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Newsletter SIGU – Natale 2015 n. 5 Pag. 1 LA NEWSLETTER SIGU n°5 Cari Soci, è questo il terzo Natale che mi appresto a festeggiare con voi. Sarebbe banale riflettere sul tempo che passa così velocemente, ma è pur vero che anche questo mio impegno alla conduzione della SIGU sta volgendo al termine. L’atmosfera di festa che comincia a diffondersi si scontra con le difficoltà che incontriamo ogni giorno nella realtà quotidiana del nostro lavoro: il sistema sanitario è in difficoltà, come pure il mondo universitario. Alcuni indicatori ci dicono che stiamo uscendo dalla crisi di questi ultimi anni, ma i finanziamenti per le nostre attività continuano ad essere esigui, il personale che riusciamo a reclutare insufficiente alle necessità, e tutto questo è reso più preoccupante dall’invecchiamento dei professionisti coinvolti nella sanità e nella ricerca scientifica. Qualche indicazione positiva per la nostra disciplina sembra però concretizzarsi nel prossimo futuro: assistiamo in questo periodo ad un sempre maggior interesse - anche da parte dei media, delle istituzioni e dei cittadini – alla cosiddetta “medicina di precisione”. Mi riferisco, in particolare, al recente pronunciamento del Capo del Governo Renzi sull’impegno della sua amministrazione a sostenere in Italia le attività di genomica, o al maxiemendamento alla legge di stabilità ora in discussione che si propone – tra l’altro - di finanziare un progetto nazionale di genomica applicata alla sanità pubblica, volto alla realizzazione di un piano nazionale di implementazione medico sanitarie delle conoscenze e tecnologie genomiche con particolare riguardo al sequenziamento, analisi e valorizzazione scientifica delle sequenze genomiche della popolazione italiana. E con questi elementi di ottimismo che voglio augurare a tutti voi ed alle vostre famiglie un sereno periodo di festività natalizie ed un 2016 ricco di soddisfazioni A presto INDICE: AUGURI DAL NUOVO DIRETTIVO………………………………………………. Pag. 2 ATTIVITÀ SIGU 2015…………………………………………………………………. pag. 2 CONGRESSO SIGU 2015…………………………………………………………….. pag. 3 MODIFICA REGOLAMENTO SIGU………………………………………………… pag. 6 GRUPPI DI LAVORO……………………………………………………………………. pag. 6 COMMISSIONI SIGU…………………………………………………………………… pag. 8 COORDINAMENTI REGIONALI…………………………………………………….. pag. 8 DNA DAY 2016…………………………………………………………………………… pag. 9 LA APP DELLA SIGU………...………………………………………………………….. pag. 9 RAPPORTI CON LE ALTRE SOCIETÀ SCIENTIFICHE…………………………. pag. 10 XIX CONGRESSO NAZIONALE SIGU 2016 ………………………………….. pag. 11 NUOVI SOCI ……………………………………………………………………………… pag. 12 RICORDO DI LEOPOLDO ZELANTE……………………………………………….. pag. 14 VISTO E SENTITO ALL’ESHG 2015……………………………………………….. pag. 16 NEWS DALLA RICERCA………………………………………………………………. pag. 15

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LA NEWSLETTER SIGU n°5 Cari Soci, è questo il terzo Natale che mi appresto a festeggiare con voi. Sarebbe banale riflettere sul tempo che passa così velocemente, ma è pur vero che anche questo mio impegno alla conduzione della SIGU sta volgendo al termine. L’atmosfera di festa che comincia a diffondersi si scontra con le difficoltà che incontriamo ogni giorno nella realtà quotidiana del nostro lavoro: il sistema sanitario è in difficoltà, come pure il mondo universitario. Alcuni indicatori ci dicono che stiamo uscendo dalla crisi di questi ultimi anni, ma i finanziamenti per le nostre attività continuano ad essere esigui, il personale che riusciamo a reclutare insufficiente alle necessità, e tutto questo è reso più preoccupante dall’invecchiamento dei professionisti coinvolti nella sanità e nella ricerca scientifica. Qualche indicazione positiva per la nostra disciplina sembra però concretizzarsi nel prossimo futuro: assistiamo in questo periodo ad un sempre maggior interesse - anche da parte dei media, delle istituzioni e dei cittadini – alla cosiddetta “medicina di precisione”. Mi riferisco, in particolare, al recente pronunciamento del Capo del Governo Renzi sull’impegno della sua amministrazione a sostenere in Italia le attività di genomica, o al maxiemendamento alla legge di stabilità ora in discussione che si propone – tra l’altro - di finanziare un progetto nazionale di genomica applicata alla sanità pubblica, volto alla realizzazione di un piano nazionale di implementazione medico sanitarie delle conoscenze e tecnologie genomiche con particolare riguardo al sequenziamento, analisi e valorizzazione scientifica delle sequenze genomiche della popolazione italiana. E con questi elementi di ottimismo che voglio augurare a tutti voi ed alle vostre famiglie un sereno periodo di festività natalizie ed un 2016 ricco di soddisfazioni A presto

INDICE: AUGURI DAL NUOVO DIRETTIVO………………………………………………. Pag. 2 ATTIVITÀ SIGU 2015…………………………………………………………………. pag. 2 CONGRESSO SIGU 2015…………………………………………………………….. pag. 3 MODIFICA REGOLAMENTO SIGU………………………………………………… pag. 6 GRUPPI DI LAVORO……………………………………………………………………. pag. 6 COMMISSIONI SIGU…………………………………………………………………… pag. 8 COORDINAMENTI REGIONALI…………………………………………………….. pag. 8 DNA DAY 2016…………………………………………………………………………… pag. 9 LA APP DELLA SIGU………...………………………………………………………….. pag. 9 RAPPORTI CON LE ALTRE SOCIETÀ SCIENTIFICHE…………………………. pag. 10 XIX CONGRESSO NAZIONALE SIGU 2016 ………………………………….. pag. 11 NUOVI SOCI ……………………………………………………………………………… pag. 12 RICORDO DI LEOPOLDO ZELANTE……………………………………………….. pag. 14 VISTO E SENTITO ALL’ESHG 2015……………………………………………….. pag. 16 NEWS DALLA RICERCA………………………………………………………………. pag. 15

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IL NUOVO CONSIGLIO DIRETTIVO VI FA GLI AUGURI Il Consiglio Direttivo della SIGU – rinnovato dopo il convegno di Rimini, e composto da Antonio Amoroso (Presidente), Luciana Chessa (Consigliere), Domenico Coviello (Consigliere), Mattia Gentile (Consigliere), Elisabetta Lenzini (Consigliere), Antonio Novelli (Consigliere), Gioacchino Scarano (Consigliere) – vi augura assieme a Maurizio Genuardi (Presidente Eletto) e Daniela Giardino (Segretario-Tesoriere) un buon Natale 2015 ed un felice 2016. Nel contempo ringrazia Marco Seri (consigliere uscente) per l’impegno costante e il grande supporto che ha dato al CD SIGU ed all’intera Società.

ATTIVITÀ SIGU 2 e 3 trimestre 2015 e DOCUMENTI LICENZIATI (a cura di Daniela Giardino)

• Sotto l’egida dell'Associazione Culturale Giuseppe Dossetti e di GIMBE (Gruppo Italiano per la Medicina Basata sulle Evidenze) lunedì 15.06.2015 si è tenuta a Palazzo Montecitorio la terza giornata degli Stati Generali della Salute “Supremazia Statale - La nostra proposta per un Servizio Sanitario Nazionale”. Scopo dell'incontro era illustrare le proposte di modifica del testo di riforma della Carta Costituzionale, approvato in prima lettura dalla Camera dei Deputati il 10.03.2015, che assegna allo Stato 'la determinazione dei livelli essenziali delle prestazioni concernenti i diritti civili e sociali che devono essere garantiti su tutto il territorio nazionale'. Le modifiche richieste riguardano l'inserimento nel testo della voce 'diritti sanitari', stante che l'art. 32 della Costituzione pone come unico diritto fondamentale quello della tutela della salute. All'incontro è intervenuta, in rappresentanza della SIGU, il consigliere Luciana Chessa, che ha confermato il pieno appoggio della SIGU ad una migliore statalizzazione delle prestazioni assistenziali e sottolineato l'assurda situazione delle differenze esistenti tra le varie regioni per le prestazioni di Genetica Medica.

