Modificação de linhagens industriais de Saccharomyces cerevisiae para o aumento da produtividade...
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Modificação de linhagens Modificação de linhagens industriais de industriais de
Saccharomyces cerevisiaeSaccharomyces cerevisiae para o aumento da para o aumento da
produtividade de álcool e produtividade de álcool e floculação condicionalfloculação condicional
Silvia Kazue MissawaSilvia Kazue Missawa
Orientador: ProfOrientador: Profoo Dr Gonçalo Amarante Guimarães Dr Gonçalo Amarante Guimarães PereiraPereira
IntroduçãoIntrodução
Saccharomyces cerevisiaeSaccharomyces cerevisiaeUtilizado processo fermentativoUtilizado processo fermentativo EtanolEtanol CachaçaCachaça CervejaCerveja VinhoVinhoO que é fermentação??O que é fermentação??
Vias Vias MetabólicasMetabólicas
GLICÓLISEGLICÓLISE
FERMENTAÇÃOFERMENTAÇÃO
RESPIRAÇÃORESPIRAÇÃO
(Schüller, 2003)
Processo Fermentativo Processo Fermentativo IndustrialIndustrial
(Meleiro & Maciel-Filho, 2000)
Genes FloculaçãoGenes Floculação
Proteína de membranaProteína de membranaFLO1 e FLO5: agregados são FLO1 e FLO5: agregados são
reprimidos por manosereprimidos por manoseFLO10: agregados são reprimidos na FLO10: agregados são reprimidos na
presença de açucares (maltose, presença de açucares (maltose, sacarose e glicose)sacarose e glicose)
Processo FloculaçãoProcesso Floculação
FloculaçãoFloculação
[ ] cálcio [ ] cálcio [ ] etanol[ ] etanolnutrientesnutrientestemperatura temperatura pHpHatividade mitocondrialatividade mitocondrial
Atividade MitocondrialAtividade Mitocondrial
Deficiência genoma da mitocôndria Deficiência genoma da mitocôndria Altera características da superfície Altera características da superfície
da célulada célulaPET191 - PET191 - gene nuclear gene nuclear (Hutter &Oliver, (Hutter &Oliver,
1998)1998)montagem subunidades citocromo montagem subunidades citocromo
C oxidaseC oxidaseRompimento Rompimento PET191 – PET191 – aumento na aumento na
produção de etanol (43%)produção de etanol (43%)
CONTROL OF CONTROL OF SACCHAROMYCES CEREVISIAESACCHAROMYCES CEREVISIAE FLOCCULATION BY SUGAR FOR INDUSTRIAL FLOCCULATION BY SUGAR FOR INDUSTRIAL
ETHANOL PRODUCTIONETHANOL PRODUCTION Cunha, A.F. Cunha, A.F. 11 , Missawa, S.K. , Missawa, S.K.11 , Gomes, L.H. , Gomes, L.H.22, Reis, S. F., Reis, S. F.33 and Pereira, G.A.G. and Pereira, G.A.G. 11
(1(1) ) Laboratório de Genômica e Expressão - Departamento de Genética e Laboratório de Genômica e Expressão - Departamento de Genética e Evolução Instituto de Biologia –Universidade Estadual de Campinas - Evolução Instituto de Biologia –Universidade Estadual de Campinas - Campinas – São Paulo – BrazilCampinas – São Paulo – Brazil
(2) Universidade de São Paulo – ESALQ – Laboratório de Genética de (2) Universidade de São Paulo – ESALQ – Laboratório de Genética de Leveduras –Piracicaba, SPLeveduras –Piracicaba, SP
(3) Departamento de Parasitologia - Instituto de Biologia - Universidade (3) Departamento de Parasitologia - Instituto de Biologia - Universidade Estadual de Campinas – Campinas - São Paulo – BrazilEstadual de Campinas – Campinas - São Paulo – Brazil
Submitted to: FEMS YEAST RESEARCHSubmitted to: FEMS YEAST RESEARCH
Objetivos ArtigoObjetivos Artigo
Floculantes condicionaisFloculantes condicionaisProcesso pedido patente Processo pedido patente
(INPI n(INPI no o 0001122)0001122)Transferir a tecnologia para indústriaTransferir a tecnologia para indústria
Engenharia genéticaEngenharia genéticaUso promotor forte e condicionalUso promotor forte e condicional
