les outils du chercheur

36
Les outils du cherche ur LARDY Jean- Pierre Université LYON 1

Transcript of les outils du chercheur

Page 1: les outils du chercheur

Les outils

du cherch

eurLARDY Jean-PierreUniversité LYON 1

Page 2: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 2

Sommaire

Le chercheur doit :–S’informer–Publier–Archiver–Évaluer et se faire évaluer–Gérer son information

Page 3: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 3

S’informer

S’informer pour explorer un sujet :

état de l’art avant de commencer une thèse

faire le point à la veille d’une publication ou d’une communication à un congrès

Source d’information les bases de données bibliographiques

Page 4: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 4

S’informer

Suivre l’actualité scientifique :• générale

Source d’information quelques publications peu nombreuses et multidisciplinaires comme La Recherche, Pour la Science, Science, Nature

• sur un sujet particulier Source d’information les bases de données Elles ont maintenant des mises à jour très rapides : quotidiennes et même en temps réel les serveurs de pré-publications

Page 5: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 5

S’informer

Rechercher une information ponctuelle :• données numériques• Propriétés physiques et chimiques • techniques• réactions chimiques• …. Source d’information handbooks, séries techniques …

Page 6: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 6

S’informer

Savoir ce que font les autres :• par l’information informelle

rencontres et discussions aux congrès• le collège invisible :

réseau de relations entretenu avec des chercheurs dans d'autres laboratoires

• les outils PUSH (l’info arrive sur son poste de travail) :– Les listes de discussion– Les fils RSS des blogs

Page 7: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 7

S’informer

Faire de la veille 

DSI = Diffusion Sélective de l’Information

Source d’information les bases de données bibliographiques et les collections de e-journaux

NB : il faut obligatoirement s’enregistre c’est-à-dire avoir un compte (gratuit) pour chaque ressource

Ex SciencDirect : Register or Login--------: Password:------

Pubmed : My NCBI[Sign In] [Register]

Page 8: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 8

S’informerLes fonctions d’alerte des bases de données ou des collections de

jounaux électroniques permettent de rester averti des dernières informations dans ses domaines de recherche.

Les différents producteurs de ressources électroniques emploient une terminologie variée.

Une alerte de recherche est une demande de recherche programmée pour fonctionner automatiquement à une fréquence choisie et fournir un avertissement par mail des résultats.

De même, une alerte de table des matières de revue est une notification par mail d’une nouvelle édition d’un journal.

Exemple d’aide http://marmaris.ku.edu.tr/sasrequest/alert_page/Alert.htm

Page 9: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 9

S’informer

• alerte sur profil = elle est basée sur un ou plusieurs termes de recherche Ex ScienceDirect Save Search | Save as Search Alert Pubmed : My Saved Searches

• alerte basée sur un article particulier = pour être averti – de la citation d’un article– d’une correction– d’une discussion

SD : Save as Citation Alert

Science : Alert me when new articles cite this article

• recevoir les tables des matières (ToC)SD : Alert me when new Journal Issues are available

Page 10: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 10

S’informer

De nouvelles sources sont apparues dernièrement :– Google Scholar http://scholar.google.com

– Scirus http://www.scirus.com

– Windows Live Academichttp://academic.live.com

– OAIster

http://oaister.umdl.umich.edu

– …

Page 11: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 11

S’informer

Le web évolue : blogs et wikis

Les blogs

Définition : Pages web constituées de textes affichées et archivées automatiquement par ordre ante-chronologique, susceptibles d’être commentées et enrichies de liens externes.

Ex : URFIST.infohttp://www.urfist.info

Il existe de nombreux moteurs de recherche spécialisés sur les blogs comme Technorati

http://www.technorati.com

Page 12: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 12

S’informer

Les wikisDéfinition : c’est un site web dynamique permettant à tout individu

d'en modifier les pages à volonté. Il permet de communiquer et diffuser des informations rapidement, et de structurer cette information pour permettre d'y naviguer commodément.