• I consiglieri Domenico Coviello e Gioacchino Scarano hanno partecipato al workshop "European Reference Networks (ERNs)" del 3 luglio scorso presso l'Istituto Superiore di Sanità. L'iniziativa aveva l'obiettivo di informare clinici, ricercatori e tutti gli stakeholders su aspetti generali e specifici degli ERNs, incluse la normativa e le procedure europee.

• Il 23 luglio a Roma, presso Palazzo Montecitorio, è stato presentato il "I Rapporto sulla condizione delle persone con Malattia Rara in Italia, MonitoRARE" che ha illustrato in modo dettagliato il quadro nazionale in termini di accesso alla diagnosi, alle terapie, all’assistenza, di organizzazione socio-sanitaria, di formazione e informazione, di ricerca, e di responsabilità sociale. I dati sono stati raccolti da UNIAMO anche grazie al contributo di SIGU, presente all'evento nella persona del suo Presidente.

• Il Presidente SIGU ha ricevuto da AGENAS informazioni circa il Tavolo di Lavoro "Reti oncologiche e percorsi clinico-assistenziali in oncologia" a cui partecipano per SIGU Maurizio Genuardi e Liliana Varesco. Il tavolo sta lavorando alla

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composizione di un documento, dal taglio spiccatamente tecnico-professionale, in supporto alla Guida per le Reti (che costituisce parte dell'allegato tecnico relativo al Documento di Intesa tra Stato e Regioni del 30 ottobre 2014).

• Il Presidente SIGU ha partecipato a due riunioni presso la sede di AGENAS, la prima il 20 ottobre e la seconda il 2 novembre, sempre alla presenza del ministro Beatrice Lorenzin e dei rappresentanti delle società scientifiche aderenti alla FISM. In entrambi gli incontri si è più volte ribadita la necessità di una regolamentazione degli aspetti istitutivi ed organizzativi delle società scientifiche, la cui concretizzazione deve essere ricercata attraverso l’istituzione di un apposito albo. Il Ministro Lorenzin ha comunicato che si sta esaminando l’iter istituzionale più corretto. Il Dr. Bevere, Direttore di Agenas, ha sottolineato la centralità di FISM come unico organismo riconosciuto a livello ministeriale e dichiarato di non voler avviare tavoli tecnici con società alternative. L’incontro è poi proseguito con la discussione dei problemi e quesiti posti dalle diverse società affiliate della cui raccolta si è occupata FISM. Alla discussione erano presenti i funzionari del ministero dottori Guerra, Botti, e Augenti. I temi trattati sono stati: appropriatezza prescrittiva e LEA; responsabilità professionale e medicina; individuazione di consulenti tecnici presso i tribunali, scelti secondo criteri oggettivi ed iscritti in un apposito albo; organizzazione della sanità a valenza nazionale; integrazione ospedale-territorio; valutazione dei Direttori Generali sulla base dei criteri indicati dal DDL di riforma della Pubblica Amministrazione e dei successivi decreti attuativi.

• A seguito della pubblicazione su Quotidiano Sanità della notizia reperibile al seguente indirizzo e che riporta il parere negativo di alcune società scientifiche nazionali attive nel campo della procreazione assistita (Cecos, Sifes e Mr, Sios.E) al nuovo Regolamento proposto dal Ministero della Salute in merito allo Screening Genetico dei Donatori di Gameti, che prevede l’obbligo che i Donatori siano sottoposti a consulenza genetica, la SIGU è intervenuta con la seguente lettera.

CONGRESSO SIGU 2015 Il XVIII Congresso SIGU, che si è svolto a Rimini dal 21 al 24 ottobre 2015, ha visto la partecipazione di 523 iscritti, così suddivisi per area geografica e ente di appartenenza:

Assistiamo ad una flessione della partecipazione al Convegno, che negli ultimi anni si è progressivamente ridotta, dai circa 1000 dei congressi di Torino 2009 e Firenze 2010. Anche gli abstract sottoposti al convegno sono in calo: al Convegno di Rimini sono stati 136 per le Comunicazioni orali e 295 come Poster. Il CD SIGU vuole ringraziare il Comitato Scientifico del Convegno per il grande lavoro che ha svolto per proporre un programma di grande interesse e per la valutazione dei contributi presentati. Ha infine particolarmente apprezzato

le valutazioni ed i suggerimenti che il Comitato Scientifico ha fatto per fronteggiare il calo di partecipazione dei Soci.

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I premiati al XVIII Congresso SIGU Qui di seguito vogliamo complimentarci con i vincitori dei premi

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MODIFICA REGOLAMENTO SIGU (a cura di Daniela Giardino) Durante l’Assemblea SIGU, svoltasi il giorno 22 ottobre 2015 con la presenza di 165 soci attivi, è stata approvata la nuova versione del regolamento SIGU, che può essere consultata sul portale SIGU. (http://www.sigu.net/documenti/Regolamento_2015.pdf) Il CD della SIGU si era impegnato nella revisione con un duplice intento: a) precisare modalità di comportamento in situazioni particolari, venutesi a creare nel corso del 2015, non regolamentate e per le quali il CD SIGU è stato invitato ad esprimersi e b) evitare l’accumulo di incarichi. GRUPPI DI LAVORO GDL SIGU EPIGENOMICA (a cura di Lucia Migliore) Nell'ambito del GdL Epigenetica si stanno delineando specifici settori di interesse: la diagnostica di malattie da difetti dell'imprinting (corso post-congressuale SIGU: Approcci diagnostici per l'identificazione di alterazioni epigenetiche costitutive, coordinatori Miozzo e Riccio); il ruolo delle modificazioni epigenetiche nei tumori (riunione congiunta con il GdL Genetica Oncologica, SIGU, Rimini, 21 ottobre); l'origine embrio-fetale delle malattie nell'adulto (DOHaD, developmental origins of health and disease, corso dedicato organizzato dalla SIMP, Società Italiana di Medicina Perinatale, Assisi, 2 dicembre, a cui sono stati invitati Migliore e Stuppia). In quest'ambito sono stati individuati interessi comuni e l'intento di organizzare corsi/sessioni di congressi congiuntamente con il GdL EPISIGU. GDL GENETICA CLINICA (a cura di Alessandra Renieri) Durante l’anno 2015, il primo anno del mio mandato, sono stati svolti 4 incontri del gruppo di lavoro in Genetica Clinica con la formula itinerante nel territorio italiano al fine di coinvolgere il maggior numero di medici specialisti: il 3 gennaio a Genova, il 9 aprile a Roma, il 19 giugno a Reggio Emilia e il 28 settembre a Torino. Tutti gli incontri

