEUSDNA
RNA
mRNA
PROTEIN
TRANSLASI
TRANKRIPSI
PENYAMBATANRNA
INTRON
EKSON
PROTEIN
TRANSLASI
TRANKRIPSI
DNA
RNA
Eukariot
Genom
Keseluruhan informasi genetik dalam suatu organisme
Informasi genetik inti: terletak di kromosomInfromasi genetik organel:
- mitokondria, - plastid (kloroplast)
Eucaryotic genomesBerlokasi pada beberapa kromosomLow gene density Juga terdapat genom organel
KromosomTerlihat di dalam nukleus dengan zat pewarna
dan diamati dibawah mikroskop.Material kromosom: KromatinKromatin terdiri atas nukleosomNukleosome merupakan lilitan DNA pada molekul
protein yaitu protein histon
Nukleosom terorganisasi ke dalam 30 nm benang-benang
Benang-benang terlipat-lipat membentuk 10,000-fold compaction yang diperlukan untuk membentuk kromosom eukariot di dalam nukleus.
Karakteristik Yeast Lalat buah Manusia
Gene density (average number per Mb)
479 76 11
Introns per gene (average) 0.04 3 9
Amount of the genome that is taken up by genome-wide repeats
3.4% 12% 44%
Kekompakan genom
Genom Mitokondria (mtDNA)
Berbentuk circular chromosomesTerdapat lebih dari satuBerukuran ~15 Kb pada hewanBerukuran ~ 200 kb sampai 2,500 kb pada
tumbuhanLebih dari 95% protein mitokondria dikode di
genom nuklear.
Genom kloroplas (cpDNA)
Multiple circular molecules Ukuran berkisar dari 120 kb sampai 160 kbMirip dengan mtDNABanyak protein kloroplas dikode di nukleus
(separate signal sequence)