Le meilleur exemple est Wikipedia, l’encyclopédie librehttp://fr.wikipedia.org

Exemples : URFIST de Nice http://www.unice.fr/urfist/LYON 1 : École doctoralehttp://biomserv.univ-lyon1.fr/wiki/e2m2vie/moin.cgiParis 5 http://wiki.univ-paris5.fr

Fluwiki http://www.fluwikie.com

Page 13: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 13

S’informer

Les fils RSS ou Atom permettent de récupérer automatiquement :

• les tables des matières des derniers numéros de revues électroniques

ex : Fils RSS des revues du groupe Naturehttp://www.nature.com/nphys/newsfeeds.html

American Institute of Physics RSS Feedshttp://www.aip.org/rss.htmlEDP Scienceshttp://www.edpsciences.org/index.cfm?id_langue=1&niv1=

rss

Page 14: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 14

S’informer

Les fils RSS ou Atom permettent de récupérer automatiquement :

• les résultats d'une recherche bibliographique dans une base de données par un fil RSS

ex : dans Pubmed,

Proquest avec Dissertations & Theses,

Engineering Village 2,

ou XPLORE d'IEEE

Page 15: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 15

Publier

Tout chercheur doit publier pour la reconnaissance de son travail :

C’est le fameux « publish or perish »

La carrière des chercheurs s’appuient sur leurs publications avec toutes les dérives liées à ce principe, en particulier le copier/coller, la surabondance …

Page 16: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 16

Publier

Page 17: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 17

Publier

En sciences exactes et

biomédicales, l’article de

périodique est devenu le

média principal de publication,

suivi des communications aux congrès et pour les doctorants des posters.

Page 18: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 18

Publier

Diffuser les connaissances scientifiques, c’est– éclairer les décisions des acteurs publics et

privés- participer aux débats science/société- développer la culture scientifique et technique

et vulgariser la science en direction du grand public

Production livres, expositions, conférences grand public…

Page 19: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 19

Publier

Valoriser la recherche en– trouvant des partenaires : société de

valorisation

Ex : EZUS à Lyon 1 http://www.ezus-lyon1.fr

– créant son entreprise : incubateur

Ex : Créalys http://www.crealys.com – déposant des brevets Ex : INPI http://www.inpi.fr

Page 20: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 20

Publier

Les nouveaux moyens de publication

le mouvement Accès Libre

• Définition de l’Open Access (OA)

C’est la disponibilité libre de la littérature validée par les pairs l'Internet public, permettant à tout utilisateur de lire, télécharger, copier, distribuer, imprimer, rechercher ou lier le texte des articles.

Page 21: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 21

Publier Archiver

• Open Access : principe d'accès gratuit aux publications scientifiques avec un comité de lecture. Les coûts d’une archive sont négligeables. C'est aussi comme cela qu'on appelle le mouvement, initié à Budapest en 2002 par des scientifiques.

• Open Archive : stockage des publications scientifiques par les auteurs ou des médiateurs institutionnels (bibliothèques) sans comité de lecture sur des serveurs fonctionnant avec un logiciel « Open Source » (généralement E-prints), permettant une interopérabilité avec d'autres serveurs et offrant un accès totalement gratuit.

Page 22: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 22

Publier

De nouveaux acteurs :

• Public Library of Science - PLoS

http://www.plos.org• Biomed Central

http://www.biomedcentral.com/• BioOne

http://www.bioone.org

Page 23: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 23

Publier

De nouvelles pratiques :

EDP Sciences expérimente différentes formules :• période de mise en accès libre - actualités ou archives ;• modèles économiques comme par exemple le modèle

mixte pour lequel le choix est laissé à l’auteur de rendre ou non son article disponible gratuitement à l’intérieur d’une revue.

De même on trouve Springer Open Choice, Blackwell Publishing Online Open, Oxford Open (mai 2005)….