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sono stati accreditati con ECM secondo la formula dell’accreditamento locale da parte dell’azienda ospitante. Agli incontri ha partecipato un numero crescente di persone dalle 40-50 persone dei primi incontri alle 70 dell’ultimo incontro a Torino dove abbiamo avuto anche i saluti del nostro presidente SIGU prof. Antonio Amoroso. Il numero dei soci SIGU iscritti formalmente al GdL che è ripartito da zero all’inizio del mio mandato, è andato aumentando durante l’anno arrivando al numero di quasi 100 soci. Tutti gli iscritti hanno ricevuto un verbale pochi giorni dopo l’incontro. Ogni incontro è stato incentrato sulla discussione di casi clinici al fine di affinare le capacità diagnostiche prevalentemente dismorfologiche, ma non solo. E’ stato inoltre dedicato spazio ad aggiornamento su terapie già in commercio o in fase avanzata di trial clinici per ribadire (e aggiornare) il ruolo attivo del gentista clinico anche nelle programmazione terapeutica. Per aumentare la reciproca conoscenza dei partecipanti è stato dedicato uno spazio alla presentazione delle singole persone (a rotazione per area geografica). E’ stato infine introdotto uno spazio per la condivisione di facsimili per consulenze genetiche su malattie o gruppi di malattie specifiche. Ogni incontro ha avuto anche una lettura principale dedicata ad argomenti professionali (decreto malattie rare), scientifico-professionali (i risultati array-CGH di significato incerto, management delle sindromi genomiche e nuove sindromi) o focus su specifiche malattie (sindrome fetoalcolica) Tutto il materiale proiettato inclusi i casi clinici e il follow-up degli stessi è scaricabile per gli iscritti al GdL dietro password protetta al sito http://www3.unisi.it/ricerca/dottorationweb/genetica_medica/incontri_di_genetica_clinica/incontri_.htm Tutti gli incontri 2015 sono stati congiunti con la società SIMGePed, (Società Italiana Malattie Genetiche Pediatriche e Disabilità). Per questa attiva collaborazione voglio ringraziare il presidente SIMGePed Luigi Memo che è anche socio SIGU di lunga data. Uno degli incontri, quello di Roma, è stato congiunto anche con il GdL di Epigenetica e SIFASD e il primo incontro del 2016 previsto a Ferrara per il 28 gennaio, sarà congiunto con il Gdl di Genetica Molecolare. A seguire per il 2016 si prevedono i seguenti incontri: 11 aprile Napoli, 13 giugno Catania (in congiunzione anche con SINP Società Italiana di Neurologia Pediatrica) e 19 settembre Milano. Anche per il 2016 tutti gli incontri saranno congiunti con SIMGePed.

GDL SIGU CITOGENETICA (a cura di Antonio Novelli) La attività del GDL Citogenetica nel corso del 2015 ha visto una naturale prosecuzione del lavoro degli anni precedenti nel quadro della applicazione delle tecniche microarrays nella citogenetica. Dal Position Statement al ruolo nella nuova formulazione delle linee guida SIGU in Citogenetica del 2013, i microarrays in citogenetica hanno assunto un posto importante nella quotidianità. Nell'anno in corso sono stati fissati due punti importanti non a caso inseriti nel meeting programmatico del 25 febbraio a Roma: CNV (Copy Number Variation) ad espressività variabile ed il loro ruolo nella dinamica clinica, Microarrays a bassa risoluzione come strumento per il progresso tecnico ad integrazione della citogenetica prenatale. Sul primo punto è stata presentato il prototipo di un portale di condivisione di dati, come strumento di ausilio per l'interpretazione dei dati di CNVs non francamente patogenetiche in diagnosi prenatale, che prevede la costituzione di un comitato di esperti che possa confrontarsi in tempo reale. Nello stesso tempo ha lo scopo di creare un database di dati di CNV raccolti in diagnosi prenatale con dati di follow-up. Su richiesta di alcuni soci, il portale è stato inoltre ampliato per contenere una pagina dedicata alle problematiche della nomenclatura in citogenetica (ISCN), con la possibilità di interpellare anche in questo caso un gruppo di esperti che possa aiutare nella codificazione in base all'ISCN di casi particolarmente complessi. Il portale è dinamico ed è possibile ampliarlo su richiesta, ad esempio diventando strumento di supporto per la problematica degli incidental findings (IF) in generale. Sul secondo punto, l'esperienza avviata da alcuni laboratori di Citogenetica italiani sull'utilizzo del cariotipo associato a una piattaforma oligo dimostra un sensibile miglioramento nella standardizzazione delle procedure routinarie di analisi del cariotipo fetale, in particolare nel ridurre la probabilità di riscontrare VOUS (varianti ad incerto significato), nel ridurre la probabilità di riscontrare CNV associate a patologie ad espressività variabile e penetranza incompleta, a esordio tardivo e loci di suscettibilità, nel fornire risultati maggiormente gestibili in consulenza genetica ,

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nonché maggiore facilità per il test di conferma (più alto numero di CNV in regioni note: disponibilità di sonde FISH commerciali) . GDL SIGU GENETICA ONCOLOGICA (a cura di Lilli Varesco) Riunioni: - Incontro congiunto dei GdL SIGU-ONC e Genetica Molecolare, svoltosi a Roma il 7

maggio, avente come tema la refertazione di analisi molecolari, con particolare riferimento ai test di oncogenetica costituzionale.

- I due incontri annuali del gruppo di Genetica Clinica Oncologica, svoltisi a Bologna il 10 luglio e l’11 dicembre, a cura di Daniela Turchetti, Barbara Pasini e Maurizio Genuardi. Nel corso del secondo incontro è stato discusso ulteriormente il percorso di refertazione dei test di oncogenetica.

- IV incontro del Forum Nazionale ONCOGenETICA, svoltosi a Genova il 16 gennaio, a cura di Linda Battistuzzi, Paola Ghiorzo, Stefania Sciallero e Liliana Varesco.

- Incontro congiunto dei GdL EPISIGU e SIGU-ONC, svoltosi a Rimini il 21 ottobre, nell’ambito del Congresso nazionale.

Documenti: “Raccomandazioni per l’implementazione dei test BRCA nei percorsi assistenziali e terapeutici delle pazienti con carcinoma ovarico”. (documento congiunto AIOM-SIGU-SiBIOC-SIAPEC/AIP, alla cui stesura hanno collaborato i membri del GdL SIGU-ONC Maurizio Genuardi, Barbara Pasini, Paolo Radice e Liliana Varesco). COMMISSIONI SIGU COMMISSIONI PER LA CERTIFICAZIONE DELLE STRUTTURE DI GENETICA (a cura di Daniela Giardino) • La commissione SIGUCERT ha dato mandato al gruppo degli Auditor SIGU di

rivedere gli standard in relazione alla recente pubblicazione della norma ISO 9001:2015. Gli Auditor, riunitisi a Rimini, si sono dati come obiettivo di sottoporre alla commissione la revisione entro il mese di giugno 2016.

COMMISSIONE NGS (a cura di Marco Seri)

• Il documento SIGU di indirizzo NGS, redatto dall’apposita commissione è stato approvato dal CD SIGU nella riunione del 18 dicembre e a breve sarà a disposizione sul sito.

COORDINAMENTI REGIONALI (a cura di Daniela Giardino) Nel corso del 2015 si sono svolte, in alcune regioni, le votazioni per le elezioni dei coordinatori regionali. L’elenco dei coordinatori neo- o ri-eletti nel suddetto periodo è riportato nella tabella sottostante:

Le regioni Calabria, Umbria e Marche e le Province Autonome di Trento e Bolzano stanno organizzando le elezioni dei rispettivi coordinatori. Auguriamo buon lavoro ai nostri colleghi