Construção com o promotor Construção com o promotor MoxBBMoxBB
Northern blotNorthern blot
Construção com o promotor Construção com o promotor ADH2ADH2
Transformação de linhagem industrialTransformação de linhagem industrial
ProblemasProblemas
Desfloculação dos agregados do Desfloculação dos agregados do gene gene FLO5FLO5
Floculação antecipada na linhagem Floculação antecipada na linhagem industrialindustrial
ObjetivosObjetivos
Avaliar o gene Avaliar o gene FLO10FLO10Analisar crescimento das células e Analisar crescimento das células e
produtividade de etanol em produtividade de etanol em linhagens de laboratório e industriaislinhagens de laboratório e industriais
Deletar o gene Deletar o gene PET191PET191 para para aumentar a produtividade de etanolaumentar a produtividade de etanol
Materiais e MétodosMateriais e Métodos
Linhagens S. cerevisiae:Linhagens S. cerevisiae: W303-1a, JD7-7C, HD9315bW303-1a, JD7-7C, HD9315b Pedra2, Fleishman, UvarumPedra2, Fleishman, Uvarum
PlasmídeosPlasmídeos YEp352-FLO5, pYADE4, pYADE4-YEp352-FLO5, pYADE4, pYADE4-
FLO5FLO5
Amplificação e Clonagem do Amplificação e Clonagem do gene gene FLO10FLO10
Amplificação por PCRAmplificação por PCRClonagem em P-gem (Promega)Clonagem em P-gem (Promega)DigestãoDigestãoClonagem no pYADE4Clonagem no pYADE4
Extração de RNA e Northern BlotExtração de RNA e Northern BlotTestes Floculação: Tempo de Testes Floculação: Tempo de
sedimentaçãosedimentação Isolamento e caracterização de Isolamento e caracterização de
linhagens selvagens: RAPDlinhagens selvagens: RAPDTeste produtividade: Cromatógrafo a Teste produtividade: Cromatógrafo a
gás, ou destilação e desimetriagás, ou destilação e desimetria
Resultados ParciaisResultados Parciais
Amplificação do gene Flo10 Amplificação do gene Flo10 FLO10BamF 5´ CGCFLO10BamF 5´ CGCGGATCCGGATCCATGCCTGTGGCTGCTCG 3´ATGCCTGTGGCTGCTCG 3´ FLO10SalR 5´ ACGCFLO10SalR 5´ ACGCGTCGACGTCGACCTATTAAACGATTG CCAG 3´. CTATTAAACGATTG CCAG 3´.
Clonagem do gene Flo10 em PgemClonagem do gene Flo10 em Pgemhind FLO10
3,5KB
hind FLO10
3,5KB4361
23222027
564
bp
λ hind 1 2 3
(1) SalI (3 e 3,5Kb)
(2) BamHI/SalI (3 e 3,5Kb)
(3) ScaI/SalI (1,1; 1,5; 1,8; 2,0Kb)
pYADE4-FLO10
FLO10PromotorADH2
pGEM-FLO10BamH I
FLO10
Sal I
pYADE4BamH I Sal I
Promotor ADH2
Construção do pYADE4-Construção do pYADE4-FLO10FLO10
Extração RNA e NorthernExtração RNA e Northern
0 20 40 0 20 40
pYADE4pYADE4 -FLO10
Tempo (horas)
Concentração de glicose (%) 4 1 0 4 1 0
A
B
0 20 40 0 20 40
pYADE4pYADE4 -FLO10
Tempo (horas)
Concentração de glicose (%) 4 1 0 4 1 0
A
B
Seleção por canavanina emSeleção por canavanina em linhagens industriais linhagens industriais
Célula cresceCAN1canavanina
arginina
Permease da arginina
XX
CAN1
canavanina
arginina Célula não cresce
XXXX Célula cresceCAN1
canavanina
arginina
Permease da arginina
XX
CAN1
canavanina
arginina Célula não cresce
XXXX
Cassete integrativoCassete integrativo
pYADE4-FLO10
ATGFLO10ADH2
Promoter FLO10CAN1
CAN1ADH2
ATGADH2
PromoterCAN1’ CAN1’’
CAN1(Genomic Locus)
+ 205 + 1467
4361
2322
λ hind
3,7 kb
pb
4361
2322
λ hind
3,7 kb
pb
Próximas EtapasPróximas Etapas
Clonar o gene Clonar o gene FLO10 FLO10 com seu com seu próprio promotorpróprio promotor
Transformação de linhagens Transformação de linhagens industriais com cassete integrativoindustriais com cassete integrativo
Desenvolver estratégia de Desenvolver estratégia de desfloculação (FLO10)desfloculação (FLO10)
Deleção de Deleção de PET191PET191Testes de floculação e produtividadeTestes de floculação e produtividade