PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431
Transcript of PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431
![Page 1: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/1.jpg)
PENGANTAR BIOINFORMATIKA
IBT 431
By Seprianto S.Pi, M.Si
![Page 2: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/2.jpg)
Ruang Lingkup Bioinformatika
Pertemuan 2
![Page 3: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/3.jpg)
Ruang Lingkup Bioinformatika
![Page 4: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/4.jpg)
Ruang Lingkup Bioinformatika
![Page 5: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/5.jpg)
Cabang –cabang Ilmu yang Terkait dengan Bioinformatika
• Biophysics
• Computational Biology
• Medical Informatics
• Cheminformatics
• Genomics
• Mathematical Biology
• Proteomics
• Pharmacogenomics
• Pharmacogenetics
![Page 6: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/6.jpg)
Biophysics
• Biophysics adalah sebuah bidang interdisipliner yang mengaplikasikan teknik-teknik dari ilmu Fisika untuk memahami struktur dan fungsi biologi (British Biophysical Society)
• Dr. Warsito menemukan alat terapi kanker dengan konsep elektrostatis
• Ex. Bioplastik dan energi terbaharukan
![Page 7: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/7.jpg)
Computational Biology
• Computational biology merupakan bagian dari Bioinformatika yang paling dekat dengan bidang Biologi umum klasik
• dari computational biology adalah gerak evolusi, populasi, dan biologi teoritis daripada biomedis dalam molekul dan sel
• Ledakan informasi biologi
• Penyimpanan database
![Page 8: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/8.jpg)
Medical Informatics
• Menurut Aamir Zakaria , medical informatics adalah "pembelajaran, penemuan, dan implementasi dari struktur dan algoritma untuk meningkatkan komunikasi, pengertian dan manajemen informasi medis
• Data Pasien
• Diagnosis penyakit.
![Page 9: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/9.jpg)
Cheminformatics
• Cheminformatics adalah kombinasi dari sintesis kimia, penyaringan biologis, dan pendekatan data-mining yang digunakan untuk penemuan dan pengembangan obat
• Penemuan ampicilin (Cara observasi obat )
![Page 10: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/10.jpg)
Genomics
1. Genomics adalah setiap usaha untuk menganalisa atau membandingkan seluruh komplemen genetik dari satu spesies atau lebih (keseluruhan)
2. Genome DataBase
![Page 11: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/11.jpg)
Gene: protein-coding DNA
Protein
mRNA
DNA
transcription
translation
CCTGAGCCAACTATTGATGAA
PEPTIDE
CCUGAGCCAACUAUUGAUGAA
![Page 12: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/12.jpg)
Proteomics• Istilah proteomics pertama kali digunakan untuk
menggambarkan himpunan dari protein-protein yang
tersusun (encoded) oleh genom
• studi kuantitatif dan kualitatif dari ekspresi gen di level dari
protein-protein fungsional itu sendiri
• Mengkarakterisasi protein
![Page 13: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/13.jpg)
• Aplikasi dari pendekatan genomik dan teknologi padaidentifikasi dari target-target obat
• Menjaring semua genom untuk penerima yang potensialdengan menggunakan cara Bioinformatika
• Pemrosesan informasi yang berkaitan dengan ilmu Farmasidan Genetika, untuk contohnya adalah pengumpulaninformasi pasien dalam database.
Pharmacogenomics
![Page 14: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/14.jpg)
Pharmacogenetics• Tiap individu mempunyai respon yang berbeda-beda
terhadap berbagai pengaruh obat
• Pharmacogenetics adalah bagian dari pharmacogenomics yang menggunakan metode genomik/Bioinformatika untuk mengidentifikasi hubungan-hubungan genomik
![Page 15: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/15.jpg)
Teknologi dan Penerapan Bioinformatika
DATABASE
Mencari sekuen yang homolog
Menyimpan Menggunakan
Sekuen DNA/ Protein
![Page 16: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/16.jpg)
![Page 17: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/17.jpg)
PENERAPAN BIOINFORMATIKA
1. Basis data sekuens Biologis :
![Page 18: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/18.jpg)
PENERAPAN BIOINFORMATIKA
2. Penyejajaran sekuens :
![Page 19: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/19.jpg)
PENERAPAN BIOINFORMATIKA
3. Prediksi struktur protein :
![Page 20: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/20.jpg)
Bidang yang terkait Bioinformatika
![Page 21: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/21.jpg)
Bidang yang terkait Bioinformatika
![Page 22: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/22.jpg)
Bidang yang terkait Bioinformatika
![Page 23: PENGANTAR BIOINFORMATIKA IBT 431](https://reader031.fdocuments.net/reader031/viewer/2022012411/616acfcf6c755407ac74b13b/html5/thumbnails/23.jpg)