Regione Data ElezioneScadenza Mandato

Data Elezione

Scadenza Mandato

Friuli Venezia Giulia Pecile Vanna 28/09/2011 28/09/2014 13/02/2015 13/02/2018Sardegna Rosatelli Cristina 20/09/2011 20/09/2014 29/05/2015 29/05/2018Veneto-Area Clinica Clementi Maurizio 11/10/2011 11/10/2014 27/04/2015 27/04/2018Veneto-Area Laboratorio Montaldi Annamaria 11/10/2011 11/10/2014 27/04/2015 27/04/2018Lazio Grammatico Paola 19/10/2011 19/10/2014 14/04/2015 14/04/2018Puglia-Basilicata Gentile Mattia 02/11/2011 02/11/2014 19/06/2015 19/06/2018Piemonte-Valle d'Aosta Brusco Alfredo 03/11/2011 03/11/2014 06/03/2015 06/03/2018Campania Scarano Gioacchino 05/11/2011 05/11/2014 23/09/2015 23/09/2018Toscana Giglio Sabrina 19/02/2015 19/02/2018Trento e Bolzano Belli Serena 02/12/2011 02/12/2014Lombardia-Area Clinica Cavalli Pietro 11/12/2014 11/12/2017Lombardia-Area Laboratorio Stioui Sabine 11/12/2014 11/12/2017Sicilia Ragusa Angela 20/09/2013 20/09/2016Emilia_Romagna Sensi Alberto 19/12/2014 19/12/2017Umbria-Marche Donti Emilio 10/02/2012 10/02/2015Liguria-Area Laboratorio Malacarne Michela 15/04/2015 15/04/2018Liguria-Area Clinica Varesco Liliana 15/04/2015 15/04/2018Abruzzo-Molise-Area Clinica Guanciali Franchi Paolo 23/05/2015 23/05/2018Abruzzo-Molise-Area Lab D’Alessandro Elvira 23/05/2015 23/05/2018RegioneCalabria Laganà

Incaricato CD per elezioni

Coordinatore

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DNA DAY 2016 (a cura di Beatrice Zanini) Anche quest’anno la Società Europea di Genetica Umana (ESHG) ha promosso il DNA DAY ESSAY CONTEST 2016 per gli studenti europei delle scuole superiori, congiuntamente alla Società Americana di Genetica Umana (ASHG) per celebrare il DNA Day, il 25 Aprile. I temi proposti all’attenzione degli studenti per il 2016 e le modalità di partecipazione sono consultabili sul sito http://www.dnaday.eu/. La SIGU, anche quest'anno, raccoglie con piacere l'invito dell'ESHG e promuove l'iniziativa europea in Italia, riconoscendone l'alto valore didattico e culturale al fine di: - contribuire a far progredire una riflessione seria e approfondita sui temi della

ricerca in genetica umana e sulle sue implicazioni sociali ed etiche - stimolare rapporti di collaborazione tra associazioni di categoria, scuola e ricerca

scientifica - valorizzare e premiare l’eccellenza

La SIGU metterà a disposizione ulteriori 3 premi per gli elaborati degli studenti italiani partecipanti, e la premiazione si svolgerà durante il convegno SIGU, che il prossimo anno si svolgerà a Torino, dal 23 - 26 Novembre 2016. Le informazioni relative a questa iniziativa sono disponibili al sito www.sigu.net La SIGU ha indirizzato una lettera ai Direttori Scolastici di tutte le Regione per divulgare questa importante iniziativa e favorire la partecipazione degli studenti al concorso. LA APP DELLA SIGU (a cura di Elisabetta Lenzini) E’ finalmente disponibile, per chi ne sia interessato, l’utilissima applicazione della SIGU per smartphone (Android), per scaricarla è sufficiente inserire nel campo di ricerca il termine “SIGU”. Siamo così in grado di avere nelle nostre mani, con estrema immediatezza, una interfaccia con la Società Italiana di Genetica Umana, che ci consente di essere aggiornati in tempo reale sulle iniziative intraprese dalla Società,

avendo anche la possibilità di poter consultare eventi passati, linee guida e indirizzi utili. La nuova App è uno strumento di facile utilizzo, con un menu intuitivo che riporta in pratica le parti salienti del sito web SIGU: - Chi siamo (organigramma, statuto e regolamento ) - Aree news: pubblicazione di tutte le news presenti sul sito - Finalità ed Obiettivi - Formazione (calendario eventi) - Diventa socio - Contatti

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Particolarmente interessante la parte sulla formazione che collega direttamente ai siti degli eventi, molto utile anche il link diretto agli indirizzi e-mail dei referenti nazionali e regionali e ai contatti della segreteria. RAPPORTI CON LE ALTRE SOCIETÀ SCIENTIFICHE FISM • La SIGU ha aderito alla iniziativa SDA Bocconi – FISM riguardante la conoscenza,

da parte dei direttori di UOS/UOC, dei requisiti minimi strutturali, organizzativi e professionali per il governo del rischio clinico e dei requisiti di accreditamento. I soci SIGU hanno risposto in maniera positiva all’invito del CD a partecipare: sono infatti 37 quelli compilati da Soci SIGU.

• In data 25 settembre a Firenze si è tenuta l’Assemblea FISM per l’elezione del CD FISM, cui ha partecipato su delega del Presidente SIGU il consigliere Coviello. Il consigliere Marco Seri, candidato per SIGU, non è risultato eletto ma il Presidente FISM ha assicurato che la SIGU verrà costantemente informata sulle iniziative in corso e interpellata ogni volta.

Qui di seguito gli eletti al CD FISM:

FISMELAB Le riunioni del CD FISMELAB si sono svolte a Milano il 9 giugno ed il 16 novembre.

• Il Presidente della SIGU ha ricevuto da FISMELAB ed ha sottoscritto con l’approvazione del CD SIGU il manifesto proposto da Assodiagnostici, a cui hanno anche aderito FISM e Cittadinanza attiva, avente lo scopo di ricordare alle Istituzioni come la sostenibilità del SSN si realizzi attraverso il miglioramento dell’efficienza e la sua valorizzazione, non con i tagli lineari, e con il contributo decisionale dei professionisti, a tutela della qualità delle prestazioni sanitarie e della salute dei pazienti.

• Il Presidente SIGU ha inviato al Presidente FISMELAB la lettera da indirizzare ai Ministri Stefania Giannini (MIUR) e Beatrice Lorenzin (Ministero della Salute) con cui si esprime la preoccupazione che i Laureati in discipline non mediche siano oggetto di discriminazione, essendo attualmente esclusi dal percorso formativo della specializzazione e quindi dall’accesso alle posizioni di Dirigenza Sanitaria. La FISMELAB ha richiesto a MIUR e Ministero della Salute di risolvere la questione in tempi brevi e programmando un adeguato numero di contratti di formazione per specializzandi non medici. A questo proposito si è messa a disposizione per trovare soluzioni che garantiscano il diritto alla formazione specialistica per tutte le categorie della dirigenza sanitaria. La lettera è scaricabile dal sito della SIGU: LINK

• Alla SIGU è stato chiesto di proporre i nominativi di due rappresentanti per il costituendo tavolo di lavoro FISMELAB/ACCREDIA finalizzato a individuare il percorso per l’accreditamento dei laboratori secondo la norma ISO 15189. Il CD SIGU ha indicato i nominativi dei soci Daniela Giardino, in qualità di coordinatore della commissione SIGU per la certificazione delle strutture di genetica e Domenico Coviello, in qualità di Auditor SIGU e membro del CD SIGU di nuova rielezione. E’ stato inoltre richiesto di fornire il nominativo di un socio esperto nelle problematiche relative alla raccolta ed al trasporto dei campioni biologici da sottoporre ad analisi di laboratorio e nel settore delle Biobanche. Il CD ha indicato il nominativo del socio Mirella Filocamo.

