Panorama General del Genoma Humano - Presentación Segundo Nivel/BC06/07... · GENERAL DEL GENOMA...
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Región del HLA de tipo III en el cromosoma 6p21.3
Gen de la distrofina en el cromosoma Xp21
La densidad de genes no es homogéneaLa densidad de genes no es homogénea
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6p21.3Xp21
Oscuras
Comparativamente ricas en ATInsensibles a la DNAsaCondensación temprana en el ciclo celularReplicación tardíaBaja densidad génicaRicas en secuencias repetidas
Claras
Claras BANDA G
Comparativamente ricas en GCSensibles a la DNAsaCondensación tardía en el ciclo celularReplicación tempranaAlta densidad génicaPobres en secuencias repetidas
Oscuras BANDA R
La densidad génica se correlaciona con el La densidad génica se correlaciona con el bandeo cromosómicobandeo cromosómico
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Los genes humanos varían enormemente en tamaño y Los genes humanos varían enormemente en tamaño y cantidad de cantidad de exonesexones
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Genes codificantes para productos idénticosrepetidos en cluster (agrupados) o dispersos
HISTONAS• 11 clusters contienen los 60
genes de histonas. • 2 clusters mayores en el
cromosoma 6 y clustersmenores incluyendo solo uno o dos subtipos.
Familias génicasFamilias génicas
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rRNA• 1 única unidad transcripcional repetida unas 50 veces en 5 clusters
ubicados en los cromosomas 13, 14, 15, 21 y 22.• El rRNA 5S codificado por varios cientos de genes en 3 clusters en el
cromosoma 1.
5S
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Genes codificantes para productos con alta
homología agrupados en clusters
Distintos genes del grupo se expresan en diferentes
momentos del desarrollo o en distintos tejidos
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En los clusters génicos son frecuentes los pseudogenes
Copias defectuosas no funcionales de genes Pseudogenes no procesados (copias genómicas con intrones)Pseudogenes procesados (copias de regiones exónicasgeneradas por transcripción reversa)Fragmentos de genes truncados
Pseudogenes y fragmentos de genes
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Ubicación tipo de secuencias en las fracciones de Ubicación tipo de secuencias en las fracciones de reasociación del ADN humanoreasociación del ADN humano
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Dos Cromosomas Dos Cromosomas eeXXtraordtraordYYnariosnarios!!!!
Tenes razón hablemos de
sexo!!!
TenesTenes razón razón hablemos de hablemos de
sexo!!!sexo!!!
Esto está muy aburrido!!!
Esto está muy Esto está muy aburrido!!!aburrido!!!
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La casa de los espejos y los archivos XLa casa de los espejos y los archivos X
SkaletskySkaletsky et al. et al. NatureNature(2003) v423 p825(2003) v423 p825
RossRoss et al. et al. NatureNature(2005)434:325(2005)434:325
La secuencia que une los sexos
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El El cromosomacromosoma Y: Y: muchamucha ““basurabasura” y ” y unauna regiónregión machomacho--específicaespecífica
Skaletsky et al. Nature(2003)v423 p825SkaletskySkaletsky et al. et al. NatureNature(2003)v423 p825(2003)v423 p825
15%15%15%
20 %20 %20 %
65%65%65%
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Niveles de expresión, deleciones y patologíaNiveles de expresión, deleciones y patología 156 transcriptos156 transcriptos78 78 codificantescodificantes para proteínaspara proteínas
27 proteínas diferentes27 proteínas diferentes
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OrigenOrigen evolutivoevolutivo de de loslos genes en la genes en la regiónregión machomacho--específicaespecífica del Ydel Y
MarshalMarshal--Graves TIG(02) v18p259Graves TIG(02) v18p259
Evolución independiente de genes específicosde sexo, vinculados con fertilidad.
Existe recombinación intracromosómica en losrepetidos, dando lugar a conversión génica
Dadas las frecuencias, se calcula que cadavarón ha “convertido” 600 pb
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Características del cromosoma XCaracterísticas del cromosoma X
109810981098
Pobre en genes (1098)Baja densidad génica99 genes (10%) expresados en testículo y asociados a tumores
Rico en repetidos(56% vs 45% promedio)29% LINE1 disperso, asociado a Silenciamiento
10% de las enfermedades mendelianasasigadas (OMIM)
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El El origenorigen de de loslos cromosomascromosomas sexualessexuales
Comparación de cromosomas humanos con los del polloOrigen de los cromosomas sexuales hace 300 millones de años, a partir de autosomas.Xp homólogo a 1 polloXq homologo a 4 polloZ y W pollo homólogos a 9 humano.
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Propiedades por cromosomaPropiedades por cromosoma
VallenderVallender et al. et al. NatureNature GeneticsGenetics (2005)37:343(2005)37:343
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ORGANIZACION GENERAL DEL
GENOMA HUMANO
GENOMAMITOCONDRIAL
GENOMANUCLEAR
2 genes rRNA 22 genes tRNA 13 genes proteinas
Genoma Genoma mitocondrialmitocondrial
Genoma compacto 16.6 Kb
97 % codificanteTranscripción policistriónica
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Organización general del genoma humanoOrganización general del genoma humano
GENOMA NUCLEAR
GENOMA MITOCONDRIAL
3300 Mb Tamaño 16.6 Kb
23 (XX) 24 (XY) lineales Cantidad de moléculas de ADN distintas 1 circular
23 (n), 46 (2n) Cantidad de moléculas de ADN / célula Varios miles
cromatina Organizacion estructural (prot. Asociadas)
libre
35000 Cantidad de genes 37
1/ 40 Kb Densidad de genes 1/ 0.45 Kb
3% Porcentaje codificante 93 %
en la mayoria de los genes Intrones Ausentes
mayoritario ADN repetido Casi ausente
Universal Uso de código genético Mitocondrial
Bidireccional, origenes multiples Duplicación Unidireccional,
origen único para c/hebra
Monocistrónica Transcripción Policistrónica
Al menos 1 vez para cada par de cromosomas Recombinación No detectada
Mendeliana para autosomas y X, Paterna para Y Herencia Materna