Petr Bureš 1) , Wang Yi-Feng 2) , Lucie Horová 1) , Jan Suda 3)
description
Transcript of Petr Bureš 1) , Wang Yi-Feng 2) , Lucie Horová 1) , Jan Suda 3)
Petr BurešPetr Bureš1)1), , Wang Yi-FengWang Yi-Feng2)2), ,
Lucie HorováLucie Horová1)1), , Jan SudaJan Suda3)3)
1)1) Department of Botany Faculty of Department of Botany Faculty of Science Masaryk Univ. Brno,Science Masaryk Univ. Brno,
2)2) Department of Botany North- Department of Botany North-West. Univ. Lanzhou, West. Univ. Lanzhou,
3)3) Department of Botany, Faculty of Department of Botany, Faculty of Science, Charles Univ., PragueScience, Charles Univ., Prague
Cirsium Cirsium : Interspecific hybridization : Interspecific hybridization and DNA contentand DNA content
arvense vulgare brachy-cephalum
canum vulgare heterophyllum palustre
erisitha-les
pannonicum spimosissimum
oleraceum acaule eriopho-rum
2n=34
Ostatní
2n=32 2n=30
2n=262n=24
2n=28
2n=162n=182n=20
2n=22
2n=1022n=51
2n=36
2n=68
Chromosomové počty v rodu Cirsium
V celém rodu převládá 2n = 34
zhruba 2/3 druhů
dalším nejčastěji zastoupeným počtem je 2n = 68 (zhruba 12 % druhů)
Cirsium palustreCirsium oleraceum
Cirsium oleraceum × C. palustre = C. × hybridum
49N
50N
51N
13E 14E 15E 16E 17E 18E
Cirsium oleraceum x palustre liter.Cirsium oleraceum x palustre herb.
Cirsium vulgareCirsium oleraceum
Cirsium oleraceum × C. vulgare = C. × bipontinum
49N
50N
51N
13E 14E 15E 16E 17E 18E
Cirsium oleraceum x C. vulgare - herb.
palustreoleraceum
rivulare
brachycephalum
arvense
vulgare
heterophyllum canum
pannonicum
acaule
eriophorum
„Intenzita mezidruhové hybridizace“ v rodu Cirsium podle počtu dokladů v českých herbářích (celkem 28 hybridů)
8
0
8
1
5
5
656
7
5
Problémy:
• Liší se velikostí genomu druhy na stejné ploidní úrovni, nebo častá hybridizace způsobuje, že se druhy velikostí genomu neliší?
• Mohou být případné rozdíly ve velikosti genomu adaptivní odpovědí na nějaké eko-geografické faktory?
• Mají kříženci jiný počet chromosomů než rodičovské druhy?
• Souvisí různá frekvence vzniku různých přirozených hybridních kombinací nějak s velikostí genomu?
I
Material & Methods
Relative DNA content: Brno
PA – I (HBO lamp + DAPI)
954 measurements of 13 species and 12 hybrids from
102 populations with standard Cirsium vulgare (the same individual in all measurements)
mean CV = 2.37 s.d. = 0.61
Prague
Absolute DNA content & AT frequency: Brno + Praha
Brno
PA – I (HBO lamp + DAPI)
108 measurements of 12 species (=12x3 individuals)
mean CV stand. = 2.09 s.d. = 0.42
mean CV sample = 2.17 s.d. = 0.39
standard Lycopersicon esculentum ‘Stupické polní tyčkové rané’
PA – II (laser + PI)
102 measurements of 12 species (=10x3+2x2 individuals)
mean CV stand. = 3.19, s.d. = 0.33
mean CV sample = 3.23, s.d. = 0.39
3x in three different days
II.
Interspecific genome size variability
G0/G1 Cirsium
heterophyllum
G0/G1 Cirsium eriophorum
G0/G1 Cirsium vulgare
100 200 300 400 Fluorescence channel
400
300
200
100
Fig. 1. Range of interspecific genome size in Central European Cirsium species: Histogram of relative nuclear DNA content obtained after flow-cytometric analysis of DAPI stained nuclei, showing the diploid species with the smallest genome (Cirsium heterophyllum), the diploid species with the largest genome (C. eriophorum), and the lone tetraploid species (C. vulgare).
0,38 0,43 0,48 0,53 0,58 0,63
relativní velikost jaderné DNA jednotlivých druhů: ♦ průměr ± směrodatná odchylka
eriophorum
brachycephalum
arvense
acaule
palustre
pannonicum
rivulare
erisithales
oleraceum
canum
heterophyllum
relative 2C DNA content ♦ mean± ├standard deviation┤
Signicicant negative correlations between genome size and eco-geographical features (p<0.05)
Ellenberg’s indicator value for moisture
(rs = –0.68, p = 0.029)
Ellenberg’s indicator value for continentality
(rs = –0.64, p = 0.045)
Eastern limit of geographical distribution
(rs = –0.64, p = 0.032)
Spinyness (adaptation to herbivore pressure)
(Kendall Tau = –7.34, p<0.001)
Longevity (biennials vers. perennials)
(Kendall Tau = –0.604, p= 0.004)
Cirsium vulgare 5.54 ± 0.12 49.85
Cirsium eriophorum 3.60 ± 0.03 48.38
Cirsium brachycephalum 2.98 ± 0.05 49.98
Cirsium arvense 2.84 ± 0.05 51.75
Cirsium acaule 2.62 ± 0.03 50.95
Cirsium palustre 2.58 ± 0.05 49.14
Cirsium spinosissimum 2.53 ± 0.02b –
Cirsium pannonicum 2.44 ± 0.03 50.73
Cirsium rivulare 2.40 ± 0.033.43 ± 0.05
51.69–
Cirsium erisithales 2.33 ± 0.03 50.94
Cirsium oleraceum 2.32 ± 0.03 50.49
Cirsium canum 2.24 ± 0.02 50.65
Cirsium heterophyllum 2.14 ± 0.03 51.65
Absolute 2C DNA content in pg ± s.d.