AIOM Importante contributo alla stesura delle “Raccomandazioni per l’implementazione del test BRCA nei percorsi assistenziali e terapeutici delle pazienti con carcinoma ovarico”

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è stato fornito dai rappresentanti del GdL SIGU di Genetica Oncologica (Liliana Varesco, Barbara Pasini, Paolo Radice e Maurizio Genuardi). Il documento è stato redatto con i rappresentanti di AIOM, SIBIOC e SIAPEC. SIEDP Il Presidente ha partecipato alla sessione congiunta SIGU-SIEDP organizzata in occasione del convegno della SIEDP, svoltosi il 25-27 ottobre scorsi a Roma. Ha moderato la sessione dal titolo: “Interazione tra genetisti ed endocrinologi nella gestione del bambino con bassa statura” insieme al Presidente SIEDP M. Maghnie. La sessione ha visto gli interventi di: S. LocheIl “Progetto SIGU-SIEDP”; G. Scarano “Selezione del paziente sulla base del fenotipo”; M. Cappa “Quali forme monogeniche?”; F. Brancati “Metodologie genetiche”; L. Mazzanti “Conclusioni e take home messages”. XIX CONGRESSO NAZIONALE SIGU 2016 (a cura di Antonio Amoroso) Il Congresso della SIGU 2016 si svolgerà a Torino da 23 al 25 novembre 2016. Come d’abitudine, i Soci sono stati richiesti di proporre argomenti: sono state inviate più di 35 proposte, che ora spetterà al Comitato Scientifico (CS) del Convegno analizzare. Il CD ringrazia i componenti del CS per avere accettato questo impegno ed augura loro un buon lavoro: Andrea Ballabio (coordinatore), Alfredo Brusco, Palma Finelli, Paola Grammatico, Giuseppe Matullo, Giuseppe Merla, Martino Ruggeri, Anna Savoia, Liliana Varesco, Nicola Brunetti-Pierri, Gioacchino Scarano ed Elisabetta Lenzini (quali componenti CD SIGU) A breve saranno fornite le informazioni utili per la presentazione degli abstract. Arrivederci a Torino, dunque.

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NUOVI SOCI Il CD della SIGU dà il benvenuto all’interno della nostra comunità ai seguenti nuovi Soci, ammessi nel corso del 2015

N° Cognome Nome Socio Presentatore Socio Presentatore1 Amabile Sonia Ilaria Meloni Mafalda Mucciolo2 Bacci Costanza Maurizio Genuardi Orsola Privitera 3 Ballabio Andrea Antonio Amoroso Maurizio Genuardi4 Banfi Sandro Franco Brunella Alberto Auricchio 5 Barbon Giovanni Francesca Schiavi Isabella Mammi6 Berera Camilla Marco Fichera Teresa Mattina7 Betti Martina Francesca Torricelli Stefania Bonifacio8 Biso Paola Marco Seri Maria Carla Pittalis9 Bonaldi Laura Elisabetta Lenzini Anna Leszl10 Boni Marina Orsetta Zuffardi Elena Rossi11 Borsani Giuseppe Giorgio Casari Massimo Gennarelli12 Bosco Paolo Pinella Failla Corrado Romano13 Buldrini Barbara Alessandra Ferlini Sergio Fini14 Buonadonna Antonia Lucia Carla Cesarano Mattia Gentile15 Carignani Giulia Alessandra Renieri Francesca Mari16 Cariola Filomena Antonella Pico Mattia Gentile17 Casalis Cavalchini Guido Claudio Barbara Pasini Cecilia Bracco 18 Cassina Matteo Maurizio Clementi Elena Di Gianantonio19 Ciccodicola Alfredo Vincenzo Nigro Andrea Riccio20 Cocciadiferro Dario Giuseppe Merla Lucia Micale21 Colombaro Elisa Salvatore Gallone Elisa Savin22 Congregati Caterina Maria Adelaide Caligo Ines Zanna 23 Costa Asia Marco Fichera Teresa Mattina24 Cusato Jessica Paola Borgiani Massimo Gennarelli25 De Vita Gabriella Achille Iolascon Lucio Nitsch26 Di Benedetto Daniela Angela Ragusa Sebastiano Bianca27 Disabella Eliana Eloisa Arbustini Giovanni Porta28 Donati Ilaria Alberto Sensi Stefania Bigoni29 Fabretto Antonella Marcello Morgutti Vanna Pecile30 Falcinelli Cristina Antonio Percesepe Sandra Santucci

31 Falco Mariateresa Gioacchino Scarano Fortunato Lonardo32 Falvella Felicia Stefania Monica Miozzo Silvia Sirchia33 Fenoglio Pierpaola Salvatore Gallone Elisa Savin34 Ficarella Romina Mattia Gentile Lucia Buonadonna35 Fontana Paolo Gioacchino Scarano Fortunato Lonardo36 Frullanti Elisa Francesca Mari Ilaria Meloni37 Fusco Carmela Giuseppe Merla Lucia Micale38 Garofalo Arcomaria Vincenzo Nigro Giuseppina Di Fruscio39 Gauci Rosaria Marco Fichera Teresa Mattina40 Germani Chiara Emiliano Giardina Stefania Zampatti41 Giacchè Mara Luigi Mori Silvia Clara Giliani42 Giliani Silvia Clara Gianfranco Savoldi Cinzia Mazza 43 Gruppioni Rita Alessandra Ferlini Sergio Fini44 Gulisano Anna Marco Fichera Teresa Mattina45 Iorfida Maria Antonietta Luciana Chessa Marco Seri46 Isidori Ilenia Paolo Prontera Gabriela Stangoni47 Isidori Ilenia Paolo Prontera Gabriela Stangoni48 Langella Concetta Gioacchino Scarano Francesca Scarano49 Lanza Maria Virginia Francesca Schiavi Isabella Mammi50 Lusso Riccardo Antonio Amoroso Alfredo Brusco51 Madia Francesca Michela Malacarne Simona Cavani 52 Maestrini Elena Marco Seri Orsetta Zuffardi53 Malerba Natascia Giuseppe Merla Lucia Micale54 Malvestiti Barbara Francesca R. Grati Giuseppe Simoni55 Mandriani Barbara Giuseppe Merla Lucia Micale56 Mantovani Vilma Daniela Turchetti Marco Seri57 Mattarozzi Angela Marco Seri Maria Carla Pittalis58 Mazara Marcella Vita Antonino Giambona Salvina Lauricella59 Menozzi Cristina Sandra Santucci Antonio Percesepe60 Mercadante Francesca Maria Piccione Nicoletta Resta

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A tutti i nostri soci porgiamo un saluto di benvenuto ed un augurio di buon lavoro

Il Grafico illustra il numero di nuovi soci ammessi nel 2014 e nel 2015

61 Nanna Caterina Mattia Gentile Antonella Pico62 Nicola Volpe Anna Lama Michela Malacarne 63 Nicotra Valeria Teresa Mattina Marco Fichera64 Novara Francesca Orsetta Zuffardi Roberto Ciccone65 Nuzzi Maria Cristina Mattia Gentile Antonia L. Buonadonna66 Ottaviani Valentina Paolo Prontera Daniela Rogaia67 Palumbo Pietro Orazio Palumbo Massimo Carella 68 Paraskevas Iatropoulos Pietro Cavalli Massimo Gennarelli69 Pelle Alessandra Daniela Fr. Giachino Diana Carli70 Pennesi Giuseppina Paola Grammatico Luciana Chessa71 Peron Angela Monica Miozzo Federica Natacci72 Perrelli Nicola Flavio Francesca Cambosu Maurizio Ferrari73 Petracca Antonio Elisabetta Pelo Cinzia Castagnini74 Pilato Brunella Stefania Tommasi Liliana Varesco75 Pinto Anna Maria Ilaria Meloni Francesca Mari76 Pirola Barbara Maria Maurizio Ferrari Maria Grazia Patricelli77 Pitta Roberta Teresa Mattina Marco Fichera78 Praticò Elena Rita Concetta Simona PerrotTeresa Mattina 79 Pregno Giulia Mario De Marchi Giorgia Mandrile80 Rampoldi Luca Antonio Amoroso Mario De Marchi81 Rampoldi Luca Mario De Marchi AntonioAmoroso82 Roversi Gaia Angela Bentivegna Nicoletta Villa83 Ruggieri Martino Gioacchino Scarano Manuela Priolo84 Saccuzzo Lucia Rita Marco Fichera Teresa Mattina85 Salvaderi Luca Emiliano Giardina Stefania Zampatti86 Sangiuolo Federica Francesca Amati Paola Borgiani87 Saveja Anna Maria Piccione Silvia Maitz88 Schiavi Francesca Isabella Mammi Stefania Boni89 Selicorni Angelo Alessandra Renieri Silvia Maitz90 Taschin Elisa Francesca Schiavi Isabella Mammi91 Tocco Giusy Mattia Gentile Antonella Pico92 Tricarico Rossella Maurizio Genuardi Giovanni Neri93 Trimarchi Gabriele Teresa Mattina Marco Fichera94 Venuto Santina Giuseppe Merla Lucia Micale95 Verri Annalisa Roberto Ciccone Elena Repetti 96 Villa Chiara Romina Combi Angela Bentivegna97 Zanna Ines Maurizio Genuardi Maria Adelaide Caligo98 Zonta Andrea Alfredo Brusco Enrico Grosso

