Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis
-
Upload
cooper-jarvis -
Category
Documents
-
view
92 -
download
3
description
Transcript of Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis
![Page 1: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/1.jpg)
Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika
Mgr. Spiros Tavandzis Laboratoř klinické genetiky, P&R Lab a.s.
Onkologické centrum J. G. Mendela Nový Jičín
![Page 2: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/2.jpg)
Klonální povaha nádoruVzniká vícečetnými genetickými změnamiVšechny buňky nádoru pochází původně z
jediné mutované buňky = KLONprimární příčina vzniku nádoru = MUTACEFaktory ovlivňující vznik nádoru:
genetické faktory + vliv prostředí epigenetické změny: metylace, microRNA
![Page 3: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/3.jpg)
Základní dělení nádorůBenigní (nezhoubný) Maligní (zhoubný)pomalý růst rychlý růst
bez invaze do orgánů invaze do orgánů
bez angiogeneze angiogeneze
nemetastazuje metastazuje
ohraničen bez ohraničení
podoba s okolní tkání odlišné od okolní tkáně
nepostihuje uzliny uzliny zasaženy
Některé benigní nádory mohou být nebezpečné např. v CNS – utlačují nervovou tkáň
![Page 4: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/4.jpg)
Maligní nádory podle původu
Karcinomy – epiteliální tkáň (90% nádorů)Sarkomy – mezenchymální tkáňLymfomy – lymfatická tkáňLeukemie – hematopoetická tkáň
![Page 5: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/5.jpg)
Rozdělení nádorů z genetického hlediska
ZÍSKANÁ vs. DĚDĚNÁ ZMĚNA
Převážná většina nádorů vzniká spontánně aktivací určitých genů nebo jejich vyřazením z funkce = KANCEROGENEZE
Forma nádoru
% z celkového počtu výskytu nádoru Celoživotní
úroveň rizika vzniku
Způsob vzniku
ca prsu ca kolorekta
Sporadická 80% 75% Populačnínáhodně (prostředí)
Familiální 10-15% 20% Střednípolygenní + prostředí
Hereditární (predispozice) 5-10% 5% Vysoká monogen
ní
![Page 6: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/6.jpg)
Úrovně ochrany organismu před látkami přijímanými z prostředí (xenobiotiky)
Organismální (vylučování, pocení) Tkáňová (chemická modifikace xenobiotik v játrech)Buněčná (aktivita imunitních buněk, tvorba protilátek,
apoptóza poškozené buňky)Molekulárně genetická (reparace poškození DNA) v těle
vzniká v průběhu života cca 30-50 mutací/dipl. genom/generaci.
Příjem xenobiotik: potrava, tekutiny, vzduch = část negenetické složky variability
![Page 7: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/7.jpg)
INICIACE
PROMOCE
PROGRESE
ApoptózaBuněčná toxicita
Buňka s adukty Iniciovaná buňka
Reparace DNA
Normální buňka
Buněčné dělení
Buněčné dělení
Buněčné dělení
MALIGNÍ NÁDOR
PRENEOPLASTICKÁ LÉZE
GENOTOXICKÉ kancerogeny
NEGENOTOXICKÉ kancerogeny
- endokrinní faktory- zánět- výživa
Genetické změny
Další genetické změny
Detoxikační Systémy buňky
Proces kancerogeneze
![Page 8: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/8.jpg)
Proces kancerogenezeIniciace (mutace, onkogenní viry) - trvalá změna v
DNAPromoce – růstová výhodaProgrese - zisk dalších výhod (neomezený růst,
únik apoptóze, neoangiogeneze, nezávislost na podnětech)
Metastáze – extracelulární matrix, migrace,
PRO MALIGNÍ TRANSORMACI BUŇKY JE NUTNÝCH 6 – 7 GENETICKÝCH ZMĚN
![Page 9: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/9.jpg)
Vznik nádoru je boj mezi obrannými mechanizmy organizmu a nově získanými
vlastnostmi nádorové buňky
Základní úkol zdravé buňky je udržet svou genetickou informaci bez poškození
![Page 10: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/10.jpg)
Zisk nových vlastnostíNeomezený růst (vysoká aktivita telomerázy)Angiogeneze (zvýšená exprese VEGF)Nezávislost na růstových signálech (autokrinní
stimul)Nereaguje na sebevražedné signály Schopnost invaze (aktivní metaloproteázy,
kolagenázy)Schopnost průniku do krve nebo lymfy
(poškození mezibuněčné adheze
Tyto vlastnosti jsou v zájmu farmaceutických firem
![Page 11: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/11.jpg)