Page 24: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 24

Réactions des éditeurs

Pour convaincre les chercheurs que les éditeurs commerciaux admettent l’auto-archivage, consultez

le site :

The SHERPA/ROMEO list

http://www.sherpa.ac.uk

Page 25: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 25

Publier

• HighWire Press

http://highwire.stanford.edu

Plus de 1 342 000 articles en texte intégral issus de 942 journaux hébergés par HighWire

• DOAJ

http://www.doaj.org

Répertoire de plus de 2 230 journaux, toutes disciplines et langues

Page 26: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 26

Publier

Les bibliothèques numériques : une bibliothèque numérique est une collection organisée de documents électroniques  en accès libre et gratuit sur Internet, associée à une interface permettant la recherche et la consultation de ces documents. – NUMDAM http://www.numdam.orgnumérisation rétrospective des fonds mathématiques

publiés en France– Persée http://www.persee.frportail de revues scientifiques en sciences humaines et

sociales

Page 27: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 27

Archiver

Différents types d’archives :Par discipline :• arXiv en physique lancé en 1991 arXiv.org• PubMed Central lancé en 1999 http://www.pubmedcentral.org/

Par institution : eScholarship - California Digital Library http://repositories.cdlib.org/

escholarship/

En France : • CDST http://hal.ccsd.cnrs.fr/• La Cellule MathDoc http://mathdoc.emath.fr/

Page 28: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 28

Evaluer

Depuis plus de 40 ans, l’ISI comptabilise les co-citations.– Journal Citation Reports (JCR) permet la

comparaison des périodiques de recherche à partir des citations tirées de plus de 8 400 périodiques de recherche.

Il présente :– le facteur d'impact annuel par revue – l'évolution de l'impact des revues scientifiques – des informations statistiques basées sur des données

de citations – une mesure qualitative des citations entre

publications

Page 29: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 29

Evaluer

• Citations

Web of Science est composé de 3 bases interrogeables séparément ou simultanément : – Arts & Humanities Citation Index

– Science Citation Index Expanded

– Social Sciences Citation Index

On peut rechercher par référence citée– auteur cité (Cited author)– publication citée (Cited work)

Page 30: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 30

Evaluer

Il existe d’autres ressources d’évaluation des articles et journaux.

Faculty of 1000, http://www.facultyof1000.com

publié dans BMC, est un ensemble d'articles sélectionnés en sciences biologiques.

Le classement est effectué par plus de 1000 chercheurs.

Page 31: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 31

Evaluer

Des bases de données récentes proposent aussi les co-citations voir http://urfist.univ-lyon1.fr/cocitations.html

ex ScienceDirect :http://www.sciencedirect.compub-date > 1994 and pub-date < 2005 and TITLE-ABSTR-KEY(vioxx)

and TITLE-ABSTR-KEY(cardio!)

11 Articles Found That Cited: Risk of cardiovascular events and rofecoxib: cumulative meta-

analysisThe Lancet, Volume 364, Issue 9450, 4 December 2004-10 December 2004, Pages 2021-2029

Page 32: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 32

Evaluer

Scholar Google

On retrouve le même article :Risk of cardiovascular events and rofecoxib

: cumulative meta-analysisP Jueni, L Nartey, S Reichenbach, R Sterchi, PA … - Lancet, 2004 - Peter Jüni, Linda Nartey, Stephan ... Cited by 49 -

Page 34: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 34

Gérer l’information

Un logiciel de gestion de bibliographie permet :

• La saisie et l’importation de références• L’interrogation de la base de données• La maintenance de la base de références• La liaison entre un document de traitement de

texte et la base de données• La génération de bibliographie selon le style

demandé par la publication

Page 35: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 35

Gérer l’information

Il existe des solutions commerciales :• EndNote est le plus connu

http://www.endnote.com

• RefWorks de CSA est disponible en lignehttp://www.refworks.com

Mais aussi des solutions Open source gratuites :• Bibus multi-plateforme

http://bibus-biblio.sourceforge.net

• Wikindx en lignehttp://wikindx.sourceforge.net

Page 36: les outils du chercheur

20 juin 2011 LARDY JP 36

Pour approfondir

Mouvement Accès Ouvert :

• http://www.inist.fr/openaccess/• http://snhs-plin.barry.edu/Open_Access.htm

Blogs, RSS• http://www.ccr.jussieu.fr/urfist/rss/index.htm

Serveurs de pré-publications• http://bmiu.univ-bpclermont.fr/DOC_ELECTR/PageEnCours/PREPR

INTS.htm

Gérer sa bibliographie• http://urfist.univ-lyon1.fr/logiciels_gestion_doc.html