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RICORDO LEOPOLDO ZELANTE (a cura di Mattia Gentile) Leopoldo Zelante, figura di riferimento per la genetica medica regionale, nazionale ed

internazionale, ci ha lasciato venerdì 11 dicembre. Leopoldo Zelante avrebbe compiuto 68 anni a Gennaio. La sua figura umana e professionale è sempre stata legata all'Ospedale Casa Sollievo della Sofferenza di San Giovanni Rotondo. Specialista in Pediatria e Genetica Medica, ha iniziato la sua attività nel 1974 per creare nel 1982 il primo laboratorio per la Citogenetica e, ufficialmente, nel 1985 il Servizio di Genetica

Medica, realtà da sempre di grandissimo rilievo nel panorama della assistenza, della diagnosi e della ricerca, tanto che l'Ospedale ha poi ricevuto la qualifica di IRCCS nel settore proprio delle malattie genetiche. Leopoldo ha fatto crescere tanti giovani ricercatori, promosso innumerevoli iniziative e progetti di Ricerca, svolto attività di formazione con prestigiosi Convegni e Corsi che hanno visto la partecipazione dei maggiori studiosi di fama internazionale, pubblicato oltre 200 lavori su riviste internazionali. Leopoldo è stato il punto di riferimento per

tanti genetisti e medici, sempre pronto a rispondere in prima persona. Ma soprattutto va ricordata la sua instancabile attività per e con il paziente, attività sempre svolta con il massimo impegno e senza alcun vantaggio se non quello di condividere ed aiutare. Leopoldo è stato un uomo di fede e siamo sicuri che la sua profonda fede lo abbia aiutato, specie negli ultimi anni, molto difficili per lui, sia per le ansie sul futuro del Servizio, la sua creatura, sia per la malattia che lo ha afflitto. Negli ultimi tempi agli amici più cari spesso confidava: ho le valigie pronte per partire! E' vero, forse una vita degnamente vissuta prepara anche alla dipartita, ma Leopoldo ci mancherà tanto. VISTO E SENTITO ALL’ESHG 2015 Alessandra Renieri e Francesca Mari -Diagnosi NIPT per analisi CNV su tutto il genoma è in grado di identificare, come risultato “secondario”, la presenza di tumori nella gestante attraverso l’identificazione di delezioni multiple nel cell free DNA del plasma. In alcuni casi la gestante aveva k ovarico, in altri differenti tipi di linfomi. In alcuni casi il trattamento è iniziato durante la gravidanza, in altri casi di tumore più indolente, subito dopo la gravidanza. La stessa analisi può essere successivamente usata anche per il monitoraggio del tumore: ripetendo l’analisi dopo la terapia le CNV cell free DNA del plasma risultavano scomparse. -Sono di numero crescente le malattie mendeliane da alterazione di long-range enhancer. Si tratta di traslocazioni o inversioni o mutazioni puntiformi in regioni “desert gene” ma conservate: Beta-Talassemia, Pierre Robin sequence e la duplicazione della regione DSD e SOX9, Haas type polysyndactyly e mutazioni in ZRS a 800kb dal gene SHH. Anche una quota di casi (circa 3%) con disturbo dello spettro autistico hanno CNVs in regioni non codificanti, la maggior parte delle quali sono ereditate ma maggiormente presenti nei pazienti rispetto ai controlli. -Analisi dell’esoma su 5000 trios dimostra che il 30% dei pazienti con ID può essere diagnosticato. Nel 15% dei casi si trovano variazioni strutturali, mentre nell’85% dei casi si ritrovano piccole variazioni, di cui nel 75% si tratta di nuove mutazioni e nel

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restante 25% sono ereditate. Nel 95% dei casi sono malattie da singolo gene, nel 5% composite. I geni più frequentemente mutati sono: ARID1B, ANKRD11, KMT5 Sono stati identificati i geni di 12 nuove malattie dominanti. TALPID3 è un nuovo gene della sindrome di Joubert, il gene HACEI causa disturbo dello sviluppo generalizzato e ipoplasia del corpo calloso, MMP2I causa destrocardia e eterotassia (malattia del cilio primario); il gene PRMT7 causa una fenocopia della osteodistrofia di Albright. Le malattie recessive sono molto meno comuni delle dominanti -I ribonucletidi sono inclusi all’interno della doppia elica del DNA e provengono da errori in fase replicativa delle polimerasi (ce n’è uno ogni 1000 bp). Le regioni maggiormente ricche in ribonucleotidi sono quelle nei tratti di DNA dei nucleosomi rispetto al DNA “linker” tra nucleosomi. Questo è dovuto al fatto che la ligazione dei frammenti di Okazaki avviene nei punti del DNA legati alle proteine (anche a transcription factors), dove si ha anche maggiore frequenza di polimorfismi, di mutazioni a mosaico e mutazioni germline. Al fine di identificare i ribonucleotidi nel genoma e spiegare l’instabilità del genoma è possibile usare il medoto emRiboSeq NGS. -identificato nuovo gene per Cornelia De Lange: NAA10 -identificato nuovo gene per la sindroem nefrocerebellare di Galloway Mowatt: WDR73 -identificato i(i) gene(i) della sindrome di Moebius: mutazioni missenso de novo nel gene della plexina D1 (PLXND1 3 casi) o nel gene REV3L (1 caso). -ulteriori geni per la sindrome Kabuki: GTPasi del RAS pathway, RAP1A e RAP1B identificati attraverso una zona di UPD paterna. Take home message: se il vostro esoma è negativo ricordatevi di analizzare per zone di UPD, il gene potrebbe esse li. -nuovo gene per la poliposi adenomatosa familiare (FAP) attenuata recessiva: NTHL1 la mutazione frameshift P.Q90* è un hotspot. Presenti anche altri tipi di tumori quali mammella e endometrio. -Ad oggi sono conosciuti 56 geni imprinted. Si stima un numero totale di geni imprinted intorno a 100, non oltre. L’espressione monoallelica può essere solo in certe finestre di sviluppo o solo in alcuni tessuti del corpo. Take home message in