DOBRÉ – jsme schopni se bránit Reparace (mutátorové geny) Detoxikační systémy
ŠPATNÉ – poškození reparace = zvýšení mutační rychlosti až 1000x - poškození genů detoxikačního systému
POŠKOZENÍ INTEGRITY GENOMU
JEŠTĚ HORŠÍ – ztráta nádorového supresoru nebo aktivace protoonkogenu
NEJHORŠÍ – kombinace a kumulace změn
Maligní transformace buňkyDobré, špatné, ještě horší…
![Page 12: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/12.jpg)
Molekulární podstata kancerogeneze AKTIVACE PROTOONKOGENU
Způsoby aktivace:Mutace: c-K-ras ztráta GTPázové aktivity – trvale aktivní
Amplifikace: c-MycTranslokace: fůze bcr-abl Inzerční mutageneze: transdukce retrovirů
Funkce protoonkogenů: regulace b. dělení, přenos signálu Mutace protoonkogenů v somatických buňkách = nedědí seÚčinek mutace na fenotyp: autozomálně dominantní
Protoonkogen → onkogen → onkoprotein (cíl terapie)
aktivace
![Page 13: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/13.jpg)
Molekulární podstata kancerogeneze produkty ONKOGENŮ
Transkripční faktory: MYC, FOS, JUNNereceptorové proteinkinázy:G-proteiny: RASRůstové faktory: EGFReceptory růstových faktorů: EGFRmicroRNA inhibující nádorové supresory
Potenciální terapeutické cíle
![Page 14: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/14.jpg)
Molekulární podstata kancerogeneze NÁDOROVÉ SUPRESORY
Rb - retinoblastomAPC – familiální adenomatózní polypózaTP53 - Li-Fraumeniho syndrom (mutován u 50%
nádorů)
BRCA1/2 - karcinom prsu / vaječníkůMSH2, MLH1 – kolorektální karcinom
Funkce nádorových supresorů: potlačení proliferace buněk
Mutace v zárodečných buňkách = dědičná predispozice (AD)
Účinek mutace na fenotyp: autozomálně recesivní ztrátou heterozygozyty (mutace, delece, nondisjunkce atd.)
Reparační geny
![Page 15: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/15.jpg)
Léčba nádoruChemoterapie:
DNA poškozující (deriváty cis Pt) mitotické jedy (vinblastin apod.) – zástava replikace
Radioterapie – zlomy v DNA
Hormonální terapie (Tamoxifen)
Biologická léčba: Antiangiogenní Diferenciační Inhibitory proteazomu Inhibitory tyrosinkináz Léčba monoklonálními protilátkam
![Page 16: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/16.jpg)
Biologická léčba nádoruAntiangiogenní Diferenciační Inhibitory proteazomuInhibitory tyrosinkinázLéčba monoklonálními protilátkami
![Page 17: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/17.jpg)
Cílové struktury léčivSložky signálních drah (fůzní produkt bcr-abl – Glivec , CML)Receptory (EGFR, HER2/neu, ca prsu)proteazómy
Při léčbě sledovány také jiné markery
PredikcePrognózaUltrastagingSledování (MRN)
![Page 18: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/18.jpg)
Cílové struktury léčiv Složky signálních drah
Produkt fůzního genu bcr-abl: vznik translokaci t(9;22), chybí kinázová reg. doména → trvalá aktivita kinázy abl
Detekce fůzního produktu PCRCML -> lék Glivec = kompetitor původního substrátu
Fůzní produkty:Major – CML a 30-50% ALLMinor - ALL
![Page 19: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/19.jpg)
Cílové struktury léčivReceptory (HER2/neu,c-erbB2)
Amplifikace u 15-25% invazivních ca prsu: lék Herceptin (Trastuzumab)
Popis léku Použití Účinek Vznik rezistence k němu
![Page 20: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/20.jpg)
Cílové struktury léčivReceptory
![Page 21: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/21.jpg)
Detoxikační systém buňky - systém gp-P
Gp-P protein kódován genem MDR1 (multidrug-resistance)Rodina ABC transporterů (ATP binging cassette), 7 podrodinŠiroká substrátová specifita
Funkce: transport xenobiotik přes intra- a extracelulární membrány (ATP-dependentní „odtoková“ pumpa xenobiotik)
Lokalizace: játra, ledviny, střeva
Způsobuje rezistenci vůči široké škále lékům, včetně protinádorových.
![Page 22: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/22.jpg)
Detoxikační systém buňky - systém cytochrómu P450
První fáze detoxikace - transformační: zvyšování polarity xenobiotik (např. vazbou -OH skupin)
Účast také na přeměně promutagenů na genotoxické kancerogeny (epoxidy ap.)
