Ľudský mikrobióm alebo čo je to bežná flóraautor L. Liščáková,

spoluautor M. Šlahorová

Oddelenie klinickej mikrobiológie

• komplex baktérií žijúci na povrchu nášho tela a slizníc

• tzv.“spolustravník“

• zdravému človeku neškodí

• s organizmom komunikuje

• spolupracuje

• je prospešný

Ľudský mikrobióm- bežná flóra

Rosiahly komplex, ktorého

zloženie je ovplyvnené

a charakteristické pre

konkrétnu lokalitu ľudského tela

-tráviaci trakt

-respiračný trakt

-pokožka

-urogenitálny trakt

Žiadny z druhov baktérií patriaci

k BF nie je primárny patogén,

ale v iných lokalitách sa môže

uplatniť ako patogén a vyvolať

i smrteľnú infekciu.

Funkcia bežnej flóry -Ovplyvňuje fyziologické funkcie, peristaltiku, vstrebávanie,

-štiepi sacharidy, proteíny, vlákninu

-podieľa sa na syntéze vitamínu B a K

-bráni v raste patogénnym baktériám tak, že obsadzuje bunkové

receptory

-súperí o živiny

-produkuje tzv. bakteriocíny, ktoré inhibujú rast patogénov

-ich metabolické produkty(kys.mliečna) menia pH prostredia, čo

tiež inhibuje rast patogénnych

mikroorganizmov

-uvoľňujú antigény, a to aktivuje imunitu

a tvorbu protilátok

Koža a sliznice dieťaťa sú počas vnútromaternicového vývoja sterilné.

Počas pôrodu sa môžu kontaminovať mikroorg. z pôrodných ciest.

Kedže baktérie sa nachádzajú všade (voda, vzduch, potrava, ľudské

telo..) pomaly dochádza ku kolonizácii novorodenca a osídľovaniu

bežnou flórou.

Koža

Z mikrobiol.hľadiska je pomerne

skromne osídlená – je to limitované

faktormi ako je napr. sucho a UV

žiarenie, najviac baktérii je v

medziprstných priestoroch,

podpazuší, záhyboch

Osídlenie je ovlyvnené tiež vlhkosťou,

umiestnením mazových a potných žliaz,

kontamináciou zo susedných slizníc

(okolie nosa, konečníka)

Najčastejšie Staphylococcus

epidermidis, S. hominis a

ostatatné koaguláza-negatívne

stafylokoky

(pozor kontaminácia HK)

-vlhké prostredie /nos,perineum/-

Staphylococcus aureus

-zvýšený výskyt mazu – korynebaktérie,

anaeróbne propionibaktérie,

Acinetobakter, Candidy

Respiračný trakt

Trvalo vystavený

prísunubaktérií z okolia

Vhodné prostredie pre

ich rast, prítomný

dostatok živín, kyslík a

optimálna teplota

Pre človeka je preto výhodné,

že je RT osídlený

neškodnými baktériami

-má viac ekosystémov – nosová sliznica, nosohltan, tonzily, laryng, trachea, pľúca

-nos + nosohltan: Staphylococcus epidermidis, St. aureus, Korynebaktérie

-laryng + tonzily: ústne streptokoky/zub.kaz/, nepatogénne neissérie, menej

korynebaktérie,prechodne nevirulentné, neopúzdrené Str.pneumoniae,

Neisserie meningitidis,Haemophylus influenzae, H.parainfluenzae

Na OAIM:G- tyčky, klebsielly. escherichie, pseudomonády-problém, keď

prechádzajú aj na sliznice dolných CD – tie majú byť sterilné

Gastrointestinálny trakt

Je bohato kolonizovaný mnohými mikroorganizmami.

Každý úsek má z hľadiska fyzikálnych a chemických podmienok

odlišnú mikroekologickú situáciu.

Množstvo a počet druhov závisí od:

Veku - s pribúdajúcim vekom klesá počet bifidobaktérií a laktobacilov, objavuje sa viac enterobaktérií (E.coli), klostrídií a kvasiniek

Zdravotného stavu človeka - funkcie imunit. systému, produkcie sekrétov, slín, pravidelného odchodu stolice a moču, stravovacích návykov, aktuálneho užívania liekov (ATB, imunosupresíva, laxancia, kortikoidy, antikoncepcia)

