Pbl gjennomgang uke 9
description
Transcript of Pbl gjennomgang uke 9
![Page 1: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/1.jpg)
PBL Uke 9Du bør velge dine foreldre med omhu
![Page 2: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/2.jpg)
Dagens tema
•Organellene•Proteiners skjebne etter translasjonen•Intracellulære transportveier•Ukens PBL-oppgave
![Page 3: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/3.jpg)
Organellene • CYTOSOL: en rekke metabolske reaksjoner
foregår her. Proteinsyntesen• KJERNEN: inneholder genomet. DNA og RNA
syntese• ER: syntese av lipider. Syntese av proteiner• GOLGI-APPARATET: modifikasjon, sortering og
pakking av proteiner og lipider• LYSOSOMER: intracellulær degradering• ENDOSOMER: sortering av endocytert materiale• MITOKONDIA: ATP syntese ved oksidativ
fosforylering• KLOROPLAST: Fotosyntesen og ATP syntese ved
karbon fiksering• PEROKSISOMER: oksidasjon av toksiske
molekyler
![Page 4: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/4.jpg)
Proteiners skjebne etter translasjonen
![Page 5: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/5.jpg)
FOLDING
•Proteiner foldes i en bestemt 3D struktur•Bestemt av aminosyre rekkefølge•Chapperoner hjelper assisterer foldingen
![Page 6: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/6.jpg)
Posttranslasjonelle modifikasjoner
• Mange proteiner modifiseres i ER
• 1. Disulfidbindinger: Oksidasjon av cystein sidekjeder▫ Intrakjeder▫ Interkjeder
▫ Stabiliserende effekt på proteinet
![Page 7: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/7.jpg)
…• Glycosylering: Påhektelse av korte oligosakkarider▫ N-glycosylering▫ O-glycosylering
▫ Beskytter mot degradering og lysosomets lumen
![Page 8: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/8.jpg)
Signalfrekvenser• Proteinene
modifiseres videre i Golgi
• Signal sekvensene er typisk 15-60 aminosyrer lange.▫ Gult=Hydrofobe▫ Rødt=Positivt ladet▫ Blått=Negativt ladet
![Page 9: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/9.jpg)
Degradering
• Organeller slites ut, proteiner kveiles feil-> må degraderes og byttes ut
• Skjer vdh Proteasomer og Lysosomer
• Proteasomer:
▫ Ubiquitin(UB) bindes til proteinet-> Polyubiquitin er en destruksjonsmerkelapp
http://www.youtube.com/watch?v=w2Qd6v-4IIc
![Page 10: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/10.jpg)
• Lysosomer:▫ Inneholder sure
hydrolaser, pH omkring 5▫ Usedvanelig glycosylerte
membranproteiner▫ Transport til lysosomet
via: Endocytose Fagocytose Autofagi
- Autofagi: ”selvspising”; tar deler av seg selv, sender med autofagocyttiske blærer.
![Page 11: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/11.jpg)
Sure hydrolaser
•Syntetiseres i ER, transporteres via Golgi. I ER og cis Golgi merkes de med Mannose-6-fosfat (M6P)
•I trans Golgi blir M6P av Mannose-6-fosfat reseptoren (MPR). Dette transporteres i vesikler til lysosomet via endosomer.
![Page 12: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/12.jpg)
Intracellulære transportveier
![Page 13: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/14.jpg)
Transport gjennom kjerneporer• Små vannløselige stoffer kan passere porene • Store molekyler kan bare passere porene hvis de har
et bestemt sorteringssignal (nuclear localization signal) som binder seg til nuclear transport receptors.
![Page 15: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/15.jpg)
Transport gjennom protein- translokatører
• Disse proteinene har en signalsekvens på N-terminal som fungerer som en merkelapp.
• Proteinet blir først foldet ut før det transporteres inn i organellen. Der vil chaperonene hjelpe til med å folde dem tilbake.
