PCR multiplex

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Aplicación de la técnica molecular PCR multiplex para la identificación de especies de peces… y uso de secuenciación masiva de ADN para el mejoramiento genético en acuicultura

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Aplicación de la técnica molecular PCR multiplex para la identificación de especies de peces… y uso de secuenciación masiva de ADN para el mejoramiento genético en acuicultura

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PCR multiplex

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Especie 1

Especie 2

Especie 3

Especie 4

Especie 5

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Tres pasos principales:

• 1) Extracción de ADN

• 2) Amplificación por PCR multiplex

• 3) Electroforesis en gel de agarosa

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PCR

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PCR

Primers ADN polimerasa

Nucleótidos

A G

C T

ADN molde

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PCR

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

Desnaturalización a 95°C

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PCR

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

asociación a 55°C

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PCR

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

Extensión a 72°C

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PCR

Ingredientes principales:

ADN molde ADN polimerasa

Nucleótidos Primers

A G

C T

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Electroforesis

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Polaca

Nototenia Cola

Austral

Común

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Surimi 2009 Surimi 2013

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- Errores de etiquetados son muy comunes en alimentos

- Muchos laboratorios dedicados a detectar estos errores

Certificación genética podría otorgar mayor competitividad y valor agregado

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Identificación de patógenos

Virus, bacterias, hongos, parásitos, etc

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Secuenciación masiva de ADN

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RAD-seq: Secuenciación de ADN asociado a sitios de restricción

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Sitios Polimórficos

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8310 sitios polimórficos

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Diferenciación de stocks

P. wiltoni Canal Beagle

P. ramsayi B. Namuncurá

P. ramsayi Golfo San Jorge

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Identificación de QTLs

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Selección asistida por marcadores (MAS)

Especialmente útil para características difíciles de medir, que exhiben poca heredabilidad y/o se expresan tarde en el desarrollo.

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Análisis de QTLs de características importantes para especies de acuicultura

Especie Características

Tilapia Tolerancia a la temperatura, tamaño de cuerpo, resistencia a enfermedades, color, tolerancia a la salinidad, etc. emperature tolerance.

Trucha arcoiris Tolerancia térmica, época de desove, crecimiento, tolerancia a la salinidad, etc.

Salvelinus fontinalis Tasa de crecimeinto, respuesta al estrés.