clinica: pensate ad un disordine da imprinting ogni volta che avete disturbi di crescita (in eccesso o in difetto), del metabolismo o del comportamento alimentare. -Test pre sintomatici nel bambino consigliati solo se c'è una possibile terapia, altrimenti rinviati all’età adulta perchè l’individuo deve essere consapevole del significato del test. -grande divulgazione dei pannelli virtuali: analisi dell’’intero esoma (WES) o del mendelioma (5.000 geni) e successiva analisi limitata ai geni di interesse (anche 1 solo, o 10 o 100 geni). -BRCA1/2: oltre 95% sono mutazioni troncanti. Molte delle VUS sono probabilmente non patogenetiche. - nuovo gene di suscettibilità per carcinoma mammella-ovaio: ERCC2 -paziente con polipi amartomatosa e gaglioneuromi intestinali dovuto a mutazioni in SMAD9 che risulta nella riduzione di PTEN -In ADS c’è sovraespressione di Mir146 e Mir221 (espressi specificamente in neuroni): biomarcatori per l’autismo?. -KCNA2 causa encefalopatia epilettica simil Dravet (hotspot p.P406) ma anche encefalopatia aspecifica (gain of function mutation). -22q11.22: delezione diversa e prossimale alla sindrome velocardiofaciale è associata con schizofrenia -trattamento del CADASIL con oligonucleotidi antisenso che provocano skipping dell’esone con mutazione. Può essere usata nel 65% delle mutazioni. -trattamento del Sclerosi tuberosa con inibitori di mTOR: Sirolimus (rapimicina) è ottimo sia a livello dermatologco locale per lesioni cutanee e in via sistemica per lesioni polmonari e il controllo degli angiomiolipomi. -terapia con iniezione spinale di adenovirus per terapia genica della atassia di Friedreich - European Variation Archives (deposito dati di 8000 genomi). Cosa ci può dire l’analisi del nostro genoma su molti individui? Mancanza di omozigosi: Nel gene 7 deidrocolesteroloreduttasi (sindrome di Smith Lemni Opitz) c’è una splicing variant che ha frequenza dell1% ma la cui omozigosi è assente (morte del feto?). Suscettibilità a infezioni: la deficienza del fattore C2 del complemento in omozigosi è associata alla suscettibilità alle infezioni da batteri capsulati con penetranza 50%.

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Aritmie: mutazione frameshift in MYL4 conferisce suscettibilità ad artimie. Fenotipi più lievi della sindrome nota: Mutazioni KO in AHI1 (sindrome di Jubert) si trovano nei pazienti con trapianto renale o retinite pigmentosa isolata. Mutazioni KO in AIRE (sindrome da poliendocrinopatia autoimmune tipo 1) si trovata in pazienti con disfunzione tiroidea isolata. NEWS DALLA RICERCA (a cura di Romano Tenconi)

Segnalo alcuni significativi articoli (in grassetto) o “spigolature” (curiosità, in corsivo) pubblicati sulle principali riviste scientifiche internazionali generaliste o di settore con l’esclusione di alcune specifiche della nostra specialità nel periodo Ottobre-Agosto 2015. Una selezione più ampia di articoli o spigolature con descrizione dell’argomento e qualche commento è reperibile sul blog con aggiornamento mensile (discutiamonegeneticaclinica.blogspot.com) Ottobre: The clinical application of genome-wide sequencing for monogenic diseases in Canada: Position Statement of the Canadian College of Medical Geneticists. Journal Medical Genetics 2015;52: 431. Position statement preparato da genetisti clinici e di laboratorio, genetic counselor, ricercatori e giuristi sull’uso del sequenziamento genomico per la diagnosi clinica. Raccomandazioni: 1. E’ un appropriato approccio diagnostico per pz con sospetta malattia monogenica geneticamente eterogenea o quando i test applicati non hanno individuato la causa. 2. Per gli “incidental findings” (IF) non opportuno l’approfondimento clinico per geni malattia che non sono correlati all’indicazione iniziale (primaria) dell’esame; interessanti le considerazioni su cosa dire per IF nei bambini per malattie per le quali non ci sono procedure preventive/terapeutiche nell’età infantile o a comparsa in età adulta. 3. Consulenza pre test da parte dei clinici che deve includere le limitazioni del test, la probabilità e le implicazioni della diagnosi, i possibili IF, la necessità di ulteriori analisi per facilitare l’interpretazione clinica, compreso il ricorso ad eventuali

approfondimenti ricorrendo anche alla ricerca e la possibilità di partecipare a progetti di ricerca. Experiences with Obtaining Informed Consent for Genomic Sequencing. AJMG Nov 2015;167:2635. Risultati di un’intervista di Genetic counselor: nel counseling meglio non soffermarsi sui vari punti del consenso e sugli aspetti tecnici ma focalizzare bene i punti che possono essere malinterpretati dai consultandi aiutandoli a valutare realisticamente le loro attese sui tipi e sulle implicazione dei possibili risultati, inclusi i risultati secondari. Settembre Fluent in DNA. Nature 2015;526:151 (non solo in English, ndr). Con il NGS applicato alla clinica si sono aperte nuove opportunità per che ha il compito di fornire la consulenza genetica per spiegare il significato di quanto trovato (questa nota scritta da un freelance writer americano sulle opportunità lavorative è dedicata ai Genetic counselor, ne viene fatta la storia di questa professione. Da noi è applicabile ai genetisti clinici che devono essere genetisti di nuova generazione, ndr). Return of genetic testing results in the era of whole-genome sequencing. Nature Reviews Genetics 2015;16:553. con la crescente applicazione sia in ricerca che in clinica di WGS dalle domande che ora ci facciamo (“how to return, who should return and when to return”) si passerà rapidamente a “what should we not return?”. E un condivisibile commento sulla possibile introduzione di NGS in sostituzione dell’attuale test di screening dei neonati asintomatici per condizioni immediatamente trattabili. Due lavori molto interessanti sulla fisiopatologia dell’autismo: From the genetic architecture to synaptic plasticity in autism spectrum disorder. Nature Reviews Neuroscience 2015;16:551 An Autism-Linked Mutation Disables Phosphorylation Control of UBE3A. Cell 2015;162:795 con commento A molecular tightrope. Nature 2015;526:50. A genetic cause of Alzheimer disease: mechanistic insights from Down syndrome. Nature Reviews Neuroscience 2015;16:564. La s. Down come esperimento naturale dell’Alzheimer? Can the impact of human genetic variations be predicted? PNAS 2015;112:11426. Idealmente i metodi di filtraggio bioinformatico dovrebbero avere un basso tasso di risultati falsi positivi, filtrare il maggior numero di varianti irrilevanti (un pagliaio il più

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ridotto possibile) e un basso tasso di falsi negativi (l’ago non deve essere rimosso dal pagliaio). Uno studio comparativo con modelli animali (Comparison of predicted and actual consequences of missense mutations. Pg. E5189) dimostra che vi sono risultati differenti tra metodi in silico (molti falsi positivi) e in modelli animali in vivo, mentre sono ugualmente bassi i falsi negativi (è un bene perchè “the worst-case scenario is to miss the good mutation”). Molto interessante la conclusione sulla validazione in futuro della predizione di patogenicità in caso di mutazione candidata ad essere patogena o di mutazione causa di malattia in pz con fenotipo diverso da quello noto. Agosto: The DNA of a Nation. Nature 2015;524:503. Sottotitolo: The United Kingdom aims to sequence 100,000 human genomes by 2017. But screening them for disease-causing variants will require innovative software Molto interessante. Comprehensive gene panels provide advantages over clinical exome sequencing for Mendelian diseases. Genome Biology 2015;16:134. Applicazione clinica del NGS. Il ricorso a uno di 13 pannelli di geni in base a criteri clinici meno restringenti con richiedenti con minima esperienza clinica è molto più economico dell’analisi esomica ed altrettanto efficace nella diagnosi. La sensibilità clinica del “Mendelioma” varia da pannello a pannello, dal 24% per le malattie ematologiche al 62% per quelle dermatologiche (38% per il pannello dismorfismi/displasie). Rise in US autism cases is mostly due to changes in diagnosis, study claims. BMJ 2015;351:h4209. Commento di un articolo (Comorbidity of intellectual disability confounds ascertainment of autism: implications for genetic diagnosis. AJMG B Neuropsychiatr Genet 2015;168:600) che sottolinea quanto già era sospettato, cioè che l’impressionante aumento della prevalenza dell’autismo (1:5.000 nel 1975, 1:150 nel 2002 e 1:68 nel 2012) sia dovuto più alla riclassificazione diagnostica di bambini con malattie del neurosviluppo che al reale aumento di frequenza della malattia. Identification of cis-suppression of human disease mutations by comparative genomics. Nature 2015;524:225. PolyPhen e AIFT nell'attribuzione di patogenicità per una variante in quanto non tengono conto del contesto genomico in cui quella variante agisce, perché un allele può sembrare dannoso in una sequenza e neutrale in una sequenza ortologa di un’altra specie, fenomeno di deviazione patogenica compensata (CPD) che contribuisce per una entità, probabilmente considerevole, di