![Page 16: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/16.jpg)
Vesikkeltransport1) Mekanismer
• Cytoplasmiske proteiner bidrar til vesikkel-formasjon: Klatrin, COPI og COPII
• Klatrin:▫ Trebenet molekylstruktur▫ Danner spontant mangekantet
burstruktur ved å binde seg til hverandre
![Page 17: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/17.jpg)
▫ Klatrin binder også adaptinmolekyler bundet til transmembranreseptorer (cargo receptors), som igjen binder molekyler som skal transporteres på ikke-cytosolisk side av membranen (cargo molecules)
▫ Vesikkelen snøres av ved hjelp av GTPasen dynamin
![Page 18: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/18.jpg)
• Hvordan fusjonere med riktig målmembran?▫ Komplementære
SNARE-proteiner danner trans-SNARE-komplekser
▫ Rab-proteiner fasiliterer ”docking” av vesikkelen og riktig paring av vSNARES og tSNARES
![Page 19: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/19.jpg)
▫Selve fusjonen er energikrevende og krever bistand fra et fusjonsmaskineri
▫vSNARES og tSNARES bidrar til membranfusjon ved å tvinge membranene sammen
![Page 20: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/20.jpg)
2) Sekretoriske transportveier
• Korrekt foldete proteiner transporteres fra ER til Golgiapparatet▫ COPII-kledte vesikler
fusjonerer med Golgiapparatet
▫ Proteiner returneres til ER i COPI-kledte vesikler
![Page 21: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/21.jpg)
• Golgiapparatet: To hovedfunksjoner1) Enzymatisk modifikasjon av proteiner fra ER2) Sortering av proteiner for videre transport
![Page 22: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/22.jpg)
• Sekretoriske proteiner kan ha ulike skjebner▫ Inkorporeres i ekstracellulær matriks▫ Tilknyttes plasmamembranen perifert▫ Diffundere som næring/signalmolekyler til andre celler
• Sekresjon skjer ved eksocytose: Fusjon med plasmamembranen
![Page 23: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/23.jpg)
• Den konstitutive sekretoriske veien:▫ Ikke-selektiv eksocytose▫ Kontinuerlig i alle eukaryote celler▫ ”Default pathway”: Forsyner
plasmamembranen og ekstracellulær matriks med nye komponenter
• Den regulerte sekretoriske veien:▫ Selektiv eksocytose▫ Kun i sekretoriske celler▫ Seleksjon i trans-Golgi▫ Fusjonerer med plasmamembranen
på signal utenfra
![Page 24: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/24.jpg)
3) Endocytiske transportveier
• Endocytose: Prosessen hvor celler tar opp makromolekyler, bestemte substanser og andre celler utenfra ved invaginering av plasmamembranen
• Kategorisering etter:▫ Størrelse: Fagocytose versus pinocytose▫ Spesifisitet: Reseptormediert eller uselektiv
![Page 25: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/25.jpg)
• Fagocytose: Når cellen tar inn store partikler som mikroorganismer og døde celler▫ Store vesikler (fagosomer) som
fusjonerer med lysosomer▫ Hos animalske arter: Spesialiserte
fagocytter beskytter mot patogener og fjerner ødelagte/døde celler
▫ Selektiv• Pinocytose: Kontinuerlig internalisering
av plasmamembran og intracellulærvæske▫ Klatrin- eller kaveolinmediert▫ Uselektiv
![Page 26: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/26.jpg)
• Reseptormediert endocytose: Selektiv pinocytose via klatrinkledte vesikler▫ Molekyler i ekstracellulærvæske
binder reseptorer i plasmamembranen
▫ Opptak av for eksempel vitamin B12, jern og kolesterol
▫ Danner reseptor-makromolekylkomplekser som entrer cellen
▫ Fusjonerer med tidlige endosomer
▫ Proteiner som ikke returneres til plasmamembranen ender opp i lysosomer
![Page 27: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/27.jpg)
Ukens PBL-oppgave
![Page 28: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/28.jpg)
•Kolesterol og LDL-reseptoren
•Mutasjon i LDL-reseptoren og familiær hyperkolesterolemi
![Page 29: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/29.jpg)
Lipoproteiner:
•Lipoprotein
•ApolipoproteinFlere forskj. typer, fungerersom ligand.
•Kolesterol
![Page 30: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/30.jpg)
Lipoproteiner og kolesterol:• Kolymikron:
Tarm plasma vev
• VLDL:Lever plasma vev
• LDL:VLDL LDL vev
• HDL:Lever plasma lever
fett
fett
kolesterol
kolesterol
![Page 31: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/31.jpg)
Godt og dårlig kolesterol:
•Vanlige verdier i plasma:Kolesterol < 5 mmol/LLDL-kolesterol < 3 mmol/L
![Page 32: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/32.jpg)
LDL-reseptorens oppbygning:
![Page 33: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/33.jpg)
Kolesterolopptakets virkning på genregulering:
![Page 34: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/34.jpg)
Familiær hyperkolesterolemi • Tilhører gruppe metabolske sykdommer: hyperlipedemier • Karakteriseres ved:
▫ autosomal dominant nedarvet hyperkolesterolemi ▫ xantomknuter
▫ tidlig debut av hjerte- og karsykdommer. • skyldes defekte (LDL)-reseptorer på cellenes overflate. • Gir akkumulering av kolesterol i blodet• Rammer 1 av 300 i Norge, 1 av 500 i Storbritannia*
• Kilde: www.pasienthandboka.no
![Page 35: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/35.jpg)
Arvemekanismene Autosomal dominant Heterozygot + frisk --> 50% Homozygot + frisk --> 100% (heterozygot) Heterozygot + heterozygot --> 75% Homozygot + Homozygot --> 100% (homozygot)
Kilde: www.pasienthandboka.no
Heterozygote pasienter har 2 til 3 ganger høyere kolesterolinnhold i serum enn normalt.
Homozygote pasienter har 4 til 8 ganger høyere kolesterolinnhold i serum enn normalt.