Monooxygenázy závislé na cytochromu P450: Flavinové oxygenázy (odstraňují sloučeniny obsahující N,S,P) Reduktázy ADH, SOD, glutathionperoxidázy, katalázy
Druhá fáze detoxikace - konjugační: konjugace s produkty buňky a vyloučení
GST -> vysoká hladina v nádorech, braní léčbě Metyltransferázy- př. TPMT (thiopurin-S-methyltransferáza) UDP-glukuronozyltransferázy - > glukuronidace (játra, ledviny)
![Page 23: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/23.jpg)
Detoxikační systém buňky - systém cytochrómu P450
Aktivita enzymů (odezva na léčbu) je ovlivněna: faktory prostředí (podávání enzymových inhibitorů, strava,
hormony apod.) mutacemi v důležitých oblastech genů, které je kódují
pomalí metabolizátoři – mutace na obou alelách = kompletní deficit daného enzymu = kumulace léčiv (TOXICITA)
středně rychlí metabolizátoři – mutace na jedné alele – dostačuje běžná dávka
rychlí metabolizátoři - bez mutace = nedostatečná hladina léku (BĚŽNÁ DÁVKA NEÚČINNÁ)
![Page 24: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/24.jpg)
Zpracování xenobiotik systémem cytochromu P450
Monooxygenázy závislé na cytochromu p450: nadrodina CYP
18 rodinpodrodiny A-Q
Široká substrátová specifita (psychofarmaka,chemoterapeutika, imunosupresiva atd.)
inducibilita
![Page 25: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/25.jpg)
Nežádoucí účinky léků jsou 4. až 6. nejčastější příčinou úmrtí v
USA.
![Page 26: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/26.jpg)
Důvody rozdílné odezvy na léčbuIndividualita každého organismu:
Stejný lék -> různí lidé -> různá odezva (rezistence , toxicita, normální metabolizace)
(interakce genotyp <-> prostředí)
Rychlejší odstraňování léku z buněk (větší počet ABC transportérů)Snížená / zvýšená aktivita enzymu detoxikačního systému (mutace
enzymů detoxikační kaskády)V buňkách mohou chybět nebo mohou být změněny cílové proteiny
pro použitý lék (mutace, změna exprese)Vliv prostředí (hormony, strava, léky apod.)
NUTNÁ ÚPRAVA DÁVKY NEBO ZMĚNA LÉKU
![Page 27: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/27.jpg)
Farmakogenetika(-omika)Zkoumá účinnost léčby v závislosti na genotypu jedince.
Důvodem rozdílné odezvy na léčbu je variabilita na úrovni DNA(polymorfismy, delece, inzerce)
Farmakogenetika (-omika) poskytuje odpovědi na otázky:
Jak léčit? - správný výběr léku (lék na míru)Koho léčit? - výběr pacientů podle profitu z léčby
PREDIKCE a PROGNÓZA
![Page 28: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/28.jpg)
Farmakogenetika nebo farmakogenomika?
Farmakogenetika: analýza jednoho nebo několika polymorfismů u známých genů asociovaných s metabolizaci určitého léku.DNA úroveň – vliv mutace na aktivitu enzymu
Farmakogenomika: analýza expresního profilu velkého počtu nespecifikovaných genů (desítky až tisíce genů) u vybrané skupiny pacientů. RNA úroveň - porovnáváním expresních profilů
lze : vytipovat nebo sledovat expresi skupin genů asociovaných s
odpovědi na léčbu (neúčinnost léčby, toxicita). zjistit skupiny pacientů s příznivou x nepříznivou prognózou
![Page 29: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/29.jpg)
Metody farmakogenetiky PCR – sledování patogenních mutací ve
vybraných genech
Q-RT-PCR - sledování úrovně exprese několika genů
Microarrays – souběžná analýza velkého počtu genů (řádově až tisíce) – vyhledávání odlišností v expresním profilu
![Page 30: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/30.jpg)
Prognóza onemocnění a predikce léčby
Prognóza: dle výsledku stagingu a gradingunutné průběžně monitorovat účinek zvoleného
léku.
Včasný záchyt mikrometastáz (sledování MRN)
![Page 31: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/31.jpg)
Prognóza Klinický a histopatologický odhad rizika
je založen na sledování nepřímých parametrů:
• Věk • Velikost nádoru• Postižení lymf uzlin• Histologický grade atd.
Tyto směrnice mohou vést ke zbytečné léčbě mnoha pacientů!
Způsob léčbydle doporučení
směrnic EU a US
![Page 32: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/32.jpg)
Prognóza a monitoring léčbyStandardně používané metody
Histologie a IHC: PCAN, Ki67 prolif. aktivita, onkoproteiny, receptory HER2, ER
Fyzikální metody (MRI, CT apod.)
Biochemické a sérologické metody (ELISA) Cytogenetika
![Page 33: Obecná genetika nádoru, strategie léčby a farmakogenetika Mgr. Spiros Tavandzis](https://reader036.fdocuments.net/reader036/viewer/2022062517/568130af550346895d96c069/html5/thumbnails/33.jpg)
Prognóza a monitoring léčbyMolekulárně biologické a genomické metody
Imunomagnetická selekce nádorových buněk Krev
Ultrastaging - exprese vybraných genů asociovaných s nádorem
Q-real time RT-PCR Low density arrays Microarrays
Primární nádor