Dutina

ústna považovaná za

začiatok

zažívacieho traktu

i keď je súčasťou

aj respiračného

systému

Je v nej

podobné

množstvo

baktérií ako v

hrubom čreve,

to je asi 1011

na gram vlhkej

váhy tkaniva

V zubnom plaku

sa nachádza

Streptococcus

mutans, v

dentálnych

chobotoch skôr

anaeróbne

baktérie

(Bifidobaktérie,

Eubaktérie,

Aktinomycéty,

Fusobaktérie)V žalúdočnej

dutine sa nachádza

HCl, ktorá účinne

obmedzuje rast

mikroorg., výnimkou je

Helicobacter pylori, ktorý

svojím metabolizmom

neutralizuje kyslé

prostredie (ulcus,

gastritída, karcinóm)

Tenké črevo (dvanástorník,

lačník, ileum) – nalačno obsahuje

pomerne malý počet bakt., po

jedle sa však zvyšuje, ale má

prechodný ráz – hlavne G+

viridujúce streptokoky, enterokoky,

lektobacily, až potom G- a

anaeróby

Hrubé črevo

-u novorodencov živených materským mliekom je

prevaha bifidobaktérií.

-bežná flóra hr.čreva pozostáva aj z 400 druhov baktérií.

95 % tvoria anaeróbne baktérie (Bacteroides,

Bifidobactérium, Eubactérium, Peptostreptococcus,

Clostrídium... tvorbou kyseliny octovej, maslovej

a mliečnej inhibujú rast iných druhov

-pri kultivácii sú dokazované tiež E.coli, Morganella,

Providentia, Proteus,Pseudomonas, v malom

množstve kvasinky

-po podaní ATB, ktoré inhibujú nesporulujúce anaeróby,

čím sa premnožia sporulujúce bakt.

a z nich Clostrídium dificille s produkciou toxínu.

Spôsobuje hnačky až pseudomembranóznu kolitídu.

Pozor – jeho spóry ľahko kontaminujú okolie pacienta

-nozokomialna nákaza

Urogenitálny trakt

Osídlená je len predná

časť uretry, baktérie sa

tam dostávajú

najčastejšie z perianálnej

oblasti

Nie je známa žiadna ich

ochranná úloha.

Treba na ňu myslieť pri

možnosti kontaminácie

odoberaných vzoriek

moču

a pri interpretácii je

nutné toto rešpektovať

Dokazujeme

Staphylococcus

epidermidis, enterokoky,

viridujúce streptokoky,

korynebaktérie,

E.coli, iné

Enterobakteriace,

kvasinky

Vyššie časti uretry

vrátane močového

mechúra sú za

normálnych okolností

sterilné

Mikrobiológia reprodukčného systému ženy je svojou anatómiou

predurčená k poruche stálej flóry/nachádza sa v blízkosti močovej

trubice a análneho otvoru.

Na stálosti vaginálneho systému sa

podieľajú hlavne hormonálne pomery,

menštruácia, ochorenie ženy, terapia,

anatomické zmeny, sexuálne

správanie, hygiena a metabolické

pomery (stav O2, CO2 a hlavne

hodnota pH).

Krátko po pôrode pretrváva

osídlenie laktobacilami,

v detstve až do puberty je flóra

obdobná ako na ako na vonkajších

genitáliach - kožná flóra.

Potom pod vplyvom estrogénov sa

v bunkách sliznice tvorí glykogén,

z ktorého sa tvorí kys.mliečna,

zabezpečuje kyslé pH, čo vyhovuje

najdôležitejšej baktérii vaginálneho

traktu= Laktobacilus

Narušením pH sa zvyšuje riziko usídlenia iných baktérií

vrátane patogénnych

Bežná flóra: malé nesporulujúce anaeróby, korynebaktérie, G+

koky a kvasinky (enterokoky nie)

Často je sliznica pošvy kolonizovaná streptokokom agalactiae bez

klinických dôsledkov, ale môže byť rizikom infekcie novorodenca.

Negatívne následky

Normálna flóra môže

predstavovať i veľké riziko

infekčných komplikácií

Sú časté situácie, kedy je porušená jej fyziologická rovnováha podávaním

antibiotík, cytostatík, imunosupresív, ťažkými operáciami, zavádzaním

umelohmotných katétrov a pod., ale i vekom

Spôsobuje to najmä premnoženie niektorých

druhov na úkor druhých (nerovnováha) ale i

to, že sa zo svojej „bezpečnej“ lokality dostanú

na iné miesto, prípadne na miesto primárne

sterilné

Nezabudnime, že

aj iné živočíchy

majú svoju typickú

bežnú flóru

Pes-dutina ústna-

Pasteurella multocida

u človeka - infekcia

rán, sepsa

Ovce-tráviaci trakt-

Campylobacter

u človeka dyspepsia

Hydina-črevný

trakt=mäso, vajcia-

Campylobacter,

Salmonella

u človeka hnačky