AT freqeuency %
III.
Genome size of hybrids
heterophyllum x rivulare
palustre x rivulare
oleraceum x rivulare
heterophyllum x oleraceum
erisithales x palustre
acaule x oleraceum
oleraceum x palustre
erisithales x oleraceum
canum x palustre
canum x oleraceum
heterophyllum x palustre
erisithales x heterophyllum
relative genome size 4.0 4.5 5.0
(mean of parent1 with smaller genome) =
average of hybrid (mean of parent1 + mean of parent2) / 2
= (mean of parent2 with larger genome)
Genome size of hybrids was smaller than predicted
Fig. 2. Relationship between the potential range of hybrid relative DNA content (├──┤), expected hybrid relative DNA content (■), and actual relative DNA content of Cirsium interspecific hybrids (◊).
0
100
200
300
400
500
600
700
ole can pal riv aca pan het arv vul eri bra
„Hybridní promiskuita“ jednotlivých druhů v rodu Cirsium podle počtu dokladů v českých herbářích
vulgare
eriophorum
brachycephalum
arvense
acaule
palustre
pannonicum
rivulare
oleraceum
canum
heterophyllum herb. specimens of hybrids 400 600 800 10 8 6 relative genome size
large genome
many
hybrids
few or no hybrids
small genome
Fig. 3. Relationship between relative DNA content of Cirsium species and the production of interspecific hybrids.
Species with smaller genome produce hybrids more frequent = the same tendency as at individual level ?
Cirsium heterophyllum
Cirsium rivulare
Důležitým faktorem pro mezidruhovou hybridizaci mohou být také rozdíly v rozšíření rodičov-ských druhů
Místa společného výskytu
Cirsiumheterophyllum
a
C. rivulare
Jen v těchto územích mohou vznikat kříženci mezi
Cirsium heterophyllum a C. rivulare
49N
50N
51N
13E 14E 15E 16E 17E 18E
Cirsium palustre - liter.Cirsium palustre - herb.
49N
50N
51N
13E 14E 15E 16E 17E 18E
Cirsium oleraceum - liter.Cirsium oleraceum - herb.
Cirsium palustre
Cirsium oleraceum
Pokud se druhy podobají svým rozšířením, mohou teoreticky tvořit hybridy častěji
Ke kvantifikaci podobnosti v roz-šíření lze využít společné výskyty ve
fytogeografických okresech !
Jak ale kvantifikovat míru podobnosti v rozšíření ve vztahu k hybridizaci ???
Intenzita hybridizace mezi druhem x a druhem y
99
Σ xi . yii = 1
i =
99
Σ h(x×y)ii = 1
počet lokalit druhu x ve fytogeografickém okrese i
počet lokalit druhu y ve stejném fytogeografickém okrese i
počet lokalit hybrida x×y v i-tém fytogeografickém okrese
druh y = C. rivulare
Intenzita hybridizace mezi druhem x a druhem y
99
Σ xi . yii = 1
i =
99
Σ h(x×y)ii = 1
Celkový počet lokalit hybrida v České republice
druh x = C. heterophyllum
Suma součinů zachycuje právě území (fytochoriony), kde se druhy vyskytují společně
na příkladu C. heterophyllum a C. rivulare
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1
1.2
1.4
can x ole ole x riv pal x riv aca x pan pal x can ole x pal aca x ole aca x can
Intenzita mezidruhové hybridizace rodu Cirsium v České republice
99
Σ xi . yii = 1
i =
99
Σ h(x×y)ii = 1
heterophyllum
canum
oleraceum
erisithales
rivulare
pannonicum
palustre
acaule
arvense
brachycephalum
eriophorum
0,39 0,44 0,49 0,54 0,59 0,64 0,69
Mají mezidruhové rozdíly ve velikosti jaderné DNA nějaký vliv na intenzitu mezidruhové hybridizace v rodu Cirsium ?
Co znamená rozdíl ve velikosti jaderné DNA ?
Rozdíl velikosti jaderné DNA
Intenzita mezidruhové hybridizace v rodu Cirsium ve vztahu k rozdílům ve velikosti jaderné DNA rodičovských
druhů
can x ole ole x riv pal x riv aca x pan pal x can ole x pal aca x ole aca x can
intenzita hybridizace rozdíl ve velikosti jaderné DNA
klima-index
Termo_lok Mezo_lok Oreo_lok 1 x ––––––––– + 0 x –––––––– + (–1) x –––––––– Termo_ploch Mezo_ploch Oreo_ploch –––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––– Termo_lok Mezo_lok Oreo_lok ––––––––– + ––––––––– + –––––––– Termo_ploch Mezo_ploch Oreo_ploch
K=
AT
con
cent
ratio
n
klima-index
Spearman
rs = 0.85
p=0.003