falsi negativi nella valutazione funzionale. Un allele non-CPD è associato allo stesso fenotipo in ogni sequenza ortologa indipendentemente dal backgroud genetico, mentre quando una variante causa di malattia nell’uomo la si trova in una sequenza ortologa wild-type significa che il background di quella specie ha un effetto compensatorio sulla variante e impedisce che si manifesti il fenotipo proteggendola dalla selezione negativa. Nel lavoro si è osservato che una considerevole proporzione di alleli causa di malattia sono “riparati” in genomi di altre specie. Questo fenomeno è stato dimostrato nello zebrafish ed è stato applicato con successo anche nell’attribuzione di patogenicità in una bambina con microcefalia dei risultati di una WES che ha segnalato missenso de novo di due diversi geni e missenso recessive di due altri geni. Una delle mutazioni è stata ritenuta causativa nonostante i risultati computazionali di benignità. Ondine Undone. NEJM 2015;373:573. Bellissimo articolo sulla sindrome Ondine ("Maledizione di Ondina") da ipoventilazione centrale congenita). Ottobre: Forensic DNA evidence is not infallible. Nature 2015;526:611. As DNA analysis techniques become more sensitive, we must be careful to reassess the probabilities of error. Essendo spesso minima la quantità di DNA per l’analisi genetica c’è il serio rischio di un trasferimento secondario che comporta che sia trovato DNA di una persona su una superficie che quella persona non ha mai toccato. A runner’s high depends on cannabinoid receptors in mice. PNAS 2015;112:13105. Si è sempre pensato che il benessere fisico del dopo esercizio fisico fosse dovuto alle sole endorfine, ma nel topo sembra che vi sia anche il contributo dei recettori endocannabinoidi con effetto ansiolitico. - Animals thrive at Chernobyl. Nature 8 October 2015. Uno studio nell’area del

disastro ecologico per l’esplosione del reattore nucleare di Chernobyl (26 Aprile 1986)(Long-term census data reveal abundant wildlife populations at Chernobyl. Curr Biol 2015;25:R824) dimostra che, contrariamente a quanto ipotizzato, c’è un’abbondante quantità di animali selvatici, dalle alci, cervi e lupi, abbondanza simile a quella di riserve naturali della Bielorussia non contaminate dalle radiazioni. I grandi mammiferi si sono quindi ben adattati all’esposizione cronica alle radiazioni.

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Settembre: A Combination Therapy for Cystic Fibrosis. Cell 2015;163:17. Bench to Bedside. Una terapia efficace con associazione di due farmaci (Orkambi) per la mutazione più comune della FC (deltaF508). Lysosomal Acid Lipase Deficiency — A New Therapy for a Genetic Lipid Disease. NEJM 2015;373:1071. Pensare a questa malattia in pz con ipercolesterolemia con familiarità negativa, soprattutto se accompagnata da bassi livelli di colesterolo HDL, aumentate le aminotransferasi, o steatosi epatica e soprattutto in caso di cirrosi micronodulare. E’ curabile. Brain stimulation in children spurs hope — and concern. Nature 2015;525:436. Ancora troppo presto per dire che funzioni il ricorso a correnti magnetiche o elettriche per attivare i circuiti cerebrali e favorire i contatti tra neuroni per trattare malattie psichiatriche, disturbi comportamentali o per stimolare l’apprendimento. C’è ora il serio rischio di un “fai-da-te”. A Randomized Trial of Phototherapy with Filtered Sunlight in African Neonates. NEJM 2015;373:1115. In Africa si possono salvare migliaia di bambini dalla morte e dalla paralisi cerebrale da iperbilirubinemia neonatale semplicemente esponendoli ai raggi solari filtrati. E’ stato dimostrato che funziona. Female genital cutting is not a social coordination norm. Science 2015;349:1446. Le motivazioni variano da regione a regione e da famiglia a famiglia, come un obbligo religioso da alcune o un tratto distintivo da altre o per favorire il matrimonio delle ragazze in una società che promuove l’incremento di natalità o per segno di fedeltà. Problematici quindi gli interventi preventivi per questa varietà di motivazioni. A proposito di determinismo genetico e del rischio di interpretarlo male. Genetics affect lung disease and smoking behaviour, study finds. BMJ 2015;351:h5150 e People who believe body weight is genetic eat less healthily and take less exercise, study finds. BMJ 2015;351:h4861. Agosto: The Paternalism Preference — Choosing Unshared Decision Making. NEJM 2015;373:589. Ancora sul consenso informato, ma in medicina generale. Quante devono essere le informazione da dare? Tautologicamente tante quante servono per decidere. Il dogma di oggi è “more information is always better”. Ma se è giusto non

negare a qualcuno le informazioni che lo riguardano lo è altrettanto fornirgliene troppe? C’è infatti anche la possibilità che il pz ne voglia di meno (viene fatto un esempio personale di un inutile eccesso di informazioni), con numerosi altri esempi e rischi connessi all’eccesso di informazione. In alcuni casi, il punto di vista dell’autore, è che il tanto deprecato paternalismo medico è benefico, più che le informazioni conta la presenza del medico accanto al paziente quando deve prendere delle decisioni sulla sua salute: quando il medico percepisce il peso dell’indecisione potrebbe dire: “I don’t know how things are going to turn out, but I promise I’ll be there with you the whole way” (proprio questa era in passato la figura del medico, ndr). How farm life prevents asthma Science 2015;349:1034. Perchè chi cresce in campagna nelle fattorie raramente ha allergie o asma? Perché da bambino respira componenti batterici che riducono la reattività del sistema immunitario. Si dimostra (Farm dust and endotoxin protect against allergy through A20 induction in lung epithelial cells. Pg. 1106) che l’esposizione precoce ad endotossina (liposaccaride, componente della parete cellulare di germi gram-negativi) in topi di 6-12 settimane, rispetto ai controlli, previene successivamente lo sviluppo di asma da inalazione dell’acaro della polvere. Le cellule epiteliali dei polmoni dei topi esposti producono meno citochine quando vengono in contatto con gli acari ed hanno meno cellule dendritiche, che sono le sentinelle immunitarie attivate dalle citochine. La protezione è dovuta ad un enzima, A20, ubiquitin-modifing. Uno SNP di questo enzima correla con un’aumentata suscettibilità all’asma ed all’allergia nei bambini allevati in una fattoria. In conclusione l’ambiente della fattoria previene l’allergia modificando la comunicazione tra le cellule della barriera epiteliale e le cellule dendritiche tramite l’induzione di A20. The Brain on Drugs: From Reward to Addiction. Cell 2015;162:712. Review sulla dipendenza da sostanze, malattia neurologica cronica con forti componenti genetiche, del neurosviluppo e socio-culturali. L’esposizione ripetuta a droghe è causa di alterazioni neuroplastiche negli stimoli glutammatergici dello striato e dei neuroni dopaminici del mesencefalo aumentando la reattività cerebrale alle assunzioni di droga e riducendo la sensibilità ad altri stimoli di ricompense non dovute alla droghe e l’autoregolazione ed aumentando la sensibilità a stimoli di stress e alla disforia (umore depressivo).

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La conoscenza dei meccanismi neurobiologici alla base dell’abuso delle droghe ci permette di concludere che la dipendenza è una malattia cronica del cervello e che ora conosciamo potenziali bersagli per interventi per una terapia efficace e personalizzata.