![Page 36: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/36.jpg)
Heterozygote• totalkolesterol ofte ligge mellom 8 og 12 mmol/L (normal under
5)• Hjerteinfarkt fra 30år• Står for 5% av hjerteinfarkt hos folk under 60
• Behandling:Kolesterolsenkende midler (statiner) kan føre til syntese av LDL reseptorer fra
det normale allelet til de heterozygote pasientene. Dermed kan det delvis kompensere.* statiner blokkerer produksjonen av kolesterol i leveren ved at de hemmer virkningen av enzymet hydroksymetyl-glutaryl-koenzym A-reduktase som er det hastighetsbestemmende enzym i kolesterolsyntesen. Da vil cellen kompenserer ved å lage flere reseptorer for å få inn kolesterol fra blodet.
Det finnes også folk som er heterozygote for 2 forskjellige mutasjoner, 1 mutant gen fra hver forelder.
* Kilde: Leren,T,1993, TDNLF, 113,3251-4
![Page 37: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/37.jpg)
Homozygote• Arver 1 mutant gen fra hver forelder. • Alvorlig tilstand• Hjerteinfarkt fra tidlige barneår
• Behandling:▫ Aktuelle behandlingsprinsipper for de homozygote innebærer
plasmautskiftninger hver annen til fjerde uke eller levertransplantasjon.
▫ I USA er det gjort lovende forsøkt med genterapi hos disse pasientene. (etablert cellekulturer av hepatocytter, hvor det introduseres et normalt LDL-reseptorgen. Hepatocyttene tranfunderes via vena portae, og slår seg ned i lever) usikker på klinisk anvendelse.
Kilde: Leren,T,1993, TDNLF, 113,3251-4
![Page 38: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/38.jpg)
Mutasjon i LDL-reseptoren• Per jan 2009: 1100 mutasjoner identifisert• Diagnostikk:
- Trengs i prinsippet test for hver av mutasjonene- I familier med påvist FH i minst 2 generasjoner, kan det sjekkes om familiemedlemmet har arvet den samme DNA strengen som den syke i familien, uten å kjenne mutasjonen i genet.
• 5 Hovedgrupper:1. Manglende syntese av reseptorprotein.2. Manglende intracellulær transport og modifisering av
reseptorproteinet3. Manglende binding av lipoproteiner4. Manglende internalisering av reseptor-ligand-
komplekset5. Manglende resyklering av reseptor
Kilde: Leren,T,1993, TDNLF, 113,3251-4
![Page 39: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/39.jpg)
![Page 40: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/40.jpg)
1.Manglende syntese av reseptorprotein
Det syntetiseres ikke noe påvisbart reseptorprotein
Vanligste typer: Nonsense mutasjon Endring av leserammen (mindre delesjoner,
duplikasjoner, insersjoner
![Page 41: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/41.jpg)
2. Manglende intracellulær transport og modifisering av reseptorproteinet
den vanligste typen, utgjør 50% av alle kjente mutasjoner
den intracellulære transporten mellom ER og Golgi-apparatet er helt eller delvis blokkert
proteinet får ikke de nødvendige modifikasjonene Lokalisering:
2/3 i det ligandbindende domenet 1/3 i domenet som har homologi
med forløperen for EGF
![Page 42: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/42.jpg)
3. Manglende binding av lipoproteiner
Fører til at reseptoren ikke binder LDL Lokalisering:
i det ligandbindende domenet i domenet som har homologi med forløperen for
EGF
![Page 43: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/43.jpg)
4. Manglende internalisering av reseptor-ligand komplekset
Resptorene konsentreres ikke i coated pits dermed kan heller ikke LDL internaliseres ved
reseptormediert endocytose Hovedsaklig lokalisert:
i det cytoplasmatiske domenet i det membranspennende domenet Av de 22 hydrofobe aminosyrene er det spesielt aminosyre
807 som er spesielt viktig.
![Page 44: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/44.jpg)
5. Manglende resirkulering av reseptor•reseptoren dissosieres ikke fra LDL i
endosomet.•reseptoren ikke kan resirkulering, og vil
derfor degraderes i lysosomene sammen med LDL.
•Type mutasjoner: missensmutasjoner eller delesjoner
•Lokalisasjon: domenet som har homologi med forløperen for EGF
![Page 45: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/45.jpg)
Elverum- variantenFH-Elverum mutasjonen er lokalisert til det ligandbindende
domenet.• Punktmutasjon: en G er byttet ut med en A på posisjon 1 av
intron 3. • Dette er en del av spleise setet sekvensen og fører mest
sannsynlig til at intron 3 ikke spleises ut av mRNA. • Resultat: null allel, et protein som forventes å være non-
funksjonelt. • Homozygoter for FH Elverum er reseptornegative.
• Denne mutasjonen ble funnet ved hjelp av PCR-metoden, sammen med FH Svartor (utskiftning av cytosin til guanin i exon 3)
Kilde: Leren T, m.fl, 1994 Atherosclerosis,Dec;111(2):175-82.
![Page 46: Pbl gjennomgang uke 9](https://reader034.fdocuments.net/reader034/viewer/2022052201/54686934b4af9f3a3f8b5cda/html5/thumbnails/46.jpg)